Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9835
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9835, 350 aa
1>>>pF1KB9835 350 - 350 aa - 350 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7202+/-0.00123; mu= 13.9363+/- 0.072
mean_var=122.8052+/-38.427, 0's: 0 Z-trim(103.5): 266 B-trim: 1039 in 2/46
Lambda= 0.115735
statistics sampled from 7030 (7457) to 7030 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.57), E-opt: 0.2 (0.229), width: 16
Scan time: 2.590
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 2328 400.6 9.9e-112
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 ( 360) 1767 307.0 1.6e-83
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 877 158.4 8.8e-39
CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 368) 791 144.0 1.8e-34
CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 415) 791 144.1 2e-34
CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 ( 360) 775 141.4 1.2e-33
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 754 137.9 1.3e-32
CCDS33295.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 356) 751 137.3 1.8e-32
CCDS46420.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 352) 745 136.3 3.6e-32
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 737 135.0 9.3e-32
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 737 135.0 9.5e-32
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 717 131.7 9.4e-31
CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 372) 715 131.4 1.2e-30
CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 378) 715 131.4 1.2e-30
CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 360) 697 128.3 9.6e-30
CCDS2706.1 ACKR2 gene_id:1238|Hs108|chr3 ( 384) 696 128.2 1.1e-29
CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 374) 695 128.0 1.2e-29
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 668 123.5 2.7e-28
CCDS3075.1 ACKR4 gene_id:51554|Hs108|chr3 ( 350) 656 121.5 1.1e-27
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 652 120.8 1.7e-27
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 647 120.0 3.1e-27
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 376) 647 120.0 3.2e-27
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 612 114.1 1.8e-25
CCDS43069.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 ( 355) 611 114.0 2e-25
CCDS54571.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 ( 387) 611 114.0 2.1e-25
CCDS11435.1 CCR10 gene_id:2826|Hs108|chr17 ( 362) 542 102.5 5.9e-22
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 538 101.8 9.4e-22
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 538 101.8 9.9e-22
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 538 101.8 1e-21
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 535 101.3 1.4e-21
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 532 100.8 1.9e-21
CCDS2735.1 CXCR6 gene_id:10663|Hs108|chr3 ( 342) 531 100.6 2e-21
CCDS9942.1 BDKRB2 gene_id:624|Hs108|chr14 ( 391) 530 100.5 2.5e-21
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 529 100.3 2.8e-21
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 529 100.3 2.8e-21
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 529 100.3 2.8e-21
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 529 100.3 2.9e-21
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 529 100.3 2.9e-21
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 529 100.3 2.9e-21
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 529 100.4 2.9e-21
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 529 100.4 2.9e-21
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 529 100.4 3.1e-21
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 529 100.4 3.3e-21
CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18 ( 349) 521 98.9 6.6e-21
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX ( 370) 512 97.5 1.9e-20
CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 ( 344) 509 96.9 2.6e-20
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 504 96.1 4.8e-20
CCDS1405.1 GPR25 gene_id:2848|Hs108|chr1 ( 361) 499 95.3 8.6e-20
CCDS13556.1 OPRL1 gene_id:4987|Hs108|chr20 ( 370) 498 95.1 9.8e-20
CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 ( 372) 498 95.1 9.8e-20
>>CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 (350 aa)
initn: 2328 init1: 2328 opt: 2328 Z-score: 2119.4 bits: 400.6 E(32554): 9.9e-112
Smith-Waterman score: 2328; 100.0% identity (100.0% similar) in 350 aa overlap (1-350:1-350)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MSNITDPQMWDFDDLNFTGMPPADEDYSPCMLETETLNKYVVIIAYALVFLLSLLGNSLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 MSNITDPQMWDFDDLNFTGMPPADEDYSPCMLETETLNKYVVIIAYALVFLLSLLGNSLV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 MLVILYSRVGRSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAASKVNGWIFGTFLCKVVSLLKEVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 MLVILYSRVGRSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAASKVNGWIFGTFLCKVVSLLKEVN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 FYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLTQKRHLVKFVCLGCWGLSMNLSLPFFLFRQAYHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 FYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLTQKRHLVKFVCLGCWGLSMNLSLPFFLFRQAYHP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 NNSSPVCYEVLGNDTAKWRMVLRILPHTFGFIVPLFVMLFCYGFTLRTLFKAHMGQKHRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 NNSSPVCYEVLGNDTAKWRMVLRILPHTFGFIVPLFVMLFCYGFTLRTLFKAHMGQKHRA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 MRVIFAVVLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQESCERRNNIGRALDATEILGFLHSCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 MRVIFAVVLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQESCERRNNIGRALDATEILGFLHSCL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB9 NPIIYAFIGQNFRHGFLKILAMHGLVSKEFLARHRVTSYTSSSVNVSSNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 NPIIYAFIGQNFRHGFLKILAMHGLVSKEFLARHRVTSYTSSSVNVSSNL
310 320 330 340 350
>>CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 (360 aa)
initn: 1757 init1: 1757 opt: 1767 Z-score: 1613.0 bits: 307.0 E(32554): 1.6e-83
Smith-Waterman score: 1767; 78.0% identity (90.5% similar) in 346 aa overlap (10-350:15-360)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MSNITDPQMWDFDDL-NFT---GMPPADEDYSPCMLETETLNKYVVIIAYALVFL
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CCDS24 MEDFNMESDSFEDFWKGEDLSNYSYSSTLPPFLLDAAPCEPESLEINKYFVVIIYALVFL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 LSLLGNSLVMLVILYSRVGRSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAASKVNGWIFGTFLCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 LSLLGNSLVMLVILYSRVGRSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAASKVNGWIFGTFLCK
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 VVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLTQKRHLVKFVCLGCWGLSMNLSLPF
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CCDS24 VVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLTQKRYLVKFICLSIWGLSLLLALPV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 FLFRQAYHPNNSSPVCYEVLGNDTAKWRMVLRILPHTFGFIVPLFVMLFCYGFTLRTLFK
.:::.. . .: ::.::: .::.::.:::.:::::..:::::::..::::::::::::::
CCDS24 LLFRRTVYSSNVSPACYEDMGNNTANWRMLLRILPQSFGFIVPLLIMLFCYGFTLRTLFK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 AHMGQKHRAMRVIFAVVLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQESCERRNNIGRALDATE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.: :::::::
CCDS24 AHMGQKHRAMRVIFAVVLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQETCERRNHIDRALDATE
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 ILGFLHSCLNPIIYAFIGQNFRHGFLKILAMHGLVSKEFLARHRVTSYT-SSSVNVSSNL
:::.:::::::.:::::::.::::.:::::.:::.::. : . :.. ::: ..:..:
CCDS24 ILGILHSCLNPLIYAFIGQKFRHGLLKILAIHGLISKDSLPKDSRPSFVGSSSGHTSTTL
310 320 330 340 350 360
>>CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 (374 aa)
initn: 808 init1: 232 opt: 877 Z-score: 809.7 bits: 158.4 E(32554): 8.8e-39
Smith-Waterman score: 877; 42.5% identity (75.5% similar) in 327 aa overlap (2-320:9-331)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MSNITDPQMWDFDDLNFTGMPPADEDYSPCML-ETETLNKYVVIIAYALVFLL
:.. : . : ..: :.. .: .. : : :.. ... : :::.:. ..
CCDS52 MSGESMNFSDVFDSSEDYFVSVN-TSYYSVDSEMLLCSLQEVRQFSRLFVPIAYSLICVF
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 SLLGNSLVMLVILYSRVGRSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAASKVNG-WIFGTFLCK
.:::: ::.... . . .::.:::::::.:.::.::.::::.::.:...: :.:.. ::
CCDS52 GLLGNILVVITFAFYKKARSMTDVYLLNMAIADILFVLTLPFWAVSHATGAWVFSNATCK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KB9 VVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLTQKRHLV---KFVCLGCWGLSMNLS
... . .:: :.:::.:::.:::.:::.::... . . . :..:: ::::. .:
CCDS52 LLKGIYAINFNCGMLLLTCISMDRYIAIVQATKSFRLRSRTLPRSKIICLVVWGLSVIIS
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 LPFFLFRQAYHPNNSSPVC---YEVLGNDTAKWRMVLRILPHTFGFIVPLFVMLFCYGFT
:.: : :. ...: :: :... .. .:.... : :::..::. :.::: :
CCDS52 SSTFVFNQKYN-TQGSDVCEPKYQTV-SEPIRWKLLMLGLELLFGFFIPLMFMIFCYTFI
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 LRTLFKAHMGQKHRAMRVIFAVVLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQESCERRNNIGR
..:: .:. ...:.:.:::.::::.:: : .:.:.:::. : ...::. .. ::
CCDS52 VKTLVQAQNSKRHKAIRVIIAVVLVFLACQIPHNMVLLV-TAANLGKMNRSCQSEKLIGY
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 ALDATEILGFLHSCLNPIIYAFIGQNFRHGFLKILAMHGLVSKEFLARHRVTSYTSSSVN
. .::.:.::: ::::..::::::.::. :::::
CCDS52 TKTVTEVLAFLHCCLNPVLYAFIGQKFRNYFLKILKDLWCVRRKYKSSGFSCAGRYSENI
300 310 320 330 340 350
350
pF1KB9 VSSNL
CCDS52 SRQTSETADNDNASSFTM
360 370
>>CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX (368 aa)
initn: 774 init1: 369 opt: 791 Z-score: 732.2 bits: 144.0 E(32554): 1.8e-34
Smith-Waterman score: 791; 40.2% identity (68.0% similar) in 331 aa overlap (21-348:41-361)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MSNITDPQMWDFDDLNFTGMPPADEDYSPCMLETETLNKYVVIIAYALVF
:: .:.: .... . :.:.:
CCDS14 LNDAEVAALLENFSSSYDYGENESDSCCTSPPCPQDFS------LNFDRAFLPALYSLLF
20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 LLSLLGNSLVMLVILYSRVGRSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAASKVNGWIFGTFLC
::.::::. : :.: :.. : ::..::.::.:: :..::::.::.. . :.::. ::
CCDS14 LLGLLGNGAVAAVLLSRRTALSSTDTFLLHLAVADTLLVLTLPLWAVDAAVQWVFGSGLC
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160
pF1KB9 KVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLTQKRHL-VKFVCLGCWGLSMNLSL
::.. : ..:::.: ::::::: :::: :::::. . : ..::. ::: . ..:
CCDS14 KVAGALFNINFYAGALLLACISFDRYLNIVHATQLYRRGPPARVTLTCLAVWGLCLLFAL
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 PFFLFRQAYHPN--NSSPVCYEVLGNDTAKWRMVLRILPHTFGFIVPLFVMLFCYGFTLR
: :.: .:.: . :.. : : : .::.: . ::..::.:: .::. :
CCDS14 PDFIFLSAHHDERLNATHCQY----NFPQVGRTALRVLQLVAGFLLPLLVMAYCYAHILA
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 TLFKAHMGQKHRAMRVIFAVVLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQESCERRNNIGRAL
.:. .. .. ::::.. .::. : ::: ::.::.:.: :: .. ..: :.. . :
CCDS14 VLLVSRGQRRLRAMRLVVVVVVAFALCWTPYHLVVLVDILMDLGALARNCGRESRVDVAK
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 DATEILGFLHSCLNPIIYAFIGQNFRHGFLKILAMHGLVSKEFLARHRVTSYTSSSVNVS
..: ::..: ::::..:::.: .::. . .: : ... : :. .: .:: . .
CCDS14 SVTSGLGYMHCCLNPLLYAFVGVKFRERMWMLLLRLGCPNQRGLQRQPSSSRRDSSWSET
310 320 330 340 350 360
350
pF1KB9 SNL
:
CCDS14 SEASYSGL
>>CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX (415 aa)
initn: 774 init1: 369 opt: 791 Z-score: 731.6 bits: 144.1 E(32554): 2e-34
Smith-Waterman score: 791; 40.2% identity (68.0% similar) in 331 aa overlap (21-348:88-408)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MSNITDPQMWDFDDLNFTGMPPADEDYSPCMLETETLNKYVVIIAYALVF
:: .:.: .... . :.:.:
CCDS48 LNDAEVAALLENFSSSYDYGENESDSCCTSPPCPQDFS------LNFDRAFLPALYSLLF
60 70 80 90 100 110
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 LLSLLGNSLVMLVILYSRVGRSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAASKVNGWIFGTFLC
::.::::. : :.: :.. : ::..::.::.:: :..::::.::.. . :.::. ::
CCDS48 LLGLLGNGAVAAVLLSRRTALSSTDTFLLHLAVADTLLVLTLPLWAVDAAVQWVFGSGLC
120 130 140 150 160 170
120 130 140 150 160
pF1KB9 KVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLTQKRHL-VKFVCLGCWGLSMNLSL
::.. : ..:::.: ::::::: :::: :::::. . : ..::. ::: . ..:
CCDS48 KVAGALFNINFYAGALLLACISFDRYLNIVHATQLYRRGPPARVTLTCLAVWGLCLLFAL
180 190 200 210 220 230
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 PFFLFRQAYHPN--NSSPVCYEVLGNDTAKWRMVLRILPHTFGFIVPLFVMLFCYGFTLR
: :.: .:.: . :.. : : : .::.: . ::..::.:: .::. :
CCDS48 PDFIFLSAHHDERLNATHCQY----NFPQVGRTALRVLQLVAGFLLPLLVMAYCYAHILA
240 250 260 270 280
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 TLFKAHMGQKHRAMRVIFAVVLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQESCERRNNIGRAL
.:. .. .. ::::.. .::. : ::: ::.::.:.: :: .. ..: :.. . :
CCDS48 VLLVSRGQRRLRAMRLVVVVVVAFALCWTPYHLVVLVDILMDLGALARNCGRESRVDVAK
290 300 310 320 330 340
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 DATEILGFLHSCLNPIIYAFIGQNFRHGFLKILAMHGLVSKEFLARHRVTSYTSSSVNVS
..: ::..: ::::..:::.: .::. . .: : ... : :. .: .:: . .
CCDS48 SVTSGLGYMHCCLNPLLYAFVGVKFRERMWMLLLRLGCPNQRGLQRQPSSSRRDSSWSET
350 360 370 380 390 400
350
pF1KB9 SNL
:
CCDS48 SEASYSGL
410
>>CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 (360 aa)
initn: 676 init1: 560 opt: 775 Z-score: 717.9 bits: 141.4 E(32554): 1.2e-33
Smith-Waterman score: 775; 38.4% identity (70.3% similar) in 320 aa overlap (3-320:2-319)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MSNITDPQMWDFDDLNFTGMPPADEDYSPCMLE-TETLNKYVVIIAYALVFLLSLLGNSL
: :: .:. .... . .:: : ..... . :.:::...:::::.
CCDS26 MNPTDIADTTLDESIYSNYYLYESIPKPCTKEGIKAFGELFLPPLYSLVFVFGLLGNSV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 VMLVILYSRVGRSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAASKVNGWIFGTFLCKVVSLLKEV
:.::.. . ::.:::::::::..::::...::.:. .. :.:: :::..: . :
CCDS26 VVLVLFKYKRLRSMTDVYLLNLAISDLLFVFSLPFWGYYAADQWVFGLGLCKMISWMYLV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 NFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLTQKRHLVKFVC-LGCWGLSMNLSLPFFLFRQAY
.:::::... .:.:::::::::. .: . . :. :.... ::: ::: :
CCDS26 GFYSGIFFVMLMSIDRYLAIVHAVFSLRARTLTYGVITSLATWSVAVFASLPGFLFSTCY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 HPNNSSPVCYEVLGNDTAKWRMVLRILPHTFGFIVPLFVMLFCYGFTLRTLFKAHMGQKH
: . : . ... :... . . .:...:: .:::::.. .::: . . .:.
CCDS26 TERNHT-YCKTKYSLNSTTWKVLSSLEINILGLVIPLGIMLFCYSMIIRTLQHCKNEKKN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 RAMRVIFAVVLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQESCERRNNIGRALDATEILGFLHS
.:...:::::..:: : :::.::. .::.. .:.:. : . . :..::: :.:.:
CCDS26 KAVKMIFAVVVLFLGFWTPYNIVLFLETLVELEVLQD-CTFERYLDYAIQATETLAFVHC
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 CLNPIIYAFIGQNFRHGFLKILAMHGLVSKEFLARHRVTSYTSSSVNVSSNL
::::::: :.:..::. .:...
CCDS26 CLNPIIYFFLGEKFRKYILQLFKTCRGLFVLCQYCGLLQIYSADTPSSSYTQSTMDHDLH
300 310 320 330 340 350
>>CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 (372 aa)
initn: 701 init1: 362 opt: 754 Z-score: 698.8 bits: 137.9 E(32554): 1.3e-32
Smith-Waterman score: 754; 36.8% identity (68.0% similar) in 359 aa overlap (1-349:11-365)
10 20 30 40
pF1KB9 MSNITDPQMWDFDDL-NFTGMPPADEDYSPCMLETETLNKYVVI---IAY
. :. : .:..: : :.. ... : : . .. .. .::
CCDS84 MNYPLTLEMDLENLED-LFWELDRLDNYNDTSLVENHLCPAT-EGPLMASFKAVFVPVAY
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 ALVFLLSLLGNSLVMLVILYSRVGRSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAASKVNGWIFG
.:.:::...:: ::.... : :: :...:..::.::::... ::. .: ::..:
CCDS84 SLIFLLGVIGNVLVLVILERHRQTRSSTETFLFHLAVADLLLVFILPFAVAEGSVGWVLG
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 TFLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLTQKRHL-VKFVCLGCWGLSM
:::::.: :..:::: . ::::::.::::::::::... ..: : ....: : ...
CCDS84 TFLCKTVIALHKVNFYCSSLLLACIAVDRYLAIVHAVHAYRHRRLLSIHITCGTIWLVGF
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 NLSLPFFLFRQAY--HPNNSSPVCYEVLGN--DTAKWRMVLRILPHTFGFIVPLFVMLFC
:.:: .:: .. : ::: : : : .: : .. :.: :. ::..:..:: .:
CCDS84 LLALPEILFAKVSQGHHNNSLPRCTFSQENQAETHAW-FTSRFLYHVAGFLLPMLVMGWC
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 YGFTLRTLFKAHM-GQKHRAMRVIFAVVLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQESCERR
: ... : .:. :...:.:: . :. ::.::: ::..:.. ::: : ......:.
CCDS84 YVGVVHRLRQAQRRPQRQKAVRVAILVTSIFFLCWSPYHIVIFLDTLARLKAVDNTCKLN
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 NNIGRALDATEILGFLHSCLNPIIYAFIGQNFRHGFLKILAMHGLVSKEFLARHRVTSYT
... :. :.::. : ::::..:.: : .:: . ..:. : .. : . :.
CCDS84 GSLPVAITMCEFLGLAHCCLNPMLYTFAGVKFRSDLSRLLTKLGCTGPASLCQL-FPSWR
300 310 320 330 340 350
350
pF1KB9 SSSVNVSSNL
::.. : :
CCDS84 RSSLSESENATSLTTF
360 370
>>CCDS33295.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 (356 aa)
initn: 673 init1: 391 opt: 751 Z-score: 696.3 bits: 137.3 E(32554): 1.8e-32
Smith-Waterman score: 751; 37.6% identity (68.8% similar) in 330 aa overlap (3-327:2-323)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MSNITDPQMWDFDDLNFTG-MPPADEDY--SPCMLETET-LNKYVVIIAYALVFLLSLLG
.: : . . . :.: : .: : ::. : .. .:: . :...:: ...:
CCDS33 MSIPLPLLQIYTSDNYTEEMGSGDYDSMKEPCFREENANFNKIFLPTIYSIIFLTGIVG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 NSLVMLVILYSRVGRSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAASKVNGWIFGTFLCKVVSLL
:.::.::. :.. ::.:: : :.:..:::::..:::.::.. : .: ::.::::.: ..
CCDS33 NGLVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVITLPFWAVDAVANWYFGNFLCKAVHVI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 KEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLTQKRHLV-KFVCLGCWGLSMNLSLPFFLFR
::.::..:.:: ::.:::::::::: . .. :. : : .: : .. :..: :.:
CCDS33 YTVNLYSSVLILAFISLDRYLAIVHATNSQRPRKLLAEKVVYVGVWIPALLLTIPDFIFA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 QAYHPNNSSPVCYEVLGNDTAKWRMVLRILPHTFGFIVPLFVMLFCYGFTLRTLFKAHMG
.. . .. .: . :: : .:... :.:.: .:.: :: . . : ...
CCDS33 NVSEADDRY-ICDRFYPNDL--WVVVFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 QKHRAMRVIFAVVLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQESCERRNNIGRALDATEILGF
::..:... ..: :. ::::: . . :... ..:...:: .:.. . .. :: :.:
CCDS33 QKRKALKTTVILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAF
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 LHSCLNPIIYAFIGQNFRHGFLKILAMHGLVSKEFLARHRVTSYTSSSVNVSSNL
.: :::::.:::.: .: : :.:.:.:
CCDS33 FHCCLNPILYAFLGAKF-----KTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRGGHSSVSTESESS
300 310 320 330 340 350
CCDS33 SFHSS
>>CCDS46420.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 (352 aa)
initn: 673 init1: 391 opt: 745 Z-score: 690.9 bits: 136.3 E(32554): 3.6e-32
Smith-Waterman score: 745; 38.5% identity (69.7% similar) in 317 aa overlap (16-327:11-319)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MSNITDPQMWDFDDLNFTG-MPPADEDY--SPCMLETET-LNKYVVIIAYALVFLLSLLG
:.: : .: : ::. : .. .:: . :...:: ...:
CCDS46 MEGISIYTSDNYTEEMGSGDYDSMKEPCFREENANFNKIFLPTIYSIIFLTGIVG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 NSLVMLVILYSRVGRSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAASKVNGWIFGTFLCKVVSLL
:.::.::. :.. ::.:: : :.:..:::::..:::.::.. : .: ::.::::.: ..
CCDS46 NGLVILVMGYQKKLRSMTDKYRLHLSVADLLFVITLPFWAVDAVANWYFGNFLCKAVHVI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 KEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLTQKRHLV-KFVCLGCWGLSMNLSLPFFLFR
::.::..:.:: ::.:::::::::: . .. :. : : .: : .. :..: :.:
CCDS46 YTVNLYSSVLILAFISLDRYLAIVHATNSQRPRKLLAEKVVYVGVWIPALLLTIPDFIFA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 QAYHPNNSSPVCYEVLGNDTAKWRMVLRILPHTFGFIVPLFVMLFCYGFTLRTLFKAHMG
.. . .. .: . :: : .:... :.:.: .:.: :: . . : ...
CCDS46 NVSEADDRY-ICDRFYPNDL--WVVVFQFQHIMVGLILPGIVILSCYCIIISKLSHSKGH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 QKHRAMRVIFAVVLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQESCERRNNIGRALDATEILGF
::..:... ..: :. ::::: . . :... ..:...:: .:.. . .. :: :.:
CCDS46 QKRKALKTTVILILAFFACWLPYYIGISIDSFILLEIIKQGCEFENTVHKWISITEALAF
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 LHSCLNPIIYAFIGQNFRHGFLKILAMHGLVSKEFLARHRVTSYTSSSVNVSSNL
.: :::::.:::.: .: : :.:.:.:
CCDS46 FHCCLNPILYAFLGAKF-----KTSAQHALTSVSRGSSLKILSKGKRGGHSSVSTESESS
300 310 320 330 340
CCDS46 SFHSS
350
>>CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 (357 aa)
initn: 667 init1: 379 opt: 737 Z-score: 683.6 bits: 135.0 E(32554): 9.3e-32
Smith-Waterman score: 737; 37.7% identity (68.8% similar) in 324 aa overlap (9-328:13-328)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MSNITDPQMWDFDDLNFTGMPPADEDYSPCMLETETLNKYVVIIAYALVFLLSLLG
: :. ..::: :. ... . .. . : :::... ::
CCDS27 MADDYGSESTSSMEDYVNFNFT-------DFYCEKNNVRQFASHFLPPLYWLVFIVGALG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 NSLVMLVILYSRVGRSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAASKVNGWIFGTFLCKVVSLL
::::.:: : ...::..:::::.::::: .:::.:: . .. : : ::.::::. .
CCDS27 NSLVILVYWYCTRVKTMTDMFLLNLAIADLLFLVTLPFWAIAAADQWKFQTFMCKVVNSM
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pF1KB9 KEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLT--QKRHLV-KFVCLGCWGLSMNLSLPFFL
..:::: .::. :::::::.::..: :. : .:: : :.::. : :. : .: .:
CCDS27 YKMNFYSCVLLIMCISVDRYIAIAQAMRAHTWREKRLLYSKMVCFTIWVLAAALCIPEIL
120 130 140 150 160 170
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pF1KB9 FRQAYHPNNSSPVCYEVLGND-TAKWRMVLRILPHTFGFIVPLFVMLFCYGFTLRTLFKA
. : . ... .: : .: ..: . .. : .::..:. :: :: . ..::..:
CCDS27 YSQI-KEESGIAICTMVYPSDESTKLKSAVLTLKVILGFFLPFVVMACCYTIIIHTLIQA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 HMGQKHRAMRVIFAVVLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQESCERRNNIGRALDATEI
. ..::.:..: ..:. .:.: .::: .::..:. .. .: .:: ...:.
CCDS27 KKSSKHKALKVTITVLTVFVLSQFPYNCILLVQTIDAYAMFISNCAVSTNIDICFQVTQT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 LGFLHSCLNPIIYAFIGQNFRHGFLKILAMHGLVSKEFLARHRVTSYTSSSVNVSSNL
..:.::::::..:.:.:. ::. ..: : : .:.
CCDS27 IAFFHSCLNPVLYVFVGERFRRDLVKTLKNLGCISQAQWVSFTRREGSLKLSSMLLETTS
300 310 320 330 340 350
CCDS27 GALSL
350 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 19:35:59 2016 done: Fri Nov 4 19:36:00 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]