Result of FASTA (ccds) for pF1KA0822
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0822, 1581 aa
  1>>>pF1KA0822 1581 - 1581 aa - 1581 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4094+/-0.00127; mu= 17.8635+/- 0.075
 mean_var=80.7162+/-16.188, 0's: 0 Z-trim(101.2): 69  B-trim: 0 in 0/50
 Lambda= 0.142756
 statistics sampled from 6359 (6420) to 6359 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.529), E-opt: 0.2 (0.197), width:  16
 Scan time:  4.360

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS11680.1 ABCA8 gene_id:10351|Hs108|chr17        (1581) 10404 2153.8       0
CCDS74139.1 ABCA8 gene_id:10351|Hs108|chr17        (1621) 6504 1350.5       0
CCDS74138.1 ABCA8 gene_id:10351|Hs108|chr17        (1616) 6450 1339.4       0
CCDS11681.1 ABCA9 gene_id:10350|Hs108|chr17        (1624) 2721 571.4  8e-162
CCDS11683.1 ABCA6 gene_id:23460|Hs108|chr17        (1617) 2261 476.7 2.6e-133
CCDS11684.1 ABCA10 gene_id:10349|Hs108|chr17       (1543) 2080 439.4 4.2e-122
CCDS11685.1 ABCA5 gene_id:23461|Hs108|chr17        (1642) 1498 319.5 5.4e-86
CCDS47584.1 ABCA13 gene_id:154664|Hs108|chr7       (5058)  738 163.2   2e-38
CCDS12055.1 ABCA7 gene_id:10347|Hs108|chr19        (2146)  715 158.3 2.4e-37
CCDS10466.1 ABCA3 gene_id:21|Hs108|chr16           (1704)  515 117.1 4.9e-25
CCDS33373.1 ABCA12 gene_id:26154|Hs108|chr2        (2277)  370 87.3 6.3e-16
CCDS33372.1 ABCA12 gene_id:26154|Hs108|chr2        (2595)  370 87.3 7.1e-16
CCDS6762.1 ABCA1 gene_id:19|Hs108|chr9             (2261)  311 75.1 2.8e-12
CCDS747.1 ABCA4 gene_id:24|Hs108|chr1              (2273)  306 74.1 5.8e-12
CCDS43909.1 ABCA2 gene_id:20|Hs108|chr9            (2436)  301 73.1 1.3e-11


>>CCDS11680.1 ABCA8 gene_id:10351|Hs108|chr17             (1581 aa)
 initn: 10404 init1: 10404 opt: 10404  Z-score: 11570.5  bits: 2153.8 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 10404; 100.0% identity (100.0% similar) in 1581 aa overlap (1-1581:1-1581)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MRKRKISVCQQTWALLCKNFLKKWRMKRESLMEWLNSLLLLLCLYIYPHSHQVNDFSSLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MRKRKISVCQQTWALLCKNFLKKWRMKRESLMEWLNSLLLLLCLYIYPHSHQVNDFSSLL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 TMDLGRVDTFNESRFSVVYTPVTNTTQQIMNKVASTPFLAGKEVLGLPDEESIKEFTANY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TMDLGRVDTFNESRFSVVYTPVTNTTQQIMNKVASTPFLAGKEVLGLPDEESIKEFTANY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 PEEIVRVTFTNTYSYHLKFLLGHGMPAKKEHKDHTAHCYETNEDVYCEVSVFWKEGFVAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PEEIVRVTFTNTYSYHLKFLLGHGMPAKKEHKDHTAHCYETNEDVYCEVSVFWKEGFVAL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 QAAINAAIIEITTNHSVMEELMSVTGKNMKMHSFIGQSGVITDLYLFSCIISFSSFIYYA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QAAINAAIIEITTNHSVMEELMSVTGKNMKMHSFIGQSGVITDLYLFSCIISFSSFIYYA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 SVNVTRERKRMKALMTMMGLRDSAFWLSWGLLYAGFIFIMALFLALVIRSTQFIILSGFM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SVNVTRERKRMKALMTMMGLRDSAFWLSWGLLYAGFIFIMALFLALVIRSTQFIILSGFM
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 VVFSLFLLYGLSLVALAFLMSILVKKSFLTGLVVFLLTVFWGCLGFTSLYRHLPASLEWI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VVFSLFLLYGLSLVALAFLMSILVKKSFLTGLVVFLLTVFWGCLGFTSLYRHLPASLEWI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 LSLLSPFAFMLGMAQLLHLDYDLNSNAFPHPSDGSNLIVATNFMLAFDTCLYLALAIYFE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LSLLSPFAFMLGMAQLLHLDYDLNSNAFPHPSDGSNLIVATNFMLAFDTCLYLALAIYFE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 KILPNEYGHRRPPLFFLKSSFWSQTQKTDHVALEDEMDADPSFHDSFEQAPPEFQGKEAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KILPNEYGHRRPPLFFLKSSFWSQTQKTDHVALEDEMDADPSFHDSFEQAPPEFQGKEAI
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 RIRNVTKEYKGKPDKIEALKDLVFDIYEGQITAILGHSGAGKSTLLNILSGLSVPTKGSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RIRNVTKEYKGKPDKIEALKDLVFDIYEGQITAILGHSGAGKSTLLNILSGLSVPTKGSV
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 TIYNNKLSEMADLENLSKLTGVCPQSNVQFDFLTVRENLRLFAKIKGILPQEVDKEIFLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TIYNNKLSEMADLENLSKLTGVCPQSNVQFDFLTVRENLRLFAKIKGILPQEVDKEIFLL
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 DEPTAGLDPFSRHQVWNLLKERKTDRVILFSTQFMDEADILADRKVFLSQGKLKCAGSSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DEPTAGLDPFSRHQVWNLLKERKTDRVILFSTQFMDEADILADRKVFLSQGKLKCAGSSL
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 FLKKKWGIGYHLSLQLNEICVEENITSLVKQHIPDAKLSAKSEGKLIYTLPLERTNKFPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FLKKKWGIGYHLSLQLNEICVEENITSLVKQHIPDAKLSAKSEGKLIYTLPLERTNKFPE
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 LYKDLDSYPDLGIENYGVSMTTLNEVFLKLEGKSTINESDIAILGEVQAEKADDTERLVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LYKDLDSYPDLGIENYGVSMTTLNEVFLKLEGKSTINESDIAILGEVQAEKADDTERLVE
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 MEQVLSSLNKMRKTIGGVALWRQQICAIARVRLLKLKHERKALLALLLILMAGFCPLLVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MEQVLSSLNKMRKTIGGVALWRQQICAIARVRLLKLKHERKALLALLLILMAGFCPLLVE
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA0 YTMVKIYQNSYTWELSPHLYFLAPGQQPHDPLTQLLIINKTGASIDDFIQSVEHQNIALE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YTMVKIYQNSYTWELSPHLYFLAPGQQPHDPLTQLLIINKTGASIDDFIQSVEHQNIALE
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA0 VDAFGTRNGTDDPSYNGAITVCCNEKNYSFSLACNAKRLNCFPVLMDIVSNGLLGMVKPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VDAFGTRNGTDDPSYNGAITVCCNEKNYSFSLACNAKRLNCFPVLMDIVSNGLLGMVKPS
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA0 VHIRTERSTFLENGQDNPIGFLAYIMFWLVLTSSCPPYIAMSSIDDYKNRARSQLRISGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VHIRTERSTFLENGQDNPIGFLAYIMFWLVLTSSCPPYIAMSSIDDYKNRARSQLRISGL
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA0 SPSAYWFGQALVDVSLYFLVFVFIYLMSYISNFEDMLLTIIHIIQIPCAVGYSFSLIFMT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SPSAYWFGQALVDVSLYFLVFVFIYLMSYISNFEDMLLTIIHIIQIPCAVGYSFSLIFMT
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KA0 YVISFIFRKGRKNSGIWSFCFYVVTVFSVAGFAFSIFESDIPFIFTFLIPPATMIGCLFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YVISFIFRKGRKNSGIWSFCFYVVTVFSVAGFAFSIFESDIPFIFTFLIPPATMIGCLFL
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KA0 SSHLLFSSLFSEERMDVQPFLVFLIPFLHFIIFLFTLRCLEWKFGKKSMRKDPFFRISPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SSHLLFSSLFSEERMDVQPFLVFLIPFLHFIIFLFTLRCLEWKFGKKSMRKDPFFRISPR
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KA0 SSDVCQNPEEPEGEDEDVQMERVRTANALNSTNFDEKPVIIASCLRKEYAGKRKGCFSKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SSDVCQNPEEPEGEDEDVQMERVRTANALNSTNFDEKPVIIASCLRKEYAGKRKGCFSKR
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KA0 KNKIATRNVSFCVRKGEVLGLLGHNGAGKSTSIKVITGDTKPTAGQVLLKGSGGGDALEF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KNKIATRNVSFCVRKGEVLGLLGHNGAGKSTSIKVITGDTKPTAGQVLLKGSGGGDALEF
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KA0 LGYCPQENALWPNLTVRQHLEVYAAVKGLRKGDAEVAITRLVDALKLQDQLKSPVKTLSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LGYCPQENALWPNLTVRQHLEVYAAVKGLRKGDAEVAITRLVDALKLQDQLKSPVKTLSE
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KA0 GIKRKLCFVLSILGNPSVVLLDEPSTGMDPEGQQQMWQAIRATFRNTERGALLTTHYMAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GIKRKLCFVLSILGNPSVVLLDEPSTGMDPEGQQQMWQAIRATFRNTERGALLTTHYMAE
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KA0 AEAVCDRVAIMVSGRLRCIGSIQHLKSKFGKDYLLEMKVKNLAQVEPLHAEILRLFPQAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AEAVCDRVAIMVSGRLRCIGSIQHLKSKFGKDYLLEMKVKNLAQVEPLHAEILRLFPQAA
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KA0 RQERYSSLMVYKLPVEDVQPLAQAFFKLEKVKQSFDLEEYSLSQSTLEQVFLELSKEQEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RQERYSSLMVYKLPVEDVQPLAQAFFKLEKVKQSFDLEEYSLSQSTLEQVFLELSKEQEL
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580 
pF1KA0 GDFEEDFDPSVKWKLLPQEEP
       :::::::::::::::::::::
CCDS11 GDFEEDFDPSVKWKLLPQEEP
             1570      1580 

>>CCDS74139.1 ABCA8 gene_id:10351|Hs108|chr17             (1621 aa)
 initn: 6504 init1: 6504 opt: 6504  Z-score: 7229.4  bits: 1350.5 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 10266; 97.5% identity (97.5% similar) in 1613 aa overlap (9-1581:9-1621)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MRKRKISVCQQTWALLCKNFLKKWRMKRESLMEWLNSLLLLLCLYIYPHSHQVNDFSSLL
               ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MRKRKISVCQQTWALLCKNFLKKWRMKRESLMEWLNSLLLLLCLYIYPHSHQVNDFSSLL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 TMDLGRVDTFNESRFSVVYTPVTNTTQQIMNKVASTPFLAGKEVLGLPDEESIKEFTANY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 TMDLGRVDTFNESRFSVVYTPVTNTTQQIMNKVASTPFLAGKEVLGLPDEESIKEFTANY
               70        80        90       100       110       120

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pF1KA0 PEEIVRVTFTNTYSYHLKFLLGHGMPAKKEHKDHTAHCYETNEDVYCEVSVFWKEGFVAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 PEEIVRVTFTNTYSYHLKFLLGHGMPAKKEHKDHTAHCYETNEDVYCEVSVFWKEGFVAL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 QAAINAAIIEITTNHSVMEELMSVTGKNMKMHSFIGQSGVITDLYLFSCIISFSSFIYYA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 QAAINAAIIEITTNHSVMEELMSVTGKNMKMHSFIGQSGVITDLYLFSCIISFSSFIYYA
              190       200       210       220       230       240

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pF1KA0 SVNVTRERKRMKALMTMMGLRDSAFWLSWGLLYAGFIFIMALFLALVIRSTQFIILSGFM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SVNVTRERKRMKALMTMMGLRDSAFWLSWGLLYAGFIFIMALFLALVIRSTQFIILSGFM
              250       260       270       280       290       300

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pF1KA0 VVFSLFLLYGLSLVALAFLMSILVKKSFLTGLVVFLLTVFWGCLGFTSLYRHLPASLEWI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 VVFSLFLLYGLSLVALAFLMSILVKKSFLTGLVVFLLTVFWGCLGFTSLYRHLPASLEWI
              310       320       330       340       350       360

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pF1KA0 LSLLSPFAFMLGMAQLLHLDYDLNSNAFPHPSDGSNLIVATNFMLAFDTCLYLALAIYFE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LSLLSPFAFMLGMAQLLHLDYDLNSNAFPHPSDGSNLIVATNFMLAFDTCLYLALAIYFE
              370       380       390       400       410       420

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pF1KA0 KILPNEYGHRRPPLFFLKSSFWSQTQKTDHVALEDEMDADPSFHDSFEQAPPEFQGKEAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 KILPNEYGHRRPPLFFLKSSFWSQTQKTDHVALEDEMDADPSFHDSFEQAPPEFQGKEAI
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pF1KA0 RIRNVTKEYKGKPDKIEALKDLVFDIYEGQITAILGHSGAGKSTLLNILSGLSVPTKGSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 RIRNVTKEYKGKPDKIEALKDLVFDIYEGQITAILGHSGAGKSTLLNILSGLSVPTKGSV
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pF1KA0 TIYNNKLSEMADLENLSKLTGVCPQSNVQFDFLTVRENLRLFAKIKGILPQEVDKEI---
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::   
CCDS74 TIYNNKLSEMADLENLSKLTGVCPQSNVQFDFLTVRENLRLFAKIKGILPQEVDKEIQRV
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pF1KA0 -------------------------------------FLLDEPTAGLDPFSRHQVWNLLK
                                            :::::::::::::::::::::::
CCDS74 LLELEMKNIQDVLAQNLSGGQKRKLTFGIAILGDPQIFLLDEPTAGLDPFSRHQVWNLLK
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              630       640       650       660       670       680
pF1KA0 ERKTDRVILFSTQFMDEADILADRKVFLSQGKLKCAGSSLFLKKKWGIGYHLSLQLNEIC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 ERKTDRVILFSTQFMDEADILADRKVFLSQGKLKCAGSSLFLKKKWGIGYHLSLQLNEIC
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pF1KA0 VEENITSLVKQHIPDAKLSAKSEGKLIYTLPLERTNKFPELYKDLDSYPDLGIENYGVSM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 VEENITSLVKQHIPDAKLSAKSEGKLIYTLPLERTNKFPELYKDLDSYPDLGIENYGVSM
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pF1KA0 TTLNEVFLKLEGKSTINESDIAILGEVQAEKADDTERLVEMEQVLSSLNKMRKTIGGVAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 TTLNEVFLKLEGKSTINESDIAILGEVQAEKADDTERLVEMEQVLSSLNKMRKTIGGVAL
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pF1KA0 WRQQICAIARVRLLKLKHERKALLALLLILMAGFCPLLVEYTMVKIYQNSYTWELSPHLY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 WRQQICAIARVRLLKLKHERKALLALLLILMAGFCPLLVEYTMVKIYQNSYTWELSPHLY
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pF1KA0 FLAPGQQPHDPLTQLLIINKTGASIDDFIQSVEHQNIALEVDAFGTRNGTDDPSYNGAIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 FLAPGQQPHDPLTQLLIINKTGASIDDFIQSVEHQNIALEVDAFGTRNGTDDPSYNGAIT
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pF1KA0 VCCNEKNYSFSLACNAKRLNCFPVLMDIVSNGLLGMVKPSVHIRTERSTFLENGQDNPIG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 VCCNEKNYSFSLACNAKRLNCFPVLMDIVSNGLLGMVKPSVHIRTERSTFLENGQDNPIG
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pF1KA0 FLAYIMFWLVLTSSCPPYIAMSSIDDYKNRARSQLRISGLSPSAYWFGQALVDVSLYFLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 FLAYIMFWLVLTSSCPPYIAMSSIDDYKNRARSQLRISGLSPSAYWFGQALVDVSLYFLV
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pF1KA0 FVFIYLMSYISNFEDMLLTIIHIIQIPCAVGYSFSLIFMTYVISFIFRKGRKNSGIWSFC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 FVFIYLMSYISNFEDMLLTIIHIIQIPCAVGYSFSLIFMTYVISFIFRKGRKNSGIWSFC
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pF1KA0 FYVVTVFSVAGFAFSIFESDIPFIFTFLIPPATMIGCLFLSSHLLFSSLFSEERMDVQPF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 FYVVTVFSVAGFAFSIFESDIPFIFTFLIPPATMIGCLFLSSHLLFSSLFSEERMDVQPF
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pF1KA0 LVFLIPFLHFIIFLFTLRCLEWKFGKKSMRKDPFFRISPRSSDVCQNPEEPEGEDEDVQM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LVFLIPFLHFIIFLFTLRCLEWKFGKKSMRKDPFFRISPRSSDVCQNPEEPEGEDEDVQM
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             1230      1240      1250      1260      1270      1280
pF1KA0 ERVRTANALNSTNFDEKPVIIASCLRKEYAGKRKGCFSKRKNKIATRNVSFCVRKGEVLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 ERVRTANALNSTNFDEKPVIIASCLRKEYAGKRKGCFSKRKNKIATRNVSFCVRKGEVLG
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pF1KA0 LLGHNGAGKSTSIKVITGDTKPTAGQVLLKGSGGGDALEFLGYCPQENALWPNLTVRQHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LLGHNGAGKSTSIKVITGDTKPTAGQVLLKGSGGGDALEFLGYCPQENALWPNLTVRQHL
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pF1KA0 EVYAAVKGLRKGDAEVAITRLVDALKLQDQLKSPVKTLSEGIKRKLCFVLSILGNPSVVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 EVYAAVKGLRKGDAEVAITRLVDALKLQDQLKSPVKTLSEGIKRKLCFVLSILGNPSVVL
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pF1KA0 LDEPSTGMDPEGQQQMWQAIRATFRNTERGALLTTHYMAEAEAVCDRVAIMVSGRLRCIG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LDEPSTGMDPEGQQQMWQAIRATFRNTERGALLTTHYMAEAEAVCDRVAIMVSGRLRCIG
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pF1KA0 SIQHLKSKFGKDYLLEMKVKNLAQVEPLHAEILRLFPQAARQERYSSLMVYKLPVEDVQP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SIQHLKSKFGKDYLLEMKVKNLAQVEPLHAEILRLFPQAARQERYSSLMVYKLPVEDVQP
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pF1KA0 LAQAFFKLEKVKQSFDLEEYSLSQSTLEQVFLELSKEQELGDFEEDFDPSVKWKLLPQEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LAQAFFKLEKVKQSFDLEEYSLSQSTLEQVFLELSKEQELGDFEEDFDPSVKWKLLPQEE
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pF1KA0 P
       :
CCDS74 P
        

>>CCDS74138.1 ABCA8 gene_id:10351|Hs108|chr17             (1616 aa)
 initn: 6456 init1: 3975 opt: 6450  Z-score: 7169.3  bits: 1339.4 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 10212; 97.2% identity (97.2% similar) in 1613 aa overlap (9-1581:9-1616)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MRKRKISVCQQTWALLCKNFLKKWRMKRESLMEWLNSLLLLLCLYIYPHSHQVNDFSSLL
               ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MRKRKISVCQQTWALLCKNFLKKWRMKRESLMEWLNSLLLLLCLYIYPHSHQVNDFSSLL
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pF1KA0 TMDLGRVDTFNESRFSVVYTPVTNTTQQIMNKVASTPFLAGKEVLGLPDEESIKEFTANY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 TMDLGRVDTFNESRFSVVYTPVTNTTQQIMNKVASTPFLAGKEVLGLPDEESIKEFTANY
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pF1KA0 PEEIVRVTFTNTYSYHLKFLLGHGMPAKKEHKDHTAHCYETNEDVYCEVSVFWKEGFVAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 PEEIVRVTFTNTYSYHLKFLLGHGMPAKKEHKDHTAHCYETNEDVYCEVSVFWKEGFVAL
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pF1KA0 QAAINAAIIEITTNHSVMEELMSVTGKNMKMHSFIGQSGVITDLYLFSCIISFSSFIYYA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 QAAINAAIIEITTNHSVMEELMSVTGKNMKMHSFIGQSGVITDLYLFSCIISFSSFIYYA
              190       200       210       220       230       240

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pF1KA0 SVNVTRERKRMKALMTMMGLRDSAFWLSWGLLYAGFIFIMALFLALVIRSTQFIILSGFM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SVNVTRERKRMKALMTMMGLRDSAFWLSWGLLYAGFIFIMALFLALVIRSTQFIILSGFM
              250       260       270       280       290       300

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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 VVFSLFLLYGLSLVALAFLMSILVKKSFLTGLVVFLLTVFWGCLGFTSLYRHLPASLEWI
              310       320       330       340       350       360

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pF1KA0 LSLLSPFAFMLGMAQLLHLDYDLNSNAFPHPSDGSNLIVATNFMLAFDTCLYLALAIYFE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LSLLSPFAFMLGMAQLLHLDYDLNSNAFPHPSDGSNLIVATNFMLAFDTCLYLALAIYFE
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pF1KA0 KILPNEYGHRRPPLFFLKSSFWSQTQKTDHVALEDEMDADPSFHDSFEQAPPEFQGKEAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 KILPNEYGHRRPPLFFLKSSFWSQTQKTDHVALEDEMDADPSFHDSFEQAPPEFQGKEAI
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pF1KA0 RIRNVTKEYKGKPDKIEALKDLVFDIYEGQITAILGHSGAGKSTLLNILSGLSVPTKGSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 RIRNVTKEYKGKPDKIEALKDLVFDIYEGQITAILGHSGAGKSTLLNILSGLSVPTKGSV
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pF1KA0 TIYNNKLSEMADLENLSKLTGVCPQSNVQFDFLTVRENLRLFAKIKGILPQEVDKEI---
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::   
CCDS74 TIYNNKLSEMADLENLSKLTGVCPQSNVQFDFLTVRENLRLFAKIKGILPQEVDKEIQRV
              550       560       570       580       590       600

                                            600       610       620
pF1KA0 -------------------------------------FLLDEPTAGLDPFSRHQVWNLLK
                                            :::::::::::::::::::::::
CCDS74 LLELEMKNIQDVLAQNLSGGQKRKLTFGIAILGDPQIFLLDEPTAGLDPFSRHQVWNLLK
              610       620       630       640       650       660

              630       640       650       660       670       680
pF1KA0 ERKTDRVILFSTQFMDEADILADRKVFLSQGKLKCAGSSLFLKKKWGIGYHLSLQLNEIC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 ERKTDRVILFSTQFMDEADILADRKVFLSQGKLKCAGSSLFLKKKWGIGYHLSLQLNEIC
              670       680       690       700       710       720

              690       700       710       720       730       740
pF1KA0 VEENITSLVKQHIPDAKLSAKSEGKLIYTLPLERTNKFPELYKDLDSYPDLGIENYGVSM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 VEENITSLVKQHIPDAKLSAKSEGKLIYTLPLERTNKFPELYKDLDSYPDLGIENYGVSM
              730       740       750       760       770       780

              750       760       770       780       790       800
pF1KA0 TTLNEVFLKLEGKSTINESDIAILGEVQAEKADDTERLVEMEQVLSSLNKMRKTIGGVAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 TTLNEVFLKLEGKSTINESDIAILGEVQAEKADDTERLVEMEQVLSSLNKMRKTIGGVAL
              790       800       810       820       830       840

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pF1KA0 WRQQICAIARVRLLKLKHERKALLALLLILMAGFCPLLVEYTMVKIYQNSYTWELSPHLY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 WRQQICAIARVRLLKLKHERKALLALLLILMAGFCPLLVEYTMVKIYQNSYTWELSPHLY
              850       860       870       880       890       900

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pF1KA0 FLAPGQQPHDPLTQLLIINKTGASIDDFIQSVEHQNIALEVDAFGTRNGTDDPSYNGAIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 FLAPGQQPHDPLTQLLIINKTGASIDDFIQSVEHQNIALEVDAFGTRNGTDDPSYNGAIT
              910       920       930       940       950       960

              930       940       950       960       970       980
pF1KA0 VCCNEKNYSFSLACNAKRLNCFPVLMDIVSNGLLGMVKPSVHIRTERSTFLENGQDNPIG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 VCCNEKNYSFSLACNAKRLNCFPVLMDIVSNGLLGMVKPSVHIRTERSTFLENGQDNPIG
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pF1KA0 FLAYIMFWLVLTSSCPPYIAMSSIDDYKNRARSQLRISGLSPSAYWFGQALVDVSLYFLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 FLAYIMFWLVLTSSCPPYIAMSSIDDYKNRARSQLRISGLSPSAYWFGQALVDVSLYFLV
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             1050      1060      1070      1080      1090      1100
pF1KA0 FVFIYLMSYISNFEDMLLTIIHIIQIPCAVGYSFSLIFMTYVISFIFRKGRKNSGIWSFC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 FVFIYLMSYISNFEDMLLTIIHIIQIPCAVGYSFSLIFMTYVISFIFRKGRKNSGIWSFC
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pF1KA0 FYVVTVFSVAGFAFSIFESDIPFIFTFLIPPATMIGCLFLSSHLLFSSLFSEERMDVQPF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 FYVVTVFSVAGFAFSIFESDIPFIFTFLIPPATMIGCLFLSSHLLFSSLFSEERMDVQPF
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pF1KA0 LVFLIPFLHFIIFLFTLRCLEWKFGKKSMRKDPFFRISPRSSDVCQNPEEPEGEDEDVQM
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::     ::::::::::::::::::::
CCDS74 LVFLIPFLHFIIFLFTLRCLEWKFGKKSMRKDPFF-----SSDVCQNPEEPEGEDEDVQM
             1210      1220      1230           1240      1250     

             1230      1240      1250      1260      1270      1280
pF1KA0 ERVRTANALNSTNFDEKPVIIASCLRKEYAGKRKGCFSKRKNKIATRNVSFCVRKGEVLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 ERVRTANALNSTNFDEKPVIIASCLRKEYAGKRKGCFSKRKNKIATRNVSFCVRKGEVLG
        1260      1270      1280      1290      1300      1310     

             1290      1300      1310      1320      1330      1340
pF1KA0 LLGHNGAGKSTSIKVITGDTKPTAGQVLLKGSGGGDALEFLGYCPQENALWPNLTVRQHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LLGHNGAGKSTSIKVITGDTKPTAGQVLLKGSGGGDALEFLGYCPQENALWPNLTVRQHL
        1320      1330      1340      1350      1360      1370     

             1350      1360      1370      1380      1390      1400
pF1KA0 EVYAAVKGLRKGDAEVAITRLVDALKLQDQLKSPVKTLSEGIKRKLCFVLSILGNPSVVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 EVYAAVKGLRKGDAEVAITRLVDALKLQDQLKSPVKTLSEGIKRKLCFVLSILGNPSVVL
        1380      1390      1400      1410      1420      1430     

             1410      1420      1430      1440      1450      1460
pF1KA0 LDEPSTGMDPEGQQQMWQAIRATFRNTERGALLTTHYMAEAEAVCDRVAIMVSGRLRCIG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LDEPSTGMDPEGQQQMWQAIRATFRNTERGALLTTHYMAEAEAVCDRVAIMVSGRLRCIG
        1440      1450      1460      1470      1480      1490     

             1470      1480      1490      1500      1510      1520
pF1KA0 SIQHLKSKFGKDYLLEMKVKNLAQVEPLHAEILRLFPQAARQERYSSLMVYKLPVEDVQP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SIQHLKSKFGKDYLLEMKVKNLAQVEPLHAEILRLFPQAARQERYSSLMVYKLPVEDVQP
        1500      1510      1520      1530      1540      1550     

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pF1KA0 LAQAFFKLEKVKQSFDLEEYSLSQSTLEQVFLELSKEQELGDFEEDFDPSVKWKLLPQEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LAQAFFKLEKVKQSFDLEEYSLSQSTLEQVFLELSKEQELGDFEEDFDPSVKWKLLPQEE
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pF1KA0 P
       :
CCDS74 P
        

>>CCDS11681.1 ABCA9 gene_id:10350|Hs108|chr17             (1624 aa)
 initn: 5251 init1: 2514 opt: 2721  Z-score: 3018.7  bits: 571.4 E(32554): 8e-162
Smith-Waterman score: 7440; 69.5% identity (86.6% similar) in 1615 aa overlap (1-1571:1-1614)

               10        20        30        40         50         
pF1KA0 MRKRKISVCQQTWALLCKNFLKKWRMKRESLMEWLNSLLLLLCLYIY-PHSHQVNDFSSL
       : ::..:: :::::::::: ::::::::..:.::: :.::.: ::..  . :::.:  ..
CCDS11 MSKRRMSVGQQTWALLCKNCLKKWRMKRQTLLEWLFSFLLVLFLYLFFSNLHQVHDTPQM
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      60        70        80        90       100       110         
pF1KA0 LTMDLGRVDTFNESRFSVVYTPVTNTTQQIMNKVASTPFLAGKEVLGLPDEESIKEFTAN
        .:::::::.::.. . ....: ..:::.:::::::.::: :. ..: :::.:. :.  :
CCDS11 SSMDLGRVDSFNDTNYVIAFAPESKTTQEIMNKVASAPFLKGRTIMGWPDEKSMDELDLN
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KA0 YPEEIVRVTFTNTYSYHLKFLLGHGMPAKKEHKDHTAHCYETNEDVYCEVSVFWKEGFVA
       :  . ::: ::.:.::::::  :: .:  :::.::.:::  .:: . :: : ::..::::
CCDS11 YSIDAVRVIFTDTFSYHLKFSWGHRIPMMKEHRDHSAHCQAVNEKMKCEGSEFWEKGFVA
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KA0 LQAAINAAIIEITTNHSVMEELMSVTGKNMKMHSFIGQSGVITDLYLFSCIISFSSFIYY
       .:::::::::::.:::::::.:::::: .::.  :..:.:: ::...: ::::::.::::
CCDS11 FQAAINAAIIEIATNHSVMEQLMSVTGVHMKILPFVAQGGVATDFFIFFCIISFSTFIYY
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270       280       290         
pF1KA0 ASVNVTRERKRMKALMTMMGLRDSAFWLSWGLLYAGFIFIMALFLALVIRSTQFIILSGF
       .:::::.::. . .::::::::.:::::::::.:::::.::: ..::...:.:...:.::
CCDS11 VSVNVTQERQYITSLMTMMGLRESAFWLSWGLMYAGFILIMATLMALIVKSAQIVVLTGF
              250       260       270       280       290       300

     300       310       320       330       340       350         
pF1KA0 MVVFSLFLLYGLSLVALAFLMSILVKKSFLTGLVVFLLTVFWGCLGFTSLYRHLPASLEW
       ..::.:::::::::..::::::.:.:: :::::::::: :::: ::: .:: .::: :::
CCDS11 VMVFTLFLLYGLSLITLAFLMSVLIKKPFLTGLVVFLLIVFWGILGFPALYTRLPAFLEW
              310       320       330       340       350       360

     360       370       380       390       400       410         
pF1KA0 ILSLLSPFAFMLGMAQLLHLDYDLNSNAFPHPSDGSNLIVATNFMLAFDTCLYLALAIYF
        : ::::::: .:::::.:::::.::::    :..  ::.:: :::.::: :::.:..::
CCDS11 TLCLLSPFAFTVGMAQLIHLDYDVNSNAHLDSSQNPYLIIATLFMLVFDTLLYLVLTLYF
              370       380       390       400       410       420

     420       430       440       450       460       470         
pF1KA0 EKILPNEYGHRRPPLFFLKSSFWSQTQKTDHVALEDEMDADPSFHDSFEQAPPEFQGKEA
       .:::: :::::  ::::::: :: :  ...::.::.: :.::. .: :: . ::: ::::
CCDS11 DKILPAEYGHRCSPLFFLKSCFWFQHGRANHVVLENETDSDPTPNDCFEPVSPEFCGKEA
              430       440       450       460       470       480

     480       490       500       510       520       530         
pF1KA0 IRIRNVTKEYKGKPDKIEALKDLVFDIYEGQITAILGHSGAGKSTLLNILSGLSVPTKGS
       :::.:. ::: :: ...:::: .:::::::::::.::::::::.:::::::::::::.::
CCDS11 IRIKNLKKEYAGKCERVEALKGVVFDIYEGQITALLGHSGAGKTTLLNILSGLSVPTSGS
              490       500       510       520       530       540

     540       550       560       570       580       590         
pF1KA0 VTIYNNKLSEMADLENLSKLTGVCPQSNVQFDFLTVRENLRLFAKIKGILPQEVDKEI--
       ::.::. ::.:::.::.::.:: :::::::: ::::.::::::::::::::.::.::.  
CCDS11 VTVYNHTLSRMADIENISKFTGFCPQSNVQFGFLTVKENLRLFAKIKGILPHEVEKEVQR
              550       560       570       580       590       600

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pF1KA0 --------------------------------------FLLDEPTAGLDPFSRHQVWNLL
                                             .:::::::::::.:::..::::
CCDS11 VVQELEMENIQDILAQNLSGGQNRKLTFGIAILGDPQVLLLDEPTAGLDPLSRHRIWNLL
              610       620       630       640       650       660

     620       630       640       650       660       670         
pF1KA0 KERKTDRVILFSTQFMDEADILADRKVFLSQGKLKCAGSSLFLKKKWGIGYHLSLQLNEI
       :: :.::::::::::.::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::::.::: 
CCDS11 KEGKSDRVILFSTQFIDEADILADRKVFISNGKLKCAGSSLFLKKKWGIGYHLSLHLNER
              670       680       690       700       710       720

     680       690       700       710       720       730         
pF1KA0 CVEENITSLVKQHIPDAKLSAKSEGKLIYTLPLERTNKFPELYKDLDSYPDLGIENYGVS
       :  :.::::::::: ::::.:.:: ::.: :::::::::::::.:::   . :::.::::
CCDS11 CDPESITSLVKQHISDAKLTAQSEEKLVYILPLERTNKFPELYRDLDRCSNQGIEDYGVS
              730       740       750       760       770       780

     740       750       760       770       780       790         
pF1KA0 MTTLNEVFLKLEGKSTINESDIAILGEVQAEKADDTERLVEMEQVLSSLNKMRKTIGGVA
       .::::::::::::::::.::::.: :..:.. : :   :::.::::::... ::::.:::
CCDS11 ITTLNEVFLKLEGKSTIDESDIGIWGQLQTDGAKDIGSLVELEQVLSSFHETRKTISGVA
              790       800       810       820       830       840

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pF1KA0 LWRQQICAIARVRLLKLKHERKALLALLLILMAGFCPLLVEYTMVKIYQNSYTWELSPHL
       :::::.::::.::.::::.:::.: ..::..  .: : :.:. . . ::.:: :::::. 
CCDS11 LWRQQVCAIAKVRFLKLKKERKSLWTILLLFGISFIPQLLEHLFYESYQKSYPWELSPNT
              850       860       870       880       890       900

     860       870       880       890       900       910         
pF1KA0 YFLAPGQQPHDPLTQLLIINKTGASIDDFIQSVEHQNIALEVDAFGTRNGTDDPSYNGAI
       :::.:::::.::::.::.:::::..::.:..:...::::.::::::::::::::::::::
CCDS11 YFLSPGQQPQDPLTHLLVINKTGSTIDNFLHSLRRQNIAIEVDAFGTRNGTDDPSYNGAI
              910       920       930       940       950       960

     920       930       940       950       960       970         
pF1KA0 TVCCNEKNYSFSLACNAKRLNCFPVLMDIVSNGLLGMVKPSVHIRTERSTFLENGQDNPI
        :  .::.. ::.:::.:::::::::.:..::::::. . : ::.:.::::.:. .:   
CCDS11 IVSGDEKDHRFSIACNTKRLNCFPVLLDVISNGLLGIFNSSEHIQTDRSTFFEEHMDYEY
              970       980       990      1000      1010      1020

     980       990      1000      1010      1020      1030         
pF1KA0 GFLAYIMFWLVLTSSCPPYIAMSSIDDYKNRARSQLRISGLSPSAYWFGQALVDVSLYFL
       :. .  .::. ...:  :::::::: :::..:.:::::::: ::::::::::::::::::
CCDS11 GYRSNTFFWIPMAASFTPYIAMSSIGDYKKKAHSQLRISGLYPSAYWFGQALVDVSLYFL
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

    1040      1050      1060       1070      1080      1090        
pF1KA0 VFVFIYLMSYISNFEDMLLTIIHI-IQIPCAVGYSFSLIFMTYVISFIFRKGRKNSGIWS
       ..... .:.:: . :.... : .. ::: :..::  ::.:.:::::::::.:::::::::
CCDS11 ILLLMQIMDYIFSPEEIIFIIQNLLIQILCSIGYVSSLVFLTYVISFIFRNGRKNSGIWS
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

     1100      1110      1120      1130      1140        1150      
pF1KA0 FCFYVVTVFSVAGFAFSIFESDIPFIFTFLIPPATMIGCLFLSSHLLFSSL--FSEERMD
       : : .:..::...  .. .     :. :.:::: :.:: ::. :..  .:.  ..  . .
CCDS11 FFFLIVVIFSIVATDLNEYGFLGLFFGTMLIPPFTLIGSLFIFSEISPDSMDYLGASESE
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

       1160      1170      1180      1190      1200      1210      
pF1KA0 VQPFLVFLIPFLHFIIFLFTLRCLEWKFGKKSMRKDPFFRISPRSSDVCQNPEEPEGEDE
       .  .:..:::.:::.:::: ::::: .  :: ::::: :::::::. .  ::::::::.:
CCDS11 IV-YLALLIPYLHFLIFLFILRCLEMNCRKKLMRKDPVFRISPRSNAIFPNPEEPEGEEE
              1210      1220      1230      1240      1250         

       1220      1230      1240      1250      1260      1270      
pF1KA0 DVQMERVRTANALNSTNFDEKPVIIASCLRKEYAGKRKGCFSKRKNKIATRNVSFCVRKG
       :.::::.::.::.   .::: :::::::::::::::.:.::::::.:::::::::::.::
CCDS11 DIQMERMRTVNAMAVRDFDETPVIIASCLRKEYAGKKKNCFSKRKKKIATRNVSFCVKKG
    1260      1270      1280      1290      1300      1310         

       1280      1290      1300      1310      1320      1330      
pF1KA0 EVLGLLGHNGAGKSTSIKVITGDTKPTAGQVLLKGSGGGDALEFLGYCPQENALWPNLTV
       ::.::::::::::::.::.::::::::::::.:::::::. : :::::::::::::::::
CCDS11 EVIGLLGHNGAGKSTTIKMITGDTKPTAGQVILKGSGGGEPLGFLGYCPQENALWPNLTV
    1320      1330      1340      1350      1360      1370         

       1340      1350      1360      1370      1380      1390      
pF1KA0 RQHLEVYAAVKGLRKGDAEVAITRLVDALKLQDQLKSPVKTLSEGIKRKLCFVLSILGNP
       :::::::::::::::::: .::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS11 RQHLEVYAAVKGLRKGDAMIAITRLVDALKLQDQLKAPVKTLSEGIKRKLCFVLSILGNP
    1380      1390      1400      1410      1420      1430         

       1400      1410      1420      1430      1440      1450      
pF1KA0 SVVLLDEPSTGMDPEGQQQMWQAIRATFRNTERGALLTTHYMAEAEAVCDRVAIMVSGRL
       ::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SVVLLDEPSTGMDPEGQQQMWQVIRATFRNTERGALLTTHYMAEAEAVCDRVAIMVSGRL
    1440      1450      1460      1470      1480      1490         

       1460      1470      1480      1490      1500      1510      
pF1KA0 RCIGSIQHLKSKFGKDYLLEMKVKNLAQVEPLHAEILRLFPQAARQERYSSLMVYKLPVE
       ::::::::::::::::::::::.:::::.:::::::::::::::.:::.:::::::::::
CCDS11 RCIGSIQHLKSKFGKDYLLEMKLKNLAQMEPLHAEILRLFPQAAQQERFSSLMVYKLPVE
    1500      1510      1520      1530      1540      1550         

       1520      1530      1540      1550      1560      1570      
pF1KA0 DVQPLAQAFFKLEKVKQSFDLEEYSLSQSTLEQVFLELSKEQELGDFEEDFDPSVKWKLL
       ::.::.::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::     
CCDS11 DVRPLSQAFFKLEIVKQSFDLEEYSLSQSTLEQVFLELSKEQELGDLEEDFDPSVKWKLL
    1560      1570      1580      1590      1600      1610         

       1580 
pF1KA0 PQEEP
            
CCDS11 LQEEP
    1620    

>>CCDS11683.1 ABCA6 gene_id:23460|Hs108|chr17             (1617 aa)
 initn: 4821 init1: 1808 opt: 2261  Z-score: 2506.7  bits: 476.7 E(32554): 2.6e-133
Smith-Waterman score: 5943; 57.7% identity (79.4% similar) in 1625 aa overlap (1-1576:1-1611)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MRKRKISVCQQTWALLCKNFLKKWRMKRESLMEWLNSLLLLLCLYIYPHSHQVNDFSSLL
       :  .. :: ::: ::::::::::::::::::.::  :.:: ::. ..  : .  .: .. 
CCDS11 MNMKQKSVYQQTKALLCKNFLKKWRMKRESLLEWGLSILLGLCIALFSSSMRNVQFPGMA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110          
pF1KA0 TMDLGRVDTFNESRFSVVYTPVTNTTQQIMNKVASTPFLAGKEVLGLPDEESIKE-FTAN
        ..::::: :: : . :::::..: :::::::.: .:.: :  :.: :..  . : .  :
CCDS11 PQNLGRVDKFNSSSLMVVYTPISNLTQQIMNKTALAPLLKGTSVIGAPNKTHMDEILLEN
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KA0 YPEEIVRVTFTNTYSYHLKFLLGHGMPAKKEHKDHTAHCYETNEDVYCEVSVFWKEGFVA
        :  .  . :..:.::.: :. :.. :  ::  : .:::..   .  : .. .:..::::
CCDS11 LPYAM-GIIFNETFSYKLIFFQGYNSPLWKE--DFSAHCWDGYGEFSCTLTKYWNRGFVA
               130       140       150         160       170       

     180       190       200       210       220       230         
pF1KA0 LQAAINAAIIEITTNHSVMEELMSVTGKNMKMHSFIGQSGVITDLYLFSCIISFSSFIYY
       ::.:::.::::::::: :::::::::. .::   :: .. . ......  .. :: ..:.
CCDS11 LQTAINTAIIEITTNHPVMEELMSVTAITMKTLPFITKNLLHNEMFILFFLLHFSPLVYF
       180       190       200       210       220       230       

     240       250       260       270       280       290         
pF1KA0 ASVNVTRERKRMKALMTMMGLRDSAFWLSWGLLYAGFIFIMALFLALVIRSTQFIILSGF
        :.:::.:::. : :: ::::.::::::::::.:::::::...:....:  ::.:...::
CCDS11 ISLNVTKERKKSKNLMKMMGLQDSAFWLSWGLIYAGFIFIISIFVTIIITFTQIIVMTGF
       240       250       260       270       280       290       

     300       310       320       330       340       350         
pF1KA0 MVVFSLFLLYGLSLVALAFLMSILVKKSFLTGLVVFLLTVFWGCLGFTSLYRHLPASLEW
       ::.: ::.:::::::::.::::.:.::. ::.:::::::.:::::::: .:..::.::::
CCDS11 MVIFILFFLYGLSLVALVFLMSVLLKKAVLTNLVVFLLTLFWGCLGFTVFYEQLPSSLEW
       300       310       320       330       340       350       

     360       370       380       390       400       410         
pF1KA0 ILSLLSPFAFMLGMAQLLHLDYDLNSNAFPHPSDGSNLIVATNFMLAFDTCLYLALAIYF
       ::.. :::::  :: :...:::.::.  :: ::  :  ..::  :: .:  .:: ::.::
CCDS11 ILNICSPFAFTTGMIQIIKLDYNLNGVIFPDPSGDSYTMIATFSMLLLDGLIYLLLALYF
       360       370       380       390       400       410       

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pF1KA0 EKILPNEYGHRR--PPLFFLKSSFWSQTQKTDHVALEDEMDADPSFHDSFEQAPPEFQGK
       .::::  :: .:   :::::.::   : :.:.  ..: :.::.    : :: . ::::::
CCDS11 DKILP--YGDERHYSPLFFLNSSSCFQHQRTNAKVIEKEIDAEHPSDDYFEPVAPEFQGK
       420         430       440       450       460       470     

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pF1KA0 EAIRIRNVTKEYKGKPDKIEALKDLVFDIYEGQITAILGHSGAGKSTLLNILSGLSVPTK
       :::::::: ::::::  :.:::: :.::::::::::::::::::::.:::::.::::::.
CCDS11 EAIRIRNVKKEYKGKSGKVEALKGLLFDIYEGQITAILGHSGAGKSSLLNILNGLSVPTE
         480       490       500       510       520       530     

       540       550       560       570       580           590   
pF1KA0 GSVTIYNNKLSEMADLENLSKLTGVCPQSNVQFDFLTVRENLRLFAKIKGI----LPQEV
       :::::::..:::: :::.. :.:::::: :::::.:::.::: ::::::::    . :::
CCDS11 GSVTIYNKNLSEMQDLEEIRKITGVCPQFNVQFDILTVKENLSLFAKIKGIHLKEVEQEV
         540       550       560       570       580       590     

                                               600       610       
pF1KA0 ------------------------------------DKEIFLLDEPTAGLDPFSRHQVWN
                                           : .:.::::::.::::::: :::.
CCDS11 QRILLELDMQNIQDNLAKHLSEGQKRKLTFGITILGDPQILLLDEPTTGLDPFSRDQVWS
         600       610       620       630       640       650     

       620       630       640       650       660       670       
pF1KA0 LLKERKTDRVILFSTQFMDEADILADRKVFLSQGKLKCAGSSLFLKKKWGIGYHLSLQLN
       ::.::..:.::::::: ::::::::::::..:.:.:::::::.:::..::.::::::. :
CCDS11 LLRERRADHVILFSTQSMDEADILADRKVIMSNGRLKCAGSSMFLKRRWGLGYHLSLHRN
         660       670       680       690       700       710     

       680       690       700       710       720       730       
pF1KA0 EICVEENITSLVKQHIPDAKLSAKSEGKLIYTLPLERTNKFPELYKDLDSYPDLGIENYG
       :::  :.:::.. .:::::::..... ::.::::::::: ::.:..:::.  : :. .: 
CCDS11 EICNPEQITSFITHHIPDAKLKTENKEKLVYTLPLERTNTFPDLFSDLDKCSDQGVTGYD
         720       730       740       750       760       770     

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pF1KA0 VSMTTLNEVFLKLEGKSTINESDIAILGEVQAEKADDTERLVEMEQVLSSLNKMRKTIGG
       .::.::::::.::::.::: :.:.      :.:   :.: : ::: . ::...:. ... 
CCDS11 ISMSTLNEVFMKLEGQSTI-EQDFE-----QVEMIRDSESLNEMELAHSSFSEMQTAVSD
         780       790             800       810       820         

       800       810       820       830       840       850       
pF1KA0 VALWRQQICAIARVRLLKLKHERKALLALLLILMAGFCPLLVEYTMVKIYQNSYTWELSP
       ..:::.:. :.::.:.::::.. :.::.:::..  .. ::.::  :  . ...  ::.. 
CCDS11 MGLWRMQVFAMARLRFLKLKRQTKVLLTLLLVFGIAIFPLIVENIMYAMLNEKIDWEFKN
     830       840       850       860       870       880         

       860       870       880       890       900       910       
pF1KA0 HLYFLAPGQQPHDPLTQLLIINKTGASIDDFIQSVEHQNIALEVDAFGTRNGTDDPSYNG
       .::::.::: :..: :.:::::.: ..:.:::.:..:::: :::: : .:::::  ::::
CCDS11 ELYFLSPGQLPQEPRTSLLIINNTESNIEDFIKSLKHQNILLEVDDFENRNGTDGLSYNG
     890       900       910       920       930       940         

       920       930       940       950       960       970       
pF1KA0 AITVCCNEKNYSFSLACNAKRLNCFPVLMDIVSNGLLGMVKPSVHIRTERSTFLENGQDN
       :: :  ..:.: ::..::.:::.:::.::.:.::::: : . . ::: : : :  .    
CCDS11 AIIVSGKQKDYRFSVVCNTKRLHCFPILMNIISNGLLQMFNHTQHIRIESSPFPLSHIGL
     950       960       970       980       990      1000         

       980       990      1000      1010      1020      1030       
pF1KA0 PIGFLAYIMFWLVLTSSCPPYIAMSSIDDYKNRARSQLRISGLSPSAYWFGQALVDVSLY
         :.    .: ...  :  :::.:.::.:::. :.::: ::::  :::: ::::::::..
CCDS11 WTGLPDGSFFLFLVLCSISPYITMGSISDYKKNAKSQLWISGLYTSAYWCGQALVDVSFF
    1010      1020      1030      1040      1050      1060         

      1040      1050        1060      1070      1080      1090     
pF1KA0 FLVFVFIYLMSYISNFEDMLLT--IIHIIQIPCAVGYSFSLIFMTYVISFIFRKGRKNSG
       .:.....::. :: :.. .:.:  :.  . :  . ::. ::.:. :.::::::: :::::
CCDS11 ILILLLMYLIFYIENMQYLLITSQIVFALVI-VTPGYAASLVFFIYMISFIFRKRRKNSG
    1070      1080      1090      1100       1110      1120        

        1100      1110      1120      1130       1140       1150   
pF1KA0 IWSFCFYVVTVFSVAGFAFSIFESDIPFIFTFLIPPATMIGC-LFLSSH-LLFSSLFSEE
       .::: :. ....  .   .. :. .: .    :.:  :..:   ::  .       : : 
CCDS11 LWSFYFFFASTIMFSITLINHFDLSILITTMVLVPSYTLLGFKTFLEVRDQEHYREFPEA
     1130      1140      1150      1160      1170      1180        

            1160      1170      1180      1190      1200      1210 
pF1KA0 RMDVQP--FLVFLIPFLHFIIFLFTLRCLEWKFGKKSMRKDPFFRISPRSSDVCQNPEEP
        ....   ::: .::... ..:.:.:::.: : ::: ::::: :::::.: :.  :::::
CCDS11 NFELSATDFLVCFIPYFQTLLFVFVLRCMELKCGKKRMRKDPVFRISPQSRDAKPNPEEP
     1190      1200      1210      1220      1230      1240        

            1220      1230      1240      1250      1260      1270 
pF1KA0 EGEDEDVQMERVRTANALNSTNFDEKPVIIASCLRKEYAGKRKGCFSKRKNKIATRNVSF
         ::::.: ::.:::.::... .:::::::::::.:::::..:.::::::.:::.::.::
CCDS11 IDEDEDIQTERIRTATALTTSILDEKPVIIASCLHKEYAGQKKSCFSKRKKKIAARNISF
     1250      1260      1270      1280      1290      1300        

            1280      1290      1300      1310      1320      1330 
pF1KA0 CVRKGEVLGLLGHNGAGKSTSIKVITGDTKPTAGQVLLKGSGGGDALEFLGYCPQENALW
       ::..::.::::: ::::::.::..:.: ::::::.: ::: ..  .:  ::::::::.::
CCDS11 CVQEGEILGLLGPNGAGKSSSIRMISGITKPTAGEVELKGCSS--VLGHLGYCPQENVLW
     1310      1320      1330      1340      1350        1360      

            1340      1350      1360      1370      1380      1390 
pF1KA0 PNLTVRQHLEVYAAVKGLRKGDAEVAITRLVDALKLQDQLKSPVKTLSEGIKRKLCFVLS
       : ::.:.:::::::::::::.::..::.:::.:.::..::. ::. :. :: ::::::::
CCDS11 PMLTLREHLEVYAAVKGLRKADARLAIARLVSAFKLHEQLNVPVQKLTAGITRKLCFVLS
       1370      1380      1390      1400      1410      1420      

            1400      1410      1420      1430      1440      1450 
pF1KA0 ILGNPSVVLLDEPSTGMDPEGQQQMWQAIRATFRNTERGALLTTHYMAEAEAVCDRVAIM
       .:::  :.::::::::.:: :::::::::.:. .:::::.::::: .:::::.:::::::
CCDS11 LLGNSPVLLLDEPSTGIDPTGQQQMWQAIQAVVKNTERGVLLTTHNLAEAEALCDRVAIM
       1430      1440      1450      1460      1470      1480      

            1460      1470      1480      1490      1500      1510 
pF1KA0 VSGRLRCIGSIQHLKSKFGKDYLLEMKVKNLAQVEPLHAEILRLFPQAARQERYSSLMVY
       :::::::::::::::.:.::::.::.:::. .::  .:.:::.:::::: :::::::..:
CCDS11 VSGRLRCIGSIQHLKNKLGKDYILELKVKETSQVTLVHTEILKLFPQAAGQERYSSLLTY
       1490      1500      1510      1520      1530      1540      

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pF1KA0 KLPVEDVQPLAQAFFKLEKVKQSFDLEEYSLSQSTLEQVFLELSKEQELGDFEEDFDPSV
       :::: :: ::.:.: ::: ::..:.:::::::: :::.::::::::::.:.:.:..: ..
CCDS11 KLPVADVYPLSQTFHKLEAVKHNFNLEEYSLSQCTLEKVFLELSKEQEVGNFDEEIDTTM
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            1580  
pF1KA0 KWKLLPQEEP 
       .::::      
CCDS11 RWKLLPHSDEP
       1610       

>>CCDS11684.1 ABCA10 gene_id:10349|Hs108|chr17            (1543 aa)
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                                     :::.: . :. :. :.: ::::..  :.  
CCDS11                               MNKMALASFMKGRTVIGTPDEETMDIELPK
                                             10        20        30

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pF1KA0 NYPEEIVRVTFTNTYSYHLKFLLGHGMPAKKEHKDHTAHCYETNEDVYCEVSVFWKEGFV
       .: .:.: : :..:.::.:::  :. .:. :::...: ::.  . ...: .. .: .:::
CCDS11 KY-HEMVGVIFSDTFSYRLKFNWGYRIPVIKEHSEYTEHCWAMHGEIFCYLAKYWLKGFV
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pF1KA0 ALQAAINAAIIEITTNHSVMEELMSVTGKNMKMHSFIGQSGVITDLYLFSCIISFSSFIY
       :.::::::::::.:::::::::: :: : :::.  ::... .... . :.:..:::::::
CCDS11 AFQAAINAAIIEVTTNHSVMEELTSVIGINMKIPPFISKGEIMNEWFHFTCLVSFSSFIY
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pF1KA0 YASVNVTRERKRMKALMTMMGLRDSAFWLSWGLLYAGFIFIMALFLALVIRSTQFIILSG
       .::.::.::: ..: :::.::::.::::::::: :  :::::..:.:::: :  ... .:
CCDS11 FASLNVARERGKFKKLMTVMGLRESAFWLSWGLTYICFIFIMSIFMALVITSIPIVFHTG
     150       160       170       180       190       200         

      300       310       320       330       340       350        
pF1KA0 FMVVFSLFLLYGLSLVALAFLMSILVKKSFLTGLVVFLLTVFWGCLGFTSLYRHLPASLE
       :::.:.:. ::::::.:::::::.:..: .:.::. ::.:::::::::: :::.:: :: 
CCDS11 FMVIFTLYSLYGLSLIALAFLMSVLIRKPMLAGLAGFLFTVFWGCLGFTVLYRQLPLSLG
     210       220       230       240       250       260         

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pF1KA0 WILSLLSPFAFMLGMAQLLHLDYDLNSNAFPHPSDGSNLIVATNFMLAFDTCLYLALAIY
       :.:::::::::  ::::. :::  :..  :: ::  :  ..:: :.::::: .:: ...:
CCDS11 WVLSLLSPFAFTAGMAQITHLDNYLSGVIFPDPSGDSYKMIATFFILAFDTLFYLIFTLY
     270       280       290       300       310       320         

      420       430       440       450       460       470        
pF1KA0 FEKILPNEYGHRRPPLFFLKSSFWSQTQKTDHVALEDEMDADPSFHDSFEQAPPEFQGKE
       ::..::.. ::   :::::::::::. :.: :  .:.:.. . :  :::: . :::.:::
CCDS11 FERVLPDKDGHGDSPLFFLKSSFWSKHQNTHHEIFENEINPEHSSDDSFEPVSPEFHGKE
     330       340       350       360       370       380         

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pF1KA0 AIRIRNVTKEYKGKPDKIEALKDLVFDIYEGQITAILGHSGAGKSTLLNILSGLSVPTKG
       ::::::: :::.::  :.:::. . ::::::::::::::.:::::::::::::::: :.:
CCDS11 AIRIRNVIKEYNGKTGKVEALQGIFFDIYEGQITAILGHNGAGKSTLLNILSGLSVSTEG
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       :.::::..:::..:.:.. :  : ::: : ::::::::::::.::::::: :.::..:. 
CCDS11 SATIYNTQLSEITDMEEIRKNIGFCPQFNFQFDFLTVRENLRVFAKIKGIQPKEVEQEVK
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pF1KA0 ---------------------------------------FLLDEPTAGLDPFSRHQVWNL
                                              .:::::::::::::::.::.:
CCDS11 RIIMELDMQSIQDIIAKKLSGGQKRKLTLGIAILGDPQVLLLDEPTAGLDPFSRHRVWSL
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       :::.:.::.::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.::::::::::. ::
CCDS11 LKEHKVDRLILFSTQFMDEADILADRKVFLSNGKLKCAGSSLFLKRKWGIGYHLSLHRNE
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       .:  :.::::.:::::::::...:: ::.:.::::.:::::.::.:::.  : ::.::.:
CCDS11 MCDTEKITSLIKQHIPDAKLTTESEEKLVYSLPLEKTNKFPDLYSDLDKCSDQGIRNYAV
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       :.:.::::::.:::::.:.: :. :  . . . . .:    :::::: :: . ::.....
CCDS11 SVTSLNEVFLNLEGKSAIDEPDFDIGKQEKIHVTRNTGDESEMEQVLCSLPETRKAVSSA
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pF1KA0 ALWRQQICAIARVRLLKLKHERKALLALLLILMAGFCPLLVEYTMVKIYQNSYTWELSPH
       ::::.:: :.: .:.:::..::.::: :::.:  .: :...:  : :. .... ::.:: 
CCDS11 ALWRRQIYAVATLRFLKLRRERRALLCLLLVLGIAFIPIILEKIMYKVTRETHCWEFSPS
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pF1KA0 LYFLAPGQQPHDPLTQLLIINKTGASIDDFIQSVEHQNIALEVDAFGTRNGTDDPSYNGA
       .:::.  : :. :::.:::.:.::..:.:...:.. :.:.::.: : .:::.::::::::
CCDS11 MYFLSLEQIPKTPLTSLLIVNNTGSNIEDLVHSLKCQDIVLEIDDFRNRNGSDDPSYNGA
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pF1KA0 ITVCCNEKNYSFSLACNAKRLNCFPVLMDIVSNGLLGMVKPSVHIRTERSTFLENGQDNP
       : :  ..:.: ::.:::.:.:::::::: ::::.:.:. . .  :. : ..: ..     
CCDS11 IIVSGDQKDYRFSVACNTKKLNCFPVLMGIVSNALMGIFNFTELIQMESTSFSRDDIVLD
     870       880       890       900       910       920         

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pF1KA0 IGFLAYIMFWLVLTSSCPPYIAMSSIDDYKNRARSQLRISGLSPSAYWFGQALVDVSLYF
       .::.   .: :..:.   :.:.::::.:::. ..::: :::: ::::: ::::::. :::
CCDS11 LGFIDGSIFLLLITNCVSPFIGMSSISDYKKNVQSQLWISGLWPSAYWCGQALVDIPLYF
     930       940       950       960       970       980         

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pF1KA0 LVFVFIYLMSYISNFEDMLLTIIHIIQIPCAVGYSFSLIFMTYVISFIFRKGRKNSGIWS
       :..  :.:. :.  .  .:   . .. . : .: . ::::.:::.:::::: :::.:.::
CCDS11 LILFSIHLIYYFIFLGFQLSWELMFVLVVCIIGCAVSLIFLTYVLSFIFRKWRKNNGFWS
     990      1000      1010      1020      1030      1040         

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pF1KA0 FCFYVVTVFSVAGFAFSIFESDIPFIFTFLIPPATMIGCLFLSSHLLF-SSLFS-EERMD
       : :... .   . .. . .:.   ..  ..::  :..: ..:  .: :  .: : ..:..
CCDS11 FGFFIILICVSTIMVSTQYEKLNLILCMIFIPSFTLLGYVMLLIQLDFMRNLDSLDNRIN
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pF1KA0 -VQP--FLVFLIPFLHFIIFLFTLRCLEWKFGKKSMRKDPFFRISPRSSDVCQNPEEPEG
        :.   .:. :::.:. .::::..:::: :.:.. : ::: ::::::: ..  :::::: 
CCDS11 EVNKTILLTTLIPYLQSVIFLFVIRCLEMKYGNEIMNKDPVFRISPRSRETHPNPEEPEE
    1110      1120      1130      1140      1150      1160         

          1220      1230      1240      1250      1260      1270   
pF1KA0 EDEDVQMERVRTANALNSTNFDEKPVIIASCLRKEYAGKRKGCFSKRKNKIATRNVSFCV
       :::::: :::..::::.. :..:.::: ::::.:::   .:.::: ::.::: :::::::
CCDS11 EDEDVQAERVQAANALTAPNLEEEPVITASCLHKEYYETKKSCFSTRKKKIAIRNVSFCV
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pF1KA0 RKGEVLGLLGHNGAGKSTSIKVITGDTKPTAGQVLLKGSGGG------DALEFLGYCPQE
       .::::::::::::::::::::.::: :::::: :.:.:: ..      ..:.::::::::
CCDS11 KKGEVLGLLGHNGAGKSTSIKMITGCTKPTAGVVVLQGSRASVRQQHDNSLKFLGYCPQE
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pF1KA0 NALWPNLTVRQHLEVYAAVKGLRKGDAEVAITRLVDALKLQDQLKSPVKTLSEGIKRKLC
       :.:::.::...:::.::::::: : :: ..:.:::.:::::.:::.::::::::::::::
CCDS11 NSLWPKLTMKEHLELYAAVKGLGKEDAALSISRLVEALKLQEQLKAPVKTLSEGIKRKLC
    1290      1300      1310      1320      1330      1340         

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pF1KA0 FVLSILGNPSVVLLDEPSTGMDPEGQQQMWQAIRATFRNTERGALLTTHYMAEAEAVCDR
       ::::::::::::::::: ::::::::::::: ..:: .: :::.:::::::.::::::::
CCDS11 FVLSILGNPSVVLLDEPFTGMDPEGQQQMWQILQATVKNKERGTLLTTHYMSEAEAVCDR
    1350      1360      1370      1380      1390      1400         

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       .:.:::: :::::::::::.:::.:::::.:.:. .::: ::.:::.:::::: ::::::
CCDS11 MAMMVSGTLRCIGSIQHLKNKFGRDYLLEIKMKEPTQVEALHTEILKLFPQAAWQERYSS
    1410      1420      1430      1440      1450      1460         

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pF1KA0 LMVYKLPVEDVQPLAQAFFKLEKVKQSFDLEEYSLSQSTLEQVFLELSKEQELGDFEEDF
       ::.::::::::.::..:::::: .::.:.::::::::.::::::::: ::::::.     
CCDS11 LMAYKLPVEDVHPLSRAFFKLEAMKQTFNLEEYSLSQATLEQVFLELCKEQELGNVDDKI
    1470      1480      1490      1500      1510      1520         

      1570      1580 
pF1KA0 DPSVKWKLLPQEEP
                     
CCDS11 DTTVEWKLLPQEDP
    1530      1540   

>>CCDS11685.1 ABCA5 gene_id:23461|Hs108|chr17             (1642 aa)
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pF1KA0   MRKRKISVCQQTWALLCKNFLKKWRMKRESLMEWLNSLLLLLCLYIYPHSHQVNDFSS
                               : : :. :..: :  :..:. : .    :  . .  
CCDS11 MSTAIREVGVWRQTRTLLLKNYLIKCRTKKSSVQEILFPLFFLFWLILISMMHPNKKYEE
               10        20        30        40        50        60

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pF1KA0 LLTMDLGRVDTFNESRFSVVYTPVTNTTQQIMNKVASTPFLAGKEVLGLPDEESIKEF--
       . ...:. .: :. : . . :::::: :..::.:: ::  :   .:.   .  . ::.  
CCDS11 VPNIELNPMDKFTLSNLILGYTPVTNITSSIMQKV-STDHLP--DVIITEEYTNEKEMLT
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pF1KA0 -TANYPEEIVRVTFTNTYSYHLKFLLGHGMPAKKEHKDHTAHCYETNEDVYCEVSVFWKE
        . . : ..: :.: ...::.:.:.    .:... . :  : : ..     ::.. .:. 
CCDS11 SSLSKPSNFVGVVFKDSMSYELRFFPDM-IPVSSIYMDSRAGCSKS-----CEAAQYWSS
       120       130       140        150       160            170 

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pF1KA0 GFVALQAAINAAIIEITTNHSVMEELMSVTGKNMKMHSFIGQSGVITDLYLFSCIISFSS
       ::..:::.:.::::.. :: :. .:: :. .  :   . .  .     . :.  .:.:: 
CCDS11 GFTVLQASIDAAIIQLKTNVSLWKELESTKAVIMGETAVVEIDTFPRGVILIYLVIAFSP
             180       190       200       210       220       230 

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pF1KA0 FIYYASVNVTRER-KRMKALMTMMGLRDSAFWLSWGLLYAGFIFIMALFLALVIRSTQFI
       : :. ..... :. :..: .. .:::.:.:::::: :::...::.:.:..:..  .. ..
CCDS11 FGYFLAIHIVAEKEKKIKEFLKIMGLHDTAFWLSWVLLYTSLIFLMSLLMAVIATASLLF
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pF1KA0 ILSGFMVVFSLFLLYGLSLVALAFLMSILVKKSFLTGLVVFLLTVFWGCLGFTS-LYRHL
         :. .:.: ::.::::: : .:.... : :::  .:.: :..:: .: .:.   : . .
CCDS11 PQSSSIVIFLLFFLYGLSSVFFALMLTPLFKKSKHVGIVEFFVTVAFGFIGLMIILIESF
             300       310       320       330       340       350 

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pF1KA0 PASLEWILSLLSPFAFMLGMAQLLHLDYDLNSNA-FPHPSDGSNLIVATNFMLAFDTCLY
       : :: :..: .   .:..:.::..::. :.: .: : . . :   .. : .::.... .:
CCDS11 PKSLVWLFSPFCHCTFVIGIAQVMHLE-DFNEGASFSNLTAGPYPLIITIIMLTLNSIFY
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pF1KA0 LALAIYFEKILPNEYGHRRPPLFFLKSSFWSQTQKTDHVALEDEMDADPSFHDSFEQAPP
       . ::.:.....:.:.: ::  :.::: :.::..... .   : ..... :: . .: .  
CCDS11 VLLAVYLDQVIPGEFGLRRSSLYFLKPSYWSKSKRNYEELSEGNVNGNISFSEIIEPVSS
              420       430       440       450       460       470

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pF1KA0 EFQGKEAIRIRNVTKEYKGKPDKIEALKDLVFDIYEGQITAILGHSGAGKSTLLNILSGL
       :: ::::::: .. : :. : ...:::..: ::::::::::.:::::.:::::.::: ::
CCDS11 EFVGKEAIRISGIQKTYRKKGENVEALRNLSFDIYEGQITALLGHSGTGKSTLMNILCGL
              480       490       500       510       520       530

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pF1KA0 SVPTKGSVTIYNNKLSEMADLENLSKLTGVCPQSNVQFDFLTVRENLRLFAKIKGI----
         :. : ..::....::. .. .  :. :.::: ...:: :::.::: ..:.::::    
CCDS11 CPPSDGFASIYGHRVSEIDEMFEARKMIGICPQLDIHFDVLTVEENLSILASIKGIPANN
              540       550       560       570       580       590

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pF1KA0 LPQEVDK------------------------------------EIFLLDEPTAGLDPFSR
       . :::.:                                    .:.::::::::.:: ::
CCDS11 IIQEVQKVLLDLDMQTIKDNQAKKLSGGQKRKLSLGIAVLGNPKILLLDEPTAGMDPCSR
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pF1KA0 HQVWNLLKERKTDRVILFSTQFMDEADILADRKVFLSQGKLKCAGSSLFLKKKWGIGYHL
       : :::::: ::..:: .:::.::::::::::::. .::: :::.:::.:::.::::::.:
CCDS11 HIVWNLLKYRKANRVTVFSTHFMDEADILADRKAVISQGMLKCVGSSMFLKSKWGIGYRL
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pF1KA0 SLQLNEICVEENITSLVKQHIPDAKLSAKSEGKLIYTLPLERTNKFPELYKDLDSYPDLG
       :. ... :. :...:::::::: : :  ... .:.:.::..  .::  :.. :::. .::
CCDS11 SMYIDKYCATESLSSLVKQHIPGATLLQQNDQQLVYSLPFKDMDKFSGLFSALDSHSNLG
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pF1KA0 IENYGVSMTTLNEVFLKLEGKSTINESDIAILGEVQAEKADDTERLVEMEQVLSSLNKMR
       . .::::::::..:::::: .. :...: ... .   :.  :.. . :::: :  :.. .
CCDS11 VISYGVSMTTLEDVFLKLEVEAEIDQADYSVFTQQPLEEEMDSKSFDEMEQSLLILSETK
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pF1KA0 KT-IGGVALWRQQICAIARVRLLKLKHERKALLALLLILMAGFCPLLVEYTMVKIYQNSY
        . .. ..::.::. .::. ... ::.: :.. ..::.:.  :   .  . . . ..:. 
CCDS11 AALVSTMSLWKQQMYTIAKFHFFTLKRESKSVRSVLLLLLIFFTVQIFMFLVHHSFKNAV
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pF1KA0 T-WELSPHLYFLAPGQQPHDPLTQLLIINKTGASIDDFIQSVEHQNIALEVDAFGTRNGT
       .  .: : :::: ::..::   :.::. :.. ..:.:.:.    :::   :  ..  . .
CCDS11 VPIKLVPDLYFLKPGDKPHKYKTSLLLQNSADSDISDLISFFTSQNIM--VTMINDSDYV
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pF1KA0 DDPSYNGAITVCCNEKNYSFSLACNAKRLNCFPVLMDIVSNGLLGMVKPSVHIRTERSTF
       .   ...:..:  .::.: :. . :.  .  .:.:..:.::  :  .. .  :.   . :
CCDS11 SVAPHSAALNVMHSEKDYVFAAVFNSTMVYSLPILVNIISNYYLYHLNVTETIQIWSTPF
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pF1KA0 LENGQDNPIGFLAYIMFWL--VLTSSCPPYIAMSSIDDYKNRARSQLRISGLSPSAYWFG
       ...  :  . .  :..  :  ..... :::.:: . ...: .: .::..::: :::::.:
CCDS11 FQEITDIVFKIELYFQAALLGIIVTAMPPYFAMENAENHKIKAYTQLKLSGLLPSAYWIG
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pF1KA0 QALVDVSLYFLVFVFIYLMSYIS-NFEDMLLTIIHIIQIPCAVGYSFSLIFMTYVISFIF
       ::.::. :.:...... : : .. ..  .. :.  .  . : .::  :.:..::. :: :
CCDS11 QAVVDIPLFFIILILM-LGSLLAFHYGLYFYTVKFLAVVFCLIGYVPSVILFTYIASFTF
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pF1KA0 RKGRKNSGIWSFCFYVVTVFSVAGFAFSIF-----ESDIPFIFTFLIPPATMIGCLFLSS
       .:  ... .::: . :...  .:   ...:      . . . : ..::   ..:::.  :
CCDS11 KKILNTKEFWSFIYSVAALACIAITEITFFMGYTIATILHYAFCIIIPIYPLLGCLI--S
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pF1KA0 HLLFSSLFSEERMDV-QPF----LVFLIPFLHFIIFLFTLRCLEWKFGKKSMRKDPFFRI
        . .:    .. .:. .:.    .. . :.:. ....: :.  : :.: .:.::::::: 
CCDS11 FIKISWKNVRKNVDTYNPWDRLSVAVISPYLQCVLWIFLLQYYEKKYGGRSIRKDPFFRN
        1190      1200      1210      1220      1230      1240     

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pF1KA0 SPRSSDVCQNPEEP--EGEDEDVQMERVRTANALNSTNFDEKPVIIASCLRKEYAGKRKG
          .:   . :: :  : :::::. ::... . ..    .::: :..: :.:::  :.  
CCDS11 LSTKSKNRKLPEPPDNEDEDEDVKAERLKVKELMGCQCCEEKPSIMVSNLHKEYDDKKDF
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pF1KA0 CFSKRKNKIATRNVSFCVRKGEVLGLLGHNGAGKSTSIKVITGDTKPTAGQVLL-----K
        .:.. .:.::. .::::.:::.::::: ::::::: :....:: .::.:::.:     .
CCDS11 LLSRKVKKVATKYISFCVKKGEILGLLGPNGAGKSTIINILVGDIEPTSGQVFLGDYSSE
        1310      1320      1330      1340      1350      1360     

             1320      1330      1340      1350      1360      1370
pF1KA0 GSGGGDALEFLGYCPQENALWPNLTVRQHLEVYAAVKGLRKGDAEVAITRLVDALKLQDQ
        :   :.:. .::::: : :::. :...:.:.:.::::.  .: . .:.:.. :: :...
CCDS11 TSEDDDSLKCMGYCPQINPLWPDTTLQEHFEIYGAVKGMSASDMKEVISRITHALDLKEH
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             1380      1390      1400      1410      1420      1430
pF1KA0 LKSPVKTLSEGIKRKLCFVLSILGNPSVVLLDEPSTGMDPEGQQQMWQAIRATFRNTERG
       :.. :: :  ::::::::.::.::::...:::::::::::...:.::.:::..:.: .:.
CCDS11 LQKTVKKLPAGIKRKLCFALSMLGNPQITLLDEPSTGMDPKAKQHMWRAIRTAFKNRKRA
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pF1KA0 ALLTTHYMAEAEAVCDRVAIMVSGRLRCIGSIQHLKSKFGKDYLLEMKVKNLAQ---VEP
       :.:::::: :::::::::::::::.:::::..::::::::: :.::.:.:.  .   :. 
CCDS11 AILTTHYMEEAEAVCDRVAIMVSGQLRCIGTVQHLKSKFGKGYFLEIKLKDWIENLEVDR
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      1490      1500      1510      1520      1530      1540       
pF1KA0 LHAEILRLFPQAARQERYSSLMVYKLPVEDVQPLAQAFFKLEKVKQSFDLEEYSLSQSTL
       :. ::  .::.:.::: .::...::.: :::: :.:.:::::..:..: .::::.::.::
CCDS11 LQREIQYIFPNASRQESFSSILAYKIPKEDVQSLSQSFFKLEEAKHAFAIEEYSFSQATL
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pF1KA0 EQVFLELSKEQELGDFEEDFDPSVKWKLLPQEEP   
       ::::.::.::::  :       :. :    ::.    
CCDS11 EQVFVELTKEQEEEDNSCGTLNSTLWWERTQEDRVVF
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>>CCDS47584.1 ABCA13 gene_id:154664|Hs108|chr7            (5058 aa)
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pF1KA0 AKKEHKDHTAHCYETNEDVYCEVSVFWKEGFVALQAAINAAIIEITTNHSVMEELMSVTG
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CCDS47 YSVRTDVVKNPSWKFHPQNLPADGFKYNYVFAPLQDMIERAIILVQTGQEALEPAAQTQA
          3500      3510      3520      3530      3540      3550   

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pF1KA0 KNMKMHS---FIGQSGVITDL-YLFSCIISFSSFIYYASVNVTRERKRMKALMTMMGLRD
         .  :.   :... : .  : .... ..: .:..      : ... ...  : :::.. 
CCDS47 APYPCHTSDLFLNNVGFFFPLIMMLTWMVSVASMVRKL---VYEQEIQIEEYMRMMGVHP
          3560      3570      3580      3590         3600      3610

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pF1KA0 SAFWLSWGLLYAGFIFIMALFLALVIRSTQFIILSGFMVVFSLFLLYGLSLVALAFLMSI
          .:.: :   . . : .  ::.:.... ..  :. ..:: ..: .:.:.: :..:.: 
CCDS47 VIHFLAWFLENMAVLTISSATLAIVLKTSGIFAHSNTFIVFLFLLDFGMSVVMLSYLLSA
             3620      3630      3640      3650      3660      3670

            330          340       350       360       370         
pF1KA0 LVKKSFLTGL---VVFLLTVFWGCLGFTSLYRHLPASLEWILSLLSPFAFMLGMAQLLHL
       . ...  ..:   .:.... :   . .  :. .:    . .: :::  ::  :.  .  :
CCDS47 FFSQANTAALCTSLVYMIS-FLPYIVLLVLHNQLSFVNQTFLCLLSTTAFGQGVFFITFL
             3680       3690      3700      3710      3720         

     380           390       400       410       420       430     
pF1KA0 DYDLN----SNAFPHPSDGSNLIVATNFMLAFDTCLYLALAIYFEKILPNEYGHRRPPLF
       . . .    .: .    .:.  .  . .:. ::. ::.  . :. ...:. .: :.:  :
CCDS47 EGQETGIQWNNMYQALEQGGMTFGWVCWMILFDSSLYFLCGWYLSNLIPGTFGLRKPWYF
    3730      3740      3750      3760      3770      3780         

         440           450       460          470        480       
pF1KA0 FLKSSFWSQT----QKTDHVALEDEMDADPSFHD---SFEQAPPEFQGKE-AIRIRNVTK
        . .:.:...    .: ..    . .  . .: .   :...   :..:.  .. . .:::
CCDS47 PFTASYWKSVGFLVEKRQYFLSSSLFFFNENFDNKGSSLQNREGELEGSAPGVTLVSVTK
    3790      3800      3810      3820      3830      3840         

       490       500       510       520       530       540       
pF1KA0 EYKGKPDKIEALKDLVFDIYEGQITAILGHSGAGKSTLLNILSGLSVPTKGSVTIYNNKL
       ::.:.     ...:: . .:. ::::.:: .::::.:....:.::  ::.:.. : ...:
CCDS47 EYEGHK---AVVQDLSLTFYRDQITALLGTNGAGKTTIISMLTGLHPPTSGTIIINGKNL
    3850         3860      3870      3880      3890      3900      

       550       560       570       580       590                 
pF1KA0 SEMADLENLSKLTGVCPQSNVQFDFLTVRENLRLFAKIKGILPQEVDKEI----------
       .  .::  .    :::::... .: :::::.: :::.::.  :: . ::.          
CCDS47 Q--TDLSRVRMELGVCPQQDILLDNLTVREHLLLFASIKA--PQWTKKELHQQVNQTLQD
         3910      3920      3930      3940        3950      3960  

                                         600       610       620   
pF1KA0 ---------------------------FL-------LDEPTAGLDPFSRHQVWNLLKERK
                                  :.       :::::.:.:: :::..:..: . .
CCDS47 VDLTQHQHKQTRALSGGLKRKLSLGIAFMGMSRTVVLDEPTSGVDPCSRHSLWDILLKYR
           3970      3980      3990      4000      4010      4020  

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pF1KA0 TDRVILFSTQFMDEADILADRKVFLSQGKLKCAGSSLFLKKKWGIGYHLSLQLNEICVEE
         :.:.:.:. .:::. :.:: . :..:.:.: :  . ::. .: : .:.:  .   .: 
CCDS47 EGRTIIFTTHHLDEAEALSDRVAVLQHGRLRCCGPPFCLKEAYGQGLRLTLTRQPSVLEA
           4030      4040      4050      4060      4070      4080  

                  690       700       710         720        730   
pF1KA0 N-------ITSLVKQHIPDAKLSAKSEGKLIYTLPLERTNK--FPELYKDLD-SYPDLGI
       .       .:::.: .::.: :. .: ..: ::.: . :.:  .  :.. :: .  .: .
CCDS47 HDLKDMACVTSLIKIYIPQAFLKDSSGSELTYTIPKD-TDKACLKGLFQALDENLHQLHL
           4090      4100      4110       4120      4130      4140 

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pF1KA0 ENYGVSMTTLNEVFLKLEGKSTINESDIAILGEVQAEKADDTERLVEMEQVLSSLNKMRK
        .::.: :::.:::: :   :. ..: ::.  : . ..   : .:       .:: .   
CCDS47 TGYGISDTTLEEVFLMLLQDSN-KKSHIALGTESELQNHRPTGHL---SGYCGSLARP-A
            4150      4160       4170      4180         4190       

           800       810       820             830          840    
pF1KA0 TIGGVALWRQQICAIARVRLLKLKHERKALLALLLI------LMAGFC---PLLVEYTMV
       :. :: : : :. ::   :: .  .  :. :: ::.      :  :.    :: .::  .
CCDS47 TVQGVQLLRAQVAAILARRLRRTLRAGKSTLADLLLPVLFVALAMGLFMVRPLATEYPPL
       4200      4210      4220      4230      4240      4250      

                                                     850           
pF1KA0 KI----YQ---------------------------------------NSYTWELSP--HL
       ..    ::                                       ::  :. .:  : 
CCDS47 RLTPGHYQRAETYFFSSGGDNLDLTRVLLRKFRDQDLPCADLNPRQKNSSCWRTDPFSHP
       4260      4270      4280      4290      4300      4310      

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pF1KA0 YFL-------APGQQPHDP-LTQLL---IINKTGASIDDFIQSVEHQNIALEVDAFGTRN
        :         :...   : ::. :   ..: .: ...... .   ..  :   .:: . 
CCDS47 EFQDSCGCLKCPNRSASAPYLTNHLGHTLLNLSGFNMEEYLLA-PSEKPRLGGWSFGLKI
       4320      4330      4340      4350       4360      4370     

      910       920              930       940             950     
pF1KA0 GTDDPSYNGAIT-------VCCNEKNYSFSLACNAKRLNCF------PVLMDIVSNGLLG
        ..  . :: :.       :  :.:..  ::    ..:: .      :  .:  . :.  
CCDS47 PSEAGGANGNISKPPTLAKVWYNQKGFH-SLPSYLNHLNNLILWQHLPPTVDWRQYGITL
        4380      4390      4400       4410      4420      4430    

         960       970       980       990      1000      1010     
pF1KA0 MVKPSVHIRTERSTFLENGQDNPIGFLAYIMFWLVLTSSCPPYIAMSSIDDYKNRARSQL
       . .:      ... .::. ..  .. :  .. . .:..:    :. : . :    :.   
CCDS47 YSHPYGGALLNEDKILESIRQCGVA-LCIVLGFSILSAS----IGSSVVRDRVIGAKRLQ
         4440      4450       4460      4470          4480         

        1020      1030      1040      1050                  1060   
pF1KA0 RISGLSPSAYWFGQALVDVSLYFLVFVFIYLMSYIS------NFED------MLLTIIHI
       .::::.   ::: . : :. :..:: : . .   ..      .:.       .::...  
CCDS47 HISGLGYRMYWFTNFLYDM-LFYLVSVCLCVAVIVAFQLTAFTFRKNLAATALLLSLFGY
    4490      4500       4510      4520      4530      4540        

          1070      1080      1090      1100             1110      
pF1KA0 IQIPCAVGYSFSLIFMTYVISFIFRKGRKNSGIWSFCFYVVTVF-------SVAGFAFSI
         .:    : .: :: .  ..::  .  . . :...: ...:..       : :    .:
CCDS47 ATLPWM--YLMSRIFSSSDVAFI--SYVSLNFIFGLCTMLITIMPRLLAIISKAKNLQNI
     4550        4560        4570      4580      4590      4600    

       1120      1130      1140      1150        1160      1170    
pF1KA0 FESDIPFIFTFLIPPATMIGCLFLSSHLLFSSLFSEERMD--VQPFLVFLIPFLHFIIFL
       ..  . ..::..       : . :  . .  .:  .  .:  :.::    . :: .:.  
CCDS47 YDV-LKWVFTIFPQFCLGQGLVELCYNQIKYDLTHNFGIDSYVSPF---EMNFLGWIFVQ
          4610      4620      4630      4640         4650      4660

         1180      1190      1200      1210      1220      1230    
pF1KA0 FTLRCLEWKFGKKSMRKDPFFRISPRSSDVCQNPEEPEGEDEDVQMERVRTANALNSTNF
       .. .     . .  .. : ..:  ::. .. :.  .  ..: ::. :. :. ..   :: 
CCDS47 LASQGTVLLLLRVLLHWD-LLRW-PRGHSTLQGTVKS-SKDTDVEKEEKRVFEG--RTNG
             4670       4680       4690       4700      4710       

         1240      1250      1260      1270      1280      1290    
pF1KA0 DEKPVIIASCLRKEYAGKRKGCFSKRKNKIATRNVSFCVRKGEVLGLLGHNGAGKSTSIK
       :   ...   : :.:  .:   :   .: ::....:. . ::: .:::: :::::::..:
CCDS47 D---ILVLYNLSKHY--RR--FF---QNIIAVQDISLGIPKGECFGLLGVNGAGKSTTFK
           4720          4730         4740      4750      4760     

         1300      1310              1320      1330      1340      
pF1KA0 VITGDTKPTAGQVLLKG--------SGGGDALEFLGYCPQENALWPNLTVRQHLEVYAAV
       ...:... :.:.....         :..: :  ..:::::..::   ::  .::  : ..
CCDS47 MLNGEVSLTSGHAIIRTPMGDAVDLSSAGTAGVLIGYCPQQDALDELLTGWEHLYYYCSL
        4770      4780      4790      4800      4810      4820     

        1350      1360      1370      1380      1390      1400     
pF1KA0 KGL-RKGDAEVAITRLVDALKLQDQLKSPVKTLSEGIKRKLCFVLSILGNPSVVLLDEPS
       .:. :.   :::   :.  :.:. .  .:: : : : ::::  .:...:.:...::::::
CCDS47 RGIPRQCIPEVA-GDLIRRLHLEAHADKPVATYSGGTKRKLSTALALVGKPDILLLDEPS
        4830       4840      4850      4860      4870      4880    

        1410      1420      1430      1440      1450      1460     
pF1KA0 TGMDPEGQQQMWQAIRATFRNTERGALLTTHYMAEAEAVCDRVAIMVSGRLRCIGSIQHL
       .:::: ... .::.:    :.   .:.::.: : : ::.: :.::::.: ..:.:: ::.
CCDS47 SGMDPCSKRYLWQTIMKEVREGC-AAVLTSHSMEECEALCTRLAIMVNGSFKCLGSPQHI
         4890      4900       4910      4920      4930      4940   

        1470      1480      1490       1500      1510      1520    
pF1KA0 KSKFGKDYLLEMKVKNLAQVEPLHAEILRL-FPQAARQERYSSLMVYKLPVEDVQPLAQA
       :..::  : ... . . :. .   .. :.: ::    . .. .:. :..: .    ::. 
CCDS47 KNRFGDGYTVKVWLCKEANQHCTVSDHLKLYFPGIQFKGQHLNLLEYHVP-KRWGCLADL
          4950      4960      4970      4980      4990       5000  

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pF1KA0 FFKLEKVKQSFDLEEYSLSQSTLEQVFLELSKEQELGDFEEDFDPSVKWKLLPQEEP
       :  .:. :  .....::..:.::::::.....::.   ..  .:::           
CCDS47 FKVIENNKTFLNIKHYSINQTTLEQVFINFASEQQQ-TLQSTLDPSTDSHHTHHLPI
           5010      5020      5030       5040      5050        

>>CCDS12055.1 ABCA7 gene_id:10347|Hs108|chr19             (2146 aa)
 initn: 1157 init1: 259 opt: 715  Z-score: 783.9  bits: 158.3 E(32554): 2.4e-37
Smith-Waterman score: 1335; 27.5% identity (51.9% similar) in 1604 aa overlap (244-1571:569-2118)

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pF1KA0 FIGQSGVITDLYLFSCIISFSSFIYYASVNVTRERK-RMKALMTMMGLRDSAFWLSWGLL
                                     :.::.. :..  :  :::  ...::.: : 
CCDS12 DDVFLRVLSRSLPLFLTLAWIYSVTLTVKAVVREKETRLRDTMRAMGLSRAVLWLGWFLS
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pF1KA0 YAGFIFIMALFLALVIRSTQFIILSGFMVVFSLFLLYGLSLVALAFLMSILVKKSFLT--
         : ... : .:.::..  ...  :   ::: ..  .... :. .::.: . ... :.  
CCDS12 CLGPFLLSAALLVLVLKLGDILPYSHPGVVFLFLAAFAVATVTQSFLLSAFFSRANLAAA
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pF1KA0 --GLVVFLLTV-FWGCLGFTSLYRHLPASLEWILSLLSPFAFMLGMAQLLHLDYDLNS--
         ::. : : . .  :... .   .:::. .   ::::: :: .:  .:  :. . ..  
CCDS12 CGGLAYFSLYLPYVLCVAWRD---RLPAGGRVAASLLSPVAFGFGCESLALLEEQGEGAQ
      660       670          680       690       700       710     

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pF1KA0 --NAFPHPSDGSNLIVATNFMLAFDTCLYLALAIYFEKILPNEYGHRRPPLFFLKSSFWS
         :.  .:.     .. .. .: .:. ::   . :.: . :..::  .:  : .. :.: 
CCDS12 WHNVGTRPTADVFSLAQVSGLLLLDAALYGLATWYLEAVCPGQYGIPEPWNFPFRRSYWC
         720       730       740       750       760       770     

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pF1KA0 QTQKTDHVALEDEMDADPSFHDSFEQAPPEFQGKEAIRIRNVTKEYKGKPDKIEALKDLV
         .     :       ::.     :.::: .  . .. .:.. :.. :.:.   ::. : 
CCDS12 GPRPPKSPA-PCPTPLDPKV--LVEEAPPGL--SPGVSVRSLEKRFPGSPQP--ALRGLS
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pF1KA0 FDIYEGQITAILGHSGAGKSTLLNILSGLSVPTKGSVTIYNNKL-SEMADLENLSKLTGV
       .:.:.:.:::.:::.::::.: :.:::::  :. ::. : .. . : :: ..      ::
CCDS12 LDFYQGHITAFLGHNGAGKTTTLSILSGLFPPSGGSAFILGHDVRSSMAAIR---PHLGV
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pF1KA0 CPQSNVQFDFLTVRENLRLFAKIKG----ILPQEVDK-----------------------
       ::: :: ::.::: :.. .....::    ..  : :.                       
CCDS12 CPQYNVLFDMLTVDEHVWFYGRLKGLSAAVVGPEQDRLLQDVGLVSKQSVQTRHLSGGMQ
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pF1KA0 -------------EIFLLDEPTAGLDPFSRHQVWNLLKERKTDRVILFSTQFMDEADILA
                    .. .:::::::.:: ::. .:.:: . .  :....::. .:::..:.
CCDS12 RKLSVAIAFVGGSQVVILDEPTAGVDPASRRGIWELLLKYREGRTLILSTHHLDEAELLG
         950       960       970       980       990      1000     

            650       660       670       680                      
pF1KA0 DRKVFLSQGKLKCAGSSLFLKKKWGIGYHLSLQLNEICVEEN------------------
       :: . .. :.: : :: :::... : ::.:.:   .. .  :                  
CCDS12 DRVAVVAGGRLCCCGSPLFLRRHLGSGYYLTLVKARLPLTTNEKADTDMEGSVDTRQEKK
        1010      1020      1030      1040      1050      1060     

                      690       700       710         720          
pF1KA0 ------------ITSLVKQHIPDAKLSAKSEGKLIYTLPLE--RTNKFPELYKDLDSY-P
                   . .::.. .: :.:  .   .:. .::    . ..:  :...::.   
CCDS12 NGSQGSRVGTPQLLALVQHWVPGARLVEELPHELVLVLPYTGAHDGSFATLFRELDTRLA
        1070      1080      1090      1100      1110      1120     

     730       740       750         760                 770       
pF1KA0 DLGIENYGVSMTTLNEVFLKL--EGKSTINESD----------IAILGEVQAEKADDTER
       .: . .::.: :.:.:.:::.  :  .  .  :          :: :  .   :    : 
CCDS12 ELRLTGYGISDTSLEEIFLKVVEECAADTDMEDGSCGQHLCTGIAGLDVTLRLKMPPQET
        1130      1140      1150      1160      1170      1180     

       780       790               800       810       820         
pF1KA0 LVEMEQVLSSLNKMRKTIG--------GVALWRQQICAIARVRLLKLKHERKALLALLLI
        .:  .  .:  .  .  :        : :: :::. :.   :.:  .. :..:.: . .
CCDS12 ALENGEPAGSAPETDQGSGPDAVGRVQGWALTRQQLQALLLKRFLLARRSRRGLFAQI-V
        1190      1200      1210      1220      1230      1240     

     830        840       850       860                            
pF1KA0 LMAGFCPL-LVEYTMVKIYQNSYTWELSPHLY-----FL---APG---------------
       : : :  : ::   .:  . .  . .::: .:     :.   :::               
CCDS12 LPALFVGLALVFSLIVPPFGHYPALRLSPTMYGAQVSFFSEDAPGDPGRARLLEALLQEA
         1250      1260      1270      1280      1290      1300    

              870                                                  
pF1KA0 --QQP---HD----------------------------PLTQ--------LL--------
         ..:   :.                            :  :        ::        
CCDS12 GLEEPPVQHSSHRFSAPEVPAEVAKVLASGNWTPESPSPACQCSRPGARRLLPDCPAAAG
         1310      1320      1330      1340      1350      1360    

                      880                890       900       910   
pF1KA0 --------------IINKTGASIDDFI---------QSVEHQNIALEVDAFGTRNGTDDP
                     . : :: ...::.         :... .. . ::   :   :  ::
CCDS12 GPPPPQAVTGSGEVVQNLTGRNLSDFLVKTYPRLVRQGLKTKKWVNEVRYGGFSLGGRDP
         1370      1380      1390      1400      1410      1420    

                                920        930               940   
pF1KA0 SY---------------------NGAIT-VCCNEKNYSFSLAC--------NAKRLNCFP
       .                      .::.  :  :   .. ::          : :  . . 
CCDS12 GLPSGQELGRSVEELWALLSPLPGGALDRVLKNLTAWAHSLDAQDSLKIWFNNKGWHSMV
         1430      1440      1450      1460      1470      1480    

           950       960       970           980        990        
pF1KA0 VLMDIVSNGLLGMVKPSVHIRTERSTFLENGQDN----PIGFLAYIMFWL-VLTSSC---
       .... .::..:    :    :  .:    :   :     ..  : .   . ::.: :   
CCDS12 AFVNRASNAILRAHLPPGPARHAHSITTLNHPLNLTKEQLSEGALMASSVDVLVSICVVF
         1490      1500      1510      1520      1530      1540    

             1000      1010      1020      1030         1040       
pF1KA0 -----PPYIAMSSIDDYKNRARSQLRISGLSPSAYWFGQALVDVSLYFL---VFVFIYLM
            :  ...  :..  .::.    ..::::. ::.:. : :.  :..   . :.:.: 
CCDS12 AMSFVPASFTLVLIEERVTRAKHLQLMGGLSPTLYWLGNFLWDMCNYLVPACIVVLIFLA
         1550      1560      1570      1580      1590      1600    

          1050        1060      1070      1080      1090      1100 
pF1KA0 ----SYIS--NFEDMLLTIIHIIQIPCAVGYSFSLIFMTYVISFIFRKGRKNSGIWSFC-
           .:..  :.  .:: ..          :..:.  . :  ::.:        . . : 
CCDS12 FQQRAYVAPANLPALLLLLLL---------YGWSITPLMYPASFFFSVPSTAYVVLT-CI
         1610      1620               1630      1640      1650     

              1110          1120        1130        1140      1150 
pF1KA0 -FYVVTVFSVAGFAFSIFES----DIPFIF--TFLIPPATMIG--CLFLSSHLLFSSLFS
        ...    :.: :.. .: .    ..  :.  .::: :   .:   . .  .  ... : 
CCDS12 NLFIGINGSMATFVLELFSDQKLQEVSRILKQVFLIFPHFCLGRGLIDMVRNQAMADAF-
         1660      1670      1680      1690      1700      1710    

                1160        1170        1180      1190      1200   
pF1KA0 EERM-DVQ---PFLVFLIP--FLHFIIF--LFTLRCLEWKFGKKSMRKDPFFRISPRSSD
        ::. : :   :.   ..   .: ..:   :: :  :  .  ....  .:  :  :  ..
CCDS12 -ERLGDRQFQSPLRWEVVGKNLLAMVIQGPLFLLFTLLLQH-RSQLLPQPRVRSLPLLGE
           1720      1730      1740      1750       1760      1770 

          1210      1220      1230      1240      1250      1260   
pF1KA0 VCQNPEEPEGEDEDVQMERVRTANALNSTNFDEKPVIIASCLRKEYAGKRKGCFSKRKNK
                 :::::  :: :....  .:. :   :..   : : : :.:          
CCDS12 ----------EDEDVARERERVVQG--ATQGD---VLVLRNLTKVYRGQRMP--------
                      1780        1790         1800                

          1270      1280      1290      1300      1310             
pF1KA0 IATRNVSFCVRKGEVLGLLGHNGAGKSTSIKVITGDTKPTAGQVLLKGSG----GGDALE
        :.  . . .  :: .:::: :::::.......::::  . :...: : .     . :  
CCDS12 -AVDRLCLGIPPGECFGLLGVNGAGKTSTFRMVTGDTLASRGEAVLAGHSVAREPSAAHL
      1810      1820      1830      1840      1850      1860       

    1320      1330      1340      1350       1360      1370        
pF1KA0 FLGYCPQENALWPNLTVRQHLEVYAAVKGLRKGD-AEVAITRLVDALKLQDQLKSPVKTL
        .::::: .:..  :: :.:::. : ..:. ... :..: . :.  : :.     :. : 
CCDS12 SMGYCPQSDAIFELLTGREHLELLARLRGVPEAQVAQTAGSGLAR-LGLSWYADRPAGTY
      1870      1880      1890      1900      1910       1920      

     1380      1390      1400      1410      1420      1430        
pF1KA0 SEGIKRKLCFVLSILGNPSVVLLDEPSTGMDPEGQQQMWQAIRATFRNTERGALLTTHYM
       : : ::::  .:...:.:.::.::::.::::: ... .:... :. :.  :...::.: :
CCDS12 SGGNKRKLATALALVGDPAVVFLDEPTTGMDPSARRFLWNSLLAVVREG-RSVMLTSHSM
       1930      1940      1950      1960      1970       1980     

     1440      1450      1460      1470      1480      1490        
pF1KA0 AEAEAVCDRVAIMVSGRLRCIGSIQHLKSKFGKDYLLEMKVKNLAQVEPLHAEILRLFPQ
        : ::.:.:.::::.::.::.:: ::::..:.  . : ..:   :. .:  : .   :: 
CCDS12 EECEALCSRLAIMVNGRFRCLGSPQHLKGRFAAGHTLTLRVPA-ARSQPAAAFVAAEFPG
        1990      2000      2010      2020       2030      2040    

     1500      1510      1520      1530      1540      1550        
pF1KA0 AARQERYSSLMVYKLPVEDVQPLAQAFFKLEKVKQSFDLEEYSLSQSTLEQVFLELSKEQ
       :  .: ... . ..::      ::..: .:        .:..:.::. ::.::: .::.:
CCDS12 AELREAHGGRLRFQLPPGGRCALARVFGELAVHGAEHGVEDFSVSQTMLEEVFLYFSKDQ
         2050      2060      2070      2080      2090      2100    

      1560      1570      1580                   
pF1KA0 -ELGDFEEDFDPSVKWKLLPQEEP                  
        .  : ::. . .:                            
CCDS12 GKDEDTEEQKEAGVGVDPAPGLQHPKRVSQFLDDPSTAETVL
         2110      2120      2130      2140      

>>CCDS10466.1 ABCA3 gene_id:21|Hs108|chr16                (1704 aa)
 initn: 1258 init1: 441 opt: 515  Z-score: 562.9  bits: 117.1 E(32554): 4.9e-25
Smith-Waterman score: 1720; 28.6% identity (59.1% similar) in 1536 aa overlap (172-1558:206-1696)

             150       160       170       180       190           
pF1KA0 GHGMPAKKEHKDHTAHCYETNEDVYCEVSVFWKEGFVALQAAINAAIIEITTNHSVME--
                                     . .:::.:.: :.. ::.:  .. .. .  
CCDS10 TEGWHTTSLFPLFPNPGPREPTSPDGGEPGYIREGFLAVQHAVDRAIMEYHADAATRQLF
         180       190       200       210       220       230     

     200       210       220       230       240           250     
pF1KA0 ELMSVTGKNMKMHSFIGQSGVITDLYLFSCIISFSSFIYYA---SVNVTRER-KRMKALM
       . ..:: : . .  ::..  ...  : .  .. . :: : :   .  :..:. .:.:  :
CCDS10 QRLTVTIKRFPYPPFIADPFLVAIQYQLPLLL-LLSFTYTALTIARAVVQEKERRLKEYM
         240       250       260        270       280       290    

         260       270       280          290         300       310
pF1KA0 TMMGLRDSAFWLSWGLLYAGFIFIMALFLAL---VIRSTQFIILS--GFMVVFSLFLLYG
        :::: .   : .: ::.  :..: : :..:   :  . .  .::     .:....: ..
CCDS10 RMMGLSSWLHWSAWFLLFFLFLLIAASFMTLLFCVKVKPNVAVLSRSDPSLVLAFLLCFA
          300       310       320       330       340       350    

              320       330           340       350       360      
pF1KA0 LSLVALAFLMSILVKKSFLT----GLVVFLLTVFWGCLGFTSLYRHLPASLEWILSLLSP
       .: ....:..: . .:. ..    :.. :.  . .  .  .  :  .  : .    ::: 
CCDS10 ISTISFSFMVSTFFSKANMAAAFGGFLYFFTYIPY--FFVAPRYNWMTLSQKLCSCLLSN
          360       370       380         390       400       410  

        370       380       390       400              410         
pF1KA0 FAFMLGMAQLLHLDYDLNSNAFPHPSDGSNLIVATNF-------MLAFDTCLYLALAIYF
        :. .: :::.   .. .. ..   .  : . :  .:       :: .:. ::  .. :.
CCDS10 VAMAMG-AQLIG-KFEAKGMGIQWRDLLSPVNVDDDFCFGQVLGMLLLDSVLYGLVTWYM
             420        430       440       450       460       470

     420       430       440       450       460         470       
pF1KA0 EKILPNEYGHRRPPLFFLKSSFWSQTQKTDHVALEDEMDADP--SFHDSFEQAPPEFQGK
       : ..:...:  .:  ::.  :.:    :   :: ..: :.::  .... . .: :: .  
CCDS10 EAVFPGQFGVPQPWYFFIMPSYWC--GKPRAVAGKEEEDSDPEKALRNEYFEAEPE-DLV
              480       490         500       510       520        

       480       490        500       510       520       530      
pF1KA0 EAIRIRNVTKEYK-GKPDKIEALKDLVFDIYEGQITAILGHSGAGKSTLLNILSGLSVPT
        .:.:....: .. :. :.  :..:: ...::::::..:::.::::.: :..:.::  ::
CCDS10 AGIKIKHLSKVFRVGNKDRA-AVRDLNLNLYEGQITVLLGHNGAGKTTTLSMLTGLFPPT
       530       540        550       560       570       580      

        540       550       560       570       580           590  
pF1KA0 KGSVTIYNNKLSEMADLENLSKLTGVCPQSNVQFDFLTVRENLRLFAKIKGI----LPQE
       .: . : . ..:.  :. .. :  :.::: .. :: ::: :.: ..:..::.     :.:
CCDS10 SGRAYISGYEISQ--DMVQIRKSLGLCPQHDILFDNLTVAEHLYFYAQLKGLSRQKCPEE
        590         600       610       620       630       640    

                                                600       610      
pF1KA0 V----------DK--------------------------EIFLLDEPTAGLDPFSRHQVW
       :          ::                          ....:::::.:.: .::. .:
CCDS10 VKQMLHIIGLEDKWNSRSRFLSGGMRRKLSIGIALIAGSKVLILDEPTSGMDAISRRAIW
          650       660       670       680       690       700    

        620       630       640       650       660       670      
pF1KA0 NLLKERKTDRVILFSTQFMDEADILADRKVFLSQGKLKCAGSSLFLKKKWGIGYHLSLQL
       .::...:.::.:...:.::::::.:.:: .....:.:.: :::::::.:.: :::..:  
CCDS10 DLLQRQKSDRTIVLTTHFMDEADLLGDRIAIMAKGELQCCGSSLFLKQKYGAGYHMTLVK
          710       720       730       740       750       760    

        680       690       700       710       720        730     
pF1KA0 NEICVEENITSLVKQHIPDAKLSAKSEGKLIYTLPLERTNKFPELYKDLDS-YPDLGIEN
       .  :  :.:..::..:.:.: : ... ..: . :: : :..:  :.  :..   .::: .
CCDS10 EPHCNPEDISQLVHHHVPNATLESSAGAELSFILPRESTHRFEGLFAKLEKKQKELGIAS
          770       780       790       800       810       820    

         740       750       760           770            780      
pF1KA0 YGVSMTTLNEVFLKLEGKSTINESDIAILG----EVQAEK-----ADDTERLVEMEQV--
       .:.:.::..::::.. :: . .  ::  .     . : :.     : :..    :.    
CCDS10 FGASITTMEEVFLRV-GKLVDSSMDIQAIQLPALQYQHERRASDWAVDSNLCGAMDPSDG
          830        840       850       860       870       880   

          790           800       810       820               830  
pF1KA0 LSSLNKMRKTI----GGVALWRQQICAIARVRLLKLKHERKALLALLLI--------LMA
       ...: . ..:      :.::  ::. :.   .     .: : . : .:.        :.:
CCDS10 IGALIEEERTAVKLNTGLALHCQQFWAMFLKKAAYSWREWKMVAAQVLVPLTCVTLALLA
           890       900       910       920       930       940   

             840       850       860        870         880        
pF1KA0 -GFCPLLVEYTMVKIYQNSYTWELSPHLYFLAPG-QQPHDPLTQLL--IINKTGASIDDF
        ..   : .  :...  . :   . :   : .:: .:  . :.. :   ..  :    . 
CCDS10 INYSSELFDDPMLRLTLGEYGRTVVP---FSVPGTSQLGQQLSEHLKDALQAEGQEPREV
           950       960          970       980       990      1000

      890          900           910       920          930        
pF1KA0 IQSVEHQNI---ALEVDAFGTR----NGTDDPSYNGAITVCCNEKNY---SFSLACNAK-
       . ..:.  :   ..:  .:. :     .  : .   ....  :.. :   . .::   . 
CCDS10 LGDLEEFLIFRASVEGGGFNERCLVAASFRDVGERTVVNALFNNQAYHSPATALAVVDNL
             1010      1020      1030      1040      1050      1060

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pF1KA0 --RLNCFPVLMDIVSNGLLGMVKPSVHIRTERSTFLENGQDNPIGFLAYIMFWLVLTSSC
         .: : :    .:::    . .:   ... .. : :. .   :..   ..: ... .: 
CCDS10 LFKLLCGPHASIVVSN----FPQPRSALQAAKDQFNEGRKGFDIAL--NLLFAMAFLAST
             1070          1080      1090      1100        1110    

        1000      1010      1020      1030      1040      1050     
pF1KA0 PPYIAMSSIDDYKNRARSQLRISGLSPSAYWFGQALVDVSLYFLVFVFIYLMSYISNFED
          .:.:   .   .:.    .::.  ...:..  : :. . ::.  .. :. . . :. 
CCDS10 FSILAVS---ERAVQAKHVQFVSGVHVASFWLSALLWDL-ISFLIPSLLLLVVF-KAFDV
         1120         1130      1140      1150       1160          

        1060        1070      1080      1090                1100   
pF1KA0 MLLTII-HIIQ-IPCAVGYSFSLIFMTYVISFIFRKGRKN----------SGIWSFCFYV
         .:   :. . .   . :....: . :...:.:  .             ::: .:   .
CCDS10 RAFTRDGHMADTLLLLLLYGWAIIPLMYLMNFFFLGAATAYTRLTIFNILSGIATF--LM
    1170      1180      1190      1200      1210      1220         

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pF1KA0 VTVFSVAGFAFSIFESDIPFIFTFLIPPATMIGCLFLSSHLLFSS----LFSE------E
       ::.. .   : .. : .  .  .::. :   .:    : .  . .      ::      .
CCDS10 VTIMRIP--AVKLEELSKTLDHVFLVLPNHCLGMAVSSFYENYETRRYCTSSEVAAHYCK
      1230        1240      1250      1260      1270      1280     

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pF1KA0 RMDVQ---PFLVFLIPFL-HFII--------FLFTLRCLEWKFGKKSMRKD--PFFRISP
       ....:    : ..  : . .:.         .:. :  .: .. .. .:     . :   
CCDS10 KYNIQYQENFYAWSAPGVGRFVASMAASGCAYLILLFLIETNLLQR-LRGILCALRRRRT
        1290      1300      1310      1320      1330       1340    

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pF1KA0 RSSDVCQNPEEPEGEDEDVQMERVRTANALNSTNFDEKPVIIASCLRKEYAGKRKGCFSK
        .    . :  :  ::.::  ::.:   : .  .. . :.::     :: .      . .
CCDS10 LTELYTRMPVLP--EDQDVADERTRIL-APSPDSLLHTPLII-----KELS----KVYEQ
         1350        1360       1370      1380               1390  

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pF1KA0 RKNKIATRNVSFCVRKGEVLGLLGHNGAGKSTSIKVITGDTKPTAGQVLLKG----SGGG
       :   .:.  .:. :.::: .:::: :::::.:..:..::. . :.:.... :    :  :
CCDS10 RVPLLAVDRLSLAVQKGECFGLLGFNGAGKTTTFKMLTGEESLTSGDAFVGGHRISSDVG
           1400      1410      1420      1430      1440      1450  

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pF1KA0 DALEFLGYCPQENALWPNLTVRQHLEVYAAVKGLRKGDAEVAITRLVDALKLQDQLKSPV
        . . .::::: .::  ..: :. : .:: ..:. .    . .   . .: :. . .. :
CCDS10 KVRQRIGYCPQFDALLDHMTGREMLVMYARLRGIPERHIGACVENTLRGLLLEPHANKLV
           1460      1470      1480      1490      1500      1510  

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pF1KA0 KTLSEGIKRKLCFVLSILGNPSVVLLDEPSTGMDPEGQQQMWQAIRATFRNTERGALLTT
       .: : : ::::   ....:.:.:..:::::::::: ... .:... :  :.. .. ..:.
CCDS10 RTYSGGNKRKLSTGIALIGEPAVIFLDEPSTGMDPVARRLLWDTV-ARARESGKAIIITS
           1520      1530      1540      1550       1560      1570 

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pF1KA0 HYMAEAEAVCDRVAIMVSGRLRCIGSIQHLKSKFGKDYLLEMKVKNLAQVEPLH---AEI
       : : : ::.: :.::::.:...:.:: ::::::::. : :. ::.. .: : :.   : .
CCDS10 HSMEECEALCTRLAIMVQGQFKCLGSPQHLKSKFGSGYSLRAKVQSEGQQEALEEFKAFV
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pF1KA0 LRLFPQAARQERYSSLMVYKLPVEDVQPLAQAFFKLEKVKQSFDLEEYSLSQSTLEQVFL
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CCDS10 DLTFPGSVLEDEHQGMVHYHLPGRDLS-WAKVFGILEKAKEKYGVDDYSVSQISLEQVFL
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CCDS10 SFAHLQPPTAEEGR               
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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