Result of FASTA (ccds) for pF1KB9843
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9843, 366 aa
  1>>>pF1KB9843 366 - 366 aa - 366 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4195+/-0.00112; mu= 15.5987+/- 0.067
 mean_var=119.2336+/-39.583, 0's: 0 Z-trim(103.2): 270  B-trim: 947 in 2/48
 Lambda= 0.117456
 statistics sampled from 6888 (7286) to 6888 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.567), E-opt: 0.2 (0.224), width:  16
 Scan time:  2.640

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS2920.1 HTR1F gene_id:3355|Hs108|chr3           ( 366) 2385 416.1 2.4e-116
CCDS5006.1 HTR1E gene_id:3354|Hs108|chr6           ( 365) 1320 235.6 5.1e-62
CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6           ( 390) 1139 205.0   9e-53
CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1            ( 377) 1086 196.0 4.5e-50
CCDS33829.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3           ( 367)  656 123.1 3.8e-28
CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5          ( 422)  646 121.5 1.3e-27
CCDS2483.1 HTR2B gene_id:3357|Hs108|chr2           ( 481)  571 108.9 9.7e-24
CCDS7586.1 ADRB1 gene_id:153|Hs108|chr10           ( 477)  566 108.0 1.7e-23
CCDS7410.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10           ( 432)  517 99.7 5.2e-21
CCDS7409.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10           ( 445)  517 99.7 5.3e-21
CCDS7408.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10           ( 479)  517 99.7 5.5e-21
CCDS4347.1 ADRA1B gene_id:147|Hs108|chr5           ( 520)  501 97.0 3.8e-20
CCDS5936.1 HTR5A gene_id:3361|Hs108|chr7           ( 357)  477 92.8   5e-19
CCDS47004.1 ADRA2C gene_id:152|Hs108|chr4          ( 462)  468 91.4 1.7e-18
CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10          ( 465)  466 91.1 2.2e-18
CCDS83269.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8          ( 342)  462 90.2 2.8e-18
CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8           ( 429)  462 90.3 3.3e-18
CCDS6053.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8           ( 455)  462 90.4 3.4e-18
CCDS6054.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8           ( 466)  462 90.4 3.5e-18
CCDS34869.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8          ( 475)  462 90.4 3.5e-18
CCDS56129.1 ADRA2B gene_id:151|Hs108|chr2          ( 450)  436 85.9 7.2e-17
CCDS5843.1 CHRM2 gene_id:1129|Hs108|chr7           ( 466)  428 84.6 1.9e-16
CCDS44581.1 CHRM4 gene_id:1132|Hs108|chr11         ( 479)  424 83.9 3.1e-16
CCDS13079.1 ADRA1D gene_id:146|Hs108|chr20         ( 572)  423 83.9 3.8e-16
CCDS1616.1 CHRM3 gene_id:1131|Hs108|chr1           ( 590)  423 83.9 3.9e-16
CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5            ( 359)  416 82.4 6.5e-16
CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5           ( 397)  416 82.5 6.9e-16
CCDS14564.1 HTR2C gene_id:3358|Hs108|chrX          ( 458)  404 80.5 3.1e-15
CCDS4393.1 DRD1 gene_id:1812|Hs108|chr5            ( 446)  403 80.4 3.4e-15
CCDS10031.1 CHRM5 gene_id:1133|Hs108|chr15         ( 532)  401 80.1 4.9e-15
CCDS8361.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11           ( 443)  400 79.8 4.9e-15
CCDS8362.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11           ( 414)  399 79.6 5.3e-15
CCDS2604.1 HRH1 gene_id:3269|Hs108|chr3            ( 487)  398 79.6 6.5e-15
CCDS3405.1 DRD5 gene_id:1816|Hs108|chr4            ( 477)  396 79.2 8.2e-15
CCDS8040.1 CHRM1 gene_id:1128|Hs108|chr11          ( 460)  391 78.3 1.4e-14
CCDS9405.1 HTR2A gene_id:3356|Hs108|chr13          ( 471)  379 76.3   6e-14
CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6         ( 345)  372 75.0 1.1e-13
CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5            ( 413)  371 74.9 1.4e-13
CCDS34273.2 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5           ( 360)  366 74.0 2.3e-13
CCDS34271.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5           ( 378)  366 74.0 2.4e-13
CCDS34270.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5           ( 387)  366 74.0 2.4e-13
CCDS4291.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5            ( 388)  366 74.0 2.4e-13
CCDS75353.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5           ( 411)  366 74.0 2.5e-13
CCDS34272.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5           ( 428)  366 74.1 2.6e-13
CCDS5154.1 TAAR8 gene_id:83551|Hs108|chr6          ( 342)  362 73.3 3.6e-13
CCDS75520.1 TAAR9 gene_id:134860|Hs108|chr6        ( 348)  348 70.9 1.9e-12
CCDS11887.1 HRH4 gene_id:59340|Hs108|chr18         ( 390)  319 66.0 6.1e-11


>>CCDS2920.1 HTR1F gene_id:3355|Hs108|chr3                (366 aa)
 initn: 2385 init1: 2385 opt: 2385  Z-score: 2202.3  bits: 416.1 E(32554): 2.4e-116
Smith-Waterman score: 2385; 100.0% identity (100.0% similar) in 366 aa overlap (1-366:1-366)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MDFLNSSDQNLTSEELLNRMPSKILVSLTLSGLALMTTTINSLVIAAIIVTRKLHHPANY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 MDFLNSSDQNLTSEELLNRMPSKILVSLTLSGLALMTTTINSLVIAAIIVTRKLHHPANY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 LICSLAVTDFLVAVLVMPFSIVYIVRESWIMGQVVCDIWLSVDITCCTCSILHLSAIALD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 LICSLAVTDFLVAVLVMPFSIVYIVRESWIMGQVVCDIWLSVDITCCTCSILHLSAIALD
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 RYRAITDAVEYARKRTPKHAGIMITIVWIISVFISMPPLFWRHQGTSRDDECIIKHDHIV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 RYRAITDAVEYARKRTPKHAGIMITIVWIISVFISMPPLFWRHQGTSRDDECIIKHDHIV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 STIYSTFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKTLYHKRQASRIAKEEVNGQVLLESGEKSTKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 STIYSTFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKTLYHKRQASRIAKEEVNGQVLLESGEKSTKS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 VSTSYVLEKSLSDPSTDFDKIHSTVRSLRSEFKHEKSWRRQKISGTRERKAATTLGLILG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 VSTSYVLEKSLSDPSTDFDKIHSTVRSLRSEFKHEKSWRRQKISGTRERKAATTLGLILG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 AFVICWLPFFVKELVVNVCDKCKISEEMSNFLAWLGYLNSLINPLIYTIFNEDFKKAFQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 AFVICWLPFFVKELVVNVCDKCKISEEMSNFLAWLGYLNSLINPLIYTIFNEDFKKAFQK
              310       320       330       340       350       360

             
pF1KB9 LVRCRC
       ::::::
CCDS29 LVRCRC
             

>>CCDS5006.1 HTR1E gene_id:3354|Hs108|chr6                (365 aa)
 initn: 1326 init1: 650 opt: 1320  Z-score: 1227.0  bits: 235.6 E(32554): 5.1e-62
Smith-Waterman score: 1320; 57.0% identity (80.0% similar) in 365 aa overlap (10-365:5-362)

               10        20            30        40        50      
pF1KB9 MDFLNSSDQNLTSEELLNRMPS----KILVSLTLSGLALMTTTINSLVIAAIIVTRKLHH
                : :.:  .   :.    :.:. .::  .. .:: .:  :: :: .:.:::.
CCDS50      MNITNCTTEASMAIRPKTITEKMLICMTLVVITTLTTLLNLAVIMAIGTTKKLHQ
                    10        20        30        40        50     

         60        70        80        90       100       110      
pF1KB9 PANYLICSLAVTDFLVAVLVMPFSIVYIVRESWIMGQVVCDIWLSVDITCCTCSILHLSA
       :::::::::::::.::::::::.::.::: . : .:  .:..:::::.:::::::::: .
CCDS50 PANYLICSLAVTDLLVAVLVMPLSIIYIVMDRWKLGYFLCEVWLSVDMTCCTCSILHLCV
          60        70        80        90       100       110     

        120       130       140       150       160         170    
pF1KB9 IALDRYRAITDAVEYARKRTPKHAGIMITIVWIISVFISMPPLFWR-HQGTSRD-DECII
       :::::: :::.:.::::::: :.:..::  :: ::.:::::::::: :.  :   ..: :
CCDS50 IALDRYWAITNAIEYARKRTAKRAALMILTVWTISIFISMPPLFWRSHRRLSPPPSQCTI
         120       130       140       150       160       170     

          180       190       200       210        220       230   
pF1KB9 KHDHIVSTIYSTFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKTLYHKRQASR-IAKEEVNGQVLLES
       .:::.. :::::.:::::::.:::::::.::.:::.::.:: .:: .... ...:    .
CCDS50 QHDHVIYTIYSTLGAFYIPLTLILILYYRIYHAAKSLYQKRGSSRHLSNRSTDSQ----N
         180       190       200       210       220       230     

           240       250       260         270       280       290 
pF1KB9 GEKSTKSVSTSYVLEKSLSDPSTDFDKIHSTVR--SLRSEFKHEKSWRRQKISGTRERKA
       .  : : ..:  : . : :::.:.:.:.:...:   . ... :    .::.::.::::::
CCDS50 SFASCKLTQTFCVSDFSTSDPTTEFEKFHASIRIPPFDNDLDHPG--ERQQISSTRERKA
             240       250       260       270         280         

             300       310       320       330       340       350 
pF1KB9 ATTLGLILGAFVICWLPFFVKELVVNVCDKCKISEEMSNFLAWLGYLNSLINPLIYTIFN
       :  ::::::::.. :::::.:::.:.. .   .: :...::.::::.:::::::.:: ::
CCDS50 ARILGLILGAFILSWLPFFIKELIVGL-SIYTVSSEVADFLTWLGYVNSLINPLLYTSFN
     290       300       310        320       330       340        

             360        
pF1KB9 EDFKKAFQKLVRCRC  
       :::: ::.::.:::   
CCDS50 EDFKLAFKKLIRCREHT
      350       360     

>>CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6                (390 aa)
 initn: 1109 init1: 617 opt: 1139  Z-score: 1060.9  bits: 205.0 E(32554): 9e-53
Smith-Waterman score: 1139; 48.2% identity (75.6% similar) in 365 aa overlap (5-366:32-388)

                                         10        20        30    
pF1KB9                           MDFLNSSDQNLTSEELLNRMPSKILVSLTLSGLA
                                     : : ..   .. .. .: :.:. . :. ..
CCDS49 EEPGAQCAPPPPAGSETWVPQANLSSAPSQNCSAKDYIYQDSIS-LPWKVLLVMLLALIT
              10        20        30        40         50        60

           40        50        60        70        80        90    
pF1KB9 LMTTTINSLVIAAIIVTRKLHHPANYLICSLAVTDFLVAVLVMPFSIVYIVRESWIMGQV
       : ::  :..:::..  ::::: :::::: ::::::.::..::::.: .: :   : .:::
CCDS49 LATTLSNAFVIATVYRTRKLHTPANYLIASLAVTDLLVSILVMPISTMYTVTGRWTLGQV
               70        80        90       100       110       120

          100       110       120       130       140       150    
pF1KB9 VCDIWLSVDITCCTCSILHLSAIALDRYRAITDAVEYARKRTPKHAGIMITIVWIISVFI
       :::.::: :::::: ::::: .:::::: ::::::::. :::::.:..::..::..:. :
CCDS49 VCDFWLSSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDAVEYSAKRTPKRAAVMIALVWVFSISI
              130       140       150       160       170       180

          160        170       180       190       200       210   
pF1KB9 SMPPLFWRHQGTSRD-DECIIKHDHIVSTIYSTFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKTLYH
       :.::.:::.  . .. .::... :::. :.::: ::::.:  :.. :: .::  :..   
CCDS49 SLPPFFWRQAKAEEEVSECVVNTDHILYTVYSTVGAFYFPTLLLIALYGRIYVEARSRIL
              190       200       210       220       230       240

           220       230       240       250        260       270  
pF1KB9 KRQASRIAKEEVNGQVLLESGEKSTKSVSTSYVLEKSLSD-PSTDFDKIHSTVRSLRSEF
       :.  .: .:. . .:.. .:   ::.::..   ... . : :: . . .. .  ..:   
CCDS49 KQTPNRTGKRLTRAQLITDS-PGSTSSVTS---INSRVPDVPSESGSPVYVNQVKVRVS-
              250       260           270       280       290      

            280       290       300       310        320       330 
pF1KB9 KHEKSWRRQKISGTRERKAATTLGLILGAFVICWLPFFVKELVVNVC-DKCKISEEMSNF
         .   ...:. ..:::::. :::.:::::..::::::.  ::. .: : : .   . .:
CCDS49 --DALLEKKKLMAARERKATKTLGIILGAFIVCWLPFFIISLVMPICKDACWFHLAIFDF
           300       310       320       330       340       350   

             340       350       360        
pF1KB9 LAWLGYLNSLINPLIYTIFNEDFKKAFQKLVRCRC  
       ..:::::::::::.:::. :::::.::.::.: .:  
CCDS49 FTWLGYLNSLINPIIYTMSNEDFKQAFHKLIRFKCTS
           360       370       380       390

>>CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1                 (377 aa)
 initn: 1050 init1: 591 opt: 1086  Z-score: 1012.5  bits: 196.0 E(32554): 4.5e-50
Smith-Waterman score: 1086; 50.4% identity (77.4% similar) in 345 aa overlap (23-365:38-374)

                       10        20        30        40        50  
pF1KB9         MDFLNSSDQNLTSEELLNRMPSKILVSLTLSGLALMTTTINSLVIAAIIVTR
                                     :: ....:: ..: :.  :..:...:..::
CCDS23 AEGLPQEASNRSLNATETSEAWDPRTLQALKISLAVVLSVITLATVLSNAFVLTTILLTR
        10        20        30        40        50        60       

             60        70        80        90       100       110  
pF1KB9 KLHHPANYLICSLAVTDFLVAVLVMPFSIVYIVRESWIMGQVVCDIWLSVDITCCTCSIL
       ::: :::::: :::.::.::..::::.::.: . ..: .::..:::::: :::::: :::
CCDS23 KLHTPANYLIGSLATTDLLVSILVMPISIAYTITHTWNFGQILCDIWLSSDITCCTASIL
        70        80        90       100       110       120       

            120       130       140       150       160        170 
pF1KB9 HLSAIALDRYRAITDAVEYARKRTPKHAGIMITIVWIISVFISMPPLFWRHQGTSRD-DE
       :: .:::::: :::::.::...::  ::. ::.::: ::. ::.::::::.  .... ..
CCDS23 HLCVIALDRYWAITDALEYSKRRTAGHAATMIAIVWAISICISIPPLFWRQAKAQEEMSD
       130       140       150       160       170       180       

             180       190       200       210       220       230 
pF1KB9 CIIKHDHIVSTIYSTFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKTLYHKRQASRIAKEEVNGQVLL
       :... ..:  ::::: :::::: .:..::: .:::::..   .   :  .:. ...... 
CCDS23 CLVNTSQISYTIYSTCGAFYIPSVLLIILYGRIYRAARNRILN-PPSLYGKRFTTAHLIT
       190       200       210       220       230        240      

             240       250       260       270       280       290 
pF1KB9 ESGEKSTKSVSTSYVLEKSLSDPSTDFDKIHSTVRSLRSEFKHEKSWRRQKISGTRERKA
        :. .:  :...:    .: :  :  : . :  ..   : ..      :..::..:::::
CCDS23 GSAGSSLCSLNSSLHEGHSHSAGSPLFFN-HVKIKLADSALE------RKRISAARERKA
        250       260       270        280             290         

             300       310        320       330       340       350
pF1KB9 ATTLGLILGAFVICWLPFFVKELVVNVC-DKCKISEEMSNFLAWLGYLNSLINPLIYTIF
       .  ::.:::::.::::::::  ::. .: :.: :   . .:..:::::::::::.:::.:
CCDS23 TKILGIILGAFIICWLPFFVVSLVLPICRDSCWIHPALFDFFTWLGYLNSLINPIIYTVF
     300       310       320       330       340       350         

              360        
pF1KB9 NEDFKKAFQKLVRCRC  
       ::.:..::::.:  :   
CCDS23 NEEFRQAFQKIVPFRKAS
     360       370       

>>CCDS33829.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3                (367 aa)
 initn: 582 init1: 303 opt: 656  Z-score: 618.8  bits: 123.1 E(32554): 3.8e-28
Smith-Waterman score: 656; 34.0% identity (66.0% similar) in 344 aa overlap (27-364:33-367)

                   10        20        30        40        50      
pF1KB9     MDFLNSSDQNLTSEELLNRMPSKILVSLTLSGLALMTTTINSLVIAAIIVTRKLHH
                                     .:.  .: :  .  :.::  :..  : :. 
CCDS33 SLSQLSGHLNYTCGAENSTGASQARPHAYYALSYCALILAIVFGNGLVCMAVLKERALQT
             10        20        30        40        50        60  

         60        70        80          90       100       110    
pF1KB9 PANYLICSLAVTDFLVAVLVMPFSIVY--IVRESWIMGQVVCDIWLSVDITCCTCSILHL
        .:::. ::::.:.:::.::::. .::  ..   : .... ::.....:.  :: :::.:
CCDS33 TTNYLVVSLAVADLLVATLVMPW-VVYLEVTGGVWNFSRICCDVFVTLDVMMCTASILNL
             70        80         90       100       110       120 

          120       130          140       150       160       170 
pF1KB9 SAIALDRYRAITDAVEYAR---KRTPKHAGIMITIVWIISVFISMPPLFWRHQGTSRDDE
        ::..::: :..  :.: .   . . .....::: ::...  .: : ::   . :.    
CCDS33 CAISIDRYTAVVMPVHYQHGTGQSSCRRVALMITAVWVLAFAVSCPLLFG-FNTTGDPTV
             130       140       150       160       170        180

             180       190       200       210       220       230 
pF1KB9 CIIKHDHIVSTIYSTFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKTLYHKRQASRIAKEEVNGQVLL
       : :..  .:  :::.  .::.:... ...: .:: . :   .::  .:  . . :.   .
CCDS33 CSISNPDFV--IYSSVVSFYLPFGVTVLVYARIYVVLKQRRRKRILTR-QNSQCNS---V
                190       200       210       220        230       

              240       250       260       270       280       290
pF1KB9 ESG-EKSTKSVSTSYVLEKSLSDPSTDFDKIHSTVRSLRSEFKHEKSWRRQKISGTRERK
       . :  ..: : . ...  :   .   :        .   .:.:.:..  :...   ::.:
CCDS33 RPGFPQQTLSPDPAHLELKRYYSICQDTALGGPGFQERGGELKREEK-TRNSLMPLREKK
          240       250       260       270       280        290   

              300       310       320       330       340       350
pF1KB9 AATTLGLILGAFVICWLPFFVKELVVNVCDKCKISEEMSNFLAWLGYLNSLINPLIYTIF
       :.  ....::::..::::::. ... . :. :..: :. .  .::::.:: .::.::: :
CCDS33 ATQMVAIVLGAFIVCWLPFFLTHVLNTHCQTCHVSPELYSATTWLGYVNSALNPVIYTTF
           300       310       320       330       340       350   

              360      
pF1KB9 NEDFKKAFQKLVRCRC
       : .:.::: :.. :  
CCDS33 NIEFRKAFLKILSC  
           360         

>>CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5               (422 aa)
 initn: 904 init1: 484 opt: 646  Z-score: 609.0  bits: 121.5 E(32554): 1.3e-27
Smith-Waterman score: 867; 40.2% identity (69.0% similar) in 381 aa overlap (23-358:36-411)

                       10        20        30        40        50  
pF1KB9         MDFLNSSDQNLTSEELLNRMPSKILVSLTLSGLALMTTTINSLVIAAIIVTR
                                     ....:: :. : . ..  :. :.::: . :
CCDS34 PGQGNNTTSPPAPFETGGNTTGISDVTVSYQVITSLLLGTLIFCAVLGNACVVAAIALER
          10        20        30        40        50        60     

             60        70        80        90       100       110  
pF1KB9 KLHHPANYLICSLAVTDFLVAVLVMPFSIVYIVRESWIMGQVVCDIWLSVDITCCTCSIL
       .:.. ::::: ::::::..:.:::.:.. .: : ..: .:::.::.....:. ::: :::
CCDS34 SLQNVANYLIGSLAVTDLMVSVLVLPMAALYQVLNKWTLGQVTCDLFIALDVLCCTSSIL
          70        80        90       100       110       120     

            120       130       140       150       160         170
pF1KB9 HLSAIALDRYRAITDAVEYARKRTPKHAGIMITIVWIISVFISMPPLF-WRH-QGTSRDD
       :: ::::::: :::: ..:. ::::..:. .:...:.:. .::.::.. ::  .  :  :
CCDS34 HLCAIALDRYWAITDPIDYVNKRTPRRAAALISLTWLIGFLISIPPMLGWRTPEDRSDPD
         130       140       150       160       170       180     

              180       190       200       210                    
pF1KB9 ECIIKHDHIVSTIYSTFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKTLYHK------------RQAS
        : :..::   ::::::::::::: :.:.:: .:.:::.   .:            :...
CCDS34 ACTISKDHGY-TIYSTFGAFYIPLLLMLVLYGRIFRAARFRIRKTVKKVEKTGADTRHGA
         190        200       210       220       230       240    

      220          230                240       250       260      
pF1KB9 RIA---KEEVNGQVLLESGEKSTK---------SVSTSYVLEKSLSDPSTDFDKIHSTVR
         :   :. :::    ::: .. .         .. .. ..... .  . .  ..: .  
CCDS34 SPAPQPKKSVNG----ESGSRNWRLGVESKAGGALCANGAVRQGDDGAALEVIEVHRVGN
          250           260       270       280       290       300

             270                    280       290       300        
pF1KB9 S-----LRSE----------F--KHEKSWR-RQKISGTRERKAATTLGLILGAFVICWLP
       :     : ::          :  :.:.. . ..:.. .::::.. :::.:.:.:..::::
CCDS34 SKEHLPLPSEAGPTPCAPASFERKNERNAEAKRKMALARERKTVKTLGIIMGTFILCWLP
              310       320       330       340       350       360

      310       320        330       340       350       360       
pF1KB9 FFVKELVVNVCDK-CKISEEMSNFLAWLGYLNSLINPLIYTIFNEDFKKAFQKLVRCRC 
       ::.  ::.  :.. :..   .. .. :::: :::.::.::. ::.::..::         
CCDS34 FFIVALVLPFCESSCHMPTLLGAIINWLGYSNSLLNPVIYAYFNKDFQNAFKKIIKCKFC
              370       380       390       400       410       420

CCDS34 RQ
         

>>CCDS2483.1 HTR2B gene_id:3357|Hs108|chr2                (481 aa)
 initn: 539 init1: 160 opt: 571  Z-score: 539.7  bits: 108.9 E(32554): 9.7e-24
Smith-Waterman score: 571; 30.3% identity (65.0% similar) in 346 aa overlap (33-364:62-397)

             10        20        30        40          50        60
pF1KB9 FLNSSDQNLTSEELLNRMPSKILVSLTLSGLALMTTTI--NSLVIAAIIVTRKLHHPANY
                                     : ..  ::  :.::: :. . .::.. .::
CCDS24 SGLQTESIPEEMKQIVEEQGNKLHWAALLILMVIIPTIGGNTLVILAVSLEKKLQYATNY
              40        50        60        70        80        90 

               70        80         90       100       110         
pF1KB9 LICSLAVTDFLVAVLVMPFSIVYIVRES-WIMGQVVCDIWLSVDITCCTCSILHLSAIAL
       .. ::::.:.::...:::.... :. :. : .  :.:  :: .:.   : ::.:: ::..
CCDS24 FLMSLAVADLLVGLFVMPIALLTIMFEAMWPLPLVLCPAWLFLDVLFSTASIMHLCAISV
             100       110       120       130       140       150 

     120       130       140       150        160       170        
pF1KB9 DRYRAITDAVEYARKRTPKHAGIMITIVWIISVFISMP-PLFWRHQGTSRDDE----CII
       ::: ::   ..  .  .   : : ::.::.::. :..: :.  .   :. :.     :..
CCDS24 DRYIAIKKPIQANQYNSRATAFIKITVVWLISIGIAIPVPI--KGIETDVDNPNNITCVL
             160       170       180       190         200         

          180        190       200       210          220       230
pF1KB9 KHDHIVS-TIYSTFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKT---LYHKRQASRIAKEEVNGQVL
        .... .  ......::. :::.... :.   .: .    : ...  .:..   :.  ..
CCDS24 TKERFGDFMLFGSLAAFFTPLAIMIVTYFLTIHALQKKAYLVKNKPPQRLTWLTVS--TV
     210       220       230       240       250       260         

              240       250       260       270       280       290
pF1KB9 LESGEKSTKSVSTSYVLEKSLSDPSTDFDKIHSTVRSLRSEFKHEKSWRRQKISGTRERK
       ..  :   .:     .:. : .: .   .  .. .:  :.    .::   : ::.  :..
CCDS24 FQRDETPCSSPEKVAMLDGSRKDKALPNSGDETLMR--RTSTIGKKSV--QTISN--EQR
       270       280       290       300         310           320 

              300       310       320         330       340        
pF1KB9 AATTLGLILGAFVICWLPFFVKELVVNVCDKCKIS--EEMSNFLAWLGYLNSLINPLIYT
       :. .::...  :.. : :::. .... .::.:. .  . . ....:.::..: .:::.::
CCDS24 ASKVLGIVFFLFLLMWCPFFITNITLVLCDSCNQTTLQMLLEIFVWIGYVSSGVNPLVYT
             330       340       350       360       370       380 

      350       360                                                
pF1KB9 IFNEDFKKAFQKLVRCRC                                          
       .::. :. :: . . :                                            
CCDS24 LFNKTFRDAFGRYITCNYRATKSVKTLRKRSSKIYFRNPMAENSKFFKKHGIRNGINPAM
             390       400       410       420       430       440 

>>CCDS7586.1 ADRB1 gene_id:153|Hs108|chr10                (477 aa)
 initn: 508 init1: 289 opt: 566  Z-score: 535.1  bits: 108.0 E(32554): 1.7e-23
Smith-Waterman score: 566; 31.8% identity (60.5% similar) in 352 aa overlap (26-364:61-393)

                    10        20        30        40        50     
pF1KB9      MDFLNSSDQNLTSEELLNRMPSKILVSLTLSGLALMTTTINSLVIAAIIVTRKLH
                                     ..: .. ..:. .. : :::.::  : .:.
CCDS75 RLLVPASPPASLLPPASESPEPLSQQWTAGMGLLMALIVLLIVAGNVLVIVAIAKTPRLQ
               40        50        60        70        80        90

          60        70        80        90       100       110     
pF1KB9 HPANYLICSLAVTDFLVAVLVMPFSIVYIVRESWIMGQVVCDIWLSVDITCCTCSILHLS
         .: .: ::: .:.....::.::. . .:   : .:.  :..: :::. : : ::  : 
CCDS75 TLTNLFIMSLASADLVMGLLVVPFGATIVVWGRWEYGSFFCELWTSVDVLCVTASIETLC
              100       110       120       130       140       150

         120       130       140       150       160               
pF1KB9 AIALDRYRAITDAVEYARKRTPKHAGIMITIVWIISVFISMPPLF---WRHQGTS-----
       .:::::: :::.  .:    :  .:  ..  :: ::...:. :..   :: ..       
CCDS75 VIALDRYLAITSPFRYQSLLTRARARGLVCTVWAISALVSFLPILMHWWRAESDEARRCY
              160       170       180       190       200       210

       170       180          190       200       210       220    
pF1KB9 RDDECIIKHDHIVSTIY---STFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKTLYHKRQASRIAKEE
        : .:    : ...  :   :.  .::.:: .. ..: ...: :.     .:...: . :
CCDS75 NDPKCC---DFVTNRAYAIASSVVSFYVPLCIMAFVYLRVFREAQ-----KQVKKIDSCE
                 220       230       240       250            260  

          230       240       250       260       270       280    
pF1KB9 VNGQVLLESGEKSTKSVSTSYVLEKSLSDPSTDFDKIHSTVRSLRSEFKHEKSWRRQ--K
             . .:     : : : :       :.      . .. .  . . . .. .:.  .
CCDS75 RR----FLGGPARPPSPSPSPV-----PAPAPPPGPPRPAAAAATAPLANGRAGKRRPSR
                270       280            290       300       310   

            290       300       310       320       330       340  
pF1KB9 ISGTRERKAATTLGLILGAFVICWLPFFVKELVVNVCDKCKISEEMSNFLAWLGYLNSLI
       . . ::.::  :::.:.:.:..::::::. . ::..  .  . ...  :. :::: :: .
CCDS75 LVALREQKALKTLGIIMGVFTLCWLPFFLAN-VVKAFHRELVPDRLFVFFNWLGYANSAF
           320       330       340        350       360       370  

            350       360                                          
pF1KB9 NPLIYTIFNEDFKKAFQKLVRCRC                                    
       ::.::   . ::.:::: :. :                                      
CCDS75 NPIIYC-RSPDFRKAFQGLLCCARRAARRRHATHGDRPRASGCLARPGPPPSPGAASDDD
             380       390       400       410       420       430 

>>CCDS7410.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10                (432 aa)
 initn: 610 init1: 224 opt: 517  Z-score: 490.7  bits: 99.7 E(32554): 5.2e-21
Smith-Waterman score: 735; 37.2% identity (66.8% similar) in 349 aa overlap (23-365:81-402)

                       10        20        30        40        50  
pF1KB9         MDFLNSSDQNLTSEELLNRMPSKILVSLTLSGLALMTTTINSLVIAAIIVTR
                                     :....  :. ..:.: . : ::. ..  ..
CCDS74 EVTASPAPTWDAPPDNASGCGEQINYGRVEKVVIGSILTLITLLTIAGNCLVVISVCFVK
               60        70        80        90       100       110

             60        70         80        90       100       110 
pF1KB9 KLHHPANYLICSLAVTDFLVAVLVMPF-SIVYIVRESWIMGQVVCDIWLSVDITCCTCSI
       ::..:.:::: :::..:. ::: :::: :.. ..  .::.:.  :......:. ::: ::
CCDS74 KLRQPSNYLIVSLALADLSVAVAVMPFVSVTDLIGGKWIFGHFFCNVFIAMDVMCCTASI
              120       130       140       150       160       170

             120       130       140       150       160       170 
pF1KB9 LHLSAIALDRYRAITDAVEYARKRTPKHAGIMITIVWIISVFISMPPLFWRHQGTSRDDE
       . : .:..::: .::  . :  ... :  . ::  ::..:. :..::::   :... :  
CCDS74 MTLCVISIDRYLGITRPLTYPVRQNGKCMAKMILSVWLLSASITLPPLFGWAQNVNDDKV
              180       190       200       210       220       230

             180       190       200       210       220       230 
pF1KB9 CIIKHDHIVSTIYSTFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKTLYHKRQASRIAKEEVNGQVLL
       :.:..: .  :::::  :::::....:..::.::.::.    :..   . . : .. . :
CCDS74 CLISQD-FGYTIYSTAVAFYIPMSVMLFMYYQIYKAARKSAAKHKFPGFPRVEPDSVIAL
               240       250       260       270       280         

             240       250       260       270       280        290
pF1KB9 ESGEKSTKSVSTSYVLEKSLSDPSTDFDKIHSTVRSLRSEFKHEKSWRRQKISG-TRERK
       ..  :  : :     : . :                     :::    :..::   ::.:
CCDS74 NGIVKLQKEVEECANLSRLL---------------------KHE----RKNISIFKREQK
     290       300                            310           320    

              300       310           320       330       340      
pF1KB9 AATTLGLILGAFVICWLPFFV----KELVVNVCDKCKISEEMSNFLAWLGYLNSLINPLI
       ::::::.:.:::..::::::.    . .. ..  .:       .:: :::: ::::::.:
CCDS74 AATTLGIIVGAFTVCWLPFFLLSTARPFICGTSCSCIPLWVERTFL-WLGYANSLINPFI
          330       340       350       360       370        380   

        350       360                                   
pF1KB9 YTIFNEDFKKAFQKLVRCRC                             
       :..::.:.. ....:..:.                              
CCDS74 YAFFNRDLRTTYRSLLQCQYRNINRKLSAAGMHEALKLAERPERPEFVL
           390       400       410       420       430  

>>CCDS7409.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10                (445 aa)
 initn: 610 init1: 224 opt: 517  Z-score: 490.6  bits: 99.7 E(32554): 5.3e-21
Smith-Waterman score: 735; 37.2% identity (66.8% similar) in 349 aa overlap (23-365:81-402)

                       10        20        30        40        50  
pF1KB9         MDFLNSSDQNLTSEELLNRMPSKILVSLTLSGLALMTTTINSLVIAAIIVTR
                                     :....  :. ..:.: . : ::. ..  ..
CCDS74 EVTASPAPTWDAPPDNASGCGEQINYGRVEKVVIGSILTLITLLTIAGNCLVVISVCFVK
               60        70        80        90       100       110

             60        70         80        90       100       110 
pF1KB9 KLHHPANYLICSLAVTDFLVAVLVMPF-SIVYIVRESWIMGQVVCDIWLSVDITCCTCSI
       ::..:.:::: :::..:. ::: :::: :.. ..  .::.:.  :......:. ::: ::
CCDS74 KLRQPSNYLIVSLALADLSVAVAVMPFVSVTDLIGGKWIFGHFFCNVFIAMDVMCCTASI
              120       130       140       150       160       170

             120       130       140       150       160       170 
pF1KB9 LHLSAIALDRYRAITDAVEYARKRTPKHAGIMITIVWIISVFISMPPLFWRHQGTSRDDE
       . : .:..::: .::  . :  ... :  . ::  ::..:. :..::::   :... :  
CCDS74 MTLCVISIDRYLGITRPLTYPVRQNGKCMAKMILSVWLLSASITLPPLFGWAQNVNDDKV
              180       190       200       210       220       230

             180       190       200       210       220       230 
pF1KB9 CIIKHDHIVSTIYSTFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKTLYHKRQASRIAKEEVNGQVLL
       :.:..: .  :::::  :::::....:..::.::.::.    :..   . . : .. . :
CCDS74 CLISQD-FGYTIYSTAVAFYIPMSVMLFMYYQIYKAARKSAAKHKFPGFPRVEPDSVIAL
               240       250       260       270       280         

             240       250       260       270       280        290
pF1KB9 ESGEKSTKSVSTSYVLEKSLSDPSTDFDKIHSTVRSLRSEFKHEKSWRRQKISG-TRERK
       ..  :  : :     : . :                     :::    :..::   ::.:
CCDS74 NGIVKLQKEVEECANLSRLL---------------------KHE----RKNISIFKREQK
     290       300                            310           320    

              300       310           320       330       340      
pF1KB9 AATTLGLILGAFVICWLPFFV----KELVVNVCDKCKISEEMSNFLAWLGYLNSLINPLI
       ::::::.:.:::..::::::.    . .. ..  .:       .:: :::: ::::::.:
CCDS74 AATTLGIIVGAFTVCWLPFFLLSTARPFICGTSCSCIPLWVERTFL-WLGYANSLINPFI
          330       340       350       360       370        380   

        350       360                                              
pF1KB9 YTIFNEDFKKAFQKLVRCRC                                        
       :..::.:.. ....:..:.                                         
CCDS74 YAFFNRDLRTTYRSLLQCQYRNINRKLSAAGMHEALKLAERPERPEFVLQNADYCRKKGH
           390       400       410       420       430       440   




366 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Fri Nov  4 19:40:49 2016 done: Fri Nov  4 19:40:50 2016
 Total Scan time:  2.640 Total Display time:  0.050

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com