Result of FASTA (ccds) for pF1KB8492
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8492, 858 aa
  1>>>pF1KB8492 858 - 858 aa - 858 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7330+/-0.00108; mu= 17.9861+/- 0.065
 mean_var=66.5766+/-13.542, 0's: 0 Z-trim(103.1): 43  B-trim: 128 in 1/46
 Lambda= 0.157186
 statistics sampled from 7214 (7246) to 7214 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.582), E-opt: 0.2 (0.223), width:  16
 Scan time:  3.930

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS12117.1 EEF2 gene_id:1938|Hs108|chr19          ( 858) 5711 1304.7       0
CCDS45707.1 EFTUD2 gene_id:9343|Hs108|chr17        ( 937) 1738 403.8 7.4e-112
CCDS59295.1 EFTUD2 gene_id:9343|Hs108|chr17        ( 962) 1738 403.8 7.6e-112
CCDS11489.1 EFTUD2 gene_id:9343|Hs108|chr17        ( 972) 1738 403.8 7.7e-112
CCDS42070.1 EFL1 gene_id:79631|Hs108|chr15         (1069)  440 109.4 3.4e-23
CCDS42071.1 EFL1 gene_id:79631|Hs108|chr15         (1120)  440 109.4 3.5e-23


>>CCDS12117.1 EEF2 gene_id:1938|Hs108|chr19               (858 aa)
 initn: 5711 init1: 5711 opt: 5711  Z-score: 6991.5  bits: 1304.7 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5711; 100.0% identity (100.0% similar) in 858 aa overlap (1-858:1-858)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 KDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGAGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGAGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 VTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 IVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 IVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 EGQLGPAERAKKVEDMMKKLWGDRYFDPANGKFSKSATSPEGKKLPRTFCQLILDPIFKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EGQLGPAERAKKVEDMMKKLWGDRYFDPANGKFSKSATSPEGKKLPRTFCQLILDPIFKV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 FDAIMNFKKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FDAIMNFKKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB8 PVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB8 VSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLV
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB8 KTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB8 SGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHN
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB8 RLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPN
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB8 ILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQ
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB8 IIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 IIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTP
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB8 MFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDNSSRPSQVVAETRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDNSSRPSQVVAETRK
              790       800       810       820       830       840

              850        
pF1KB8 RKGLKEGIPALDNFLDKL
       ::::::::::::::::::
CCDS12 RKGLKEGIPALDNFLDKL
              850        

>>CCDS45707.1 EFTUD2 gene_id:9343|Hs108|chr17             (937 aa)
 initn: 2117 init1: 637 opt: 1738  Z-score: 2121.6  bits: 403.8 E(32554): 7.4e-112
Smith-Waterman score: 2153; 39.2% identity (69.6% similar) in 873 aa overlap (4-856:79-919)

                                          10        20        30   
pF1KB8                            MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKS
                                     . .: .  .::..  :::... .:. :::.
CCDS45 EDTQPLTEPIIKPVKTKKFTLMEQTLPVTVYEMDFLADLMDNSELIRNVTLCGHLHHGKT
       50        60        70        80        90       100        

            40        50         60        70        80        90  
pF1KB8 TLTDSLVCKAGIIASARAGETR-FTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQS
        ..: :. ..      :  .   .::    :::: . :::: ...           . ..
CCDS45 CFVDCLIEQTHPEIRKRYDQDLCYTDILFTEQERGVGIKSTPVTVV----------LPDT
      110       120       130       140       150                  

            100       110       120       130       140       150  
pF1KB8 KDGAGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIK
       : : ..:.:..:.::::.::.::::.::..::... .: . :: ..:: ....:. ::. 
CCDS45 K-GKSYLFNIMDTPGHVNFSDEVTAGLRISDGVVLFIDAAEGVMLNTERLIKHAVQERLA
       160       170       180       190       200       210       

            160       170       180       190       200       210  
pF1KB8 PVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTV
        .. .::.:: .:::.: : . :  ...::..:: .:: :.  :     :....:.::.:
CCDS45 VTVCINKIDRLILELKLPPTDAYYKLRHIVDEVNGLISMYSTDE-----NLILSPLLGNV
       220       230       240       250       260            270  

            220       230       240       250       260       270  
pF1KB8 GFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGQLGPAERAKKVEDMMKKLWGDRYFDPANGK
        :.:. ..  ::: .::..:.  :     :...  : ::.       :::: ::.: . :
CCDS45 CFSSSQYSICFTLGSFAKIYADTF-----GDINYQEFAKR-------LWGDIYFNPKTRK
            280       290            300              310       320

            280       290       300       310       320       330  
pF1KB8 FSKSATSPEGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFKKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEG
       :.:.: .  ..   :.: ..::.:..:..  ...       . ...: :.: .:.   . 
CCDS45 FTKKAPTSSSQ---RSFVEFILEPLYKILAQVVGDVDTSLPRTLDELGIHLTKEELKLNI
              330          340       350       360       370       

            340       350       360       370       380       390  
pF1KB8 KPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKG
       .:::. : ....    ....: . :.::: .. : . :  : :  :.. . ....::: :
CCDS45 RPLLRLVCKKFFGEFTGFVDMCVQHIPSPKVGAKPKIEHTYTGGVDSDLGEAMSDCDPDG
       380       390       400       410       420       430       

            400       410       420       430       440       450  
pF1KB8 PLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTIL
       ::: . .::  :.:  .:.:::::.:: . .:  :...: :::   .::  .  . :  .
CCDS45 PLMCHTTKMYSTDDGVQFHAFGRVLSGTIHAGQPVKVLGENYTLEDEEDSQICTVGRLWI
       440       450       460       470       480       490       

            460       470       480          490       500         
pF1KB8 MMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTF---EHAHNMRVMKFSVSPVVRVAV
        ..::   .. :: :: : . :::: .:::.:::     :.:. .: .::... :...::
CCDS45 SVARYHIEVNRVPAGNWVLIEGVDQPIVKTATITEPRGNEEAQIFRPLKFNTTSVIKIAV
       500       510       520       530       540       550       

     510       520       530       540       550       560         
pF1KB8 EAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIP
       :  ::..:::...::... :: : .   .::::::.: :.:::.:.  ..::.. .. : 
CCDS45 EPVNPSELPKMLDGLRKVNKSYPSLTTKVEESGEHVILGTGELYLDCVMHDLRKMYSEID
       560       570       580       590       600       610       

     570       580       590       600       610       620         
pF1KB8 IKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELK
       :: .::::.. ::: : :.. :....:::.:.. : :.:.  ::::::..  :.   . :
CCDS45 IKVADPVVTFCETVVETSSLKCFAETPNKKNKITMIAEPLEKGLAEDIENEVVQITWNRK
       620       630       640       650       660       670       

     630       640       650       660       670           680     
pF1KB8 QRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQY----LNEIKDSVVAGFQW
       . ....  ::.::.  ::.:: ::::.::::::.: :   .     :. .:::.: ::::
CCDS45 KLGEFFQTKYDWDLLAARSIWAFGPDATGPNILVDDTLPSEVDKALLGSVKDSIVQGFQW
       680       690       700       710       720       730       

         690       700       710       720       730       740     
pF1KB8 ATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIY
       .:.:: ::.: .:.:.: . :...  . .::::::::::::: .:.. : : :::::: :
CCDS45 GTREGPLCDELIRNVKFKILDAVVAQEPLHRGGGQIIPTARRVVYSAFLMATPRLMEPYY
       740       750       760       770       780       790       

         750       760       770       780       790       800     
pF1KB8 LVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTG
       .::.: : . :...: :: :.:::: ... . :.:....::..:. .:::: .:::..: 
CCDS45 FVEVQAPADCVSAVYTVLARRRGHVTQDAPIPGSPLYTIKAFIPAIDSFGFETDLRTHTQ
       800       810       820       830       840       850       

         810       820         830                 840       850   
pF1KB8 GQAFPQCVFDHWQILPGDPFDNSS--RP----------SQVVAETRKRKGLKEGIPALDN
       ::::   :: ::::.::::.:.:   ::           . . .::.::::.: . ....
CCDS45 GQAFSLSVFHHWQIVPGDPLDKSIVIRPLEPQPAPHLAREFMIKTRRRKGLSEDV-SISK
       860       870       880       890       900       910       

                            
pF1KB8 FLDKL                
       :.:                  
CCDS45 FFDDPMLLELAKQDVVLNYPM
        920       930       

>>CCDS59295.1 EFTUD2 gene_id:9343|Hs108|chr17             (962 aa)
 initn: 2101 init1: 637 opt: 1738  Z-score: 2121.5  bits: 403.8 E(32554): 7.6e-112
Smith-Waterman score: 2118; 39.0% identity (69.0% similar) in 872 aa overlap (4-856:114-944)

                                          10        20        30   
pF1KB8                            MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKS
                                     . .: .  .::..  :::... .:. :::.
CCDS59 EDTQPLTEPIIKPVKTKKFTLMEQTLPVTVYEMDFLADLMDNSELIRNVTLCGHLHHGKT
            90       100       110       120       130       140   

            40        50        60        70        80        90   
pF1KB8 TLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSK
                   : .    .  .::    :::: . :::: ...           . ..:
CCDS59 HPE---------IRKRYDQDLCYTDILFTEQERGVGIKSTPVTVV----------LPDTK
                    150       160       170                 180    

           100       110       120       130       140       150   
pF1KB8 DGAGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKP
        : ..:.:..:.::::.::.::::.::..::... .: . :: ..:: ....:. ::.  
CCDS59 -GKSYLFNIMDTPGHVNFSDEVTAGLRISDGVVLFIDAAEGVMLNTERLIKHAVQERLAV
           190       200       210       220       230       240   

           160       170       180       190       200       210   
pF1KB8 VLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVG
       .. .::.:: .:::.: : . :  ...::..:: .:: :.  :     :....:.::.: 
CCDS59 TVCINKIDRLILELKLPPTDAYYKLRHIVDEVNGLISMYSTDE-----NLILSPLLGNVC
           250       260       270       280            290        

           220       230       240       250       260       270   
pF1KB8 FGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGQLGPAERAKKVEDMMKKLWGDRYFDPANGKF
       :.:. ..  ::: .::..:.  :     :...  : ::.       :::: ::.: . ::
CCDS59 FSSSQYSICFTLGSFAKIYADTF-----GDINYQEFAKR-------LWGDIYFNPKTRKF
      300       310       320            330              340      

           280       290       300       310       320       330   
pF1KB8 SKSATSPEGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFKKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGK
       .:.: .  ..   :.: ..::.:..:..  ...       . ...: :.: .:.   . .
CCDS59 TKKAPTSSSQ---RSFVEFILEPLYKILAQVVGDVDTSLPRTLDELGIHLTKEELKLNIR
        350          360       370       380       390       400   

           340       350       360       370       380       390   
pF1KB8 PLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGP
       :::. : ....    ....: . :.::: .. : . :  : :  :.. . ....::: ::
CCDS59 PLLRLVCKKFFGEFTGFVDMCVQHIPSPKVGAKPKIEHTYTGGVDSDLGEAMSDCDPDGP
           410       420       430       440       450       460   

           400       410       420       430       440       450   
pF1KB8 LMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILM
       :: . .::  :.:  .:.:::::.:: . .:  :...: :::   .::  .  . :  . 
CCDS59 LMCHTTKMYSTDDGVQFHAFGRVLSGTIHAGQPVKVLGENYTLEDEEDSQICTVGRLWIS
           470       480       490       500       510       520   

           460       470       480          490       500       510
pF1KB8 MGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTF---EHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVE
       ..::   .. :: :: : . :::: .:::.:::     :.:. .: .::... :...:::
CCDS59 VARYHIEVNRVPAGNWVLIEGVDQPIVKTATITEPRGNEEAQIFRPLKFNTTSVIKIAVE
           530       540       550       560       570       580   

              520       530       540       550       560       570
pF1KB8 AKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPI
         ::..:::...::... :: : .   .::::::.: :.:::.:.  ..::.. .. : :
CCDS59 PVNPSELPKMLDGLRKVNKSYPSLTTKVEESGEHVILGTGELYLDCVMHDLRKMYSEIDI
           590       600       610       620       630       640   

              580       590       600       610       620       630
pF1KB8 KKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQ
       : .::::.. ::: : :.. :....:::.:.. : :.:.  ::::::..  :.   . :.
CCDS59 KVADPVVTFCETVVETSSLKCFAETPNKKNKITMIAEPLEKGLAEDIENEVVQITWNRKK
           650       660       670       680       690       700   

              640       650       660       670           680      
pF1KB8 RARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQY----LNEIKDSVVAGFQWA
        ....  ::.::.  ::.:: ::::.::::::.: :   .     :. .:::.: ::::.
CCDS59 LGEFFQTKYDWDLLAARSIWAFGPDATGPNILVDDTLPSEVDKALLGSVKDSIVQGFQWG
           710       720       730       740       750       760   

        690       700       710       720       730       740      
pF1KB8 TKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYL
       :.:: ::.: .:.:.: . :...  . .::::::::::::: .:.. : : :::::: :.
CCDS59 TREGPLCDELIRNVKFKILDAVVAQEPLHRGGGQIIPTARRVVYSAFLMATPRLMEPYYF
           770       780       790       800       810       820   

        750       760       770       780       790       800      
pF1KB8 VEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGG
       ::.: : . :...: :: :.:::: ... . :.:....::..:. .:::: .:::..: :
CCDS59 VEVQAPADCVSAVYTVLARRRGHVTQDAPIPGSPLYTIKAFIPAIDSFGFETDLRTHTQG
           830       840       850       860       870       880   

        810       820         830                 840       850    
pF1KB8 QAFPQCVFDHWQILPGDPFDNSS--RP----------SQVVAETRKRKGLKEGIPALDNF
       :::   :: ::::.::::.:.:   ::           . . .::.::::.: . ....:
CCDS59 QAFSLSVFHHWQIVPGDPLDKSIVIRPLEPQPAPHLAREFMIKTRRRKGLSEDV-SISKF
           890       900       910       920       930        940  

                           
pF1KB8 LDKL                
       .:                  
CCDS59 FDDPMLLELAKQDVVLNYPM
            950       960  

>>CCDS11489.1 EFTUD2 gene_id:9343|Hs108|chr17             (972 aa)
 initn: 2117 init1: 637 opt: 1738  Z-score: 2121.4  bits: 403.8 E(32554): 7.7e-112
Smith-Waterman score: 2153; 39.2% identity (69.6% similar) in 873 aa overlap (4-856:114-954)

                                          10        20        30   
pF1KB8                            MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKS
                                     . .: .  .::..  :::... .:. :::.
CCDS11 EDTQPLTEPIIKPVKTKKFTLMEQTLPVTVYEMDFLADLMDNSELIRNVTLCGHLHHGKT
            90       100       110       120       130       140   

            40        50         60        70        80        90  
pF1KB8 TLTDSLVCKAGIIASARAGETR-FTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQS
        ..: :. ..      :  .   .::    :::: . :::: ...           . ..
CCDS11 CFVDCLIEQTHPEIRKRYDQDLCYTDILFTEQERGVGIKSTPVTVV----------LPDT
           150       160       170       180                 190   

            100       110       120       130       140       150  
pF1KB8 KDGAGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIK
       : : ..:.:..:.::::.::.::::.::..::... .: . :: ..:: ....:. ::. 
CCDS11 K-GKSYLFNIMDTPGHVNFSDEVTAGLRISDGVVLFIDAAEGVMLNTERLIKHAVQERLA
            200       210       220       230       240       250  

            160       170       180       190       200       210  
pF1KB8 PVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTV
        .. .::.:: .:::.: : . :  ...::..:: .:: :.  :     :....:.::.:
CCDS11 VTVCINKIDRLILELKLPPTDAYYKLRHIVDEVNGLISMYSTDE-----NLILSPLLGNV
            260       270       280       290            300       

            220       230       240       250       260       270  
pF1KB8 GFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGQLGPAERAKKVEDMMKKLWGDRYFDPANGK
        :.:. ..  ::: .::..:.  :     :...  : ::.       :::: ::.: . :
CCDS11 CFSSSQYSICFTLGSFAKIYADTF-----GDINYQEFAKR-------LWGDIYFNPKTRK
       310       320       330            340              350     

            280       290       300       310       320       330  
pF1KB8 FSKSATSPEGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFKKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEG
       :.:.: .  ..   :.: ..::.:..:..  ...       . ...: :.: .:.   . 
CCDS11 FTKKAPTSSSQ---RSFVEFILEPLYKILAQVVGDVDTSLPRTLDELGIHLTKEELKLNI
         360          370       380       390       400       410  

            340       350       360       370       380       390  
pF1KB8 KPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKG
       .:::. : ....    ....: . :.::: .. : . :  : :  :.. . ....::: :
CCDS11 RPLLRLVCKKFFGEFTGFVDMCVQHIPSPKVGAKPKIEHTYTGGVDSDLGEAMSDCDPDG
            420       430       440       450       460       470  

            400       410       420       430       440       450  
pF1KB8 PLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTIL
       ::: . .::  :.:  .:.:::::.:: . .:  :...: :::   .::  .  . :  .
CCDS11 PLMCHTTKMYSTDDGVQFHAFGRVLSGTIHAGQPVKVLGENYTLEDEEDSQICTVGRLWI
            480       490       500       510       520       530  

            460       470       480          490       500         
pF1KB8 MMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTF---EHAHNMRVMKFSVSPVVRVAV
        ..::   .. :: :: : . :::: .:::.:::     :.:. .: .::... :...::
CCDS11 SVARYHIEVNRVPAGNWVLIEGVDQPIVKTATITEPRGNEEAQIFRPLKFNTTSVIKIAV
            540       550       560       570       580       590  

     510       520       530       540       550       560         
pF1KB8 EAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIP
       :  ::..:::...::... :: : .   .::::::.: :.:::.:.  ..::.. .. : 
CCDS11 EPVNPSELPKMLDGLRKVNKSYPSLTTKVEESGEHVILGTGELYLDCVMHDLRKMYSEID
            600       610       620       630       640       650  

     570       580       590       600       610       620         
pF1KB8 IKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELK
       :: .::::.. ::: : :.. :....:::.:.. : :.:.  ::::::..  :.   . :
CCDS11 IKVADPVVTFCETVVETSSLKCFAETPNKKNKITMIAEPLEKGLAEDIENEVVQITWNRK
            660       670       680       690       700       710  

     630       640       650       660       670           680     
pF1KB8 QRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQY----LNEIKDSVVAGFQW
       . ....  ::.::.  ::.:: ::::.::::::.: :   .     :. .:::.: ::::
CCDS11 KLGEFFQTKYDWDLLAARSIWAFGPDATGPNILVDDTLPSEVDKALLGSVKDSIVQGFQW
            720       730       740       750       760       770  

         690       700       710       720       730       740     
pF1KB8 ATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIY
       .:.:: ::.: .:.:.: . :...  . .::::::::::::: .:.. : : :::::: :
CCDS11 GTREGPLCDELIRNVKFKILDAVVAQEPLHRGGGQIIPTARRVVYSAFLMATPRLMEPYY
            780       790       800       810       820       830  

         750       760       770       780       790       800     
pF1KB8 LVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTG
       .::.: : . :...: :: :.:::: ... . :.:....::..:. .:::: .:::..: 
CCDS11 FVEVQAPADCVSAVYTVLARRRGHVTQDAPIPGSPLYTIKAFIPAIDSFGFETDLRTHTQ
            840       850       860       870       880       890  

         810       820         830                 840       850   
pF1KB8 GQAFPQCVFDHWQILPGDPFDNSS--RP----------SQVVAETRKRKGLKEGIPALDN
       ::::   :: ::::.::::.:.:   ::           . . .::.::::.: . ....
CCDS11 GQAFSLSVFHHWQIVPGDPLDKSIVIRPLEPQPAPHLAREFMIKTRRRKGLSEDV-SISK
            900       910       920       930       940        950 

                            
pF1KB8 FLDKL                
       :.:                  
CCDS11 FFDDPMLLELAKQDVVLNYPM
             960       970  

>>CCDS42070.1 EFL1 gene_id:79631|Hs108|chr15              (1069 aa)
 initn: 1505 init1: 432 opt: 440  Z-score: 529.9  bits: 109.4 E(32554): 3.4e-23
Smith-Waterman score: 1009; 29.4% identity (52.4% similar) in 823 aa overlap (98-702:35-841)

        70        80        90       100       110       120       
pF1KB8 ITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGAGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALV
                                     .:::::::::::::::::..:.:. :: ..
CCDS42 SLDKMIQLQKNTANIRNICVLAHVDHGNEEYLINLIDSPGHVDFSSEVSTAVRICDGCII
           10        20        30        40        50        60    

       130       140       150       160       170       180       
pF1KB8 VVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNV
       ::: : ::: ::..:::::  : :.:::..::.:: ..::.. :.: :. .. :.:..:.
CCDS42 VVDAVEGVCPQTQAVLRQAWLENIRPVLVINKIDRLIVELKFTPQEAYSHLKNILEQINA
           70        80        90       100       110       120    

       190                       200                       210     
pF1KB8 IISTY-------------GEGESGP---MGNIMID----------------PVLGTVGFG
       . .:               :.. .:   .:. . :                :  :.: : 
CCDS42 LTGTLFTSKVLEERAERETESQVNPNSEQGEQVYDWSTGLEDTDDSHLYFSPEQGNVVFT
          130       140       150       160       170       180    

         220       230       240       250       260       270     
pF1KB8 SGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGQLGPAERAKKVEDMMKKLWGDRYFDPANGKFSK
       :.. ::.: ...::..:  :.. :           :.:  .:: :::: :..    :. :
CCDS42 SAIDGWGFGIEHFARIYSQKIGIK-----------KEV--LMKTLWGDYYINMKAKKIMK
          190       200                  210         220       230 

         280       290       300       310       320        330    
pF1KB8 SATSPEGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFKKEETAKLIEKLDIKLDS-EDKDKEGKP
       .  . .::: :  : ::::. :....::...  :..  :.. .: .:. . : . .. : 
CCDS42 G-DQAKGKK-P-LFVQLILENIWSLYDAVLKKDKDKIDKIVTSLGLKIGAREARHSDPKV
               240        250       260       270       280        

          340       350       360       370               380      
pF1KB8 LLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCE-LLYEG-------PPDDEA-AMGI
        ..:.  .::: . :.: :.  .::::.     : : :.  :       ::. .:   ..
CCDS42 QINAICSQWLPISHAVLAMVCQKLPSPLDITAERVERLMCTGSQTFDSFPPETQALKAAF
      290       300       310       320       330       340        

           390       400                                           
pF1KB8 KSC--DPKGPLMMYISKMV-----------------------------------------
        .:  .  .:.....:::                                          
CCDS42 MKCGSEDTAPVIIFVSKMFAVDAKALPQNKPRPLTQEEIAQRRERARQRHAEKLAAAQGQ
      350       360       370       380       390       400        

                                                  410       420    
pF1KB8 ----PTSD--------KGR--------------------------FYAFGRVFSGLVSTG
           ::.:        ::.                          : ::.:::::..  :
CCDS42 APLEPTQDGSAIETCPKGEEPRGDEQQVESMTPKPVLQEENNQESFIAFARVFSGVARRG
      410       420       430       440       450       460        

          430                   440             450       460      
pF1KB8 LKVRIMGPNYTP------------GKKEDLYLKP------IQRTILMMGRYVEPIEDVPC
        :. ..::.:.:            .  . :   :      ..   :.::: .: .:.:: 
CCDS42 KKIFVLGPKYSPLEFLRRVPLGFSAPPDGLPQVPHMAYCALENLYLLMGRELEYLEEVPP
      470       480       490       500       510       520        

        470       480       490       500       510       520      
pF1KB8 GNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKR
       ::..:. :...:..:..:. ..     .  ..: ..:.:::::: :.:...:.::.:.: 
CCDS42 GNVLGIGGLQDFVLKSATLCSLPSCPPFIPLNFEATPIVRVAVEPKHPSEMPQLVKGMKL
      530       540       550       560       570       580        

        530       540       550       560       570       580      
pF1KB8 LAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSE-
       : ..:: :: .:.:.:::... :::.::. :: ::.:  : : :. :.:.. .:::... 
CCDS42 LNQADPCVQILIQETGEHVLVTAGEVHLQRCLDDLKERFAKIHISVSEPIIPFRETITKP
      590       600       610       620       630       640        

                                            590       600       610
pF1KB8 -----------------------------------ESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFP
                                          .:. :    .:::   : ..: :.:
CCDS42 PKVDMVNEEIGKQQKVAVIHQMKEDQSKIPEGIQVDSDGLITITTPNKLATLSVRAMPLP
      650       660       670       680       690       700        

                               620         630       640           
pF1KB8 D-----------------GLAEDIDKGEVS--ARQELKQRARYLAEKYEWDVAEAR----
       .                  :. ....:: .   .:. ...   .  : :  ..  :    
CCDS42 EEVTQILEENSDLIRSMEQLTSSLNEGENTHMIHQKTQEKIWEFKGKLEQHLTGRRWRNI
      710       720       730       740       750       760        

         650       660       670                       680         
pF1KB8 --KIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQ----------------YLNEIKDSVVAGFQWATKE
         .:: :::   :::::.. ..  :                   .. .:.:.::: ::  
CCDS42 VDQIWSFGPRKCGPNILVNKSEDFQNSVWTGPADKASKEASRYRDLGNSIVSGFQLATLS
      770       780       790       800       810       820        

     690       700       710       720       730       740         
pF1KB8 GALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEI
       : .::: . :: :                                               
CCDS42 GPMCEEPLMGVCFVLEKWDLSKFEEQGASDLAKEGQEENETCSGGNENQELQDGCSEAFE
      830       840       850       860       870       880        

>--
 initn: 348 init1: 321 opt: 336  Z-score: 402.5  bits: 85.9 E(32554): 4.3e-16
Smith-Waterman score: 336; 40.3% identity (66.0% similar) in 144 aa overlap (719-844:908-1049)

      690       700       710       720        730        740      
pF1KB8 EGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARR-CLYASVLTAQP-RLMEPIYL
                                     ::.: : .. : ::  : ..: :::  .: 
CCDS42 ELQDGCSEAFEKRTSQKGESPLTDCYGPFSGQLIATMKEACRYA--LQVKPQRLMAAMYT
       880       890       900       910       920         930     

        750       760       770       780       790       800      
pF1KB8 VEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGG
        .:.   .:.: .:.::....:.:..: .  :: ::..:: ::: :::::. ..:. :.:
CCDS42 CDIMATGDVLGRVYAVLSKREGRVLQEEMKEGTDMFIIKAVLPVAESFGFADEIRKRTSG
         940       950       960       970       980       990     

        810       820                       830       840       850
pF1KB8 QAFPQCVFDHWQILPGDPF----------------DNSSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPA
        : :: ::.::.:.:.:::                :. ..  . .  .::::::      
CCDS42 LASPQLVFSHWEIIPSDPFWVPTTEEEYLHFGEKADSENQARKYMNAVRKRKGLYVEEKI
        1000      1010      1020      1030      1040      1050     

                     
pF1KB8 LDNFLDKL      
                     
CCDS42 VEHAEKQRTLSKNK
        1060         

>>CCDS42071.1 EFL1 gene_id:79631|Hs108|chr15              (1120 aa)
 initn: 1670 init1: 432 opt: 440  Z-score: 529.6  bits: 109.4 E(32554): 3.5e-23
Smith-Waterman score: 1009; 29.4% identity (52.4% similar) in 823 aa overlap (98-702:86-892)

        70        80        90       100       110       120       
pF1KB8 ITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGAGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALV
                                     .:::::::::::::::::..:.:. :: ..
CCDS42 YMDSREDEQIRGITMKSSAISLHYATGNEEYLINLIDSPGHVDFSSEVSTAVRICDGCII
          60        70        80        90       100       110     

       130       140       150       160       170       180       
pF1KB8 VVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNV
       ::: : ::: ::..:::::  : :.:::..::.:: ..::.. :.: :. .. :.:..:.
CCDS42 VVDAVEGVCPQTQAVLRQAWLENIRPVLVINKIDRLIVELKFTPQEAYSHLKNILEQINA
         120       130       140       150       160       170     

       190                       200                       210     
pF1KB8 IISTY-------------GEGESGP---MGNIMID----------------PVLGTVGFG
       . .:               :.. .:   .:. . :                :  :.: : 
CCDS42 LTGTLFTSKVLEERAERETESQVNPNSEQGEQVYDWSTGLEDTDDSHLYFSPEQGNVVFT
         180       190       200       210       220       230     

         220       230       240       250       260       270     
pF1KB8 SGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGQLGPAERAKKVEDMMKKLWGDRYFDPANGKFSK
       :.. ::.: ...::..:  :.. :           :.:  .:: :::: :..    :. :
CCDS42 SAIDGWGFGIEHFARIYSQKIGIK-----------KEV--LMKTLWGDYYINMKAKKIMK
         240       250                  260         270       280  

         280       290       300       310       320        330    
pF1KB8 SATSPEGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFKKEETAKLIEKLDIKLDS-EDKDKEGKP
       .  . .::: :  : ::::. :....::...  :..  :.. .: .:. . : . .. : 
CCDS42 G-DQAKGKK-P-LFVQLILENIWSLYDAVLKKDKDKIDKIVTSLGLKIGAREARHSDPKV
             290         300       310       320       330         

          340       350       360       370               380      
pF1KB8 LLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCE-LLYEG-------PPDDEA-AMGI
        ..:.  .::: . :.: :.  .::::.     : : :.  :       ::. .:   ..
CCDS42 QINAICSQWLPISHAVLAMVCQKLPSPLDITAERVERLMCTGSQTFDSFPPETQALKAAF
     340       350       360       370       380       390         

           390       400                                           
pF1KB8 KSC--DPKGPLMMYISKMV-----------------------------------------
        .:  .  .:.....:::                                          
CCDS42 MKCGSEDTAPVIIFVSKMFAVDAKALPQNKPRPLTQEEIAQRRERARQRHAEKLAAAQGQ
     400       410       420       430       440       450         

                                                  410       420    
pF1KB8 ----PTSD--------KGR--------------------------FYAFGRVFSGLVSTG
           ::.:        ::.                          : ::.:::::..  :
CCDS42 APLEPTQDGSAIETCPKGEEPRGDEQQVESMTPKPVLQEENNQESFIAFARVFSGVARRG
     460       470       480       490       500       510         

          430                   440             450       460      
pF1KB8 LKVRIMGPNYTP------------GKKEDLYLKP------IQRTILMMGRYVEPIEDVPC
        :. ..::.:.:            .  . :   :      ..   :.::: .: .:.:: 
CCDS42 KKIFVLGPKYSPLEFLRRVPLGFSAPPDGLPQVPHMAYCALENLYLLMGRELEYLEEVPP
     520       530       540       550       560       570         

        470       480       490       500       510       520      
pF1KB8 GNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKR
       ::..:. :...:..:..:. ..     .  ..: ..:.:::::: :.:...:.::.:.: 
CCDS42 GNVLGIGGLQDFVLKSATLCSLPSCPPFIPLNFEATPIVRVAVEPKHPSEMPQLVKGMKL
     580       590       600       610       620       630         

        530       540       550       560       570       580      
pF1KB8 LAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSE-
       : ..:: :: .:.:.:::... :::.::. :: ::.:  : : :. :.:.. .:::... 
CCDS42 LNQADPCVQILIQETGEHVLVTAGEVHLQRCLDDLKERFAKIHISVSEPIIPFRETITKP
     640       650       660       670       680       690         

                                            590       600       610
pF1KB8 -----------------------------------ESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFP
                                          .:. :    .:::   : ..: :.:
CCDS42 PKVDMVNEEIGKQQKVAVIHQMKEDQSKIPEGIQVDSDGLITITTPNKLATLSVRAMPLP
     700       710       720       730       740       750         

                               620         630       640           
pF1KB8 D-----------------GLAEDIDKGEVS--ARQELKQRARYLAEKYEWDVAEAR----
       .                  :. ....:: .   .:. ...   .  : :  ..  :    
CCDS42 EEVTQILEENSDLIRSMEQLTSSLNEGENTHMIHQKTQEKIWEFKGKLEQHLTGRRWRNI
     760       770       780       790       800       810         

         650       660       670                       680         
pF1KB8 --KIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQ----------------YLNEIKDSVVAGFQWATKE
         .:: :::   :::::.. ..  :                   .. .:.:.::: ::  
CCDS42 VDQIWSFGPRKCGPNILVNKSEDFQNSVWTGPADKASKEASRYRDLGNSIVSGFQLATLS
     820       830       840       850       860       870         

     690       700       710       720       730       740         
pF1KB8 GALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEI
       : .::: . :: :                                               
CCDS42 GPMCEEPLMGVCFVLEKWDLSKFEEQGASDLAKEGQEENETCSGGNENQELQDGCSEAFE
     880       890       900       910       920       930         

>--
 initn: 348 init1: 321 opt: 336  Z-score: 402.1  bits: 85.9 E(32554): 4.4e-16
Smith-Waterman score: 336; 40.3% identity (66.0% similar) in 144 aa overlap (719-844:959-1100)

      690       700       710       720        730        740      
pF1KB8 EGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARR-CLYASVLTAQP-RLMEPIYL
                                     ::.: : .. : ::  : ..: :::  .: 
CCDS42 ELQDGCSEAFEKRTSQKGESPLTDCYGPFSGQLIATMKEACRYA--LQVKPQRLMAAMYT
      930       940       950       960       970         980      

        750       760       770       780       790       800      
pF1KB8 VEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGG
        .:.   .:.: .:.::....:.:..: .  :: ::..:: ::: :::::. ..:. :.:
CCDS42 CDIMATGDVLGRVYAVLSKREGRVLQEEMKEGTDMFIIKAVLPVAESFGFADEIRKRTSG
        990      1000      1010      1020      1030      1040      

        810       820                       830       840       850
pF1KB8 QAFPQCVFDHWQILPGDPF----------------DNSSRPSQVVAETRKRKGLKEGIPA
        : :: ::.::.:.:.:::                :. ..  . .  .::::::      
CCDS42 LASPQLVFSHWEIIPSDPFWVPTTEEEYLHFGEKADSENQARKYMNAVRKRKGLYVEEKI
       1050      1060      1070      1080      1090      1100      

                     
pF1KB8 LDNFLDKL      
                     
CCDS42 VEHAEKQRTLSKNK
       1110      1120




858 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sat Nov  5 16:28:55 2016 done: Sat Nov  5 16:28:55 2016
 Total Scan time:  3.930 Total Display time:  0.200

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com