Result of FASTA (ccds) for pF1KB8999
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8999, 357 aa
  1>>>pF1KB8999 357 - 357 aa - 357 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0421+/-0.000998; mu= 18.1950+/- 0.059
 mean_var=119.1978+/-37.871, 0's: 0 Z-trim(105.0): 219  B-trim: 510 in 1/48
 Lambda= 0.117474
 statistics sampled from 7917 (8203) to 7917 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.61), E-opt: 0.2 (0.252), width:  16
 Scan time:  2.520

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS5936.1 HTR5A gene_id:3361|Hs108|chr7           ( 357) 2392 417.1 1.2e-116
CCDS7410.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10           ( 432)  709 131.9 9.6e-31
CCDS7409.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10           ( 445)  709 132.0 9.7e-31
CCDS7408.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10           ( 479)  709 132.0   1e-30
CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8           ( 429)  675 126.2 5.2e-29
CCDS6053.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8           ( 455)  675 126.2 5.4e-29
CCDS6054.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8           ( 466)  675 126.2 5.4e-29
CCDS34869.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8          ( 475)  675 126.2 5.5e-29
CCDS4347.1 ADRA1B gene_id:147|Hs108|chr5           ( 520)  652 122.4 8.6e-28
CCDS83269.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8          ( 342)  585 110.8 1.8e-24
CCDS197.1 HTR6 gene_id:3362|Hs108|chr1             ( 440)  565 107.6 2.1e-23
CCDS13079.1 ADRA1D gene_id:146|Hs108|chr20         ( 572)  544 104.1   3e-22
CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6           ( 390)  527 101.0 1.7e-21
CCDS9405.1 HTR2A gene_id:3356|Hs108|chr13          ( 471)  523 100.5 3.1e-21
CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5          ( 422)  520 99.9 4.1e-21
CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1            ( 377)  502 96.8 3.2e-20
CCDS2920.1 HTR1F gene_id:3355|Hs108|chr3           ( 366)  477 92.5 5.9e-19
CCDS5006.1 HTR1E gene_id:3354|Hs108|chr6           ( 365)  474 92.0 8.4e-19
CCDS47004.1 ADRA2C gene_id:152|Hs108|chr4          ( 462)  456 89.1   8e-18
CCDS56129.1 ADRA2B gene_id:151|Hs108|chr2          ( 450)  450 88.1 1.6e-17
CCDS34273.2 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5           ( 360)  446 87.3 2.2e-17
CCDS34271.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5           ( 378)  446 87.3 2.3e-17
CCDS34270.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5           ( 387)  446 87.3 2.3e-17
CCDS4291.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5            ( 388)  446 87.3 2.3e-17
CCDS75353.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5           ( 411)  446 87.3 2.4e-17
CCDS34272.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5           ( 428)  446 87.4 2.5e-17
CCDS4393.1 DRD1 gene_id:1812|Hs108|chr5            ( 446)  446 87.4 2.6e-17
CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10          ( 465)  443 86.9 3.7e-17
CCDS53867.1 HTR2A gene_id:3356|Hs108|chr13         ( 387)  423 83.4 3.5e-16
CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5            ( 413)  410 81.2 1.7e-15
CCDS33829.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3           ( 367)  382 76.4 4.2e-14
CCDS7586.1 ADRB1 gene_id:153|Hs108|chr10           ( 477)  383 76.8 4.3e-14
CCDS2978.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3            ( 400)  382 76.5 4.4e-14
CCDS6099.1 ADRB3 gene_id:155|Hs108|chr8            ( 408)  377 75.6   8e-14
CCDS5843.1 CHRM2 gene_id:1129|Hs108|chr7           ( 466)  369 74.4 2.2e-13
CCDS7710.1 DRD4 gene_id:1815|Hs108|chr11           ( 419)  368 74.1 2.3e-13
CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5            ( 359)  356 72.0 8.8e-13
CCDS3405.1 DRD5 gene_id:1816|Hs108|chr4            ( 477)  357 72.3 9.2e-13
CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5           ( 397)  356 72.1 9.3e-13
CCDS1616.1 CHRM3 gene_id:1131|Hs108|chr1           ( 590)  355 72.1 1.3e-12
CCDS44581.1 CHRM4 gene_id:1132|Hs108|chr11         ( 479)  353 71.7 1.5e-12
CCDS1268.1 GPR161 gene_id:23432|Hs108|chr1         ( 529)  332 68.2 1.8e-11
CCDS72978.1 GPR161 gene_id:23432|Hs108|chr1        ( 546)  332 68.2 1.9e-11
CCDS58043.1 GPR161 gene_id:23432|Hs108|chr1        ( 549)  332 68.2 1.9e-11
CCDS8040.1 CHRM1 gene_id:1128|Hs108|chr11          ( 460)  331 67.9 1.9e-11
CCDS14564.1 HTR2C gene_id:3358|Hs108|chrX          ( 458)  324 66.7 4.3e-11
CCDS10031.1 CHRM5 gene_id:1133|Hs108|chr15         ( 532)  324 66.8 4.7e-11
CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6         ( 345)  319 65.7 6.6e-11


>>CCDS5936.1 HTR5A gene_id:3361|Hs108|chr7                (357 aa)
 initn: 2392 init1: 2392 opt: 2392  Z-score: 2207.9  bits: 417.1 E(32554): 1.2e-116
Smith-Waterman score: 2392; 100.0% identity (100.0% similar) in 357 aa overlap (1-357:1-357)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MDLPVNLTSFSLSTPSPLETNHSLGKDDLRPSSPLLSVFGVLILTLLGFLVAATFAWNLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MDLPVNLTSFSLSTPSPLETNHSLGKDDLRPSSPLLSVFGVLILTLLGFLVAATFAWNLL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 VLATILRVRTFHRVPHNLVASMAVSDVLVAALVMPLSLVHELSGRRWQLGRRLCQLWIAC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 VLATILRVRTFHRVPHNLVASMAVSDVLVAALVMPLSLVHELSGRRWQLGRRLCQLWIAC
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 DVLCCTASIWNVTAIALDRYWSITRHMEYTLRTRKCVSNVMIALTWALSAVISLAPLLFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DVLCCTASIWNVTAIALDRYWSITRHMEYTLRTRKCVSNVMIALTWALSAVISLAPLLFG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 WGETYSEGSEECQVSREPSYAVFSTVGAFYLPLCVVLFVYWKIYKAAKFRVGSRKTNSVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 WGETYSEGSEECQVSREPSYAVFSTVGAFYLPLCVVLFVYWKIYKAAKFRVGSRKTNSVS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 PISEAVEVKDSAKQPQMVFTVRHATVTFQPEGDTWREQKEQRAALMVGILIGVFVLCWIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PISEAVEVKDSAKQPQMVFTVRHATVTFQPEGDTWREQKEQRAALMVGILIGVFVLCWIP
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       
pF1KB8 FFLTELISPLCSCDIPAIWKSIFLWLGYSNSFFNPLIYTAFNKNYNSAFKNFFSRQH
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 FFLTELISPLCSCDIPAIWKSIFLWLGYSNSFFNPLIYTAFNKNYNSAFKNFFSRQH
              310       320       330       340       350       

>>CCDS7410.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10                (432 aa)
 initn: 641 init1: 251 opt: 709  Z-score: 665.5  bits: 131.9 E(32554): 9.6e-31
Smith-Waterman score: 709; 37.1% identity (70.2% similar) in 329 aa overlap (41-357:82-403)

               20        30        40        50        60        70
pF1KB8 SLSTPSPLETNHSLGKDDLRPSSPLLSVFGVLILTLLGFLVAATFAWNLLVLATILRVRT
                                     :.: ..: ...  :.: : ::. ..  :. 
CCDS74 VTASPAPTWDAPPDNASGCGEQINYGRVEKVVIGSILTLITLLTIAGNCLVVISVCFVKK
              60        70        80        90       100       110 

                80        90       100       110       120         
pF1KB8 FHRVPHN-LVASMAVSDVLVAALVMPLSLVHELSGRRWQLGRRLCQLWIACDVLCCTASI
       . : : : :..:.:..:. ::. :::.  : .: : .: .:. .:...:: ::.::::::
CCDS74 L-RQPSNYLIVSLALADLSVAVAVMPFVSVTDLIGGKWIFGHFFCNVFIAMDVMCCTASI
              120       130       140       150       160       170

     130       140       150        160       170       180        
pF1KB8 WNVTAIALDRYWSITRHMEYTLRTR-KCVSNVMIALTWALSAVISLAPLLFGWGETYSEG
        .. .:..::: .::: . : .:   ::... ::  .: ::: :.: :: :::... .. 
CCDS74 MTLCVISIDRYLGITRPLTYPVRQNGKCMAK-MILSVWLLSASITLPPL-FGWAQNVND-
              180       190       200        210        220        

      190       200       210       220       230          240     
pF1KB8 SEECQVSREPSYAVFSTVGAFYLPLCVVLFVYWKIYKAAKFRVGSRKTNS---VSPISEA
       .. : .:.. .:...::. :::.:. :.::.:..:::::.  ....:  .   : : : .
CCDS74 DKVCLISQDFGYTIYSTAVAFYIPMSVMLFMYYQIYKAARKSAAKHKFPGFPRVEPDS-V
       230       240       250       260       270       280       

         250       260       270        280       290       300    
pF1KB8 VEVKDSAKQPQMVFTVRHATVTFQPEGDTWR-EQKEQRAALMVGILIGVFVLCWIPFFLT
       . ..  .:  . :    . .  .. :  .    ..::.::  .::..:.:..::.:::: 
CCDS74 IALNGIVKLQKEVEECANLSRLLKHERKNISIFKREQKAATTLGIIVGAFTVCWLPFFLL
        290       300       310       320       330       340      

          310             320       330       340       350        
pF1KB8 ELISPL-----CSCDIPAIW-KSIFLWLGYSNSFFNPLIYTAFNKNYNSAFKNFFSRQH 
           :.     ::: :: .: .  ::::::.::..::.::. ::..  ........ :. 
CCDS74 STARPFICGTSCSC-IP-LWVERTFLWLGYANSLINPFIYAFFNRDLRTTYRSLLQCQYR
        350       360         370       380       390       400    

CCDS74 NINRKLSAAGMHEALKLAERPERPEFVL
          410       420       430  

>>CCDS7409.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10                (445 aa)
 initn: 641 init1: 251 opt: 709  Z-score: 665.3  bits: 132.0 E(32554): 9.7e-31
Smith-Waterman score: 709; 37.1% identity (70.2% similar) in 329 aa overlap (41-357:82-403)

               20        30        40        50        60        70
pF1KB8 SLSTPSPLETNHSLGKDDLRPSSPLLSVFGVLILTLLGFLVAATFAWNLLVLATILRVRT
                                     :.: ..: ...  :.: : ::. ..  :. 
CCDS74 VTASPAPTWDAPPDNASGCGEQINYGRVEKVVIGSILTLITLLTIAGNCLVVISVCFVKK
              60        70        80        90       100       110 

                80        90       100       110       120         
pF1KB8 FHRVPHN-LVASMAVSDVLVAALVMPLSLVHELSGRRWQLGRRLCQLWIACDVLCCTASI
       . : : : :..:.:..:. ::. :::.  : .: : .: .:. .:...:: ::.::::::
CCDS74 L-RQPSNYLIVSLALADLSVAVAVMPFVSVTDLIGGKWIFGHFFCNVFIAMDVMCCTASI
              120       130       140       150       160       170

     130       140       150        160       170       180        
pF1KB8 WNVTAIALDRYWSITRHMEYTLRTR-KCVSNVMIALTWALSAVISLAPLLFGWGETYSEG
        .. .:..::: .::: . : .:   ::... ::  .: ::: :.: :: :::... .. 
CCDS74 MTLCVISIDRYLGITRPLTYPVRQNGKCMAK-MILSVWLLSASITLPPL-FGWAQNVND-
              180       190       200        210        220        

      190       200       210       220       230          240     
pF1KB8 SEECQVSREPSYAVFSTVGAFYLPLCVVLFVYWKIYKAAKFRVGSRKTNS---VSPISEA
       .. : .:.. .:...::. :::.:. :.::.:..:::::.  ....:  .   : : : .
CCDS74 DKVCLISQDFGYTIYSTAVAFYIPMSVMLFMYYQIYKAARKSAAKHKFPGFPRVEPDS-V
       230       240       250       260       270       280       

         250       260       270        280       290       300    
pF1KB8 VEVKDSAKQPQMVFTVRHATVTFQPEGDTWR-EQKEQRAALMVGILIGVFVLCWIPFFLT
       . ..  .:  . :    . .  .. :  .    ..::.::  .::..:.:..::.:::: 
CCDS74 IALNGIVKLQKEVEECANLSRLLKHERKNISIFKREQKAATTLGIIVGAFTVCWLPFFLL
        290       300       310       320       330       340      

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       . ..  .:  . :    . .  .. :  .    ..::.::  .::..:.:..::.:::: 
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CCDS74 NINRKLSAAGMHEALKLAERPERPEFVLRACTRRVLLRPEKRPPVSVWVLQSPDHHNWLA
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>>CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8                (429 aa)
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>>CCDS6053.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8                (455 aa)
 initn: 389 init1: 193 opt: 675  Z-score: 634.1  bits: 126.2 E(32554): 5.4e-29
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CCDS60 LCWLPFFLVMPIGSFFPDFKPSETVFKIVF-WLGYLNSCINPIIYPCSSQEFKKAFQNVL
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pF1KB8 SRQH                                                        
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CCDS60 RIQCLCRKQSSKHALGYTLHPPSQAVEGQHKDMVRIPVGSRETFYRISKTDGVCEWKFFS
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>>CCDS6054.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8                (466 aa)
 initn: 389 init1: 193 opt: 675  Z-score: 634.0  bits: 126.2 E(32554): 5.4e-29
Smith-Waterman score: 675; 34.7% identity (65.0% similar) in 346 aa overlap (18-356:4-344)

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pF1KB8 MDLPVNLTSFSLSTPSPLETNHSLGKDDLRPSSPLLSVFGVLILTLLGFLVAATFAWNLL
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CCDS60 VILSVACHRHLHSVTHYYIVNLAVADLLLTSTVLPFSAIFEVLGY-WAFGRVFCNIWAAV
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pF1KB8 LCWIPFFLTELISPLCSCDIPA--IWKSIFLWLGYSNSFFNPLIYTAFNKNYNSAFKNFF
       :::.::::.  :. .     :.  ..: .: :::: :: .::.::   ......::.: .
CCDS60 LCWLPFFLVMPIGSFFPDFKPSETVFKIVF-WLGYLNSCINPIIYPCSSQEFKKAFQNVL
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pF1KB8 SRQH                                                        
         :                                                         
CCDS60 RIQCLCRKQSSKHALGYTLHPPSQAVEGQHKDMVRIPVGSRETFYRISKTDGVCEWKFFS
             350       360       370       380       390       400 

>>CCDS34869.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8               (475 aa)
 initn: 389 init1: 193 opt: 675  Z-score: 633.9  bits: 126.2 E(32554): 5.5e-29
Smith-Waterman score: 675; 34.7% identity (65.0% similar) in 346 aa overlap (18-356:4-344)

               10        20        30        40        50        60
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                        :  : : ...  .: .:.    ..:. ..:: :.      :.:
CCDS34               MVFLSGNASDSSNCTQPPAPVNISKAILLGVILGGLILFGVLGNIL
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pF1KB8 VLATILRVRTFHRVPHNLVASMAVSDVLVAALVMPLSLVHELSGRRWQLGRRLCQLWIAC
       :. ..   : .: : :  ....::.:.:... :.:.: . :. :  : .:: .:..: : 
CCDS34 VILSVACHRHLHSVTHYYIVNLAVADLLLTSTVLPFSAIFEVLGY-WAFGRVFCNIWAAV
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pF1KB8 DVLCCTASIWNVTAIALDRYWSITRHMEY-TLRTRKCVSNVMIAL-TWALSAVISLAPLL
       ::::::::: ..  :..::: ...  ..: :. :..   ..:  : .:::: :::..:: 
CCDS34 DVLCCTASIMGLCIISIDRYIGVSYPLRYPTIVTQR--RGLMALLCVWALSLVISIGPL-
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       ::: .   :    ::...::.:..::..:.::::: ..: .: ..: .:: .  . :.. 
CCDS34 FGWRQPAPEDETICQINEEPGYVLFSALGSFYLPLAIILVMYCRVYVVAKRESRGLKSGL
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pF1KB8 -SVSPISEAVEVKDSAKQ-PQMVFTVRHATVTFQPEGDTWREQKEQRAALMVGILIGVFV
        . .  :: : ..   :. :     .  : .  .      . ..:..::  .::..: ::
CCDS34 KTDKSDSEQVTLRIHRKNAPAGGSGMASAKTKTHFSVRLLKFSREKKAAKTLGIVVGCFV
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pF1KB8 LCWIPFFLTELISPLCSCDIPA--IWKSIFLWLGYSNSFFNPLIYTAFNKNYNSAFKNFF
       :::.::::.  :. .     :.  ..: .: :::: :: .::.::   ......::.: .
CCDS34 LCWLPFFLVMPIGSFFPDFKPSETVFKIVF-WLGYLNSCINPIIYPCSSQEFKKAFQNVL
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pF1KB8 SRQH                                                        
         :                                                         
CCDS34 RIQCLCRKQSSKHALGYTLHPPSQAVEGQHKDMVRIPVGSRETFYRISKTDGVCEWKFFS
             350       360       370       380       390       400 

>>CCDS4347.1 ADRA1B gene_id:147|Hs108|chr5                (520 aa)
 initn: 398 init1: 219 opt: 652  Z-score: 612.4  bits: 122.4 E(32554): 8.6e-28
Smith-Waterman score: 657; 33.7% identity (68.0% similar) in 353 aa overlap (7-349:20-359)

                            10        20        30        40       
pF1KB8              MDLPVNLTSFSLSTPSPLETNHSLGKDDLRPSSPLLSVFGVLILTLL
                          : . ... :.   .: .: . :.  .  .  :.:..::   
CCDS43 MNPDLDTGHNTSAPAHWGELKNANFTGPNQTSSNSTLPQLDITRAISVGLVLGAFIL---
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pF1KB8 GFLVAATFAWNLLVLATILRVRTFHRVPHN-LVASMAVSDVLVAALVMPLSLVHELSGRR
        : ...    :.::. ..   : . :.: : .....:..:.:..  :.:.: . :. :  
CCDS43 -FAIVG----NILVILSVACNRHL-RTPTNYFIVNLAMADLLLSFTVLPFSAALEVLGY-
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pF1KB8 WQLGRRLCQLWIACDVLCCTASIWNVTAIALDRYWSITRHMEY-TLRTRKCVSNVMIALT
       : ::: .:..: : ::::::::: .. ::..::: ..   ..: :: ::. .  ..... 
CCDS43 WVLGRIFCDIWAAVDVLCCTASILSLCAISIDRYIGVRYSLQYPTLVTRRKAILALLSV-
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pF1KB8 WALSAVISLAPLLFGWGETYSEGSEECQVSREPSYAVFSTVGAFYLPLCVVLFVYWKIYK
       :.::.:::..::: :: :   . ..:: :..:: ::.::..:.::.:: :.: .: ..: 
CCDS43 WVLSTVISIGPLL-GWKEPAPNDDKECGVTEEPFYALFSSLGSFYIPLAVILVMYCRVYI
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pF1KB8 AAKFRVGSRKTNSVSPISEAVEVKDSAKQPQMVFTVRHATVT--FQPEGDT----WREQK
       .::  . . ... .. .:.. :.    .. ..   .  .: .   .:...     .. ..
CCDS43 VAKRTTKNLEAGVMKEMSNSKELTLRIHSKNFHEDTLSSTKAKGHNPRSSIAVKLFKFSR
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pF1KB8 EQRAALMVGILIGVFVLCWIPFFLTELISPLCSCDIP--AIWKSIFLWLGYSNSFFNPLI
       :..::  .::..:.:.:::.:::..  .. : :   :  :..: .: :::: :: .::.:
CCDS43 EKKAAKTLGIVVGMFILCWLPFFIALPLGSLFSTLKPPDAVFKVVF-WLGYFNSCLNPII
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pF1KB8 YTAFNKNYNSAFKNFFSRQH                                        
       :   .:... ::                                                
CCDS43 YPCSSKEFKRAFVRILGCQCRGRGRRRRRRRRRLGGCAYTYRPWTRGGSLERSQSRKDSL
       350       360       370       380       390       400       

>>CCDS83269.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8               (342 aa)
 initn: 304 init1: 193 opt: 585  Z-score: 553.0  bits: 110.8 E(32554): 1.8e-24
Smith-Waterman score: 585; 35.1% identity (65.3% similar) in 291 aa overlap (18-303:4-290)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MDLPVNLTSFSLSTPSPLETNHSLGKDDLRPSSPLLSVFGVLILTLLGFLVAATFAWNLL
                        :  : : ...  .: .:.    ..:. ..:: :.      :.:
CCDS83               MVFLSGNASDSSNCTQPPAPVNISKAILLGVILGGLILFGVLGNIL
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pF1KB8 VLATILRVRTFHRVPHNLVASMAVSDVLVAALVMPLSLVHELSGRRWQLGRRLCQLWIAC
       :. ..   : .: : :  ....::.:.:... :.:.: . :. :  : .:: .:..: : 
CCDS83 VILSVACHRHLHSVTHYYIVNLAVADLLLTSTVLPFSAIFEVLGY-WAFGRVFCNIWAAV
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pF1KB8 DVLCCTASIWNVTAIALDRYWSITRHMEY-TLRTRKCVSNVMIAL-TWALSAVISLAPLL
       ::::::::: ..  :..::: ...  ..: :. :..   ..:  : .:::: :::..:: 
CCDS83 DVLCCTASIMGLCIISIDRYIGVSYPLRYPTIVTQR--RGLMALLCVWALSLVISIGPL-
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      180       190       200       210       220       230        
pF1KB8 FGWGETYSEGSEECQVSREPSYAVFSTVGAFYLPLCVVLFVYWKIYKAAKFRVGSRKTN-
       ::: .   :    ::...::.:..::..:.::::: ..: .: ..: .:: .  . :.. 
CCDS83 FGWRQPAPEDETICQINEEPGYVLFSALGSFYLPLAIILVMYCRVYVVAKRESRGLKSGL
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pF1KB8 -SVSPISEAVEVKDSAKQ-PQMVFTVRHATVTFQPEGDTWREQKEQRAALMVGILIGVFV
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CCDS83 KTDKSDSEQVTLRIHRKNAPAGGSGMASAKTKTHFSVRLLKFSREKKAAKTLGIVVGCFV
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       :::.::::                                                    
CCDS83 LCWLPFFLVMPIDEETEAQEGKNDSPSFKQPVHHAAVLGLEVMEKENLEGVSRKDTCGVW
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357 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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