Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7375
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7375, 311 aa
1>>>pF1KB7375 311 - 311 aa - 311 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7326+/-0.0013; mu= 7.5912+/- 0.075
mean_var=206.4017+/-74.104, 0's: 0 Z-trim(102.3): 412 B-trim: 416 in 1/45
Lambda= 0.089272
statistics sampled from 6374 (6892) to 6374 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.555), E-opt: 0.2 (0.212), width: 16
Scan time: 2.420
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31108.1 OR2M4 gene_id:26245|Hs108|chr1 ( 311) 2029 275.0 5.2e-74
CCDS31105.1 OR2M5 gene_id:127059|Hs108|chr1 ( 312) 1558 214.3 9.5e-56
CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1 ( 347) 1553 213.8 1.6e-55
CCDS31107.1 OR2M3 gene_id:127062|Hs108|chr1 ( 312) 1549 213.2 2.1e-55
CCDS31111.1 OR2M7 gene_id:391196|Hs108|chr1 ( 312) 1544 212.5 3.3e-55
CCDS4461.1 OR2V2 gene_id:285659|Hs108|chr5 ( 315) 1204 168.8 5.1e-42
CCDS31100.1 OR2T8 gene_id:343172|Hs108|chr1 ( 312) 1192 167.2 1.5e-41
CCDS58992.1 OR2V1 gene_id:26693|Hs108|chr5 ( 315) 1187 166.6 2.3e-41
CCDS31109.1 OR2T33 gene_id:391195|Hs108|chr1 ( 320) 1175 165.0 6.8e-41
CCDS31116.1 OR2T2 gene_id:401992|Hs108|chr1 ( 324) 1175 165.0 6.8e-41
CCDS31110.1 OR2T12 gene_id:127064|Hs108|chr1 ( 320) 1163 163.5 2e-40
CCDS31123.1 OR2T35 gene_id:403244|Hs108|chr1 ( 323) 1161 163.2 2.4e-40
CCDS31121.1 OR2T10 gene_id:127069|Hs108|chr1 ( 312) 1134 159.7 2.6e-39
CCDS31124.1 OR2T27 gene_id:403239|Hs108|chr1 ( 317) 1112 156.9 1.9e-38
CCDS31118.1 OR2T5 gene_id:401993|Hs108|chr1 ( 315) 1105 156.0 3.5e-38
CCDS55695.1 OR2T29 gene_id:343563|Hs108|chr1 ( 315) 1105 156.0 3.5e-38
CCDS31115.1 OR2T1 gene_id:26696|Hs108|chr1 ( 369) 1105 156.1 3.8e-38
CCDS31113.1 OR2T4 gene_id:127074|Hs108|chr1 ( 348) 1102 155.7 4.8e-38
CCDS31117.1 OR2T3 gene_id:343173|Hs108|chr1 ( 318) 1073 151.9 6.1e-37
CCDS31120.1 OR2T34 gene_id:127068|Hs108|chr1 ( 318) 1057 149.8 2.5e-36
CCDS31114.1 OR2T6 gene_id:254879|Hs108|chr1 ( 308) 1045 148.3 7.3e-36
CCDS31104.1 OR2L3 gene_id:391192|Hs108|chr1 ( 312) 1045 148.3 7.3e-36
CCDS34696.1 OR2AE1 gene_id:81392|Hs108|chr7 ( 323) 1042 147.9 9.8e-36
CCDS31103.1 OR2L2 gene_id:26246|Hs108|chr1 ( 312) 1034 146.9 2e-35
CCDS32895.1 OR2Z1 gene_id:284383|Hs108|chr19 ( 314) 1031 146.5 2.6e-35
CCDS31413.1 OR2AG2 gene_id:338755|Hs108|chr11 ( 316) 997 142.1 5.4e-34
CCDS1637.1 OR2L13 gene_id:284521|Hs108|chr1 ( 312) 996 142.0 5.8e-34
CCDS58068.1 OR2L5 gene_id:81466|Hs108|chr1 ( 312) 995 141.8 6.4e-34
CCDS31414.1 OR2AG1 gene_id:144125|Hs108|chr11 ( 316) 976 139.4 3.5e-33
CCDS31102.1 OR2AK2 gene_id:391191|Hs108|chr1 ( 335) 972 138.9 5.2e-33
CCDS31560.1 OR5A2 gene_id:219981|Hs108|chr11 ( 324) 931 133.6 2e-31
CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 918 131.9 6.1e-31
CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 918 131.9 6.1e-31
CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 910 130.9 1.3e-30
CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 909 130.8 1.4e-30
CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 902 129.9 2.8e-30
CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 896 129.1 4.4e-30
CCDS31515.1 OR5F1 gene_id:338674|Hs108|chr11 ( 314) 895 129.0 4.8e-30
CCDS43669.1 OR2A25 gene_id:392138|Hs108|chr7 ( 310) 893 128.7 5.7e-30
CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 889 128.2 8.5e-30
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 881 127.2 1.7e-29
CCDS43115.1 OR5K1 gene_id:26339|Hs108|chr3 ( 308) 880 127.0 1.8e-29
CCDS31712.1 OR8A1 gene_id:390275|Hs108|chr11 ( 326) 877 126.7 2.5e-29
CCDS30898.1 OR10R2 gene_id:343406|Hs108|chr1 ( 335) 872 126.0 3.9e-29
CCDS31706.1 OR8D1 gene_id:283159|Hs108|chr11 ( 308) 870 125.7 4.4e-29
CCDS31551.1 OR5B12 gene_id:390191|Hs108|chr11 ( 314) 867 125.3 5.9e-29
CCDS31516.1 OR5AS1 gene_id:219447|Hs108|chr11 ( 324) 867 125.4 6e-29
CCDS43672.1 OR2A14 gene_id:135941|Hs108|chr7 ( 310) 866 125.2 6.4e-29
CCDS31534.1 OR5AP2 gene_id:338675|Hs108|chr11 ( 316) 866 125.2 6.4e-29
CCDS35093.1 OR13C9 gene_id:286362|Hs108|chr9 ( 318) 866 125.2 6.5e-29
>>CCDS31108.1 OR2M4 gene_id:26245|Hs108|chr1 (311 aa)
initn: 2029 init1: 2029 opt: 2029 Z-score: 1442.2 bits: 275.0 E(32554): 5.2e-74
Smith-Waterman score: 2029; 100.0% identity (100.0% similar) in 311 aa overlap (1-311:1-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MVWENQTFNSIFILLGIFNHSPTHTFLFSLVLGIFSLALMENISMVLLIYIEKQLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MVWENQTFNSIFILLGIFNHSPTHTFLFSLVLGIFSLALMENISMVLLIYIEKQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FLLSQLSLMDLMLICTTLPKMIFSYLSGKKSISLAGCGTQIFFYVSLLGAECFLLAVMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FLLSQLSLMDLMLICTTLPKMIFSYLSGKKSISLAGCGTQIFFYVSLLGAECFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DRYVAICHPLQYTILMNPKLCVFMTVASWTLGSLDGIIVLAAVLSFSYCSSLEIHHFFCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DRYVAICHPLQYTILMNPKLCVFMTVASWTLGSLDGIIVLAAVLSFSYCSSLEIHHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 VAALLPLSCTETSAFERLLVICCVVMLIFPVSVIILSYSHVLRAVIHMGSGESRRKAFTT
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CCDS31 VAALLPLSCTETSAFERLLVICCVVMLIFPVSVIILSYSHVLRAVIHMGSGESRRKAFTT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CSSHLSVVGLYYGAAMFMYMRPASKHTPDQDKMVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVFRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CSSHLSVVGLYYGAAMFMYMRPASKHTPDQDKMVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVFRA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 LQKVLKKRKLI
:::::::::::
CCDS31 LQKVLKKRKLI
310
>>CCDS31105.1 OR2M5 gene_id:127059|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1573 init1: 1551 opt: 1558 Z-score: 1114.4 bits: 214.3 E(32554): 9.5e-56
Smith-Waterman score: 1558; 74.4% identity (90.3% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MVWENQTFNSIFILLGIFNHSPTHTFLFSLVLGIFSLALMENISMVLLIYIEKQLHTPMY
:.:::::::: ::::::::::::::::: :::.:::.:.: : ::::::.. :::::::
CCDS31 MAWENQTFNSDFILLGIFNHSPTHTFLFFLVLAIFSVAFMGNSVMVLLIYLDTQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FLLSQLSLMDLMLICTTLPKMIFSYLSGKKSISLAGCGTQIFFYVSLLGAECFLLAVMAY
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CCDS31 FLLSQLFLMDLMLICSTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCATQIFFYVSLLGSECFLLAVMSY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DRYVAICHPLQYTILMNPKLCVFMTVASWTLGSLDGIIVLAAVLSFSYCSSLEIHHFFCD
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CCDS31 DRYIAICHPLRYTNLMRPKICGLMTAFSWILGSMDAIIDAVATFSFSYCGSREIAHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 VAALLPLSCTETSAFERLLVICCVVMLIFPVSVIILSYSHVLRAVIHMGSGESRRKAFTT
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CCDS31 FPSLLILSCNDTSIFEKVLFICCIVMIVFPVAIIIASYARVILAVIHMGSGEGRRKAFTT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CSSHLSVVGLYYGAAMFMYMRPASKHTPDQDKMVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVFRA
::::: :::.::::..:::.::.: ..: :::.::.::::::::::::::::::::: ::
CCDS31 CSSHLMVVGMYYGAGLFMYIRPTSDRSPMQDKLVSVFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 LQKVLKKRKLI
:.::: : :
CCDS31 LRKVLGKGKCGE
310
>>CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1 (347 aa)
initn: 1546 init1: 1546 opt: 1553 Z-score: 1110.4 bits: 213.8 E(32554): 1.6e-55
Smith-Waterman score: 1553; 74.1% identity (89.0% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MVWENQTFNSIFILLGIFNHSPTHTFLFSLVLGIFSLALMENISMVLLIYIEKQLHTPMY
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CCDS31 MAWENQTFNSDFILLGIFNHSPPHTFLFFLVLGIFLVAFMGNSVMVLLIYLDTQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FLLSQLSLMDLMLICTTLPKMIFSYLSGKKSISLAGCGTQIFFYVSLLGAECFLLAVMAY
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CCDS31 FLLSQLSLMDLMLICTTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCVTQIFFYISLSGSECFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DRYVAICHPLQYTILMNPKLCVFMTVASWTLGSLDGIIVLAAVLSFSYCSSLEIHHFFCD
:::.::::::.:: :::::.: .:.. :: ::: :::: .:..:::.:.: :: ::::.
CCDS31 DRYIAICHPLRYTNLMNPKICGLMATFSWILGSTDGIIDAVATFSFSFCGSREIAHFFCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 VAALLPLSCTETSAFERLLVICCVVMLIFPVSVIILSYSHVLRAVIHMGSGESRRKAFTT
.:: :::..:: ::... :::.:::.:::..:: ::..:. :::::::::.: :::::
CCDS31 FPSLLILSCNDTSIFEEVIFICCIVMLVFPVAIIIASYARVILAVIHMGSGEGRCKAFTT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CSSHLSVVGLYYGAAMFMYMRPASKHTPDQDKMVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVFRA
::::: :::.:::::.:::.::.: :.: ::::::.::::::::::::::::::::: ::
CCDS31 CSSHLMVVGMYYGAALFMYIRPTSDHSPTQDKMVSVFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 LQKVLKKRKLI
..:.: : :
CCDS31 FMKILGKGKSESELPHKLYVLLFAKFFFLISIFFYDVKILALIMYIA
310 320 330 340
>>CCDS31107.1 OR2M3 gene_id:127062|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1565 init1: 1545 opt: 1549 Z-score: 1108.1 bits: 213.2 E(32554): 2.1e-55
Smith-Waterman score: 1549; 74.4% identity (90.6% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MVWENQTFNSIFILLGIFNHSPTHTFLFSLVLGIFSLALMENISMVLLIYIEKQLHTPMY
:. ::.:::: ::::::::::::::::: :::.:::.:.: : ::::::.. :::::::
CCDS31 MARENSTFNSDFILLGIFNHSPTHTFLFFLVLAIFSVAFMGNSVMVLLIYLDTQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FLLSQLSLMDLMLICTTLPKMIFSYLSGKKSISLAGCGTQIFFYVSLLGAECFLLAVMAY
.::::::::::::::::.::: :.::::.::::.:::.::::::.::::.::::::::::
CCDS31 LLLSQLSLMDLMLICTTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCATQIFFYTSLLGSECFLLAVMAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DRYVAICHPLQYTILMNPKLCVFMTVASWTLGSLDGIIVLAAVLSFSYCSSLEIHHFFCD
:::.::::::.:: ::.::.: .::. :: ::: :::: ..:..:::::.: :: :::::
CCDS31 DRYTAICHPLRYTNLMSPKICGLMTAFSWILGSTDGIIDVVATFSFSYCGSREIAHFFCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 VAALLPLSCTETSAFERLLVICCVVMLIFPVSVIILSYSHVLRAVIHMGSGESRRKAFTT
.:: :::..:: ::..: :::.::..:::..:: ::..:. :::::::::.:::::::
CCDS31 FPSLLILSCSDTSIFEKILFICCIVMIVFPVAIIIASYARVILAVIHMGSGEGRRKAFTT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CSSHLSVVGLYYGAAMFMYMRPASKHTPDQDKMVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVFRA
::::: :::.:::::.:::.::.: ..: ::::::.::::::::::::::::::::: ::
CCDS31 CSSHLLVVGMYYGAALFMYIRPTSDRSPTQDKMVSVFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 LQKVLKKRKLI
..:.: : :
CCDS31 FMKILGKGKSGE
310
>>CCDS31111.1 OR2M7 gene_id:391196|Hs108|chr1 (312 aa)
initn: 1556 init1: 1537 opt: 1544 Z-score: 1104.6 bits: 212.5 E(32554): 3.3e-55
Smith-Waterman score: 1544; 73.8% identity (90.0% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MVWENQTFNSIFILLGIFNHSPTHTFLFSLVLGIFSLALMENISMVLLIYIEKQLHTPMY
:.:::::::: :.::::::::::::::: :::.:::.:.: : ::::::.. :::::::
CCDS31 MAWENQTFNSDFLLLGIFNHSPTHTFLFFLVLAIFSVAFMGNSIMVLLIYLDTQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FLLSQLSLMDLMLICTTLPKMIFSYLSGKKSISLAGCGTQIFFYVSLLGAECFLLAVMAY
:::::::::::::::::.::: :.::::.::::.:::.::::::.::::.::::::::.:
CCDS31 FLLSQLSLMDLMLICTTVPKMAFNYLSGSKSISMAGCATQIFFYISLLGSECFLLAVMSY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DRYVAICHPLQYTILMNPKLCVFMTVASWTLGSLDGIIVLAAVLSFSYCSSLEIHHFFCD
:::.::::::.:: :: ::.: .::. :: ::: :::: .:..:::::.: :: :: ::
CCDS31 DRYTAICHPLRYTNLMRPKICGLMTAFSWILGSTDGIIDAVATFSFSYCGSREIAHFCCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 VAALLPLSCTETSAFERLLVICCVVMLIFPVSVIILSYSHVLRAVIHMGSGESRRKAFTT
.:: :::..:: ::... :::.:::.:::..:: ::..:. :::::::::.:::::::
CCDS31 FPSLLILSCNDTSIFEEVIFICCIVMLVFPVAIIITSYARVILAVIHMGSGEGRRKAFTT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CSSHLSVVGLYYGAAMFMYMRPASKHTPDQDKMVSAFYTILTPMLNPLIYSLRNKEVFRA
::::: :::.::::..:: ..:.:.:.: ::::::.::::.:::::::::::::::: ::
CCDS31 CSSHLMVVGMYYGAGLFMCIQPTSHHSPMQDKMVSVFYTIVTPMLNPLIYSLRNKEVTRA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 LQKVLKKRKLI
:.:.: : :
CCDS31 LMKILGKGKSGD
310
>>CCDS4461.1 OR2V2 gene_id:285659|Hs108|chr5 (315 aa)
initn: 1239 init1: 1192 opt: 1204 Z-score: 867.9 bits: 168.8 E(32554): 5.1e-42
Smith-Waterman score: 1204; 53.9% identity (85.1% similar) in 308 aa overlap (3-310:4-311)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MVWENQTFNSIFILLGIFNHSPTHTFLFSLVLGIFSLALMENISMVLLIYIEKQLHTPM
: ::.... :.:::::.:: . :::.:...:..:: :. ...:::.. .:::::
CCDS44 METWVNQSYTDGFFLLGIFSHSTADLVLFSVVMAVFTVALCGNVLLIFLIYMDPHLHTPM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 YFLLSQLSLMDLMLICTTLPKMIFSYLSGKKSISLAGCGTQIFFYVSLLGAECFLLAVMA
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: . . .
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CCDS58 ALRKGLDRCRIGSQH
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]