Result of FASTA (ccds) for pF1KB5791
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5791, 830 aa
  1>>>pF1KB5791 830 - 830 aa - 830 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3108+/-0.00145; mu= 17.7150+/- 0.087
 mean_var=220.5515+/-40.733, 0's: 0 Z-trim(107.5): 156  B-trim: 4 in 1/48
 Lambda= 0.086361
 statistics sampled from 9470 (9634) to 9470 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.645), E-opt: 0.2 (0.296), width:  16
 Scan time:  4.140

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS1282.1 SELP gene_id:6403|Hs108|chr1            ( 830) 6027 765.4       0
CCDS1283.1 SELE gene_id:6401|Hs108|chr1            ( 610) 1875 247.9 3.9e-65
CCDS53427.1 SELL gene_id:6402|Hs108|chr1           ( 385) 1229 167.1 5.1e-41
CCDS1478.1 CR2 gene_id:1380|Hs108|chr1             (1033)  841 119.4 3.1e-26
CCDS31007.1 CR2 gene_id:1380|Hs108|chr1            (1092)  760 109.4 3.5e-23
CCDS6316.2 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8         (3538)  661 97.8 3.5e-19
CCDS6317.1 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8         (3667)  661 97.8 3.5e-19
CCDS6315.1 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8         (3707)  661 97.8 3.6e-19
CCDS44310.1 CR1L gene_id:1379|Hs108|chr1           ( 569)  540 81.5 4.4e-15
CCDS1385.1 CFH gene_id:3075|Hs108|chr1             (1231)  541 82.2 6.2e-15
CCDS1477.1 C4BPA gene_id:722|Hs108|chr1            ( 597)  535 80.9   7e-15
CCDS48004.1 SVEP1 gene_id:79987|Hs108|chr9         (3571)  523 80.6 5.2e-14
CCDS55189.1 CSMD1 gene_id:64478|Hs108|chr8         (3564)  518 80.0   8e-14
CCDS44309.1 CR1 gene_id:1378|Hs108|chr1            (2039)  513 79.0 9.1e-14
CCDS44308.1 CR1 gene_id:1378|Hs108|chr1            (2489)  510 78.8 1.3e-13
CCDS11663.1 APOH gene_id:350|Hs108|chr17           ( 345)  459 71.1 3.7e-12
CCDS380.1 CSMD2 gene_id:114784|Hs108|chr1          (3487)  442 70.5 5.6e-11
CCDS60082.1 CSMD2 gene_id:114784|Hs108|chr1        (3631)  442 70.5 5.8e-11


>>CCDS1282.1 SELP gene_id:6403|Hs108|chr1                 (830 aa)
 initn: 6027 init1: 6027 opt: 6027  Z-score: 4077.3  bits: 765.4 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6027; 99.8% identity (100.0% similar) in 830 aa overlap (1-830:1-830)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MANCQIAILYQRFQRVVFGISQLLCFSALISELTNQKEVAAWTYHYSTKAYSWNISRKYC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MANCQIAILYQRFQRVVFGISQLLCFSALISELTNQKEVAAWTYHYSTKAYSWNISRKYC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 QNRYTDLVAIQNKNEIDYLNKVLPYYSSYYWIGIRKNNKTWTWVGTKKALTNEAENWADN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QNRYTDLVAIQNKNEIDYLNKVLPYYSSYYWIGIRKNNKTWTWVGTKKALTNEAENWADN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 EPNNKRNNEDCVEIYIKSPSAPGKWNDEHCLKKKHALCYTASCQDMSCSKQGECLETIGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EPNNKRNNEDCVEIYIKSPSAPGKWNDEHCLKKKHALCYTASCQDMSCSKQGECLETIGN
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 YTCSCYPGFYGPECEYVRECGELELPQHVLMNCSHPLGNFSFNSQCSFHCTDGYQVNGPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 YTCSCYPGFYGPECEYVRECGELELPQHVLMNCSHPLGNFSFNSQCSFHCTDGYQVNGPS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 KLECLASGIWTNKPPQCLAAQCPPLKIPERGNMTCLHSAKAFQHQSSCSFSCEEGFALVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KLECLASGIWTNKPPQCLAAQCPPLKIPERGNMTCLHSAKAFQHQSSCSFSCEEGFALVG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 PEVVQCTASGVWTAPAPVCKAVQCQHLEAPNEGTMDCVHPLTAFAYGSSCKFECQPGYRV
       ::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PEVVQCTASGVWTAPAPVCKAVQCQHLEAPSEGTMDCVHPLTAFAYGSSCKFECQPGYRV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 RGLDMLRCIDSGHWSAPLPTCEAISCEPLESPVHGSMDCSPSLRAFQYDTNCSFRCAEGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RGLDMLRCIDSGHWSAPLPTCEAISCEPLESPVHGSMDCSPSLRAFQYDTNCSFRCAEGF
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 MLRGADIVRCDNLGQWTAPAPVCQALQCQDLPVPNEARVNCSHPFGAFRYQSVCSFTCNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MLRGADIVRCDNLGQWTAPAPVCQALQCQDLPVPNEARVNCSHPFGAFRYQSVCSFTCNE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 GLLLVGASVLQCLATGNWNSVPPECQAIPCTPLLSPQNGTMTCVQPLGSSSYKSTCQFIC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GLLLVGASVLQCLATGNWNSVPPECQAIPCTPLLSPQNGTMTCVQPLGSSSYKSTCQFIC
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 DEGYSLSGPERLDCTRSGRWTDSPPMCEAIKCPELFAPEQGSLDCSDTRGEFNVGSTCHF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DEGYSLSGPERLDCTRSGRWTDSPPMCEAIKCPELFAPEQGSLDCSDTRGEFNVGSTCHF
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB5 SCNNGFKLEGPNNVECTTSGRWSATPPTCKGIASLPTPGVQCPALTTPGQGTMYCRHHPG
       ::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SCDNGFKLEGPNNVECTTSGRWSATPPTCKGIASLPTPGVQCPALTTPGQGTMYCRHHPG
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB5 TFGFNTTCYFGCNAGFTLIGDSTLSCRPSGQWTAVTPACRAVKCSELHVNKPIAMNCSNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TFGFNTTCYFGCNAGFTLIGDSTLSCRPSGQWTAVTPACRAVKCSELHVNKPIAMNCSNL
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB5 WGNFSYGSICSFHCLEGQLLNGSAQTACQENGHWSTTVPTCQAGPLTIQEALTYFGGAVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 WGNFSYGSICSFHCLEGQLLNGSAQTACQENGHWSTTVPTCQAGPLTIQEALTYFGGAVA
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830
pF1KB5 STIGLIMGGTLLALLRKRFRQKDDGKCPLNPHSHLGTYGVFTNAAFDPSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 STIGLIMGGTLLALLRKRFRQKDDGKCPLNPHSHLGTYGVFTNAAFDPSP
              790       800       810       820       830

>>CCDS1283.1 SELE gene_id:6401|Hs108|chr1                 (610 aa)
 initn: 1620 init1: 1206 opt: 1875  Z-score: 1282.9  bits: 247.9 E(32554): 3.9e-65
Smith-Waterman score: 1875; 44.7% identity (70.7% similar) in 552 aa overlap (21-569:4-549)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MANCQIAILYQRFQRVVFGISQLLCFSALISELTNQKEVAAWTYHYSTKAYSWNISRKYC
                           ::.:  :::   :   :: .::.:. ::.:.... .  ::
CCDS12                  MIASQFL--SALTLVLLI-KESGAWSYNTSTEAMTYDEASAYC
                                  10         20        30        40

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 QNRYTDLVAIQNKNEIDYLNKVLPYYSSYYWIGIRKNNKTWTWVGTKKALTNEAENWADN
       :.::: :::::::.::.:::..: :  ::::::::: :..:.::::.: ::.::.::: .
CCDS12 QQRYTHLVAIQNKEEIEYLNSILSYSPSYYWIGIRKVNNVWVWVGTQKPLTEEAKNWAPG
               50        60        70        80        90       100

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 EPNNKRNNEDCVEIYIKSPSAPGKWNDEHCLKKKHALCYTASCQDMSCSKQGECLETIGN
       ::::....:::::::::  .  : ::::.: ::: ::::::.: . ::: .:::.:::.:
CCDS12 EPNNRQKDEDCVEIYIKREKDVGMWNDERCSKKKLALCYTAACTNTSCSGHGECVETINN
              110       120       130       140       150       160

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 YTCSCYPGFYGPECEYVRECGELELPQHVLMNCSHPLGNFSFNSQCSFHCTDGYQVNGPS
       :::.: ::: : .:: . .:  :: :.:  . :::::::::.::.::. :  ::  ..  
CCDS12 YTCKCDPGFSGLKCEQIVNCTALESPEHGSLVCSHPLGNFSYNSSCSISCDRGYLPSSME
              170       180       190       200       210       220

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 KLECLASGIWTNKPPQCLAAQCPPLKIPERGNMTCLHSAKAFQHQSSCSFSCEEGFALVG
        ..:..:: :.   : : ...:  .  :  : . :...  .:  ...:.:.::::: :.:
CCDS12 TMQCMSSGEWSAPIPACNVVECDAVTNPANGFVECFQNPGSFPWNTTCTFDCEEGFELMG
              230       240       250       260       270       280

              310       320       330        340       350         
pF1KB5 PEVVQCTASGVWTAPAPVCKAVQCQHLEAPNEGTMDCVH-PLTAFAYGSSCKFECQPGYR
        . .:::.:: :    :.:::: :. .. :..:.. : : :   :.. :::.: :. :. 
CCDS12 AQSLQCTSSGNWDNEKPTCKAVTCRAVRQPQNGSVRCSHSPAGEFTFKSSCNFTCEEGFM
              290       300       310       320       330       340

     360       370       380       390       400        410        
pF1KB5 VRGLDMLRCIDSGHWSAPLPTCEAISCEPLESPVHGSMDCSPSLR-AFQYDTNCSFRCAE
       ..:  ...:  .:.:.  .:.:::..:  : .: .: :.: ::   .:.: ..: : : .
CCDS12 LQGPAQVECTTQGQWTQQIPVCEAFQCTALSNPERGYMNCLPSASGSFRYGSSCEFSCEQ
              350       360       370       380       390       400

      420       430       440       450       460        470       
pF1KB5 GFMLRGADIVRCDNLGQWTAPAPVCQALQCQDLPVPNEARVNCSH-PFGAFRYQSVCSFT
       ::.:.:.  ..:   :.:    :.:.:..:. .  : .. : :.: :.: : :.: :.:.
CCDS12 GFVLKGSKRLQCGPTGEWDNEKPTCEAVRCDAVHQPPKGLVRCAHSPIGEFTYKSSCAFS
              410       420       430       440       450       460

       480       490       500       510       520       530       
pF1KB5 CNEGLLLVGASVLQCLATGNWNSVPPECQAIPCTPLLSPQNGTMTCVQPLGSSSYKSTCQ
       :.::. : :.. :.: . :.:.   : ::.. :. :  : . .:.:    :   . ..:.
CCDS12 CEEGFELHGSTQLECTSQGQWTEEVPSCQVVKCSSLAVPGKINMSCS---GEPVFGTVCK
              470       480       490       500          510       

       540       550       560       570       580       590       
pF1KB5 FICDEGYSLSGPERLDCTRSGRWTDSPPMCEAIKCPELFAPEQGSLDCSDTRGEFNVGST
       : : ::..:.:     :  .:.:.   : :::                            
CCDS12 FACPEGWTLNGSAARTCGATGHWSGLLPTCEAPTESNIPLVAGLSAAGLSLLTLAPFLLW
       520       530       540       550       560       570       

       600       610       620       630       640       650       
pF1KB5 CHFSCNNGFKLEGPNNVECTTSGRWSATPPTCKGIASLPTPGVQCPALTTPGQGTMYCRH
                                                                   
CCDS12 LRKCLRKAKKFVPASSCQSLESDGSYQKPSYIL                           
       580       590       600       610                           

>>CCDS53427.1 SELL gene_id:6402|Hs108|chr1                (385 aa)
 initn: 1668 init1: 1225 opt: 1229  Z-score: 849.8  bits: 167.1 E(32554): 5.1e-41
Smith-Waterman score: 1229; 51.3% identity (74.5% similar) in 310 aa overlap (11-320:21-330)

                         10        20        30        40        50
pF1KB5           MANCQIAILYQRFQRVVFGISQLLCFSALISELTNQKEVAAWTYHYSTKA
                           :  :: ...: .:  .. :  ..  .. .  :::::: : 
CCDS53 MGCRRTREGPSKAMIFPWKCQSTQRDLWNIFKLWGWTMLCCDFLAHHGTDCWTYHYSEKP
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pF1KB5 YSWNISRKYCQNRYTDLVAIQNKNEIDYLNKVLPYYSSYYWIGIRKNNKTWTWVGTKKAL
       ..:. .:..:.. :::::::::: ::.::.:.::.  ::::::::: .  ::::::.:.:
CCDS53 MNWQRARRFCRDNYTDLVAIQNKAEIEYLEKTLPFSRSYYWIGIRKIGGIWTWVGTNKSL
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pF1KB5 TNEAENWADNEPNNKRNNEDCVEIYIKSPSAPGKWNDEHCLKKKHALCYTASCQDMSCSK
       :.:::::.:.:::::.:.:::::::::  .  :::::. : : : :::::::::  ::: 
CCDS53 TEEAENWGDGEPNNKKNKEDCVEIYIKRNKDAGKWNDDACHKLKAALCYTASCQPWSCSG
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pF1KB5 QGECLETIGNYTCSCYPGFYGPECEYVRECGELELPQHVLMNCSHPLGNFSFNSQCSFHC
       .:::.: :.::::.:  :.:::.:..: .:  :: :.   :.:.::::::::.:::.: :
CCDS53 HGECVEIINNYTCNCDVGYYGPQCQFVIQCEPLEAPELGTMDCTHPLGNFSFSSQCAFSC
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pF1KB5 TDGYQVNGPSKLECLASGIWTNKPPQCLAAQCPPLKIPERGNMTCLHSAKAFQHQSSCSF
       ..: ...:  .  :   : :..  : : . :: ::. :. : :.: :   .:.  :.:.:
CCDS53 SEGTNLTGIEETTCGPFGNWSSPEPTCQVIQCEPLSAPDLGIMNCSHPLASFSFTSACTF
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pF1KB5 SCEEGFALVGPEVVQCTASGVWTAPAPVCKAVQCQHLEAPNEGTMDCVHPLTAFAYGSSC
        : ::  :.: . . : .::.:. :.:.:.                              
CCDS53 ICSEGTELIGKKKTICESSGIWSNPSPICQKLDKSFSMIKEGDYNPLFIPVAVMVTAFSG
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CCDS14 VPGGYKIRGSTPYRHGDSVTFACKTNFSMNGNKSVWCQANNMWGPTRLPTCVSVFPLECP
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pF1KB5 ELELPQHVLMNCSHPLGNFSFNSQCSFHCTDGYQVNGPSKLECLASGIWTNKPPQCLAAQ
        : .  :   . :. .:... . . .. : .:: . : . ..::.:: :.  :: :  :.
CCDS14 ALPMI-HNGHHTSENVGSIAPGLSVTYSCESGYLLVGEKIINCLSSGKWSAVPPTCEEAR
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pF1KB5 CPPL-KIPERGNMTCLHSAKAFQHQSSCSFSCEEGFALVGPEVVQCTASG---VWTAPAP
       :  : ..:. :..   .    ..   . .: :.::. : ::   .:. .:   .::   :
CCDS14 CKSLGRFPN-GKV---KEPPILRVGVTANFFCDEGYRLQGPPSSRCVIAGQGVAWTK-MP
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pF1KB5 VCKAVQCQHLEAPNEGTMDCVHPLTAFAYGSSCKFECQP------GYRVRGLDMLRC-ID
       ::. . :     :  .     . :.  .:::   . :.:      .. . : . ::: .:
CCDS14 VCEEIFCPS-PPPILNGRHIGNSLANVSYGSIVTYTCDPDPEEGVNFILIGESTLRCTVD
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pF1KB5 S---GHWSAPLPTCE----AISCEPLESPVHGSMDCSPSLRAFQYDTNCSFRCAEGFMLR
       :   : ::.: : ::    :..: :  . ..: :  . . : . :. .  : :  :: :.
CCDS14 SQKTGTWSGPAPRCELSTSAVQC-PHPQILRGRMVSGQKDR-YTYNDTVIFACMFGFTLK
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pF1KB5 GADIVRCDNLGQWTAPAPVCQALQCQDLPVPNEARVNCSHPFGAFRYQSVCSFTCNEGLL
       :.  .::.  : :   ::::.  .::  :   ... .  :    :   .  ...:: : .
CCDS14 GSKQIRCNAQGTWEPSAPVCEK-ECQAPPNILNGQKEDRHMV-RFDPGTSIKYSCNPGYV
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pF1KB5 LVGASVLQCLATGNWNSVPPECQAIPCTP-----LLSPQNGTMTCVQPLGSSSYKSTCQF
       :::   .:: . : :.   :.:..  :       : .::.     :.:  .::       
CCDS14 LVGEESIQCTSEGVWTPPVPQCKVAACEATGRQLLTKPQH---QFVRPDVNSS-------
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pF1KB5 ICDEGYSLSGPERLDCTRSGRWTDSPPMCEAIKCPELFAPEQGSLDCSDTRGEFNVGSTC
        : :::.:::    .:  .  :     .:. : ::   .  .:.   :. . .:  :.: 
CCDS14 -CGEGYKLSGSVYQECQGTIPWFMEIRLCKEITCPPPPVIYNGAHTGSSLE-DFPYGTTV
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pF1KB5 HFSCNNG------FKLEGPNNVECTTS----GRWSATPPTCKGIASLPTPGVQCPALTTP
        ..:: :      :.: : ....::..    : ::.  : ::    :   .:::  .   
CCDS14 TYTCNPGPERGVEFSLIGESTIRCTSNDQERGTWSGPAPLCK----LSLLAVQCSHVHIA
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pF1KB5 GQGTMYCRHHPGTFGFNTTCYFGCNAGFTLIGDSTLSCRPSGQWTAVTPACRAVKCSELH
       .   .  .. :  . .: :  : : .:::: :.: . :. .. :    :.:.   :.  :
CCDS14 NGYKISGKEAP--YFYNDTVTFKCYSGFTLKGSSQIRCKADNTWDPEIPVCEKETCQ--H
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pF1KB5 VNKPIAMNCSNLWGNFSYGSICSFHCLEGQLLNGSAQTACQ--ENGHWSTTVPTCQAGPL
       : . .    ..: .. :   . .  : .:  :.: :   ::  ::: :   .: :.    
CCDS14 VRQSL----QELPAG-SRVELVNTSCQDGYQLTGHAYQMCQDAENGIWFKKIPLCKVIHC
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pF1KB5 TIQEALTYFGGAVASTIGLIMGGTLLALLRKRFRQKDDGKCPLNPHSHLGTYGVFTNAAF
                                                                   
CCDS14 HPPPVIVNGKHTGMMAENFLYGNEVSYECDQGFYLLGEKKLQCRSDSKGHGSWSGPSPQC
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pF1KB5 HCLKKKHALCYTASCQDMSCSKQGECLETIGNYTCSCYPG-FYGPE----CEYVR--ECG
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pF1KB5 ELELPQHVLMNCSHPLGNFSFNSQCSFHCTDGYQVNGPSKLECLASGIWTNKPPQCLAAQ
        : .  :   . :. .:... . . .. : .:: . : . ..::.:: :.  :: :  :.
CCDS31 ALPMI-HNGHHTSENVGSIAPGLSVTYSCESGYLLVGEKIINCLSSGKWSAVPPTCEEAR
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pF1KB5 CPPL-KIPERGNMTCLHSAKAFQHQSSCSFSCEEGFALVGPEVVQCTASG---VWTAPAP
       :  : ..:. :..   .    ..   . .: :.::. : ::   .:. .:   .::   :
CCDS31 CKSLGRFPN-GKV---KEPPILRVGVTANFFCDEGYRLQGPPSSRCVIAGQGVAWTK-MP
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pF1KB5 VCKAVQCQHLEAPNEGTMDCVHPLTAFAYGSSCKFECQP------GYRVRGLDMLRC-ID
       ::. . :     :  .     . :.  .:::   . :.:      .. . : . ::: .:
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pF1KB5 S---GHWSAPLPTCE----AISCEPLESPVHGSMDCSPSLRAFQYDTNCSFRCAEGFMLR
       :   : ::.: : ::    :..: :  . ..: :  . . : . :. .  : :  :: :.
CCDS31 SQKTGTWSGPAPRCELSTSAVQC-PHPQILRGRMVSGQKDR-YTYNDTVIFACMFGFTLK
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pF1KB5 GADIVRCDNLGQWTAPAPVCQALQCQDLPVPNEARVNCSHPFGAFRYQSVCSFTCNEGLL
       :.  .::.  : :   ::::.  .::  :   ... .  :    :   .  ...:: : .
CCDS31 GSKQIRCNAQGTWEPSAPVCEK-ECQAPPNILNGQKEDRHMV-RFDPGTSIKYSCNPGYV
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pF1KB5 LVGASVLQCLATGNWNSVPPECQAIPCTP-----LLSPQNGTMTCVQPLGSSSYKSTCQF
       :::   .:: . : :.   :.:..  :       : .::.     :.:  .::       
CCDS31 LVGEESIQCTSEGVWTPPVPQCKVAACEATGRQLLTKPQH---QFVRPDVNSS-------
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pF1KB5 ICDEGYSLSGPERLDCTRSGRWTDSPPMCEAIKCPELFAPEQGSLDCSDTRGEFNVGSTC
        : :::.:::    .:  .  :     .:. : ::   .  .:.   :. . .:  :.: 
CCDS31 -CGEGYKLSGSVYQECQGTIPWFMEIRLCKEITCPPPPVIYNGAHTGSSLE-DFPYGTTV
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pF1KB5 HFSCNNG------FKLEGPNNVECTTS----GRWSATPPTCKGIASLPTPGVQCPALTTP
        ..:: :      :.: : ....::..    : ::.  : ::    :   .:::  .   
CCDS31 TYTCNPGPERGVEFSLIGESTIRCTSNDQERGTWSGPAPLCK----LSLLAVQCSHVHIA
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pF1KB5 GQGTMYCRHHPGTFGFNTTCYFGCNAGFTLIGDSTLSCRPSGQWTAVTPACRAVKCSELH
       .   .  .. :  . .: :  : : .:::: :.: . :. .. :    :.:.   :.   
CCDS31 NGYKISGKEAP--YFYNDTVTFKCYSGFTLKGSSQIRCKADNTWDPEIPVCEK-GCQ---
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pF1KB5 VNKPIAMNCSNLWGN---FSYGSICSFHCLEGQLLNGSAQTACQENGHWSTTVPTCQAGP
        . :   .  .  ::   :  :   .. :  : :: :. .  :. .:.:: ..: :.   
CCDS31 -SPPGLHHGRHTGGNTVFFVSGMTVDYTCDPGYLLVGNKSIHCMPSGNWSPSAPRCEETC
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pF1KB5 LTIQEALTYFGGAVASTIGLIMGGTLLALLRKRFRQKDDGKCPLNPHSHLGTYGVFTNAA
         ....:                                                     
CCDS31 QHVRQSLQELPAGSRVELVNTSCQDGYQLTGHAYQMCQDAENGIWFKKIPLCKVIHCHPP
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>>CCDS6316.2 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8              (3538 aa)
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          :    ...     :    .:..    .. .:. .  :  . ::        : :. .
CCDS63 --PHGYIISQTGGQLNSVVRWACDRG---FRLVGKSSAVCRKSSYGYHAWDAPVPACQAI
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         ::  . :     : .    ..  ... .. :.:::....   .   : ..: :.:  :
CCDS63 S-CGIPKAPT----NGGILTTDYLVGTRVTYFCNDGYRLSSKELTTAVCQSDGTWSNHNK
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        :.:.. .:  :  :  ::    ...    . :.  :.:. :: :::  : .: .::.:.
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            : : .:   :   .: .        ..: ..  ..:.::.:. : ..  : .. .
CCDS63 ESETRCLAGHCGIPELIVNGQVIG----ENYGYRDTVVYQCNPGFRLIGSSVRICQQDHN
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       ::. ::.:  .::    ::..:      :  .:...   .: :  :....:   ..:.  
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        ::. : :.:....:.:  .: ... . .   : : : .:  . :: : .: :.::: : 
CCDS63 RQWSHPPPMCKVVNCSDPGIPANSKRESKIEHGNFTYGTVVFYDCNPGYFLFGSSVLICQ
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        .:.:..  :::  : :     : :....  .     .. :: .. :    :: :     
CCDS63 PNGQWDKPLPECIMIDCGHPGVPPNAVLSGEK----YTFGSTVHYSCTGKRSLLGQSSRT
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       :  .:.:. : : :  .:   : .  .: .:: . :.    : . :: ...:..:. :.:
CCDS63 CQLNGHWSGSQPHCSGDATGTCGDPGTPGHGSRQESN----FRTKSTVRYACDTGYILHG
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        ..  : ..: :..  : ::.        :::    : ..: ..  .  ::  :...  .
CCDS63 SEERTCLANGSWTGRQPECKA--------VQCGNPGTTANGKVF--RIDGTT-FSSSVIY
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pF1KB5 GCNAGFTLIGDSTLSCRPSGQWTAVTPACRAVKCSELHVNKPIAMNCSNLWGNFSYGSIC
       .:  :. : : :. .:  .: :... : :  ..:..      :  :      ..  :.  
CCDS63 SCMEGYILSGPSVRQCTANGTWSGTLPNCTIISCGD----PGIPANGLRYGDDYVVGQNV
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       :. :  :    ::::   .:  :: :: ..:::.:                         
CCDS63 SYMCQPGYTMELNGSRIRTCTINGTWSGVMPTCRAVTCPTPPQISNGRLEGTNFDWGFSI
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CCDS63 SYICSPGYELSFPAVLTCVGNGTWSGEVPQCLPKFCGDPGIPAQGKREGKSFIYQSEVSF
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>>CCDS6317.1 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8              (3667 aa)
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         ...    . :.  :.:. :: :::  : .: .::.:.     : : .:   :   .: 
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       .        ..: ..  ..:.::.:. : ..  : .. .::. ::.:  .::    ::..
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       :      :  .:...   .: :  :....:   ..:.   ::. : :.:....:.:  .:
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        ... . .   : : : .:  . :: : .: :.::: :  .:.:..  :::  : :    
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        : :....  .     .. :: .. :    :: :     :  .:.:. : : :  .:   
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       : .  .: .:: . :.    : . :: ...:..:. :.: ..  : ..: :..  : ::.
CCDS63 CGDPGTPGHGSRQESN----FRTKSTVRYACDTGYILHGSEERTCLANGSWTGRQPECKA
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               :::    : ..: ..  .  ::  :...  ..:  :. : : :. .:  .: 
CCDS63 --------VQCGNPGTTANGKVF--RIDGTT-FSSSVIYSCMEGYILSGPSVRQCTANGT
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       :... : :  ..:.    .  :  :      ..  :.  :. :  :    ::::   .: 
CCDS63 WSGTLPNCTIISCG----DPGIPANGLRYGDDYVVGQNVSYMCQPGYTMELNGSRIRTCT
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        :: :: ..:::.:                                              
CCDS63 INGTWSGVMPTCRAVTCPTPPQISNGRLEGTNFDWGFSISYICSPGYELSFPAVLTCVGN
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>>CCDS6315.1 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8              (3707 aa)
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CCDS63 FCNDGYRLSSKELTTAVCQSDGTWSNHNKTPRC-VVVTCPSINSFILEHGRWRIVNGSH-
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         ...    . :.  :.:. :: :::  : .: .::.:.     : : .:   :   .: 
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       .        ..: ..  ..:.::.:. : ..  : .. .::. ::.:  .::    ::..
CCDS63 VIG----ENYGYRDTVVYQCNPGFRLIGSSVRICQQDHNWSGQLPSCVPVSCGHPGSPIY
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CCDS63 GR----TSGNGFNFNDVVTFSCNIGYLMQGPTKAQCQANRQWSHPPPMCKVVNCSDPGIP
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        ... . .   : : : .:  . :: : .: :.::: :  .:.:..  :::  : :    
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pF1KB5 SPQNGTMTCVQPLGSSSYKSTCQFICDEGYSLSGPERLDCTRSGRWTDSPPMC--EAI-K
        : :....  .     .. :: .. :    :: :     :  .:.:. : : :  .:   
CCDS63 VPPNAVLSGEK----YTFGSTVHYSCTGKRSLLGQSSRTCQLNGHWSGSQPHCSGDATGT
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pF1KB5 CPELFAPEQGSLDCSDTRGEFNVGSTCHFSCNNGFKLEGPNNVECTTSGRWSATPPTCKG
       : .  .: .:: . :.    : . :: ...:..:. :.: ..  : ..: :..  : ::.
CCDS63 CGDPGTPGHGSRQESN----FRTKSTVRYACDTGYILHGSEERTCLANGSWTGRQPECKA
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pF1KB5 IASLPTPGVQCPALTTPGQGTMYCRHHPGTFGFNTTCYFGCNAGFTLIGDSTLSCRPSGQ
               :::    : ..: ..  .  ::  :...  ..:  :. : : :. .:  .: 
CCDS63 --------VQCGNPGTTANGKVF--RIDGTT-FSSSVIYSCMEGYILSGPSVRQCTANGT
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pF1KB5 WTAVTPACRAVKCSELHVNKPIAMNCSNLWGNFSYGSICSFHCLEGQL--LNGSAQTACQ
       :... : :  ..:.    .  :  :      ..  :.  :. :  :    ::::   .: 
CCDS63 WSGTLPNCTIISCG----DPGIPANGLRYGDDYVVGQNVSYMCQPGYTMELNGSRIRTCT
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pF1KB5 ENGHWSTTVPTCQAGPLTIQEALTYFGGAVASTIGLIMGGTLLALLRKRFRQKDDGKCPL
        :: :: ..:::.:                                              
CCDS63 INGTWSGVMPTCRAVTCPTPPQISNGRLEGTNFDWGFSISYICSPGYELSFPAVLTCVGN
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CCDS44 MAPPVRLERPFPSRRFPGLLLAALVLLLSSFSDQCN-VPEWLPFARPTNLTDDFEFPIGT
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       .      ...:  ::. . : .. :: ...::.   .:   .:  ::   :  : :.  :
CCDS44 Y-----LNYECRPGYS-GRPFSIICLKNSVWTSAKDKCKRKSCRNPP--DPVNG-MA--H
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pF1KB5 SAKAFQHQSSCSFSCEEGFALVGPEVVQCTASG---VWTAPAPVCKAVQCQHLEAPNEGT
         : .: .:. ..:: .:. :.:   . :  ::   .:   .:::  . :    .  .: 
CCDS44 VIKDIQFRSQIKYSCPKGYRLIGSSSATCIISGNTVIWDNKTPVCDRIICGLPPTIANGD
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pF1KB5 MDCVHPLTAFAYGSSCKFECQPGYRVR------GLDMLRCIDS----GHWSAPLPTCEAI
       .  .     : :::   ..:. : : .      :   . : ..    : ::.: : :   
CCDS44 FTSISR-EYFHYGSVVTYHCNLGSRGKKVFELVGEPSIYCTSKDDQVGIWSGPAPQCIIP
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pF1KB5 S-CEPLESPVHGSMDCSPSLRAFQYDTNCSFRCAEGFMLRGADIVRCDNLGQWTAPAPVC
       . : :    :....  : .   :. .    :::  :: ..: . :.:. :..:    : :
CCDS44 NKCTP--PNVENGILVSDNRSLFSLNEVVEFRCQPGFGMKGPSHVKCQALNKWEPELPSC
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pF1KB5 QALQCQDLPVPNEARVNCSH-PFGAFRYQSVCSFTCNEGLLLVGASVLQCLATGNWNSVP
       . . ::  : :.  ... ..     :   .   ..:. :  : :.. :.:   :.:. . 
CCDS44 SRV-CQ--PPPDVLHAERTQRDKDNFSPGQEVFYSCEPGYDLRGSTYLHCTPQGDWSPAA
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pF1KB5 PECQAIPCTPLLSP-QNGTMTCVQPLGSSSYKSTCQFICDEGYSLSGPERLDCTRSGR--
       :.:..  :  .:.   :: .    :: . .  .  .:.::::..:.:     :. .:   
CCDS44 PRCEVKSCDDFLGQLPNGHVLF--PL-NLQLGAKVDFVCDEGFQLKGSSASYCVLAGMES
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pF1KB5 -WTDSPPMCEAIKCPELFAPEQGSLDCSDTRGEFNVGSTCHFSCNNGFKLEGPNNVECTT
        :..: :.::  .:    .: .: .       ...:::  ..::..: .: : ...::  
CCDS44 LWNSSVPVCERKSCETPPVPVNGMVHVIT---DIHVGSRINYSCTTGHRLIGHSSAECIL
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pF1KB5 SG---RWSATPPTCKGIASLPTPGVQCPALTTPGQGTMYCRHHPGTFGFNTTCYFGCNAG
       ::   .::  :: :. :   :.:    ::. .  .        :     . ::    . :
CCDS44 SGNTAHWSMKPPICQQIFC-PNP----PAILNGRHTGTPLGDIPYGKEVSYTCDPHPDRG
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pF1KB5 --FTLIGDSTL--SCRPSGQ--WTAVTPACRAVKCSELHVNKPIAMNCSNLWGNFSYGSI
         :.:::.::.  . .: :.  :.. .: :                              
CCDS44 MTFNLIGESTIRRTSEPHGNGVWSSPAPRCELPVGAGSHDALIVGKFYEVFAEEFCHL  
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>>CCDS1385.1 CFH gene_id:3075|Hs108|chr1                  (1231 aa)
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CCDS13 GYALPKAQTTVTCMENGWSPTPRCIRVKTCSKSSIDIENGFIS--ESQYTYALKEKAKYQ
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pF1KB5 TWVG-------TKKALTNEAENWADNEPNNKRNNEDCVEIYIKSPSAPGKWNDEHCLKKK
         .:       :. ..:   ..:.  .:.  .. .  . ..... .     ::   .: .
CCDS13 CKLGYVTADGETSGSITCGKDGWS-AQPTCIKSCD--IPVFMNARTK----NDFTWFKLN
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pF1KB5 HALCYTASCQDMSCSKQGECLETIGNYTCSCYPGFYG-PECEYVRECGELELPQ-HVLMN
        .: :   :.:   :. :    : :. .:. : :.   : : : :::   :::.  : . 
CCDS13 DTLDYE--CHDGYESNTG---STTGSIVCG-YNGWSDLPIC-YEREC---ELPKIDVHLV
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pF1KB5 CSHPLGNFSFNSQCSFHCTDGYQVNGPSKLECLASGIWTNKPPQC--LAAQC-PPLKIPE
        ..   ... .   .: :  :. . ::....:   :. .   : :   . .: ::   ::
CCDS13 PDRKKDQYKVGEVLKFSCKPGFTIVGPNSVQCYHFGL-SPDLPICKEQVQSCGPP---PE
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pF1KB5 --RGNMTCLHSAKAFQHQSSCSFSCEEGFALVGPEVVQCTASGVWTAPAPVC--KAVQCQ
          ::.   .. . . :.    . :.  : . ::. .::. .: ::.  :::  .   : 
CCDS13 LLNGNVKE-KTKEEYGHSEVVEYYCNPRFLMKGPNKIQCV-DGEWTT-LPVCIVEESTCG
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pF1KB5 HLEAPNEGTMDCVHPLTAFAYGSSCKFECQPGYRVRGLDMLRCIDSGHWSAPLPTCEAIS
        .   ..:  .   :   . ::.: .:.:. .. . :   . ::  : :.  :: : ::.
CCDS13 DIPELEHGWAQLSSP--PYYYGDSVEFNCSESFTMIGHRSITCIH-GVWTQ-LPQCVAID
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pF1KB5 ----CEPLESPVHGSMDCSPSLRAFQYDTNCSFRC--AEGFMLRGADIVRCDNLGQWTAP
           :.   : .    .   . . :....:  .::   ::..      . : : :.:  :
CCDS13 KLKKCKS--SNLIILEEHLKNKKEFDHNSNIRYRCRGKEGWIH-----TVCIN-GRWD-P
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pF1KB5 APVCQALQCQDLPVPNEARVNCSHPFGA---FRYQSVCSFTCNEGLLLVGASVLQCLATG
          :.  : :  : : .  .  :: . .   .:     :  :.:. :.  .  . :   :
CCDS13 EVNCSMAQIQLCPPPPQ--IPNSHNMTTTLNYRDGEKVSVLCQENYLIQEGEEITC-KDG
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pF1KB5 NWNSVPPECQAIPCTPLLSPQNGTMTCVQPLGSS-SYKSTCQFICDEGYSLSGPERLDCT
        :.:.:   . :::.   . ..::..  .    : .. .  .. :. :. .:  ..  : 
CCDS13 RWQSIPLCVEKIPCSQPPQIEHGTINSSRSSQESYAHGTKLSYTCEGGFRISEENETTC-
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pF1KB5 RSGRWTDSPPMCEAIKCPELFAPEQGSLDCSDTRGEFNVGSTCHFSCNNGFKLEGPNNVE
         :.:. :::.::.. :     :: .    .     .. :    ..: .:: ..::  ..
CCDS13 YMGKWS-SPPQCEGLPCKS--PPEISHGVVAHMSDSYQYGEEVTYKCFEGFGIDGPAIAK
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pF1KB5 CTTSGRWSATPPTCKGIASLPTPGVQCPALTTPGQGTMYCRHHPGTFGFNTTCYFGCNAG
       :  . .::  ::.:     :  :. .  :.    .  .:        : ..:  . : . 
CCDS13 CL-GEKWSH-PPSCIKTDCLSLPSFEN-AIPMGEKKDVY------KAGEQVT--YTCATY
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pF1KB5 FTLIGDSTLSCRPSGQWTAVTPACRAVKCSELHVNKPIAMNC---SNLWGNFSYGSICSF
       . . : :...:  : .::.  :.:: ..:    :: : ..:    :   ...  :    .
CCDS13 YKMDGASNVTCINS-RWTG-RPTCRDTSC----VNPPTVQNAYIVSRQMSKYPSGERVRY
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pF1KB5 HCLEGQLLNGSAQTACQENGHWSTTVPTCQAGPLTIQEALTYFGGAVASTIGLIMGGTLL
       .:     . :. .. :  ::.: :  : :.                              
CCDS13 QCRSPYEMFGDEEVMCL-NGNW-TEPPQCKDSTGKCGPPPPIDNGDITSFPLSVYAPASS
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830 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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