Result of FASTA (ccds) for pF1KB8113
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8113, 380 aa
  1>>>pF1KB8113 380 - 380 aa - 380 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9705+/-0.000882; mu= 19.0249+/- 0.053
 mean_var=71.0456+/-14.888, 0's: 0 Z-trim(105.7): 37  B-trim: 3 in 1/48
 Lambda= 0.152162
 statistics sampled from 8561 (8586) to 8561 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.627), E-opt: 0.2 (0.264), width:  16
 Scan time:  1.510

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS973.1 CERS2 gene_id:29956|Hs108|chr1           ( 380) 2573 574.1 7.2e-164
CCDS10384.1 CERS3 gene_id:204219|Hs108|chr15       ( 383) 1438 324.9 7.4e-89
CCDS12197.1 CERS4 gene_id:79603|Hs108|chr19        ( 394) 1296 293.8 1.8e-79
CCDS8801.1 CERS5 gene_id:91012|Hs108|chr12         ( 392) 1095 249.6 3.5e-66
CCDS2228.1 CERS6 gene_id:253782|Hs108|chr2         ( 384) 1088 248.1 9.9e-66
CCDS58734.1 CERS6 gene_id:253782|Hs108|chr2        ( 392) 1063 242.6 4.5e-64
CCDS61120.1 CERS5 gene_id:91012|Hs108|chr12        ( 334)  940 215.5 5.4e-56


>>CCDS973.1 CERS2 gene_id:29956|Hs108|chr1                (380 aa)
 initn: 2573 init1: 2573 opt: 2573  Z-score: 3055.4  bits: 574.1 E(32554): 7.2e-164
Smith-Waterman score: 2573; 100.0% identity (100.0% similar) in 380 aa overlap (1-380:1-380)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MLQTLYDYFWWERLWLPVNLTWADLEDRDGRVYAKASDLYITLPLALLFLIVRYFFELYV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 MLQTLYDYFWWERLWLPVNLTWADLEDRDGRVYAKASDLYITLPLALLFLIVRYFFELYV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 ATPLAALLNIKEKTRLRAPPNATLEHFYLTSGKQPKQVEVELLSRQSGLSGRQVERWFRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 ATPLAALLNIKEKTRLRAPPNATLEHFYLTSGKQPKQVEVELLSRQSGLSGRQVERWFRR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 RRNQDRPSLLKKFREASWRFTFYLIAFIAGMAVIVDKPWFYDMKKVWEGYPIQSTIPSQY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 RRNQDRPSLLKKFREASWRFTFYLIAFIAGMAVIVDKPWFYDMKKVWEGYPIQSTIPSQY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 WYYMIELSFYWSLLFSIASDVKRKDFKEQIIHHVATIILISFSWFANYIRAGTLIMALHD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 WYYMIELSFYWSLLFSIASDVKRKDFKEQIIHHVATIILISFSWFANYIRAGTLIMALHD
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 SSDYLLESAKMFNYAGWKNTCNNIFIVFAIVFIITRLVILPFWILHCTLVYPLELYPAFF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 SSDYLLESAKMFNYAGWKNTCNNIFIVFAIVFIITRLVILPFWILHCTLVYPLELYPAFF
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 GYYFFNSMMGVLQLLHIFWAYLILRMAHKFITGKLVEDERSDREETESSEGEEAAAGGGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 GYYFFNSMMGVLQLLHIFWAYLILRMAHKFITGKLVEDERSDREETESSEGEEAAAGGGA
              310       320       330       340       350       360

              370       380
pF1KB8 KSRPLANGHPILNNNHRKND
       ::::::::::::::::::::
CCDS97 KSRPLANGHPILNNNHRKND
              370       380

>>CCDS10384.1 CERS3 gene_id:204219|Hs108|chr15            (383 aa)
 initn: 1198 init1: 1156 opt: 1438  Z-score: 1708.8  bits: 324.9 E(32554): 7.4e-89
Smith-Waterman score: 1438; 52.6% identity (77.5% similar) in 382 aa overlap (1-376:1-381)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MLQTLYDYFWWERLWLPVNLTWADLEDRDGRVYAKASDLYITLPLALLFLIVRYFFELYV
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CCDS10 MFWTFKEWFWLERFWLPPTIKWSDLEDHDGLVFVKPSHLYVTIPYAFLLLIIRRVFEKFV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 ATPLAALLNIKEKTRLRAPPNATLEHFYLTSGKQPKQVEVELLSRQSGLSGRQVERWFRR
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CCDS10 ASPLAKSFGIKETVR-KVTPNTVLENFFKHSTRQPLQTDIYGLAKKCNLTERQVERWFRS
               70         80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 RRNQDRPSLLKKFREASWRFTFYLIAFIAGMAVIVDKPWFYDMKKVWEGYPIQSTIPSQY
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CCDS10 RRNQERPSRLKKFQEACWRFAFYLMITVAGIAFLYDKPWLYDLWEVWNGYPKQPLLPSQY
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 WYYMIELSFYWSLLFSIASDVKRKDFKEQIIHHVATIILISFSWFANYIRAGTLIMALHD
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CCDS10 WYYILEMSFYWSLLFRLGFDVKRKDFLAHIIHHLAAISLMSFSWCANYIRSGTLVMIVHD
     180       190       200       210       220       230         

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 SSDYLLESAKMFNYAGWKNTCNNIFIVFAIVFIITRLVILPFWILHCTLVYPLELYPAFF
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CCDS10 VADIWLESAKMFSYAGWTQTCNTLFFIFSTIFFISRLIVFPFWILYCTLILPMYHLEPFF
     240       250       260       270       280       290         

              310       320       330       340        350         
pF1KB8 GYYFFNSMMGVLQLLHIFWAYLILRMAHKFITGKLVEDERSDREE-TESSEGEEAAAGGG
       .: :.: .. .::.::..:.: ::.: .. :  : ..: ::: :.  :  : ::  :  :
CCDS10 SYIFLNLQLMILQVLHLYWGYYILKMLNRCIFMKSIQDVRSDDEDYEEEEEEEEEEATKG
     300       310       320       330       340       350         

     360            370       380
pF1KB8 AKSRPLANG-----HPILNNNHRKND
        .   : ::     : : :..:    
CCDS10 KEMDCLKNGLRAERHLIPNGQHGH  
     360       370       380     

>>CCDS12197.1 CERS4 gene_id:79603|Hs108|chr19             (394 aa)
 initn: 1246 init1: 1246 opt: 1296  Z-score: 1540.2  bits: 293.8 E(32554): 1.8e-79
Smith-Waterman score: 1296; 49.9% identity (76.8% similar) in 371 aa overlap (1-370:1-370)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MLQTLYDYFWWERLWLPVNLTWADLEDRDGRVYAKASDLYITLPLALLFLIVRYFFELYV
       ::... ..:: .:.::: :.::..::::::::: . .::  .:::::..: .:  :: ..
CCDS12 MLSSFNEWFWQDRFWLPPNVTWTELEDRDGRVYPHPQDLLAALPLALVLLAMRLAFERFI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 ATPLAALLNIKEKTRLRAPPNATLEHFYLTSGKQPKQVEVELLSRQSGLSGRQVERWFRR
       . ::.  :.....:: .. ::::::. .:: :..::. .. ::. : ::. .:..:::::
CCDS12 GLPLSRWLGVRDQTRRQVKPNATLEKHFLTEGHRPKEPQLSLLAAQCGLTLQQTQRWFRR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 RRNQDRPSLLKKFREASWRFTFYLIAFIAGMAVIVDKPWFYDMKKVWEGYPIQSTIPSQY
       :::::::.: ::: :::::: ::: .:..:..:.  . :..     :. :: :.  :: :
CCDS12 RRNQDRPQLTKKFCEASWRFLFYLSSFVGGLSVLYHESWLWAPVMCWDRYPNQTLKPSLY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 WYYMIELSFYWSLLFSIASDVKRKDFKEQIIHHVATIILISFSWFANYIRAGTLIMALHD
       :.:..::.:: :::. .  ::::::::::.::: ...::..::. :: .: :.:.. :::
CCDS12 WWYLLELGFYLSLLIRLPFDVKRKDFKEQVIHHFVAVILMTFSYSANLLRIGSLVLLLHD
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 SSDYLLESAKMFNYAGWKNTCNNIFIVFAIVFIITRLVILPFWILHCTLVYPLELYPAFF
       :::::::. :: ::  ....:. .:..:..::. ::::..:  ::. :    .     ::
CCDS12 SSDYLLEACKMVNYMQYQQVCDALFLIFSFVFFYTRLVLFPTQILYTTYYESISNRGPFF
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330        340       350         
pF1KB8 GYYFFNSMMGVLQLLHIFWAYLILRMAHKFIT-GKLVEDERSDREETESSEGEEAAAGGG
       ::::::... .:::::.::. ::::: ..:.  :.. .: ::: ::..::: : :::   
CCDS12 GYYFFNGLLMLLQLLHVFWSCLILRMLYSFMKKGQMEKDIRSDVEESDSSE-EAAAAQEP
              310       320       330       340       350          

     360       370       380              
pF1KB8 AKSRPLANGHPILNNNHRKND              
        . .  : : :                        
CCDS12 LQLKNGAAGGPRPAPTDGPRSRVAGRLTNRHTTAT
     360       370       380       390    

>>CCDS8801.1 CERS5 gene_id:91012|Hs108|chr12              (392 aa)
 initn: 1054 init1: 954 opt: 1095  Z-score: 1301.7  bits: 249.6 E(32554): 3.5e-66
Smith-Waterman score: 1095; 45.2% identity (73.7% similar) in 354 aa overlap (2-353:9-360)

                      10        20         30        40        50  
pF1KB8        MLQTLYDYFWWERLWLPVNLTWADLED-RDGRVYAKASDLYITLPLALLFLIV
               :. :. ..: ::.::: :..:::::   ::  : ..  .  ..:::  ...:
CCDS88 MATAAQGPLSLLWGWLWSERFWLPENVSWADLEGPADGYGYPRGRHILSVFPLAAGIFFV
               10        20        30        40        50        60

             60        70        80        90       100       110  
pF1KB8 RYFFELYVATPLAALLNIKEKTRLRAPPNATLEHFYLTSGKQPKQVEVELLSRQSGLSGR
       : .:: ..: : :  ..:...   .: ::: ::. ...  : : . ..: ::.:   . :
CCDS88 RLLFERFIAKPCALCIGIEDSGPYQAQPNAILEKVFISITKYPDKKRLEGLSKQLDWNVR
               70        80        90       100       110       120

            120       130       140       150       160       170  
pF1KB8 QVERWFRRRRNQDRPSLLKKFREASWRFTFYLIAFIAGMAVIVDKPWFYDMKKVWEGYPI
       ... :::.:::::.:  : :: :. :::::::  :  :.  . ..:::.:... :..::.
CCDS88 KIQCWFRHRRNQDKPPTLTKFCESMWRFTFYLCIFCYGIRFLWSSPWFWDIRQCWHNYPF
              130       140       150       160       170       180

            180       190       200       210       220       230  
pF1KB8 QSTIPSQYWYYMIELSFYWSLLFSIASDVKRKDFKEQIIHHVATIILISFSWFANYIRAG
       :    . : ::..::.:::::.::  .:.:::::  ...::..:: :::::.. :..:.:
CCDS88 QPLSSGLYHYYIMELAFYWSLMFSQFTDIKRKDFLIMFVHHLVTIGLISFSYINNMVRVG
              190       200       210       220       230       240

            240       250       260       270       280       290  
pF1KB8 TLIMALHDSSDYLLESAKMFNYAGWKNTCNNIFIVFAIVFIITRLVILPFWILHCTLVYP
       :::: ::: ::.:::.::. ::: ..  :...:..:. ::..::: : :::::. ::   
CCDS88 TLIMCLHDVSDFLLEAAKLANYAKYQRLCDTLFVIFSAVFMVTRLGIYPFWILNTTLFES
              250       260       270       280       290       300

            300       310       320        330       340       350 
pF1KB8 LELYPAFFGYYFFNSMMGVLQLLHIFWAYLILRMAHK-FITGKLVEDERSDREETESSEG
        :.   . .....:... .:::::..:.::: :.: : .: ::. .:.::: :   ::: 
CCDS88 WEIIGPYASWWLLNGLLLTLQLLHVIWSYLIARIALKALIRGKVSKDDRSDVES--SSEE
              310       320       330       340       350          

             360       370       380     
pF1KB8 EEAAAGGGAKSRPLANGHPILNNNHRKND     
       :.                                
CCDS88 EDVTTCTKSPCDSSSSNGANRVNGHMGGSYWAEE
      360       370       380       390  

>>CCDS2228.1 CERS6 gene_id:253782|Hs108|chr2              (384 aa)
 initn: 1060 init1: 1060 opt: 1088  Z-score: 1293.5  bits: 248.1 E(32554): 9.9e-66
Smith-Waterman score: 1088; 43.1% identity (72.9% similar) in 362 aa overlap (8-368:7-367)

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       .::..::::::::.::  .:.:::::  ...::...:.::.::.  :. :.:::.. :::
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        ..   .::                 
CCDS22 PHTATTTNGTSGTNGYLLTGSCSMDD
      360       370       380    

>>CCDS58734.1 CERS6 gene_id:253782|Hs108|chr2             (392 aa)
 initn: 1123 init1: 1039 opt: 1063  Z-score: 1263.8  bits: 242.6 E(32554): 4.5e-64
Smith-Waterman score: 1063; 43.0% identity (72.1% similar) in 358 aa overlap (8-359:7-364)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MLQTLYDYFWWERLWLPVNLTWADLEDRDGRVYAKASDLYITLPLALLFLIVRYFFELYV
              .:: ::.::: :.:::::.. .  .. .: :::...:::. ...:: .:: .:
CCDS58  MAGILAWFWNERFWLPHNVTWADLKNTEEATFPQAEDLYLAFPLAFCIFMVRLIFERFV
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       : : :  :::. .    ::::: ::. . .  :.: . ..: ::.:   . :...::::.
CCDS58 AKPCAIALNIQANGPQIAPPNAILEKVFTAITKHPDEKRLEGLSKQLDWDVRSIQRWFRQ
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       ::::..:: : .: :. :::.::: .:  :.  .   ::... .. : .:: :    . .
CCDS58 RRNQEKPSTLTRFCESMWRFSFYLYVFTYGVRFLKKTPWLWNTRHCWYNYPYQPLTTDLH
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       .::..::::::::.::  .:.:::::  ...::...:.::.::.  :. :.:::.. :::
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       :.: :::.::: ::: ... :. .:..::.::: ::: :.:.:.:. ::    :.   . 
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       ... :: .. ..: :. ::.:::...: : .. ::      ..  ..:: . :::  :: 
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pF1KB8 AAGGGAKSRPLANGHPILNNNHRKND       
       .   :                            
CCDS58 SEPPGKNPHTATTTNGTSGTNGYLLTGSCSMDD
     360       370       380       390  

>>CCDS61120.1 CERS5 gene_id:91012|Hs108|chr12             (334 aa)
 initn: 873 init1: 873 opt: 940  Z-score: 1118.8  bits: 215.5 E(32554): 5.4e-56
Smith-Waterman score: 940; 45.9% identity (74.7% similar) in 296 aa overlap (59-353:9-302)

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CCDS61                       MMKPRPKRFIAKPCALCIGIEDSGPYQAQPNAILEKVF
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pF1KB8 LTSGKQPKQVEVELLSRQSGLSGRQVERWFRRRRNQDRPSLLKKFREASWRFTFYLIAFI
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CCDS61 ISITKYPDKKRLEGLSKQLDWNVRKIQCWFRHRRNQDKPPTLTKFCESMWRFTFYLCIFC
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        :.  . ..:::.:... :..::.:    . : ::..::.:::::.::  .:.:::::  
CCDS61 YGIRFLWSSPWFWDIRQCWHNYPFQPLSSGLYHYYIMELAFYWSLMFSQFTDIKRKDFLI
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       . ::..::: : :::::. ::    :.   . .....:... .:::::..:.::: :.: 
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380 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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 start: Fri Nov  4 09:38:24 2016 done: Fri Nov  4 09:38:24 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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