Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6117
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6117, 621 aa
1>>>pF1KB6117 621 - 621 aa - 621 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9011+/-0.000831; mu= 7.9810+/- 0.050
mean_var=134.7769+/-27.866, 0's: 0 Z-trim(112.2): 19 B-trim: 770 in 2/51
Lambda= 0.110476
statistics sampled from 13006 (13020) to 13006 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.734), E-opt: 0.2 (0.4), width: 16
Scan time: 2.980
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32824.1 PIAS2 gene_id:9063|Hs108|chr18 ( 621) 4113 666.9 2.2e-191
CCDS32825.1 PIAS2 gene_id:9063|Hs108|chr18 ( 572) 3670 596.3 3.7e-170
CCDS45290.1 PIAS1 gene_id:8554|Hs108|chr15 ( 651) 1842 304.9 2.1e-82
CCDS81902.1 PIAS1 gene_id:8554|Hs108|chr15 ( 653) 1842 304.9 2.1e-82
CCDS72866.1 PIAS3 gene_id:10401|Hs108|chr1 ( 628) 1813 300.3 5e-81
CCDS12118.1 PIAS4 gene_id:51588|Hs108|chr19 ( 510) 1178 199.1 1.2e-50
>>CCDS32824.1 PIAS2 gene_id:9063|Hs108|chr18 (621 aa)
initn: 4113 init1: 4113 opt: 4113 Z-score: 3549.3 bits: 666.9 E(32554): 2.2e-191
Smith-Waterman score: 4113; 100.0% identity (100.0% similar) in 621 aa overlap (1-621:1-621)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MADFEELRNMVSSFRVSELQVLLGFAGRNKSGRKHDLLMRALHLLKSGCSPAVQIKIREL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MADFEELRNMVSSFRVSELQVLLGFAGRNKSGRKHDLLMRALHLLKSGCSPAVQIKIREL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 YRRRYPRTLEGLSDLSTIKSSVFSLDGGSSPVEPDLAVAGIHSLPSTSVTPHSPSSPVGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YRRRYPRTLEGLSDLSTIKSSVFSLDGGSSPVEPDLAVAGIHSLPSTSVTPHSPSSPVGS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 VLLQDTKPTFEMQQPSPPIPPVHPDVQLKNLPFYDVLDVLIKPTSLVQSSIQRFQEKFFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VLLQDTKPTFEMQQPSPPIPPVHPDVQLKNLPFYDVLDVLIKPTSLVQSSIQRFQEKFFI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 FALTPQQVREICISRDFLPGGRRDYTVQVQLRLCLAETSCPQEDNYPNSLCIKVNGKLFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FALTPQQVREICISRDFLPGGRRDYTVQVQLRLCLAETSCPQEDNYPNSLCIKVNGKLFP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 LPGYAPPPKNGIEQKRPGRPLNITSLVRLSSAVPNQISISWASEIGKNYSMSVYLVRQLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LPGYAPPPKNGIEQKRPGRPLNITSLVRLSSAVPNQISISWASEIGKNYSMSVYLVRQLT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 SAMLLQRLKMKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLMCPLGKMRLTIPCRAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SAMLLQRLKMKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLMCPLGKMRLTIPCRAV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 TCTHLQCFDAALYLQMNEKKPTWICPVCDKKAAYESLILDGLFMEILNDCSDVDEIKFQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TCTHLQCFDAALYLQMNEKKPTWICPVCDKKAAYESLILDGLFMEILNDCSDVDEIKFQE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 DGSWCPMRPKKEAMKVSSQPCTKIESSSVLSKPCSVTVASEASKKKVDVIDLTIESSSDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DGSWCPMRPKKEAMKVSSQPCTKIESSSVLSKPCSVTVASEASKKKVDVIDLTIESSSDE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 EEDPPAKRKCIFMSETQSSPTKGVLMYQPSSVRVPSVTSVDPAAIPPSLTDYSVPFHHTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EEDPPAKRKCIFMSETQSSPTKGVLMYQPSSVRVPSVTSVDPAAIPPSLTDYSVPFHHTP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 ISSMSSDLPGLDFLSLIPVDPQYCPPMFLDSLTSPLTASSTSVTTTSSHESSTHVSSSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ISSMSSDLPGLDFLSLIPVDPQYCPPMFLDSLTSPLTASSTSVTTTSSHESSTHVSSSSS
550 560 570 580 590 600
610 620
pF1KB6 RSETGVITSSGSNIPDIISLD
:::::::::::::::::::::
CCDS32 RSETGVITSSGSNIPDIISLD
610 620
>>CCDS32825.1 PIAS2 gene_id:9063|Hs108|chr18 (572 aa)
initn: 3670 init1: 3670 opt: 3670 Z-score: 3168.3 bits: 596.3 E(32554): 3.7e-170
Smith-Waterman score: 3670; 100.0% identity (100.0% similar) in 550 aa overlap (1-550:1-550)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MADFEELRNMVSSFRVSELQVLLGFAGRNKSGRKHDLLMRALHLLKSGCSPAVQIKIREL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MADFEELRNMVSSFRVSELQVLLGFAGRNKSGRKHDLLMRALHLLKSGCSPAVQIKIREL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 YRRRYPRTLEGLSDLSTIKSSVFSLDGGSSPVEPDLAVAGIHSLPSTSVTPHSPSSPVGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YRRRYPRTLEGLSDLSTIKSSVFSLDGGSSPVEPDLAVAGIHSLPSTSVTPHSPSSPVGS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 VLLQDTKPTFEMQQPSPPIPPVHPDVQLKNLPFYDVLDVLIKPTSLVQSSIQRFQEKFFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VLLQDTKPTFEMQQPSPPIPPVHPDVQLKNLPFYDVLDVLIKPTSLVQSSIQRFQEKFFI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 FALTPQQVREICISRDFLPGGRRDYTVQVQLRLCLAETSCPQEDNYPNSLCIKVNGKLFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FALTPQQVREICISRDFLPGGRRDYTVQVQLRLCLAETSCPQEDNYPNSLCIKVNGKLFP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 LPGYAPPPKNGIEQKRPGRPLNITSLVRLSSAVPNQISISWASEIGKNYSMSVYLVRQLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LPGYAPPPKNGIEQKRPGRPLNITSLVRLSSAVPNQISISWASEIGKNYSMSVYLVRQLT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 SAMLLQRLKMKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLMCPLGKMRLTIPCRAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SAMLLQRLKMKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLMCPLGKMRLTIPCRAV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 TCTHLQCFDAALYLQMNEKKPTWICPVCDKKAAYESLILDGLFMEILNDCSDVDEIKFQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TCTHLQCFDAALYLQMNEKKPTWICPVCDKKAAYESLILDGLFMEILNDCSDVDEIKFQE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 DGSWCPMRPKKEAMKVSSQPCTKIESSSVLSKPCSVTVASEASKKKVDVIDLTIESSSDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DGSWCPMRPKKEAMKVSSQPCTKIESSSVLSKPCSVTVASEASKKKVDVIDLTIESSSDE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 EEDPPAKRKCIFMSETQSSPTKGVLMYQPSSVRVPSVTSVDPAAIPPSLTDYSVPFHHTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EEDPPAKRKCIFMSETQSSPTKGVLMYQPSSVRVPSVTSVDPAAIPPSLTDYSVPFHHTP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 ISSMSSDLPGLDFLSLIPVDPQYCPPMFLDSLTSPLTASSTSVTTTSSHESSTHVSSSSS
::::::::::
CCDS32 ISSMSSDLPGEQRRNDINNELKLGTSSDTVQQ
550 560 570
>>CCDS45290.1 PIAS1 gene_id:8554|Hs108|chr15 (651 aa)
initn: 2150 init1: 1304 opt: 1842 Z-score: 1592.8 bits: 304.9 E(32554): 2.1e-82
Smith-Waterman score: 2179; 57.1% identity (75.6% similar) in 627 aa overlap (1-613:1-612)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MADFEELRNMVSSFRVSELQVLLGFAGRNKSGRKHDLLMRALHLLKSGCSPAVQIKIREL
::: ::..:: :.::::::::::.::::: ::::.:: .::::::.:::::::.::.::
CCDS45 MADSAELKQMVMSLRVSELQVLLGYAGRNKHGRKHELLTKALHLLKAGCSPAVQMKIKEL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 YRRRYPRTLEGLSDLSTIKSSVFSLDGGSSPVEPDLAVAGIHSLPSTSVTPHSPSSPVGS
::::.:. . .::: .: : ::. :. . ..:. . : :::.
CCDS45 YRRRFPQKIMTPADLSI--PNVHS-----SPMPATLSPS---TIPQLTYDGHPASSPLLP
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 VLLQDTKPTFEMQQPSPPIPPVHPDVQLKNLPFYDVLDVLIKPTSLVQSSIQRFQEKFFI
: : : .:. . . . :::::..:..:::::.:: :::::::.... :::.: :
CCDS45 VSLLGPKHELELPHLTSALHPVHPDIKLQKLPFYDLLDELIKPTSLASDNSQRFRETCFA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 FALTPQQVREICISRDFLPGGRRDYTVQVQLRLCLAETSCPQEDNYPNSLCIKVNGKLFP
::::::::..: : : . : . :.:::::::.::.::::::::..: .::.::: :
CCDS45 FALTPQQVQQISSSMD-ISGTKCDFTVQVQLRFCLSETSCPQEDHFPPNLCVKVNTKPCS
180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 LPGYAPPPKNGIEQKRPGRPLNITSLVRLSSAVPNQISISWASEIGKNYSMSVYLVRQLT
:::: :: :::.: :::.::.:::::::::..::: : .::..:::.::::.::::.::.
CCDS45 LPGYLPPTKNGVEPKRPSRPINITSLVRLSTTVPNTIVVSWTAEIGRNYSMAVYLVKQLS
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 SAMLLQRLKMKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLMCPLGKMRLTIPCRAV
:..:::::. ::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::.
CCDS45 STVLLQRLRAKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLLCPLGKMRLTIPCRAL
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 TCTHLQCFDAALYLQMNEKKPTWICPVCDKKAAYESLILDGLFMEILNDCSDVDEIKFQE
::.:::::::.::.:::::::::.:::::::: :: ::.::::::::. :.: :::.:.:
CCDS45 TCSHLQCFDATLYIQMNEKKPTWVCPVCDKKAPYEHLIIDGLFMEILKYCTDCDEIQFKE
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470
pF1KB6 DGSWCPMRPKKEAMKVSSQPCTKIES--SSVLSKPCSVTVASEASKKKVDVIDLTIESSS
::.: ::: :::...::.. . ... ::.: . . : ..:::.::::::.:::
CCDS45 DGTWAPMRSKKEVQEVSASY-NGVDGCLSSTLEHQVASHHQSSNKNKKVEVIDLTIDSSS
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 DEEEDPP-AKRKCIFMSETQSSPTKGVLM--YQPSSV-RVPSVTSVDPAAIPPSLT-DYS
::::. : ::: : .: :. .::.: .: : : :.::. .:: . : :: ::
CCDS45 DEEEEEPSAKRTCPSLSPTSPLNNKGILSLPHQASPVSRTPSLPAVDTSYINTSLIQDYR
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580
pF1KB6 VPFHHTPISSMSSDLPGLDFLSLIPVDPQYCPPMFLDSLTSP------LTASSTSVTTTS
::: :: : :: ::::. .. : :. .: . .. : :: ::
CCDS45 HPFHMTP---MPYDLQGLDFFPFLSGDNQHYNTSLLAAAAAAVSDDQDLLHSSRFFPYTS
530 540 550 560 570 580
590 600 610 620
pF1KB6 SHESSTHVSSSSSRS-ETGVITSSGSNIPDIISLD
:. ..:...: : : .:::::
CCDS45 SQMFLDQLSAGGSTSLPTTNGSSSGSNSSLVSSNSLRESHSHTVTNRSSTDTASIFGIIP
590 600 610 620 630 640
>>CCDS81902.1 PIAS1 gene_id:8554|Hs108|chr15 (653 aa)
initn: 2124 init1: 1304 opt: 1842 Z-score: 1592.8 bits: 304.9 E(32554): 2.1e-82
Smith-Waterman score: 2153; 56.7% identity (75.5% similar) in 621 aa overlap (7-613:9-614)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MADFEELRNMVSSFRVSELQVLLGFAGRNKSGRKHDLLMRALHLLKSGCSPAVQIKIR
...:: :.::::::::::.::::: ::::.:: .::::::.:::::::.::.
CCDS81 MFTLQDSYVKQMVMSLRVSELQVLLGYAGRNKHGRKHELLTKALHLLKAGCSPAVQMKIK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 ELYRRRYPRTLEGLSDLSTIKSSVFSLDGGSSPVEPDLAVAGIHSLPSTSVTPHSPSSPV
::::::.:. . .::: . :::. :. . ..:. . : :::.
CCDS81 ELYRRRFPQKIMTPADLSIPNVH-------SSPMPATLSPS---TIPQLTYDGHPASSPL
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 GSVLLQDTKPTFEMQQPSPPIPPVHPDVQLKNLPFYDVLDVLIKPTSLVQSSIQRFQEKF
: : : .:. . . . :::::..:..:::::.:: :::::::.... :::.:
CCDS81 LPVSLLGPKHELELPHLTSALHPVHPDIKLQKLPFYDLLDELIKPTSLASDNSQRFRETC
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 FIFALTPQQVREICISRDFLPGGRRDYTVQVQLRLCLAETSCPQEDNYPNSLCIKVNGKL
: ::::::::..: : : . : . :.:::::::.::.::::::::..: .::.::: :
CCDS81 FAFALTPQQVQQISSSMD-ISGTKCDFTVQVQLRFCLSETSCPQEDHFPPNLCVKVNTKP
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 FPLPGYAPPPKNGIEQKRPGRPLNITSLVRLSSAVPNQISISWASEIGKNYSMSVYLVRQ
:::: :: :::.: :::.::.:::::::::..::: : .::..:::.::::.::::.:
CCDS81 CSLPGYLPPTKNGVEPKRPSRPINITSLVRLSTTVPNTIVVSWTAEIGRNYSMAVYLVKQ
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 LTSAMLLQRLKMKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLMCPLGKMRLTIPCR
:.:..:::::. ::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS81 LSSTVLLQRLRAKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLLCPLGKMRLTIPCR
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 AVTCTHLQCFDAALYLQMNEKKPTWICPVCDKKAAYESLILDGLFMEILNDCSDVDEIKF
:.::.:::::::.::.:::::::::.:::::::: :: ::.::::::::. :.: :::.:
CCDS81 ALTCSHLQCFDATLYIQMNEKKPTWVCPVCDKKAPYEHLIIDGLFMEILKYCTDCDEIQF
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 QEDGSWCPMRPKKEAMKVSSQPCTKIES--SSVLSKPCSVTVASEASKKKVDVIDLTIES
.:::.: ::: :::...::.. . ... ::.: . . : ..:::.::::::.:
CCDS81 KEDGTWAPMRSKKEVQEVSASY-NGVDGCLSSTLEHQVASHHQSSNKNKKVEVIDLTIDS
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 SSDEEEDPP-AKRKCIFMSETQSSPTKGVLM--YQPSSV-RVPSVTSVDPAAIPPSLT-D
::::::. : ::: : .: :. .::.: .: : : :.::. .:: . : :: :
CCDS81 SSDEEEEEPSAKRTCPSLSPTSPLNNKGILSLPHQASPVSRTPSLPAVDTSYINTSLIQD
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580
pF1KB6 YSVPFHHTPISSMSSDLPGLDFLSLIPVDPQYCPPMFLDSLTSP------LTASSTSVTT
: ::: :: : :: ::::. .. : :. .: . .. : ::
CCDS81 YRHPFHMTP---MPYDLQGLDFFPFLSGDNQHYNTSLLAAAAAAVSDDQDLLHSSRFFPY
530 540 550 560 570 580
590 600 610 620
pF1KB6 TSSHESSTHVSSSSSRS-ETGVITSSGSNIPDIISLD
:::. ..:...: : : .:::::
CCDS81 TSSQMFLDQLSAGGSTSLPTTNGSSSGSNSSLVSSNSLRESHSHTVTNRSSTDTASIFGI
590 600 610 620 630 640
>>CCDS72866.1 PIAS3 gene_id:10401|Hs108|chr1 (628 aa)
initn: 2079 init1: 1568 opt: 1813 Z-score: 1568.1 bits: 300.3 E(32554): 5e-81
Smith-Waterman score: 2168; 59.8% identity (77.7% similar) in 579 aa overlap (1-572:1-550)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MADFEELRNMVSSFRVSELQVLLGFAGRNKSGRKHDLLMRALHLLKSGCSPAVQIKIREL
::.. ::..:: :::::::::::::::::::::::.:: .:::::::.:.:.::.::.::
CCDS72 MAELGELKHMVMSFRVSELQVLLGFAGRNKSGRKHELLAKALHLLKSSCAPSVQMKIKEL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 YRRRYPRTLEGLSDLSTIKSSVFSLDGGSSPVEPDLAVAGIHSLPSTSVTPHSPSSPVGS
::::.:: : ::: :..:: :.::: .: : : : ..: :.
CCDS72 YRRRFPRKTLGPSDL-----SLLSLPPGTSPVGSPGPLAPI---PPTLLAP-------GT
70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KB6 VLLQDTKPTFEMQQPSPPIP-PVHPDVQLKNLPFYDVLDVLIKPTSLVQSSIQRFQEKFF
.: : :... ::.: :::::: .: ::::.: ::.::.:...: :::.: :
CCDS72 LL----GPKREVDM-HPPLPQPVHPDVTMKPLPFYEVYGELIRPTTLASTSSQRFEEAHF
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 IFALTPQQVREICISRDFLPGGRRDYTVQVQLRLCLAETSCPQEDNYPNSLCIKVNGKLF
::::::::..: ::. :::.. :::.:::::.:: :::::::: .: .: .::::::
CCDS72 TFALTPQQVQQILTSREVLPGAKCDYTIQVQLRFCLCETSCPQEDYFPPNLFVKVNGKLC
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 PLPGYAPPPKNGIEQKRPGRPLNITSLVRLSSAVPNQISISWASEIGKNYSMSVYLVRQL
::::: :: ::: : :::.::.::: :.:::..::: : ..:.::.:.:::.::::::::
CCDS72 PLPGYLPPTKNGAEPKRPSRPINITPLARLSATVPNTIVVNWSSEFGRNYSLSVYLVRQL
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 TSAMLLQRLKMKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEIATTSLRVSLMCPLGKMRLTIPCRA
:.. :::.:. ::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.::::
CCDS72 TAGTLLQKLRAKGIRNPDHSRALIKEKLTADPDSEVATTSLRVSLMCPLGKMRLTVPCRA
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
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