Result of FASTA (ccds) for pF1KB6115
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6115, 620 aa
  1>>>pF1KB6115 620 - 620 aa - 620 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7319+/-0.00105; mu= 22.4170+/- 0.063
 mean_var=66.8087+/-13.482, 0's: 0 Z-trim(103.4): 35  B-trim: 32 in 1/48
 Lambda= 0.156913
 statistics sampled from 7363 (7397) to 7363 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.585), E-opt: 0.2 (0.227), width:  16
 Scan time:  3.030

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS3863.1 SLC6A3 gene_id:6531|Hs108|chr5          ( 620) 4179 955.6       0
CCDS10754.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16        ( 617) 2850 654.7  1e-187
CCDS54011.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16        ( 628) 2817 647.3 1.8e-185
CCDS58463.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16        ( 512) 2264 522.0 7.5e-148
CCDS11256.1 SLC6A4 gene_id:6532|Hs108|chr17        ( 630) 2065 477.0 3.2e-134
CCDS8501.1 SLC6A12 gene_id:6539|Hs108|chr12        ( 614) 1769 410.0 4.6e-114
CCDS8502.1 SLC6A13 gene_id:6540|Hs108|chr12        ( 602) 1739 403.2 5.1e-112
CCDS33705.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3         ( 620) 1722 399.4 7.4e-111
CCDS77704.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3         ( 721) 1722 399.4 8.3e-111
CCDS14726.1 SLC6A8 gene_id:6535|Hs108|chrX         ( 635) 1720 398.9  1e-110
CCDS4305.1 SLC6A7 gene_id:6534|Hs108|chr5          ( 636) 1713 397.4 3.1e-110
CCDS2602.1 SLC6A11 gene_id:6538|Hs108|chr3         ( 632) 1686 391.2 2.1e-108
CCDS48190.1 SLC6A8 gene_id:6535|Hs108|chrX         ( 520) 1383 322.6 8.2e-88
CCDS2603.1 SLC6A1 gene_id:6529|Hs108|chr3          ( 599) 1296 302.9 7.8e-82
CCDS7854.1 SLC6A5 gene_id:9152|Hs108|chr11         ( 797) 1238 289.9 8.6e-78
CCDS53729.1 SLC6A13 gene_id:6540|Hs108|chr12       ( 510) 1215 284.5 2.3e-76
CCDS30695.1 SLC6A9 gene_id:6536|Hs108|chr1         ( 633) 1101 258.8 1.6e-68
CCDS41316.1 SLC6A9 gene_id:6536|Hs108|chr1         ( 652) 1101 258.8 1.6e-68
CCDS41317.1 SLC6A9 gene_id:6536|Hs108|chr1         ( 706) 1101 258.9 1.7e-68
CCDS2730.1 SLC6A20 gene_id:54716|Hs108|chr3        ( 555)  769 183.6   6e-46
CCDS14570.1 SLC6A14 gene_id:11254|Hs108|chrX       ( 642)  635 153.3 9.1e-37
CCDS46765.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3         ( 200)  601 145.2 7.9e-35
CCDS82734.1 SLC6A11 gene_id:6538|Hs108|chr3        ( 208)  570 138.2 1.1e-32
CCDS9027.1 SLC6A15 gene_id:55117|Hs108|chr12       ( 289)  491 120.4 3.3e-27
CCDS43077.1 SLC6A20 gene_id:54716|Hs108|chr3       ( 592)  460 113.7 7.2e-25
CCDS3860.1 SLC6A18 gene_id:348932|Hs108|chr5       ( 628)  444 110.1 9.3e-24
CCDS34130.1 SLC6A19 gene_id:340024|Hs108|chr5      ( 634)  435 108.0 3.8e-23
CCDS53816.1 SLC6A15 gene_id:55117|Hs108|chr12      ( 623)  432 107.4   6e-23
CCDS9026.1 SLC6A15 gene_id:55117|Hs108|chr12       ( 730)  432 107.4 6.8e-23
CCDS30799.1 SLC6A17 gene_id:388662|Hs108|chr1      ( 727)  414 103.3 1.1e-21
CCDS42590.1 SLC6A16 gene_id:28968|Hs108|chr19      ( 736)  325 83.2 1.3e-15


>>CCDS3863.1 SLC6A3 gene_id:6531|Hs108|chr5               (620 aa)
 initn: 4179 init1: 4179 opt: 4179  Z-score: 5109.7  bits: 955.6 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4179; 100.0% identity (100.0% similar) in 620 aa overlap (1-620:1-620)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MSKSKCSVGLMSSVVAPAKEPNAVGPKEVELILVKEQNGVQLTSSTLTNPRQSPVEAQDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 MSKSKCSVGLMSSVVAPAKEPNAVGPKEVELILVKEQNGVQLTSSTLTNPRQSPVEAQDR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 ETWGKKIDFLLSVIGFAVDLANVWRFPYLCYKNGGGAFLVPYLLFMVIAGMPLFYMELAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 ETWGKKIDFLLSVIGFAVDLANVWRFPYLCYKNGGGAFLVPYLLFMVIAGMPLFYMELAL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 GQFNREGAAGVWKICPILKGVGFTVILISLYVGFFYNVIIAWALHYLFSSFTTELPWIHC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 GQFNREGAAGVWKICPILKGVGFTVILISLYVGFFYNVIIAWALHYLFSSFTTELPWIHC
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 NNSWNSPNCSDAHPGDSSGDSSGLNDTFGTTPAAEYFERGVLHLHQSHGIDDLGPPRWQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 NNSWNSPNCSDAHPGDSSGDSSGLNDTFGTTPAAEYFERGVLHLHQSHGIDDLGPPRWQL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 TACLVLVIVLLYFSLWKGVKTSGKVVWITATMPYVVLTALLLRGVTLPGAIDGIRAYLSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 TACLVLVIVLLYFSLWKGVKTSGKVVWITATMPYVVLTALLLRGVTLPGAIDGIRAYLSV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 DFYRLCEASVWIDAATQVCFSLGVGFGVLIAFSSYNKFTNNCYRDAIVTTSINSLTSFSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 DFYRLCEASVWIDAATQVCFSLGVGFGVLIAFSSYNKFTNNCYRDAIVTTSINSLTSFSS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 GFVVFSFLGYMAQKHSVPIGDVAKDGPGLIFIIYPEAIATLPLSSAWAVVFFIMLLTLGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 GFVVFSFLGYMAQKHSVPIGDVAKDGPGLIFIIYPEAIATLPLSSAWAVVFFIMLLTLGI
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB6 DSAMGGMESVITGLIDEFQLLHRHRELFTLFIVLATFLLSLFCVTNGGIYVFTLLDHFAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 DSAMGGMESVITGLIDEFQLLHRHRELFTLFIVLATFLLSLFCVTNGGIYVFTLLDHFAA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB6 GTSILFGVLIEAIGVAWFYGVGQFSDDIQQMTGQRPSLYWRLCWKLVSPCFLLFVVVVSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 GTSILFGVLIEAIGVAWFYGVGQFSDDIQQMTGQRPSLYWRLCWKLVSPCFLLFVVVVSI
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB6 VTFRPPHYGAYIFPDWANALGWVIATSSMAMVPIYAAYKFCSLPGSFREKLAYAIAPEKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 VTFRPPHYGAYIFPDWANALGWVIATSSMAMVPIYAAYKFCSLPGSFREKLAYAIAPEKD
              550       560       570       580       590       600

              610       620
pF1KB6 RELVDRGEVRQFTLRHWLKV
       ::::::::::::::::::::
CCDS38 RELVDRGEVRQFTLRHWLKV
              610       620

>>CCDS10754.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16             (617 aa)
 initn: 2847 init1: 1978 opt: 2850  Z-score: 3483.7  bits: 654.7 E(32554): 1e-187
Smith-Waterman score: 2850; 67.0% identity (85.6% similar) in 619 aa overlap (11-620:6-617)

               10        20               30        40        50   
pF1KB6 MSKSKCSVGLMSSVVAPAKEPNAVGP-------KEVELILVKEQNGVQLTSSTLTNPRQS
                 :.  : : ..   .::       : .::..:::.::::     :  ::..
CCDS10      MLLARMNPQVQPENNGADTGPEQPLRARKTAELLVVKERNGVQ----CLLAPRDG
                    10        20        30        40            50 

            60        70        80        90       100       110   
pF1KB6 PVEAQDRETWGKKIDFLLSVIGFAVDLANVWRFPYLCYKNGGGAFLVPYLLFMVIAGMPL
         .:: ::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.:: ::..::::::
CCDS10 --DAQPRETWGKKIDFLLSVVGFAVDLANVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYTLFLIIAGMPL
                60        70        80        90       100         

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB6 FYMELALGQFNREGAAGVWKICPILKGVGFTVILISLYVGFFYNVIIAWALHYLFSSFTT
       :::::::::.:::::: ::::::..::::..::::.:::::.:::::::.:.::::::: 
CCDS10 FYMELALGQYNREGAATVWKICPFFKGVGYAVILIALYVGFYYNVIIAWSLYYLFSSFTL
     110       120       130       140       150       160         

           180       190         200       210       220       230 
pF1KB6 ELPWIHCNNSWNSPNCSDAH--PGDSSGDSSGLNDTFGTTPAAEYFERGVLHLHQSHGID
       .:::  :...::::::.: .   :.  :. .  .  .  :::::..::::::::.: :: 
CCDS10 NLPWTDCGHTWNSPNCTDPKLLNGSVLGNHTKYSK-YKFTPAAEFYERGVLHLHESSGIH
     170       180       190       200        210       220        

             240       250       260       270       280       290 
pF1KB6 DLGPPRWQLTACLVLVIVLLYFSLWKGVKTSGKVVWITATMPYVVLTALLLRGVTLPGAI
       :.: :.:::  ::..:...:::::::::::::::::::::.:: :: .::..::::::: 
CCDS10 DIGLPQWQLLLCLMVVVIVLYFSLWKGVKTSGKVVWITATLPYFVLFVLLVHGVTLPGAS
      230       240       250       260       270       280        

             300       310       320       330       340       350 
pF1KB6 DGIRAYLSVDFYRLCEASVWIDAATQVCFSLGVGFGVLIAFSSYNKFTNNCYRDAIVTTS
       .:: ::: .::::: ::.::::::::. ::::.::::::::.::::: :::::::..:.:
CCDS10 NGINAYLHIDFYRLKEATVWIDAATQIFFSLGAGFGVLIAFASYNKFDNNCYRDALLTSS
      290       300       310       320       330       340        

             360       370       380       390       400       410 
pF1KB6 INSLTSFSSGFVVFSFLGYMAQKHSVPIGDVAKDGPGLIFIIYPEAIATLPLSSAWAVVF
       :: .::: :::..::.:::::..:.: : ::: .: ::.::.:::::.::  :. :::::
CCDS10 INCITSFVSGFAIFSILGYMAHEHKVNIEDVATEGAGLVFILYPEAISTLSGSTFWAVVF
      350       360       370       380       390       400        

             420       430       440       450       460       470 
pF1KB6 FIMLLTLGIDSAMGGMESVITGLIDEFQLLHRHRELFTLFIVLATFLLSLFCVTNGGIYV
       :.:::.::.::.:::::.::::: :.::.:.:::.:::. ....::::.:::.:.:::::
CCDS10 FVMLLALGLDSSMGGMEAVITGLADDFQVLKRHRKLFTFGVTFSTFLLALFCITKGGIYV
      410       420       430       440       450       460        

             480       490       500       510       520       530 
pF1KB6 FTLLDHFAAGTSILFGVLIEAIGVAWFYGVGQFSDDIQQMTGQRPSLYWRLCWKLVSPCF
       .:::: :::::::::.::.:::::.::::: .::.::::: : ::.::::::::.::: :
CCDS10 LTLLDTFAAGTSILFAVLMEAIGVSWFYGVDRFSNDIQQMMGFRPGLYWRLCWKFVSPAF
      470       480       490       500       510       520        

             540       550       560       570       580       590 
pF1KB6 LLFVVVVSIVTFRPPHYGAYIFPDWANALGWVIATSSMAMVPIYAAYKFCSLPGSFREKL
       :::::::::..:.:  :  :::: ::: .:: :: :::..::::. ::: :  ::. :.:
CCDS10 LLFVVVVSIINFKPLTYDDYIFPPWANWVGWGIALSSMVLVPIYVIYKFLSTQGSLWERL
      530       540       550       560       570       580        

             600       610       620
pF1KB6 AYAIAPEKDRELVDRGEVRQFTLRHWLKV
       ::.:.::....:: . ..::: :.::: .
CCDS10 AYGITPENEHHLVAQRDIRQFQLQHWLAI
      590       600       610       

>>CCDS54011.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16             (628 aa)
 initn: 2814 init1: 1945 opt: 2817  Z-score: 3443.3  bits: 647.3 E(32554): 1.8e-185
Smith-Waterman score: 2817; 66.9% identity (85.7% similar) in 614 aa overlap (11-615:6-612)

               10        20               30        40        50   
pF1KB6 MSKSKCSVGLMSSVVAPAKEPNAVGP-------KEVELILVKEQNGVQLTSSTLTNPRQS
                 :.  : : ..   .::       : .::..:::.::::     :  ::..
CCDS54      MLLARMNPQVQPENNGADTGPEQPLRARKTAELLVVKERNGVQ----CLLAPRDG
                    10        20        30        40            50 

            60        70        80        90       100       110   
pF1KB6 PVEAQDRETWGKKIDFLLSVIGFAVDLANVWRFPYLCYKNGGGAFLVPYLLFMVIAGMPL
         .:: ::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.:: ::..::::::
CCDS54 --DAQPRETWGKKIDFLLSVVGFAVDLANVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYTLFLIIAGMPL
                60        70        80        90       100         

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB6 FYMELALGQFNREGAAGVWKICPILKGVGFTVILISLYVGFFYNVIIAWALHYLFSSFTT
       :::::::::.:::::: ::::::..::::..::::.:::::.:::::::.:.::::::: 
CCDS54 FYMELALGQYNREGAATVWKICPFFKGVGYAVILIALYVGFYYNVIIAWSLYYLFSSFTL
     110       120       130       140       150       160         

           180       190         200       210       220       230 
pF1KB6 ELPWIHCNNSWNSPNCSDAH--PGDSSGDSSGLNDTFGTTPAAEYFERGVLHLHQSHGID
       .:::  :...::::::.: .   :.  :. .  .  .  :::::..::::::::.: :: 
CCDS54 NLPWTDCGHTWNSPNCTDPKLLNGSVLGNHTKYSK-YKFTPAAEFYERGVLHLHESSGIH
     170       180       190       200        210       220        

             240       250       260       270       280       290 
pF1KB6 DLGPPRWQLTACLVLVIVLLYFSLWKGVKTSGKVVWITATMPYVVLTALLLRGVTLPGAI
       :.: :.:::  ::..:...:::::::::::::::::::::.:: :: .::..::::::: 
CCDS54 DIGLPQWQLLLCLMVVVIVLYFSLWKGVKTSGKVVWITATLPYFVLFVLLVHGVTLPGAS
      230       240       250       260       270       280        

             300       310       320       330       340       350 
pF1KB6 DGIRAYLSVDFYRLCEASVWIDAATQVCFSLGVGFGVLIAFSSYNKFTNNCYRDAIVTTS
       .:: ::: .::::: ::.::::::::. ::::.::::::::.::::: :::::::..:.:
CCDS54 NGINAYLHIDFYRLKEATVWIDAATQIFFSLGAGFGVLIAFASYNKFDNNCYRDALLTSS
      290       300       310       320       330       340        

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pF1KB6 INSLTSFSSGFVVFSFLGYMAQKHSVPIGDVAKDGPGLIFIIYPEAIATLPLSSAWAVVF
       :: .::: :::..::.:::::..:.: : ::: .: ::.::.:::::.::  :. :::::
CCDS54 INCITSFVSGFAIFSILGYMAHEHKVNIEDVATEGAGLVFILYPEAISTLSGSTFWAVVF
      350       360       370       380       390       400        

             420       430       440       450       460       470 
pF1KB6 FIMLLTLGIDSAMGGMESVITGLIDEFQLLHRHRELFTLFIVLATFLLSLFCVTNGGIYV
       :.:::.::.::.:::::.::::: :.::.:.:::.:::. ....::::.:::.:.:::::
CCDS54 FVMLLALGLDSSMGGMEAVITGLADDFQVLKRHRKLFTFGVTFSTFLLALFCITKGGIYV
      410       420       430       440       450       460        

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pF1KB6 FTLLDHFAAGTSILFGVLIEAIGVAWFYGVGQFSDDIQQMTGQRPSLYWRLCWKLVSPCF
       .:::: :::::::::.::.:::::.::::: .::.::::: : ::.::::::::.::: :
CCDS54 LTLLDTFAAGTSILFAVLMEAIGVSWFYGVDRFSNDIQQMMGFRPGLYWRLCWKFVSPAF
      470       480       490       500       510       520        

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pF1KB6 LLFVVVVSIVTFRPPHYGAYIFPDWANALGWVIATSSMAMVPIYAAYKFCSLPGSFREKL
       :::::::::..:.:  :  :::: ::: .:: :: :::..::::. ::: :  ::. :.:
CCDS54 LLFVVVVSIINFKPLTYDDYIFPPWANWVGWGIALSSMVLVPIYVIYKFLSTQGSLWERL
      530       540       550       560       570       580        

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pF1KB6 AYAIAPEKDRELVDRGEVRQFTLRHWLKV           
       ::.:.::....:: . ..::: ..                
CCDS54 AYGITPENEHHLVAQRDIRQFQMKTRQGRRRATNSCQISC
      590       600       610       620        

>>CCDS58463.1 SLC6A2 gene_id:6530|Hs108|chr16             (512 aa)
 initn: 2260 init1: 1978 opt: 2264  Z-score: 2767.9  bits: 522.0 E(32554): 7.5e-148
Smith-Waterman score: 2264; 66.8% identity (86.7% similar) in 488 aa overlap (135-620:27-512)

          110       120       130       140       150       160    
pF1KB6 FMVIAGMPLFYMELALGQFNREGAAGVWKICPILKGVGFTVILISLYVGFFYNVIIAWAL
                                     ::   :::..::::.:::::.:::::::.:
CCDS58     MGVQWWSHTQGEVAVGLGLGDSYLTPCPC-PGVGYAVILIALYVGFYYNVIIAWSL
                   10        20         30        40        50     

          170       180       190         200       210       220  
pF1KB6 HYLFSSFTTELPWIHCNNSWNSPNCSDAH--PGDSSGDSSGLNDTFGTTPAAEYFERGVL
       .::::::: .:::  :...::::::.: .   :.  :. .  .  .  :::::..:::::
CCDS58 YYLFSSFTLNLPWTDCGHTWNSPNCTDPKLLNGSVLGNHTKYSK-YKFTPAAEFYERGVL
          60        70        80        90        100       110    

            230       240       250       260       270       280  
pF1KB6 HLHQSHGIDDLGPPRWQLTACLVLVIVLLYFSLWKGVKTSGKVVWITATMPYVVLTALLL
       :::.: :: :.: :.:::  ::..:...:::::::::::::::::::::.:: :: .::.
CCDS58 HLHESSGIHDIGLPQWQLLLCLMVVVIVLYFSLWKGVKTSGKVVWITATLPYFVLFVLLV
          120       130       140       150       160       170    

            290       300       310       320       330       340  
pF1KB6 RGVTLPGAIDGIRAYLSVDFYRLCEASVWIDAATQVCFSLGVGFGVLIAFSSYNKFTNNC
       .::::::: .:: ::: .::::: ::.::::::::. ::::.::::::::.::::: :::
CCDS58 HGVTLPGASNGINAYLHIDFYRLKEATVWIDAATQIFFSLGAGFGVLIAFASYNKFDNNC
          180       190       200       210       220       230    

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pF1KB6 YRDAIVTTSINSLTSFSSGFVVFSFLGYMAQKHSVPIGDVAKDGPGLIFIIYPEAIATLP
       ::::..:.::: .::: :::..::.:::::..:.: : ::: .: ::.::.:::::.:: 
CCDS58 YRDALLTSSINCITSFVSGFAIFSILGYMAHEHKVNIEDVATEGAGLVFILYPEAISTLS
          240       250       260       270       280       290    

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pF1KB6 LSSAWAVVFFIMLLTLGIDSAMGGMESVITGLIDEFQLLHRHRELFTLFIVLATFLLSLF
        :. ::::::.:::.::.::.:::::.::::: :.::.:.:::.:::. ....::::.::
CCDS58 GSTFWAVVFFVMLLALGLDSSMGGMEAVITGLADDFQVLKRHRKLFTFGVTFSTFLLALF
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pF1KB6 CVTNGGIYVFTLLDHFAAGTSILFGVLIEAIGVAWFYGVGQFSDDIQQMTGQRPSLYWRL
       :.:.:::::.:::: :::::::::.::.:::::.::::: .::.::::: : ::.:::::
CCDS58 CITKGGIYVLTLLDTFAAGTSILFAVLMEAIGVSWFYGVDRFSNDIQQMMGFRPGLYWRL
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pF1KB6 CWKLVSPCFLLFVVVVSIVTFRPPHYGAYIFPDWANALGWVIATSSMAMVPIYAAYKFCS
       :::.::: ::::::::::..:.:  :  :::: ::: .:: :: :::..::::. ::: :
CCDS58 CWKFVSPAFLLFVVVVSIINFKPLTYDDYIFPPWANWVGWGIALSSMVLVPIYVIYKFLS
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            590       600       610       620
pF1KB6 LPGSFREKLAYAIAPEKDRELVDRGEVRQFTLRHWLKV
         ::. :.:::.:.::....:: . ..::: :.::: .
CCDS58 TQGSLWERLAYGITPENEHHLVAQRDIRQFQLQHWLAI
          480       490       500       510  

>>CCDS11256.1 SLC6A4 gene_id:6532|Hs108|chr17             (630 aa)
 initn: 1902 init1: 750 opt: 2065  Z-score: 2523.2  bits: 477.0 E(32554): 3.2e-134
Smith-Waterman score: 2065; 49.9% identity (79.6% similar) in 579 aa overlap (37-610:60-626)

         10        20        30        40        50        60      
pF1KB6 SVGLMSSVVAPAKEPNAVGPKEVELILVKEQNGVQLTSSTLTNPRQSPVEAQDRETWGKK
                                     ....  :..::.    . ..  .:::::::
CCDS11 VVPTPGDKVESGQISNGYSAVPSPGAGDDTRHSIPATTTTLV----AELHQGERETWGKK
      30        40        50        60        70            80     

         70        80        90       100       110       120      
pF1KB6 IDFLLSVIGFAVDLANVWRFPYLCYKNGGGAFLVPYLLFMVIAGMPLFYMELALGQFNRE
       .::::::::.::::.:::::::.::.:::::::.:: .. ...:.:::::::::::..:.
CCDS11 VDFLLSVIGYAVDLGNVWRFPYICYQNGGGAFLLPYTIMAIFGGIPLFYMELALGQYHRN
          90       100       110       120       130       140     

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pF1KB6 GAAGVW-KICPILKGVGFTVILISLYVGFFYNVIIAWALHYLFSSFTTELPWIHCNNSWN
       :  ..: :::::.::.:... .:..:.. .::.:.::::.::.:::: .:::  :.::::
CCDS11 GCISIWRKICPIFKGIGYAICIIAFYIASYYNTIMAWALYYLISSFTDQLPWTSCKNSWN
         150       160       170       180       190       200     

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pF1KB6 SPNCSDAHPGDSSGDSSGLNDTFGTTPAAEYFERGVLHLHQSHGIDDLGPPRWQLTACLV
       . ::..    :.   .       .:.:: :.. : ::..:.:.:..:::   :::. :..
CCDS11 TGNCTNYFSEDNITWT-----LHSTSPAEEFYTRHVLQIHRSKGLQDLGGISWQLALCIM
         210       220            230       240       250       260

         250       260       270       280       290       300     
pF1KB6 LVIVLLYFSLWKGVKTSGKVVWITATMPYVVLTALLLRGVTLPGAIDGIRAYLSVDFYRL
       :.....:::.::::::::::::.:::.::..:..::.::.:::::  :.  ::. .. .:
CCDS11 LIFTVIYFSIWKGVKTSGKVVWVTATFPYIILSVLLVRGATLPGAWRGVLFYLKPNWQKL
              270       280       290       300       310       320

         310       320       330       340       350       360     
pF1KB6 CEASVWIDAATQVCFSLGVGFGVLIAFSSYNKFTNNCYRDAIVTTSINSLTSFSSGFVVF
        :..::::::.:. :::: :::::.::.:::::.::::.::.::. .: .::: ::::.:
CCDS11 LETGVWIDAAAQIFFSLGPGFGVLLAFASYNKFNNNCYQDALVTSVVNCMTSFVSGFVIF
              330       340       350       360       370       380

         370       380        390       400       410       420    
pF1KB6 SFLGYMAQKHSVPIGDVAKD-GPGLIFIIYPEAIATLPLSSAWAVVFFIMLLTLGIDSAM
       . :::::. ..  ...:::: ::.:.:: : ::::..: :. .:..::.::.:::.::..
CCDS11 TVLGYMAEMRNEDVSEVAKDAGPSLLFITYAEAIANMPASTFFAIIFFLMLITLGLDSTF
              390       400       410       420       430       440

          430        440       450       460       470       480   
pF1KB6 GGMESVITGLIDEF-QLLHRHRELFTLFIVLATFLLSLFCVTNGGIYVFTLLDHFAAGTS
       .:.:.:::...::: ..  ..:: :.: .:.. :. ::  .: :: ::  ::...:.: .
CCDS11 AGLEGVITAVLDEFPHVWAKRRERFVLAVVITCFFGSLVTLTFGGAYVVKLLEEYATGPA
              450       460       470       480       490       500

           490       500       510       520       530       540   
pF1KB6 ILFGVLIEAIGVAWFYGVGQFSDDIQQMTGQRPSLYWRLCWKLVSPCFLLFVVVVSIVTF
       .:  .::::..:.::::. ::  :...: :  :. .::.::  .:: ::::..   ... 
CCDS11 VLTVALIEAVAVSWFYGITQFCRDVKEMLGFSPGWFWRICWVAISPLFLLFIICSFLMS-
              510       520       530       540       550          

             550       560       570       580       590       600 
pF1KB6 RPPHYG--AYIFPDWANALGWVIATSSMAMVPIYAAYKFCSLPGSFREKLAYAIAPEKDR
        ::.     : .: :.  ::. :.:::.  .: : ::..   ::.:.:..  .:.::   
CCDS11 -PPQLRLFQYNYPYWSIILGYCIGTSSFICIPTYIAYRLIITPGTFKERIIKSITPETPT
      560       570       580       590       600       610        

             610       620
pF1KB6 ELVDRGEVRQFTLRHWLKV
       : .  :..:          
CCDS11 E-IPCGDIRLNAV      
       620       630      

>>CCDS8501.1 SLC6A12 gene_id:6539|Hs108|chr12             (614 aa)
 initn: 1212 init1: 783 opt: 1769  Z-score: 2161.2  bits: 410.0 E(32554): 4.6e-114
Smith-Waterman score: 1769; 45.4% identity (76.3% similar) in 549 aa overlap (56-598:32-576)

          30        40        50        60        70        80     
pF1KB6 PKEVELILVKEQNGVQLTSSTLTNPRQSPVEAQDRETWGKKIDFLLSVIGFAVDLANVWR
                                     ...::  : .:..:.::: :  . :.::::
CCDS85 DGKVAVQECGPPAVSWVPEEGEKLDQEDEDQVKDRGQWTNKMEFVLSVAGEIIGLGNVWR
              10        20        30        40        50        60 

          90       100       110       120       130        140    
pF1KB6 FPYLCYKNGGGAFLVPYLLFMVIAGMPLFYMELALGQFNREGAAGVW-KICPILKGVGFT
       :::::::::::::..::..:. . :.:.:..:.::::.. .:.. .: ::::...:.:..
CCDS85 FPYLCYKNGGGAFFIPYFIFFFVCGIPVFFLEVALGQYTSQGSVTAWRKICPLFQGIGLA
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pF1KB6 VILISLYVGFFYNVIIAWALHYLFSSFTTELPWIHCNNSWNSPNCSDAHPGDSSGDSSGL
        ..:  :.. .: .:.:::: :::::::.::::  ::: ::. .:.:    ...:  . .
CCDS85 SVVIESYLNVYYIIILAWALFYLFSSFTSELPWTTCNNFWNTEHCTDFLNHSGAGTVTPF
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pF1KB6 NDTFGTTPAAEYFERGVLHLHQSHGIDDLGPPRWQLTACLVLVIVLLYFSLWKGVKTSGK
       ..   :.:. :..:: :: .  . :: :::  ::.:. ::.:. :. :: .:::::..::
CCDS85 ENF--TSPVMEFWERRVLGI--TSGIHDLGSLRWELALCLLLAWVICYFCIWKGVKSTGK
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pF1KB6 VVWITATMPYVVLTALLLRGVTLPGAIDGIRAYLSVDFYRLCEASVWIDAATQVCFSLGV
       ::..:::.::..:. ::.:::::::: .::  ::. :..:: . .::.::.::. ::...
CCDS85 VVYFTATFPYLMLVILLIRGVTLPGAYQGIIYYLKPDLFRLKDPQVWMDAGTQIFFSFAI
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pF1KB6 GFGVLIAFSSYNKFTNNCYRDAIVTTSINSLTSFSSGFVVFSFLGYMAQKHSVPIGDVAK
         : : :..::::. ::::.: :.   .:: ::: .::::::.::.:.:...:::..::.
CCDS85 CQGCLTALGSYNKYHNNCYKDCIALCFLNSATSFVAGFVVFSILGFMSQEQGVPISEVAE
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pF1KB6 DGPGLIFIIYPEAIATLPLSSAWAVVFFIMLLTLGIDSAMGGMESVITGLIDEFQLLHRH
       .:::: :: .:.:.. .:::. :. .:::::. ::.:: .  .: ..:. :: :    :.
CCDS85 SGPGLAFIAFPKAVTMMPLSQLWSCLFFIMLIFLGLDSQFVCVECLVTASIDMFPRQLRK
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pF1KB6 ---RELFTLFIVLATFLLSLFCVTNGGIYVFTLLDHFAA-GTSILFGVLIEAIGVAWFYG
          :::. : :..  .:..:: ::.::.:.: :.:..:. :  .::  :.:.. ..: ::
CCDS85 SGRRELLILTIAVMCYLIGLFLVTEGGMYIFQLFDYYASSGICLLFLSLFEVVCISWVYG
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pF1KB6 VGQFSDDIQQMTGQRPSLYWRLCWKLVSPCFLLFVVVVSIVTFRPPHYG-AYIFPDWANA
       . .: :.:..: : ::    .. : ...: . : . . :.  . : .:. .:..: :. .
CCDS85 ADRFYDNIEDMIGYRPWPLVKISWLFLTPGLCLATFLFSLSKYTPLKYNNVYVYPPWGYS
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pF1KB6 LGWVIATSSMAMVPIYAAYKFCSLPGSFREKLAYAIAPEKDRELVDRGEVRQFTLRHWLK
       .:: .: :::. ::....  . .  : ::..:   :.:.                     
CCDS85 IGWFLALSSMVCVPLFVVITLLKTRGPFRKRLRQLITPDSSLPQPKQHPCLDGSAGRNFG
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     620                
pF1KB6 V                
                        
CCDS85 PSPTREGLIAGEKETHL
       600       610    

>>CCDS8502.1 SLC6A13 gene_id:6540|Hs108|chr12             (602 aa)
 initn: 1410 init1: 780 opt: 1739  Z-score: 2124.6  bits: 403.2 E(32554): 5.1e-112
Smith-Waterman score: 1739; 44.9% identity (76.1% similar) in 548 aa overlap (59-600:31-573)

       30        40        50        60        70        80        
pF1KB6 VELILVKEQNGVQLTSSTLTNPRQSPVEAQDRETWGKKIDFLLSVIGFAVDLANVWRFPY
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CCDS85 MDSRVSGTTSNGETKPVYPVMEKKEEDGTLERGHWNNKMEFVLSVAGEIIGLGNVWRFPY
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pF1KB6 LCYKNGGGAFLVPYLLFMVIAGMPLFYMELALGQFNREGAAGVW-KICPILKGVGFTVIL
       ::::::::::..:::.:.   :.:.: .: ::::.. .:.. .: :::::..:.:..  .
CCDS85 LCYKNGGGAFFIPYLVFLFTCGIPVFLLETALGQYTSQGGVTAWRKICPIFEGIGYASQM
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pF1KB6 ISLYVGFFYNVIIAWALHYLFSSFTTELPWIHCNNSWNSPNCSDAHPGDSSGDSSGLNDT
       : . .. .: ...:::: ::::::: .:::  : . ::. .: . .   ..:. .: ...
CCDS85 IVILLNVYYIIVLAWALFYLFSSFTIDLPWGGCYHEWNTEHCMEFQ--KTNGSLNGTSEN
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pF1KB6 FGTTPAAEYFERGVLHLHQSHGIDDLGPPRWQLTACLVLVIVLLYFSLWKGVKTSGKVVW
        .:.:. :..:: ::..  : ::. ::  ::.:. ::.:. :. :: .:::::..::::.
CCDS85 -ATSPVIEFWERRVLKI--SDGIQHLGALRWELALCLLLAWVICYFCIWKGVKSTGKVVY
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pF1KB6 ITATMPYVVLTALLLRGVTLPGAIDGIRAYLSVDFYRLCEASVWIDAATQVCFSLGVGFG
       .:::.::..:..::.:::::::: .::. ::  .. :: . .::.::.::. ::... .:
CCDS85 FTATFPYLMLVVLLIRGVTLPGAAQGIQFYLYPNLTRLWDPQVWMDAGTQIFFSFAICLG
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pF1KB6 VLIAFSSYNKFTNNCYRDAIVTTSINSLTSFSSGFVVFSFLGYMAQKHSVPIGDVAKDGP
        : :..::::. :::::: :.   .:: ::: .::..::.::.:.:...:::..::..::
CCDS85 CLTALGSYNKYHNNCYRDCIALCFLNSGTSFVAGFAIFSILGFMSQEQGVPISEVAESGP
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pF1KB6 GLIFIIYPEAIATLPLSSAWAVVFFIMLLTLGIDSAMGGMESVITGLIDEFQLLHRH---
       :: :: ::.:.. ::.:  ::  ::.:.. ::.:: .  .::..:.:.: .  . :.   
CCDS85 GLAFIAYPRAVVMLPFSPLWACCFFFMVVLLGLDSQFVCVESLVTALVDMYPHVFRKKNR
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pF1KB6 RELFTLFIVLATFLLSLFCVTNGGIYVFTLLDHFAA-GTSILFGVLIEAIGVAWFYGVGQ
       ::.. : . ...::..:. .:.::.::: :.:..:: :  .:: ...:.. ::: ::. .
CCDS85 REVLILGVSVVSFLVGLIMLTEGGMYVFQLFDYYAASGMCLLFVAIFESLCVAWVYGAKR
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pF1KB6 FSDDIQQMTGQRPSLYWRLCWKLVSPCFLLFVVVVSIVTFRPPHYGA-YIFPDWANALGW
       : :.:..: : ::    . :: ...:     . . :.. . :  :.  : .: :..::::
CCDS85 FYDNIEDMIGYRPWPLIKYCWLFLTPAVCTATFLFSLIKYTPLTYNKKYTYPWWGDALGW
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pF1KB6 VIATSSMAMVPIYAAYKFCSLPGSFREKLAYAIAPEKDRELVDRGEVRQFTLRHWLKV  
       ..: :::. .: .. :.. .: : :::..   . : .:                      
CCDS85 LLALSSMVCIPAWSLYRLGTLKGPFRERIRQLMCPAEDLPQRNPAGPSAPATPRTSLLRL
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CCDS85 TELESHC
         600  

>>CCDS33705.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3              (620 aa)
 initn: 1242 init1: 733 opt: 1722  Z-score: 2103.7  bits: 399.4 E(32554): 7.4e-111
Smith-Waterman score: 1722; 45.0% identity (74.8% similar) in 555 aa overlap (60-606:41-592)

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pF1KB6 ELILVKEQNGVQLTSSTLTNPRQSPVEAQDRETWGKKIDFLLSVIGFAVDLANVWRFPYL
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CCDS33 KDFHKDILKPSPGKSPGTRPEDEAEGKPPQREKWSSKIDFVLSVAGGFVGLGNVWRFPYL
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pF1KB6 CYKNGGGAFLVPYLLFMVIAGMPLFYMELALGQFNREGAAGVW-KICPILKGVGF-TVIL
       ::::::::::.::..:.  .:.:.:..:. .::.. ::.   : ::::...:.:. .:..
CCDS33 CYKNGGGAFLIPYFIFLFGSGLPVFFLEIIIGQYTSEGGITCWEKICPLFSGIGYASVVI
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pF1KB6 ISLYVGFFYNVIIAWALHYLFSSFTTELPWIHCNNSWNSPNCSDAHPGDSSGDSSGLNDT
       .:: .. .: ::.::: .:::.::  :::: :::.:::.:.: .     ...    ...:
CCDS33 VSL-LNVYYIVILAWATYYLFQSFQKELPWAHCNHSWNTPHCMEDTMRKNKSVWITISST
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pF1KB6 FGTTPAAEYFERGVLHLHQSHGIDDLGPPRWQLTACLVLVIVLLYFSLWKGVKTSGKVVW
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CCDS33 NFTSPVIEFWERNVLSL--SPGIDHPGSLKWDLALCLLLVWLVCFFCIWKGVRSTGKVVY
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pF1KB6 ITATMPYVVLTALLLRGVTLPGAIDGIRAYLSVDFYRLCEASVWIDAATQVCFSLGVGFG
       .:::.:...: .::.::.:::::  ::. ::  :. :: . .:::::.::. :: .. .:
CCDS33 FTATFPFAMLLVLLVRGLTLPGAGAGIKFYLYPDITRLEDPQVWIDAGTQIFFSYAICLG
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pF1KB6 VLIAFSSYNKFTNNCYRDAIVTTSINSLTSFSSGFVVFSFLGYMAQKHSVPIGDVAKDGP
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CCDS33 AMTSLGSYNKYKYNSYRDCMLLGCLNSGTSFVSGFAIFSILGFMAQEQGVDIADVAESGP
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pF1KB6 GLIFIIYPEAIATLPLSSAWAVVFFIMLLTLGIDSAMGGMESVITGLIDEFQLLHRH---
       :: :: ::.:.. .:: . :...:::::: ::.:: .  .:. ::.:.: .  . :.   
CCDS33 GLAFIAYPKAVTMMPLPTFWSILFFIMLLLLGLDSQFVEVEGQITSLVDLYPSFLRKGYR
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pF1KB6 RELFTLFIVLATFLLSLFCVTNGGIYVFTLLDHFAA-GTSILFGVLIEAIGVAWFYGVGQ
       ::.:  :.   ..::.:  ::.::.::: :.:..:: :. .:. ...: . .::.::  .
CCDS33 REIFIAFVCSISYLLGLTMVTEGGMYVFQLFDYYAASGVCLLWVAFFECFVIAWIYGGDN
       430       440       450       460       470       480       

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pF1KB6 FSDDIQQMTGQRPSLYWRLCWKLVSPCFLLFVVVVSIVTFRPPHYG-AYIFPDWANALGW
       . : :..: : ::. . .  : ...: . .   . :.: . :  :. .:..:.:: .:::
CCDS33 LYDGIEDMIGYRPGPWMKYSWAVITPVLCVGCFIFSLVKYVPLTYNKTYVYPNWAIGLGW
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pF1KB6 VIATSSMAMVPIYAAYKFCSLPGSFREKLAYAIAP-EKDRELVDRGEVRQFTLRHWLKV 
        .: :::  ::.  . ..:.  : :  .. : ..: : .:  :.:               
CCDS33 SLALSSMLCVPLVIVIRLCQTEGPFLVRVKYLLTPREPNRWAVEREGATPYNSRTVMNGA
       550       560       570       580       590       600       

CCDS33 LVKPTHIIVETMM
       610       620

>>CCDS77704.1 SLC6A6 gene_id:6533|Hs108|chr3              (721 aa)
 initn: 1242 init1: 733 opt: 1722  Z-score: 2102.8  bits: 399.4 E(32554): 8.3e-111
Smith-Waterman score: 1722; 45.0% identity (74.8% similar) in 555 aa overlap (60-606:142-693)

      30        40        50        60        70        80         
pF1KB6 ELILVKEQNGVQLTSSTLTNPRQSPVEAQDRETWGKKIDFLLSVIGFAVDLANVWRFPYL
                                     :: :..::::.::: :  : :.::::::::
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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