Result of FASTA (ccds) for pF1KB9856
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9856, 390 aa
  1>>>pF1KB9856 390 - 390 aa - 390 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9468+/-0.000788; mu= 20.3497+/- 0.049
 mean_var=120.7268+/-38.074, 0's: 0 Z-trim(110.0): 273  B-trim: 1301 in 2/48
 Lambda= 0.116727
 statistics sampled from 10836 (11322) to 10836 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.694), E-opt: 0.2 (0.348), width:  16
 Scan time:  3.000

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6           ( 390) 2572 444.3 8.8e-125
CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1            ( 377) 1561 274.0 1.5e-73
CCDS2920.1 HTR1F gene_id:3355|Hs108|chr3           ( 366) 1139 202.9 3.8e-52
CCDS5006.1 HTR1E gene_id:3354|Hs108|chr6           ( 365) 1061 189.8 3.4e-48
CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5          ( 422)  721 132.6 6.3e-31
CCDS7586.1 ADRB1 gene_id:153|Hs108|chr10           ( 477)  685 126.7 4.5e-29
CCDS33829.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3           ( 367)  663 122.8 5.1e-28
CCDS14564.1 HTR2C gene_id:3358|Hs108|chrX          ( 458)  574 107.9 1.9e-23
CCDS2483.1 HTR2B gene_id:3357|Hs108|chr2           ( 481)  566 106.6 4.9e-23
CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10          ( 465)  540 102.2   1e-21
CCDS5936.1 HTR5A gene_id:3361|Hs108|chr7           ( 357)  527 99.9 3.9e-21
CCDS7410.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10           ( 432)  523 99.3   7e-21
CCDS7409.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10           ( 445)  523 99.3 7.1e-21
CCDS7408.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10           ( 479)  523 99.4 7.4e-21
CCDS83269.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8          ( 342)  504 96.0 5.6e-20
CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8           ( 429)  504 96.1 6.4e-20
CCDS6053.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8           ( 455)  504 96.1 6.6e-20
CCDS6054.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8           ( 466)  504 96.2 6.7e-20
CCDS34869.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8          ( 475)  504 96.2 6.8e-20
CCDS56129.1 ADRA2B gene_id:151|Hs108|chr2          ( 450)  497 95.0 1.5e-19
CCDS4347.1 ADRA1B gene_id:147|Hs108|chr5           ( 520)  497 95.0 1.6e-19
CCDS47004.1 ADRA2C gene_id:152|Hs108|chr4          ( 462)  490 93.8 3.4e-19
CCDS13079.1 ADRA1D gene_id:146|Hs108|chr20         ( 572)  483 92.7 8.7e-19
CCDS1616.1 CHRM3 gene_id:1131|Hs108|chr1           ( 590)  479 92.1 1.4e-18
CCDS3405.1 DRD5 gene_id:1816|Hs108|chr4            ( 477)  469 90.3   4e-18
CCDS8040.1 CHRM1 gene_id:1128|Hs108|chr11          ( 460)  465 89.6 6.3e-18
CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5            ( 413)  460 88.7 1.1e-17
CCDS6099.1 ADRB3 gene_id:155|Hs108|chr8            ( 408)  459 88.5 1.2e-17
CCDS8361.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11           ( 443)  458 88.4 1.4e-17
CCDS8362.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11           ( 414)  454 87.7 2.1e-17
CCDS4393.1 DRD1 gene_id:1812|Hs108|chr5            ( 446)  447 86.5 5.1e-17
CCDS44581.1 CHRM4 gene_id:1132|Hs108|chr11         ( 479)  446 86.4 5.9e-17
CCDS10031.1 CHRM5 gene_id:1133|Hs108|chr15         ( 532)  444 86.1   8e-17
CCDS5843.1 CHRM2 gene_id:1129|Hs108|chr7           ( 466)  443 85.9 8.3e-17
CCDS2978.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3            ( 400)  431 83.8 3.1e-16
CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5            ( 359)  427 83.0 4.6e-16
CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5           ( 397)  427 83.1 4.9e-16
CCDS2604.1 HRH1 gene_id:3269|Hs108|chr3            ( 487)  427 83.2 5.5e-16
CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6         ( 345)  400 78.5 1.1e-14
CCDS9405.1 HTR2A gene_id:3356|Hs108|chr13          ( 471)  388 76.6 5.1e-14
CCDS75520.1 TAAR9 gene_id:134860|Hs108|chr6        ( 348)  386 76.1 5.4e-14
CCDS5154.1 TAAR8 gene_id:83551|Hs108|chr6          ( 342)  375 74.2 1.9e-13
CCDS344.1 HCRTR1 gene_id:3061|Hs108|chr1           ( 425)  360 71.9 1.3e-12
CCDS13493.1 HRH3 gene_id:11255|Hs108|chr20         ( 445)  355 71.0 2.3e-12
CCDS197.1 HTR6 gene_id:3362|Hs108|chr1             ( 440)  351 70.4 3.7e-12
CCDS5158.1 TAAR1 gene_id:134864|Hs108|chr6         ( 339)  348 69.7 4.5e-12
CCDS7710.1 DRD4 gene_id:1815|Hs108|chr11           ( 419)  339 68.3 1.5e-11
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 389)  334 67.4 2.5e-11
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 392)  334 67.4 2.5e-11
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 397)  334 67.4 2.5e-11


>>CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6                (390 aa)
 initn: 2572 init1: 2572 opt: 2572  Z-score: 2353.7  bits: 444.3 E(32554): 8.8e-125
Smith-Waterman score: 2572; 100.0% identity (100.0% similar) in 390 aa overlap (1-390:1-390)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MEEPGAQCAPPPPAGSETWVPQANLSSAPSQNCSAKDYIYQDSISLPWKVLLVMLLALIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 MEEPGAQCAPPPPAGSETWVPQANLSSAPSQNCSAKDYIYQDSISLPWKVLLVMLLALIT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 LATTLSNAFVIATVYRTRKLHTPANYLIASLAVTDLLVSILVMPISTMYTVTGRWTLGQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 LATTLSNAFVIATVYRTRKLHTPANYLIASLAVTDLLVSILVMPISTMYTVTGRWTLGQV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 VCDFWLSSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDAVEYSAKRTPKRAAVMIALVWVFSISI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 VCDFWLSSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDAVEYSAKRTPKRAAVMIALVWVFSISI
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 SLPPFFWRQAKAEEEVSECVVNTDHILYTVYSTVGAFYFPTLLLIALYGRIYVEARSRIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 SLPPFFWRQAKAEEEVSECVVNTDHILYTVYSTVGAFYFPTLLLIALYGRIYVEARSRIL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 KQTPNRTGKRLTRAQLITDSPGSTSSVTSINSRVPDVPSESGSPVYVNQVKVRVSDALLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 KQTPNRTGKRLTRAQLITDSPGSTSSVTSINSRVPDVPSESGSPVYVNQVKVRVSDALLE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 KKKLMAARERKATKTLGIILGAFIVCWLPFFIISLVMPICKDACWFHLAIFDFFTWLGYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 KKKLMAARERKATKTLGIILGAFIVCWLPFFIISLVMPICKDACWFHLAIFDFFTWLGYL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390
pF1KB9 NSLINPIIYTMSNEDFKQAFHKLIRFKCTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 NSLINPIIYTMSNEDFKQAFHKLIRFKCTS
              370       380       390

>>CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1                 (377 aa)
 initn: 1535 init1: 931 opt: 1561  Z-score: 1433.7  bits: 274.0 E(32554): 1.5e-73
Smith-Waterman score: 1561; 62.4% identity (83.4% similar) in 380 aa overlap (12-390:3-377)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MEEPGAQCAPPPPAGSETWVPQANLSSAPSQNCSAKDYIYQDSISLPWKVLLVMLLALIT
                  :   :   .::   .:  : : .  .  ..       :. :...:..::
CCDS23          MSPLNQSAEGLPQE--ASNRSLNATETSEAWDPRTLQALKISLAVVLSVIT
                        10          20        30        40         

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 LATTLSNAFVIATVYRTRKLHTPANYLIASLAVTDLLVSILVMPISTMYTVTGRWTLGQV
       :::.::::::..:.  ::::::::::::.:::.:::::::::::::  ::.:  :..::.
CCDS23 LATVLSNAFVLTTILLTRKLHTPANYLIGSLATTDLLVSILVMPISIAYTITHTWNFGQI
      50        60        70        80        90       100         

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 VCDFWLSSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDAVEYSAKRTPKRAAVMIALVWVFSISI
       .::.::::::::::::::::::::::::::::::.::: .::  .::.:::.::..:: :
CCDS23 LCDIWLSSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDALEYSKRRTAGHAATMIAIVWAISICI
     110       120       130       140       150       160         

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 SLPPFFWRQAKAEEEVSECVVNTDHILYTVYSTVGAFYFPTLLLIALYGRIYVEARSRIL
       :.::.:::::::.::.:.:.:::..: ::.::: ::::.:..::: ::::::  ::.:::
CCDS23 SIPPLFWRQAKAQEEMSDCLVNTSQISYTIYSTCGAFYIPSVLLIILYGRIYRAARNRIL
     170       180       190       200       210       220         

              250       260       270       280        290         
pF1KB9 KQTPNRTGKRLTRAQLITDSPGSTSSVTSINSRVPDVPSES-GSPVYVNQVKVRVSDALL
       .  :.  :::.: :.::: : ::  :. :.:: . .  :.: :::.. :.::....:. :
CCDS23 NP-PSLYGKRFTTAHLITGSAGS--SLCSLNSSLHEGHSHSAGSPLFFNHVKIKLADSAL
     230        240       250         260       270       280      

     300       310       320       330       340       350         
pF1KB9 EKKKLMAARERKATKTLGIILGAFIVCWLPFFIISLVMPICKDACWFHLAIFDFFTWLGY
       :.:.. ::::::::: :::::::::.::::::..:::.:::.:.::.: :.:::::::::
CCDS23 ERKRISAARERKATKILGIILGAFIICWLPFFVVSLVLPICRDSCWIHPALFDFFTWLGY
        290       300       310       320       330       340      

     360       370       380       390
pF1KB9 LNSLINPIIYTMSNEDFKQAFHKLIRFKCTS
       :::::::::::. ::.:.:::.:.. :. .:
CCDS23 LNSLINPIIYTVFNEEFRQAFQKIVPFRKAS
        350       360       370       

>>CCDS2920.1 HTR1F gene_id:3355|Hs108|chr3                (366 aa)
 initn: 1109 init1: 617 opt: 1139  Z-score: 1049.8  bits: 202.9 E(32554): 3.8e-52
Smith-Waterman score: 1139; 48.9% identity (75.4% similar) in 366 aa overlap (32-388:5-366)

              10        20        30        40         50        60
pF1KB9 EEPGAQCAPPPPAGSETWVPQANLSSAPSQNCSAKDYIYQDSIS-LPWKVLLVMLLALIT
                                     : : ..   .. .. .: :.:. . :. ..
CCDS29                           MDFLNSSDQNLTSEELLNRMPSKILVSLTLSGLA
                                         10        20        30    

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 LATTLSNAFVIATVYRTRKLHTPANYLIASLAVTDLLVSILVMPISTMYTVTGRWTLGQV
       : ::  :..:::..  ::::: :::::: ::::::.::..::::.: .: :   : .:::
CCDS29 LMTTTINSLVIAAIIVTRKLHHPANYLICSLAVTDFLVAVLVMPFSIVYIVRESWIMGQV
           40        50        60        70        80        90    

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 VCDFWLSSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDAVEYSAKRTPKRAAVMIALVWVFSISI
       :::.::: :::::: ::::: .:::::: ::::::::. :::::.:..::..::..:. :
CCDS29 VCDIWLSVDITCCTCSILHLSAIALDRYRAITDAVEYARKRTPKHAGIMITIVWIISVFI
          100       110       120       130       140       150    

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 SLPPFFWRQAKAEEEVSECVVNTDHILYTVYSTVGAFYFPTLLLIALYGRIYVEARSRIL
       :.::.:::.  . .. .::... :::. :.::: ::::.:  :.. :: .::  :..   
CCDS29 SMPPLFWRHQGTSRD-DECIIKHDHIVSTIYSTFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKTLYH
          160        170       180       190       200       210   

              250       260           270       280       290      
pF1KB9 KQTPNRTGKRLTRAQLITDS-PGSTSSVTS---INSRVPDVPSESGSPVYVNQVKVRVSD
       :.  .: .:. . .:.. .:   ::.::..   ... . : :: . . .. . :.   :.
CCDS29 KRQASRIAKEEVNGQVLLESGEKSTKSVSTSYVLEKSLSD-PSTDFDKIH-STVRSLRSE
           220       230       240       250        260        270 

        300           310       320       330       340       350  
pF1KB9 ALLEK----KKLMAARERKATKTLGIILGAFIVCWLPFFIISLVMPICKDACWFHLAIFD
          ::    .:. ..:::::. :::.:::::..::::::.  ::. .: : : .   . .
CCDS29 FKHEKSWRRQKISGTRERKAATTLGLILGAFVICWLPFFVKELVVNVC-DKCKISEEMSN
             280       290       300       310        320       330

            360       370       380       390
pF1KB9 FFTWLGYLNSLINPIIYTMSNEDFKQAFHKLIRFKCTS
       :..:::::::::::.:::. :::::.::.::.: .:  
CCDS29 FLAWLGYLNSLINPLIYTIFNEDFKKAFQKLVRCRC  
              340       350       360        

>>CCDS5006.1 HTR1E gene_id:3354|Hs108|chr6                (365 aa)
 initn: 1063 init1: 627 opt: 1061  Z-score: 978.8  bits: 189.8 E(32554): 3.4e-48
Smith-Waterman score: 1061; 47.8% identity (71.2% similar) in 364 aa overlap (32-387:5-362)

              10        20        30        40        50        60 
pF1KB9 EEPGAQCAPPPPAGSETWVPQANLSSAPSQNCSAKDYIYQDSISLPWKVLLVMLLALITL
                                     ::...  .     ..  :.:. : :..:: 
CCDS50                           MNITNCTTEASMAIRPKTITEKMLICMTLVVITT
                                         10        20        30    

              70        80        90       100       110       120 
pF1KB9 ATTLSNAFVIATVYRTRKLHTPANYLIASLAVTDLLVSILVMPISTMYTVTGRWTLGQVV
        ::: :  :: ..  :.::: :::::: :::::::::..::::.: .: :  :: ::  .
CCDS50 LTTLLNLAVIMAIGTTKKLHQPANYLICSLAVTDLLVAVLVMPLSIIYIVMDRWKLGYFL
           40        50        60        70        80        90    

             130       140       150       160       170       180 
pF1KB9 CDFWLSSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDAVEYSAKRTPKRAAVMIALVWVFSISIS
       :. ::: :.:::: :::::::::::::::::.:.::. ::: ::::.::  ::..:: ::
CCDS50 CEVWLSVDMTCCTCSILHLCVIALDRYWAITNAIEYARKRTAKRAALMILTVWTISIFIS
          100       110       120       130       140       150    

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 LPPFFWR-QAKAEEEVSECVVNTDHILYTVYSTVGAFYFPTLLLIALYGRIYVEARSRIL
       .::.::: . .     :.:... ::..::.:::.::::.:  :.. :: :::  :.:   
CCDS50 MPPLFWRSHRRLSPPPSQCTIQHDHVIYTIYSTLGAFYIPLTLILILYYRIYHAAKSLYQ
          160       170       180       190       200       210    

               250         260       270       280       290       
pF1KB9 KQTPNR-TGKRLTRAQ--LITDSPGSTSSVTSINSRVPDVPSESGSPVYVNQVKVRVSDA
       :.  .:  ..: : .:  . . .  .:  :.....  : .  :.    .  ....   : 
CCDS50 KRGSSRHLSNRSTDSQNSFASCKLTQTFCVSDFSTSDPTTEFEK----FHASIRIPPFDN
          220       230       240       250           260       270

           300       310       320       330       340       350   
pF1KB9 LL----EKKKLMAARERKATKTLGIILGAFIVCWLPFFIISLVMPICKDACWFHLAIFDF
        :    :.... ..:::::.. ::.::::::. ::::::  :.. .   .   ..:  ::
CCDS50 DLDHPGERQQISSTRERKAARILGLILGAFILSWLPFFIKELIVGLSIYTVSSEVA--DF
              280       290       300       310       320          

           360       370       380       390
pF1KB9 FTWLGYLNSLINPIIYTMSNEDFKQAFHKLIRFKCTS
       .:::::.::::::..::  ::::: ::.:::: .   
CCDS50 LTWLGYVNSLINPLLYTSFNEDFKLAFKKLIRCREHT
      330       340       350       360     

>>CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5               (422 aa)
 initn: 988 init1: 662 opt: 721  Z-score: 668.7  bits: 132.6 E(32554): 6.3e-31
Smith-Waterman score: 965; 39.7% identity (69.2% similar) in 403 aa overlap (24-377:11-408)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MEEPGAQCAPPPPAGSETWVPQANLSSAPSQNCSAKDYIYQDSISLPWKVLLVMLLALIT
                              : .: :.   .. .    ..... ..:.  .::. . 
CCDS34              MDVLSPGQGNNTTSPPAPFETGGNTTGISDVTVSYQVITSLLLGTLI
                            10        20        30        40       

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 LATTLSNAFVIATVYRTRKLHTPANYLIASLAVTDLLVSILVMPISTMYTVTGRWTLGQV
       . ..:.:: :.:..   :.:.. :::::.:::::::.::.::.:....: : ..::::::
CCDS34 FCAVLGNACVVAAIALERSLQNVANYLIGSLAVTDLMVSVLVLPMAALYQVLNKWTLGQV
        50        60        70        80        90       100       

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 VCDFWLSSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDAVEYSAKRTPKRAAVMIALVWVFSISI
       .::.... :. :::.::::::.::::::::::: ..:  ::::.:::..:.:.:.... :
CCDS34 TCDLFIALDVLCCTSSILHLCAIALDRYWAITDPIDYVNKRTPRRAAALISLTWLIGFLI
       110       120       130       140       150       160       

               190       200       210       220       230         
pF1KB9 SLPPFF-WRQAKAEEEVSECVVNTDHILYTVYSTVGAFYFPTLLLIALYGRIYVEARSRI
       :.::.. ::  . . . . :... ::  ::.::: ::::.: ::...:::::.  :: ::
CCDS34 SIPPMLGWRTPEDRSDPDACTISKDHG-YTIYSTFGAFYIPLLLMLVLYGRIFRAARFRI
       170       180       190        200       210       220      

     240                               250       260       270     
pF1KB9 LKQT-------------------PNRT-----GKRLTRAQLITDSPGSTSSVTSI-----
        : .                   :...     :.:  :  . . . :.  .  ..     
CCDS34 RKTVKKVEKTGADTRHGASPAPQPKKSVNGESGSRNWRLGVESKAGGALCANGAVRQGDD
        230       240       250       260       270       280      

                             280           290       300       310 
pF1KB9 -------------NSR--VPDVPSESG----SPVYVNQVKVRVSDALLEKKKLMAARERK
                    ::.  .: .:::.:    .:.  .. . : ..:   :.:.  :::::
CCDS34 GAALEVIEVHRVGNSKEHLP-LPSEAGPTPCAPASFERKNERNAEA---KRKMALARERK
        290       300        310       320       330          340  

             320       330       340       350       360       370 
pF1KB9 ATKTLGIILGAFIVCWLPFFIISLVMPICKDACWFHLAIFDFFTWLGYLNSLINPIIYTM
       ..::::::.:.::.:::::::..::.:.:...: .   .  ...:::: :::.::.::..
CCDS34 TVKTLGIIMGTFILCWLPFFIVALVLPFCESSCHMPTLLGAIINWLGYSNSLLNPVIYAY
            350       360       370       380       390       400  

             380       390 
pF1KB9 SNEDFKQAFHKLIRFKCTS 
        :.::.              
CCDS34 FNKDFQNAFKKIIKCKFCRQ
            410       420  

>>CCDS7586.1 ADRB1 gene_id:153|Hs108|chr10                (477 aa)
 initn: 588 init1: 352 opt: 685  Z-score: 635.4  bits: 126.7 E(32554): 4.5e-29
Smith-Waterman score: 685; 34.4% identity (62.3% similar) in 390 aa overlap (3-384:12-391)

                         10        20        30        40        50
pF1KB9          MEEPGA-QCAPPPPAGSETWVPQANLSSAPSQNCSAKDYIYQDSISLPWKV
                  :::  . : : : :. : . .  . ..:  .         . .:  : .
CCDS75 MGAGVLVLGASEPGNLSSAAPLPDGAAT-AARLLVPASPPASLLPPASESPEPLSQQWTA
               10        20         30        40        50         

               60        70        80        90       100       110
pF1KB9 LLVMLLALITLATTLSNAFVIATVYRTRKLHTPANYLIASLAVTDLLVSILVMPISTMYT
        . .:.:::.:  . .:..::... .: .:.: .: .: ::: .::....::.:...  .
CCDS75 GMGLLMALIVLLIVAGNVLVIVAIAKTPRLQTLTNLFIMSLASADLVMGLLVVPFGATIV
      60        70        80        90       100       110         

              120       130       140       150       160       170
pF1KB9 VTGRWTLGQVVCDFWLSSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDAVEYSAKRTPKRAAVMI
       : :::  :.  :..: : :. : ::::  ::::::::: :::.  .:..  :  ::  ..
CCDS75 VWGRWEYGSFFCELWTSVDVLCVTASIETLCVIALDRYLAITSPFRYQSLLTRARARGLV
     120       130       140       150       160       170         

              180       190        200             210       220   
pF1KB9 ALVWVFSISISLPPFFWRQAKAE-EEVSECVVNT---DHIL---YTVYSTVGAFYFPTLL
         ::..:  .:. :.. .  .:: .:. .:  .    : .    :.. :.: .:: :  .
CCDS75 CTVWAISALVSFLPILMHWWRAESDEARRCYNDPKCCDFVTNRAYAIASSVVSFYVPLCI
     180       190       200       210       220       230         

           230       240       250       260       270       280   
pF1KB9 LIALYGRIYVEARSRILKQTPNRTGKRLTRAQLITDSPGSTSSVTSINSRVPDVPSESGS
       .  .: :.. ::.... :   .   .:.  .     :: : : : .  .  :  :  ...
CCDS75 MAFVYLRVFREAQKQVKK--IDSCERRFLGGPARPPSP-SPSPVPA-PAPPPGPPRPAAA
     240       250         260       270        280        290     

           290       300       310       320       330       340   
pF1KB9 PVYVNQVKVRVSDALLEKKKLMAARERKATKTLGIILGAFIVCWLPFFIISLVMPICKDA
        . .  .. :..    . ..:.: ::.:: ::::::.:.: .::::::. ..:  . .. 
CCDS75 AATAPLANGRAGKR--RPSRLVALREQKALKTLGIIMGVFTLCWLPFFLANVVKAFHREL
         300         310       320       330       340       350   

           350       360       370       380       390             
pF1KB9 CWFHLAIFDFFTWLGYLNSLINPIIYTMSNEDFKQAFHKLIRFKCTS             
          .:  : ::.:::: :: .:::::  :  ::..::. :.                   
CCDS75 VPDRL--FVFFNWLGYANSAFNPIIYCRS-PDFRKAFQGLLCCARRAARRRHATHGDRPR
             360       370       380        390       400       410

CCDS75 ASGCLARPGPPPSPGAASDDDDDDVVGATPPARLLEPWAGCNGGAAADSDSSLDEPCRPG
              420       430       440       450       460       470

>>CCDS33829.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3                (367 aa)
 initn: 552 init1: 149 opt: 663  Z-score: 616.5  bits: 122.8 E(32554): 5.1e-28
Smith-Waterman score: 670; 36.0% identity (65.1% similar) in 381 aa overlap (23-384:5-365)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MEEPGAQCAPPPPAGSETWVPQANLSSAPSQNCSAKDYIYQDSISLPWKVLLVMLLALIT
                             ..::.  . .:.:..     : . :     .   ::: 
CCDS33                   MASLSQLSGHLNYTCGAENSTGA-SQARPHAYYALSYCALI-
                                 10        20         30        40 

               70        80        90       100       110          
pF1KB9 LATTLSNAFVIATVYRTRKLHTPANYLIASLAVTDLLVSILVMPISTMYTVTGR-WTLGQ
       :: ...:..:  .: . : :.: .:::..::::.::::. ::::  ..  :::  :....
CCDS33 LAIVFGNGLVCMAVLKERALQTTTNYLVVSLAVADLLVATLVMPWVVYLEVTGGVWNFSR
               50        60        70        80        90       100

     120       130       140       150          160       170      
pF1KB9 VVCDFWLSSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDAVEY---SAKRTPKRAAVMIALVWVF
       . :: ... :.  ::::::.::.:..::: :..  :.:   ... . .:.:.::. :::.
CCDS33 ICCDVFVTLDVMMCTASILNLCAISIDRYTAVVMPVHYQHGTGQSSCRRVALMITAVWVL
              110       120       130       140       150       160

        180       190       200        210       220       230     
pF1KB9 SISISLPPFFWRQAKAEEEVSECVV-NTDHILYTVYSTVGAFYFPTLLLIALYGRIYVEA
       ....: : .:  .. ..  :  : . : :   ...::.: .::.:  . . .:.::::  
CCDS33 AFAVSCPLLFGFNTTGDPTV--CSISNPD---FVIYSSVVSFYLPFGVTVLVYARIYV--
              170       180            190       200       210     

         240       250          260       270             280      
pF1KB9 RSRILKQTPNRTGKR-LTR--AQLITDSPGSTSSVTSIN------SRVPDVPSES--GSP
          .:::   :  :: :::  .:  .  ::  ... : .      .:  .. ...  :.:
CCDS33 ---VLKQ---RRRKRILTRQNSQCNSVRPGFPQQTLSPDPAHLELKRYYSICQDTALGGP
                 220       230       240       250       260       

          290       300          310       320       330       340 
pF1KB9 VYVNQVKVRVSDALLEKK---KLMAARERKATKTLGIILGAFIVCWLPFFIISLVMPICK
        .    . : ..   :.:   .::  ::.:::. ..:.::::::::::::.  ..   :.
CCDS33 GF----QERGGELKREEKTRNSLMPLREKKATQMVAIVLGAFIVCWLPFFLTHVLNTHCQ
           270       280       290       300       310       320   

             350       360       370       380       390
pF1KB9 DACWFHLAIFDFFTWLGYLNSLINPIIYTMSNEDFKQAFHKLIRFKCTS
        .:     ...  :::::.:: .::.:::  : .:..:: :..      
CCDS33 -TCHVSPELYSATTWLGYVNSALNPVIYTTFNIEFRKAFLKILSC    
            330       340       350       360           

>>CCDS14564.1 HTR2C gene_id:3358|Hs108|chrX               (458 aa)
 initn: 515 init1: 224 opt: 574  Z-score: 534.5  bits: 107.9 E(32554): 1.9e-23
Smith-Waterman score: 599; 31.3% identity (62.6% similar) in 358 aa overlap (38-385:46-384)

        10        20        30        40        50        60       
pF1KB9 CAPPPPAGSETWVPQANLSSAPSQNCSAKDYIYQDSISLPWKVLLVMLLALITLATTLSN
                                     . . :...  : .: .... ..:..   .:
CCDS14 IGLLVWQSDISVSPVAAIVTDIFNTSDGGRFKFPDGVQ-NWPALSIVIIIIMTIG---GN
          20        30        40        50         60           70 

        70        80        90       100       110        120      
pF1KB9 AFVIATVYRTRKLHTPANYLIASLAVTDLLVSILVMPISTMYTVTGR-WTLGQVVCDFWL
        .:: .:   .:::. .::.. :::..:.::..::::.: .  .    : : . .:  :.
CCDS14 ILVIMAVSMEKKLHNATNYFLMSLAIADMLVGLLVMPLSLLAILYDYVWPLPRYLCPVWI
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pF1KB9 SSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDAVEYSAKRTPKRAAVMIALVWVFSISISLP-PF
       : :.   ::::.:::.:.:::: :: . .:.:   .  .: . ::.::..::..:.: : 
CCDS14 SLDVLFSTASIMHLCAISLDRYVAIRNPIEHSRFNSRTKAIMKIAIVWAISIGVSVPIPV
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pF1KB9 FWRQAKAEEEV----SECVVNTDHILYTVYSTVGAFYFPTLLLIALYG-RIYVEARSRIL
       .    . ::.:    . ::.: :  .  . : : ::..:  ...  :   :::  :. ..
CCDS14 I--GLRDEEKVFVNNTTCVLN-DPNFVLIGSFV-AFFIPLTIMVITYCLTIYVLRRQALM
               200       210        220        230       240       

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pF1KB9 KQTPNRTGKRLTRAQLITDSPGSTSSVTSINSRVPDVPSESGSPVYVNQVKVRVSDALLE
                 : ...   . :: . .  .  .:      .:..:   .... : .     
CCDS14 ----------LLHGHT-EEPPGLSLDFLKCCKRNTAEEENSANPNQDQNARRRKKKERRP
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pF1KB9 KKKLMAAR-ERKATKTLGIILGAFIVCWLPFFIISLVMPICKDACWFHLA--IFDFFTWL
       .  ..:   ::::.:.:::.. .:.. : :::: ...  .:. .:  .:   ... :.:.
CCDS14 RGTMQAINNERKASKVLGIVFFVFLIMWCPFFITNILSVLCEKSCNQKLMEKLLNVFVWI
        300       310       320       330       340       350      

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pF1KB9 GYLNSLINPIIYTMSNEDFKQAFHKLIRFKCTS                           
       ::. : :::..::. :. ...:: . .:                                
CCDS14 GYVCSGINPLVYTLFNKIYRRAFSNYLRCNYKVEKKPPVRQIPRVAATALSGRELNVNIY
        360       370       380       390       400       410      

>>CCDS2483.1 HTR2B gene_id:3357|Hs108|chr2                (481 aa)
 initn: 446 init1: 194 opt: 566  Z-score: 527.0  bits: 106.6 E(32554): 4.9e-23
Smith-Waterman score: 568; 29.3% identity (65.5% similar) in 362 aa overlap (36-384:44-395)

          10        20        30        40        50        60     
pF1KB9 AQCAPPPPAGSETWVPQANLSSAPSQNCSAKDYIYQDSISLPWKVLLVMLLALITLATTL
                                     :. . ... .: : .::.... . :..   
CCDS24 IPEHILQSTFVHVISSNWSGLQTESIPEEMKQIVEEQGNKLHWAALLILMVIIPTIG---
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pF1KB9 SNAFVIATVYRTRKLHTPANYLIASLAVTDLLVSILVMPISTMYTV-TGRWTLGQVVCDF
       .:..:: .:   .::.  .::.. ::::.::::...::::. .  .  . : :  :.:  
CCDS24 GNTLVILAVSLEKKLQYATNYFLMSLAVADLLVGLFVMPIALLTIMFEAMWPLPLVLCPA
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pF1KB9 WLSSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDAVEYSAKRTPKRAAVMIALVWVFSISISLP-
       ::  :.   ::::.:::.:..::: ::   .. .   .   : . :..::..::.:..: 
CCDS24 WLFLDVLFSTASIMHLCAISVDRYIAIKKPIQANQYNSRATAFIKITVVWLISIGIAIPV
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pF1KB9 PFFWRQAKAEEEVS-ECVVNTDHIL-YTVYSTVGAFYFPTLLLIALYGRIYVEARSRILK
       :.   .. ...  .  ::.. ...  . ......::. :  ..:. :  . ..: ..   
CCDS24 PIKGIETDVDNPNNITCVLTKERFGDFMLFGSLAAFFTPLAIMIVTY-FLTIHALQKKAY
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pF1KB9 QTPNRTGKRLTRAQLIT-----DSPGSTSSVTSI--NSRVPDVPSESGSPVYVNQVKVRV
        . :.  .:::   . :     ..: :.   ...  .::   .  .::     ... .: 
CCDS24 LVKNKPPQRLTWLTVSTVFQRDETPCSSPEKVAMLDGSRKDKALPNSG-----DETLMRR
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pF1KB9 SDALLEKKKLMAARERKATKTLGIILGAFIVCWLPFFIISLVMPICKDAC-WFHLAIF-D
       .... .:.    . :..:.:.:::..  :.. : :::: .... .: :.:    : .. .
CCDS24 TSTIGKKSVQTISNEQRASKVLGIVFFLFLLMWCPFFITNITLVLC-DSCNQTTLQMLLE
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pF1KB9 FFTWLGYLNSLINPIIYTMSNEDFKQAFHKLIRFKCTS                      
       .:.:.::..: .::..::. :. :..:: . :                            
CCDS24 IFVWIGYVSSGVNPLVYTLFNKTFRDAFGRYITCNYRATKSVKTLRKRSSKIYFRNPMAE
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CCDS24 NSKFFKKHGIRNGINPAMYQSPMRLRSSTIQSSSIILLDTLLLTENEGDKTEEQVSYV
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>>CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10               (465 aa)
 initn: 674 init1: 443 opt: 540  Z-score: 503.5  bits: 102.2 E(32554): 1e-21
Smith-Waterman score: 562; 34.3% identity (61.5% similar) in 327 aa overlap (2-310:5-319)

                    10            20        30        40        50 
pF1KB9    MEEPGAQ--CAP----PPPAGSETWVPQANLSSAPSQNCSAKDYIYQDSISLPWKVL
           :.: :.   ::     : ::. .:    : . ::. .  :  :  : ...:     
CCDS75 MFRQEQPLAEGSFAPMGSLQPDAGNASW----NGTEAPGGGARATPYSLQVTLTL-----
               10        20            30        40        50      

              60        70        80        90       100       110 
pF1KB9 LVMLLALITLATTLSNAFVIATVYRTRKLHTPANYLIASLAVTDLLVSILVMPISTMYTV
        : : .:. : :...:..:: .:. .: :..: : ...::: .:.::. ::.:.:    :
CCDS75 -VCLAGLLMLLTVFGNVLVIIAVFTSRALKAPQNLFLVSLASADILVATLVIPFSLANEV
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pF1KB9 TGRWTLGQVVCDFWLSSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDAVEYSAKRTPKRAAVMIA
        : : .:.. :...:. :.  ::.::.:::.:.:::::.::.:.::. ::::.:  ..: 
CCDS75 MGYWYFGKAWCEIYLALDVLFCTSSIVHLCAISLDRYWSITQAIEYNLKRTPRRIKAIII
              120       130       140       150       160       170

             180       190            200       210       220      
pF1KB9 LVWVFSISISLPPFFWRQAKA-----EEEVSECVVNTDHILYTVYSTVGAFYFPTLLLIA
        :::.:  ::.::..  . :.     .    .: .: :.  :.. : .:.:. : :..: 
CCDS75 TVWVISAVISFPPLISIEKKGGGGGPQPAEPRCEIN-DQKWYVISSCIGSFFAPCLIMIL
              180       190       200        210       220         

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pF1KB9 LYGRIYVEARSRILKQTPNRTGKRLTRA-----QLITDSPGSTSSVTSINSRVPDVPSE-
       .: :::  :. :  .  :.: :   . :     .   .. :   :.   ....  .:.. 
CCDS75 VYVRIYQIAKRRT-RVPPSRRGPDAVAAPPGGTERRPNGLGPERSAGPGGAEAEPLPTQL
     230       240        250       260       270       280        

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pF1KB9 SGSPVYVNQVKVRVSDAL-LEKKKLMAARERKATKTLGIILGAFIVCWLPFFIISLVMPI
       .:.:     .  : .::: ::...     ::                             
CCDS75 NGAPGEPAPAGPRDTDALDLEESSSSDHAERPPGPRRPERGPRGKGKARASQVKPGDSLP
      290       300       310       320       330       340        

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pF1KB9 CKDACWFHLAIFDFFTWLGYLNSLINPIIYTMSNEDFKQAFHKLIRFKCTS         
                                                                   
CCDS75 RRGPGATGIGTPAAGPGEERVGAAKASRWRGRQNREKRFTFVLAVVIGVFVVCWFPFFFT
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390 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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