Result of FASTA (ccds) for pF1KB5940
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5940, 540 aa
  1>>>pF1KB5940 540 - 540 aa - 540 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1543+/-0.000934; mu= 14.2451+/- 0.056
 mean_var=86.9243+/-17.710, 0's: 0 Z-trim(106.5): 96  B-trim: 0 in 0/48
 Lambda= 0.137564
 statistics sampled from 8914 (9020) to 8914 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.653), E-opt: 0.2 (0.277), width:  16
 Scan time:  2.740

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS2222.1 GRB14 gene_id:2888|Hs108|chr2           ( 540) 3671 738.9 3.6e-213
CCDS43583.1 GRB10 gene_id:2887|Hs108|chr7          ( 536) 1952 397.7 1.8e-110
CCDS43582.1 GRB10 gene_id:2887|Hs108|chr7          ( 594) 1952 397.7 1.9e-110
CCDS11345.1 GRB7 gene_id:2886|Hs108|chr17          ( 532) 1708 349.3 6.6e-96
CCDS56028.1 GRB7 gene_id:2886|Hs108|chr17          ( 555) 1708 349.3 6.9e-96
CCDS82116.1 GRB7 gene_id:2886|Hs108|chr17          ( 447) 1197 247.8 1.9e-65
CCDS47586.1 GRB10 gene_id:2887|Hs108|chr7          ( 548) 1133 235.2 1.5e-61
CCDS31167.1 APBB1IP gene_id:54518|Hs108|chr10      ( 666)  585 126.5 9.9e-29
CCDS2360.1 RAPH1 gene_id:65059|Hs108|chr2          ( 644)  533 116.1 1.2e-25
CCDS2359.1 RAPH1 gene_id:65059|Hs108|chr2          (1250)  533 116.3 2.2e-25


>>CCDS2222.1 GRB14 gene_id:2888|Hs108|chr2                (540 aa)
 initn: 3671 init1: 3671 opt: 3671  Z-score: 3940.6  bits: 738.9 E(32554): 3.6e-213
Smith-Waterman score: 3671; 99.8% identity (100.0% similar) in 540 aa overlap (1-540:1-540)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MTTSLQDGQSAASRAAARDSPLAAQVCGAAQGRGDAHDLAPAPWLHARALLPLPDGTRGC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 MTTSLQDGQSAASRAAARDSPLAAQVCGAAQGRGDAHDLAPAPWLHARALLPLPDGTRGC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 AADRRKKKDLDVPEMPSIPNPFPELCCSPITSVLSADLFPKANSRKKQVIKVYSEDETSR
       :::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 AADRRKKKDLDVPEMPSIPNPFPELCCSPFTSVLSADLFPKANSRKKQVIKVYSEDETSR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 ALDVPSDITARDVCQLLILKNHYIDDHSWTLFEHLPHIGVERTIEDHELVIEVLSNWGIE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 ALDVPSDITARDVCQLLILKNHYIDDHSWTLFEHLPHIGVERTIEDHELVIEVLSNWGIE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 EENKLYFRKNYAKYEFFKNPMYFFPEHMVSFATETNGEISPTQILQMFLSSSTYPEIHGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 EENKLYFRKNYAKYEFFKNPMYFFPEHMVSFATETNGEISPTQILQMFLSSSTYPEIHGF
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 LHAKEQGKKSWKKIYFFLRRSGLYFSTKGTSKEPRHLQFFSEFGNSDIYVSLAGKKKHGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 LHAKEQGKKSWKKIYFFLRRSGLYFSTKGTSKEPRHLQFFSEFGNSDIYVSLAGKKKHGA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 PTNYGFCFKPNKAGGPRDLKMLCAEEEQSRTCWVTAIRLLKYGMQLYQNYMHPYQGRSGC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 PTNYGFCFKPNKAGGPRDLKMLCAEEEQSRTCWVTAIRLLKYGMQLYQNYMHPYQGRSGC
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 SSQSISPMRSISENSLVAMDFSGQKSRVIENPTEALSVAVEEGLAWRKKGCLRLGTHGSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 SSQSISPMRSISENSLVAMDFSGQKSRVIENPTEALSVAVEEGLAWRKKGCLRLGTHGSP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 TASSQSSATNMAIHRSQPWFHHKISRDEAQRLIIQQGLVDGVFLVRDSQSNPKTFVLSMS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 TASSQSSATNMAIHRSQPWFHHKISRDEAQRLIIQQGLVDGVFLVRDSQSNPKTFVLSMS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 HGQKIKHFQIIPVEDDGEMFHTLDDGHTRFTDLIQLVEFYQLNKGVLPCKLKHYCARIAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 HGQKIKHFQIIPVEDDGEMFHTLDDGHTRFTDLIQLVEFYQLNKGVLPCKLKHYCARIAL
              490       500       510       520       530       540

>>CCDS43583.1 GRB10 gene_id:2887|Hs108|chr7               (536 aa)
 initn: 1749 init1: 610 opt: 1952  Z-score: 2096.9  bits: 397.7 E(32554): 1.8e-110
Smith-Waterman score: 1952; 54.7% identity (78.5% similar) in 543 aa overlap (1-540:1-536)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MTTSLQDGQSAASRAAARDSPLAAQVCGAAQGRGDAHDLAPAPWLHARALLPLPDGTRGC
       :..::..  :: :  .     :     . .: :...   .  : .  :  .   . ..  
CCDS43 MNASLESLYSACSMQSDTVPLLQNGQHARSQPRASGPPRSIQPQVSPRQRVQRSQPVHIL
               10        20        30        40        50        60

                 70        80        90       100       110        
pF1KB5 AADRRKKKD--LDVPEMPSIPNPFPELCCSPITSVLSADLFPKANSRKKQVIKVYSEDET
       :. : ...:  . .  .:.:::::::::      ::.   .: ...  :: .::.::: :
CCDS43 AVRRLQEEDQQFRTSSLPAIPNPFPELCGPGSPPVLTPGSLPPSQAAAKQDVKVFSEDGT
               70        80        90       100       110       120

      120       130       140       150       160       170        
pF1KB5 SRALDVPSDITARDVCQLLILKNHYIDDHSWTLFEHLPHIGVERTIEDHELVIEVLSNWG
       :..... .:.::::.::::. :.: .::.:::: :: ::.:.:: .::::::..: :.  
CCDS43 SKVVEILADMTARDLCQLLVYKSHCVDDNSWTLVEHHPHLGLERCLEDHELVVQVEST--
              130       140       150       160       170          

      180       190       200       210       220       230        
pF1KB5 IEEENKLYFRKNYAKYEFFKNPMYFFPEHMVSFATETNGEISPTQILQMFLSSSTYPEIH
       .  :.:. ::::::::::::::: ::::.::..  ..::  : ::.:: ::.::. :::.
CCDS43 MASESKFLFRKNYAKYEFFKNPMNFFPEQMVTWCQQSNG--SQTQLLQNFLNSSSCPEIQ
      180       190       200       210         220       230      

      240       250       260       270       280       290        
pF1KB5 GFLHAKEQGKKSWKKIYFFLRRSGLYFSTKGTSKEPRHLQFFSEFGNSDIYVSLAGKKKH
       ::::.:: :::::::.:  ::::::: :::::::::::::..... .:.:.  .::.:..
CCDS43 GFLHVKELGKKSWKKLYVCLRRSGLYCSTKGTSKEPRHLQLLADLEDSNIFSLIAGRKQY
        240       250       260       270       280       290      

      300       310        320       330       340       350       
pF1KB5 GAPTNYGFCFKPNKAGGP-RDLKMLCAEEEQSRTCWVTAIRLLKYGMQLYQNYMHPYQGR
       .:::..:.:.::::. .  ..:..::::.::.::::.::.::::::: :::::  : : :
CCDS43 NAPTDHGLCIKPNKVRNETKELRLLCAEDEQTRTCWMTAFRLLKYGMLLYQNYRIPQQ-R
        300       310       320       330       340       350      

       360       370       380       390       400       410       
pF1KB5 SGCSSQSISPMRSISENSLVAMDFSGQKSRVIENPTEALSVAVEEGLAWRKKGCLRLGTH
       ..  :   .:.::.::::::::::::: .::::::.:: :.:.::: ::::..  :..  
CCDS43 KALLSPFSTPVRSVSENSLVAMDFSGQTGRVIENPAEAQSAALEEGHAWRKRST-RMNIL
         360       370       380       390       400        410    

       420       430       440       450       460       470       
pF1KB5 GSPTASSQSSATNMAIHRSQPWFHHKISRDEAQRLIIQQGLVDGVFLVRDSQSNPKTFVL
       :: .    :. ... :::.: ::: .:::.:..:.: :::::::.::.::::::::.:::
CCDS43 GSQSPLHPSTLSTV-IHRTQHWFHGRISREESHRIIKQQGLVDGLFLLRDSQSNPKAFVL
          420        430       440       450       460       470   

       480       490       500       510       520       530       
pF1KB5 SMSHGQKIKHFQIIPVEDDGEMFHTLDDGHTRFTDLIQLVEFYQLNKGVLPCKLKHYCAR
       .. : ::::.:::.: ::::. : .::::.:.:.::::::.:::::::::::::::.: :
CCDS43 TLCHHQKIKNFQILPCEDDGQTFFSLDDGNTKFSDLIQLVDFYQLNKGVLPCKLKHHCIR
           480       490       500       510       520       530   

       540
pF1KB5 IAL
       .::
CCDS43 VAL
          

>>CCDS43582.1 GRB10 gene_id:2887|Hs108|chr7               (594 aa)
 initn: 1749 init1: 610 opt: 1952  Z-score: 2096.2  bits: 397.7 E(32554): 1.9e-110
Smith-Waterman score: 1952; 54.7% identity (78.5% similar) in 543 aa overlap (1-540:59-594)

                                             10        20        30
pF1KB5                               MTTSLQDGQSAASRAAARDSPLAAQVCGAA
                                     :..::..  :: :  .     :     . .
CCDS43 DPAGPGLPAQSDRLANHQEDDVDLEALVNDMNASLESLYSACSMQSDTVPLLQNGQHARS
       30        40        50        60        70        80        

               40        50        60          70        80        
pF1KB5 QGRGDAHDLAPAPWLHARALLPLPDGTRGCAADRRKKKD--LDVPEMPSIPNPFPELCCS
       : :...   .  : .  :  .   . ..  :. : ...:  . .  .:.:::::::::  
CCDS43 QPRASGPPRSIQPQVSPRQRVQRSQPVHILAVRRLQEEDQQFRTSSLPAIPNPFPELCGP
       90       100       110       120       130       140        

       90       100       110       120       130       140        
pF1KB5 PITSVLSADLFPKANSRKKQVIKVYSEDETSRALDVPSDITARDVCQLLILKNHYIDDHS
           ::.   .: ...  :: .::.::: ::..... .:.::::.::::. :.: .::.:
CCDS43 GSPPVLTPGSLPPSQAAAKQDVKVFSEDGTSKVVEILADMTARDLCQLLVYKSHCVDDNS
      150       160       170       180       190       200        

      150       160       170       180       190       200        
pF1KB5 WTLFEHLPHIGVERTIEDHELVIEVLSNWGIEEENKLYFRKNYAKYEFFKNPMYFFPEHM
       ::: :: ::.:.:: .::::::..: :.  .  :.:. ::::::::::::::: ::::.:
CCDS43 WTLVEHHPHLGLERCLEDHELVVQVEST--MASESKFLFRKNYAKYEFFKNPMNFFPEQM
      210       220       230         240       250       260      

      210       220       230       240       250       260        
pF1KB5 VSFATETNGEISPTQILQMFLSSSTYPEIHGFLHAKEQGKKSWKKIYFFLRRSGLYFSTK
       :..  ..::  : ::.:: ::.::. :::.::::.:: :::::::.:  ::::::: :::
CCDS43 VTWCQQSNG--SQTQLLQNFLNSSSCPEIQGFLHVKELGKKSWKKLYVCLRRSGLYCSTK
        270         280       290       300       310       320    

      270       280       290       300       310        320       
pF1KB5 GTSKEPRHLQFFSEFGNSDIYVSLAGKKKHGAPTNYGFCFKPNKAGGP-RDLKMLCAEEE
       ::::::::::..... .:.:.  .::.:...:::..:.:.::::. .  ..:..::::.:
CCDS43 GTSKEPRHLQLLADLEDSNIFSLIAGRKQYNAPTDHGLCIKPNKVRNETKELRLLCAEDE
          330       340       350       360       370       380    

       330       340       350       360       370       380       
pF1KB5 QSRTCWVTAIRLLKYGMQLYQNYMHPYQGRSGCSSQSISPMRSISENSLVAMDFSGQKSR
       :.::::.::.::::::: :::::  : : :..  :   .:.::.::::::::::::: .:
CCDS43 QTRTCWMTAFRLLKYGMLLYQNYRIPQQ-RKALLSPFSTPVRSVSENSLVAMDFSGQTGR
          390       400       410        420       430       440   

       390       400       410       420       430       440       
pF1KB5 VIENPTEALSVAVEEGLAWRKKGCLRLGTHGSPTASSQSSATNMAIHRSQPWFHHKISRD
       :::::.:: :.:.::: ::::..  :..  :: .    :. ... :::.: ::: .:::.
CCDS43 VIENPAEAQSAALEEGHAWRKRST-RMNILGSQSPLHPSTLSTV-IHRTQHWFHGRISRE
           450       460        470       480        490       500 

       450       460       470       480       490       500       
pF1KB5 EAQRLIIQQGLVDGVFLVRDSQSNPKTFVLSMSHGQKIKHFQIIPVEDDGEMFHTLDDGH
       :..:.: :::::::.::.::::::::.:::.. : ::::.:::.: ::::. : .::::.
CCDS43 ESHRIIKQQGLVDGLFLLRDSQSNPKAFVLTLCHHQKIKNFQILPCEDDGQTFFSLDDGN
             510       520       530       540       550       560 

       510       520       530       540
pF1KB5 TRFTDLIQLVEFYQLNKGVLPCKLKHYCARIAL
       :.:.::::::.:::::::::::::::.: :.::
CCDS43 TKFSDLIQLVDFYQLNKGVLPCKLKHHCIRVAL
             570       580       590    

>>CCDS11345.1 GRB7 gene_id:2886|Hs108|chr17               (532 aa)
 initn: 1035 init1: 535 opt: 1708  Z-score: 1835.3  bits: 349.3 E(32554): 6.6e-96
Smith-Waterman score: 1708; 49.6% identity (74.7% similar) in 522 aa overlap (28-540:22-532)

               10        20        30        40        50          
pF1KB5 MTTSLQDGQSAASRAAARDSPLAAQVCGAAQGRGDAHDLAPAPWLHARAL-LPLPDGTRG
                                  :.  :     : .: :    :.  : .:   : 
CCDS11       MELDLSPPHLSSSPEDLCPAPGTPPGTPRPPD-TPLPEEVKRSQPLLIPTTGRK
                     10        20        30         40        50   

      60        70        80        90             100       110   
pF1KB5 CAADRRKKKDLDVPEMPSIPNPFPELCCSPITS-VLSAD-----LFPKANSRKKQVIKVY
          ..:.  .:     :::::::::::  :  : .:..      :.:.  ::  .:.:::
CCDS11 LREEERRATSL-----PSIPNPFPELCSPPSQSPILGGPSSARGLLPRDASRP-HVVKVY
            60             70        80        90       100        

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pF1KB5 SEDETSRALDVPSDITARDVCQLLILKNHYIDDHSWTLFEHLPHIGVERTIEDHELVIEV
       ::: . :...: .  ::: ::..:. . : ..:..: : :  ::...:: .:::: :.::
CCDS11 SEDGACRSVEVAAGATARHVCEMLVQRAHALSDETWGLVECHPHLALERGLEDHESVVEV
       110       120       130       140       150       160       

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pF1KB5 LSNWGIEEENKLYFRKNYAKYEFFKN-PMYFFPEHMVSFATETNGEISPTQILQMFLSSS
        . : .  .... ::::.::::.::. :  .:::.:::   ...  ::  ...: ::...
CCDS11 QAAWPVGGDSRFVFRKNFAKYELFKSSPHSLFPEKMVSSCLDAHTGISHEDLIQNFLNAG
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pF1KB5 TYPEIHGFLHAKEQGKKSWKKIYFFLRRSGLYFSTKGTSKEPRHLQFFSEFGNSDIYVSL
       ..:::.:::. . .:.: ::... ::::::::.:::::::.:::::. .. ..:..::  
CCDS11 SFPEIQGFLQLRGSGRKLWKRFFCFLRRSGLYYSTKGTSKDPRHLQYVADVNESNVYVVT
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pF1KB5 AGKKKHGAPTNYGFCFKPNKA-GGPRDLKMLCAEEEQSRTCWVTAIRLLKYGMQLYQNYM
        :.: .: ::..::: ::::  .: . :...:.:.:::::::..:.::.:::.:::.::.
CCDS11 QGRKLYGMPTDFGFCVKPNKLRNGHKGLRIFCSEDEQSRTCWLAAFRLFKYGVQLYKNYQ
       290       300       310       320       330       340       

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pF1KB5 HPYQGRSGCSSQSISPMRSISENSLVAMDFSGQKSRVIENPTEALSVAVEEGLAWRKKGC
       .  . .   :  .  :.:: :.:.::::::::. .:::::: ::::::.::. :::::  
CCDS11 QAQSRHLHPSCLGSPPLRSASDNTLVAMDFSGHAGRVIENPREALSVALEEAQAWRKKTN
       350       360       370       380       390       400       

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pF1KB5 LRLGTHGSPTASSQSSATNMAIHRSQPWFHHKISRDEAQRLIIQQGLVDGVFLVRDSQSN
        ::.    :  .: .: .  ::::.: ::: .:::.:.:::: :::::::.::::.:: :
CCDS11 HRLSL---PMPASGTSLSA-AIHRTQLWFHGRISREESQRLIGQQGLVDGLFLVRESQRN
       410          420        430       440       450       460   

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pF1KB5 PKTFVLSMSHGQKIKHFQIIPVEDDGEMFHTLDDGHTRFTDLIQLVEFYQLNKGVLPCKL
       :. ::::. : ::.::. :.: :..:... ..:::.::::::.:::::.:::.:.::: :
CCDS11 PQGFVLSLCHLQKVKHYLILPSEEEGRLYFSMDDGQTRFTDLLQLVEFHQLNRGILPCLL
           470       480       490       500       510       520   

             540
pF1KB5 KHYCARIAL
       .: :.:.::
CCDS11 RHCCTRVAL
           530  

>>CCDS56028.1 GRB7 gene_id:2886|Hs108|chr17               (555 aa)
 initn: 1035 init1: 535 opt: 1708  Z-score: 1835.0  bits: 349.3 E(32554): 6.9e-96
Smith-Waterman score: 1708; 49.6% identity (74.7% similar) in 522 aa overlap (28-540:45-555)

                  10        20        30        40        50       
pF1KB5    MTTSLQDGQSAASRAAARDSPLAAQVCGAAQGRGDAHDLAPAPWLHARAL-LPLPDG
                                     :.  :     : .: :    :.  : .:  
CCDS56 VKPLSCSDAMELDLSPPHLSSSPEDLCPAPGTPPGTPRPPD-TPLPEEVKRSQPLLIPTT
           20        30        40        50         60        70   

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pF1KB5 TRGCAADRRKKKDLDVPEMPSIPNPFPELCCSPITS-VLSAD-----LFPKANSRKKQVI
        :    ..:.  .:     :::::::::::  :  : .:..      :.:.  ::  .:.
CCDS56 GRKLREEERRATSL-----PSIPNPFPELCSPPSQSPILGGPSSARGLLPRDASRP-HVV
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pF1KB5 KVYSEDETSRALDVPSDITARDVCQLLILKNHYIDDHSWTLFEHLPHIGVERTIEDHELV
       :::::: . :...: .  ::: ::..:. . : ..:..: : :  ::...:: .:::: :
CCDS56 KVYSEDGACRSVEVAAGATARHVCEMLVQRAHALSDETWGLVECHPHLALERGLEDHESV
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pF1KB5 IEVLSNWGIEEENKLYFRKNYAKYEFFKN-PMYFFPEHMVSFATETNGEISPTQILQMFL
       .:: . : .  .... ::::.::::.::. :  .:::.:::   ...  ::  ...: ::
CCDS56 VEVQAAWPVGGDSRFVFRKNFAKYELFKSSPHSLFPEKMVSSCLDAHTGISHEDLIQNFL
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pF1KB5 SSSTYPEIHGFLHAKEQGKKSWKKIYFFLRRSGLYFSTKGTSKEPRHLQFFSEFGNSDIY
       .....:::.:::. . .:.: ::... ::::::::.:::::::.:::::. .. ..:..:
CCDS56 NAGSFPEIQGFLQLRGSGRKLWKRFFCFLRRSGLYYSTKGTSKDPRHLQYVADVNESNVY
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pF1KB5 VSLAGKKKHGAPTNYGFCFKPNKA-GGPRDLKMLCAEEEQSRTCWVTAIRLLKYGMQLYQ
       :   :.: .: ::..::: ::::  .: . :...:.:.:::::::..:.::.:::.:::.
CCDS56 VVTQGRKLYGMPTDFGFCVKPNKLRNGHKGLRIFCSEDEQSRTCWLAAFRLFKYGVQLYK
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pF1KB5 NYMHPYQGRSGCSSQSISPMRSISENSLVAMDFSGQKSRVIENPTEALSVAVEEGLAWRK
       ::..  . .   :  .  :.:: :.:.::::::::. .:::::: ::::::.::. ::::
CCDS56 NYQQAQSRHLHPSCLGSPPLRSASDNTLVAMDFSGHAGRVIENPREALSVALEEAQAWRK
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pF1KB5 KGCLRLGTHGSPTASSQSSATNMAIHRSQPWFHHKISRDEAQRLIIQQGLVDGVFLVRDS
       :   ::.    :  .: .: .  ::::.: ::: .:::.:.:::: :::::::.::::.:
CCDS56 KTNHRLSL---PMPASGTSLSA-AIHRTQLWFHGRISREESQRLIGQQGLVDGLFLVRES
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pF1KB5 QSNPKTFVLSMSHGQKIKHFQIIPVEDDGEMFHTLDDGHTRFTDLIQLVEFYQLNKGVLP
       : ::. ::::. : ::.::. :.: :..:... ..:::.::::::.:::::.:::.:.::
CCDS56 QRNPQGFVLSLCHLQKVKHYLILPSEEEGRLYFSMDDGQTRFTDLLQLVEFHQLNRGILP
           490       500       510       520       530       540   

      530       540
pF1KB5 CKLKHYCARIAL
       : :.: :.:.::
CCDS56 CLLRHCCTRVAL
           550     

>>CCDS82116.1 GRB7 gene_id:2886|Hs108|chr17               (447 aa)
 initn: 902 init1: 430 opt: 1197  Z-score: 1288.3  bits: 247.8 E(32554): 1.9e-65
Smith-Waterman score: 1197; 45.9% identity (71.7% similar) in 410 aa overlap (28-428:22-424)

               10        20        30        40        50          
pF1KB5 MTTSLQDGQSAASRAAARDSPLAAQVCGAAQGRGDAHDLAPAPWLHARAL-LPLPDGTRG
                                  :.  :     : .: :    :.  : .:   : 
CCDS82       MELDLSPPHLSSSPEDLCPAPGTPPGTPRPPD-TPLPEEVKRSQPLLIPTTGRK
                     10        20        30         40        50   

      60        70        80        90             100       110   
pF1KB5 CAADRRKKKDLDVPEMPSIPNPFPELCCSPITS-VLSAD-----LFPKANSRKKQVIKVY
          ..:.  .:     :::::::::::  :  : .:..      :.:.  ::  .:.:::
CCDS82 LREEERRATSL-----PSIPNPFPELCSPPSQSPILGGPSSARGLLPRDASRP-HVVKVY
            60             70        80        90       100        

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB5 SEDETSRALDVPSDITARDVCQLLILKNHYIDDHSWTLFEHLPHIGVERTIEDHELVIEV
       ::: . :...: .  ::: ::..:. . : ..:..: : :  ::...:: .:::: :.::
CCDS82 SEDGACRSVEVAAGATARHVCEMLVQRAHALSDETWGLVECHPHLALERGLEDHESVVEV
       110       120       130       140       150       160       

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pF1KB5 LSNWGIEEENKLYFRKNYAKYEFFKN-PMYFFPEHMVSFATETNGEISPTQILQMFLSSS
        . : .  .... ::::.::::.::. :  .:::.:::   ...  ::  ...: ::...
CCDS82 QAAWPVGGDSRFVFRKNFAKYELFKSSPHSLFPEKMVSSCLDAHTGISHEDLIQNFLNAG
       170       180       190       200       210       220       

            240       250       260       270       280       290  
pF1KB5 TYPEIHGFLHAKEQGKKSWKKIYFFLRRSGLYFSTKGTSKEPRHLQFFSEFGNSDIYVSL
       ..:::.:::. . .:.: ::... ::::::::.:::::::.:::::. .. ..:..::  
CCDS82 SFPEIQGFLQLRGSGRKLWKRFFCFLRRSGLYYSTKGTSKDPRHLQYVADVNESNVYVVT
       230       240       250       260       270       280       

            300       310        320       330       340       350 
pF1KB5 AGKKKHGAPTNYGFCFKPNKA-GGPRDLKMLCAEEEQSRTCWVTAIRLLKYGMQLYQNYM
        :.: .: ::..::: ::::  .: . :...:.:.:::::::..:.::.:::.:::.::.
CCDS82 QGRKLYGMPTDFGFCVKPNKLRNGHKGLRIFCSEDEQSRTCWLAAFRLFKYGVQLYKNYQ
       290       300       310       320       330       340       

             360       370       380       390       400       410 
pF1KB5 HPYQGRSGCSSQSISPMRSISENSLVAMDFSGQKSRVIENPTEALSVAVEEGLAWRKKGC
       .  . .   :  .  :.:: :.:.::::::::. .:::::: ::::::.::. :::::  
CCDS82 QAQSRHLHPSCLGSPPLRSASDNTLVAMDFSGHAGRVIENPREALSVALEEAQAWRKKTN
       350       360       370       380       390       400       

             420       430       440       450       460       470 
pF1KB5 LRLGTHGSPTASSQSSATNMAIHRSQPWFHHKISRDEAQRLIIQQGLVDGVFLVRDSQSN
        ::.     ...: :.:                                           
CCDS82 HRLSLPMPASGTSLSAACSWSGRVSGTPRALSSLCATCRK                    
       410       420       430       440                           

>>CCDS47586.1 GRB10 gene_id:2887|Hs108|chr7               (548 aa)
 initn: 1497 init1: 578 opt: 1133  Z-score: 1218.3  bits: 235.2 E(32554): 1.5e-61
Smith-Waterman score: 1624; 48.3% identity (71.1% similar) in 543 aa overlap (1-540:59-548)

                                             10        20        30
pF1KB5                               MTTSLQDGQSAASRAAARDSPLAAQVCGAA
                                     :..::..  :: :  .     :     . .
CCDS47 DPAGPGLPAQSDRLANHQEDDVDLEALVNDMNASLESLYSACSMQSDTVPLLQNGQHARS
       30        40        50        60        70        80        

               40        50        60          70        80        
pF1KB5 QGRGDAHDLAPAPWLHARALLPLPDGTRGCAADRRKKKD--LDVPEMPSIPNPFPELCCS
       : :...   .  : .  :  .   . ..  :. : ...:  . .  .:.:::::::::  
CCDS47 QPRASGPPRSIQPQVSPRQRVQRSQPVHILAVRRLQEEDQQFRTSSLPAIPNPFPELCGP
       90       100       110       120       130       140        

       90       100       110       120       130       140        
pF1KB5 PITSVLSADLFPKANSRKKQVIKVYSEDETSRALDVPSDITARDVCQLLILKNHYIDDHS
           ::.   .: ...  :: .::.::: ::..... .:.::::.::::. :.: .::.:
CCDS47 GSPPVLTPGSLPPSQAAAKQDVKVFSEDGTSKVVEILADMTARDLCQLLVYKSHCVDDNS
      150       160       170       180       190       200        

      150       160       170       180       190       200        
pF1KB5 WTLFEHLPHIGVERTIEDHELVIEVLSNWGIEEENKLYFRKNYAKYEFFKNPMYFFPEHM
       ::: :: ::.:.:: .::::::..: :.  .  :.:. ::::::::::::::: ::::.:
CCDS47 WTLVEHHPHLGLERCLEDHELVVQVEST--MASESKFLFRKNYAKYEFFKNPMNFFPEQM
      210       220       230         240       250       260      

      210       220       230       240       250       260        
pF1KB5 VSFATETNGEISPTQILQMFLSSSTYPEIHGFLHAKEQGKKSWKKIYFFLRRSGLYFSTK
       :..  ..::  : ::.::                                          
CCDS47 VTWCQQSNG--SQTQLLQ------------------------------------------
        270         280                                            

      270       280       290       300       310        320       
pF1KB5 GTSKEPRHLQFFSEFGNSDIYVSLAGKKKHGAPTNYGFCFKPNKAGGP-RDLKMLCAEEE
           ::::::..... .:.:.  .::.:...:::..:.:.::::. .  ..:..::::.:
CCDS47 ----EPRHLQLLADLEDSNIFSLIAGRKQYNAPTDHGLCIKPNKVRNETKELRLLCAEDE
                290       300       310       320       330        

       330       340       350       360       370       380       
pF1KB5 QSRTCWVTAIRLLKYGMQLYQNYMHPYQGRSGCSSQSISPMRSISENSLVAMDFSGQKSR
       :.::::.::.::::::: :::::  : : :..  :   .:.::.::::::::::::: .:
CCDS47 QTRTCWMTAFRLLKYGMLLYQNYRIPQQ-RKALLSPFSTPVRSVSENSLVAMDFSGQTGR
      340       350       360        370       380       390       

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pF1KB5 VIENPTEALSVAVEEGLAWRKKGCLRLGTHGSPTASSQSSATNMAIHRSQPWFHHKISRD
       :::::.:: :.:.::: ::::..  :..  :: .    :. ... :::.: ::: .:::.
CCDS47 VIENPAEAQSAALEEGHAWRKRST-RMNILGSQSPLHPSTLSTV-IHRTQHWFHGRISRE
       400       410       420        430       440        450     

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pF1KB5 EAQRLIIQQGLVDGVFLVRDSQSNPKTFVLSMSHGQKIKHFQIIPVEDDGEMFHTLDDGH
       :..:.: :::::::.::.::::::::.:::.. : ::::.:::.: ::::. : .::::.
CCDS47 ESHRIIKQQGLVDGLFLLRDSQSNPKAFVLTLCHHQKIKNFQILPCEDDGQTFFSLDDGN
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       510       520       530       540
pF1KB5 TRFTDLIQLVEFYQLNKGVLPCKLKHYCARIAL
       :.:.::::::.:::::::::::::::.: :.::
CCDS47 TKFSDLIQLVDFYQLNKGVLPCKLKHHCIRVAL
         520       530       540        

>>CCDS31167.1 APBB1IP gene_id:54518|Hs108|chr10           (666 aa)
 initn: 608 init1: 261 opt: 585  Z-score: 629.3  bits: 126.5 E(32554): 9.9e-29
Smith-Waterman score: 585; 36.2% identity (62.2% similar) in 304 aa overlap (70-363:137-439)

      40        50        60        70        80           90      
pF1KB5 APAPWLHARALLPLPDGTRGCAADRRKKKDLDVPEMPSIPNPFP---ELCCSPITSVLSA
                                     ::.:  :  :.:.    :   .   ..  :
CCDS31 AASLGYGTNVAATGISQYEDDLPPPPADPVLDLPLPPPPPEPLSQEEEEAQAKADKIKLA
        110       120       130       140       150       160      

        100       110       120       130       140       150      
pF1KB5 DLFPKANSRKKQVIKVYSEDETSRALDVPSDITARDVCQLLILKNHYIDDHSWTLFEHLP
           :  . :: :.::. .:.....: :     :::: . :. :.:   . .: :.:  :
CCDS31 LEKLKEAKVKKLVVKVHMNDNSTKSLMVDERQLARDVLDNLFEKTHCDCNVDWCLYEIYP
        170       180       190       200       210       220      

        160       170       180       190       200        210     
pF1KB5 HIGVERTIEDHELVIEVLSNWGIEEENKLYFRKNYAKYEFFKNPMYFFPEHM-VSFATET
       .. .:: .:::: :.::::.:  . :::. : ..  ::  ::::. :. ..   . . ::
CCDS31 ELQIERFFEDHENVVEVLSDWTRDTENKILFLEKEEKYAVFKNPQNFYLDNRGKKESKET
        230       240       250       260       270       280      

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pF1KB5 NGEISP----TQILQMFLSSSTY-PEIHGFLHAKEQGKKSWKKIYFFLRRSGLYFSTKGT
       : ...     . . . : ..:   ::..: :. ::.::::::. ::.:: ::.:.  :: 
CCDS31 NEKMNAKNKESLLEESFCGTSIIVPELEGALYLKEDGKKSWKRRYFLLRASGIYYVPKGK
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pF1KB5 SKEPRHLQFFSEFGNSDIYVSLAGKKKHGAPTNYGFCFK-PNKAGGPRDLKMLCAEEEQS
       .:  : :  : .: : .:: .   : :. :::.: : .: :.     . .:.:: .. ..
CCDS31 TKTSRDLACFIQFENVNIYYGTQHKMKYKAPTDYCFVLKHPQIQKESQYIKYLCCDDTRT
        350       360       370       380       390       400      

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pF1KB5 RTCWVTAIRLLKYGMQLYQNYMHPYQGRSGCSSQSISPMRSISENSLVAMDFSGQKSRVI
        . :: .::. :::  ::.::..   ...: .:.                          
CCDS31 LNQWVMGIRIAKYGKTLYDNYQRAV-AKAGLASRWTNLGTVNAAAPAQPSTGPKTGTTQP
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pF1KB5 ENPTEALSVAVEEGLAWRKKGCLRLGTHGSPTASSQSSATNMAIHRSQPWFHHKISRDEA
                                                                   
CCDS31 NGQIPQATHSVSAVLQEAQRHAETSKDKKPALGNHHDPAVPRAPHAPKSSLPPPPPVRRS
         470       480       490       500       510       520     

>>CCDS2360.1 RAPH1 gene_id:65059|Hs108|chr2               (644 aa)
 initn: 249 init1: 224 opt: 533  Z-score: 573.7  bits: 116.1 E(32554): 1.2e-25
Smith-Waterman score: 533; 34.5% identity (63.8% similar) in 293 aa overlap (101-387:316-605)

               80        90       100       110       120       130
pF1KB5 DVPEMPSIPNPFPELCCSPITSVLSADLFPKANSRKKQVIKVYSEDETSRALDVPSDITA
                                     :  . :: ::.:.  :..:... :    :.
CCDS23 IAGKPSHLLTKEEQAAKLKAEKIRVALEKIKEAQVKKLVIRVHMSDDSSKTMMVDERQTV
         290       300       310       320       330       340     

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pF1KB5 RDVCQLLILKNHYIDDHSWTLFEHLPHIGVERTIEDHELVIEVLSNWGIEEENKLYFRKN
       :.: . :. :.:   . .:.: : . .. .:: .:::: ..: : ::  . .::: : . 
CCDS23 RQVLDNLMDKSHCGYSLDWSLVETVSELQMERIFEDHENLVENLLNWTRDSQNKLIFMER
         350       360       370       380       390       400     

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pF1KB5 YAKYEFFKNPM-YFFPEHMVSFATETNGEISPTQILQMFLSSS-TYPEIHGFLHAKEQGK
         :: .::::. :.. .. ..  .. : :.    . . : .:: : :::.: :  :..::
CCDS23 IEKYALFKNPQNYLLGKKETAEMADRNKEV---LLEECFCGSSVTVPEIEGVLWLKDDGK
         410       420       430          440       450       460  

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pF1KB5 KSWKKIYFFLRRSGLYFSTKGTSKEPRHLQFFSEFGNSDIYVSLAGKKKHGAPTNYGFCF
       ::::: ::.:: ::.:.  :: .:  : :  : .. . ..: .   ..:. :::.: . .
CCDS23 KSWKKRYFLLRASGIYYVPKGKAKVSRDLVCFLQLDHVNVYYGQDYRNKYKAPTDYCLVL
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pF1KB5 K-PNKAGGPRDLKMLCAEEEQSRTCWVTAIRLLKYGMQLYQNYMHPYQGRSGC---SSQS
       : :.     . .:.:: .. ..   ::..::. ::: :::.::..  .   .    .: :
CCDS23 KHPQIQKKSQYIKYLCCDDVRTLHQWVNGIRIAKYGKQLYMNYQEALKRTESAYDWTSLS
            530       540       550       560       570       580  

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pF1KB5 ISPMRSISENSLVAMDFSGQKSRVIENPTEALSVAVEEGLAWRKKGCLRLGTHGSPTASS
        : ..: : .: .  . :.....                                     
CCDS23 SSSIKSGSSSSSIPESQSNHSNQSDSGVSDTQPAGHVRSQSIVSSVFSEAWKRGTQLEES
            590       600       610       620       630       640  

>>CCDS2359.1 RAPH1 gene_id:65059|Hs108|chr2               (1250 aa)
 initn: 224 init1: 224 opt: 533  Z-score: 569.3  bits: 116.3 E(32554): 2.2e-25
Smith-Waterman score: 533; 34.5% identity (63.8% similar) in 293 aa overlap (101-387:264-553)

               80        90       100       110       120       130
pF1KB5 DVPEMPSIPNPFPELCCSPITSVLSADLFPKANSRKKQVIKVYSEDETSRALDVPSDITA
                                     :  . :: ::.:.  :..:... :    :.
CCDS23 DLTHQGQPITEEEQAAKLKAEKIRVALEKIKEAQVKKLVIRVHMSDDSSKTMMVDERQTV
           240       250       260       270       280       290   

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pF1KB5 RDVCQLLILKNHYIDDHSWTLFEHLPHIGVERTIEDHELVIEVLSNWGIEEENKLYFRKN
       :.: . :. :.:   . .:.: : . .. .:: .:::: ..: : ::  . .::: : . 
CCDS23 RQVLDNLMDKSHCGYSLDWSLVETVSELQMERIFEDHENLVENLLNWTRDSQNKLIFMER
           300       310       320       330       340       350   

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pF1KB5 YAKYEFFKNPM-YFFPEHMVSFATETNGEISPTQILQMFLSSS-TYPEIHGFLHAKEQGK
         :: .::::. :.. .. ..  .. : :.    . . : .:: : :::.: :  :..::
CCDS23 IEKYALFKNPQNYLLGKKETAEMADRNKEV---LLEECFCGSSVTVPEIEGVLWLKDDGK
           360       370       380          390       400       410

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pF1KB5 KSWKKIYFFLRRSGLYFSTKGTSKEPRHLQFFSEFGNSDIYVSLAGKKKHGAPTNYGFCF
       ::::: ::.:: ::.:.  :: .:  : :  : .. . ..: .   ..:. :::.: . .
CCDS23 KSWKKRYFLLRASGIYYVPKGKAKVSRDLVCFLQLDHVNVYYGQDYRNKYKAPTDYCLVL
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pF1KB5 K-PNKAGGPRDLKMLCAEEEQSRTCWVTAIRLLKYGMQLYQNYMHPYQGRSGC---SSQS
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CCDS23 KHPQIQKKSQYIKYLCCDDVRTLHQWVNGIRIAKYGKQLYMNYQEALKRTESAYDWTSLS
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pF1KB5 ISPMRSISENSLVAMDFSGQKSRVIENPTEALSVAVEEGLAWRKKGCLRLGTHGSPTASS
        : ..: : .: .  . :.....                                     
CCDS23 SSSIKSGSSSSSIPESQSNHSNQSDSGVSDTQPAGHVRSQSIVSSVFSEAWKRGTQLEES
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540 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sat Nov  5 10:44:36 2016 done: Sat Nov  5 10:44:36 2016
 Total Scan time:  2.740 Total Display time:  0.080

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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