Result of FASTA (ccds) for pF1KB7359
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7359, 339 aa
  1>>>pF1KB7359 339 - 339 aa - 339 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1906+/-0.000975; mu= 11.8150+/- 0.057
 mean_var=97.1401+/-21.090, 0's: 0 Z-trim(105.6): 71  B-trim: 402 in 1/50
 Lambda= 0.130129
 statistics sampled from 8406 (8492) to 8406 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.63), E-opt: 0.2 (0.261), width:  16
 Scan time:  2.390

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS53944.1 USP50 gene_id:373509|Hs108|chr15       ( 334) 2303 442.9 1.7e-124
CCDS61632.1 USP8 gene_id:9101|Hs108|chr15          (1012)  733 148.5 2.2e-35
CCDS10137.1 USP8 gene_id:9101|Hs108|chr15          (1118)  733 148.5 2.4e-35
CCDS58189.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11          ( 362)  428 91.0 1.7e-18
CCDS8423.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11           ( 396)  421 89.7 4.4e-18
CCDS8422.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11           ( 605)  421 89.8 6.2e-18
CCDS8963.1 USP15 gene_id:9958|Hs108|chr12          ( 952)  352 77.0 7.1e-14
CCDS58251.1 USP15 gene_id:9958|Hs108|chr12         ( 981)  351 76.8 8.3e-14
CCDS30920.1 USP21 gene_id:27005|Hs108|chr1         ( 565)  340 74.6 2.2e-13
CCDS31952.1 USP12 gene_id:219333|Hs108|chr13       ( 370)  337 73.9 2.3e-13
CCDS47054.1 USP46 gene_id:64854|Hs108|chr4         ( 359)  336 73.7 2.6e-13
CCDS47053.1 USP46 gene_id:64854|Hs108|chr4         ( 366)  336 73.7 2.6e-13
CCDS2794.1 USP4 gene_id:7375|Hs108|chr3            ( 916)  334 73.6 7.2e-13
CCDS2793.1 USP4 gene_id:7375|Hs108|chr3            ( 963)  334 73.6 7.5e-13
CCDS11069.2 USP6 gene_id:9098|Hs108|chr17          (1406)  319 70.9 7.1e-12
CCDS32697.1 USP32 gene_id:84669|Hs108|chr17        (1604)  319 70.9 7.9e-12
CCDS14277.1 USP11 gene_id:8237|Hs108|chrX          ( 963)  299 67.0 7.1e-11


>>CCDS53944.1 USP50 gene_id:373509|Hs108|chr15            (334 aa)
 initn: 1750 init1: 1750 opt: 2303  Z-score: 2348.6  bits: 442.9 E(32554): 1.7e-124
Smith-Waterman score: 2303; 98.2% identity (98.5% similar) in 339 aa overlap (1-339:1-334)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MTSQPSLPADDFDIYHVLAECTDYYDTLPVKEADGNQPHFQGVTGLWNLGNTCCVNAISQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MTSQPSLPADDFDIYHVLAECTDYYDTLPVKEADGNQPHFQGVTGLWNLGNTCCVNAISQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 CLCSILPLVEYFLTGKYITALQKFLLPSDCSEVATAFAYLMTDMWLGDSDCVSPEIFWSA
       ::::::::::::::::::::::     .::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 CLCSILPLVEYFLTGKYITALQ-----NDCSEVATAFAYLMTDMWLGDSDCVSPEIFWSA
               70        80             90       100       110     

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 LGNLYPAFTKKMQQDAQEFLICVLNELHEALKKYHYSRRRSYEKGSTQRCCRKWITTETS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LGNLYPAFTKKMQQDAQEFLICVLNELHEALKKYHYSRRRSYEKGSTQRCCRKWITTETS
         120       130       140       150       160       170     

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 IITQLFEEQLNYSIVCLKCEKCTYKNEVFTVFSLPIPSKYECSLRDCLQCFFQQDALTWN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 IITQLFEEQLNYSIVCLKCEKCTYKNEVFTVFSLPIPSKYECSLRDCLQCFFQQDALTWN
         180       190       200       210       220       230     

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 NEIHCSFCETKQETAVRASISKAPKIIIFHLKRFDIQGTTKRKLRTDIHYPLTNLDLTPY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NEIHCSFCETKQETAVRASISKAPKIIIFHLKRFDIQGTTKRKLRTDIHYPLTNLDLTPY
         240       250       260       270       280       290     

              310       320       330         
pF1KB7 ICSIFRKYPKYNLCAVVNHFGDLDGGHYTAFCKNSVTQA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ICSIFRKYPKYNLCAVVNHFGDLDGGHYTAFCKNSVTQA
         300       310       320       330    

>>CCDS61632.1 USP8 gene_id:9101|Hs108|chr15               (1012 aa)
 initn: 739 init1: 493 opt: 733  Z-score: 748.7  bits: 148.5 E(32554): 2.2e-35
Smith-Waterman score: 734; 37.8% identity (65.7% similar) in 312 aa overlap (38-338:661-972)

        10        20        30        40            50        60   
pF1KB7 PADDFDIYHVLAECTDYYDTLPVKEADGNQPHFQG----VTGLWNLGNTCCVNAISQCLC
                                     : : :    .::: :::::: .:.: ::::
CCDS61 TPTVNRENKPTCYPKAEISRLSASQIRNLNPVFGGSGPALTGLRNLGNTCYMNSILQCLC
              640       650       660       670       680       690

            70        80        90       100       110       120   
pF1KB7 SILPLVEYFLTGKYITALQKFLLPSDCSEVATAFAYLMTDMWLGDSDCVSPEIFWSALGN
       .   :..::  . :   ...  : .  .:::  :. .:  .: :.   .::. :  ..:.
CCDS61 NAPHLADYFNRNCYQDDINRSNLLGHKGEVAEEFGIIMKALWTGQYRYISPKDFKITIGK
              700       710       720       730       740       750

           130       140       150       160              170      
pF1KB7 LYPAFTKKMQQDAQEFLICVLNELHEALKKYHYSRRRSYEKG-------STQRCCRKWIT
       .   :.   :::.::.:. ... ::: :.:    .: . :..       ....  .:   
CCDS61 INDQFAGYSQQDSQELLLFLMDGLHEDLNKADNRKRYKEENNDHLDDFKAAEHAWQKHKQ
              760       770       780       790       800       810

        180       190       200       210       220       230      
pF1KB7 TETSIITQLFEEQLNYSIVCLKCEKCTYKNEVFTVFSLPIPSKYECSLRDCLQCFFQQDA
        . :::. ::. :.. .. :: :.: .   :.:  .:::. :  .:.:.:::. : ... 
CCDS61 LNESIIVALFQGQFKSTVQCLTCHKKSRTFEAFMYLSLPLASTSKCTLQDCLRLFSKEEK
              820       830       840       850       860       870

        240       250       260       270       280       290      
pF1KB7 LTWNNEIHCSFCETKQETAVRASISKAPKIIIFHLKRFDIQGTTKRKLRTDIHYPLTNLD
       :: ::...:: :......  .  : : : ... :::::. .:  :.::.:.. .:: :::
CCDS61 LTDNNRFYCSHCRARRDSLKKIEIWKLPPVLLVHLKRFSYDGRWKQKLQTSVDFPLENLD
              880       890       900       910       920       930

        300       310       320       330                          
pF1KB7 LTPYICSIFRKYPKYNLCAVVNHFGDLDGGHYTAFCKNSVTQA                 
       :. :. .   .  :::: .: ::.: ::::::::.:::.. :                  
CCDS61 LSQYVIGPKNNLKKYNLFSVSNHYGGLDGGHYTAYCKNAARQRWFKFDDHEVSDISVSSV
              940       950       960       970       980       990

CCDS61 KSSAAYILFYTSLGPRVTDVAT
             1000      1010  

>>CCDS10137.1 USP8 gene_id:9101|Hs108|chr15               (1118 aa)
 initn: 739 init1: 493 opt: 733  Z-score: 748.1  bits: 148.5 E(32554): 2.4e-35
Smith-Waterman score: 734; 37.8% identity (65.7% similar) in 312 aa overlap (38-338:767-1078)

        10        20        30        40            50        60   
pF1KB7 PADDFDIYHVLAECTDYYDTLPVKEADGNQPHFQG----VTGLWNLGNTCCVNAISQCLC
                                     : : :    .::: :::::: .:.: ::::
CCDS10 TPTVNRENKPTCYPKAEISRLSASQIRNLNPVFGGSGPALTGLRNLGNTCYMNSILQCLC
        740       750       760       770       780       790      

            70        80        90       100       110       120   
pF1KB7 SILPLVEYFLTGKYITALQKFLLPSDCSEVATAFAYLMTDMWLGDSDCVSPEIFWSALGN
       .   :..::  . :   ...  : .  .:::  :. .:  .: :.   .::. :  ..:.
CCDS10 NAPHLADYFNRNCYQDDINRSNLLGHKGEVAEEFGIIMKALWTGQYRYISPKDFKITIGK
        800       810       820       830       840       850      

           130       140       150       160              170      
pF1KB7 LYPAFTKKMQQDAQEFLICVLNELHEALKKYHYSRRRSYEKG-------STQRCCRKWIT
       .   :.   :::.::.:. ... ::: :.:    .: . :..       ....  .:   
CCDS10 INDQFAGYSQQDSQELLLFLMDGLHEDLNKADNRKRYKEENNDHLDDFKAAEHAWQKHKQ
        860       870       880       890       900       910      

        180       190       200       210       220       230      
pF1KB7 TETSIITQLFEEQLNYSIVCLKCEKCTYKNEVFTVFSLPIPSKYECSLRDCLQCFFQQDA
        . :::. ::. :.. .. :: :.: .   :.:  .:::. :  .:.:.:::. : ... 
CCDS10 LNESIIVALFQGQFKSTVQCLTCHKKSRTFEAFMYLSLPLASTSKCTLQDCLRLFSKEEK
        920       930       940       950       960       970      

        240       250       260       270       280       290      
pF1KB7 LTWNNEIHCSFCETKQETAVRASISKAPKIIIFHLKRFDIQGTTKRKLRTDIHYPLTNLD
       :: ::...:: :......  .  : : : ... :::::. .:  :.::.:.. .:: :::
CCDS10 LTDNNRFYCSHCRARRDSLKKIEIWKLPPVLLVHLKRFSYDGRWKQKLQTSVDFPLENLD
        980       990      1000      1010      1020      1030      

        300       310       320       330                          
pF1KB7 LTPYICSIFRKYPKYNLCAVVNHFGDLDGGHYTAFCKNSVTQA                 
       :. :. .   .  :::: .: ::.: ::::::::.:::.. :                  
CCDS10 LSQYVIGPKNNLKKYNLFSVSNHYGGLDGGHYTAYCKNAARQRWFKFDDHEVSDISVSSV
       1040      1050      1060      1070      1080      1090      

CCDS10 KSSAAYILFYTSLGPRVTDVAT
       1100      1110        

>>CCDS58189.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11               (362 aa)
 initn: 555 init1: 178 opt: 428  Z-score: 445.7  bits: 91.0 E(32554): 1.7e-18
Smith-Waterman score: 557; 34.9% identity (58.3% similar) in 321 aa overlap (27-334:7-321)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MTSQPSLPADDFDIYHVLAECTDYYDTLPVKEADGNQPHFQGVTGLWNLGNTCCVNAISQ
                                 : : ..   :.   ::..:: :::::: .:.: :
CCDS58                     MLVPGSTRPYSKKRQNSKSAQGLAGLRNLGNTCFMNSILQ
                                   10        20        30        40

               70        80        90       100        110         
pF1KB7 CLCSILPLVEYFLTGKYITALQKFLLPSDCSEVATAFAYLMTDMWLGD-SDCVSPEIFWS
       :: .   : .: :   :.  :..    .  . ..  :: :.  .: .. .: :::  : .
CCDS58 CLSNTRELRDYCLQRLYMRDLHH--GSNAHTALVEEFAKLIQTIWTSSPNDVVSPSEFKT
               50        60          70        80        90        

     120       130       140       150       160                   
pF1KB7 ALGNLYPAFTKKMQQDAQEFLICVLNELHEALKKYHYSRRRSY----------EKGSTQR
        .    : :.   ::::::::  .:. ::. ...    : .:           :::  ..
CCDS58 QIQRYAPRFVGYNQQDAQEFLRFLLDGLHNEVNRVTL-RPKSNPENLDHLPDDEKG--RQ
      100       110       120       130        140       150       

     170       180       190       200       210        220        
pF1KB7 CCRKWITTETSIITQLFEEQLNYSIVCLKCEKCTYKNEVFTVFSLPIPSK-Y-ECSLRDC
         ::..  : : : .::  ::. :..:  :  :.   . :  .:::: .. : : .: ::
CCDS58 MWRKYLEREDSRIGDLFVGQLKSSLTCTDCGYCSTVFDPFWDLSLPIAKRGYPEVTLMDC
         160       170       180       190       200       210     

       230       240       250       260       270       280       
pF1KB7 LQCFFQQDALTWNNEIHCSFCETKQETAVRASISKAPKIIIFHLKRFDIQGTTKRKLRTD
       .. : ..:.:  ...  :  :. ...   . ::.. :::...:::::. .     :: : 
CCDS58 MRLFTKEDVLDGDEKPTCCRCRGRKRCIKKFSIQRFPKILVLHLKRFSESRIRTSKLTTF
         220       230       240       250       260       270     

       290       300       310       320       330                 
pF1KB7 IHYPLTNLDLTPYICSIFRKYPKYNLCAVVNHFGDLDGGHYTAFCKNSVTQA        
       ...:: .:::  .  :   ..  ::: :: :: :   ::::::.:..             
CCDS58 VNFPLRDLDLREFA-SENTNHAVYNLYAVSNHSGTTMGGHYTAYCRSPGTGEWHTFNDSS
         280        290       300       310       320       330    

CCDS58 VTPMSSSQVRTSDAYLLFYELASPPSRM
          340       350       360  

>>CCDS8423.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11                (396 aa)
 initn: 555 init1: 178 opt: 421  Z-score: 438.1  bits: 89.7 E(32554): 4.4e-18
Smith-Waterman score: 550; 35.3% identity (58.3% similar) in 312 aa overlap (36-334:50-355)

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pF1KB7 SLPADDFDIYHVLAECTDYYDTLPVKEADGNQPHFQGVTGLWNLGNTCCVNAISQCLCSI
                                     :.   ::..:: :::::: .:.: ::: . 
CCDS84 ALAKELRPRSPLSPSLLLSTFVGLLLNKAKNSKSAQGLAGLRNLGNTCFMNSILQCLSNT
      20        30        40        50        60        70         

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pF1KB7 LPLVEYFLTGKYITALQKFLLPSDCSEVATAFAYLMTDMWLGD-SDCVSPEIFWSALGNL
         : .: :   :.  :..    .  . ..  :: :.  .: .. .: :::  : . .   
CCDS84 RELRDYCLQRLYMRDLHH--GSNAHTALVEEFAKLIQTIWTSSPNDVVSPSEFKTQIQRY
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pF1KB7 YPAFTKKMQQDAQEFLICVLNELHEALKKYHYSRRRSY----------EKGSTQRCCRKW
        : :.   ::::::::  .:. ::. ...    : .:           :::  .   ::.
CCDS84 APRFVGYNQQDAQEFLRFLLDGLHNEVNRVTL-RPKSNPENLDHLPDDEKGRQMW--RKY
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       .  : : : .::  ::. :..:  :  :.   . :  .:::: .. : : .: ::.. : 
CCDS84 LEREDSRIGDLFVGQLKSSLTCTDCGYCSTVFDPFWDLSLPIAKRGYPEVTLMDCMRLFT
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pF1KB7 QQDALTWNNEIHCSFCETKQETAVRASISKAPKIIIFHLKRFDIQGTTKRKLRTDIHYPL
       ..:.:  ...  :  :. ...   . ::.. :::...:::::. .     :: : ...::
CCDS84 KEDVLDGDEKPTCCRCRGRKRCIKKFSIQRFPKILVLHLKRFSESRIRTSKLTTFVNFPL
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pF1KB7 TNLDLTPYICSIFRKYPKYNLCAVVNHFGDLDGGHYTAFCKNSVTQA             
        .:::  .  :   ..  ::: :: :: :   ::::::.:..                  
CCDS84 RDLDLREFA-SENTNHAVYNLYAVSNHSGTTMGGHYTAYCRSPGTGEWHTFNDSSVTPMS
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CCDS84 SSQVRTSDAYLLFYELASPPSRM
           380       390      

>>CCDS8422.1 USP2 gene_id:9099|Hs108|chr11                (605 aa)
 initn: 555 init1: 178 opt: 421  Z-score: 435.4  bits: 89.8 E(32554): 6.2e-18
Smith-Waterman score: 554; 35.6% identity (58.7% similar) in 315 aa overlap (34-334:256-564)

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pF1KB7 QPSLPADDFDIYHVLAECTDYYDTLPVKEADG-NQPHFQGVTGLWNLGNTCCVNAISQCL
                                     :: :.   ::..:: :::::: .:.: :::
CCDS84 PTYRPIGRYTLWETGKGQAPGPSRSSSPGRDGMNSKSAQGLAGLRNLGNTCFMNSILQCL
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pF1KB7 CSILPLVEYFLTGKYITALQKFLLPSDCSEVATAFAYLMTDMWLGD-SDCVSPEIFWSAL
        .   : .: :   :.  :..    .  . ..  :: :.  .: .. .: :::  : . .
CCDS84 SNTRELRDYCLQRLYMRDLHHG--SNAHTALVEEFAKLIQTIWTSSPNDVVSPSEFKTQI
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pF1KB7 GNLYPAFTKKMQQDAQEFLICVLNELHEALKKYHYSRRRSY----------EKGSTQRCC
           : :.   ::::::::  .:. ::. ...    : .:           :::  ..  
CCDS84 QRYAPRFVGYNQQDAQEFLRFLLDGLHNEVNRVTL-RPKSNPENLDHLPDDEKG--RQMW
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pF1KB7 RKWITTETSIITQLFEEQLNYSIVCLKCEKCTYKNEVFTVFSLPIPSK-Y-ECSLRDCLQ
       ::..  : : : .::  ::. :..:  :  :.   . :  .:::: .. : : .: ::..
CCDS84 RKYLEREDSRIGDLFVGQLKSSLTCTDCGYCSTVFDPFWDLSLPIAKRGYPEVTLMDCMR
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pF1KB7 CFFQQDALTWNNEIHCSFCETKQETAVRASISKAPKIIIFHLKRFDIQGTTKRKLRTDIH
        : ..:.:  ...  :  :. ...   . ::.. :::...:::::. .     :: : ..
CCDS84 LFTKEDVLDGDEKPTCCRCRGRKRCIKKFSIQRFPKILVLHLKRFSESRIRTSKLTTFVN
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pF1KB7 YPLTNLDLTPYICSIFRKYPKYNLCAVVNHFGDLDGGHYTAFCKNSVTQA          
       .:: .:::  .  :   ..  ::: :: :: :   ::::::.:..               
CCDS84 FPLRDLDLREFA-SENTNHAVYNLYAVSNHSGTTMGGHYTAYCRSPGTGEWHTFNDSSVT
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CCDS84 PMSSSQVRTSDAYLLFYELASPPSRM
     580       590       600     

>>CCDS8963.1 USP15 gene_id:9958|Hs108|chr12               (952 aa)
 initn: 609 init1: 272 opt: 352  Z-score: 362.6  bits: 77.0 E(32554): 7.1e-14
Smith-Waterman score: 352; 33.8% identity (57.3% similar) in 234 aa overlap (5-224:224-447)

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pF1KB7                           MTSQPSLPADDFDIYHVLAECTDY--YD-TLPVK
                                     :: :    . :  :   : :  :: . : .
CCDS89 PDSTIQDAGLYQGQVLVIEQKNEDGTWPRGPSTPNVKNSNY-CLPSYTAYKNYDYSEPGR
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pF1KB7 EADGNQPHFQGVTGLWNLGNTCCVNAISQCLCSILPLVEYFLTGKYITALQKFLLPSDC-
         ...::   :. :: :::::: .:.  ::: .  ::.::::. ::   :. :  :    
CCDS89 --NNEQP---GLCGLSNLGNTCFMNSAIQCLSNTPPLTEYFLNDKYQEELN-FDNPLGMR
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pF1KB7 SEVATAFAYLMTDMWLGDSDCVSPEIFWSALGNLYPAFTKKMQQDAQEFLICVLNELHEA
       .:.: ..: :. .:: :  . :.:. : . .: . : :.  .::: ::.:  .:. ::: 
CCDS89 GEIAKSYAELIKQMWSGKFSYVTPRAFKTQVGRFAPQFSGYQQQDCQELLAFLLDGLHED
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pF1KB7 LKKYHYSRRRSYEK-----GSTQRCCRK--W---ITTETSIITQLFEEQLNYSIVCLKCE
       :..    :.. : .     :  ..   .  :   .  . :::...:.  .. ..:: .: 
CCDS89 LNRI---RKKPYIQLKDADGRPDKVVAEEAWENHLKRNDSIIVDIFHGLFKSTLVCPECA
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pF1KB7 KCTYKNEVFTVFSLPIPSKYECSLRDCLQCFFQQDALTWNNEIHCSFCETKQETAVRASI
       : .   . :  ..::.: : : .:                                    
CCDS89 KISVTFDPFCYLTLPLPMKKERTLEVYLVRMDPLTKPMQYKVVVPKIGNILDLCTALSAL
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>>CCDS58251.1 USP15 gene_id:9958|Hs108|chr12              (981 aa)
 initn: 609 init1: 272 opt: 351  Z-score: 361.4  bits: 76.8 E(32554): 8.3e-14
Smith-Waterman score: 351; 34.2% identity (59.9% similar) in 202 aa overlap (34-224:282-476)

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pF1KB7 QPSLPADDFDIYHVLAECTDYYDTLPVKEADGNQPHFQGVTGLWNLGNTCCVNAISQCLC
                                     ...::   :. :: :::::: .:.  ::: 
CCDS58 NMNNRNVKNSNYCLPSYTAYKNYDYSEPGRNNEQP---GLCGLSNLGNTCFMNSAIQCLS
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pF1KB7 SILPLVEYFLTGKYITALQKFLLPSDC-SEVATAFAYLMTDMWLGDSDCVSPEIFWSALG
       .  ::.::::. ::   :. :  :    .:.: ..: :. .:: :  . :.:. : . .:
CCDS58 NTPPLTEYFLNDKYQEELN-FDNPLGMRGEIAKSYAELIKQMWSGKFSYVTPRAFKTQVG
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pF1KB7 NLYPAFTKKMQQDAQEFLICVLNELHEALKKYHYSRRRSYEK-----GSTQRCCRK--W-
        . : :.  .::: ::.:  .:. ::: :..    :.. : .     :  ..   .  : 
CCDS58 RFAPQFSGYQQQDCQELLAFLLDGLHEDLNRI---RKKPYIQLKDADGRPDKVVAEEAWE
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pF1KB7 --ITTETSIITQLFEEQLNYSIVCLKCEKCTYKNEVFTVFSLPIPSKYECSLRDCLQCFF
         .  . :::...:.  .. ..:: .: : .   . :  ..::.: : : .:        
CCDS58 NHLKRNDSIIVDIFHGLFKSTLVCPECAKISVTFDPFCYLTLPLPMKKERTLEVYLVRMD
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pF1KB7 QQDALTWNNEIHCSFCETKQETAVRASISKAPKIIIFHLKRFDIQGTTKRKLRTDIHYPL
                                                                   
CCDS58 PLTKPMQYKVVVPKIGNILDLCTALSALSGIPADKMIVTDIYNHRFHRIFAMDENLSSIM
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>>CCDS30920.1 USP21 gene_id:27005|Hs108|chr1              (565 aa)
 initn: 460 init1: 163 opt: 340  Z-score: 353.7  bits: 74.6 E(32554): 2.2e-13
Smith-Waterman score: 502; 32.3% identity (56.8% similar) in 322 aa overlap (42-333:210-524)

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pF1KB7 FDIYHVLAECTDYYDTLPVKEADGNQPHFQGVTGLWNLGNTCCVNAISQCLCSILPLVEY
                                     : .:: :::::: .::. ::: :  :: ..
CCDS30 HGSFHMISARSSEPFYSDDKMAHHTLLLGSGHVGLRNLGNTCFLNAVLQCLSSTRPLRDF
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pF1KB7 FLTGKYITALQKFLLPSDCSEVATAFAYLMTDMWLGDS-DCVSPEIFWSALGNLYPAFTK
        :   .    :.    .  .:.. ::: ..  .:  :: . :.:  : ... .  :.:. 
CCDS30 CLRRDF---RQEVPGGGRAQELTEAFADVIGALWHPDSCEAVNPTRFRAVFQKYVPSFSG
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pF1KB7 KMQQDAQEFLICVLNELHEALKKYHYS--------------RR-----RSYEKGSTQRCC
         ::::::::  ....::  ...                  ::     .  : .. .:  
CCDS30 YSQQDAQEFLKLLMERLHLEINRRGRRAPPILANGPVPSPPRRGGALLEEPELSDDDRAN
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pF1KB7 RKW---ITTETSIITQLFEEQLNYSIVCLKCEKCTYKNEVFTVF---SLPIPSKY----E
         :   .  : : :..::  ::.    ::::. : :.. .: ::   :::::.:     .
CCDS30 LMWKRYLEREDSKIVDLFVGQLKS---CLKCQACGYRSTTFEVFCDLSLPIPKKGFAGGK
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pF1KB7 CSLRDCLQCFFQQDALTWNNEIHCSFCETKQETAVRASISKAPKIIIFHLKRFDIQGTTK
        :::::.. : ... :  .:   :. :. : ... . .... :.:...::.::. .  . 
CCDS30 VSLRDCFNLFTKEEELESENAPVCDRCRQKTRSTKKLTVQRFPRILVLHLNRFSASRGSI
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