Result of FASTA (ccds) for pF1KB9779
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9779, 887 aa
  1>>>pF1KB9779 887 - 887 aa - 887 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0130+/-0.000931; mu= 17.9302+/- 0.057
 mean_var=78.1036+/-15.552, 0's: 0 Z-trim(106.9): 28  B-trim: 355 in 2/49
 Lambda= 0.145124
 statistics sampled from 9245 (9269) to 9245 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.645), E-opt: 0.2 (0.285), width:  16
 Scan time:  4.460

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS11920.1 PIK3C3 gene_id:5289|Hs108|chr18        ( 887) 5897 1244.6       0
CCDS77180.1 PIK3C3 gene_id:5289|Hs108|chr18        ( 824) 5319 1123.6       0
CCDS44839.1 PIK3C2G gene_id:5288|Hs108|chr12       (1445)  612 138.2 1.1e-31
CCDS73452.1 PIK3C2G gene_id:5288|Hs108|chr12       (1486)  612 138.2 1.1e-31
CCDS5739.1 PIK3CG gene_id:5294|Hs108|chr7          (1102)  576 130.6 1.6e-29
CCDS104.1 PIK3CD gene_id:5293|Hs108|chr1           (1044)  567 128.7 5.6e-29
CCDS3104.1 PIK3CB gene_id:5291|Hs108|chr3          (1070)  563 127.8   1e-28
CCDS7824.1 PIK3C2A gene_id:5286|Hs108|chr11        (1686)  564 128.1 1.3e-28
CCDS1446.1 PIK3C2B gene_id:5287|Hs108|chr1         (1634)  557 126.7 3.5e-28
CCDS43171.1 PIK3CA gene_id:5290|Hs108|chr3         (1068)  421 98.1   9e-20
CCDS55637.1 PI4KB gene_id:5298|Hs108|chr1          ( 484)  414 96.5 1.2e-19
CCDS55638.1 PI4KB gene_id:5298|Hs108|chr1          ( 801)  414 96.6 1.9e-19
CCDS81376.1 PI4KB gene_id:5298|Hs108|chr1          ( 816)  414 96.6   2e-19
CCDS993.1 PI4KB gene_id:5298|Hs108|chr1            ( 828)  414 96.6   2e-19
CCDS33603.2 PI4KA gene_id:5297|Hs108|chr22         (2102)  410 95.9   8e-19


>>CCDS11920.1 PIK3C3 gene_id:5289|Hs108|chr18             (887 aa)
 initn: 5897 init1: 5897 opt: 5897  Z-score: 6665.9  bits: 1244.6 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5897; 100.0% identity (100.0% similar) in 887 aa overlap (1-887:1-887)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MGEAEKFHYIYSCDLDINVQLKIGSLEGKREQKSYKAVLEDPMLKFSGLYQETCSDLYVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MGEAEKFHYIYSCDLDINVQLKIGSLEGKREQKSYKAVLEDPMLKFSGLYQETCSDLYVT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 CQVFAEGKPLALPVRTSYKAFSTRWNWNEWLKLPVKYPDLPRNAQVALTIWDVYGPGKAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 CQVFAEGKPLALPVRTSYKAFSTRWNWNEWLKLPVKYPDLPRNAQVALTIWDVYGPGKAV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 PVGGTTVSLFGKYGMFRQGMHDLKVWPNVEADGSEPTKTPGRTSSTLSEDQMSRLAKLTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PVGGTTVSLFGKYGMFRQGMHDLKVWPNVEADGSEPTKTPGRTSSTLSEDQMSRLAKLTK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 AHRQGHMVKVDWLDRLTFREIEMINESEKRSSNFMYLMVEFRCVKCDDKEYGIVYYEKDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AHRQGHMVKVDWLDRLTFREIEMINESEKRSSNFMYLMVEFRCVKCDDKEYGIVYYEKDG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 DESSPILTSFELVKVPDPQMSMENLVESKHHKLARSLRSGPSDHDLKPNAATRDQLNIIV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DESSPILTSFELVKVPDPQMSMENLVESKHHKLARSLRSGPSDHDLKPNAATRDQLNIIV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 SYPPTKQLTYEEQDLVWKFRYYLTNQEKALTKFLKCVNWDLPQEAKQALELLGKWKPMDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SYPPTKQLTYEEQDLVWKFRYYLTNQEKALTKFLKCVNWDLPQEAKQALELLGKWKPMDV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 EDSLELLSSHYTNPTVRRYAVARLRQADDEDLLMYLLQLVQALKYENFDDIKNGLEPTKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EDSLELLSSHYTNPTVRRYAVARLRQADDEDLLMYLLQLVQALKYENFDDIKNGLEPTKK
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 DSQSSVSENVSNSGINSAEIDSSQIITSPLPSVSSPPPASKTKEVPDGENLEQDLCTFLI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DSQSSVSENVSNSGINSAEIDSSQIITSPLPSVSSPPPASKTKEVPDGENLEQDLCTFLI
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB9 SRACKNSTLANYLYWYVIVECEDQDTQQRDPKTHEMYLNVMRRFSQALLKGDKSVRVMRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SRACKNSTLANYLYWYVIVECEDQDTQQRDPKTHEMYLNVMRRFSQALLKGDKSVRVMRS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB9 LLAAQQTFVDRLVHLMKAVQRESGNRKKKNERLQALLGDNEKMNLSDVELIPLPLEPQVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LLAAQQTFVDRLVHLMKAVQRESGNRKKKNERLQALLGDNEKMNLSDVELIPLPLEPQVK
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB9 IRGIIPETATLFKSALMPAQLFFKTEDGGKYPVIFKHGDDLRQDQLILQIISLMDKLLRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IRGIIPETATLFKSALMPAQLFFKTEDGGKYPVIFKHGDDLRQDQLILQIISLMDKLLRK
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB9 ENLDLKLTPYKVLATSTKHGFMQFIQSVPVAEVLDTEGSIQNFFRKYAPSENGPNGISAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ENLDLKLTPYKVLATSTKHGFMQFIQSVPVAEVLDTEGSIQNFFRKYAPSENGPNGISAE
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB9 VMDTYVKSCAGYCVITYILGVGDRHLDNLLLTKTGKLFHIDFGYILGRDPKPLPPPMKLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VMDTYVKSCAGYCVITYILGVGDRHLDNLLLTKTGKLFHIDFGYILGRDPKPLPPPMKLN
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB9 KEMVEGMGGTQSEQYQEFRKQCYTAFLHLRRYSNLILNLFSLMVDANIPDIALEPDKTVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KEMVEGMGGTQSEQYQEFRKQCYTAFLHLRRYSNLILNLFSLMVDANIPDIALEPDKTVK
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       
pF1KB9 KVQDKFRLDLSDEEAVHYMQSLIDESVHALFAAVVEQIHKFAQYWRK
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KVQDKFRLDLSDEEAVHYMQSLIDESVHALFAAVVEQIHKFAQYWRK
              850       860       870       880       

>>CCDS77180.1 PIK3C3 gene_id:5289|Hs108|chr18             (824 aa)
 initn: 5461 init1: 5319 opt: 5319  Z-score: 6012.4  bits: 1123.6 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5339; 92.9% identity (92.9% similar) in 887 aa overlap (1-887:1-824)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MGEAEKFHYIYSCDLDINVQLKIGSLEGKREQKSYKAVLEDPMLKFSGLYQETCSDLYVT
       :::::::::::::::::::::::                                     
CCDS77 MGEAEKFHYIYSCDLDINVQLKI-------------------------------------
               10        20                                        

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 CQVFAEGKPLALPVRTSYKAFSTRWNWNEWLKLPVKYPDLPRNAQVALTIWDVYGPGKAV
                                 ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 --------------------------WNEWLKLPVKYPDLPRNAQVALTIWDVYGPGKAV
                                      30        40        50       

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 PVGGTTVSLFGKYGMFRQGMHDLKVWPNVEADGSEPTKTPGRTSSTLSEDQMSRLAKLTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 PVGGTTVSLFGKYGMFRQGMHDLKVWPNVEADGSEPTKTPGRTSSTLSEDQMSRLAKLTK
        60        70        80        90       100       110       

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 AHRQGHMVKVDWLDRLTFREIEMINESEKRSSNFMYLMVEFRCVKCDDKEYGIVYYEKDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 AHRQGHMVKVDWLDRLTFREIEMINESEKRSSNFMYLMVEFRCVKCDDKEYGIVYYEKDG
       120       130       140       150       160       170       

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 DESSPILTSFELVKVPDPQMSMENLVESKHHKLARSLRSGPSDHDLKPNAATRDQLNIIV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DESSPILTSFELVKVPDPQMSMENLVESKHHKLARSLRSGPSDHDLKPNAATRDQLNIIV
       180       190       200       210       220       230       

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 SYPPTKQLTYEEQDLVWKFRYYLTNQEKALTKFLKCVNWDLPQEAKQALELLGKWKPMDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 SYPPTKQLTYEEQDLVWKFRYYLTNQEKALTKFLKCVNWDLPQEAKQALELLGKWKPMDV
       240       250       260       270       280       290       

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 EDSLELLSSHYTNPTVRRYAVARLRQADDEDLLMYLLQLVQALKYENFDDIKNGLEPTKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 EDSLELLSSHYTNPTVRRYAVARLRQADDEDLLMYLLQLVQALKYENFDDIKNGLEPTKK
       300       310       320       330       340       350       

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 DSQSSVSENVSNSGINSAEIDSSQIITSPLPSVSSPPPASKTKEVPDGENLEQDLCTFLI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DSQSSVSENVSNSGINSAEIDSSQIITSPLPSVSSPPPASKTKEVPDGENLEQDLCTFLI
       360       370       380       390       400       410       

              490       500       510       520       530       540
pF1KB9 SRACKNSTLANYLYWYVIVECEDQDTQQRDPKTHEMYLNVMRRFSQALLKGDKSVRVMRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 SRACKNSTLANYLYWYVIVECEDQDTQQRDPKTHEMYLNVMRRFSQALLKGDKSVRVMRS
       420       430       440       450       460       470       

              550       560       570       580       590       600
pF1KB9 LLAAQQTFVDRLVHLMKAVQRESGNRKKKNERLQALLGDNEKMNLSDVELIPLPLEPQVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LLAAQQTFVDRLVHLMKAVQRESGNRKKKNERLQALLGDNEKMNLSDVELIPLPLEPQVK
       480       490       500       510       520       530       

              610       620       630       640       650       660
pF1KB9 IRGIIPETATLFKSALMPAQLFFKTEDGGKYPVIFKHGDDLRQDQLILQIISLMDKLLRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 IRGIIPETATLFKSALMPAQLFFKTEDGGKYPVIFKHGDDLRQDQLILQIISLMDKLLRK
       540       550       560       570       580       590       

              670       680       690       700       710       720
pF1KB9 ENLDLKLTPYKVLATSTKHGFMQFIQSVPVAEVLDTEGSIQNFFRKYAPSENGPNGISAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 ENLDLKLTPYKVLATSTKHGFMQFIQSVPVAEVLDTEGSIQNFFRKYAPSENGPNGISAE
       600       610       620       630       640       650       

              730       740       750       760       770       780
pF1KB9 VMDTYVKSCAGYCVITYILGVGDRHLDNLLLTKTGKLFHIDFGYILGRDPKPLPPPMKLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 VMDTYVKSCAGYCVITYILGVGDRHLDNLLLTKTGKLFHIDFGYILGRDPKPLPPPMKLN
       660       670       680       690       700       710       

              790       800       810       820       830       840
pF1KB9 KEMVEGMGGTQSEQYQEFRKQCYTAFLHLRRYSNLILNLFSLMVDANIPDIALEPDKTVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 KEMVEGMGGTQSEQYQEFRKQCYTAFLHLRRYSNLILNLFSLMVDANIPDIALEPDKTVK
       720       730       740       750       760       770       

              850       860       870       880       
pF1KB9 KVQDKFRLDLSDEEAVHYMQSLIDESVHALFAAVVEQIHKFAQYWRK
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 KVQDKFRLDLSDEEAVHYMQSLIDESVHALFAAVVEQIHKFAQYWRK
       780       790       800       810       820    

>>CCDS44839.1 PIK3C2G gene_id:5288|Hs108|chr12            (1445 aa)
 initn: 605 init1: 215 opt: 612  Z-score: 682.5  bits: 138.2 E(32554): 1.1e-31
Smith-Waterman score: 675; 25.0% identity (55.5% similar) in 768 aa overlap (155-883:506-1178)

          130       140       150       160       170       180    
pF1KB9 TTVSLFGKYGMFRQGMHDLKVWPNVEADGSEPTKTPGRTSSTLSEDQMSRLAKLTKAHRQ
                                     .:...: : .: :.    :.:.  . :   
CCDS44 KGLIEKVTTELSTSIYQLINVYCNSFYADFQPVNVP-RCTSYLNPGLPSHLSFTVYA---
         480       490       500       510        520       530    

          190       200       210       220       230              
pF1KB9 GHMVKVDWLDRLTFREIEMINESEKRSSNFMYLMVEFRCVKCDDKEYGIV------YYEK
       .: .   :. :..:  .:.  .:  : :   .: :..  . :  .. ...       . :
CCDS44 AHNIPETWVHRINF-PLEI--KSLPRES---MLTVKLFGIACATNNANLLAWTCLPLFPK
             540          550          560       570       580     

      240       250       260       270       280         290      
pF1KB9 DGDESSPILTSFELVKVPDPQMSMENLVESKHHKLARSLRSGPSD--HDLKPNAA-TRDQ
       . .  . .: :. : . :  .:   .. . .. . .    . :.   . .::..  .:..
CCDS44 EKSILGSMLFSMTLQSEPPVEMITPGVWDVSQPSPVTLQIDFPATGWEYMKPDSEENRSN
         590       600       610       620       630       640     

                300           310       320       330        340   
pF1KB9 LNII-------VSYPPTKQ----LTYEEQDLVWKFRYYLTNQEKALTKFLKCV-NWDLPQ
       :.         ..    ::    :. :..  .: .:.: .:.. .:   :  . .::  .
CCDS44 LEEPLKECIKHIARLSQKQTPLLLSEEKKRYLWFYRFYCNNENCSLPLVLGSAPGWD-ER
         650       660       670       680       690       700     

           350       360       370       380       390       400   
pF1KB9 EAKQALELLGKWKPMDVEDSLELLSSHYTNPTVRRYAVARLRQADDEDLLMYLLQLVQAL
        ...   .: .:   .  ..: ::.: . .  .:. :: .: .  ...:: :: :::::.
CCDS44 TVSEMHTILRRWTFSQPLEALGLLTSSFPDQEIRKVAVQQLDNLLNDELLEYLPQLVQAV
          710       720       730       740       750       760    

           410       420       430       440       450       460   
pF1KB9 KYENFDDIKNGLEPTKKDSQSSVSENVSNSGINSAEIDSSQIITSPLPSVSSPPPASKTK
       :.:                                                         
CCDS44 KFE---------------------------------------------------------
                                                                   

           470       480       490       500       510       520   
pF1KB9 EVPDGENLEQDLCTFLISRACKNSTLANYLYWYVIVECEDQDTQQRDPKTHEMYLNVMRR
             :::. :  .:. :. ..  .:. ::: .      ....      .: :.   . 
CCDS44 -----WNLESPLVQLLLHRSLQSIQVAHRLYWLL------KNAE------NEAYF---KS
            770       780       790             800                

           530         540       550       560       570       580 
pF1KB9 FSQALLKGDK--SVRVMRSLLAAQQTFVDRLVHLMKAVQRESGNRKKKNERLQALLGDNE
       . : :: . .  . ... . .. .: ..  :  . . :.  :.. ....: :.  .:  :
CCDS44 WYQKLLAALQFCAGKALNDEFSKEQKLIKILGDIGERVK--SASDHQRQEVLKKEIGRLE
       810       820       830       840         850       860     

             590       600       610       620         630         
pF1KB9 KMNLSDVELIPLPLEPQVKIRGIIPETATLFKSALMPAQLFFKTED--GGKYPVIFKHGD
       .. ..::.   :::.: . :.::  .. . : :  .: .. : . .  : .  .::: ::
CCDS44 EF-FQDVNTCHLPLNPALCIKGIDHDACSYFTSNALPLKITFINANPMGKNISIIFKAGD
          870       880       890       900       910       920    

     640       650       660       670       680        690        
pF1KB9 DLRQDQLILQIISLMDKLLRKENLDLKLTPYKVLATSTKHGFMQFI-QSVPVAEVLDTEG
       :::::.:.::.:..::..  .:.::...  :. :.:.  .:..:.. ..: .:..    :
CCDS44 DLRQDMLVLQLIQVMDNIWLQEGLDMQMIIYRCLSTGKDQGLVQMVPDAVTLAKIHRHSG
          930       940       950       960       970       980    

      700           710       720       730       740       750    
pF1KB9 SI----QNFFRKYAPSENGPNGISAEVMDTYVKSCAGYCVITYILGVGDRHLDNLLLTKT
        :    .: ..:.  ..:  ..   ... ..  ::::.::.:.:::: ::: ::..:::.
CCDS44 LIGPLKENTIKKWFSQHNHLKADYEKALRNFFYSCAGWCVVTFILGVCDRHNDNIMLTKS
          990      1000      1010      1020      1030      1040    

          760                770       780       790       800     
pF1KB9 GKLFHIDFGYILG---------RDPKPLPPPMKLNKEMVEGMGGTQSEQYQEFRKQCYTA
       :..:::::: .::         ::  :.    ...  ..::  : . ...:.: . :  :
CCDS44 GHMFHIDFGKFLGHAQTFGGIKRDRAPFIFTSEMEYFITEG--GKNPQHFQDFVELCCRA
         1050      1060      1070      1080        1090      1100  

         810       820       830       840       850       860     
pF1KB9 FLHLRRYSNLILNLFSLMVDANIPDIALEPDKTVKKVQDKFRLDLSDEEAVHYMQSLIDE
       .  .:..:.:.:::. .:. :..:...   :  .: : ...: . .: ::. .. . : :
CCDS44 YNIIRKHSQLLLNLLEMMLYAGLPELSGIQD--LKYVYNNLRPQDTDLEATSHFTKKIKE
           1110      1120      1130        1140      1150      1160

         870       880                                             
pF1KB9 SVHALFAAVVEQIHKFAQYWRK                                      
       :.. . . . . :: .::                                          
CCDS44 SLECFPVKLNNLIHTLAQMSAISPAKSTSQTFPQESCLLSTTRSIERATILGFSKKSSNL
             1170      1180      1190      1200      1210      1220

>>CCDS73452.1 PIK3C2G gene_id:5288|Hs108|chr12            (1486 aa)
 initn: 666 init1: 215 opt: 612  Z-score: 682.3  bits: 138.2 E(32554): 1.1e-31
Smith-Waterman score: 673; 26.9% identity (57.0% similar) in 595 aa overlap (308-883:710-1219)

       280       290       300       310       320       330       
pF1KB9 RSGPSDHDLKPNAATRDQLNIIVSYPPTKQLTYEEQDLVWKFRYYLTNQEKALTKFLKCV
                                     :. :..  .: .:.: .:.. .:   :  .
CCDS73 SEENRSNLEEPLKECIKHIARLSQKQTPLLLSEEKKRYLWFYRFYCNNENCSLPLVLGSA
     680       690       700       710       720       730         

        340       350       360       370       380       390      
pF1KB9 -NWDLPQEAKQALELLGKWKPMDVEDSLELLSSHYTNPTVRRYAVARLRQADDEDLLMYL
        .::  . ...   .: .:   .  ..: ::.: . .  .:. :: .: .  ...:: ::
CCDS73 PGWD-ERTVSEMHTILRRWTFSQPLEALGLLTSSFPDQEIRKVAVQQLDNLLNDELLEYL
     740        750       760       770       780       790        

        400       410       420       430       440       450      
pF1KB9 LQLVQALKYENFDDIKNGLEPTKKDSQSSVSENVSNSGINSAEIDSSQIITSPLPSVSSP
        :::::.:.:                                                  
CCDS73 PQLVQAVKFE--------------------------------------------------
      800                                                          

        460       470       480       490       500       510      
pF1KB9 PPASKTKEVPDGENLEQDLCTFLISRACKNSTLANYLYWYVIVECEDQDTQQRDPKTHEM
                    :::. :  .:. :. ..  .:. ::: .      ....      .: 
CCDS73 ------------WNLESPLVQLLLHRSLQSIQVAHRLYWLL------KNAE------NEA
                  810       820       830             840          

        520       530         540       550       560       570    
pF1KB9 YLNVMRRFSQALLKGDK--SVRVMRSLLAAQQTFVDRLVHLMKAVQRESGNRKKKNERLQ
       :.   . . : :: . .  . ... . .. .: ..  :  . . :.  : ....  : :.
CCDS73 YF---KSWYQKLLAALQFCAGKALNDEFSKEQKLIKILGDIGERVKSASDHQRQ--EVLK
             850       860       870       880       890           

          580       590       600       610       620         630  
pF1KB9 ALLGDNEKMNLSDVELIPLPLEPQVKIRGIIPETATLFKSALMPAQLFFKTED--GGKYP
         .:  :.. ..::.   :::.: . :.::  .. . : :  .: .. : . .  : .  
CCDS73 KEIGRLEEF-FQDVNTCHLPLNPALCIKGIDHDACSYFTSNALPLKITFINANPMGKNIS
     900        910       920       930       940       950        

            640       650       660       670       680        690 
pF1KB9 VIFKHGDDLRQDQLILQIISLMDKLLRKENLDLKLTPYKVLATSTKHGFMQFI-QSVPVA
       .::: :::::::.:.::.:..::..  .:.::...  :. :.:.  .:..:.. ..: .:
CCDS73 IIFKAGDDLRQDMLVLQLIQVMDNIWLQEGLDMQMIIYRCLSTGKDQGLVQMVPDAVTLA
      960       970       980       990      1000      1010        

             700           710       720       730       740       
pF1KB9 EVLDTEGSI----QNFFRKYAPSENGPNGISAEVMDTYVKSCAGYCVITYILGVGDRHLD
       ..    : :    .: ..:.  ..:  ..   ... ..  ::::.::.:.:::: ::: :
CCDS73 KIHRHSGLIGPLKENTIKKWFSQHNHLKADYEKALRNFFYSCAGWCVVTFILGVCDRHND
     1020      1030      1040      1050      1060      1070        

       750       760                770       780       790        
pF1KB9 NLLLTKTGKLFHIDFGYILG---------RDPKPLPPPMKLNKEMVEGMGGTQSEQYQEF
       :..:::.:..:::::: .::         ::  :.    ...  ..::  : . ...:.:
CCDS73 NIMLTKSGHMFHIDFGKFLGHAQTFGGIKRDRAPFIFTSEMEYFITEG--GKNPQHFQDF
     1080      1090      1100      1110      1120        1130      

      800       810       820       830       840       850        
pF1KB9 RKQCYTAFLHLRRYSNLILNLFSLMVDANIPDIALEPDKTVKKVQDKFRLDLSDEEAVHY
        . :  :.  .:..:.:.:::. .:. :..:...   :  .: : ...: . .: ::. .
CCDS73 VELCCRAYNIIRKHSQLLLNLLEMMLYAGLPELSGIQD--LKYVYNNLRPQDTDLEATSH
       1140      1150      1160      1170        1180      1190    

      860       870       880                                      
pF1KB9 MQSLIDESVHALFAAVVEQIHKFAQYWRK                               
       . . : ::.. . . . . :: .::                                   
CCDS73 FTKKIKESLECFPVKLNNLIHTLAQMSAISPAKSTSQTFPQESCLLSTTRSIERATILGF
         1200      1210      1220      1230      1240      1250    

>>CCDS5739.1 PIK3CG gene_id:5294|Hs108|chr7               (1102 aa)
 initn: 816 init1: 237 opt: 576  Z-score: 643.6  bits: 130.6 E(32554): 1.6e-29
Smith-Waterman score: 757; 27.7% identity (57.5% similar) in 664 aa overlap (237-864:492-1073)

        210       220       230       240       250         260    
pF1KB9 SEKRSSNFMYLMVEFRCVKCDDKEYGIVYYEKDGDESSPILTSFELVKVPDPQ--MSMEN
                                     : .:. ..  :::   .  :: .  ::.  
CCDS57 YYVNLLLIDHRFLLRRGEYVLHMWQISGKGEDQGSFNADKLTS---ATNPDKENSMSISI
             470       480       490       500          510        

          270       280             290       300       310        
pF1KB9 LVESKHHKLARSLRSGPSDHDLK------PNAATRDQLNIIVSYPPTKQLTYEEQDLVWK
       :...  : .:   ..   : .        ::   : ::. :..  : . :: :...:.:.
CCDS57 LLDNYCHPIALPKHQPTPDPEGDRVRAEMPNQ-LRKQLEAIIATDPLNPLTAEDKELLWH
      520       530       540       550        560       570       

      320       330       340       350            360       370   
pF1KB9 FRYYLTNQEKALTKFLKCVNWDLPQEAKQALELLGK---W--KPMDVEDSLELLSSHYTN
       :::   .. ::  :... :.:   . . .. .::..   :  . .::  ...::. ....
CCDS57 FRYESLKHPKAYPKLFSSVKWGQQEIVAKTYQLLARREVWDQSALDVGLTMQLLDCNFSD
       580       590       600       610       620       630       

           380       390       400       410       420       430   
pF1KB9 PTVRRYAVARLRQADDEDLLMYLLQLVQALKYENFDDIKNGLEPTKKDSQSSVSENVSNS
        .::  :: .:.. .:.:.: ::::::::.:.: . :                       
CCDS57 ENVRAIAVQKLESLEDDDVLHYLLQLVQAVKFEPYHD-----------------------
       640       650       660       670                           

           440       450       460       470       480       490   
pF1KB9 GINSAEIDSSQIITSPLPSVSSPPPASKTKEVPDGENLEQDLCTFLISRACKNSTLANYL
          ::                                    :  ::..:. .:. ....:
CCDS57 ---SA------------------------------------LARFLLKRGLRNKRIGHFL
                                                 680       690     

           500        510       520       530        540       550 
pF1KB9 YWYVIVE-CEDQDTQQRDPKTHEMYLNVMRRFSQALLKG-DKSVRVMRSLLAAQQTFVDR
       .:..  :  ...  :::     : ::   :  . :.:.   ..:.:.. :   :.. .: 
CCDS57 FWFLRSEIAQSRHYQQRFAVILEAYL---RGCGTAMLHDFTQQVQVIEML---QKVTLD-
         700       710       720          730       740            

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pF1KB9 LVHLMKAVQRESGNR--KKKNERLQALLGDNEKMNLSDVELIPLPLEPQVKIRGIIPETA
        .. ..: . . ...  .. ...:. :  .: ..     : . .: .: .:  ..  :  
CCDS57 -IKSLSAEKYDVSSQVISQLKQKLENL--QNSQLP----ESFRVPYDPGLKAGALAIEKC
       750       760       770         780           790       800 

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pF1KB9 TLFKSALMPAQLFFKTEDGGKYP-----VIFKHGDDLRQDQLILQIISLMDKLLRKENLD
        .. :   :  : ::  :          .:::::::::::.:::::. .:... . :.::
CCDS57 KVMASKKKPLWLEFKCADPTALSNETIGIIFKHGDDLRQDMLILQILRIMESIWETESLD
             810       820       830       840       850       860 

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pF1KB9 LKLTPYKVLATSTKHGFMQFIQ-SVPVAEVLDTE----GSIQNFFRKYAPSENGPNGISA
       : : ::  ..:. : :...... .. .:.. ..     :....   ..  .:..:.  . 
CCDS57 LCLLPYGCISTGDKIGMIEIVKDATTIAKIQQSTVGNTGAFKDEVLNHWLKEKSPTEEKF
             870       880       890       900       910       920 

     720        730       740       750       760              770 
pF1KB9 EV-MDTYVKSCAGYCVITYILGVGDRHLDNLLLTKTGKLFHIDFGYILGR-------DPK
       .. .. .: ::::::: :..::.:::: ::...:.::.:::::::.:::        . .
CCDS57 QAAVERFVYSCAGYCVATFVLGIGDRHNDNIMITETGNLFHIDFGHILGNYKSFLGINKE
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pF1KB9 PLPPPMKLNKEMVEGMGGTQ-SEQYQEFRKQCYTAFLHLRRYSNLILNLFSLMVDANIPD
        .:  .  .  .: : .: . : ..:.:.  :  :.: ::...::.. :::.:. ...:.
CCDS57 RVPFVLTPDFLFVMGTSGKKTSPHFQKFQDICVKAYLALRHHTNLLIILFSMMLMTGMPQ
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pF1KB9 IALEPDKTVKKVQDKFRLDLSDEEAVHYMQSLIDESVHALFAAVVEQIHKFAQYWRK   
       .. . :  .. ..: . .  ..:.: .:. . :.                          
CCDS57 LTSKED--IEYIRDALTVGKNEEDAKKYFLDQIEVCRDKGWTVQFNWFLHLVLGIKQGEK
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CCDS57 HSA
    1100  

>>CCDS104.1 PIK3CD gene_id:5293|Hs108|chr1                (1044 aa)
 initn: 742 init1: 225 opt: 567  Z-score: 633.8  bits: 128.7 E(32554): 5.6e-29
Smith-Waterman score: 740; 24.3% identity (52.2% similar) in 944 aa overlap (2-887:198-1044)

                                            10        20        30 
pF1KB9                              MGEAEKFHYIYSCDLDINVQLKIGSLEGKRE
                                     :  :.: .  :   :. . :   .:. :. 
CCDS10 PLQLEPSAQTWGPGTLRLPNRALLVNVKFEGSEESFTFQVSTK-DVPLALMACALR-KKA
       170       180       190       200       210        220      

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pF1KB9 QKSYKAVLEDP---MLKFSG----LY--QETCSDLYVTCQVFAEGKPLALPVRTSYKAFS
           . ..:.:    :. .:    ::     :.  :. :. .  :    : .  : . ..
CCDS10 TVFRQPLVEQPEDYTLQVNGRHEYLYGSYPLCQFQYI-CSCLHSGLTPHLTMVHSSSILA
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pF1KB9 TR---WNWNEWLKLP-VKYPDLPRNAQVALTIWDVYGPGKAVPVGGTTVS------LFGK
        :    :    .. : .: : .: .   ....:..  : .   . :. :.      :  .
CCDS10 MRDEQSNPAPQVQKPRAKPPPIPAKKPSSVSLWSLEQPFRIELIQGSKVNADERMKLVVQ
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pF1KB9 YGMFRQGMHDLKVWPNVEAD-GSEPTKTPGRTSSTLSEDQMSRLAKL-------------
        :.:. .    :.  . :..  :::.    :    ..  .. :.:.:             
CCDS10 AGLFHGNEMLCKTVSSSEVSVCSEPVWKQ-RLEFDINICDLPRMARLCFALYAVIEKAKK
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pF1KB9 ---TKAHRQGHMVKVDWLDRLTFREIEMINESEKRSSNFMYLMVEFRCVKCDD-KEYGIV
          :: . .     . : . . :   .... .:.     .:.       : .  .  : :
CCDS10 ARSTKKKSKKADCPIAWANLMLFDYKDQLKTGER----CLYMWPSVPDEKGELLNPTGTV
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pF1KB9 YYEKDGDESSPILTSFELVKVPDPQMSMENLVESKHHKLARSLRSGPSDHDLKPNAATRD
         . . : .. .:  .  : .: : .         .  : . :. :  .. .. .   . 
CCDS10 RSNPNTDSAAALLICLPEV-APHPVY---------YPALEKILELGRHSECVHVTEEEQL
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pF1KB9 QLNIIVSYPPTKQLTYEEQDLVWKFRYYLTNQ-EKALTKFLKCVNWDLPQEAKQALELLG
       ::  :.    . .:  .:.:::::.:. . ..  .::...:  ..:.  ... : : :: 
CCDS10 QLREILERRGSGELYEHEKDLVWKLRHEVQEHFPEALARLLLVTKWNKHEDVAQMLYLLC
     510       520       530       540       550       560         

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pF1KB9 KWKPMDVEDSLELLSSHYTNPTVRRYAVARLRQADDEDLLMYLLQLVQALKYENFDDIKN
       .:  . : ..::::.  . .  :  .:.  ::.  :..:..:::::::.::::..     
CCDS10 SWPELPVLSALELLDFSFPDCHVGSFAIKSLRKLTDDELFQYLLQLVQVLKYESY-----
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pF1KB9 GLEPTKKDSQSSVSENVSNSGINSAEIDSSQIITSPLPSVSSPPPASKTKEVPDGENLEQ
                                                                :. 
CCDS10 ---------------------------------------------------------LDC
                                                                   

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pF1KB9 DLCTFLISRACKNSTLANYLYWYVIVECEDQDTQQRDPKTHEMYLNVMRRFSQALLKGDK
       .:  ::..::  :  ....:.:..  : .  ..  :     : :     .  ..:.:  .
CCDS10 ELTKFLLDRALANRKIGHFLFWHLRSEMHVPSVALRFGLILEAYCRGSTHHMKVLMKQGE
       630       640       650       660       670       680       

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pF1KB9 SVRVMRSLLAAQQTFVDRLVHLMKAVQRESGNRKKKNERLQALLGDNEKMNLSDVELIPL
       ..  ...:        . .:.:  . :.     : ....:. :   .: . :  .  .  
CCDS10 ALSKLKAL--------NDFVKL--SSQKTP---KPQTKELMHLCMRQEAY-LEALSHLQS
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pF1KB9 PLEPQVKIRGIIPETATLFKSALMPAQLFFKTED---GGKYPVIFKHGDDLRQDQLILQI
       ::.:.. .  .  :  :.. : . :  .....:.   ::.  .:::.:::::::.: ::.
CCDS10 PLDPSTLLAEVCVEQCTFMDSKMKPLWIMYSNEEAGSGGSVGIIFKNGDDLRQDMLTLQM
           740       750       760       770       780       790   

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pF1KB9 ISLMDKLLRKENLDLKLTPYKVLATSTKHGFMQFI-QSVPVAEVLDTEGSIQNF--FRKY
       :.::: : ..:.:::..:::  : :. . :... . .:  .:..  .....     : : 
CCDS10 IQLMDVLWKQEGLDLRMTPYGCLPTGDRTGLIEVVLRSDTIANIQLNKSNMAATAAFNKD
           800       810       820       830       840       850   

            710       720       730       740       750       760  
pF1KB9 A-----PSENGPNGISAEVMDTYVKSCAGYCVITYILGVGDRHLDNLLLTKTGKLFHIDF
       :      :.: :.    .... .. ::::::: ::.::.:::: ::... ..:.::::::
CCDS10 ALLNWLKSKN-PGEALDRAIEEFTLSCAGYCVATYVLGIGDRHSDNIMIRESGQLFHIDF
           860        870       880       890       900       910  

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pF1KB9 GYILGR-------DPKPLPPPMKLNKEMVEGMGGTQ-SEQYQEFRKQCYTAFLHLRRYSN
       :..::        . . .:  .  .   :  .: :. ::....::  :  :.  :::.. 
CCDS10 GHFLGNFKTKFGINRERVPFILTYDFVHVIQQGKTNNSEKFERFRGYCERAYTILRRHGL
            920       930       940       950       960       970  

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pF1KB9 LILNLFSLMVDANIPDIALEPDKTVKKVQDKFRLDLSDEEAVHYMQSLIDESVHALFAAV
       :.:.::.::  :..:...   :  .. ..:.. :  ..:::.....  ..:...  . . 
CCDS10 LFLHLFALMRAAGLPELSCSKD--IQYLKDSLALGKTEEEALKHFRVKFNEALRESWKTK
            980       990        1000      1010      1020      1030

           880       
pF1KB9 VEQI-HKFAQYWRK
       :. . :. ..  :.
CCDS10 VNWLAHNVSKDNRQ
             1040    

>>CCDS3104.1 PIK3CB gene_id:5291|Hs108|chr3               (1070 aa)
 initn: 774 init1: 234 opt: 563  Z-score: 629.1  bits: 127.8 E(32554): 1e-28
Smith-Waterman score: 735; 29.1% identity (56.1% similar) in 619 aa overlap (296-887:538-1066)

         270       280       290       300       310       320     
pF1KB9 VESKHHKLARSLRSGPSDHDLKPNAATRDQLNIIVSYPPTKQLTYEEQDLVWKFRYYLTN
                                     :. :..  : .::  .:.::.: .:    .
CCDS31 FDKIIEKAAEIASSDSANVSSRGGKKFLPVLKEILDRDPLSQLCENEMDLIWTLRQDCRE
       510       520       530       540       550       560       

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pF1KB9 Q-EKALTKFLKCVNWDLPQEAKQALELLGKWKPMDVEDSLELLSSHYTNPTVRRYAVARL
          ..: :.:  ..:.  ... :   ::  :  .  ...::::. .: .  ::.:::. :
CCDS31 IFPQSLPKLLLSIKWNKLEDVAQLQALLQIWPKLPPREALELLDFNYPDQYVREYAVGCL
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pF1KB9 RQADDEDLLMYLLQLVQALKYENFDDIKNGLEPTKKDSQSSVSENVSNSGINSAEIDSSQ
       :: .::.: .:::::::.:::: :                                    
CCDS31 RQMSDEELSQYLLQLVQVLKYEPF------------------------------------
       630       640       650                                     

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pF1KB9 IITSPLPSVSSPPPASKTKEVPDGENLEQDLCTFLISRACKNSTLANYLYWYVIVECEDQ
                                 :.  :  ::. ::  :  ....:.:..       
CCDS31 --------------------------LDCALSRFLLERALGNRRIGQFLFWHL-------
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pF1KB9 DTQQRDPKTHEMYLNVMRRFSQALLKGDKSVRVMRSLLAAQQTFVDRLVHLMKAVQRESG
        .. . : .  ..  ..    .:  .:  ::  :. .:. :   ...:  : . .. .. 
CCDS31 RSEVHIPAVSVQFGVIL----EAYCRG--SVGHMK-VLSKQVEALNKLKTLNSLIKLNAV
      680       690           700          710       720       730 

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pF1KB9 --NRKKKNERLQALLGDNE-KMNLSDVELIPLPLEPQVKIRGIIPETATLFKSALMPAQL
         :: : .: ... : ..  .  :::..    ::.: : .  .  :    . : . :  :
CCDS31 KLNRAKGKEAMHTCLKQSAYREALSDLQS---PLNPCVILSELYVEKCKYMDSKMKPLWL
             740       750       760          770       780        

             630         640       650       660       670         
pF1KB9 FFKTEDGGK--YPVIFKHGDDLRQDQLILQIISLMDKLLRKENLDLKLTPYKVLATSTKH
        ....  :.    ::::.:::::::.: ::.. ::: : .. .:::.. ::  :::. . 
CCDS31 VYNNKVFGEDSVGVIFKNGDDLRQDMLTLQMLRLMDLLWKEAGLDLRMLPYGCLATGDRS
      790       800       810       820       830       840        

     680        690                  700       710       720       
pF1KB9 GFMQFIQ-SVPVAEV-LDT----------EGSIQNFFRKYAPSENGPNGISAEVMDTYVK
       :... .. :  .:.. :..          . .. :....:  ...   .:     . .. 
CCDS31 GLIEVVSTSETIADIQLNSSNVAAAAAFNKDALLNWLKEYNSGDDLDRAI-----EEFTL
      850       860       870       880       890            900   

       730       740       750       760                770        
pF1KB9 SCAGYCVITYILGVGDRHLDNLLLTKTGKLFHIDFGYILG---------RDPKPLPPPMK
       ::::::: .:.::.:::: ::... :::.:::::::.:::         :.  :.   . 
CCDS31 SCAGYCVASYVLGIGDRHSDNIMVKKTGQLFHIDFGHILGNFKSKFGIKRERVPFILTYD
           910       920       930       940       950       960   

      780       790       800       810       820       830        
pF1KB9 LNKEMVEGMGGTQSEQYQEFRKQCYTAFLHLRRYSNLILNLFSLMVDANIPDIALEPDKT
       . . . .:  :. .:.. .::. :  :.: :::..::...::.::. :..:.  :   : 
CCDS31 FIHVIQQGKTGN-TEKFGRFRQCCEDAYLILRRHGNLFITLFALMLTAGLPE--LTSVKD
           970        980       990      1000      1010        1020

      840       850       860       870       880           
pF1KB9 VKKVQDKFRLDLSDEEAVHYMQSLIDESVHALFAAVVEQIHKFAQYWRK    
       .. ..:.. :  :.:::.. ... .::   ::  . . ... .:.  ::    
CCDS31 IQYLKDSLALGKSEEEALKQFKQKFDE---ALRESWTTKVNWMAHTVRKDYRS
             1030      1040         1050      1060      1070

>>CCDS7824.1 PIK3C2A gene_id:5286|Hs108|chr11             (1686 aa)
 initn: 681 init1: 203 opt: 564  Z-score: 627.1  bits: 128.1 E(32554): 1.3e-28
Smith-Waterman score: 657; 28.3% identity (55.1% similar) in 632 aa overlap (278-883:856-1395)

       250       260       270       280        290       300      
pF1KB9 TSFELVKVPDPQMSMENLVESKHHKLARSLRSGPSDHDLKP-NAATRDQLNIIVSYPPTK
                                     ::  ..:.:.  .   . .:  :.    . 
CCDS78 KKGYVMERIVLQVDFPSPAFDIIYTTPQVDRSIIQQHNLETLENDIKGKLLDILHKDSSL
         830       840       850       860       870       880     

        310       320       330        340       350       360     
pF1KB9 QLTYEEQDLVWKFRYYLTNQEKALTKFLKCV-NWDLPQEAKQALELLGKWKPMDVEDSLE
        :. :.. ..:. :::  .. . : :.:  . ::   . :: .  :: .:  .    .::
CCDS78 GLSKEDKAFLWEKRYYCFKHPNCLPKILASAPNWKWVNLAK-TYSLLHQWPALYPLIALE
         890       900       910       920        930       940    

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pF1KB9 LLSSHYTNPTVRRYAVARLRQADDEDLLMYLLQLVQALKYENFDDIKNGLEPTKKDSQSS
       ::.:....  ::  ::. ..  .:..:   : :.::::::: .                 
CCDS78 LLDSKFADQEVRSLAVTWIEAISDDELTDLLPQFVQALKYEIY-----------------
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pF1KB9 VSENVSNSGINSAEIDSSQIITSPLPSVSSPPPASKTKEVPDGENLEQDLCTFLISRACK
                .::.                                    :  ::.:::  
CCDS78 ---------LNSS------------------------------------LVQFLLSRALG
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pF1KB9 NSTLANYLYWYVIVECEDQDTQQRDPKTHEMYLNVMRRFSQALLK-GDKSVRVMRSLLAA
       :  .:. ::: .      .:. . : .    : .:.     :::. : :    .:  :  
CCDS78 NIQIAHNLYWLL------KDALH-DVQFSTRYEHVL----GALLSVGGKR---LREELLK
           1010             1020      1030          1040           

          550       560            570       580       590         
pF1KB9 QQTFVDRLVHLMKAVQRESGNRK-----KKNERLQALLGDNEKMNLSDVELIPLPLEPQV
       :  .:. :  . . :.. ::. .     .. ::.:...  :.           :::.:..
CCDS78 QTKLVQLLGGVAEKVRQASGSARQVVLQRSMERVQSFFQKNKCR---------LPLKPSL
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pF1KB9 KIRGIIPETATLFKSALMPAQLFFKTED--GGKYPVIFKHGDDLRQDQLILQIISLMDKL
         . .  .. ..:.:  .: .. . . :  : .  :.:: :.:::::.: ::.:..:::.
CCDS78 VAKELNIKSCSFFSSNAVPLKVTMVNADPMGEEINVMFKVGEDLRQDMLALQMIKIMDKI
    1100      1110      1120      1130      1140      1150         

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pF1KB9 LRKENLDLKLTPYKVLATSTKHGFMQFIQSVPVAEVLDTE----GSIQN-----FFRKYA
         ::.:::... .: :.:.  .:..... .  . . ...:    ::...     ..::: 
CCDS78 WLKEGLDLRMVIFKCLSTGRDRGMVELVPASDTLRKIQVEYGVTGSFKDKPLAEWLRKYN
    1160      1170      1180      1190      1200      1210         

      710       720       730       740       750       760        
pF1KB9 PSENGPNGISAEVMDTYVKSCAGYCVITYILGVGDRHLDNLLLTKTGKLFHIDFGYILGR
       :::.  .  :    .... :::: :: ::.::. ::: ::..: .::..:::::: .::.
CCDS78 PSEEEYEKAS----ENFIYSCAGCCVATYVLGICDRHNDNIMLRSTGHMFHIDFGKFLGH
    1220          1230      1240      1250      1260      1270     

      770            780       790         800       810       820 
pF1KB9 DP-----KPLPPPMKLNKEMVEGMGGTQSE--QYQEFRKQCYTAFLHLRRYSNLILNLFS
              :    :. :...:.  ..: ..   ..: :   :  :.  .:. .::.:::.:
CCDS78 AQMFGSFKRDRAPFVLTSDMAYVINGGEKPTIRFQLFVDLCCQAYNLIRKQTNLFLNLLS
        1280      1290      1300      1310      1320      1330     

             830       840       850       860       870       880 
pF1KB9 LMVDANIPDIALEPDKTVKKVQDKFRLDLSDEEAVHYMQSLIDESVHALFAAVVEQIHKF
       ::. ...:...   :  .: :.: .. . .: ::. ..  ::. :. .. .     ::..
CCDS78 LMIPSGLPELTSIQD--LKYVRDALQPQTTDAEATIFFTRLIESSLGSIATKFNFFIHNL
        1340      1350        1360      1370      1380      1390   

                                                                   
pF1KB9 AQYWRK                                                      
       ::                                                          
CCDS78 AQLRFSGLPSNDEPILSFSPKTYSFRQDGRIKEVSVFTYHKKYNPDKHYIYVVRILREGQ
          1400      1410      1420      1430      1440      1450   

>>CCDS1446.1 PIK3C2B gene_id:5287|Hs108|chr1              (1634 aa)
 initn: 585 init1: 205 opt: 557  Z-score: 619.4  bits: 126.7 E(32554): 3.5e-28
Smith-Waterman score: 620; 27.2% identity (55.3% similar) in 611 aa overlap (295-883:818-1340)

          270       280       290       300       310       320    
pF1KB9 LVESKHHKLARSLRSGPSDHDLKPNAATRDQLNIIVSYPPTKQLTYEEQDLVWKFRYYLT
                                     .:. :..      ::  ..  .:. :::  
CCDS14 SAFDIKFTSPPGDKFSPRYEFGSLREEDQRKLKDIMQKESLYWLTDADKKRLWEKRYYCH
       790       800       810       820       830       840       

          330        340          350       360       370       380
pF1KB9 NQEKALTKFLKCV-NWD---LPQEAKQALELLGKWKPMDVEDSLELLSSHYTNPTVRRYA
       .. ..:   :  . .:.   ::.       :: .:  :. .:.: :: . . .  :::.:
CCDS14 SEVSSLPLVLASAPSWEWACLPD----IYVLLKQWTHMNHQDALGLLHATFPDQEVRRMA
       850       860       870           880       890       900   

              390       400       410       420       430       440
pF1KB9 VARLRQADDEDLLMYLLQLVQALKYENFDDIKNGLEPTKKDSQSSVSENVSNSGINSAEI
       :  . . .: .:: :: ::::::::: . :                              
CCDS14 VQWIGSLSDAELLDYLPQLVQALKYECYLD------------------------------
           910       920       930                                 

              450       460       470       480       490       500
pF1KB9 DSSQIITSPLPSVSSPPPASKTKEVPDGENLEQDLCTFLISRACKNSTLANYLYWYVIVE
              :::                           ::..:: ..  ...:..: .   
CCDS14 -------SPL-------------------------VRFLLKRAVSDLRVTHYFFWLL---
                                           940       950           

              510       520       530       540       550       560
pF1KB9 CEDQDTQQRDPKTHEMYLNVMRRFSQALLKGDKSVRVMRSLLAAQQTFVDRLVHLMKAVQ
          .:   .: .    :  ..  .     ::      .:  .  :  .:. :..: . : 
CCDS14 ---KDGL-KDSQFSIRYQYLLAALLCCCGKG------LREEFNRQCWLVNALAKLAQQV-
         960        970       980             990      1000        

              570       580       590       600       610       620
pF1KB9 RESGNRKKKNERLQALLGDNEKMNLSDVELIPLPLEPQVKIRGIIPETATLFKSALMPAQ
       ::..   ...    .:   .. . :.      ::: :.. ..::.:.  . :.:  .: .
CCDS14 REAAPSARQGILRTGLEEVKQFFALNGS--CRLPLSPSLLVKGIVPRDCSYFNSNAVPLK
      1010      1020      1030        1040      1050      1060     

                630       640       650       660       670        
pF1KB9 LFFKTED--GGKYPVIFKHGDDLRQDQLILQIISLMDKLLRKENLDLKLTPYKVLATSTK
       : :.. :  : .  :::: :::::::.: ::.: .:.:.  .:.::.... .. ..:.  
CCDS14 LSFQNVDPLGENIRVIFKCGDDLRQDMLTLQMIRIMSKIWVQEGLDMRMVIFRCFSTGRG
        1070      1080      1090      1100      1110      1120     

      680       690           700            710       720         
pF1KB9 HGFMQFIQSVPVAEVLDTE----GSIQN-----FFRKYAPSENGPNGISAEVMDTYVKSC
       .:....: .. . . ...:    ::...     ...:. :.:.  .    ....... ::
CCDS14 RGMVEMIPNAETLRKIQVEHGVTGSFKDRPLADWLQKHNPGEDEYE----KAVENFIYSC
        1130      1140      1150      1160      1170          1180 

     730       740       750       760            770       780    
pF1KB9 AGYCVITYILGVGDRHLDNLLLTKTGKLFHIDFGYILGR-----DPKPLPPPMKLNKEMV
       :: :: ::.::. ::: ::..:  ::..:::::: .::.     . :    :. ....:.
CCDS14 AGCCVATYVLGICDRHNDNIMLKTTGHMFHIDFGRFLGHAQMFGNIKRDRAPFVFTSDMA
            1190      1200      1210      1220      1230      1240 

           790        800       810       820       830       840  
pF1KB9 EGM-GGTQ-SEQYQEFRKQCYTAFLHLRRYSNLILNLFSLMVDANIPDIALEPDKTVKKV
         . :: . : ....:   :  :.  .:....:.:::..::.. .::...   :  .: :
CCDS14 YVINGGDKPSSRFHDFVDLCCQAYNLIRKHTHLFLNLLGLMLSCGIPELSDLED--LKYV
            1250      1260      1270      1280      1290           

            850       860       870       880                      
pF1KB9 QDKFRLDLSDEEAVHYMQSLIDESVHALFAAVVEQIHKFAQYWRK               
        : .: . .. .:. :.  ::. :. .. . .   ::..::                   
CCDS14 YDALRPQDTEANATTYFTRLIESSLGSVATKLNFFIHNLAQMKFTGSDDRLTLSFASRTH
    1300      1310      1320      1330      1340      1350         

CCDS14 TLKSSGRISDVFLCRHEKIFHPNKGYIYVVKVMRENTHEATYIQRTFEEFQELHNKLRLL
    1360      1370      1380      1390      1400      1410         

>>CCDS43171.1 PIK3CA gene_id:5290|Hs108|chr3              (1068 aa)
 initn: 678 init1: 198 opt: 421  Z-score: 468.4  bits: 98.1 E(32554): 9e-20
Smith-Waterman score: 779; 24.7% identity (54.1% similar) in 859 aa overlap (57-884:354-1065)

         30        40        50        60        70        80      
pF1KB9 EGKREQKSYKAVLEDPMLKFSGLYQETCSDLYVTCQVFAEGKPLALPVRTSYKAFSTRWN
                                     .::   ..  :.::   : :. ..  .   
CCDS43 TKSLWVINSALRIKILCATYVNVNIRDIDKIYVRTGIYHGGEPLCDNVNTQ-RVPCSNPR
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       :::::.  .  ::::: :.. :.: .: :   :     :..  ...::     . .:   
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       :..::     : :   .: : :.:  . .. .   .:          . ::.. .. : .
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       . .:.:  . : .               .: :. :                         
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       :  .:     ..:::       :..:. :   ..::. : .  : ...: .:.:..:. :
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       .: ..  . : :.:  :.:.  .:. :   :.  : :.  :...:::. .: .: :: .:
CCDS43 HYCVTIPEILPKLLLSVKWNSRDEVAQMYCLVKDWPPIKPEQAMELLDCNYPDPMVRGFA
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       :  :..   :. : .::.::::.::::.. :                             
CCDS43 VRCLEKYLTDDKLSQYLIQLVQVLKYEQYLD-----------------------------
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CCDS43 ------------------------------NL---LVRFLLKKALTNQRIGHFFFWHLKS
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       : ... ..::     : :    :  .. : . ...:..:           ..:..:   .
CCDS43 EMHNKTVSQRFGLLLESYC---RACGMYLKHLNRQVEAM-----------EKLINLTDIL
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       ..:. .. .: . .. :. . .. .. :.    : ::.:  .. ..  :   ...::  :
CCDS43 KQEKKDETQKVQ-MKFLVEQMRRPDFMDALQGFLSPLNPAHQLGNLRLEECRIMSSAKRP
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CCDS43 LWLNWENPDIMSELLFQNNEIIFKNGDDLRQDMLTLQIIRIMENIWQNQGLDLRMLPYGC
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CCDS43 LSIGDCVGLIEVVRNSHTIMQIQCKGGLKGALQFNSHTLHQWLKDKNKGEIYDAAIDLFT
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CCDS43 RSCAGYCVATFILGIGDRHNSNIMVKDDGQLFHIDFGHFLDHKKKKFGYKRERVPFVLTQ
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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