Result of FASTA (ccds) for pF1KB9852
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9852, 382 aa
  1>>>pF1KB9852 382 - 382 aa - 382 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7615+/-0.000752; mu= 15.0885+/- 0.046
 mean_var=78.9360+/-15.335, 0's: 0 Z-trim(109.6): 21  B-trim: 35 in 1/50
 Lambda= 0.144357
 statistics sampled from 10990 (11010) to 10990 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.707), E-opt: 0.2 (0.338), width:  16
 Scan time:  2.700

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS5123.1 GJA1 gene_id:2697|Hs108|chr6            ( 382) 2573 545.1 3.8e-155
CCDS30669.1 GJA4 gene_id:2701|Hs108|chr1           ( 333)  995 216.5 2.9e-56
CCDS9289.1 GJA3 gene_id:2700|Hs108|chr13           ( 435)  942 205.5 7.5e-53
CCDS30834.1 GJA8 gene_id:2703|Hs108|chr1           ( 433)  900 196.7 3.2e-50
CCDS929.1 GJA5 gene_id:2702|Hs108|chr1             ( 358)  883 193.2 3.2e-49
CCDS5025.1 GJA10 gene_id:84694|Hs108|chr6          ( 543)  847 185.8 8.1e-47
CCDS432.1 GJA9 gene_id:81025|Hs108|chr1            ( 515)  832 182.6 6.8e-46
CCDS384.1 GJB3 gene_id:2707|Hs108|chr1             ( 270)  436 100.0 2.7e-21
CCDS9290.1 GJB2 gene_id:2706|Hs108|chr13           ( 226)  433 99.3 3.5e-21
CCDS14408.1 GJB1 gene_id:2705|Hs108|chrX           ( 283)  426 97.9 1.2e-20
CCDS9291.1 GJB6 gene_id:10804|Hs108|chr13          ( 261)  413 95.2 7.2e-20
CCDS383.1 GJB4 gene_id:127534|Hs108|chr1           ( 266)  407 94.0 1.7e-19
CCDS11487.1 GJC1 gene_id:10052|Hs108|chr17         ( 396)  405 93.6 3.2e-19
CCDS382.1 GJB5 gene_id:2709|Hs108|chr1             ( 273)  392 90.8 1.5e-18
CCDS5008.1 GJB7 gene_id:375519|Hs108|chr6          ( 223)  390 90.4 1.7e-18
CCDS1569.1 GJC2 gene_id:57165|Hs108|chr1           ( 439)  385 89.5 6.3e-18
CCDS58547.1 GJD3 gene_id:125111|Hs108|chr17        ( 294)  367 85.6   6e-17
CCDS10040.1 GJD2 gene_id:57369|Hs108|chr15         ( 321)  358 83.8 2.4e-16
CCDS34697.1 GJC3 gene_id:349149|Hs108|chr7         ( 279)  313 74.4 1.4e-13


>>CCDS5123.1 GJA1 gene_id:2697|Hs108|chr6                 (382 aa)
 initn: 2573 init1: 2573 opt: 2573  Z-score: 2898.9  bits: 545.1 E(32554): 3.8e-155
Smith-Waterman score: 2573; 100.0% identity (100.0% similar) in 382 aa overlap (1-382:1-382)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MGDWSALGKLLDKVQAYSTAGGKVWLSVLFIFRILLLGTAVESAWGDEQSAFRCNTQQPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 MGDWSALGKLLDKVQAYSTAGGKVWLSVLFIFRILLLGTAVESAWGDEQSAFRCNTQQPG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 CENVCYDKSFPISHVRFWVLQIIFVSVPTLLYLAHVFYVMRKEEKLNKKEEELKVAQTDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 CENVCYDKSFPISHVRFWVLQIIFVSVPTLLYLAHVFYVMRKEEKLNKKEEELKVAQTDG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 VNVDMHLKQIEIKKFKYGIEEHGKVKMRGGLLRTYIISILFKSIFEVAFLLIQWYIYGFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 VNVDMHLKQIEIKKFKYGIEEHGKVKMRGGLLRTYIISILFKSIFEVAFLLIQWYIYGFS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 LSAVYTCKRDPCPHQVDCFLSRPTEKTIFIIFMLVVSLVSLALNIIELFYVFFKGVKDRV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 LSAVYTCKRDPCPHQVDCFLSRPTEKTIFIIFMLVVSLVSLALNIIELFYVFFKGVKDRV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 KGKSDPYHATSGALSPAKDCGSQKYAYFNGCSSPTAPLSPMSPPGYKLVTGDRNNSSCRN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 KGKSDPYHATSGALSPAKDCGSQKYAYFNGCSSPTAPLSPMSPPGYKLVTGDRNNSSCRN
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 YNKQASEQNWANYSAEQNRMGQAGSTISNSHAQPFDFPDDNQNSKKLAAGHELQPLAIVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 YNKQASEQNWANYSAEQNRMGQAGSTISNSHAQPFDFPDDNQNSKKLAAGHELQPLAIVD
              310       320       330       340       350       360

              370       380  
pF1KB9 QRPSSRASSRASSRPRPDDLEI
       ::::::::::::::::::::::
CCDS51 QRPSSRASSRASSRPRPDDLEI
              370       380  

>>CCDS30669.1 GJA4 gene_id:2701|Hs108|chr1                (333 aa)
 initn: 1039 init1: 967 opt: 995  Z-score: 1123.7  bits: 216.5 E(32554): 2.9e-56
Smith-Waterman score: 1024; 45.6% identity (69.3% similar) in 375 aa overlap (1-370:1-330)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MGDWSALGKLLDKVQAYSTAGGKVWLSVLFIFRILLLGTAVESAWGDEQSAFRCNTQQPG
       ::::. : ::::.:: .::. ::.::.::::::::.:: : ::.:::::: :.::: :::
CCDS30 MGDWGFLEKLLDQVQEHSTVVGKIWLTVLFIFRILILGLAGESVWGDEQSDFECNTAQPG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 CENVCYDKSFPISHVRFWVLQIIFVSVPTLLYLAHVFYVMRKEEKLNKKEEELKVAQTDG
       : :::::..:::::.:.::::..:::.:::.::.::.:. :.::.: .:: ::..  .  
CCDS30 CTNVCYDQAFPISHIRYWVLQFLFVSTPTLVYLGHVIYLSRREERLRQKEGELRALPAKD
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 VNVDMHLKQIEIKKFKYGIEEHGKVKMRGGLLRTYIISILFKSIFEVAFLLIQWYIYGFS
        .:.  :  .: .  : .. : :....::.:. ::. :.: ::..:..::  :: .::..
CCDS30 PQVERALAAVERQMAKISVAEDGRLRIRGALMGTYVASVLCKSVLEAGFLYGQWRLYGWT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230          
pF1KB9 LSAVYTCKRDPCPHQVDCFLSRPTEKTIFIIFMLVVSLVSLALNIIELFYVFFK----GV
       .  :..:.: :::. ::::.::::::::::::::::.:.::.::..:: ... .    :.
CCDS30 MEPVFVCQRAPCPYLVDCFVSRPTEKTIFIIFMLVVGLISLVLNLLELVHLLCRCLSRGM
              190       200       210       220       230       240

        240       250       260       270       280       290      
pF1KB9 KDRVKGKSDPYHATSGALSPAKDCGSQKYAYFNGCSSPTAPLSPMSPPGYKLVTGDRNNS
       . :    . : ..::.  .:  :   : . :.     :..  .: :::            
CCDS30 RARQGQDAPPTQGTSS--DPYTD---QVFFYL-----PVGQ-GPSSPP------------
              250         260               270                    

        300        310       320       330       340       350     
pF1KB9 SCRNYNK-QASEQNWANYSAEQNRMGQAGSTISNSHAQPFDFPDDNQNSKKLAAGHELQP
        : .::  ..::::::: ..:. :..        :   :. .    ::..:        :
CCDS30 -CPTYNGLSSSEQNWANLTTEE-RLA--------SSRPPLFLDPPPQNGQK--------P
        280       290        300               310                 

         360       370       380  
pF1KB9 LAIVDQRPSSRASSRASSRPRPDDLEI
            .:::: ::..            
CCDS30 ----PSRPSSSASKKQYV         
         320       330            

>>CCDS9289.1 GJA3 gene_id:2700|Hs108|chr13                (435 aa)
 initn: 1117 init1: 583 opt: 942  Z-score: 1062.3  bits: 205.5 E(32554): 7.5e-53
Smith-Waterman score: 985; 42.2% identity (67.2% similar) in 412 aa overlap (1-382:1-398)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MGDWSALGKLLDKVQAYSTAGGKVWLSVLFIFRILLLGTAVESAWGDEQSAFRCNTQQPG
       ::::: ::.::...: .::. :::::.::::::::.::.:.:..:::::: : :::::::
CCDS92 MGDWSFLGRLLENAQEHSTVIGKVWLTVLFIFRILVLGAAAEDVWGDEQSDFTCNTQQPG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 CENVCYDKSFPISHVRFWVLQIIFVSVPTLLYLAHVFYVMRKEEKLNKKEEELKVAQTDG
       :::::::..:::::.:::.:::::::.:::.::.::....: ::: ...::: .. . . 
CCDS92 CENVCYDRAFPISHIRFWALQIIFVSTPTLIYLGHVLHIVRMEEKKKEREEEEQLKRESP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 VNVDMHLKQIEIKKFKYGIEEHGKVKMRGGLLRTYIISILFKSIFEVAFLLIQWYIYGFS
          .    .   .      ...:.:.: :.:::::...:.::..:::.:.  :...::: 
CCDS92 SPKEPPQDNPSSR------DDRGRVRMAGALLRTYVFNIIFKTLFEVGFIAGQYFLYGFE
              130             140       150       160       170    

              190       200       210       220       230          
pF1KB9 LSAVYTCKRDPCPHQVDCFLSRPTEKTIFIIFMLVVSLVSLALNIIELFYVFFK----GV
       :. .: : : :::. ::::.::::::::::::::.:. .:: ::..:.... .:    ::
CCDS92 LKPLYRCDRWPCPNTVDCFISRPTEKTIFIIFMLAVACASLLLNMLEIYHLGWKKLKQGV
          180       190       200       210       220       230    

        240               250       260       270           280    
pF1KB9 KDRVK--------GKSDPYHATSGALSPAKDCGSQKYAYFNGCSSPTAPLS----PMSPP
        .:.         : .::     ..  ::   :   :  .   ..: .       : .::
CCDS92 TSRLGPDASEAPLGTADPPPLPPSSRPPAVAIGFPPY--YAHTAAPLGQARAVGYPGAPP
          240       250       260       270         280       290  

               290        300           310       320       330    
pF1KB9 ---GYKLV--TGDRNNS-SCRNYNKQ----ASEQNWANYSAEQNRMGQAGSTISNSHAQP
           .::.  :  :... : . :: .     .:::::: .::..  .  .   ... : :
CCDS92 PAADFKLLALTEARGKGQSAKLYNGHHHLLMTEQNWANQAAERQPPALKAYPAASTPAAP
            300       310       320       330       340       350  

          340       350           360       370       380          
pF1KB9 FDFPDDNQNSKKLAAGHELQ----PLAIVDQRPSSRASSRASSRPRPDDLEI        
             ...:  ::  :: .    :: ..:   ::  .:  .. :. ..  .        
CCDS92 SPV---GSSSPPLA--HEAEAGAAPL-LLDGSGSSLEGSALAGTPEEEEQAVTTAAQMHQ
               360         370        380       390       400      

CCDS92 PPLPLGDPGRASKASRASSGRARPEDLAI
        410       420       430     

>>CCDS30834.1 GJA8 gene_id:2703|Hs108|chr1                (433 aa)
 initn: 959 init1: 544 opt: 900  Z-score: 1015.1  bits: 196.7 E(32554): 3.2e-50
Smith-Waterman score: 900; 55.2% identity (81.3% similar) in 241 aa overlap (1-241:1-237)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MGDWSALGKLLDKVQAYSTAGGKVWLSVLFIFRILLLGTAVESAWGDEQSAFRCNTQQPG
       ::::: ::..:..:. .::. :.:::.::::::::.::::.: .:::::: : :::::::
CCDS30 MGDWSFLGNILEEVNEHSTVIGRVWLTVLFIFRILILGTAAEFVWGDEQSDFVCNTQQPG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 CENVCYDKSFPISHVRFWVLQIIFVSVPTLLYLAHVFYVMRKEEKLNKKEEELKVAQTDG
       :::::::..:::::.:.:::::::::.:.:.:..:. . .: ::: ...: : ...:  :
CCDS30 CENVCYDEAFPISHIRLWVLQIIFVSTPSLMYVGHAVHYVRMEEKRKSREAE-ELGQQAG
               70        80        90       100       110          

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 VNVDMHLKQIEIKKFKYGIEEHGKVKMRGGLLRTYIISILFKSIFEVAFLLIQWYIYGFS
       .:      :  .:: . : .   : ...: ::::::  :.::..:::.:.. ....::: 
CCDS30 TNGGP--DQGSVKK-SSGSKGTKKFRLEGTLLRTYICHIIFKTLFEVGFIVGHYFLYGFR
     120         130        140       150       160       170      

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 LSAVYTCKRDPCPHQVDCFLSRPTEKTIFIIFMLVVSLVSLALNIIELFYVFFKGVKDRV
       .  .: :.: :::. ::::.::::::::::.::: :. ::: ::..:: .. .::... .
CCDS30 ILPLYRCSRWPCPNVVDCFVSRPTEKTIFILFMLSVASVSLFLNVMELGHLGLKGIRSAL
        180       190       200       210       220       230      

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 KGKSDPYHATSGALSPAKDCGSQKYAYFNGCSSPTAPLSPMSPPGYKLVTGDRNNSSCRN
       :                                                           
CCDS30 KRPVEQPLGEIPEKSLHSIAVSSIQKAKGYQLLEEEKIVSHYFPLTEVGMVETSPLPAKP
        240       250       260       270       280       290      

>>CCDS929.1 GJA5 gene_id:2702|Hs108|chr1                  (358 aa)
 initn: 938 init1: 538 opt: 883  Z-score: 997.2  bits: 193.2 E(32554): 3.2e-49
Smith-Waterman score: 921; 40.6% identity (69.9% similar) in 389 aa overlap (1-382:1-358)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MGDWSALGKLLDKVQAYSTAGGKVWLSVLFIFRILLLGTAVESAWGDEQSAFRCNTQQPG
       ::::: ::..:..:. .::. :::::.::::::.:.::::.::.:::::. :::.: :::
CCDS92 MGDWSFLGNFLEEVHKHSTVVGKVWLTVLFIFRMLVLGTAAESSWGDEQADFRCDTIQPG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110          
pF1KB9 CENVCYDKSFPISHVRFWVLQIIFVSVPTLLYLAHVFYVMRKEEKLNKKE-EELKVAQTD
       :.:::::..:::::.:.:::::::::.:.:.:..:.....: .:: . .: :. : .. .
CCDS92 CQNVCYDQAFPISHIRYWVLQIIFVSTPSLVYMGHAMHTVRMQEKRKLREAERAKEVRGS
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB9 GVNVDMHLKQIEIKKFKYGIEEHGKVKMRGGLLRTYIISILFKSIFEVAFLLIQWYIYGF
       :       .. :.. .. :   .:.. ..: :: ::. :::... .::.:.. :..:::.
CCDS92 GSYEYPVAEKAELSCWEEG---NGRIALQGTLLNTYVCSILIRTTMEVGFIVGQYFIYGI
              130          140       150       160       170       

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB9 SLSAVYTCKRDPCPHQVDCFLSRPTEKTIFIIFMLVVSLVSLALNIIELFYVFFKGVKDR
        :.....:.:.:::: :.:..::::::..::.:::.:. .:: :.. ::... .: ...:
CCDS92 FLTTLHVCRRSPCPHPVNCYVSRPTEKNVFIVFMLAVAALSLLLSLAELYHLGWKKIRQR
       180       190       200       210       220       230       

      240       250       260       270       280        290       
pF1KB9 -VKGKSDPYHATSGALSPAKDCGSQKYAYFNGCSSPTAPLSPM-SPPGYKLVTGDRNNSS
        :: ..   : ..  ::      . . .  ..:. :    . . . :: :. .   ::  
CCDS92 FVKPRQ---HMAKCQLS------GPSVGIVQSCTPPPDFNQCLENGPGGKFFNPFSNN--
       240          250             260       270       280        

       300       310       320           330       340       350   
pF1KB9 CRNYNKQASEQNWANYSAEQNRMGQAGST----ISNSHAQPFDFPDDNQNSKKLAAGHEL
             .::.::  :  .:: : ::  .     :.  ..:  . :.       .. ::.:
CCDS92 ------MASQQNTDNLVTEQVR-GQEQTPGEGFIQVRYGQKPEVPNG------VSPGHRL
              290       300        310       320             330   

           360       370       380  
pF1KB9 QPLAIVDQRPSSRASSRASSRPRPDDLEI
             :.:  :.:::.:    : ::: .
CCDS92 PHGYHSDKRRLSKASSKA----RSDDLSV
           340       350            

>>CCDS5025.1 GJA10 gene_id:84694|Hs108|chr6               (543 aa)
 initn: 846 init1: 512 opt: 847  Z-score: 954.0  bits: 185.8 E(32554): 8.1e-47
Smith-Waterman score: 847; 42.5% identity (73.1% similar) in 294 aa overlap (1-289:1-291)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MGDWSALGKLLDKVQAYSTAGGKVWLSVLFIFRILLLGTAVESAWGDEQSAFRCNTQQPG
       ::::. :: .:..:...::  ::.::..:::::.:.: .:.:..: :::::: :::.:::
CCDS50 MGDWNLLGGILEEVHSHSTIVGKIWLTILFIFRMLVLRVAAEDVWDDEQSAFACNTRQPG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 CENVCYDKSFPISHVRFWVLQIIFVSVPTLLYLAHVFYVMRKEEKLNKKEEELKVAQTDG
       :.:.::: .:::: .::::::::::: :.:.:..:..: .:  ::  ....    :: ..
CCDS50 CNNICYDDAFPISLIRFWVLQIIFVSSPSLVYMGHALYRLRAFEKDRQRKKSHLRAQMEN
               70        80        90       100       110       120

              130          140       150       160       170       
pF1KB9 VNVDMHLKQI---EIKKFKYGIEEHGKVKMRGGLLRTYIISILFKSIFEVAFLLIQWYIY
        ..:.. .:    :.....   . : :: ..: :::::.. :: .:..::.:.. :. .:
CCDS50 PDLDLEEQQRIDRELRRLEEQKRIH-KVPLKGCLLRTYVLHILTRSVLEVGFMIGQYILY
              130       140        150       160       170         

       180       190       200       210       220       230       
pF1KB9 GFSLSAVYTCKRDPCPHQVDCFLSRPTEKTIFIIFMLVVSLVSLALNIIELFYVFFKGVK
       ::..  .: : . :::. ::::.:::::::::..::  .. .:: :::.:.:.. .. . 
CCDS50 GFQMHPLYKCTQPPCPNAVDCFVSRPTEKTIFMLFMHSIAAISLLLNILEIFHLGIRKIM
     180       190       200       210       220       230         

       240         250       260       270       280       290     
pF1KB9 DRV--KGKSDPYHATSGALSPAKDCGSQKYAYFNGCSSPTAPLSPMSPPGYKLVTGDRNN
         .  :..:.  .  .:     :  .  .  ..  :::    .::..  . . :      
CCDS50 RTLYKKSSSEGIEDETGPPFHLKKYSVAQQCMI--CSSLPERISPLQANNQQQVIRVNVP
     240       250       260       270         280       290       

         300       310       320       330       340       350     
pF1KB9 SSCRNYNKQASEQNWANYSAEQNRMGQAGSTISNSHAQPFDFPDDNQNSKKLAAGHELQP
                                                                   
CCDS50 KSKTMWQIPQPRQLEVDPSNGKKDWSEKDQHSGQLHVHSPCPWAGSAGNQHLGQQSDHSS
       300       310       320       330       340       350       

>>CCDS432.1 GJA9 gene_id:81025|Hs108|chr1                 (515 aa)
 initn: 816 init1: 483 opt: 832  Z-score: 937.4  bits: 182.6 E(32554): 6.8e-46
Smith-Waterman score: 850; 36.5% identity (69.6% similar) in 392 aa overlap (1-376:1-385)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MGDWSALGKLLDKVQAYSTAGGKVWLSVLFIFRILLLGTAVESAWGDEQSAFRCNTQQPG
       ::::. ::  :..:. .::  ::.::..:::::.:.::.:.:..:.::::.: :::.:::
CCDS43 MGDWNLLGDTLEEVHIHSTMIGKIWLTILFIFRMLVLGVAAEDVWNDEQSGFICNTEQPG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100        110         
pF1KB9 CENVCYDKSFPISHVRFWVLQIIFVSVPTLLYLAHVFYVMRK-EEKLNKKEEELKVAQTD
       :.:::::..:::: .:.::::.:::: :.:.:..:..: .:  ::. .. . .:.: . .
CCDS43 CRNVCYDQAFPISLIRYWVLQVIFVSSPSLVYMGHALYRLRVLEEERQRMKAQLRV-ELE
               70        80        90       100       110          

     120       130       140         150       160       170       
pF1KB9 GVNVDMHLKQIEIKKFKYGIEEH--GKVKMRGGLLRTYIISILFKSIFEVAFLLIQWYIY
        :. .:   . ....    .:..  .:. .:: :: ::.: :. .:. ::.:.. :. .:
CCDS43 EVEFEMPRDRRRLEQELCQLEKRKLNKAPLRGTLLCTYVIHIFTRSVVEVGFMIGQYLLY
     120       130       140       150       160       170         

       180       190       200       210       220       230       
pF1KB9 GFSLSAVYTCKRDPCPHQVDCFLSRPTEKTIFIIFMLVVSLVSLALNIIELFYVFFKGVK
       :: :  .. :.  :::. .:::.:::::::::..::  .. .:: :::.:.:.. :: .:
CCDS43 GFHLEPLFKCHGHPCPNIIDCFVSRPTEKTIFLLFMQSIATISLFLNILEIFHLGFKKIK
     180       190       200       210       220       230         

       240       250       260       270       280       290       
pF1KB9 DRVKGKSDPYHATSGALSPAKDCGSQKYAYFNGCSSPTAPLSPMSPPGYKLVTGDRNNSS
         . ::   :.  .       . ..:. : ... :. .    : : : :.:..  .....
CCDS43 RGLWGK---YKLKKEHNEFHANKAKQNVAKYQSTSANSLKRLP-SAPDYNLLVEKQTHTA
     240          250       260       270        280       290     

        300        310         320                330       340    
pF1KB9 CR-NYNKQASEQ-NWANYSAEQNR--MGQAGSTISN---------SHAQPFDFPDDNQNS
          . :...  : :  :.:.....  . .  ...::         :: : ..  ..:...
CCDS43 VYPSLNSSSVFQPNPDNHSVNDEKCILDEQETVLSNEISTLSTSCSHFQHIS-SNNNKDT
         300       310       320       330       340        350    

          350       360       370       380                        
pF1KB9 KKLAAGHELQPLAIVDQRPSSRASSRASSRPRPDDLEI                      
       .:.  :.::.   ....: .   .:. .   :                            
CCDS43 HKIF-GKELNGNQLMEKRETEGKDSKRNYYSRGHRSIPGVAIDGENNMRQSPQTVFSLPA
           360       370       380       390       400       410   

CCDS43 NCDWKPRWLRATWGSSTEHENRGSPPKGNLKGQFRKGTVRTLPPSQGDSQSLDIPNTADS
           420       430       440       450       460       470   

>>CCDS384.1 GJB3 gene_id:2707|Hs108|chr1                  (270 aa)
 initn: 646 init1: 425 opt: 436  Z-score: 495.9  bits: 100.0 E(32554): 2.7e-21
Smith-Waterman score: 633; 39.8% identity (63.8% similar) in 279 aa overlap (3-274:2-253)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MGDWSALGKLLDKVQAYSTAGGKVWLSVLFIFRILLLGTAVESAWGDEQSAFRCNTQQPG
         ::..:  ::. :. :::: :..::::.:.::.:.  .:.: .:::::. : :::.:::
CCDS38  MDWKTLQALLSGVNKYSTAFGRIWLSVVFVFRVLVYVVAAERVWGDEQKDFDCNTKQPG
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 CENVCYDKSFPISHVRFWVLQIIFVSVPTLLYLAHVFYVMRKEEKLNKKEEELKVAQTDG
       : :::::. ::::..:.:.::.:::. :.:: . :: :  ..:..  .:           
CCDS38 CTNVCYDNYFPISNIRLWALQLIFVTCPSLLVILHVAYREERERRHRQK-----------
      60        70        80        90       100                   

              130       140       150       160       170          
pF1KB9 VNVDMHLKQIEIKKFKYGIEEHGKVKMRGGLLRTYIISILFKSIFEVAFL-LIQWYIYGF
            :  :   : .  . ..::      ::  ::..:..:: :.:  :: :..   .::
CCDS38 -----HGDQCA-KLYDNAGKKHG------GLWWTYLFSLIFKLIIEFLFLYLLHTLWHGF
           110        120             130       140       150      

     180        190       200       210       220       230        
pF1KB9 SLSAVYTCKR-DPCPHQVDCFLSRPTEKTIFIIFMLVVSLVSLALNIIELFYVF----FK
       ..  .  :    :::. :::...::::: ::  ::. .: : ..:.: :: :..    ..
CCDS38 NMPRLVQCANVAPCPNIVDCYIARPTEKKIFTYFMVGASAVCIVLTICELCYLICHRVLR
        160       170       180       190       200       210      

           240       250       260       270       280       290   
pF1KB9 GV-KDRVKGKSDPYHATSGALSPAKDCGSQKYAYFNGCSSPTAPLSPMSPPGYKLVTGDR
       :. ::. .:  .:    :.. : :. :  ..     :  .:                   
CCDS38 GLHKDKPRGGCSP----SSSASRASTCRCHHKLVEAGEVDPDPGNNKLQASAPNLTPI  
        220           230       240       250       260       270  

           300       310       320       330       340       350   
pF1KB9 NNSSCRNYNKQASEQNWANYSAEQNRMGQAGSTISNSHAQPFDFPDDNQNSKKLAAGHEL

>>CCDS9290.1 GJB2 gene_id:2706|Hs108|chr13                (226 aa)
 initn: 710 init1: 423 opt: 433  Z-score: 493.7  bits: 99.3 E(32554): 3.5e-21
Smith-Waterman score: 702; 46.2% identity (72.9% similar) in 240 aa overlap (3-241:2-223)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MGDWSALGKLLDKVQAYSTAGGKVWLSVLFIFRILLLGTAVESAWGDEQSAFRCNTQQPG
         ::..:  .:  :. .::. ::.::.:::::::..: .:.. .:::::. : ::: :::
CCDS92  MDWGTLQTILGGVNKHSTSIGKIWLTVLFIFRIMILVVAAKEVWGDEQADFVCNTLQPG
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 CENVCYDKSFPISHVRFWVLQIIFVSVPTLLYLAHVFYVMRKEEKLNKKEEELKVAQTDG
       :.:::::. :::::.:.:.::.::::.:.::   :: :  :..::   :.. .:     :
CCDS92 CKNVCYDHYFPISHIRLWALQLIFVSTPALLVAMHVAY--RRHEK---KRKFIK-----G
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