Result of FASTA (ccds) for pF1KB6553
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6553, 371 aa
  1>>>pF1KB6553 371 - 371 aa - 371 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2379+/-0.000652; mu= 17.9477+/- 0.039
 mean_var=131.1997+/-43.660, 0's: 0 Z-trim(112.0): 166  B-trim: 1447 in 2/48
 Lambda= 0.111972
 statistics sampled from 12502 (12814) to 12502 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.73), E-opt: 0.2 (0.394), width:  16
 Scan time:  2.480

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS14735.1 AVPR2 gene_id:554|Hs108|chrX           ( 371) 2516 417.8 7.7e-117
CCDS55539.1 AVPR2 gene_id:554|Hs108|chrX           ( 309) 2076 346.6 1.7e-95
CCDS2570.1 OXTR gene_id:5021|Hs108|chr3            ( 389)  915 159.2 5.7e-39
CCDS8965.1 AVPR1A gene_id:552|Hs108|chr12          ( 418)  784 138.1 1.4e-32
CCDS73015.1 AVPR1B gene_id:553|Hs108|chr1          ( 424)  668 119.3 6.1e-27
CCDS75579.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7        ( 390)  511 93.9 2.5e-19
CCDS5443.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7         ( 377)  507 93.3 3.9e-19
CCDS5444.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7         ( 371)  505 92.9 4.8e-19
CCDS75580.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7        ( 366)  443 82.9 4.9e-16
CCDS3517.1 GNRHR gene_id:2798|Hs108|chr4           ( 328)  376 72.0 8.3e-13


>>CCDS14735.1 AVPR2 gene_id:554|Hs108|chrX                (371 aa)
 initn: 2516 init1: 2516 opt: 2516  Z-score: 2211.1  bits: 417.8 E(32554): 7.7e-117
Smith-Waterman score: 2516; 100.0% identity (100.0% similar) in 371 aa overlap (1-371:1-371)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MLMASTTSAVPGHPSLPSLPSNSSQERPLDTRDPLLARAELALLSIVFVAVALSNGLVLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MLMASTTSAVPGHPSLPSLPSNSSQERPLDTRDPLLARAELALLSIVFVAVALSNGLVLA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 ALARRGRRGHWAPIHVFIGHLCLADLAVALFQVLPQLAWKATDRFRGPDALCRAVKYLQM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ALARRGRRGHWAPIHVFIGHLCLADLAVALFQVLPQLAWKATDRFRGPDALCRAVKYLQM
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 VGMYASSYMILAMTLDRHRAICRPMLAYRHGSGAHWNRPVLVAWAFSLLLSLPQLFIFAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VGMYASSYMILAMTLDRHRAICRPMLAYRHGSGAHWNRPVLVAWAFSLLLSLPQLFIFAQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 RNVEGGSGVTDCWACFAEPWGRRTYVTWIALMVFVAPTLGIAACQVLIFREIHASLVPGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RNVEGGSGVTDCWACFAEPWGRRTYVTWIALMVFVAPTLGIAACQVLIFREIHASLVPGP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 SERPGGRRRGRRTGSPGEGAHVSAAVAKTVRMTLVIVVVYVLCWAPFFLVQLWAAWDPEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SERPGGRRRGRRTGSPGEGAHVSAAVAKTVRMTLVIVVVYVLCWAPFFLVQLWAAWDPEA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 PLEGAPFVLLMLLASLNSCTNPWIYASFSSSVSSELRSLLCCARGRTPPSLGPQDESCTT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PLEGAPFVLLMLLASLNSCTNPWIYASFSSSVSSELRSLLCCARGRTPPSLGPQDESCTT
              310       320       330       340       350       360

              370 
pF1KB6 ASSSLAKDTSS
       :::::::::::
CCDS14 ASSSLAKDTSS
              370 

>>CCDS55539.1 AVPR2 gene_id:554|Hs108|chrX                (309 aa)
 initn: 2076 init1: 2076 opt: 2076  Z-score: 1827.8  bits: 346.6 E(32554): 1.7e-95
Smith-Waterman score: 2076; 100.0% identity (100.0% similar) in 304 aa overlap (1-304:1-304)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MLMASTTSAVPGHPSLPSLPSNSSQERPLDTRDPLLARAELALLSIVFVAVALSNGLVLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MLMASTTSAVPGHPSLPSLPSNSSQERPLDTRDPLLARAELALLSIVFVAVALSNGLVLA
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 ALARRGRRGHWAPIHVFIGHLCLADLAVALFQVLPQLAWKATDRFRGPDALCRAVKYLQM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ALARRGRRGHWAPIHVFIGHLCLADLAVALFQVLPQLAWKATDRFRGPDALCRAVKYLQM
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 VGMYASSYMILAMTLDRHRAICRPMLAYRHGSGAHWNRPVLVAWAFSLLLSLPQLFIFAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VGMYASSYMILAMTLDRHRAICRPMLAYRHGSGAHWNRPVLVAWAFSLLLSLPQLFIFAQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 RNVEGGSGVTDCWACFAEPWGRRTYVTWIALMVFVAPTLGIAACQVLIFREIHASLVPGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RNVEGGSGVTDCWACFAEPWGRRTYVTWIALMVFVAPTLGIAACQVLIFREIHASLVPGP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 SERPGGRRRGRRTGSPGEGAHVSAAVAKTVRMTLVIVVVYVLCWAPFFLVQLWAAWDPEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SERPGGRRRGRRTGSPGEGAHVSAAVAKTVRMTLVIVVVYVLCWAPFFLVQLWAAWDPEA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 PLEGAPFVLLMLLASLNSCTNPWIYASFSSSVSSELRSLLCCARGRTPPSLGPQDESCTT
       ::::                                                        
CCDS55 PLEGGCSRG                                                   
                                                                   

>>CCDS2570.1 OXTR gene_id:5021|Hs108|chr3                 (389 aa)
 initn: 807 init1: 331 opt: 915  Z-score: 813.2  bits: 159.2 E(32554): 5.7e-39
Smith-Waterman score: 923; 42.3% identity (67.0% similar) in 388 aa overlap (4-371:13-379)

                        10        20        30        40        50 
pF1KB6          MLMASTTSAVPGHPSLPSLPSNSSQERPLDTRDPLLARAELALLSIVFVAV
                   :...::.:     :.  .: .   :   :.  :::.:.:.: .... .
CCDS25 MEGALAANWSAEAANASAAP-----PGAEGNRTAGPP--RRNEALARVEVAVLCLILLLA
               10        20             30          40        50   

              60        70        80        90       100       110 
pF1KB6 ALSNGLVLAALARRGRRGHWAPIHVFIGHLCLADLAVALFQVLPQLAWKATDRFRGPDAL
         .:. :: :: :  :. : . .  :. :: .:::.::.::::::: :  : :: ::: :
CCDS25 LSGNACVLLAL-RTTRQKH-SRLFFFMKHLSIADLVVAVFQVLPQLLWDITFRFYGPDLL
            60         70         80        90       100       110 

             120       130       140       150        160       170
pF1KB6 CRAVKYLQMVGMYASSYMILAMTLDRHRAICRPMLAYRHGSGAHWNR-PVLVAWAFSLLL
       :: :::::.:::.::.:..: :.:::  :::.:. . :. .    .:  ::..:   :. 
CCDS25 CRLVKYLQVVGMFASTYLLLLMSLDRCLAICQPLRSLRRRT----DRLAVLATWLGCLVA
             120       130       140       150           160       

              180       190       200       210       220       230
pF1KB6 SLPQLFIFAQRNVEGGSGVTDCWACFAEPWGRRTYVTWIALMVFVAPTLGIAACQVLIFR
       : ::. ::. :.:  ..:: :::: : .::: ..:.:::.: :...:.. .:::  ::  
CCDS25 SAPQVHIFSLREV--ADGVFDCWAVFIQPWGPKAYITWITLAVYIVPVIVLAACYGLISF
       170       180         190       200       210       220     

                   240              250       260       270        
pF1KB6 EIHASL-----VPGPSERP-------GGRRRGRRTGSPGEGAHVSAAVAKTVRMTLVIVV
       .:  .:     . . .: :       :::    :..:      .: :  .::.::..::.
CCDS25 KIWQNLRLKTAAAAAAEAPEGAAAGDGGRVALARVSSV---KLISKAKIRTVKMTFIIVL
         230       240       250       260          270       280  

      280       290       300       310       320       330        
pF1KB6 VYVLCWAPFFLVQLWAAWDPEAPLEGAPFVLLMLLASLNSCTNPWIYASFSSSVSSEL-R
       ....::.:::.::.:..:: .:: :.. :...::::::::: :::::  :.. .  :: .
CCDS25 AFIVCWTPFFFVQMWSVWDANAPKEASAFIIVMLLASLNSCCNPWIYMLFTGHLFHELVQ
            290       300       310       320       330       340  

       340           350       360         370           
pF1KB6 SLLCCA----RGRTPPSLGPQDESCTTASSS--LAKDTSS          
        .:::.    .::    ::  . :  . :::  :.. .::          
CCDS25 RFLCCSASYLKGRR---LGETSASKKSNSSSFVLSHRSSSQRSCSQPSTA
            350          360       370       380         

>>CCDS8965.1 AVPR1A gene_id:552|Hs108|chr12               (418 aa)
 initn: 820 init1: 336 opt: 784  Z-score: 698.5  bits: 138.1 E(32554): 1.4e-32
Smith-Waterman score: 882; 42.2% identity (72.6% similar) in 329 aa overlap (28-342:42-366)

                  10        20        30        40        50       
pF1KB6    MLMASTTSAVPGHPSLPSLPSNSSQERPLDTRDPLLARAELALLSIVFVAVALSNGL
                                     : :.:.  ::. :.:.:...:....:.:. 
CCDS89 SGNSSPWWPLATGAGNTSREAEALGEGNGPPRDVRNEELAKLEIAVLAVTFAVAVLGNSS
              20        30        40        50        60        70 

        60        70        80        90       100       110       
pF1KB6 VLAALARRGRRGHWAPIHVFIGHLCLADLAVALFQVLPQLAWKATDRFRGPDALCRAVKY
       :: :: :  :.   . .:.:: :: :::::::.::::::. :  : :::::: :::.::.
CCDS89 VLLALHRTPRKT--SRMHLFIRHLSLADLAVAFFQVLPQMCWDITYRFRGPDWLCRVVKH
              80          90       100       110       120         

       120       130       140       150       160        170      
pF1KB6 LQMVGMYASSYMILAMTLDRHRAICRPMLAYRHGSGAHWNRPVLVA-WAFSLLLSLPQLF
       ::. ::.::.::...:: ::. :.:.:. . ..   :. .: ...: :..:..:: :: :
CCDS89 LQVFGMFASAYMLVVMTADRYIAVCHPLKTLQQP--ARRSRLMIAAAWVLSFVLSTPQYF
     130       140       150       160         170       180       

        180       190       200       210       220       230      
pF1KB6 IFAQRNVEGGSGVTDCWACFAEPWGRRTYVTWIALMVFVAPTLGIAACQVLIFREIHASL
       .:.. .:.. . . :::: : .::: :.::::..  .::::.. ...:  .:  .:  ..
CCDS89 VFSMIEVNNVTKARDCWATFIQPWGSRAYVTWMTGGIFVAPVVILGTCYGFICYNIWCNV
       190       200       210       220       230       240       

        240         250            260         270       280       
pF1KB6 VPGPSERP--GGRRRGR--RTG---SPGEGA--HVSAAVAKTVRMTLVIVVVYVLCWAPF
           . :   :... :   . :   .:  ..   .: :  .::.::.:::..:..:::::
CCDS89 RGKTASRQSKGAEQAGVAFQKGFLLAPCVSSVKSISRAKIRTVKMTFVIVTAYIVCWAPF
       250       260       270       280       290       300       

       290       300          310       320       330        340   
pF1KB6 FLVQLWAAWDPEA---PLEGAPFVLLMLLASLNSCTNPWIYASFSSSVSSE-LRSLLCCA
       :..:.:..::: .     :.  ...  ::.::::: :::::  ::. . .. ..:. :: 
CCDS89 FIIQMWSVWDPMSVWTESENPTITITALLGSLNSCCNPWIYMFFSGHLLQDCVQSFPCCQ
       310       320       330       340       350       360       

           350       360       370                        
pF1KB6 RGRTPPSLGPQDESCTTASSSLAKDTSS                       
                                                          
CCDS89 NMKEKFNKEDTDSMSRRQTFYSNNRSPTNSTGMWKDSPKSSKSIKFIPVST
       370       380       390       400       410        

>>CCDS73015.1 AVPR1B gene_id:553|Hs108|chr1               (424 aa)
 initn: 931 init1: 352 opt: 668  Z-score: 597.1  bits: 119.3 E(32554): 6.1e-27
Smith-Waterman score: 933; 44.4% identity (67.9% similar) in 358 aa overlap (13-348:10-361)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MLMASTTSAVPGHPSLPSLPSNSSQERPLDTRDPLLARAELALLSIVFVAVALSNGLVLA
                   .:.  .  :  .   :   ::  ::..:...:. :.: .. .:  :: 
CCDS73    MDSGPLWDANPTPRGTLSAPNATTPWLGRDEELAKVEIGVLATVLVLATGGNLAVLL
                  10        20        30        40        50       

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 ALARRGRRGHWAPIHVFIGHLCLADLAVALFQVLPQLAWKATDRFRGPDALCRAVKYLQM
       .:.. ::.   . .:.:. :: :.::::::::::::: :  : ::.::: :::::::::.
CCDS73 TLGQLGRKR--SRMHLFVLHLALTDLAVALFQVLPQLLWDITYRFQGPDLLCRAVKYLQV
        60          70        80        90       100       110     

              130       140       150       160         170        
pF1KB6 VGMYASSYMILAMTLDRHRAICRPMLAYRHGSGAHWNRPVLVA--WAFSLLLSLPQLFIF
       ..:.::.::.:::::::. :.:.:. . .. . . .   .:.:  : .. ..::::.:::
CCDS73 LSMFASTYMLLAMTLDRYLAVCHPLRSLQQPGQSTY---LLIAAPWLLAAIFSLPQVFIF
         120       130       140       150          160       170  

      180       190       200       210       220       230        
pF1KB6 AQRNVEGGSGVTDCWACFAEPWGRRTYVTWIALMVFVAPTLGIAACQVLIFREIHASL-V
       . :.:  :::: :::: :. ::: :.:.:: .: .:: :.  ..::  :: .::  .: :
CCDS73 SLREVIQGSGVLDCWADFGFPWGPRAYLTWTTLAIFVLPVTMLTACYSLICHEICKNLKV
            180       190       200       210       220       230  

       240          250                260          270       280  
pF1KB6 PGPSERPGG---RRRGRRT---------GSPGEGAHV---SAAVAKTVRMTLVIVVVYVL
          . : ::   :   : .         : :.. . .   : :  .::.::.:::..:. 
CCDS73 KTQAWRVGGGGWRTWDRPSPSTLAATTRGLPSRVSSINTISRAKIRTVKMTFVIVLAYIA
            240       250       260       270       280       290  

            290       300          310       320       330         
pF1KB6 CWAPFFLVQLWAAWDPEAPLEGAP---FVLLMLLASLNSCTNPWIYASFSSSV-SSELRS
       :::::: ::.:..:: .:: : .    :.. :::..:::: ::::: .:.: .    :: 
CCDS73 CWAPFFSVQMWSVWDKNAPDEDSTNVAFTISMLLGNLNSCCNPWIYMGFNSHLLPRPLRH
            300       310       320       330       340       350  

      340       350       360       370                            
pF1KB6 LLCCARGRTPPSLGPQDESCTTASSSLAKDTSS                           
       : ::. :  :                                                  
CCDS73 LACCG-GPQPRMRRRLSDGSLSSRHTTLLTRSSCPATLSLSLSLTLSGRPRPEESPRDLE
             360       370       380       390       400       410 

>>CCDS75579.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7             (390 aa)
 initn: 341 init1: 189 opt: 511  Z-score: 460.4  bits: 93.9 E(32554): 2.5e-19
Smith-Waterman score: 511; 28.7% identity (61.7% similar) in 345 aa overlap (40-369:52-380)

      10        20        30        40        50        60         
pF1KB6 VPGHPSLPSLPSNSSQERPLDTRDPLLARAELALLSIVFVAVALSNGLVLAALARRGRRG
                                     .:  : ..:: . ..:..:: .  :: ...
CCDS75 SPVACTETVTFTEVVEGKEWGSFYYSFKTEQLITLWVLFVFTIVGNSVVLFSTWRRKKKS
              30        40        50        60        70        80 

      70        80        90       100       110       120         
pF1KB6 HWAPIHVFIGHLCLADLAVALFQVLPQLAWKATDRFRGPDALCRAVKYLQMVGMYASSYM
       .   .  :. .: ..:  ..: ..: .. :. :  : .:: .::.:.:::.: .:::.:.
CCDS75 R---MTFFVTQLAITDSFTGLVNILTDINWRFTGDFTAPDLVCRVVRYLQVVLLYASTYV
                 90       100       110       120       130        

     130       140       150        160       170       180        
pF1KB6 ILAMTLDRHRAICRPMLAYRHGSGAHWNRP-VLVAWAFSLLLSLPQLFIFAQRNVEGGSG
       ......::..::  ::   .  .: .  :  ...::..:.:.:.: :.::..:..  ..:
CCDS75 LVSLSIDRYHAIVYPM---KFLQGEKQARVLIVIAWSLSFLFSIPTLIIFGKRTL--SNG
      140       150          160       170       180       190     

      190       200       210       220       230             240  
pF1KB6 VTDCWACFAEPWGRRTYVTWIALMVFVAPTLGIAACQVLIFREI------HASLVPGPSE
        ..::: . .      :.: .:..:.  :   :.    ...: :      . ... . :.
CCDS75 EVQCWALWPDDSYWTPYMTIVAFLVYFIPLTIISIMYGIVIRTIWIKSKTYETVISNCSD
           200       210       220       230       240       250   

            250       260       270       280       290         300
pF1KB6 RPGGRRRGRRTGSPGEGAHVSAAVAKTVRMTLVIVVVYVLCWAPFFLVQLWAAWD--PEA
              :.  .: ..:  .: :  :.......:..... ::.:.:: ..   ..  :..
CCDS75 -------GKLCSSYNRGL-ISKAKIKAIKYSIIIILAFICCWSPYFLFDILDNFNLLPDT
                  260        270       280       290       300     

              310       320       330            340        350    
pF1KB6 PLEGAPFVLLMLLASLNSCTNPWIYASFSSSVSSELRS-----LLCCARGRTPP-SLGPQ
         .    :... : .:::  :: ::  ::::.:   :.     :: :  .      :  .
CCDS75 QERFYASVIIQNLPALNSAINPLIYCVFSSSISFPCRANSSVYLLACDVSVLWALVLTSE
         310       320       330       340       350       360     

          360       370         
pF1KB6 DESCTTASSSLAKDTSS        
        ::: .   . :: :          
CCDS75 KESCESWRRKGAKITGFQNDVPGEN
         370       380       390

>>CCDS5443.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7              (377 aa)
 initn: 352 init1: 189 opt: 507  Z-score: 457.1  bits: 93.3 E(32554): 3.9e-19
Smith-Waterman score: 507; 28.4% identity (63.0% similar) in 327 aa overlap (40-357:52-362)

      10        20        30        40        50        60         
pF1KB6 VPGHPSLPSLPSNSSQERPLDTRDPLLARAELALLSIVFVAVALSNGLVLAALARRGRRG
                                     .:  : ..:: . ..:..:: .  :: ...
CCDS54 SPVACTETVTFTEVVEGKEWGSFYYSFKTEQLITLWVLFVFTIVGNSVVLFSTWRRKKKS
              30        40        50        60        70        80 

      70        80        90       100       110       120         
pF1KB6 HWAPIHVFIGHLCLADLAVALFQVLPQLAWKATDRFRGPDALCRAVKYLQMVGMYASSYM
       .   .  :. .: ..:  ..: ..: .. :. :  : .:: .::.:.:::.: .:::.:.
CCDS54 R---MTFFVTQLAITDSFTGLVNILTDINWRFTGDFTAPDLVCRVVRYLQVVLLYASTYV
                 90       100       110       120       130        

     130       140       150        160       170       180        
pF1KB6 ILAMTLDRHRAICRPMLAYRHGSGAHWNRP-VLVAWAFSLLLSLPQLFIFAQRNVEGGSG
       ......::..::  ::   .  .: .  :  ...::..:.:.:.: :.::..:..  ..:
CCDS54 LVSLSIDRYHAIVYPM---KFLQGEKQARVLIVIAWSLSFLFSIPTLIIFGKRTL--SNG
      140       150          160       170       180       190     

      190       200       210       220       230             240  
pF1KB6 VTDCWACFAEPWGRRTYVTWIALMVFVAPTLGIAACQVLIFREI------HASLVPGPSE
        ..::: . .      :.: .:..:.  :   :.    ...: :      . ... . :.
CCDS54 EVQCWALWPDDSYWTPYMTIVAFLVYFIPLTIISIMYGIVIRTIWIKSKTYETVISNCSD
           200       210       220       230       240       250   

            250       260       270       280       290         300
pF1KB6 RPGGRRRGRRTGSPGEGAHVSAAVAKTVRMTLVIVVVYVLCWAPFFLVQLWAAWD--PEA
              :.  .: ..:  .: :  :.......:..... ::.:.:: ..   ..  :..
CCDS54 -------GKLCSSYNRGL-ISKAKIKAIKYSIIIILAFICCWSPYFLFDILDNFNLLPDT
                  260        270       280       290       300     

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 PLEGAPFVLLMLLASLNSCTNPWIYASFSSSVSSELRSLLCCARGRTPPSLGPQDESCTT
         .    :... : .:::  :: ::  ::::.:   : .      ..   : :: :.   
CCDS54 QERFYASVIIQNLPALNSAINPLIYCVFSSSISFPCRVIRLRQLQEAALMLCPQRENWKG
         310       320       330       340       350       360     

              370  
pF1KB6 ASSSLAKDTSS 
                   
CCDS54 TWPGVPSWALPR
         370       

>>CCDS5444.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7              (371 aa)
 initn: 341 init1: 189 opt: 505  Z-score: 455.4  bits: 92.9 E(32554): 4.8e-19
Smith-Waterman score: 505; 29.0% identity (64.5% similar) in 307 aa overlap (40-337:52-342)

      10        20        30        40        50        60         
pF1KB6 VPGHPSLPSLPSNSSQERPLDTRDPLLARAELALLSIVFVAVALSNGLVLAALARRGRRG
                                     .:  : ..:: . ..:..:: .  :: ...
CCDS54 SPVACTETVTFTEVVEGKEWGSFYYSFKTEQLITLWVLFVFTIVGNSVVLFSTWRRKKKS
              30        40        50        60        70        80 

      70        80        90       100       110       120         
pF1KB6 HWAPIHVFIGHLCLADLAVALFQVLPQLAWKATDRFRGPDALCRAVKYLQMVGMYASSYM
       .   .  :. .: ..:  ..: ..: .. :. :  : .:: .::.:.:::.: .:::.:.
CCDS54 R---MTFFVTQLAITDSFTGLVNILTDINWRFTGDFTAPDLVCRVVRYLQVVLLYASTYV
                 90       100       110       120       130        

     130       140       150        160       170       180        
pF1KB6 ILAMTLDRHRAICRPMLAYRHGSGAHWNRP-VLVAWAFSLLLSLPQLFIFAQRNVEGGSG
       ......::..::  ::   .  .: .  :  ...::..:.:.:.: :.::..:..  ..:
CCDS54 LVSLSIDRYHAIVYPM---KFLQGEKQARVLIVIAWSLSFLFSIPTLIIFGKRTL--SNG
      140       150          160       170       180       190     

      190       200       210       220       230             240  
pF1KB6 VTDCWACFAEPWGRRTYVTWIALMVFVAPTLGIAACQVLIFREI------HASLVPGPSE
        ..::: . .      :.: .:..:.  :   :.    ...: :      . ... . :.
CCDS54 EVQCWALWPDDSYWTPYMTIVAFLVYFIPLTIISIMYGIVIRTIWIKSKTYETVISNCSD
           200       210       220       230       240       250   

            250       260       270       280       290         300
pF1KB6 RPGGRRRGRRTGSPGEGAHVSAAVAKTVRMTLVIVVVYVLCWAPFFLVQLWAAWD--PEA
              :.  .: ..:  .: :  :.......:..... ::.:.:: ..   ..  :..
CCDS54 -------GKLCSSYNRGL-ISKAKIKAIKYSIIIILAFICCWSPYFLFDILDNFNLLPDT
                  260        270       280       290       300     

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 PLEGAPFVLLMLLASLNSCTNPWIYASFSSSVSSELRSLLCCARGRTPPSLGPQDESCTT
         .    :... : .:::  :: ::  ::::.:   :                       
CCDS54 QERFYASVIIQNLPALNSAINPLIYCVFSSSISFPCREQRSQDSRMTFRERTERHEMQIL
         310       320       330       340       350       360     

              370 
pF1KB6 ASSSLAKDTSS
                  
CCDS54 SKPEFI     
         370      

>>CCDS75580.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7             (366 aa)
 initn: 341 init1: 178 opt: 443  Z-score: 401.4  bits: 82.9 E(32554): 4.9e-16
Smith-Waterman score: 469; 27.8% identity (60.9% similar) in 327 aa overlap (40-357:52-351)

      10        20        30        40        50        60         
pF1KB6 VPGHPSLPSLPSNSSQERPLDTRDPLLARAELALLSIVFVAVALSNGLVLAALARRGRRG
                                     .:  : ..:: . ..:..:: .  :: ...
CCDS75 SPVACTETVTFTEVVEGKEWGSFYYSFKTEQLITLWVLFVFTIVGNSVVLFSTWRRKKKS
              30        40        50        60        70        80 

      70        80        90       100       110       120         
pF1KB6 HWAPIHVFIGHLCLADLAVALFQVLPQLAWKATDRFRGPDALCRAVKYLQMVGMYASSYM
       .   .  :. .: ..:.            :. :  : .:: .::.:.:::.: .:::.:.
CCDS75 R---MTFFVTQLAITDIN-----------WRFTGDFTAPDLVCRVVRYLQVVLLYASTYV
                 90                  100       110       120       

     130       140       150        160       170       180        
pF1KB6 ILAMTLDRHRAICRPMLAYRHGSGAHWNRP-VLVAWAFSLLLSLPQLFIFAQRNVEGGSG
       ......::..::  ::   .  .: .  :  ...::..:.:.:.: :.::..:..  ..:
CCDS75 LVSLSIDRYHAIVYPM---KFLQGEKQARVLIVIAWSLSFLFSIPTLIIFGKRTL--SNG
       130       140          150       160       170         180  

      190       200       210       220       230             240  
pF1KB6 VTDCWACFAEPWGRRTYVTWIALMVFVAPTLGIAACQVLIFREI------HASLVPGPSE
        ..::: . .      :.: .:..:.  :   :.    ...: :      . ... . :.
CCDS75 EVQCWALWPDDSYWTPYMTIVAFLVYFIPLTIISIMYGIVIRTIWIKSKTYETVISNCSD
            190       200       210       220       230       240  

            250       260       270       280       290         300
pF1KB6 RPGGRRRGRRTGSPGEGAHVSAAVAKTVRMTLVIVVVYVLCWAPFFLVQLWAAWD--PEA
              :.  .: ..:  .: :  :.......:..... ::.:.:: ..   ..  :..
CCDS75 -------GKLCSSYNRGL-ISKAKIKAIKYSIIIILAFICCWSPYFLFDILDNFNLLPDT
                   250        260       270       280       290    

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 PLEGAPFVLLMLLASLNSCTNPWIYASFSSSVSSELRSLLCCARGRTPPSLGPQDESCTT
         .    :... : .:::  :: ::  ::::.:   : .      ..   : :: :.   
CCDS75 QERFYASVIIQNLPALNSAINPLIYCVFSSSISFPCRVIRLRQLQEAALMLCPQRENWKG
          300       310       320       330       340       350    

              370  
pF1KB6 ASSSLAKDTSS 
                   
CCDS75 TWPGVPSWALPR
          360      

>>CCDS3517.1 GNRHR gene_id:2798|Hs108|chr4                (328 aa)
 initn: 361 init1: 152 opt: 376  Z-score: 343.4  bits: 72.0 E(32554): 8.3e-13
Smith-Waterman score: 376; 28.1% identity (60.2% similar) in 299 aa overlap (41-329:45-327)

               20        30        40        50        60        70
pF1KB6 PGHPSLPSLPSNSSQERPLDTRDPLLARAELALLSIVFVAVALSNGLVLAALARRGRRGH
                                     : ::: .: :  :   : :   ... ..:.
CCDS35 SAINNSIPLMQGNLPTLTLSGKIRVTVTFFLFLLSATFNASFL---LKLQKWTQKKEKGK
           20        30        40        50           60        70 

                80        90        100       110       120        
pF1KB6 -WAPIHVFIGHLCLADLAVALFQVLP-QLAWKATDRFRGPDALCRAVKYLQMVGMYASSY
         . ..... :: ::.:  .:. :.: .  :. : .. . . ::....::.. .::: ..
CCDS35 KLSRMKLLLKHLTLANLLETLI-VMPLDGMWNITVQWYAGELLCKVLSYLKLFSMYAPAF
              80        90        100       110       120       130

      130       140       150       160       170       180        
pF1KB6 MILAMTLDRHRAICRPMLAYRHGSGAHWNRPVLVAWAFSLLLSLPQLFIFAQRNVEGGSG
       :.....:::  :: :: :: . .: .  .  : .:: .: ... :::.:: . ..  .::
CCDS35 MMVVISLDRSLAITRP-LALKSNSKVGQSM-VGLAWILSSVFAGPQLYIFRMIHLADSSG
              140        150        160       170       180        

      190             200       210       220       230       240  
pF1KB6 VTDCWA-C-----FAEPWGRRTYVTWIALMVFVAPTLGIAACQVLIFREIHASLVPGPSE
        :  .. :     :.. : .  :  .    .:. : . .  :.. :.  .   :   : :
CCDS35 QTKVFSQCVTHCSFSQWWHQAFYNFFTFSCLFIIPLFIMLICNAKIIFTLTRVLHQDPHE
      190       200       210       220       230       240        

            250       260       270       280       290       300  
pF1KB6 RPGGRRRGRRTGSPGEGAHVSAAVAKTVRMTLVIVVVYVLCWAPFFLVQLWAAWDPEAPL
          .. ..          ..  :  ::..::..... ...::.:.... .:  .:::   
CCDS35 LQLNQSKN----------NIPRARLKTLKMTVAFATSFTVCWTPYYVLGIWYWFDPEMLN
      250                 260       270       280       290        

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 EGAPFV--LLMLLASLNSCTNPWIYASFSSSVSSELRSLLCCARGRTPPSLGPQDESCTT
       . .  :  ...:.: :: : .: ::. ::                               
CCDS35 RLSDPVNHFFFLFAFLNPCFDPLIYGYFSL                              
      300       310       320                                      




371 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sat Nov  5 11:27:12 2016 done: Sat Nov  5 11:27:13 2016
 Total Scan time:  2.480 Total Display time:  0.030

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com