Result of FASTA (ccds) for pF1KB5979
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5979, 520 aa
  1>>>pF1KB5979 520 - 520 aa - 520 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0818+/-0.000848; mu= 11.2603+/- 0.052
 mean_var=119.7577+/-23.780, 0's: 0 Z-trim(111.1): 31  B-trim: 47 in 1/50
 Lambda= 0.117199
 statistics sampled from 12114 (12145) to 12114 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.726), E-opt: 0.2 (0.373), width:  16
 Scan time:  3.310

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS14445.1 TBX22 gene_id:50945|Hs108|chrX         ( 520) 3528 607.4 1.2e-173
CCDS81360.1 TBX15 gene_id:6913|Hs108|chr1          ( 602) 1265 224.8 2.1e-58
CCDS30816.1 TBX15 gene_id:6913|Hs108|chr1          ( 496) 1241 220.7   3e-57
CCDS34495.1 TBX18 gene_id:9096|Hs108|chr6          ( 607) 1210 215.5 1.3e-55
CCDS43568.1 TBX20 gene_id:57057|Hs108|chr7         ( 447)  851 154.8   2e-37
CCDS13765.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22          ( 372)  760 139.3 7.2e-33
CCDS31621.1 TBX10 gene_id:347853|Hs108|chr11       ( 385)  754 138.3 1.5e-32
CCDS13766.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22          ( 398)  745 136.8 4.4e-32
CCDS13767.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22          ( 495)  737 135.5 1.4e-31
CCDS11629.1 TBX4 gene_id:9496|Hs108|chr17          ( 545)  724 133.3 6.7e-31
CCDS82180.1 TBX4 gene_id:9496|Hs108|chr17          ( 546)  724 133.3 6.7e-31
CCDS9173.1 TBX5 gene_id:6910|Hs108|chr12           ( 518)  695 128.4 1.9e-29
CCDS9175.1 TBX3 gene_id:6926|Hs108|chr12           ( 723)  688 127.3 5.8e-29
CCDS9174.1 TBX5 gene_id:6910|Hs108|chr12           ( 468)  679 125.7 1.2e-28
CCDS55960.1 MGA gene_id:23269|Hs108|chr15          (2856)  630 117.8 1.6e-25
CCDS55959.1 MGA gene_id:23269|Hs108|chr15          (3065)  630 117.9 1.7e-25
CCDS33310.1 TBR1 gene_id:10716|Hs108|chr2          ( 682)  600 112.4 1.7e-24
CCDS2646.1 EOMES gene_id:8320|Hs108|chr3           ( 686)  599 112.3 1.9e-24
CCDS63585.1 EOMES gene_id:8320|Hs108|chr3          ( 705)  597 111.9 2.4e-24
CCDS11514.1 TBX21 gene_id:30009|Hs108|chr17        ( 535)  578 108.6 1.8e-23
CCDS10670.1 TBX6 gene_id:6911|Hs108|chr16          ( 436)  537 101.7 1.8e-21
CCDS11627.2 TBX2 gene_id:6909|Hs108|chr17          ( 712)  524 99.6 1.3e-20
CCDS1272.1 TBX19 gene_id:9095|Hs108|chr1           ( 448)  487 93.2 6.6e-19
CCDS63584.1 EOMES gene_id:8320|Hs108|chr3          ( 410)  479 91.8 1.6e-18
CCDS5290.1 T gene_id:6862|Hs108|chr6               ( 435)  456 88.0 2.4e-17
CCDS59045.1 T gene_id:6862|Hs108|chr6              ( 377)  446 86.2   7e-17
CCDS9176.1 TBX3 gene_id:6926|Hs108|chr12           ( 743)  420 82.0 2.6e-15


>>CCDS14445.1 TBX22 gene_id:50945|Hs108|chrX              (520 aa)
 initn: 3528 init1: 3528 opt: 3528  Z-score: 3230.8  bits: 607.4 E(32554): 1.2e-173
Smith-Waterman score: 3528; 100.0% identity (100.0% similar) in 520 aa overlap (1-520:1-520)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MALSSRARAFSVEALVGRPSKRKLQDPIQAEQPELREKKGGEEEEERRSSAAGKSEPLEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MALSSRARAFSVEALVGRPSKRKLQDPIQAEQPELREKKGGEEEEERRSSAAGKSEPLEK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 QPKTEPSTSASSGCGSDSGYGNSSESLEEKDIQMELQGSELWKRFHDIGTEMIITKAGRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QPKTEPSTSASSGCGSDSGYGNSSESLEEKDIQMELQGSELWKRFHDIGTEMIITKAGRR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 MFPSVRVKVKGLDPGKQYHVAIDVVPVDSKRYRYVYHSSQWMVAGNTDHLCIIPRFYVHP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MFPSVRVKVKGLDPGKQYHVAIDVVPVDSKRYRYVYHSSQWMVAGNTDHLCIIPRFYVHP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 DSPCSGETWMRQIISFDRMKLTNNEMDDKGHIILQSMHKYKPRVHVIEQGSSVDLSQIQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DSPCSGETWMRQIISFDRMKLTNNEMDDKGHIILQSMHKYKPRVHVIEQGSSVDLSQIQS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 LPTEGVKTFSFKETEFTTVTAYQNQQITKLKIERNPFAKGFRDTGRNRGVLDGLLETYPW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LPTEGVKTFSFKETEFTTVTAYQNQQITKLKIERNPFAKGFRDTGRNRGVLDGLLETYPW
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 RPSFTLDFKTFGADTQSGSSGSSPVTSSGGAPSPLNSLLSPLCFSPMFHLPTSSLGMPCP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RPSFTLDFKTFGADTQSGSSGSSPVTSSGGAPSPLNSLLSPLCFSPMFHLPTSSLGMPCP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 EAYLPNVNLPLCYKICPTNFWQQQPLVLPAPERLASSNSSQSLAPLMMEVPMLSSLGVTN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EAYLPNVNLPLCYKICPTNFWQQQPLVLPAPERLASSNSSQSLAPLMMEVPMLSSLGVTN
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 SKSGSSEDSSDQYLQAPNSTNQMLYGLQSPGNIFLPNSITPEALSCSFHPSYDFYRYNFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SKSGSSEDSSDQYLQAPNSTNQMLYGLQSPGNIFLPNSITPEALSCSFHPSYDFYRYNFS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520
pF1KB5 MPSRLISGSNHLKVNDDSQVSFGEGKCNHVHWYPAINHYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MPSRLISGSNHLKVNDDSQVSFGEGKCNHVHWYPAINHYL
              490       500       510       520

>>CCDS81360.1 TBX15 gene_id:6913|Hs108|chr1               (602 aa)
 initn: 914 init1: 634 opt: 1265  Z-score: 1161.9  bits: 224.8 E(32554): 2.1e-58
Smith-Waterman score: 1400; 45.5% identity (69.0% similar) in 565 aa overlap (1-520:9-566)

                       10        20                30              
pF1KB5         MALSSRARAFSVEALVGRPSKRKLQD--------PIQAEQP-------ELRE
               .::::::.:::::::.:  .::::.:         ..: .:       :   
CCDS81 MSERRRSAVALSSRAHAFSVEALIGSNKKRKLRDWEEKGLDLSMEALSPAGPLGDTEDAA
               10        20        30        40        50        60

        40        50        60        70        80        90       
pF1KB5 KKGGEEEEERRSSAAGKSEPLEKQPKTEPSTSASSGCGSDSGYGNSSESLEEKDIQMELQ
        .: : . . ..:... :: : .. .   :: .. . :. .    .  :.::  ::.:::
CCDS81 AHGLEPHPDSEQSTGSDSEVLTERTSCSFSTHTDLASGAAGPVPAAMSSMEE--IQVELQ
               70        80        90       100       110          

       100       110       120       130       140       150       
pF1KB5 GSELWKRFHDIGTEMIITKAGRRMFPSVRVKVKGLDPGKQYHVAIDVVPVDSKRYRYVYH
        ..:::::::::::::::::::::::..:::. :::: .::..:.:.::::.::::::::
CCDS81 CADLWKRFHDIGTEMIITKAGRRMFPAMRVKITGLDPHQQYYIAMDIVPVDNKRYRYVYH
      120       130       140       150       160       170        

       160       170       180       190       200       210       
pF1KB5 SSQWMVAGNTDHLCIIPRFYVHPDSPCSGETWMRQIISFDRMKLTNNEMDDKGHIILQSM
       ::.::::::.:   . :: :.::::  ::.:::::..:::..::::::.::.:::::.::
CCDS81 SSKWMVAGNADSP-VPPRVYIHPDSLASGDTWMRQVVSFDKLKLTNNELDDQGHIILHSM
      180       190        200       210       220       230       

       220       230       240        250       260       270      
pF1KB5 HKYKPRVHVIEQGSSVDLSQIQSLPT-EGVKTFSFKETEFTTVTAYQNQQITKLKIERNP
       :::.::::::..  : :::  . .:. .:::::.: :: :::::::::::::.:::.:::
CCDS81 HKYQPRVHVIRKDFSSDLSPTKPVPVGDGVKTFNFPETVFTTVTAYQNQQITRLKIDRNP
       240       250       260       270       280       290       

        280       290        300        310         320       330  
pF1KB5 FAKGFRDTGRNRGVLDGLLETYP-WRPSF-TLDFKTFGA--DTQSGSSGSSPVTSSGGAP
       :::::::.::::  :....:::  :::   :: :. : .    :.::.:.::.::: :.:
CCDS81 FAKGFRDSGRNRTGLEAIMETYAFWRPPVRTLTFEDFTTMQKQQGGSTGTSPTTSSTGTP
       300       310       320       330       340       350       

              340       350       360          370       380       
pF1KB5 SPLNS--LLSPLCFSPMFHLPTSSLGMPCPEAYLPNVNL---PLCYKICPTNFWQQQPLV
       ::  :  :::: :  : :::  ..... : :. : :.::   : : .   . . .   : 
CCDS81 SPSASSHLLSPSCSPPTFHLAPNTFNVGCRESQLCNLNLSDYPPCARSNMAALQSYPGLS
       360       370       380       390       400       410       

       390       400          410        420         430       440 
pF1KB5 LPAPERLASSNSS--QSLAPLM-MEVP-MLSSLGVTNSKSGSS--EDSSDQYLQAPNSTN
         . .:: :...:  :    .: ...: ..:.. .  :  :.:  :  . :  . :  :.
CCDS81 DSGYNRLQSGTTSATQPSETFMPQRTPSLISGIPTPPSLPGNSKMEAYGGQLGSFP--TS
       420       430       440       450       460       470       

             450       460                  470       480       490
pF1KB5 QMLYGLQSPGNIFLPNSITPEAL-----------SCSFHPSYDFYRYNFSMPSRLISGSN
       :. : .:. ::    .: .:. .           . :.:  :..: :::    :: .. .
CCDS81 QFQYVMQA-GNA-ASSSSSPHMFGGSHMQQSSYNAFSLHNPYNLYGYNFPTSPRLAASPE
         480         490       500       510       520       530   

              500         510        520                           
pF1KB5 HLKVNDDSQV--SFGEGKCNHVHWYPA-INHYL                           
       .:...... .  : ..:  .. .. :. ..: .                           
CCDS81 KLSASQSTLLCSSPSNGAFGERQYLPSGMEHSMHMISPSPNNQQATNTCDGRQYGAVPGS
           540       550       560       570       580       590   

CCDS81 SSQMSVHMV
           600  

>>CCDS30816.1 TBX15 gene_id:6913|Hs108|chr1               (496 aa)
 initn: 789 init1: 634 opt: 1241  Z-score: 1141.3  bits: 220.7 E(32554): 3e-57
Smith-Waterman score: 1299; 48.6% identity (71.8% similar) in 465 aa overlap (86-520:3-460)

          60        70        80        90       100       110     
pF1KB5 EPLEKQPKTEPSTSASSGCGSDSGYGNSSESLEEKDIQMELQGSELWKRFHDIGTEMIIT
                                     :.::  ::.::: ..:::::::::::::::
CCDS30                             MSSMEE--IQVELQCADLWKRFHDIGTEMIIT
                                             10        20        30

         120       130       140       150       160       170     
pF1KB5 KAGRRMFPSVRVKVKGLDPGKQYHVAIDVVPVDSKRYRYVYHSSQWMVAGNTDHLCIIPR
       ::::::::..:::. :::: .::..:.:.::::.::::::::::.::::::.:   . ::
CCDS30 KAGRRMFPAMRVKITGLDPHQQYYIAMDIVPVDNKRYRYVYHSSKWMVAGNADSP-VPPR
               40        50        60        70        80          

         180       190       200       210       220       230     
pF1KB5 FYVHPDSPCSGETWMRQIISFDRMKLTNNEMDDKGHIILQSMHKYKPRVHVIEQGSSVDL
        :.::::  ::.:::::..:::..::::::.::.:::::.:::::.::::::..  : ::
CCDS30 VYIHPDSLASGDTWMRQVVSFDKLKLTNNELDDQGHIILHSMHKYQPRVHVIRKDFSSDL
      90       100       110       120       130       140         

         240        250       260       270       280       290    
pF1KB5 SQIQSLPT-EGVKTFSFKETEFTTVTAYQNQQITKLKIERNPFAKGFRDTGRNRGVLDGL
       :  . .:. .:::::.: :: :::::::::::::.:::.::::::::::.::::  :...
CCDS30 SPTKPVPVGDGVKTFNFPETVFTTVTAYQNQQITRLKIDRNPFAKGFRDSGRNRTGLEAI
     150       160       170       180       190       200         

           300        310         320       330         340        
pF1KB5 LETYP-WRPSF-TLDFKTFGA--DTQSGSSGSSPVTSSGGAPSPLNS--LLSPLCFSPMF
       .:::  :::   :: :. : .    :.::.:.::.::: :.:::  :  :::: :  : :
CCDS30 METYAFWRPPVRTLTFEDFTTMQKQQGGSTGTSPTTSSTGTPSPSASSHLLSPSCSPPTF
     210       220       230       240       250       260         

      350       360          370       380       390       400     
pF1KB5 HLPTSSLGMPCPEAYLPNVNL---PLCYKICPTNFWQQQPLVLPAPERLASSNSS--QSL
       ::  ..... : :. : :.::   : : .   . . .   :   . .:: :...:  :  
CCDS30 HLAPNTFNVGCRESQLCNLNLSDYPPCARSNMAALQSYPGLSDSGYNRLQSGTTSATQPS
     270       280       290       300       310       320         

            410        420         430       440       450         
pF1KB5 APLM-MEVP-MLSSLGVTNSKSGSS--EDSSDQYLQAPNSTNQMLYGLQSPGNIFLPNSI
         .: ...: ..:.. .  :  :.:  :  . :  . :  :.:. : .:. ::    .: 
CCDS30 ETFMPQRTPSLISGIPTPPSLPGNSKMEAYGGQLGSFP--TSQFQYVMQA-GNA-ASSSS
     330       340       350       360         370        380      

     460                  470       480       490       500        
pF1KB5 TPEAL-----------SCSFHPSYDFYRYNFSMPSRLISGSNHLKVNDDSQV--SFGEGK
       .:. .           . :.:  :..: :::    :: .. ..:...... .  : ..: 
CCDS30 SPHMFGGSHMQQSSYNAFSLHNPYNLYGYNFPTSPRLAASPEKLSASQSTLLCSSPSNGA
         390       400       410       420       430       440     

        510        520                                    
pF1KB5 CNHVHWYPA-INHYL                                    
        .. .. :. ..: .                                    
CCDS30 FGERQYLPSGMEHSMHMISPSPNNQQATNTCDGRQYGAVPGSSSQMSVHMV
         450       460       470       480       490      

>>CCDS34495.1 TBX18 gene_id:9096|Hs108|chr6               (607 aa)
 initn: 725 init1: 618 opt: 1210  Z-score: 1111.6  bits: 215.5 E(32554): 1.3e-55
Smith-Waterman score: 1231; 43.2% identity (64.4% similar) in 553 aa overlap (6-502:16-554)

                         10        20           30              40 
pF1KB5           MALSSRARAFSVEALVGRPSKRKLQDP---IQAEQPELR------EKKGG
                      .:.:::::::.:  ....::     . ::.           . ::
CCDS34 MAEKRRGSPCSMLSLKAHAFSVEALIGAEKQQQLQKKRRKLGAEEAAGAVDDGGCSRGGG
               10        20        30        40        50        60

              50        60               70          80            
pF1KB5 EEEEERRSSAAGKSEPLEKQPKTEPSTS-------ASSGC--GSDSGY-----------G
         :.    .  : . :      . :. :       :..::  : ..:            :
CCDS34 AGEKGSSEGDEGAALPPPAGATSGPARSGADLERGAAGGCEDGFQQGASPLASPGGSPKG
               70        80        90       100       110       120

              90               100       110       120       130   
pF1KB5 NSSESLEEKDIQM--------ELQGSELWKRFHDIGTEMIITKAGRRMFPSVRVKVKGLD
       . ..:: .    .        .:::.:::::::.::::::::::::::::..:::..:::
CCDS34 SPARSLARPGTPLPSPQAPRVDLQGAELWKRFHEIGTEMIITKAGRRMFPAMRVKISGLD
              130       140       150       160       170       180

           140       150       160       170       180       190   
pF1KB5 PGKQYHVAIDVVPVDSKRYRYVYHSSQWMVAGNTDHLCIIPRFYVHPDSPCSGETWMRQI
       : .::..:.:.::::.::::::::::.::::::.:   . :: :.::::: ::::::::.
CCDS34 PHQQYYIAMDIVPVDNKRYRYVYHSSKWMVAGNADSP-VPPRVYIHPDSPASGETWMRQV
              190       200       210        220       230         

           200       210       220       230       240        250  
pF1KB5 ISFDRMKLTNNEMDDKGHIILQSMHKYKPRVHVIEQGSSVDLSQIQSLPT-EGVKTFSFK
       ::::..::::::.::.:::::.:::::.::::::..  . ::: :. .:. ::::.::: 
CCDS34 ISFDKLKLTNNELDDQGHIILHSMHKYQPRVHVIRKDCGDDLSPIKPVPSGEGVKAFSFP
     240       250       260       270       280       290         

            260       270       280       290        300        310
pF1KB5 ETEFTTVTAYQNQQITKLKIERNPFAKGFRDTGRNRGVLDGLLETYP-WRPSF-TLDFKT
       :: :::::::::::::.:::.::::::::::.::::  :..:.:.:  ::::. :: :. 
CCDS34 ETVFTTVTAYQNQQITRLKIDRNPFAKGFRDSGRNRMGLEALVESYAFWRPSLRTLTFED
     300       310       320       330       340       350         

               320        330       340        350        360      
pF1KB5 F-GADTQSGSSGSSPVTSSG-GAPSPLNSLLS-PLCFSPMFHL-PTSSLGMPCPEAYLPN
       . :   :...:.:. . ..: :.:.    :::   : :: ::: :..:  . :  :    
CCDS34 IPGIPKQGNASSSTLLQGTGNGVPATHPHLLSGSSCSSPAFHLGPNTS--QLCSLA----
     360       370       380       390       400         410       

        370         380       390       400         410       420  
pF1KB5 VNLPLCYKICPTN--FWQQQPLVLPAPERLASSNSSQSLAPLMME--VPMLSSLGVTNSK
          :  :. :  .    ..    :       ........::      : . :: .:. : 
CCDS34 ---PADYSACARSGLTLNRYSTSLAETYNRLTNQAGETFAPPRTPSYVGVSSSTSVNMSM
              420       430       440       450       460       470

                 430       440       450        460         470    
pF1KB5 SGSSEDS-----SDQYLQAPNSTNQMLYGLQSPG-NIFLPNSITPEALSCSF--HPSYDF
       .:.. :.     ..  .:  . . :. : . ::. : :  :. : ..   .:  :    .
CCDS34 GGTDGDTFSCPQTSLSMQISGMSPQLQYIMPSPSSNAFATNQ-THQGSYNTFRLHSPCAL
              480       490       500       510        520         

          480       490       500       510       520              
pF1KB5 YRYNFSMPSRLISGSNHLKVNDDSQVSFGEGKCNHVHWYPAINHYL              
       : ::::   .: .. ...    .:: ::                                
CCDS34 YGYNFSTSPKLAASPEKIV---SSQGSFLGSSPSGTMTDRQMLPPVEGVHLLSSGGQQSF
     530       540          550       560       570       580      

>>CCDS43568.1 TBX20 gene_id:57057|Hs108|chr7              (447 aa)
 initn: 799 init1: 349 opt: 851  Z-score: 785.5  bits: 154.8 E(32554): 2e-37
Smith-Waterman score: 851; 40.3% identity (65.8% similar) in 409 aa overlap (3-397:11-405)

                       10           20        30        40         
pF1KB5         MALSSRARAFSVEALV---GRPSKRKLQDPIQAEQPELREKKGGEEEEERRS
                 ::::: :::. ::.   :   :.  .. :.  . .. ::..  .   . .
CCDS43 MEFTASPKPQLSSRANAFSIAALMSSGGSKEKEATENTIKPLE-QFVEKSSCAQPLGELT
               10        20        30        40         50         

      50        60        70        80          90       100       
pF1KB5 SAAGKSEPLEKQPKTEPSTSASSGCGSDSGYGNSS--ESLEEKDIQMELQGSELWKRFHD
       :  ...: .     . ::.:  : : ..    ..    : :   :   :. .::: .::.
CCDS43 SLDAHGE-FGGGSGSSPSSS--SLC-TEPLIPTTPIIPSEEMAKIACSLETKELWDKFHE
      60         70          80         90       100       110     

       110       120       130       140       150       160       
pF1KB5 IGTEMIITKAGRRMFPSVRVKVKGLDPGKQYHVAIDVVPVDSKRYRYVYHSSQWMVAGNT
       .::::::::.::::::..::. .:.::  .: : .:.::::.:::::.:: :.:.:::..
CCDS43 LGTEMIITKSGRRMFPTIRVSFSGVDPEAKYIVLMDIVPVDNKRYRYAYHRSSWLVAGKA
         120       130       140       150       160       170     

       170        180       190       200       210       220      
pF1KB5 DHLCIIP-RFYVHPDSPCSGETWMRQIISFDRMKLTNNEMDDKGHIILQSMHKYKPRVHV
       :    .: :.::::::: .::  ..:..::...::::::.:..:::::.:::::.::::.
CCDS43 DP--PLPARLYVHPDSPFTGEQLLKQMVSFEKVKLTNNELDQHGHIILNSMHKYQPRVHI
           180       190       200       210       220       230   

        230       240       250       260       270       280      
pF1KB5 IEQGSSVDLSQIQSLPTEGVKTFSFKETEFTTVTAYQNQQITKLKIERNPFAKGFRDTGR
       :.. . .  ... .: .:  .:: : :: ::.::::::: ::::::. :::::::::..:
CCDS43 IKKKDHT--ASLLNLKSEEFRTFIFPETVFTAVTAYQNQLITKLKIDSNPFAKGFRDSSR
           240         250       260       270       280       290 

        290       300        310         320       330          340
pF1KB5 NRGVLDGLLETYPWRPSFTLD-FKTFGA--DTQSGSSGSSPVTSSGGAPSP---LNSLLS
          .    .:.   . :.. . ..:.:.  :. .  : ..:  .:. . :    :.: .:
CCDS43 LTDIERESVESLIQKHSYARSPIRTYGGEEDVLGDESQTTPNRGSAFTTSDNLSLSSWVS
             300       310       320       330       340       350 

              350         360       370       380       390        
pF1KB5 PLCFSPMFHLPTS--SLGMPCPEAYLPNVNLPLCYKICPTNFWQQQPLVLPAPERLASSN
            : :. : :  .::        : .  :.  .. : .   . ::.   :  .::: 
CCDS43 SSSSFPGFQHPQSLTALGTSTASIATP-IPHPIQGSLPPYSRLGM-PLT---PSAIASSM
             360       370        380       390           400      

      400       410       420       430       440       450        
pF1KB5 SSQSLAPLMMEVPMLSSLGVTNSKSGSSEDSSDQYLQAPNSTNQMLYGLQSPGNIFLPNS
                                                                   
CCDS43 QGSGPTFPSFHMPRYHHYFQQGPYAAIQGLRHSSAVMTPFV                   
        410       420       430       440                          

>>CCDS13765.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22               (372 aa)
 initn: 764 init1: 310 opt: 760  Z-score: 703.6  bits: 139.3 E(32554): 7.2e-33
Smith-Waterman score: 770; 43.3% identity (66.2% similar) in 305 aa overlap (51-341:60-356)

               30        40        50        60        70        80
pF1KB5 KRKLQDPIQAEQPELREKKGGEEEEERRSSAAGKSEPLEKQPKTEPSTSASSGCGSDSGY
                                     : :   : .  : .  . .:.:. .   : 
CCDS13 AASPGADPYGPREPPPPPPRYDPCAAAAPGAPGPPPPPHAYPFAPAAGAATSAAAEPEGP
      30        40        50        60        70        80         

               90                100       110       120       130 
pF1KB5 GNSSESLEEKDIQ---------MELQGSELWKRFHDIGTEMIITKAGRRMFPSVRVKVKG
       : :  .  .  ..         ..:. . :: .:...:::::.:::::::::. .::. :
CCDS13 GASCAAAAKAPVKKNAKVAGVSVQLEMKALWDEFNQLGTEMIVTKAGRRMFPTFQVKLFG
      90       100       110       120       130       140         

             140       150       160       170        180       190
pF1KB5 LDPGKQYHVAIDVVPVDSKRYRYVYHSSQWMVAGNTDHLCIIP-RFYVHPDSPCSGETWM
       .::  .: . .: ::::.:::::..:::.:.:::..:     : : . ::::: .:  ::
CCDS13 MDPMADYMLLMDFVPVDDKRYRYAFHSSSWLVAGKADP--ATPGRVHYHPDSPAKGAQWM
     150       160       170       180         190       200       

              200       210       220       230       240       250
pF1KB5 RQIISFDRMKLTNNEMDDKGHIILQSMHKYKPRVHVIEQGSSVDLSQIQSLPTEGVKTFS
       .::.:::..::::: .::.:::::.:::.:.:: ::.      :    ..   :. ::: 
CCDS13 KQIVSFDKLKLTNNLLDDNGHIILNSMHRYQPRFHVVYVDPRKDS---EKYAEENFKTFV
       210       220       230       240       250          260    

              260       270       280          290       300       
pF1KB5 FKETEFTTVTAYQNQQITKLKIERNPFAKGFRDTGRN---RGVLDGLLETYPWRPSFTLD
       :.::.::.::::::..::.:::  :::::::::   .   :.   : :   :   .:. .
CCDS13 FEETRFTAVTAYQNHRITQLKIASNPFAKGFRDCDPEDWPRNHRPGAL---PLMSAFARS
          270       280       290       300       310          320 

       310        320       330       340       350       360      
pF1KB5 FKTFGADTQ-SGSSGSSPVTSSGGAPSPLNSLLSPLCFSPMFHLPTSSLGMPCPEAYLPN
        .  .. :: ::.  .  . .::  :. :. ::.:                         
CCDS13 RNPVASPTQPSGTEKGLVTEGSGLQPGLLDVLLKPPSKKSESLRPPHCKDT         
             330       340       350       360       370           

        370       380       390       400       410       420      
pF1KB5 VNLPLCYKICPTNFWQQQPLVLPAPERLASSNSSQSLAPLMMEVPMLSSLGVTNSKSGSS

>>CCDS31621.1 TBX10 gene_id:347853|Hs108|chr11            (385 aa)
 initn: 696 init1: 294 opt: 754  Z-score: 697.9  bits: 138.3 E(32554): 1.5e-32
Smith-Waterman score: 770; 41.5% identity (65.2% similar) in 330 aa overlap (57-367:34-353)

         30        40        50        60        70        80      
pF1KB5 PIQAEQPELREKKGGEEEEERRSSAAGKSEPLEKQPKTEPSTSASSGCGSDSGYGNSSES
                                     :. . : :  :...... .  .: : ..  
CCDS31 FLSAGLGILAPSETYPLPTTSSGWEPRLGSPFPSGPCT--SSTGAQAVAEPTGQGPKNPR
            10        20        30        40          50        60 

         90       100       110       120       130       140      
pF1KB5 LEEKDIQMELQGSELWKRFHDIGTEMIITKAGRRMFPSVRVKVKGLDPGKQYHVAIDVVP
       . .  .:.:..   ::..:...:::::.:::::::::  .::. :.:   .: . .: .:
CCDS31 VSRVTVQLEMK--PLWEEFNQLGTEMIVTKAGRRMFPPFQVKILGMDSLADYALLMDFIP
              70          80        90       100       110         

        150       160       170        180       190       200     
pF1KB5 VDSKRYRYVYHSSQWMVAGNTDHLCIIP-RFYVHPDSPCSGETWMRQIISFDRMKLTNNE
       .:.:::::..::: :.:::..:     : : . ::::: .:  :::::.:::..::::: 
CCDS31 LDDKRYRYAFHSSAWLVAGKADP--ATPGRVHFHPDSPAKGAQWMRQIVSFDKLKLTNNL
     120       130       140         150       160       170       

         210       220       230       240       250       260     
pF1KB5 MDDKGHIILQSMHKYKPRVHVIEQGSSVDLSQIQSLPTEGVKTFSFKETEFTTVTAYQNQ
       .::.:::::.:::.:.:: ::.      :  .  .   :. :.: : ::.::.::::::.
CCDS31 LDDNGHIILNSMHRYQPRFHVVFVDPRKDSERYAQ---ENFKSFIFTETQFTAVTAYQNH
       180       190       200       210          220       230    

         270       280        290       300       310         320  
pF1KB5 QITKLKIERNPFAKGFRDTGRNR-GVLDGLLETYPWRPSFTLDFKTF-GA-DTQSGSSGS
       .::.:::  ::::::::..  .   :    : . : :   .:.  .. :: : ..  . .
CCDS31 RITQLKIASNPFAKGFRESDLDSWPVAPRPLLSVPARSHSSLSPCVLKGATDREKDPNKA
          240       250       260       270       280       290    

            330              340            350         360        
pF1KB5 SPVTSSGGA-------PSPLNSLLSPLCFSP-----MFHLPTSSLGMPC--PEAY-LPNV
       :  ::.  :       : : . ::.:  . :     ..    : ::.:   :  : :::.
CCDS31 SASTSKTPAWLHHQLLPPP-EVLLAPATYRPVTYQSLYSGAPSHLGIPRTRPAPYPLPNI
          300       310        320       330       340       350   

       370       380       390       400       410       420       
pF1KB5 NLPLCYKICPTNFWQQQPLVLPAPERLASSNSSQSLAPLMMEVPMLSSLGVTNSKSGSSE
                                                                   
CCDS31 RADRDQGGLPLPAGLGLLSPTVVCLGPGQDSQ                            
           360       370       380                                 

>>CCDS13766.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22               (398 aa)
 initn: 770 init1: 310 opt: 745  Z-score: 689.4  bits: 136.8 E(32554): 4.4e-32
Smith-Waterman score: 755; 40.5% identity (64.0% similar) in 331 aa overlap (51-365:60-381)

               30        40        50        60        70        80
pF1KB5 KRKLQDPIQAEQPELREKKGGEEEEERRSSAAGKSEPLEKQPKTEPSTSASSGCGSDSGY
                                     : :   : .  : .  . .:.:. .   : 
CCDS13 AASPGADPYGPREPPPPPPRYDPCAAAAPGAPGPPPPPHAYPFAPAAGAATSAAAEPEGP
      30        40        50        60        70        80         

               90                100       110       120       130 
pF1KB5 GNSSESLEEKDIQ---------MELQGSELWKRFHDIGTEMIITKAGRRMFPSVRVKVKG
       : :  .  .  ..         ..:. . :: .:...:::::.:::::::::. .::. :
CCDS13 GASCAAAAKAPVKKNAKVAGVSVQLEMKALWDEFNQLGTEMIVTKAGRRMFPTFQVKLFG
      90       100       110       120       130       140         

             140       150       160       170        180       190
pF1KB5 LDPGKQYHVAIDVVPVDSKRYRYVYHSSQWMVAGNTDHLCIIP-RFYVHPDSPCSGETWM
       .::  .: . .: ::::.:::::..:::.:.:::..:     : : . ::::: .:  ::
CCDS13 MDPMADYMLLMDFVPVDDKRYRYAFHSSSWLVAGKADP--ATPGRVHYHPDSPAKGAQWM
     150       160       170       180         190       200       

              200       210       220       230       240       250
pF1KB5 RQIISFDRMKLTNNEMDDKGHIILQSMHKYKPRVHVIEQGSSVDLSQIQSLPTEGVKTFS
       .::.:::..::::: .::.:::::.:::.:.:: ::.      :    ..   :. ::: 
CCDS13 KQIVSFDKLKLTNNLLDDNGHIILNSMHRYQPRFHVVYVDPRKDS---EKYAEENFKTFV
       210       220       230       240       250          260    

              260       270       280          290       300       
pF1KB5 FKETEFTTVTAYQNQQITKLKIERNPFAKGFRDTGRN---RGVLDGLLETYPWRPSFTLD
       :.::.::.::::::..::.:::  :::::::::   .   :.   : :   :   .:. .
CCDS13 FEETRFTAVTAYQNHRITQLKIASNPFAKGFRDCDPEDWPRNHRPGAL---PLMSAFARS
          270       280       290       300       310          320 

       310        320       330       340       350         360    
pF1KB5 FKTFGADTQ-SGSSGSSPVTSSGGAPSPLNSLLSPLCFSPMFHLPTS--SLGMPCPEAYL
        .  .. :: ::.  .. : ..  . .  .:  .:     ...   .  .::.:::    
CCDS13 RNPVASPTQPSGTEKGGHVLKDKEVKAE-TSRNTPEREVELLRDAGGCVNLGLPCPAECQ
             330       340        350       360       370       380

          370       380       390       400       410       420    
pF1KB5 PNVNLPLCYKICPTNFWQQQPLVLPAPERLASSNSSQSLAPLMMEVPMLSSLGVTNSKSG
       :                                                           
CCDS13 PFNTQGLVAGRTAGDRLC                                          
              390                                                  

>>CCDS13767.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22               (495 aa)
 initn: 773 init1: 320 opt: 737  Z-score: 680.7  bits: 135.5 E(32554): 1.4e-31
Smith-Waterman score: 756; 39.7% identity (61.2% similar) in 358 aa overlap (51-371:60-411)

               30        40        50        60        70        80
pF1KB5 KRKLQDPIQAEQPELREKKGGEEEEERRSSAAGKSEPLEKQPKTEPSTSASSGCGSDSGY
                                     : :   : .  : .  . .:.:. .   : 
CCDS13 AASPGADPYGPREPPPPPPRYDPCAAAAPGAPGPPPPPHAYPFAPAAGAATSAAAEPEGP
      30        40        50        60        70        80         

               90                100       110       120       130 
pF1KB5 GNSSESLEEKDIQ---------MELQGSELWKRFHDIGTEMIITKAGRRMFPSVRVKVKG
       : :  .  .  ..         ..:. . :: .:...:::::.:::::::::. .::. :
CCDS13 GASCAAAAKAPVKKNAKVAGVSVQLEMKALWDEFNQLGTEMIVTKAGRRMFPTFQVKLFG
      90       100       110       120       130       140         

             140       150       160       170        180       190
pF1KB5 LDPGKQYHVAIDVVPVDSKRYRYVYHSSQWMVAGNTDHLCIIP-RFYVHPDSPCSGETWM
       .::  .: . .: ::::.:::::..:::.:.:::..:     : : . ::::: .:  ::
CCDS13 MDPMADYMLLMDFVPVDDKRYRYAFHSSSWLVAGKADP--ATPGRVHYHPDSPAKGAQWM
     150       160       170       180         190       200       

              200       210       220       230       240       250
pF1KB5 RQIISFDRMKLTNNEMDDKGHIILQSMHKYKPRVHVIEQGSSVDLSQIQSLPTEGVKTFS
       .::.:::..::::: .::.:::::.:::.:.:: ::.      :    ..   :. ::: 
CCDS13 KQIVSFDKLKLTNNLLDDNGHIILNSMHRYQPRFHVVYVDPRKDS---EKYAEENFKTFV
       210       220       230       240       250          260    

              260       270       280              290             
pF1KB5 FKETEFTTVTAYQNQQITKLKIERNPFAKGFRDTG-----RNR--GVLDGLLETY-----
       :.::.::.::::::..::.:::  :::::::::       ::.  :.:  :. ..     
CCDS13 FEETRFTAVTAYQNHRITQLKIASNPFAKGFRDCDPEDWPRNHRPGALP-LMSAFARSRN
          270       280       290       300       310        320   

          300        310       320       330       340             
pF1KB5 ----PWRPSFTL-DFKTFGADTQSGSSGSSPVTSSGGAPSPLNSLLSPLC--------FS
           : .:: :  :      . :  ..: . . . .  :. :  .:::          . 
CCDS13 PVASPTQPSGTEKDAAEARREFQRDAGGPAVLGDPAHPPQLLARVLSPSLPGAGGAGGLV
           330       340       350       360       370       380   

         350       360         370       380       390       400   
pF1KB5 PMFHLPTSSLGMPCPEAYL--PNVNLPLCYKICPTNFWQQQPLVLPAPERLASSNSSQSL
       :.   : .  . : ::  :  :... ::                                
CCDS13 PLPGAPGGRPSPPNPELRLEAPGASEPLHHHPYKYPAAAYDHYLGAKSRPAPYPLPGLRG
           390       400       410       420       430       440   

>>CCDS11629.1 TBX4 gene_id:9496|Hs108|chr17               (545 aa)
 initn: 716 init1: 280 opt: 724  Z-score: 668.2  bits: 133.3 E(32554): 6.7e-31
Smith-Waterman score: 724; 46.0% identity (70.7% similar) in 263 aa overlap (24-284:2-252)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MALSSRARAFSVEALVGRPSKRKLQDPIQAEQPELREKKGGEEEEERRSSAAGKSEPLEK
                              :::   .:. :  .  :    :   .:::.  ::   
CCDS11                       MLQDKGLSESEEAFRAPGPALGE---ASAANAPEPALA
                                     10        20           30     

               70         80        90       100       110         
pF1KB5 QPKTEPSTSASS-GCGSDSGYGNSSESLEEKDIQMELQGSELWKRFHDIGTEMIITKAGR
        :    .. .:  : :.:   . ..:.  : .:.. :. .::::.::. :::::::::::
CCDS11 APGLSGAALGSPPGPGADVVAAAAAEQTIE-NIKVGLHEKELWKKFHEAGTEMIITKAGR
          40        50        60         70        80        90    

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB5 RMFPSVRVKVKGLDPGKQYHVAIDVVPVDSKRYRYVYHSSQWMVAGNTDHLCIIP-RFYV
       ::::: .::: :..:  .: . ::.::.:..::..   ...:::::...    .: :.::
CCDS11 RMFPSYKVKVTGMNPKTKYILLIDIVPADDHRYKFC--DNKWMVAGKAEP--AMPGRLYV
          100       110       120       130         140         150

      180       190       200       210       220       230        
pF1KB5 HPDSPCSGETWMRQIISFDRMKLTNNEMDDKGHIILQSMHKYKPRVHVIEQGSSVDLSQI
       ::::: .:  ::::..::...:::::..:  :::::.:::::.::.:...    .: .. 
CCDS11 HPDSPATGAHWMRQLVSFQKLKLTNNHLDPFGHIILNSMHKYQPRLHIVK----ADENNA
              160       170       180       190       200          

      240       250       260       270       280       290        
pF1KB5 QSLPTEGVKTFSFKETEFTTVTAYQNQQITKLKIERNPFAKGFRDTGRNRGVLDGLLETY
        .  . .  :  : :: : .::.:::..::.:::: :::::::: .              
CCDS11 FGSKNTAFCTHVFPETSFISVTSYQNHKITQLKIENNPFAKGFRGSDDSDLRVARLQSKE
        210       220       230       240       250       260      

      300       310       320       330       340       350        
pF1KB5 PWRPSFTLDFKTFGADTQSGSSGSSPVTSSGGAPSPLNSLLSPLCFSPMFHLPTSSLGMP
                                                                   
CCDS11 YPVISKSIMRQRLISPQLSATPDVGPLLGTHQALQHYQHENGAHSQLAEPQDLPLSTFPT
        270       280       290       300       310       320      




520 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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