Result of FASTA (ccds) for pF1KB6684
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6684, 456 aa
  1>>>pF1KB6684 456 - 456 aa - 456 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2221+/-0.000813; mu= 18.0772+/- 0.049
 mean_var=66.3468+/-12.974, 0's: 0 Z-trim(107.4): 18  B-trim: 0 in 0/48
 Lambda= 0.157458
 statistics sampled from 9533 (9546) to 9533 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.667), E-opt: 0.2 (0.293), width:  16
 Scan time:  2.960

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS2991.1 PLA1A gene_id:51365|Hs108|chr3          ( 456) 3095 712.0 3.2e-205
CCDS77795.1 PLA1A gene_id:51365|Hs108|chr3         ( 440) 2904 668.6 3.6e-192
CCDS56268.1 PLA1A gene_id:51365|Hs108|chr3         ( 440) 2070 479.1 3.9e-135
CCDS56269.1 PLA1A gene_id:51365|Hs108|chr3         ( 283) 1934 448.1 5.4e-126
CCDS3272.1 LIPH gene_id:200879|Hs108|chr3          ( 451)  891 211.3 1.7e-54
CCDS13564.1 LIPI gene_id:149998|Hs108|chr21        ( 481)  867 205.9 7.6e-53
CCDS11938.1 LIPG gene_id:9388|Hs108|chr18          ( 500)  506 123.9 3.8e-28
CCDS7594.1 PNLIP gene_id:5406|Hs108|chr10          ( 465)  467 115.0 1.7e-25
CCDS7595.1 PNLIPRP1 gene_id:5407|Hs108|chr10       ( 467)  420 104.3 2.7e-22
CCDS6012.1 LPL gene_id:4023|Hs108|chr8             ( 475)  414 103.0 7.2e-22
CCDS31292.1 PNLIPRP3 gene_id:119548|Hs108|chr10    ( 467)  410 102.0 1.3e-21
CCDS10166.1 LIPC gene_id:3990|Hs108|chr15          ( 499)  386 96.6 6.1e-20
CCDS77187.1 LIPG gene_id:9388|Hs108|chr18          ( 426)  267 69.5 7.4e-12


>>CCDS2991.1 PLA1A gene_id:51365|Hs108|chr3               (456 aa)
 initn: 3095 init1: 3095 opt: 3095  Z-score: 3797.8  bits: 712.0 E(32554): 3.2e-205
Smith-Waterman score: 3095; 100.0% identity (100.0% similar) in 456 aa overlap (1-456:1-456)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MPPGPWESCFWVGGLILWLSVGSSGDAPPTPQPKCADFQSANLFEGTDLKVQFLLFVPSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 MPPGPWESCFWVGGLILWLSVGSSGDAPPTPQPKCADFQSANLFEGTDLKVQFLLFVPSN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 PSCGQLVEGSSDLQNSGFNATLGTKLIIHGFRVLGTKPSWIDTFIRTLLRATNANVIAVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 PSCGQLVEGSSDLQNSGFNATLGTKLIIHGFRVLGTKPSWIDTFIRTLLRATNANVIAVD
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 WIYGSTGVYFSAVKNVIKLSLEISLFLNKLLVLGVSESSIHIIGVSLGAHVGGMVGQLFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 WIYGSTGVYFSAVKNVIKLSLEISLFLNKLLVLGVSESSIHIIGVSLGAHVGGMVGQLFG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 GQLGQITGLDPAGPEYTRASVEERLDAGDALFVEAIHTDTDNLGIRIPVGHVDYFVNGGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 GQLGQITGLDPAGPEYTRASVEERLDAGDALFVEAIHTDTDNLGIRIPVGHVDYFVNGGQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 DQPGCPTFFYAGYSYLICDHMRAVHLYISALENSCPLMAFPCASYKAFLAGRCLDCFNPF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 DQPGCPTFFYAGYSYLICDHMRAVHLYISALENSCPLMAFPCASYKAFLAGRCLDCFNPF
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 LLSCPRIGLVEQGGVKIEPLPKEVKVYLLTTSSAPYCMHHSLVEFHLKELRNKDTNIEVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 LLSCPRIGLVEQGGVKIEPLPKEVKVYLLTTSSAPYCMHHSLVEFHLKELRNKDTNIEVT
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 FLSSNITSSSKITIPKQQRYGKGIIAHATPQCQINQVKFKFQSSNRVWKKDRTTIIGKFC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 FLSSNITSSSKITIPKQQRYGKGIIAHATPQCQINQVKFKFQSSNRVWKKDRTTIIGKFC
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450      
pF1KB6 TALLPVNDREKMVCLPEPVNLQASVTVSCDLKIACV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 TALLPVNDREKMVCLPEPVNLQASVTVSCDLKIACV
              430       440       450      

>>CCDS77795.1 PLA1A gene_id:51365|Hs108|chr3              (440 aa)
 initn: 2904 init1: 2904 opt: 2904  Z-score: 3563.6  bits: 668.6 E(32554): 3.6e-192
Smith-Waterman score: 2904; 100.0% identity (100.0% similar) in 432 aa overlap (25-456:9-440)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MPPGPWESCFWVGGLILWLSVGSSGDAPPTPQPKCADFQSANLFEGTDLKVQFLLFVPSN
                               ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77                 MHKSSSIWGDAPPTPQPKCADFQSANLFEGTDLKVQFLLFVPSN
                               10        20        30        40    

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 PSCGQLVEGSSDLQNSGFNATLGTKLIIHGFRVLGTKPSWIDTFIRTLLRATNANVIAVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 PSCGQLVEGSSDLQNSGFNATLGTKLIIHGFRVLGTKPSWIDTFIRTLLRATNANVIAVD
           50        60        70        80        90       100    

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 WIYGSTGVYFSAVKNVIKLSLEISLFLNKLLVLGVSESSIHIIGVSLGAHVGGMVGQLFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 WIYGSTGVYFSAVKNVIKLSLEISLFLNKLLVLGVSESSIHIIGVSLGAHVGGMVGQLFG
          110       120       130       140       150       160    

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 GQLGQITGLDPAGPEYTRASVEERLDAGDALFVEAIHTDTDNLGIRIPVGHVDYFVNGGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 GQLGQITGLDPAGPEYTRASVEERLDAGDALFVEAIHTDTDNLGIRIPVGHVDYFVNGGQ
          170       180       190       200       210       220    

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 DQPGCPTFFYAGYSYLICDHMRAVHLYISALENSCPLMAFPCASYKAFLAGRCLDCFNPF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DQPGCPTFFYAGYSYLICDHMRAVHLYISALENSCPLMAFPCASYKAFLAGRCLDCFNPF
          230       240       250       260       270       280    

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 LLSCPRIGLVEQGGVKIEPLPKEVKVYLLTTSSAPYCMHHSLVEFHLKELRNKDTNIEVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LLSCPRIGLVEQGGVKIEPLPKEVKVYLLTTSSAPYCMHHSLVEFHLKELRNKDTNIEVT
          290       300       310       320       330       340    

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 FLSSNITSSSKITIPKQQRYGKGIIAHATPQCQINQVKFKFQSSNRVWKKDRTTIIGKFC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 FLSSNITSSSKITIPKQQRYGKGIIAHATPQCQINQVKFKFQSSNRVWKKDRTTIIGKFC
          350       360       370       380       390       400    

              430       440       450      
pF1KB6 TALLPVNDREKMVCLPEPVNLQASVTVSCDLKIACV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 TALLPVNDREKMVCLPEPVNLQASVTVSCDLKIACV
          410       420       430       440

>>CCDS56268.1 PLA1A gene_id:51365|Hs108|chr3              (440 aa)
 initn: 2070 init1: 2070 opt: 2070  Z-score: 2539.7  bits: 479.1 E(32554): 3.9e-135
Smith-Waterman score: 2965; 96.5% identity (96.5% similar) in 456 aa overlap (1-456:1-440)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MPPGPWESCFWVGGLILWLSVGSSGDAPPTPQPKCADFQSANLFEGTDLKVQFLLFVPSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MPPGPWESCFWVGGLILWLSVGSSGDAPPTPQPKCADFQSANLFEGTDLKVQFLLFVPSN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 PSCGQLVEGSSDLQNSGFNATLGTKLIIHGFRVLGTKPSWIDTFIRTLLRATNANVIAVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 PSCGQLVEGSSDLQNSGFNATLGTKLIIHGFRVLGTKPSWIDTFIRTLLRATNANVIAVD
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 WIYGSTGVYFSAVKNVIKLSLEISLFLNKLLVLGVSESSIHIIGVSLGAHVGGMVGQLFG
       ::::::::::::::::                ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 WIYGSTGVYFSAVKNV----------------LGVSESSIHIIGVSLGAHVGGMVGQLFG
              130                       140       150       160    

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 GQLGQITGLDPAGPEYTRASVEERLDAGDALFVEAIHTDTDNLGIRIPVGHVDYFVNGGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 GQLGQITGLDPAGPEYTRASVEERLDAGDALFVEAIHTDTDNLGIRIPVGHVDYFVNGGQ
          170       180       190       200       210       220    

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 DQPGCPTFFYAGYSYLICDHMRAVHLYISALENSCPLMAFPCASYKAFLAGRCLDCFNPF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DQPGCPTFFYAGYSYLICDHMRAVHLYISALENSCPLMAFPCASYKAFLAGRCLDCFNPF
          230       240       250       260       270       280    

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 LLSCPRIGLVEQGGVKIEPLPKEVKVYLLTTSSAPYCMHHSLVEFHLKELRNKDTNIEVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LLSCPRIGLVEQGGVKIEPLPKEVKVYLLTTSSAPYCMHHSLVEFHLKELRNKDTNIEVT
          290       300       310       320       330       340    

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 FLSSNITSSSKITIPKQQRYGKGIIAHATPQCQINQVKFKFQSSNRVWKKDRTTIIGKFC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 FLSSNITSSSKITIPKQQRYGKGIIAHATPQCQINQVKFKFQSSNRVWKKDRTTIIGKFC
          350       360       370       380       390       400    

              430       440       450      
pF1KB6 TALLPVNDREKMVCLPEPVNLQASVTVSCDLKIACV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 TALLPVNDREKMVCLPEPVNLQASVTVSCDLKIACV
          410       420       430       440

>>CCDS56269.1 PLA1A gene_id:51365|Hs108|chr3              (283 aa)
 initn: 1934 init1: 1934 opt: 1934  Z-score: 2375.5  bits: 448.1 E(32554): 5.4e-126
Smith-Waterman score: 1934; 100.0% identity (100.0% similar) in 283 aa overlap (174-456:1-283)

           150       160       170       180       190       200   
pF1KB6 SLFLNKLLVLGVSESSIHIIGVSLGAHVGGMVGQLFGGQLGQITGLDPAGPEYTRASVEE
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56                               MVGQLFGGQLGQITGLDPAGPEYTRASVEE
                                             10        20        30

           210       220       230       240       250       260   
pF1KB6 RLDAGDALFVEAIHTDTDNLGIRIPVGHVDYFVNGGQDQPGCPTFFYAGYSYLICDHMRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RLDAGDALFVEAIHTDTDNLGIRIPVGHVDYFVNGGQDQPGCPTFFYAGYSYLICDHMRA
               40        50        60        70        80        90

           270       280       290       300       310       320   
pF1KB6 VHLYISALENSCPLMAFPCASYKAFLAGRCLDCFNPFLLSCPRIGLVEQGGVKIEPLPKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VHLYISALENSCPLMAFPCASYKAFLAGRCLDCFNPFLLSCPRIGLVEQGGVKIEPLPKE
              100       110       120       130       140       150

           330       340       350       360       370       380   
pF1KB6 VKVYLLTTSSAPYCMHHSLVEFHLKELRNKDTNIEVTFLSSNITSSSKITIPKQQRYGKG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VKVYLLTTSSAPYCMHHSLVEFHLKELRNKDTNIEVTFLSSNITSSSKITIPKQQRYGKG
              160       170       180       190       200       210

           390       400       410       420       430       440   
pF1KB6 IIAHATPQCQINQVKFKFQSSNRVWKKDRTTIIGKFCTALLPVNDREKMVCLPEPVNLQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 IIAHATPQCQINQVKFKFQSSNRVWKKDRTTIIGKFCTALLPVNDREKMVCLPEPVNLQA
              220       230       240       250       260       270

           450      
pF1KB6 SVTVSCDLKIACV
       :::::::::::::
CCDS56 SVTVSCDLKIACV
              280   

>>CCDS3272.1 LIPH gene_id:200879|Hs108|chr3               (451 aa)
 initn: 751 init1: 622 opt: 891  Z-score: 1092.1  bits: 211.3 E(32554): 1.7e-54
Smith-Waterman score: 891; 35.4% identity (69.1% similar) in 404 aa overlap (23-416:14-411)

               10        20        30         40        50         
pF1KB6 MPPGPWESCFWVGGLILWLSVGSSGDAPPT-PQPKCADFQSANLFEGTDLKVQFLLFVPS
                             : .::  : :.    .:.:: .  :: :.:...:.. .
CCDS32          MLRFYLFISLLCLSRSDAEETCPSFTRLSFHSAVV--GTGLNVRLMLYTRK
                        10        20        30          40         

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB6 NPSCGQLVEGSSDLQNSGFNATLGTKLIIHGFRVLGTKPSWIDTFIRTLLRATNANVIAV
       : .:.: .. :: . :  .:.:  : .:.::::  :. : :.: ... :: . . ::..:
CCDS32 NLTCAQTIN-SSAFGN--LNVTKKTTFIVHGFRPTGSPPVWMDDLVKGLLSVEDMNVVVV
      50         60          70        80        90       100      

     120        130       140       150       160       170        
pF1KB6 DWIYGSTG-VYFSAVKNVIKLSLEISLFLNKLLVLGVSESSIHIIGVSLGAHVGGMVGQL
       ::  :.:  .:  : ... :... .. :....:. :.: ..:..::::::::..:.::..
CCDS32 DWNRGATTLIYTHASSKTRKVAMVLKEFIDQMLAEGASLDDIYMIGVSLGAHISGFVGEM
        110       120       130       140       150       160      

      180       190       200       210       220       230        
pF1KB6 FGGQLGQITGLDPAGPEYTRASVEERLDAGDALFVEAIHTDTDNLGIRIPVGHVDYFVNG
       . : ::.::::::::: ..    ..::: .:: ::..::.::: :: . :.:..:.. ::
CCDS32 YDGWLGRITGLDPAGPLFNGKPHQDRLDPSDAQFVDVIHSDTDALGYKEPLGNIDFYPNG
        170       180       190       200       210       220      

      240       250       260       270       280       290        
pF1KB6 GQDQPGCPTFFYAGYSYLICDHMRAVHLYISALENSCPLMAFPCASYKAFLAGRCLDCFN
       : ::::::  . .:..:. :::.:.:.::.:.:..:: . :.:: ::. .  :.:..: .
CCDS32 GLDQPGCPKTILGGFQYFKCDHQRSVYLYLSSLRESCTITAYPCDSYQDYRNGKCVSCGT
        230       240       250       260       270       280      

      300       310          320       330       340         350   
pF1KB6 PFLLSCPRIGLVE---QGGVKIEPLPKEVKVYLLTTSSAPYCMHHSLVEFHL--KELRNK
           ::: .:      .  .. .  :  .:... :.  .:.::.: .:..    :..:  
CCDS32 SQKESCPLLGYYADNWKDHLRGKD-PPMTKAFFDTAEESPFCMYHYFVDIITWNKNVRRG
        290       300       310        320       330       340     

           360       370        380        390        400       410
pF1KB6 DTNIEVTFLSSNITSSSKITIPKQ-QRYGK-GIIAHATPQC-QINQVKFKFQSSNRVWKK
       : .:..   ..: : :.    :   :.: . ...:. . .  ..  ... :.... .  .
CCDS32 DITIKLRDKAGNTTESKINHEPTTFQKYHQVSLLARFNQDLDKVAAISLMFSTGSLIGPR
         350       360       370       380       390       400     

              420       430       440       450      
pF1KB6 DRTTIIGKFCTALLPVNDREKMVCLPEPVNLQASVTVSCDLKIACV
        .  :.                                        
CCDS32 YKLRILRMKLRSLAHPERPQLCRYDLVLMENVETVFQPILCPELQL
         410       420       430       440       450 

>>CCDS13564.1 LIPI gene_id:149998|Hs108|chr21             (481 aa)
 initn: 817 init1: 652 opt: 867  Z-score: 1062.2  bits: 205.9 E(32554): 7.6e-53
Smith-Waterman score: 867; 39.6% identity (70.7% similar) in 338 aa overlap (16-340:26-359)

                         10        20        30        40          
pF1KB6           MPPGPWESCFWVGGLILWLSVGSSGDAPPTPQPKCADFQSANLFEG-TDL
                                .::: :    .    :   : .:.. .. ..  ::
CCDS13 MLLKCLHNNLCQKYSAHAFQFSPRNVLWLLVVCLRSDNKRP---CLEFSQLSVKDSFRDL
               10        20        30        40           50       

      50             60         70        80        90       100   
pF1KB6 KVQ-----FLLFVPSNPSCGQ-LVEGSSDLQNSGFNATLGTKLIIHGFRVLGTKPSWIDT
        .      ..... .: .:.. : : ...: : .::.   :  .:::.: .:. : :...
CCDS13 FIPRIETILMMYTRNNLNCAEPLFEQNNSL-NVNFNTQKKTVWLIHGYRPVGSIPLWLQN
        60        70        80         90       100       110      

           110       120        130       140       150       160  
pF1KB6 FIRTLLRATNANVIAVDWIYGSTG-VYFSAVKNVIKLSLEISLFLNKLLVLGVSESSIHI
       :.: ::   . :::.:::  :.:  .:  ::::. :... .:. ...::  :.: ...:.
CCDS13 FVRILLNEEDMNVIVVDWSRGATTFIYNRAVKNTRKVAVSLSVHIKNLLKHGASLDNFHF
        120       130       140       150       160       170      

            170       180       190       200       210       220  
pF1KB6 IGVSLGAHVGGMVGQLFGGQLGQITGLDPAGPEYTRASVEERLDAGDALFVEAIHTDTDN
       ::::::::..:.::..: ::::.:::::::::...:     :::  :: ::..::.:...
CCDS13 IGVSLGAHISGFVGKIFHGQLGRITGLDPAGPRFSRKPPYSRLDYTDAKFVDVIHSDSNG
        180       190       200       210       220       230      

            230       240       250       260       270       280  
pF1KB6 LGIRIPVGHVDYFVNGGQDQPGCPTFFYAGYSYLICDHMRAVHLYISALENSCPLMAFPC
       :::. :.::.:.. :::. :::::  ...: ... :.:.:::::....::..: ...:::
CCDS13 LGIQEPLGHIDFYPNGGNKQPGCPKSIFSGIQFIKCNHQRAVHLFMASLETNCNFISFPC
        240       250       260       270       280       290      

            290       300       310            320       330       
pF1KB6 ASYKAFLAGRCLDCFNPFLLSCPRIGLVEQ--GGV---KIEPLPKEVKVYLLTTSSAPYC
        ::: . .. :.::      ::::.:   .   ::   ..:  : .. :.: :... :.:
CCDS13 RSYKDYKTSLCVDCDCFKEKSCPRLGYQAKLFKGVLKERMEGRPLRTTVFLDTSGTYPFC
        300       310       320       330       340       350      

       340       350       360       370       380       390       
pF1KB6 MHHSLVEFHLKELRNKDTNIEVTFLSSNITSSSKITIPKQQRYGKGIIAHATPQCQINQV
        ..                                                         
CCDS13 TYYFVLSIIVPDKTMMDGSFSFKLLNQLGMIEEPRLYEKNKPFYKLQEVKILAQFYNDFV
        360       370       380       390       400       410      

>>CCDS11938.1 LIPG gene_id:9388|Hs108|chr18               (500 aa)
 initn: 346 init1: 222 opt: 506  Z-score: 618.7  bits: 123.9 E(32554): 3.8e-28
Smith-Waterman score: 620; 33.3% identity (61.0% similar) in 387 aa overlap (9-375:9-383)

               10        20        30        40        50          
pF1KB6 MPPGPWESCFWVGGLILWLSVGSSGDAPPTPQPKCADFQSANLFEGTDLK--VQFLLFVP
               :::  .:   ...::   .:  :. .  :         :..:  :.: : . 
CCDS11 MSNSVPLLCFW--SLCYCFAAGSP--VPFGPEGRLEDKLHKPKATQTEVKPSVRFNLRTS
               10          20          30        40        50      

       60           70        80        90       100        110    
pF1KB6 SNP---SCGQLVEGSSDLQNSGFNATLGTKLIIHGFRVLGTKPSWIDTFIRTL-LRATNA
       ..:   .:   :  :. :.. .:: :  : .::::. . :   .:.  .. .:  :  .:
CCDS11 KDPEHEGCYLSVGHSQPLEDCSFNMTAKTFFIIHGWTMSGIFENWLHKLVSALHTREKDA
         60        70        80        90       100       110      

          120       130       140       150        160       170   
pF1KB6 NVIAVDWIYGSTGVYFSAVKNVIKLSLEISLFLNKLLVLG-VSESSIHIIGVSLGAHVGG
       ::..:::.  .  .: .::.:.  ..  :. .:. :      : ...:.:: ::::::.:
CCDS11 NVVVVDWLPLAHQLYTDAVNNTRVVGHSIARMLDWLQEKDDFSLGNVHLIGYSLGAHVAG
        120       130       140       150       160       170      

           180       190       200       210       220             
pF1KB6 MVGQLFGGQLGQITGLDPAGPEYTRASVEERLDAGDALFVEAIHTDTDN----LGIRIPV
       ..:..  : .:.::::::::: .  :....::.  :: ::...:: : .    .::..::
CCDS11 YAGNFVKGTVGRITGLDPAGPMFEGADIHKRLSPDDADFVDVLHTYTRSFGLSIGIQMPV
        180       190       200       210       220       230      

     230       240             250        260       270        280 
pF1KB6 GHVDYFVNGGQDQPGCP------TFFYAGYSYLI-CDHMRAVHLYISALENS-CPLMAFP
       ::.: . :::. ::::       .. :.  . .. :.: :::::....: :.  : .:: 
CCDS11 GHIDIYPNGGDFQPGCGLNDVLGSIAYGTITEVVKCEHERAVHLFVDSLVNQDKPSFAFQ
        240       250       260       270       280       290      

             290       300       310       320       330       340 
pF1KB6 CASYKAFLAGRCLDCFNPFLLSCPRIGLVEQGGVKIEPLPKEVKVYLLTTSSAPYCMHHS
       :.. . :  : ::.: .     :  ::     ..:     .. :.:: : .. :. ..: 
CCDS11 CTDSNRFKKGICLSCRKN---RCNSIGY----NAKKMRNKRNSKMYLKTRAGMPFRVYHY
        300       310          320           330       340         

             350       360        370       380       390       400
pF1KB6 LVEFHLKELRNKDTNIEVTFLSSNI-TSSSKITIPKQQRYGKGIIAHATPQCQINQVKFK
        ...:.   .:   .:: ::  .   :.... :.:                         
CCDS11 QMKIHVFSYKNMG-EIEPTFYVTLYGTNADSQTLPLEIVERIEQNATNTFLVYTEEDLGD
     350       360        370       380       390       400        

              410       420       430       440       450          
pF1KB6 FQSSNRVWKKDRTTIIGKFCTALLPVNDREKMVCLPEPVNLQASVTVSCDLKIACV    
                                                                   
CCDS11 LLKIQLTWEGASQSWYNLWKEFRSYLSQPRNPGRELNIRRIRVKSGETQRKLTFCTEDPE
      410       420       430       440       450       460        

>>CCDS7594.1 PNLIP gene_id:5406|Hs108|chr10               (465 aa)
 initn: 475 init1: 218 opt: 467  Z-score: 571.3  bits: 115.0 E(32554): 1.7e-25
Smith-Waterman score: 574; 35.7% identity (66.1% similar) in 280 aa overlap (48-308:50-325)

        20        30        40        50        60         70      
pF1KB6 WLSVGSSGDAPPTPQPKCADFQSANLFEGTDLKVQFLLFVPSNPSCGQLVEG-SSDLQNS
                                     :....:::..  ::.  : : . ::....:
CCDS75 CYERLGCFSDDSPWSGITERPLHILPWSPKDVNTRFLLYTNENPNNFQEVAADSSSISGS
      20        30        40        50        60        70         

         80        90       100       110       120       130      
pF1KB6 GFNATLGTKLIIHGFRVLGTKPSWIDTFIRTLLRATNANVIAVDWIYGSTGVYFSAVKNV
       .:...  :..:::::   : . .:. .  ..:... ..: : :::  ::   : .: .:.
CCDS75 NFKTNRKTRFIIHGFIDKGEE-NWLANVCKNLFKVESVNCICVDWKGGSRTGYTQASQNI
      80        90       100        110       120       130        

        140       150        160       170       180       190     
pF1KB6 IKLSLEISLFLNKLL-VLGVSESSIHIIGVSLGAHVGGMVGQLFGGQLGQITGLDPAGPE
         .. :.. :.. :  ..: : :..:.:: :::::..: .:.  .: .:.::::::: : 
CCDS75 RIVGAEVAYFVEFLQSAFGYSPSNVHVIGHSLGAHAAGEAGRRTNGTIGRITGLDPAEPC
      140       150       160       170       180       190        

         200       210           220         230       240         
pF1KB6 YTRASVEERLDAGDALFVEAIHTD----TDNLGIRIP--VGHVDYFVNGGQDQPGCPT--
       .  .    ::: .:: ::..::::    . :::. .   :::.:.: ::: ..:::    
CCDS75 FQGTPELVRLDPSDAKFVDVIHTDGAPIVPNLGFGMSQVVGHLDFFPNGGVEMPGCKKNI
      200       210       220       230       240       250        

                250       260       270       280       290        
pF1KB6 ---------FFYAGYSYLICDHMRAVHLYISALENSCPLMAFPCASYKAFLAGRCLDCFN
                .. .  ..  :.:.:. . : ... :   . .::::::..: :..:. : .
CCDS75 LSQIVDIDGIWEGTRDFAACNHLRSYKYYTDSIVNPDGFAGFPCASYNVFTANKCFPCPS
      260       270       280       290       300       310        

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CCDS75 -GCPQMGHYADKFAGRTSEEQQKFFLNTGEASNFARWRYGVSITLSGRTATGQIKVALFG
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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