Result of FASTA (omim) for
pF1KB8816
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8816, 379 aa
1>>>pF1KB8816 379 - 379 aa - 379 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7209+/-0.000425; mu= 14.7729+/- 0.026
mean_var=82.0463+/-16.412, 0's: 0 Z-trim(111.9): 96 B-trim: 39 in 1/50
Lambda= 0.141594
statistics sampled from 20550 (20681) to 20550 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.604), E-opt: 0.2 (0.242), width: 16
Scan time: 8.350
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_808817 (OMIM: 300364) armadillo repeat-containi ( 379) 2474 515.4 8.5e-146
NP_057691 (OMIM: 300364) armadillo repeat-containi ( 379) 2474 515.4 8.5e-146
NP_808816 (OMIM: 300364) armadillo repeat-containi ( 379) 2474 515.4 8.5e-146
XP_005262198 (OMIM: 300364) PREDICTED: armadillo r ( 379) 2474 515.4 8.5e-146
NP_057692 (OMIM: 300362) armadillo repeat-containi ( 453) 997 213.8 6.5e-55
NP_055597 (OMIM: 300363) armadillo repeat-containi ( 632) 875 188.9 2.7e-47
XP_005278172 (OMIM: 300363) PREDICTED: armadillo r ( 632) 875 188.9 2.7e-47
XP_016885483 (OMIM: 300363) PREDICTED: armadillo r ( 632) 875 188.9 2.7e-47
XP_016885486 (OMIM: 300363) PREDICTED: armadillo r ( 632) 875 188.9 2.7e-47
XP_016885485 (OMIM: 300363) PREDICTED: armadillo r ( 632) 875 188.9 2.7e-47
XP_016885481 (OMIM: 300363) PREDICTED: armadillo r ( 632) 875 188.9 2.7e-47
XP_005278170 (OMIM: 300363) PREDICTED: armadillo r ( 632) 875 188.9 2.7e-47
XP_005278168 (OMIM: 300363) PREDICTED: armadillo r ( 632) 875 188.9 2.7e-47
XP_016885479 (OMIM: 300363) PREDICTED: armadillo r ( 632) 875 188.9 2.7e-47
XP_005278171 (OMIM: 300363) PREDICTED: armadillo r ( 632) 875 188.9 2.7e-47
XP_005278167 (OMIM: 300363) PREDICTED: armadillo r ( 632) 875 188.9 2.7e-47
XP_005278173 (OMIM: 300363) PREDICTED: armadillo r ( 632) 875 188.9 2.7e-47
NP_001269160 (OMIM: 300363) armadillo repeat-conta ( 632) 875 188.9 2.7e-47
NP_808818 (OMIM: 300363) armadillo repeat-containi ( 632) 875 188.9 2.7e-47
XP_016885478 (OMIM: 300363) PREDICTED: armadillo r ( 632) 875 188.9 2.7e-47
XP_005278166 (OMIM: 300363) PREDICTED: armadillo r ( 632) 875 188.9 2.7e-47
XP_011529374 (OMIM: 300363) PREDICTED: armadillo r ( 632) 875 188.9 2.7e-47
XP_016885484 (OMIM: 300363) PREDICTED: armadillo r ( 632) 875 188.9 2.7e-47
XP_016885477 (OMIM: 300363) PREDICTED: armadillo r ( 632) 875 188.9 2.7e-47
XP_016885480 (OMIM: 300363) PREDICTED: armadillo r ( 632) 875 188.9 2.7e-47
XP_011529373 (OMIM: 300363) PREDICTED: armadillo r ( 632) 875 188.9 2.7e-47
XP_016885482 (OMIM: 300363) PREDICTED: armadillo r ( 632) 875 188.9 2.7e-47
XP_016885476 (OMIM: 300363) PREDICTED: armadillo r ( 632) 875 188.9 2.7e-47
XP_005278174 (OMIM: 300363) PREDICTED: armadillo r ( 632) 875 188.9 2.7e-47
NP_001154481 (OMIM: 611864) armadillo repeat-conta ( 308) 862 186.1 9.6e-47
XP_016868173 (OMIM: 611864) PREDICTED: armadillo r ( 352) 850 183.7 5.8e-46
XP_016868176 (OMIM: 611864) PREDICTED: armadillo r ( 273) 848 183.2 6.3e-46
XP_011514904 (OMIM: 611864) PREDICTED: armadillo r ( 280) 848 183.2 6.4e-46
XP_011514903 (OMIM: 611864) PREDICTED: armadillo r ( 316) 848 183.2 7.1e-46
NP_114111 (OMIM: 611864) armadillo repeat-containi ( 343) 848 183.3 7.6e-46
NP_001154483 (OMIM: 611864) armadillo repeat-conta ( 284) 558 124.0 4.4e-28
XP_016868174 (OMIM: 611864) PREDICTED: armadillo r ( 328) 546 121.5 2.7e-27
NP_001092880 (OMIM: 300417) G-protein coupled rece (1395) 440 100.3 2.9e-20
NP_055525 (OMIM: 300417) G-protein coupled recepto (1395) 440 100.3 2.9e-20
XP_016885470 (OMIM: 300417) PREDICTED: G-protein c (1395) 440 100.3 2.9e-20
NP_001171656 (OMIM: 300417) G-protein coupled rece (1395) 440 100.3 2.9e-20
NP_001092881 (OMIM: 300417) G-protein coupled rece (1395) 440 100.3 2.9e-20
XP_016885471 (OMIM: 300417) PREDICTED: G-protein c (1395) 440 100.3 2.9e-20
NP_001171803 (OMIM: 300969) G-protein coupled rece ( 838) 415 95.0 6.6e-19
NP_001171805 (OMIM: 300969) G-protein coupled rece ( 838) 415 95.0 6.6e-19
NP_001171804 (OMIM: 300969) G-protein coupled rece ( 838) 415 95.0 6.6e-19
NP_612446 (OMIM: 300969) G-protein coupled recepto ( 838) 415 95.0 6.6e-19
NP_001004051 (OMIM: 300969) G-protein coupled rece ( 838) 415 95.0 6.6e-19
NP_001135998 (OMIM: 300921) protein BHLHb9 [Homo s ( 547) 406 93.1 1.7e-18
NP_001135999 (OMIM: 300921) protein BHLHb9 [Homo s ( 547) 406 93.1 1.7e-18
>>NP_808817 (OMIM: 300364) armadillo repeat-containing X (379 aa)
initn: 2474 init1: 2474 opt: 2474 Z-score: 2738.5 bits: 515.4 E(85289): 8.5e-146
Smith-Waterman score: 2474; 100.0% identity (100.0% similar) in 379 aa overlap (1-379:1-379)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MGYARKVGWVTAGLVIGAGACYCIYRLTRGRKQNKEKMAEGGSGDVDDAGDCSGARYNDW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_808 MGYARKVGWVTAGLVIGAGACYCIYRLTRGRKQNKEKMAEGGSGDVDDAGDCSGARYNDW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 SDDDDDSNESKSIVWYPPWARIGTEAGTRARARARARATRARRAVQKRASPNSDDTVLSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_808 SDDDDDSNESKSIVWYPPWARIGTEAGTRARARARARATRARRAVQKRASPNSDDTVLSP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 QELQKVLCLVEMSEKPYILEAALIALGNNAAYAFNRDIIRDLGGLPIVAKILNTRDPIVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_808 QELQKVLCLVEMSEKPYILEAALIALGNNAAYAFNRDIIRDLGGLPIVAKILNTRDPIVK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 EKALIVLNNLSVNAENQRRLKVYMNQVCDDTITSRLNSSVQLAGLRLLTNMTVTNEYQHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_808 EKALIVLNNLSVNAENQRRLKVYMNQVCDDTITSRLNSSVQLAGLRLLTNMTVTNEYQHM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 LANSISDFFRLFSAGNEETKLQVLKLLLNLAENPAMTRELLRAQVPSSLGSLFNKKENKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_808 LANSISDFFRLFSAGNEETKLQVLKLLLNLAENPAMTRELLRAQVPSSLGSLFNKKENKE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 VILKLLVIFENINDNFKWEENEPTQNQFGEGSLFFFLKEFQVCADKVLGIESHHDFLVKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_808 VILKLLVIFENINDNFKWEENEPTQNQFGEGSLFFFLKEFQVCADKVLGIESHHDFLVKV
310 320 330 340 350 360
370
pF1KB8 KVGKFMAKLAEHMFPKSQE
:::::::::::::::::::
NP_808 KVGKFMAKLAEHMFPKSQE
370
>>NP_057691 (OMIM: 300364) armadillo repeat-containing X (379 aa)
initn: 2474 init1: 2474 opt: 2474 Z-score: 2738.5 bits: 515.4 E(85289): 8.5e-146
Smith-Waterman score: 2474; 100.0% identity (100.0% similar) in 379 aa overlap (1-379:1-379)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MGYARKVGWVTAGLVIGAGACYCIYRLTRGRKQNKEKMAEGGSGDVDDAGDCSGARYNDW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 MGYARKVGWVTAGLVIGAGACYCIYRLTRGRKQNKEKMAEGGSGDVDDAGDCSGARYNDW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 SDDDDDSNESKSIVWYPPWARIGTEAGTRARARARARATRARRAVQKRASPNSDDTVLSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 SDDDDDSNESKSIVWYPPWARIGTEAGTRARARARARATRARRAVQKRASPNSDDTVLSP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 QELQKVLCLVEMSEKPYILEAALIALGNNAAYAFNRDIIRDLGGLPIVAKILNTRDPIVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 QELQKVLCLVEMSEKPYILEAALIALGNNAAYAFNRDIIRDLGGLPIVAKILNTRDPIVK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 EKALIVLNNLSVNAENQRRLKVYMNQVCDDTITSRLNSSVQLAGLRLLTNMTVTNEYQHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 EKALIVLNNLSVNAENQRRLKVYMNQVCDDTITSRLNSSVQLAGLRLLTNMTVTNEYQHM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 LANSISDFFRLFSAGNEETKLQVLKLLLNLAENPAMTRELLRAQVPSSLGSLFNKKENKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 LANSISDFFRLFSAGNEETKLQVLKLLLNLAENPAMTRELLRAQVPSSLGSLFNKKENKE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 VILKLLVIFENINDNFKWEENEPTQNQFGEGSLFFFLKEFQVCADKVLGIESHHDFLVKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 VILKLLVIFENINDNFKWEENEPTQNQFGEGSLFFFLKEFQVCADKVLGIESHHDFLVKV
310 320 330 340 350 360
370
pF1KB8 KVGKFMAKLAEHMFPKSQE
:::::::::::::::::::
NP_057 KVGKFMAKLAEHMFPKSQE
370
>>NP_808816 (OMIM: 300364) armadillo repeat-containing X (379 aa)
initn: 2474 init1: 2474 opt: 2474 Z-score: 2738.5 bits: 515.4 E(85289): 8.5e-146
Smith-Waterman score: 2474; 100.0% identity (100.0% similar) in 379 aa overlap (1-379:1-379)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MGYARKVGWVTAGLVIGAGACYCIYRLTRGRKQNKEKMAEGGSGDVDDAGDCSGARYNDW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_808 MGYARKVGWVTAGLVIGAGACYCIYRLTRGRKQNKEKMAEGGSGDVDDAGDCSGARYNDW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 SDDDDDSNESKSIVWYPPWARIGTEAGTRARARARARATRARRAVQKRASPNSDDTVLSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_808 SDDDDDSNESKSIVWYPPWARIGTEAGTRARARARARATRARRAVQKRASPNSDDTVLSP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 QELQKVLCLVEMSEKPYILEAALIALGNNAAYAFNRDIIRDLGGLPIVAKILNTRDPIVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_808 QELQKVLCLVEMSEKPYILEAALIALGNNAAYAFNRDIIRDLGGLPIVAKILNTRDPIVK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 EKALIVLNNLSVNAENQRRLKVYMNQVCDDTITSRLNSSVQLAGLRLLTNMTVTNEYQHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_808 EKALIVLNNLSVNAENQRRLKVYMNQVCDDTITSRLNSSVQLAGLRLLTNMTVTNEYQHM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 LANSISDFFRLFSAGNEETKLQVLKLLLNLAENPAMTRELLRAQVPSSLGSLFNKKENKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_808 LANSISDFFRLFSAGNEETKLQVLKLLLNLAENPAMTRELLRAQVPSSLGSLFNKKENKE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 VILKLLVIFENINDNFKWEENEPTQNQFGEGSLFFFLKEFQVCADKVLGIESHHDFLVKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_808 VILKLLVIFENINDNFKWEENEPTQNQFGEGSLFFFLKEFQVCADKVLGIESHHDFLVKV
310 320 330 340 350 360
370
pF1KB8 KVGKFMAKLAEHMFPKSQE
:::::::::::::::::::
NP_808 KVGKFMAKLAEHMFPKSQE
370
>>XP_005262198 (OMIM: 300364) PREDICTED: armadillo repea (379 aa)
initn: 2474 init1: 2474 opt: 2474 Z-score: 2738.5 bits: 515.4 E(85289): 8.5e-146
Smith-Waterman score: 2474; 100.0% identity (100.0% similar) in 379 aa overlap (1-379:1-379)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MGYARKVGWVTAGLVIGAGACYCIYRLTRGRKQNKEKMAEGGSGDVDDAGDCSGARYNDW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MGYARKVGWVTAGLVIGAGACYCIYRLTRGRKQNKEKMAEGGSGDVDDAGDCSGARYNDW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 SDDDDDSNESKSIVWYPPWARIGTEAGTRARARARARATRARRAVQKRASPNSDDTVLSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SDDDDDSNESKSIVWYPPWARIGTEAGTRARARARARATRARRAVQKRASPNSDDTVLSP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 QELQKVLCLVEMSEKPYILEAALIALGNNAAYAFNRDIIRDLGGLPIVAKILNTRDPIVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QELQKVLCLVEMSEKPYILEAALIALGNNAAYAFNRDIIRDLGGLPIVAKILNTRDPIVK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 EKALIVLNNLSVNAENQRRLKVYMNQVCDDTITSRLNSSVQLAGLRLLTNMTVTNEYQHM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EKALIVLNNLSVNAENQRRLKVYMNQVCDDTITSRLNSSVQLAGLRLLTNMTVTNEYQHM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 LANSISDFFRLFSAGNEETKLQVLKLLLNLAENPAMTRELLRAQVPSSLGSLFNKKENKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LANSISDFFRLFSAGNEETKLQVLKLLLNLAENPAMTRELLRAQVPSSLGSLFNKKENKE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 VILKLLVIFENINDNFKWEENEPTQNQFGEGSLFFFLKEFQVCADKVLGIESHHDFLVKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VILKLLVIFENINDNFKWEENEPTQNQFGEGSLFFFLKEFQVCADKVLGIESHHDFLVKV
310 320 330 340 350 360
370
pF1KB8 KVGKFMAKLAEHMFPKSQE
:::::::::::::::::::
XP_005 KVGKFMAKLAEHMFPKSQE
370
>>NP_057692 (OMIM: 300362) armadillo repeat-containing X (453 aa)
initn: 1109 init1: 963 opt: 997 Z-score: 1106.8 bits: 213.8 E(85289): 6.5e-55
Smith-Waterman score: 997; 51.9% identity (82.5% similar) in 297 aa overlap (80-369:159-453)
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 GDCSGARYNDWSDDDDDSNESKSIVWYPPWARIGTEAGTRARARARARATRA-------R
.: : .:. .....::...::: :
NP_057 VGTISGNRTLAPSLPCPGGRGGGCHPTRSGSRAGGRASGKSKGKARSKSTRAPATTWPVR
130 140 150 160 170 180
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 RAVQKRASPNSDDTVLSPQELQKVLCLVEMSEKPYILEAALIALGNNAAYAFNRDIIRDL
:. : : . : .:: .::::: ..: .. :.: :.::..:::::::.::.. ::.:
NP_057 RG--KFNFPYKIDDILSAPDLQKVLNILERTNDPFIQEVALVTLGNNAAYSFNQNAIREL
190 200 210 220 230 240
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 GGLPIVAKILNTRDPIVKEKALIVLNNLSVNAENQRRLKVYMNQVCDDTITSRLNSSVQL
::.::.::...:.:::..::. .::::::::::: ..:.:..::::::.. ::.:.::.
NP_057 GGVPIIAKLIKTKDPIIREKTYNALNNLSVNAENQGKIKTYISQVCDDTMVCRLDSAVQM
250 260 270 280 290 300
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 AGLRLLTNMTVTNEYQHMLANSISDFFRLFSAGNEETKLQVLKLLLNLAENPAMTRELLR
:::::::::::::.:::.:. :. ::: :. ::. ::.:..::..:..:::::::::.
NP_057 AGLRLLTNMTVTNHYQHLLSYSFPDFFALLFLGNHFTKIQIMKLIINFTENPAMTRELVS
310 320 330 340 350 360
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 AQVPSSLGSLFNKKENKEVILKLLVIFENINDNFKWEENEPTQNQFGEGSLFFFLKEFQV
.::: : :::::. ..:..:..:..:::::::.: : ....:...::::..:: :
NP_057 CKVPSELISLFNKEWDREILLNILTLFENINDNIKNEGLASSRKEFSRSSLFFLFKESGV
370 380 390 400 410 420
350 360 370
pF1KB8 CADKVLGIESHHDFLVKVKVGKFMAKLAEHMFPKSQE
:. :. .. .:.:..::::: : ..::
NP_057 CVKKIKALANHNDLVVKVKVLKVLTKL
430 440 450
>>NP_055597 (OMIM: 300363) armadillo repeat-containing X (632 aa)
initn: 1007 init1: 742 opt: 875 Z-score: 970.0 bits: 188.9 E(85289): 2.7e-47
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XP_005 HHDLLVKVKVIKLVNKF
620 630
>>XP_016885483 (OMIM: 300363) PREDICTED: armadillo repea (632 aa)
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Smith-Waterman score: 875; 42.9% identity (73.8% similar) in 347 aa overlap (29-369:294-632)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MGYARKVGWVTAGLVIGAGACYCIYRLTRGR-KQNKEKMAEGGSG--DVDDAGDCSGA
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XP_016 HTGAIPKATSATGAVPKGGGKGVTRSRNGGKGKGKKSKVEVDELGMGFRPGDGAAAAAAA
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XP_016 SANGGQAFLAEVPDSEEGES-----GWTDTESDSDSEPETQRRGRGRRPV-AMQKRPFPY
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XP_016 NKTDPHIKEKALMAMNNLSENYENQGRLQVYMNKVMDDIMASNLNSAVQVVGLKFLTNMT
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pF1KB8 VTNEYQHMLANSISDFFRLFSAGNEETKLQVLKLLLNLAENPAMTRELLRAQVPSSLGSL
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XP_016 HTGAIPKATSATGAVPKGGGKGVTRSRNGGKGKGKKSKVEVDELGMGFRPGDGAAAAAAA
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XP_016 SANGGQAFLAEVPDSEEGES-----GWTDTESDSDSEPETQRRGRGRRPV-AMQKRPFPY
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pF1KB8 SDDTVLSPQELQKVLCLVEMSEKPYILEAALIALGNNAAYAFNRDIIRDLGGLPIVAKIL
: .:. ..:.::: :.. :. :.: ..::..:.::: :. :.. :: ::::::.:...
XP_016 EIDEILGVRDLRKVLALLQKSDDPFIQQVALLTLSNNANYSCNQETIRKLGGLPIIANMI
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XP_016 NKTDPHIKEKALMAMNNLSENYENQGRLQVYMNKVMDDIMASNLNSAVQVVGLKFLTNMT
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240 250 260 270 280 290
pF1KB8 VTNEYQHMLANSISDFFRLFSAGNEETKLQVLKLLLNLAENPAMTRELLRAQVPSSLGSL
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XP_016 ITNDYQHLLVNSIANFFRLLSQGGGKIKVEILKILSNFAENPDMLKKLLSTQVPASFSSL
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XP_016 YNSYVESEILINALTLFEIIYDNLRAEVF--NYREFNKGSLFYLCTTSGVCVKKIRALAN
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pF1KB8 HHDFLVKVKVGKFMAKLAEHMFPKSQE
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XP_016 HHDLLVKVKVIKLVNKF
620 630
>>XP_016885485 (OMIM: 300363) PREDICTED: armadillo repea (632 aa)
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Smith-Waterman score: 875; 42.9% identity (73.8% similar) in 347 aa overlap (29-369:294-632)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MGYARKVGWVTAGLVIGAGACYCIYRLTRGR-KQNKEKMAEGGSG--DVDDAGDCSGA
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XP_016 HTGAIPKATSATGAVPKGGGKGVTRSRNGGKGKGKKSKVEVDELGMGFRPGDGAAAAAAA
270 280 290 300 310 320
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 RYND---WSDDDDDSNESKSIVWYPPWARIGTEAGTRARARARARATRARRAVQKRASPN
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XP_016 SANGGQAFLAEVPDSEEGES-----GWTDTESDSDSEPETQRRGRGRRPV-AMQKRPFPY
330 340 350 360 370
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 SDDTVLSPQELQKVLCLVEMSEKPYILEAALIALGNNAAYAFNRDIIRDLGGLPIVAKIL
: .:. ..:.::: :.. :. :.: ..::..:.::: :. :.. :: ::::::.:...
XP_016 EIDEILGVRDLRKVLALLQKSDDPFIQQVALLTLSNNANYSCNQETIRKLGGLPIIANMI
380 390 400 410 420 430
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 NTRDPIVKEKALIVLNNLSVNAENQRRLKVYMNQVCDDTITSRLNSSVQLAGLRLLTNMT
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XP_016 NKTDPHIKEKALMAMNNLSENYENQGRLQVYMNKVMDDIMASNLNSAVQVVGLKFLTNMT
440 450 460 470 480 490
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 VTNEYQHMLANSISDFFRLFSAGNEETKLQVLKLLLNLAENPAMTRELLRAQVPSSLGSL
.::.:::.:.:::..::::.: :. . :...::.: :.:::: : ..:: .:::.:..::
XP_016 ITNDYQHLLVNSIANFFRLLSQGGGKIKVEILKILSNFAENPDMLKKLLSTQVPASFSSL
500 510 520 530 540 550
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 FNKKENKEVILKLLVIFENINDNFKWEENEPTQNQFGEGSLFFFLKEFQVCADKVLGIES
.:. ..:.... :..:: : ::.. : . .:..::::.. ::. :. .. .
XP_016 YNSYVESEILINALTLFEIIYDNLRAEVF--NYREFNKGSLFYLCTTSGVCVKKIRALAN
560 570 580 590 600 610
360 370
pF1KB8 HHDFLVKVKVGKFMAKLAEHMFPKSQE
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XP_016 HHDLLVKVKVIKLVNKF
620 630
379 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 15:49:12 2016 done: Fri Nov 4 15:49:13 2016
Total Scan time: 8.350 Total Display time: 0.030
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]