Result of FASTA (omim) for pF1KB0926
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB0926, 356 aa
  1>>>pF1KB0926 356 - 356 aa - 356 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7044+/-0.00029; mu= 7.8778+/- 0.018
 mean_var=156.2410+/-31.655, 0's: 0 Z-trim(122.1): 87  B-trim: 0 in 0/59
 Lambda= 0.102607
 statistics sampled from 39622 (39709) to 39622 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.784), E-opt: 0.2 (0.466), width:  16
 Scan time:  9.380

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
XP_016856199 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 466)  648 107.0 8.6e-23
XP_016856198 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 470)  648 107.0 8.6e-23
NP_001165693 (OMIM: 616396) polycomb protein SCMH1 ( 480)  648 107.0 8.8e-23
XP_016856196 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 480)  648 107.0 8.8e-23
XP_016856195 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 488)  648 107.0 8.9e-23
XP_011539345 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 492)  648 107.0 8.9e-23
XP_011539346 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 492)  648 107.0 8.9e-23
XP_016856194 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 502)  648 107.0 9.1e-23
XP_011539342 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 523)  648 107.1 9.4e-23
XP_016856193 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 537)  648 107.1 9.6e-23
XP_016856192 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 547)  648 107.1 9.7e-23
XP_016856191 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 547)  648 107.1 9.7e-23
XP_016856190 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 559)  648 107.1 9.9e-23
XP_016856189 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 564)  648 107.1   1e-22
XP_011539347 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 569)  648 107.1   1e-22
NP_001165689 (OMIM: 616396) polycomb protein SCMH1 ( 577)  648 107.1   1e-22
NP_001165691 (OMIM: 616396) polycomb protein SCMH1 ( 577)  648 107.1   1e-22
NP_036368 (OMIM: 616396) polycomb protein SCMH1 is ( 591)  648 107.1   1e-22
XP_006710527 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 599)  648 107.1   1e-22
XP_016856188 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 599)  648 107.1   1e-22
XP_011539338 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 599)  648 107.1   1e-22
NP_001165692 (OMIM: 616396) polycomb protein SCMH1 ( 599)  648 107.1   1e-22
XP_011539337 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 613)  648 107.1 1.1e-22
XP_016856187 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 618)  648 107.1 1.1e-22
XP_011539336 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 621)  648 107.1 1.1e-22
NP_001165690 (OMIM: 616396) polycomb protein SCMH1 ( 648)  648 107.1 1.1e-22
NP_001026864 (OMIM: 616396) polycomb protein SCMH1 ( 660)  648 107.1 1.1e-22
XP_011539335 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 660)  648 107.1 1.1e-22
XP_011539334 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 670)  648 107.1 1.1e-22
XP_006710525 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 670)  648 107.1 1.1e-22
XP_016856202 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 449)  519 87.9 4.7e-17
XP_016856201 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 457)  519 87.9 4.7e-17
XP_016856200 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 457)  519 87.9 4.7e-17
XP_016856197 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 479)  519 87.9 4.9e-17
XP_011539341 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb pr ( 550)  519 88.0 5.5e-17
XP_016884710 (OMIM: 300208) PREDICTED: sex comb on ( 609)  436 75.7   3e-13
XP_006724521 (OMIM: 300208) PREDICTED: sex comb on ( 609)  436 75.7   3e-13
XP_016884711 (OMIM: 300208) PREDICTED: sex comb on ( 436)  386 68.2 3.8e-11
NP_006080 (OMIM: 300208) sex comb on midleg-like p ( 700)  386 68.4 5.6e-11
XP_016884709 (OMIM: 300208) PREDICTED: sex comb on ( 700)  386 68.4 5.6e-11
XP_016884708 (OMIM: 300208) PREDICTED: sex comb on ( 700)  386 68.4 5.6e-11
NP_001032625 (OMIM: 300227) sex comb on midleg-lik ( 208)  333 60.2 4.9e-09
NP_001032624 (OMIM: 300227) sex comb on midleg-lik ( 208)  333 60.2 4.9e-09
XP_006724572 (OMIM: 300227) PREDICTED: sex comb on ( 301)  333 60.3 6.6e-09
XP_005274636 (OMIM: 300227) PREDICTED: sex comb on ( 301)  333 60.3 6.6e-09
XP_016885212 (OMIM: 300227) PREDICTED: sex comb on ( 302)  333 60.3 6.6e-09
NP_006737 (OMIM: 300227) sex comb on midleg-like p ( 302)  333 60.3 6.6e-09
XP_006724571 (OMIM: 300227) PREDICTED: sex comb on ( 329)  333 60.3 7.1e-09
NP_001032629 (OMIM: 300227) sex comb on midleg-lik ( 329)  333 60.3 7.1e-09
XP_005274635 (OMIM: 300227) PREDICTED: sex comb on ( 330)  333 60.3 7.1e-09


>>XP_016856199 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb protei  (466 aa)
 initn: 881 init1: 361 opt: 648  Z-score: 530.2  bits: 107.0 E(85289): 8.6e-23
Smith-Waterman score: 1016; 51.0% identity (71.4% similar) in 357 aa overlap (1-356:151-466)

                                             10        20        30
pF1KB0                               MTPLALSPPRSTPEPDLSSIPQDAATVPSL
                                     ..:   ::  :::::: :..::::::.:: 
XP_016 ISAPSKTAEPLKFPKKRGPKPGSKRKPRTLLNPPPASPTTSTPEPDTSTVPQDAATIPS-
              130       140       150       160       170          

               40        50        60        70        80        90
pF1KB0 AAPQALTVCLYINKQANAGPYLERKKVQQLPEHFGPERPSAVLQQAVQACIDCAHQQKLV
       .: :: :::.:.::....::.:..:::::::.:::: : :.:::::::::::::..:: :
XP_016 SAMQAPTVCIYLNKNGSTGPHLDKKKVQQLPDHFGPARASVVLQQAVQACIDCAYHQKTV
     180       190       200       210       220       230         

              100       110       120       130       140       150
pF1KB0 FSLVKQGYGGEMVSVSASFDGKQHLRSLPVVNSIGYVLRFLAKLCRSLLCDDLFSHQPFP
       ::..:::.:::..  :: :: .::  .::.:::: :::::: :::..:  :.::..::: 
XP_016 FSFLKQGHGGEVI--SAVFDREQHTLNLPAVNSITYVLRFLEKLCHNLRSDNLFGNQPFT
     240       250         260       270       280       290       

              160       170       180       190       200       210
pF1KB0 RGCSASEKVQEKEEGRMESVKTVTTEEYLVNPVGMNRYSVDTSASTFNHRGSLHPSSSLY
                        ..  ..:. ::     . .::     . ::   .::  . :: 
XP_016 -----------------QTHLSLTAIEY---SHSHDRY---LPGETFVLGNSL--ARSLE
                        300          310          320         330  

              220       230        240       250       260         
pF1KB0 CKRQNSGDSHLGGGPAATAG-GPRTSPMSSGGPSAPGLRPPASSPKRNTTSLEGNRCASS
         ...: ::  ...:.  .. . :  :. :    . :: : ..:  :   :  ..:   :
XP_016 -PHSDSMDS--ASNPTNLVSTSQRHRPLLS----SCGLPPSTASAVRRLCSRGSDRYLES
             340         350           360       370       380     

     270       280       290       300       310       320         
pF1KB0 PSQDAQDARRPRSRNPSAWTVEDVVWFVKDADPQALGPHVELFRKHEIDGNALLLLKSDM
            .:: :  .:.::.::::::. ::..:::: ::::..:::::::::.:::::.:::
XP_016 -----RDASRLSGRDPSSWTVEDVMQFVREADPQ-LGPHADLFRKHEIDGKALLLLRSDM
              390       400       410        420       430         

     330       340       350      
pF1KB0 VMKYLGLKLGPALKLCYHIDKLKQAKF
       .:::.:::::::::: ::::.:::.::
XP_016 MMKYMGLKLGPALKLSYHIDRLKQGKF
     440       450       460      

>>XP_016856198 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb protei  (470 aa)
 initn: 881 init1: 361 opt: 648  Z-score: 530.1  bits: 107.0 E(85289): 8.6e-23
Smith-Waterman score: 1016; 51.0% identity (71.4% similar) in 357 aa overlap (1-356:155-470)

                                             10        20        30
pF1KB0                               MTPLALSPPRSTPEPDLSSIPQDAATVPSL
                                     ..:   ::  :::::: :..::::::.:: 
XP_016 ISAPSKTAEPLKFPKKRGPKPGSKRKPRTLLNPPPASPTTSTPEPDTSTVPQDAATIPS-
          130       140       150       160       170       180    

               40        50        60        70        80        90
pF1KB0 AAPQALTVCLYINKQANAGPYLERKKVQQLPEHFGPERPSAVLQQAVQACIDCAHQQKLV
       .: :: :::.:.::....::.:..:::::::.:::: : :.:::::::::::::..:: :
XP_016 SAMQAPTVCIYLNKNGSTGPHLDKKKVQQLPDHFGPARASVVLQQAVQACIDCAYHQKTV
           190       200       210       220       230       240   

              100       110       120       130       140       150
pF1KB0 FSLVKQGYGGEMVSVSASFDGKQHLRSLPVVNSIGYVLRFLAKLCRSLLCDDLFSHQPFP
       ::..:::.:::..  :: :: .::  .::.:::: :::::: :::..:  :.::..::: 
XP_016 FSFLKQGHGGEVI--SAVFDREQHTLNLPAVNSITYVLRFLEKLCHNLRSDNLFGNQPFT
           250         260       270       280       290       300 

              160       170       180       190       200       210
pF1KB0 RGCSASEKVQEKEEGRMESVKTVTTEEYLVNPVGMNRYSVDTSASTFNHRGSLHPSSSLY
                        ..  ..:. ::     . .::     . ::   .::  . :: 
XP_016 -----------------QTHLSLTAIEY---SHSHDRY---LPGETFVLGNSL--ARSLE
                              310             320       330        

              220       230        240       250       260         
pF1KB0 CKRQNSGDSHLGGGPAATAG-GPRTSPMSSGGPSAPGLRPPASSPKRNTTSLEGNRCASS
         ...: ::  ...:.  .. . :  :. :    . :: : ..:  :   :  ..:   :
XP_016 -PHSDSMDS--ASNPTNLVSTSQRHRPLLS----SCGLPPSTASAVRRLCSRGSDRYLES
         340         350       360           370       380         

     270       280       290       300       310       320         
pF1KB0 PSQDAQDARRPRSRNPSAWTVEDVVWFVKDADPQALGPHVELFRKHEIDGNALLLLKSDM
            .:: :  .:.::.::::::. ::..:::: ::::..:::::::::.:::::.:::
XP_016 -----RDASRLSGRDPSSWTVEDVMQFVREADPQ-LGPHADLFRKHEIDGKALLLLRSDM
          390       400       410        420       430       440   

     330       340       350      
pF1KB0 VMKYLGLKLGPALKLCYHIDKLKQAKF
       .:::.:::::::::: ::::.:::.::
XP_016 MMKYMGLKLGPALKLSYHIDRLKQGKF
           450       460       470

>>NP_001165693 (OMIM: 616396) polycomb protein SCMH1 iso  (480 aa)
 initn: 881 init1: 361 opt: 648  Z-score: 530.0  bits: 107.0 E(85289): 8.8e-23
Smith-Waterman score: 1016; 51.0% identity (71.4% similar) in 357 aa overlap (1-356:165-480)

                                             10        20        30
pF1KB0                               MTPLALSPPRSTPEPDLSSIPQDAATVPSL
                                     ..:   ::  :::::: :..::::::.:: 
NP_001 ISAPSKTAEPLKFPKKRGPKPGSKRKPRTLLNPPPASPTTSTPEPDTSTVPQDAATIPS-
          140       150       160       170       180       190    

               40        50        60        70        80        90
pF1KB0 AAPQALTVCLYINKQANAGPYLERKKVQQLPEHFGPERPSAVLQQAVQACIDCAHQQKLV
       .: :: :::.:.::....::.:..:::::::.:::: : :.:::::::::::::..:: :
NP_001 SAMQAPTVCIYLNKNGSTGPHLDKKKVQQLPDHFGPARASVVLQQAVQACIDCAYHQKTV
           200       210       220       230       240       250   

              100       110       120       130       140       150
pF1KB0 FSLVKQGYGGEMVSVSASFDGKQHLRSLPVVNSIGYVLRFLAKLCRSLLCDDLFSHQPFP
       ::..:::.:::..  :: :: .::  .::.:::: :::::: :::..:  :.::..::: 
NP_001 FSFLKQGHGGEVI--SAVFDREQHTLNLPAVNSITYVLRFLEKLCHNLRSDNLFGNQPFT
           260         270       280       290       300       310 

              160       170       180       190       200       210
pF1KB0 RGCSASEKVQEKEEGRMESVKTVTTEEYLVNPVGMNRYSVDTSASTFNHRGSLHPSSSLY
                        ..  ..:. ::     . .::     . ::   .::  . :: 
NP_001 -----------------QTHLSLTAIEY---SHSHDRY---LPGETFVLGNSL--ARSLE
                              320             330       340        

              220       230        240       250       260         
pF1KB0 CKRQNSGDSHLGGGPAATAG-GPRTSPMSSGGPSAPGLRPPASSPKRNTTSLEGNRCASS
         ...: ::  ...:.  .. . :  :. :    . :: : ..:  :   :  ..:   :
NP_001 -PHSDSMDS--ASNPTNLVSTSQRHRPLLS----SCGLPPSTASAVRRLCSRGSDRYLES
         350         360       370           380       390         

     270       280       290       300       310       320         
pF1KB0 PSQDAQDARRPRSRNPSAWTVEDVVWFVKDADPQALGPHVELFRKHEIDGNALLLLKSDM
            .:: :  .:.::.::::::. ::..:::: ::::..:::::::::.:::::.:::
NP_001 -----RDASRLSGRDPSSWTVEDVMQFVREADPQ-LGPHADLFRKHEIDGKALLLLRSDM
          400       410       420        430       440       450   

     330       340       350      
pF1KB0 VMKYLGLKLGPALKLCYHIDKLKQAKF
       .:::.:::::::::: ::::.:::.::
NP_001 MMKYMGLKLGPALKLSYHIDRLKQGKF
           460       470       480

>>XP_016856196 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb protei  (480 aa)
 initn: 881 init1: 361 opt: 648  Z-score: 530.0  bits: 107.0 E(85289): 8.8e-23
Smith-Waterman score: 1016; 51.0% identity (71.4% similar) in 357 aa overlap (1-356:165-480)

                                             10        20        30
pF1KB0                               MTPLALSPPRSTPEPDLSSIPQDAATVPSL
                                     ..:   ::  :::::: :..::::::.:: 
XP_016 ISAPSKTAEPLKFPKKRGPKPGSKRKPRTLLNPPPASPTTSTPEPDTSTVPQDAATIPS-
          140       150       160       170       180       190    

               40        50        60        70        80        90
pF1KB0 AAPQALTVCLYINKQANAGPYLERKKVQQLPEHFGPERPSAVLQQAVQACIDCAHQQKLV
       .: :: :::.:.::....::.:..:::::::.:::: : :.:::::::::::::..:: :
XP_016 SAMQAPTVCIYLNKNGSTGPHLDKKKVQQLPDHFGPARASVVLQQAVQACIDCAYHQKTV
           200       210       220       230       240       250   

              100       110       120       130       140       150
pF1KB0 FSLVKQGYGGEMVSVSASFDGKQHLRSLPVVNSIGYVLRFLAKLCRSLLCDDLFSHQPFP
       ::..:::.:::..  :: :: .::  .::.:::: :::::: :::..:  :.::..::: 
XP_016 FSFLKQGHGGEVI--SAVFDREQHTLNLPAVNSITYVLRFLEKLCHNLRSDNLFGNQPFT
           260         270       280       290       300       310 

              160       170       180       190       200       210
pF1KB0 RGCSASEKVQEKEEGRMESVKTVTTEEYLVNPVGMNRYSVDTSASTFNHRGSLHPSSSLY
                        ..  ..:. ::     . .::     . ::   .::  . :: 
XP_016 -----------------QTHLSLTAIEY---SHSHDRY---LPGETFVLGNSL--ARSLE
                              320             330       340        

              220       230        240       250       260         
pF1KB0 CKRQNSGDSHLGGGPAATAG-GPRTSPMSSGGPSAPGLRPPASSPKRNTTSLEGNRCASS
         ...: ::  ...:.  .. . :  :. :    . :: : ..:  :   :  ..:   :
XP_016 -PHSDSMDS--ASNPTNLVSTSQRHRPLLS----SCGLPPSTASAVRRLCSRGSDRYLES
         350         360       370           380       390         

     270       280       290       300       310       320         
pF1KB0 PSQDAQDARRPRSRNPSAWTVEDVVWFVKDADPQALGPHVELFRKHEIDGNALLLLKSDM
            .:: :  .:.::.::::::. ::..:::: ::::..:::::::::.:::::.:::
XP_016 -----RDASRLSGRDPSSWTVEDVMQFVREADPQ-LGPHADLFRKHEIDGKALLLLRSDM
          400       410       420        430       440       450   

     330       340       350      
pF1KB0 VMKYLGLKLGPALKLCYHIDKLKQAKF
       .:::.:::::::::: ::::.:::.::
XP_016 MMKYMGLKLGPALKLSYHIDRLKQGKF
           460       470       480

>>XP_016856195 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb protei  (488 aa)
 initn: 770 init1: 364 opt: 648  Z-score: 529.9  bits: 107.0 E(85289): 8.9e-23
Smith-Waterman score: 1034; 49.9% identity (73.3% similar) in 359 aa overlap (1-356:151-488)

                                             10        20        30
pF1KB0                               MTPLALSPPRSTPEPDLSSIPQDAATVPSL
                                     ..:   ::  :::::: :..::::::.:: 
XP_016 ISAPSKTAEPLKFPKKRGPKPGSKRKPRTLLNPPPASPTTSTPEPDTSTVPQDAATIPS-
              130       140       150       160       170          

               40        50        60        70        80        90
pF1KB0 AAPQALTVCLYINKQANAGPYLERKKVQQLPEHFGPERPSAVLQQAVQACIDCAHQQKLV
       .: :: :::.:.::....::.:..:::::::.:::: : :.:::::::::::::..:: :
XP_016 SAMQAPTVCIYLNKNGSTGPHLDKKKVQQLPDHFGPARASVVLQQAVQACIDCAYHQKTV
     180       190       200       210       220       230         

              100       110       120       130       140       150
pF1KB0 FSLVKQGYGGEMVSVSASFDGKQHLRSLPVVNSIGYVLRFLAKLCRSLLCDDLFSHQPFP
       ::..:::.:::..  :: :: .::  .::.:::: :::::: :::..:  :.::..::: 
XP_016 FSFLKQGHGGEVI--SAVFDREQHTLNLPAVNSITYVLRFLEKLCHNLRSDNLFGNQPFT
     240       250         260       270       280       290       

              160        170       180       190       200         
pF1KB0 RGCSASEKVQEKE-EGRMESVKTVTTEEYLVNPVGMNRYSVDTSASTFNHRGSLHPSSSL
       .   .   .. .. . :.   .: .  . :.  .  .  :.: :::        .:.. .
XP_016 QTHLSLTAIEYSHSHDRYLPGETFVLGNSLARSLEPHSDSMD-SAS--------NPTNLV
       300       310       320       330        340                

     210       220       230       240       250       260         
pF1KB0 YCKRQNSGDSHLGGGPAATAGGPRTSPMSSGGPSAPGLRPPASSPKRNTTSL-EGNRCAS
         ....       : : .::.. :   . : :     :.  .:. .:.  :. . ::  .
XP_016 STSQRHRPLLSSCGLPPSTASAVRR--LCSRGV----LK--GSNERRDMESFWKLNRSPG
      350       360       370             380         390       400

      270        280       290       300       310       320       
pF1KB0 SPSQ-DAQDARRPRSRNPSAWTVEDVVWFVKDADPQALGPHVELFRKHEIDGNALLLLKS
       :    ...:: :  .:.::.::::::. ::..:::: ::::..:::::::::.:::::.:
XP_016 SDRYLESRDASRLSGRDPSSWTVEDVMQFVREADPQ-LGPHADLFRKHEIDGKALLLLRS
              410       420       430        440       450         

       330       340       350      
pF1KB0 DMVMKYLGLKLGPALKLCYHIDKLKQAKF
       ::.:::.:::::::::: ::::.:::.::
XP_016 DMMMKYMGLKLGPALKLSYHIDRLKQGKF
     460       470       480        

>>XP_011539345 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb protei  (492 aa)
 initn: 770 init1: 364 opt: 648  Z-score: 529.9  bits: 107.0 E(85289): 8.9e-23
Smith-Waterman score: 1034; 49.9% identity (73.3% similar) in 359 aa overlap (1-356:155-492)

                                             10        20        30
pF1KB0                               MTPLALSPPRSTPEPDLSSIPQDAATVPSL
                                     ..:   ::  :::::: :..::::::.:: 
XP_011 ISAPSKTAEPLKFPKKRGPKPGSKRKPRTLLNPPPASPTTSTPEPDTSTVPQDAATIPS-
          130       140       150       160       170       180    

               40        50        60        70        80        90
pF1KB0 AAPQALTVCLYINKQANAGPYLERKKVQQLPEHFGPERPSAVLQQAVQACIDCAHQQKLV
       .: :: :::.:.::....::.:..:::::::.:::: : :.:::::::::::::..:: :
XP_011 SAMQAPTVCIYLNKNGSTGPHLDKKKVQQLPDHFGPARASVVLQQAVQACIDCAYHQKTV
           190       200       210       220       230       240   

              100       110       120       130       140       150
pF1KB0 FSLVKQGYGGEMVSVSASFDGKQHLRSLPVVNSIGYVLRFLAKLCRSLLCDDLFSHQPFP
       ::..:::.:::..  :: :: .::  .::.:::: :::::: :::..:  :.::..::: 
XP_011 FSFLKQGHGGEVI--SAVFDREQHTLNLPAVNSITYVLRFLEKLCHNLRSDNLFGNQPFT
           250         260       270       280       290       300 

              160        170       180       190       200         
pF1KB0 RGCSASEKVQEKE-EGRMESVKTVTTEEYLVNPVGMNRYSVDTSASTFNHRGSLHPSSSL
       .   .   .. .. . :.   .: .  . :.  .  .  :.: :::        .:.. .
XP_011 QTHLSLTAIEYSHSHDRYLPGETFVLGNSLARSLEPHSDSMD-SAS--------NPTNLV
             310       320       330       340                350  

     210       220       230       240       250       260         
pF1KB0 YCKRQNSGDSHLGGGPAATAGGPRTSPMSSGGPSAPGLRPPASSPKRNTTSL-EGNRCAS
         ....       : : .::.. :   . : :     :.  .:. .:.  :. . ::  .
XP_011 STSQRHRPLLSSCGLPPSTASAVRR--LCSRGV----LK--GSNERRDMESFWKLNRSPG
            360       370         380             390       400    

      270        280       290       300       310       320       
pF1KB0 SPSQ-DAQDARRPRSRNPSAWTVEDVVWFVKDADPQALGPHVELFRKHEIDGNALLLLKS
       :    ...:: :  .:.::.::::::. ::..:::: ::::..:::::::::.:::::.:
XP_011 SDRYLESRDASRLSGRDPSSWTVEDVMQFVREADPQ-LGPHADLFRKHEIDGKALLLLRS
          410       420       430       440        450       460   

       330       340       350      
pF1KB0 DMVMKYLGLKLGPALKLCYHIDKLKQAKF
       ::.:::.:::::::::: ::::.:::.::
XP_011 DMMMKYMGLKLGPALKLSYHIDRLKQGKF
           470       480       490  

>>XP_011539346 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb protei  (492 aa)
 initn: 770 init1: 364 opt: 648  Z-score: 529.9  bits: 107.0 E(85289): 8.9e-23
Smith-Waterman score: 1034; 49.9% identity (73.3% similar) in 359 aa overlap (1-356:155-492)

                                             10        20        30
pF1KB0                               MTPLALSPPRSTPEPDLSSIPQDAATVPSL
                                     ..:   ::  :::::: :..::::::.:: 
XP_011 ISAPSKTAEPLKFPKKRGPKPGSKRKPRTLLNPPPASPTTSTPEPDTSTVPQDAATIPS-
          130       140       150       160       170       180    

               40        50        60        70        80        90
pF1KB0 AAPQALTVCLYINKQANAGPYLERKKVQQLPEHFGPERPSAVLQQAVQACIDCAHQQKLV
       .: :: :::.:.::....::.:..:::::::.:::: : :.:::::::::::::..:: :
XP_011 SAMQAPTVCIYLNKNGSTGPHLDKKKVQQLPDHFGPARASVVLQQAVQACIDCAYHQKTV
           190       200       210       220       230       240   

              100       110       120       130       140       150
pF1KB0 FSLVKQGYGGEMVSVSASFDGKQHLRSLPVVNSIGYVLRFLAKLCRSLLCDDLFSHQPFP
       ::..:::.:::..  :: :: .::  .::.:::: :::::: :::..:  :.::..::: 
XP_011 FSFLKQGHGGEVI--SAVFDREQHTLNLPAVNSITYVLRFLEKLCHNLRSDNLFGNQPFT
           250         260       270       280       290       300 

              160        170       180       190       200         
pF1KB0 RGCSASEKVQEKE-EGRMESVKTVTTEEYLVNPVGMNRYSVDTSASTFNHRGSLHPSSSL
       .   .   .. .. . :.   .: .  . :.  .  .  :.: :::        .:.. .
XP_011 QTHLSLTAIEYSHSHDRYLPGETFVLGNSLARSLEPHSDSMD-SAS--------NPTNLV
             310       320       330       340                350  

     210       220       230       240       250       260         
pF1KB0 YCKRQNSGDSHLGGGPAATAGGPRTSPMSSGGPSAPGLRPPASSPKRNTTSL-EGNRCAS
         ....       : : .::.. :   . : :     :.  .:. .:.  :. . ::  .
XP_011 STSQRHRPLLSSCGLPPSTASAVRR--LCSRGV----LK--GSNERRDMESFWKLNRSPG
            360       370         380             390       400    

      270        280       290       300       310       320       
pF1KB0 SPSQ-DAQDARRPRSRNPSAWTVEDVVWFVKDADPQALGPHVELFRKHEIDGNALLLLKS
       :    ...:: :  .:.::.::::::. ::..:::: ::::..:::::::::.:::::.:
XP_011 SDRYLESRDASRLSGRDPSSWTVEDVMQFVREADPQ-LGPHADLFRKHEIDGKALLLLRS
          410       420       430       440        450       460   

       330       340       350      
pF1KB0 DMVMKYLGLKLGPALKLCYHIDKLKQAKF
       ::.:::.:::::::::: ::::.:::.::
XP_011 DMMMKYMGLKLGPALKLSYHIDRLKQGKF
           470       480       490  

>>XP_016856194 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb protei  (502 aa)
 initn: 770 init1: 364 opt: 648  Z-score: 529.7  bits: 107.0 E(85289): 9.1e-23
Smith-Waterman score: 1034; 49.9% identity (73.3% similar) in 359 aa overlap (1-356:165-502)

                                             10        20        30
pF1KB0                               MTPLALSPPRSTPEPDLSSIPQDAATVPSL
                                     ..:   ::  :::::: :..::::::.:: 
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pF1KB0 AAPQALTVCLYINKQANAGPYLERKKVQQLPEHFGPERPSAVLQQAVQACIDCAHQQKLV
       .: :: :::.:.::....::.:..:::::::.:::: : :.:::::::::::::..:: :
XP_016 SAMQAPTVCIYLNKNGSTGPHLDKKKVQQLPDHFGPARASVVLQQAVQACIDCAYHQKTV
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pF1KB0 FSLVKQGYGGEMVSVSASFDGKQHLRSLPVVNSIGYVLRFLAKLCRSLLCDDLFSHQPFP
       ::..:::.:::..  :: :: .::  .::.:::: :::::: :::..:  :.::..::: 
XP_016 FSFLKQGHGGEVI--SAVFDREQHTLNLPAVNSITYVLRFLEKLCHNLRSDNLFGNQPFT
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pF1KB0 RGCSASEKVQEKE-EGRMESVKTVTTEEYLVNPVGMNRYSVDTSASTFNHRGSLHPSSSL
       .   .   .. .. . :.   .: .  . :.  .  .  :.: :::        .:.. .
XP_016 QTHLSLTAIEYSHSHDRYLPGETFVLGNSLARSLEPHSDSMD-SAS--------NPTNLV
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pF1KB0 YCKRQNSGDSHLGGGPAATAGGPRTSPMSSGGPSAPGLRPPASSPKRNTTSL-EGNRCAS
         ....       : : .::.. :   . : :     :.  .:. .:.  :. . ::  .
XP_016 STSQRHRPLLSSCGLPPSTASAVRR--LCSRGV----LK--GSNERRDMESFWKLNRSPG
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       :    ...:: :  .:.::.::::::. ::..:::: ::::..:::::::::.:::::.:
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pF1KB0 DMVMKYLGLKLGPALKLCYHIDKLKQAKF
       ::.:::.:::::::::: ::::.:::.::
XP_016 DMMMKYMGLKLGPALKLSYHIDRLKQGKF
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>>XP_011539342 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb protei  (523 aa)
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Smith-Waterman score: 648; 63.8% identity (85.2% similar) in 149 aa overlap (1-149:333-478)

                                             10        20        30
pF1KB0                               MTPLALSPPRSTPEPDLSSIPQDAATVPSL
                                     ..:   ::  :::::: :..::::::.:: 
XP_011 ISAPSKTAEPLKFPKKRGPKPGSKRKPRTLLNPPPASPTTSTPEPDTSTVPQDAATIPS-
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pF1KB0 AAPQALTVCLYINKQANAGPYLERKKVQQLPEHFGPERPSAVLQQAVQACIDCAHQQKLV
       .: :: :::.:.::....::.:..:::::::.:::: : :.:::::::::::::..:: :
XP_011 SAMQAPTVCIYLNKNGSTGPHLDKKKVQQLPDHFGPARASVVLQQAVQACIDCAYHQKTV
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       ::..:::.:::..:  : :: .::  .::.:::: :::::: :::..:  :.::..::: 
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>>XP_016856193 (OMIM: 616396) PREDICTED: polycomb protei  (537 aa)
 initn: 881 init1: 361 opt: 648  Z-score: 529.3  bits: 107.1 E(85289): 9.6e-23
Smith-Waterman score: 1016; 51.0% identity (71.4% similar) in 357 aa overlap (1-356:222-537)

                                             10        20        30
pF1KB0                               MTPLALSPPRSTPEPDLSSIPQDAATVPSL
                                     ..:   ::  :::::: :..::::::.:: 
XP_016 ISAPSKTAEPLKFPKKRGPKPGSKRKPRTLLNPPPASPTTSTPEPDTSTVPQDAATIPS-
             200       210       220       230       240       250 

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pF1KB0 AAPQALTVCLYINKQANAGPYLERKKVQQLPEHFGPERPSAVLQQAVQACIDCAHQQKLV
       .: :: :::.:.::....::.:..:::::::.:::: : :.:::::::::::::..:: :
XP_016 SAMQAPTVCIYLNKNGSTGPHLDKKKVQQLPDHFGPARASVVLQQAVQACIDCAYHQKTV
              260       270       280       290       300       310

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pF1KB0 FSLVKQGYGGEMVSVSASFDGKQHLRSLPVVNSIGYVLRFLAKLCRSLLCDDLFSHQPFP
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XP_016 FSFLKQGHGGEVI--SAVFDREQHTLNLPAVNSITYVLRFLEKLCHNLRSDNLFGNQPFT
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pF1KB0 RGCSASEKVQEKEEGRMESVKTVTTEEYLVNPVGMNRYSVDTSASTFNHRGSLHPSSSLY
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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