Result of FASTA (ccds) for pF1KB7298
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7298, 1017 aa
  1>>>pF1KB7298 1017 - 1017 aa - 1017 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.6596+/-0.00107; mu= -1.7859+/- 0.064
 mean_var=298.5499+/-60.372, 0's: 0 Z-trim(113.7): 33  B-trim: 151 in 1/50
 Lambda= 0.074228
 statistics sampled from 14311 (14341) to 14311 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.752), E-opt: 0.2 (0.441), width:  16
 Scan time:  5.230

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS11420.1 KCNH4 gene_id:23415|Hs108|chr17        (1017) 6898 753.0 7.2e-217
CCDS2632.1 KCNH8 gene_id:131096|Hs108|chr3         (1107) 3154 352.1 3.8e-96
CCDS11638.1 KCNH6 gene_id:81033|Hs108|chr17        ( 994) 1464 171.1 1.1e-41
CCDS5911.1 KCNH2 gene_id:3757|Hs108|chr7           ( 819) 1442 168.6 4.7e-41
CCDS62290.1 KCNH6 gene_id:81033|Hs108|chr17        ( 958) 1442 168.7 5.3e-41
CCDS5910.1 KCNH2 gene_id:3757|Hs108|chr7           (1159) 1442 168.7 6.1e-41
CCDS2219.1 KCNH7 gene_id:90134|Hs108|chr2          (1196) 1392 163.4 2.6e-39
CCDS31015.1 KCNH1 gene_id:3756|Hs108|chr1          ( 962) 1387 162.8 3.1e-39
CCDS9756.1 KCNH5 gene_id:27133|Hs108|chr14         ( 988) 1367 160.7 1.4e-38
CCDS45122.1 KCNH5 gene_id:27133|Hs108|chr14        ( 611) 1327 156.2 1.9e-37
CCDS8786.1 KCNH3 gene_id:23416|Hs108|chr12         (1083) 1168 139.4   4e-32
CCDS2220.1 KCNH7 gene_id:90134|Hs108|chr2          ( 732) 1099 131.9 4.9e-30
CCDS1496.1 KCNH1 gene_id:3756|Hs108|chr1           ( 989)  942 115.2 7.1e-25
CCDS11639.1 KCNH6 gene_id:81033|Hs108|chr17        ( 905)  767 96.4 2.9e-19


>>CCDS11420.1 KCNH4 gene_id:23415|Hs108|chr17             (1017 aa)
 initn: 6898 init1: 6898 opt: 6898  Z-score: 4006.9  bits: 753.0 E(32554): 7.2e-217
Smith-Waterman score: 6898; 100.0% identity (100.0% similar) in 1017 aa overlap (1-1017:1-1017)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MPVMKGLLAPQNTFLDTIATRFDGTHSNFLLANAQGTRGFPIVYCSDGFCELTGYGRTEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MPVMKGLLAPQNTFLDTIATRFDGTHSNFLLANAQGTRGFPIVYCSDGFCELTGYGRTEV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 MQKTCSCRFLYGPETSEPALQRLHKALEGHQEHRAEICFYRKDGSAFWCLLDMMPIKNEM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MQKTCSCRFLYGPETSEPALQRLHKALEGHQEHRAEICFYRKDGSAFWCLLDMMPIKNEM
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 GEVVLFLFSFKDITQSGSPGLGPQGGRGDSNHENSLGRRGATWKFRSARRRSRTVLHRLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GEVVLFLFSFKDITQSGSPGLGPQGGRGDSNHENSLGRRGATWKFRSARRRSRTVLHRLT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 GHFGRRGQGGMKANNNVFEPKPSVPEYKVASVGGSRCLLLHYSVSKAIWDGLILLATFYV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GHFGRRGQGGMKANNNVFEPKPSVPEYKVASVGGSRCLLLHYSVSKAIWDGLILLATFYV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 AVTVPYNVCFSGDDDTPITSRHTLVSDIAVEMLFILDIILNFRTTYVSQSGQVISAPRSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AVTVPYNVCFSGDDDTPITSRHTLVSDIAVEMLFILDIILNFRTTYVSQSGQVISAPRSI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 GLHYLATWFFIDLIAALPFDLLYIFNITVTSLVHLLKTVRLLRLLRLLQKLERYSQCSAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GLHYLATWFFIDLIAALPFDLLYIFNITVTSLVHLLKTVRLLRLLRLLQKLERYSQCSAV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 VLTLLMSVFALLAHWMACIWYVIGRREMEANDPLLWDIGWLHELGKRLEVPYVNGSVGGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VLTLLMSVFALLAHWMACIWYVIGRREMEANDPLLWDIGWLHELGKRLEVPYVNGSVGGP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB7 SRRSAYIAALYFTLSSLTSVGFGNVCANTDAEKIFSICTMLIGALMHAVVFGNVTAIIQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SRRSAYIAALYFTLSSLTSVGFGNVCANTDAEKIFSICTMLIGALMHAVVFGNVTAIIQR
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB7 MYSRRSLYHSRMKDLKDFIRVHRLPRPLKQRMLEYFQTTWAVNSGIDANELLRDFPDELR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MYSRRSLYHSRMKDLKDFIRVHRLPRPLKQRMLEYFQTTWAVNSGIDANELLRDFPDELR
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB7 ADIAMHLNREILQLPLFGAASRGCLRALSLHIKTSFCAPGEYLLRRGDALQAHYYVCSGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ADIAMHLNREILQLPLFGAASRGCLRALSLHIKTSFCAPGEYLLRRGDALQAHYYVCSGS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB7 LEVLRDNMVLAILGKGDLIGADIPEPGQEPGLGADPNFVLKTSADVKALTYCGLQQLSSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LEVLRDNMVLAILGKGDLIGADIPEPGQEPGLGADPNFVLKTSADVKALTYCGLQQLSSR
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB7 GLAEVLRLYPEYGAAFRAGLPRDLTFNLRQGSDTSGLSRFSRSPRLSQPRSESLGSSSDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GLAEVLRLYPEYGAAFRAGLPRDLTFNLRQGSDTSGLSRFSRSPRLSQPRSESLGSSSDK
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB7 TLPSITEAESGAEPGGGPRPRRPLLLPNLSPARPRGSLVSLLGEELPPFSALVSSPSLSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TLPSITEAESGAEPGGGPRPRRPLLLPNLSPARPRGSLVSLLGEELPPFSALVSSPSLSP
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB7 SLSPALAGQGHSASPHGPPRCSAAWKPPQLLIPPLGTFGPPDLSPRIVDGIEDSGSTAEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SLSPALAGQGHSASPHGPPRCSAAWKPPQLLIPPLGTFGPPDLSPRIVDGIEDSGSTAEA
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB7 PSFRFSRRPELPRPRSQAPPTGTRPSPELASEAEEVKEKVCRLNQEISRLNQEVSQLSRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PSFRFSRRPELPRPRSQAPPTGTRPSPELASEAEEVKEKVCRLNQEISRLNQEVSQLSRE
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB7 LRHIMGLLQARLGPPGHPAGSAWTPDPPCPQLRPPCLSPCASRPPPSLQDTTLAEVHCPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LRHIMGLLQARLGPPGHPAGSAWTPDPPCPQLRPPCLSPCASRPPPSLQDTTLAEVHCPA
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010       
pF1KB7 SVGTMETGTALLDLRPSILPPYPSEPDPLGPSPVPEASPPTPSLLRHSFQSRSDTFH
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SVGTMETGTALLDLRPSILPPYPSEPDPLGPSPVPEASPPTPSLLRHSFQSRSDTFH
              970       980       990      1000      1010       

>>CCDS2632.1 KCNH8 gene_id:131096|Hs108|chr3              (1107 aa)
 initn: 2424 init1: 1459 opt: 3154  Z-score: 1839.6  bits: 352.1 E(32554): 3.8e-96
Smith-Waterman score: 3549; 57.8% identity (76.4% similar) in 1015 aa overlap (1-1004:1-991)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MPVMKGLLAPQNTFLDTIATRFDGTHSNFLLANAQGTRGFPIVYCSDGFCELTGYGRTEV
       :::::::::::::::::::::::::::::.::::: ..::::::::::::::.:..::::
CCDS26 MPVMKGLLAPQNTFLDTIATRFDGTHSNFILANAQVAKGFPIVYCSDGFCELAGFARTEV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 MQKTCSCRFLYGPETSEPALQRLHKALEGHQEHRAEICFYRKDGSAFWCLLDMMPIKNEM
       :::.:::.::.: ::.:  . ...:.:: . : ..:: ::.:.:: ::::::..::::: 
CCDS26 MQKSCSCKFLFGVETNEQLMLQIEKSLEEKTEFKGEIMFYKKNGSPFWCLLDIVPIKNEK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 GEVVLFLFSFKDITQSGSPGLGPQGGRGDSNHENSLGRRGATWKFRSARRRSRTVLHRLT
       :.::::: ::::::.. .  . :.    :.....  ::  :  .: :::::::.::....
CCDS26 GDVVLFLASFKDITDT-KVKITPE----DKKEDKVKGRSRAGTHFDSARRRSRAVLYHIS
              130        140           150       160       170     

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 GHFGRRGQGGMKANNNVFEPKPSVPEYKVASVGGSRCLLLHYSVSKAIWDGLILLATFYV
       ::. :: .. .: :::::  ::. :::::...  :. .:::.:. :: :: :::::::::
CCDS26 GHLQRREKNKLKINNNVFVDKPAFPEYKVSDAKKSKFILLHFSTFKAGWDWLILLATFYV
         180       190       200       210       220       230     

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 AVTVPYNVCFSGDDDTPITSRHTLVSDIAVEMLFILDIILNFRTTYVSQSGQVISAPRSI
       :::::::::: :.::   :.: : :::::::.:::.::::::::::::.:::::   :::
CCDS26 AVTVPYNVCFIGNDDLS-TTRSTTVSDIAVEILFIIDIILNFRTTYVSKSGQVIFEARSI
         240       250        260       270       280       290    

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 GLHYLATWFFIDLIAALPFDLLYIFNITVTSLVHLLKTVRLLRLLRLLQKLERYSQCSAV
        .::..:::.::::::::::::: ::.::.:::::::::::::::::::::.:::: :..
CCDS26 CIHYVTTWFIIDLIAALPFDLLYAFNVTVVSLVHLLKTVRLLRLLRLLQKLDRYSQHSTI
          300       310       320       330       340       350    

              370       380       390       400       410          
pF1KB7 VLTLLMSVFALLAHWMACIWYVIGRREMEANDPLLWDIGWLHELGKRLEVPYV-NGSVGG
       :::::::.::::::::::::::::. : : :. : :..::::::::::: ::  :...::
CCDS26 VLTLLMSMFALLAHWMACIWYVIGKMEREDNSLLKWEVGWLHELGKRLESPYYGNNTLGG
          360       370       380       390       400       410    

     420       430       440       450       460       470         
pF1KB7 PSRRSAYIAALYFTLSSLTSVGFGNVCANTDAEKIFSICTMLIGALMHAVVFGNVTAIIQ
       :: ::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS26 PSIRSAYIAALYFTLSSLTSVGFGNVSANTDAEKIFSICTMLIGALMHALVFGNVTAIIQ
          420       430       440       450       460       470    

     480       490       500       510       520       530         
pF1KB7 RMYSRRSLYHSRMKDLKDFIRVHRLPRPLKQRMLEYFQTTWAVNSGIDANELLRDFPDEL
       ::::: ::::.: ::::::::::.::. :::::::::::::.::.:::.::::.::::::
CCDS26 RMYSRWSLYHTRTKDLKDFIRVHHLPQQLKQRMLEYFQTTWSVNNGIDSNELLKDFPDEL
          480       490       500       510       520       530    

     540       550       560       570       580       590         
pF1KB7 RADIAMHLNREILQLPLFGAASRGCLRALSLHIKTSFCAPGEYLLRRGDALQAHYYVCSG
       :.::.::::.::::: ::  :::::::.::::::::::::::::::.:::::: :.::::
CCDS26 RSDITMHLNKEILQLSLFECASRGCLRSLSLHIKTSFCAPGEYLLRQGDALQAIYFVCSG
          540       550       560       570       580       590    

     600       610       620       630       640       650         
pF1KB7 SLEVLRDNMVLAILGKGDLIGADIPEPGQEPGLGADPNFVLKTSADVKALTYCGLQQLSS
       :.:::.:.::::::::::::::..    :          :.::.::::::::: :: .  
CCDS26 SMEVLKDSMVLAILGKGDLIGANLSIKDQ----------VIKTNADVKALTYCDLQCIIL
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CCDS26 NSSEESQTFDFGSERIRSEPRI-SPPLG---DPEIGAAVLFIKAEETKQQINKLNSEVTT
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CCDS11 MQQPCTCDFLTGPNTPSSAVSRLAQALLGAEECKVDILYYRKDASSFRCLVDVVPVKNED
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CCDS11 GAVIMFILNFEDLAQLLAKCSSRSLSQRLLSQSFLGSEGSHGRPGGPGPGTGRGKYRTIS
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CCDS11 LTVVDLIVDIMFVVDIVINFRTTYVNTNDEVVSHPRRIAVHYFKGWFLIDMVAAIPFDLL
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CCDS11 WYAIGNVER----PYLEHKIGWLDSLGVQLGKRY-NGSDPASGPSVQDKYVTALYFTFSS
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CCDS11 LTSVGFGNVSPNTNSEKVFSICVMLIGSLMYASIFGNVSAIIQRLYSGTARYHTQMLRVK
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CCDS11 EFIRFHQIPNPLRQRLEEYFQHAWSYTNGIDMNAVLKGFPECLQADICLHLHRALLQHCP
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CCDS11 AFSGAGKGCLRALAVKFKTTHAPPGDTLVHLGDVLSTLYFISRGSIEILRDDVVVAILGK
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CCDS11 NDIFG----EP---VSLHAQPG---KSSADVRALTYCDLHKIQRADLLEVLDMYPAFAES
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pF1KB7 FRAGLPRDLTFNLRQGSDTSGLSRFSRSPRLSQPR-----SESLGSSSDKTLPSI-TEAE
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pF1KB7 SGAEPGG------GP-RPRRPLLLPNLSPARPRGSLVSLLGEELPPFSALVSSPSLSPSL
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pF1KB7 SPALAG----QGHSASPHGPPRCSAAW-KPPQLLIPPLGTFGPPDLSPRIVDGIEDSGST
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CCDS11 WPLKLGSRLEQLQAQMNRLESRVSSDLSRILQLLQKPM----PQGHASYILEA-PASNDL
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pF1KB7 AEAPSFRFSRRPELPR-PRSQAPPTGTRPSPELASEAEEVKEKVCRLNQEISRLNQEVSQ
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CCDS11 ALVPIASETTSPG-PRLPQGFLPPAQTPSYGDLDDCSPKHRNSSPRMPHLAVATDKTLAP
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CCDS11 -SSEQEQPEGLWPP-LASPLHPLEVQGLICGPCFSSLPEHLGSVPKQLDFQRHGSDPGFA
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CCDS11 GSWGH                                                       
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>>CCDS5911.1 KCNH2 gene_id:3757|Hs108|chr7                (819 aa)
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pF1KB7 LLATFYVAVTVPYNVCF---SGDDDTPITS-----RHTLVSDIAVEMLFILDIILNFRTT
       :: ..:.:: .::.. :     ..  : :      .   : :. :...::.::..:::::
CCDS59 LLLVIYTAVFTPYSAAFLLKETEEGPPATECGYACQPLAVVDLIVDIMFIVDILINFRTT
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pF1KB7 YVSQSGQVISAPRSIGLHYLATWFFIDLIAALPFDLLYIFNITVTSLVHLLKTVRLLRLL
       ::. . .:.: :  :..::.  ::.::..::.::::: ::.     :. ::::.:::::.
CCDS59 YVNANEEVVSHPGRIAVHYFKGWFLIDMVAAIPFDLL-IFGSGSEELIGLLKTARLLRLV
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CCDS59 RVARKLDRYSEYGAAVLFLLMCTFALIAHWLACIWYAIGNMEQPHMDS---RIGWLHNLG
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pF1KB7 KRLEVPYVNGSVGGPSRRSAYIAALYFTLSSLTSVGFGNVCANTDAEKIFSICTMLIGAL
        ..  :: ....:::: .. :..:::::.:::::::::::  ::..:::::::.::::.:
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       .. :: : : :..  ::.:.:: ..:.:::::.:..:    ::    .: : :.   :..
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        :..:      .: :  :   :::  : :  ::   :.     : : :      :  .  
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CCDS59 GS                                      
                                               

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CCDS62 MPVRRGHVAPQNTYLDTIIRKFEGQSRKFLIANAQ-MENCAIIYCNDGFCELFGYSRVEV
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CCDS62 MQQPCTCDFLTGPNTPSSAVSRLAQALLGAEECKVDILYYRKDASSFRCLVDVVPVKNED
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CCDS62 GAVIMFILNFEDLAQLLAKCSSRSLSQRLLSQSFLGSEGSHGRPGGPGPGTGRGKYRTIS
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CCDS62 QIPQFTLNFVEFNLEKHRSSSTTEIEIIAPHKVVERTQNVTEKVTQVLSLGADVLPEYKL
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pF1KB7 ASVGGSRCLLLHYSVSKAIWDGLILLATFYVAVTVPYNVCF--SGDDDT-----PITSRH
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CCDS62 LTVVDLIVDIMFVVDIVINFRTTYVNTNDEVVSHPRRIAVHYFKGWFLIDMVAAIPFDLL
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pF1KB7 YIFNI---TVTSLVHLLKTVRLLRLLRLLQKLERYSQCSAVVLTLLMSVFALLAHWMACI
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CCDS62 -IFRTGSDETTTLIGLLKTARLLRLVRVARKLDRYSEYGAAVLFLLMCTFALIAHWLACI
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pF1KB7 WYVIGRREMEANDPLLWD-IGWLHELGKRLEVPYVNGS--VGGPSRRSAYIAALYFTLSS
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CCDS62 WYAIGNVE----RPYLEHKIGWLDSLGVQLGKRY-NGSDPASGPSVQDKYVTALYFTFSS
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pF1KB7 LTSVGFGNVCANTDAEKIFSICTMLIGALMHAVVFGNVTAIIQRMYSRRSLYHSRMKDLK
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CCDS62 LTSVGFGNVSPNTNSEKVFSICVMLIGSLMYASIFGNVSAIIQRLYSGTARYHTQMLRVK
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pF1KB7 DFIRVHRLPRPLKQRMLEYFQTTWAVNSGIDANELLRDFPDELRADIAMHLNREILQ-LP
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CCDS62 EFIRFHQIPNPLRQRLEEYFQHAWSYTNGIDMNAVLKGFPECLQADICLHLHRALLQHCP
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pF1KB7 LFGAASRGCLRALSLHIKTSFCAPGEYLLRRGDALQAHYYVCSGSLEVLRDNMVLAILGK
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CCDS62 AFSGAGKGCLRALAVKFKTTHAPPGDTLVHLGDVLSTLYFISRGSIEILRDDVVVAILGK
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pF1KB7 GDLIGADIPEPGQEPGLGADPNFVLKTSADVKALTYCGLQQLSSRGLAEVLRLYPEYGAA
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CCDS62 NDIFG----EP---VSLHAQPG---KSSADVRALTYCDLHKIQRADLLEVLDMYPAFAES
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pF1KB7 FRAGLPRDLTFNLRQGSDTSGLSRFSRSPRLSQPRSESLG-----SSSDKTLP-SITEAE
       : . :  ..:::::   :..:   .  ::: .   ..  :     ..:: . : ::..: 
CCDS62 FWSKL--EVTFNLR---DAAG--GLHSSPRQAPGSQDHQGFFLSDNQSDAAPPLSISDA-
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       ::  :       ::  :. :   :.  : .  :: .  :  ..  . . :::  :   .:
CCDS62 SGLWPELLQEMPPRHSPQSPQEDPDCWPLK-LGSRLEQLQAQMNRLESRVSSDLSRILQL
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pF1KB7 SPALAGQGHSA----SPHGP-----PRCSAAWKP-PQLLIPPLGTFGPPDLSPRIVDGIE
             :::..    .: .      :  : . .: :.:   : : : ::  .:   : ..
CCDS62 LQKPMPQGHASYILEAPASNDLALVPIASETTSPGPRL---PQG-FLPPAQTPSYGD-LD
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pF1KB7 DSG-----STAEAPSFRFSRRPELPRPRSQAPPTGTRPSPELASEAE--EVKEKVCRLNQ
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CCDS62 DCSPKHRNSSPRMPHLAVATDKTLAPSSEQEQPEGLWP-P-LASPLHPLEVQGLIC--GP
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        .: : ...... ..:      .: . . ::  ::: :                      
CCDS62 CFSSLPEHLGSVPKQLD-----FQRHGSDPGF-AGS-WGH                    
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pF1KB7 PSLQDTTLAEVHCPASVGTMETGTALLDLRPSILPPYPSEPDPLGPSPVPEASPPTPSLL

>>CCDS5910.1 KCNH2 gene_id:3757|Hs108|chr7                (1159 aa)
 initn: 1846 init1: 649 opt: 1442  Z-score: 848.5  bits: 168.7 E(32554): 6.1e-41
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CCDS59 DREIIAPKIKERTHNVTEKVTQVLSLGADVLPEYKLQAPRIHRWTILHYSPFKAVWDWLI
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pF1KB7 LLATFYVAVTVPYNVCF---SGDDDTPITS-----RHTLVSDIAVEMLFILDIILNFRTT
       :: ..:.:: .::.. :     ..  : :      .   : :. :...::.::..:::::
CCDS59 LLLVIYTAVFTPYSAAFLLKETEEGPPATECGYACQPLAVVDLIVDIMFIVDILINFRTT
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pF1KB7 YVSQSGQVISAPRSIGLHYLATWFFIDLIAALPFDLLYIFNITVTSLVHLLKTVRLLRLL
       ::. . .:.: :  :..::.  ::.::..::.::::: ::.     :. ::::.:::::.
CCDS59 YVNANEEVVSHPGRIAVHYFKGWFLIDMVAAIPFDLL-IFGSGSEELIGLLKTARLLRLV
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pF1KB7 RLLQKLERYSQCSAVVLTLLMSVFALLAHWMACIWYVIGRREMEANDPLLWDIGWLHELG
       :. .::.:::. .:.:: ::: .:::.:::.:::::.::  :.   :     :::::.::
CCDS59 RVARKLDRYSEYGAAVLFLLMCTFALIAHWLACIWYAIGNMEQPHMDS---RIGWLHNLG
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pF1KB7 KRLEVPYVNGSVGGPSRRSAYIAALYFTLSSLTSVGFGNVCANTDAEKIFSICTMLIGAL
        ..  :: ....:::: .. :..:::::.:::::::::::  ::..:::::::.::::.:
CCDS59 DQIGKPYNSSGLGGPSIKDKYVTALYFTFSSLTSVGFGNVSPNTNSEKIFSICVMLIGSL
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pF1KB7 MHAVVFGNVTAIIQRMYSRRSLYHSRMKDLKDFIRVHRLPRPLKQRMLEYFQTTWAVNSG
       :.: .::::.:::::.::  . ::..:  ...::: :..: ::.::. :::: .:. ..:
CCDS59 MYASIFGNVSAIIQRLYSGTARYHTQMLRVREFIRFHQIPNPLRQRLEEYFQHAWSYTNG
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pF1KB7 IDANELLRDFPDELRADIAMHLNREILQL--PLFGAASRGCLRALSLHIKTSFCAPGEYL
       :: : .:. ::. :.::: .:::: .::   :. :: ..::::::....::.   ::. :
CCDS59 IDMNAVLKGFPECLQADICLHLNRSLLQHCKPFRGA-TKGCLRALAMKFKTTHAPPGDTL
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pF1KB7 LRRGDALQAHYYVCSGSLEVLRDNMVLAILGKGDLIGADIPEPGQEPGLGADPNFVLKTS
       .. :: : : :..  ::.:.:: ..:.:::::.:..:    ::    .: : :.   :..
CCDS59 VHAGDLLTALYFISRGSIEILRGDVVVAILGKNDIFG----EP---LNLYARPG---KSN
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pF1KB7 ADVKALTYCGLQQLSSRGLAEVLRLYPEYGAAFRAGLPRDLTFNLRQ-----GSDTS---
       .::.::::: :...    : ::: .:::..  : ..:  ..:::::.     ::  :   
CCDS59 GDVRALTYCDLHKIHRDDLLEVLDMYPEFSDHFWSSL--EITFNLRDTNMIPGSPGSTEL
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pF1KB7 --GLSRFSRSPRLSQPRSESLGSSSDKTLPSITEAESGAEPGGGPRPRRPL-LLPNLSPA
         :.:: .:. .::  :  .  . .   . ..  ...:: :..  ::  :    :. .:.
CCDS59 EGGFSR-QRKRKLSFRRRTDKDTEQPGEVSALGPGRAGAGPSSRGRPGGPWGESPSSGPS
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pF1KB7 RPRGSLVSLLGEELPPFSALVSSP-SLSPSLSPALAGQGHSASPHGPPRCSAAWKPPQLL
        :..:      .: :  :   :::  : :  ::   :.     : : :      :  .  
CCDS59 SPESSE-----DEGPGRS---SSPLRLVPFSSPRPPGE----PPGGEPLMEDCEKSSDTC
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pF1KB7 IPPLGTFGPPDLSPRIVDGIEDSGSTAEAPSFRFSRRPELPRPRSQAPPT---GTRPSPE
        :  :.:.        :..: .  . ... ...   :   : :     :    : ::  .
CCDS59 NPLSGAFSG-------VSNIFSFWGDSRGRQYQELPRCPAPTPSLLNIPLSSPGRRPRGD
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pF1KB7 LASEAEEVKEKVCRLNQEISRLNQEVSQL-SRELRHIMGLLQARLGP-PGHPAGSAWTPD
       . :. . ..... ::. ..:     : :: .:..  .    .:   : ::  . :   : 
CCDS59 VESRLDALQRQLNRLETRLSADMATVLQLLQRQMTLVPPAYSAVTTPGPGPTSTSPLLPV
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pF1KB7 PPCPQLRPPCLSP------CASRPP--PSL-QDTTLAEVHCPASVGTMETGTALLDLRPS
        : : :    ::       :   ::  : : :.    ..  :...:.. .          
CCDS59 SPLPTLTLDSLSQVSQFMACEELPPGAPELPQEGPTRRLSLPGQLGALTSQPLHRHGSDP
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pF1KB7 ILPPYPSEPDPLGPSPVPEASPPTPSLLRHSFQSRSDTFH
                                               
CCDS59 GS                                      
                                               

>>CCDS2219.1 KCNH7 gene_id:90134|Hs108|chr2               (1196 aa)
 initn: 1595 init1: 668 opt: 1392  Z-score: 819.3  bits: 163.4 E(32554): 2.6e-39
Smith-Waterman score: 1557; 39.0% identity (64.9% similar) in 780 aa overlap (204-959:385-1110)

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CCDS22 DKTIIAPKVKDRTHNVTEKVTQVLSLGADVLPEYKLQTPRINKFTILHYSPFKAVWDWLI
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pF1KB7 LLATFYVAVTVPYNVCFSGDDDTPITSRHTLVS-------DIAVEMLFILDIILNFRTTY
       :: ..:.:. .::.. :  .:      :.   :       :. :...::.::..::::::
CCDS22 LLLVIYTAIFTPYSAAFLLNDREEQKRRECGYSCSPLNVVDLIVDIMFIIDILINFRTTY
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pF1KB7 VSQSGQVISAPRSIGLHYLATWFFIDLIAALPFDLLYIFNI---TVTSLVHLLKTVRLLR
       :.:. .:.: : .:..::.  ::.::..::.::::: ::.     .:.:. ::::.::::
CCDS22 VNQNEEVVSDPAKIAIHYFKGWFLIDMVAAIPFDLL-IFGSGSDETTTLIGLLKTARLLR
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pF1KB7 LLRLLQKLERYSQCSAVVLTLLMSVFALLAHWMACIWYVIGRREMEANDPLLWD-IGWLH
       :.:. .::.:::. .:.:: ::: .:::.:::.:::::.::  :     : : : :::: 
CCDS22 LVRVARKLDRYSEYGAAVLMLLMCIFALIAHWLACIWYAIGNVER----PYLTDKIGWLD
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pF1KB7 ELGKRLEVPYVNG-SVGGPSRRSAYIAALYFTLSSLTSVGFGNVCANTDAEKIFSICTML
        ::...   : .. : .::: .. :..:::::.:::::::::::  ::..:::::::.::
CCDS22 SLGQQIGKRYNDSDSSSGPSIKDKYVTALYFTFSSLTSVGFGNVSPNTNSEKIFSICVML
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pF1KB7 IGALMHAVVFGNVTAIIQRMYSRRSLYHSRMKDLKDFIRVHRLPRPLKQRMLEYFQTTWA
       ::.::.: .::::.:::::.::  . :: .:  .:.::: :..: ::.::. :::: .:.
CCDS22 IGSLMYASIFGNVSAIIQRLYSGTARYHMQMLRVKEFIRFHQIPNPLRQRLEEYFQHAWT
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pF1KB7 VNSGIDANELLRDFPDELRADIAMHLNREILQ-LPLFGAASRGCLRALSLHIKTSFCAPG
        ..::: : .:. ::. :.::: .:::. .::    : .::.::::::....::.   ::
CCDS22 YTNGIDMNMVLKGFPECLQADICLHLNQTLLQNCKAFRGASKGCLRALAMKFKTTHAPPG
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pF1KB7 EYLLRRGDALQAHYYVCSGSLEVLRDNMVLAILGKGDLIGADIPEPGQEPGLGADPNFVL
       . :.. ::.: : :..  ::.:.:.:..:.:::::.:..:  .        : : :.   
CCDS22 DTLVHCGDVLTALYFLSRGSIEILKDDIVVAILGKNDIFGEMVH-------LYAKPG---
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pF1KB7 KTSADVKALTYCGLQQLSSRGLAEVLRLYPEYGAAFRAGLPRDLTFNLRQGSDTSGLSRF
       :..:::.::::: :.... . : ::: .:::..  : ..:  .::::::. :  . : : 
CCDS22 KSNADVRALTYCDLHKIQREDLLEVLDMYPEFSDHFLTNL--ELTFNLRHESAKADLLR-
     820       830       840       850         860       870       

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pF1KB7 SRSPRLSQPRSESLGSSSDKTLPSITEAESGAEPGGGPRPRRPLLLPNLSPARPRGSLVS
             ::  ..: :..      ...    : . ..   :.      . .  :   :   
CCDS22 ------SQSMNDSEGDNCKLRRRKLSFESEGEKENSTNDPE-----DSADTIRHYQSSKR
              880       890       900       910            920     

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pF1KB7 LLGEELPPFSALVSSPSLSPSLSPALAGQGHSASPHGPPRCSAAWKPPQLLIPPLGTFGP
        . :.    :...::  ..   .: ..:   : :: :  . :.     .  .:  : .  
CCDS22 HFEEKKSRSSSFISS--IDDEQKPLFSGIVDS-SP-GIGKASGL--DFEETVPTSGRMH-
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pF1KB7 PDLSPRIVDGIEDSGSTAEAPSFR-FSRRPELPRPRSQAPPTGTRPSPELASEAE-----
              .:  . : :  .  ..: . :.   :.:....: .  : .  . ::.:     
CCDS22 -------ID--KRSHSCKDITDMRSWERENAHPQPEDSSPSALQRAAWGI-SETESDLTY
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pF1KB7 -EVKEKVCRLNQEISRLNQEVSQLSRELRHIMGLLQARLG--PPGHPAGSAWTPDPPCPQ
        ::....  :.....::.   ::.. ... :. ::: .    ::..   .: .       
CCDS22 GEVEQRLDLLQEQLNRLE---SQMTTDIQTILQLLQKQTTVVPPAYSMVTAGS-----EY
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pF1KB7 LRPPCLSPCASRPPPSLQ-DTTLAEV-HCPASVGTMETGTALLDLRPSILPPYPSEPDPL
        ::      .:.:  :.. : ...   .::                              
CCDS22 QRPIIQLMRTSQPEASIKTDRSFSPSSQCPEFLDLEKSKLKSKESLSSGVHLNTASEDNL
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>>CCDS31015.1 KCNH1 gene_id:3756|Hs108|chr1               (962 aa)
 initn: 1478 init1: 491 opt: 1387  Z-score: 817.8  bits: 162.8 E(32554): 3.1e-39
Smith-Waterman score: 1721; 35.5% identity (64.1% similar) in 963 aa overlap (5-911:8-934)

                  10        20        30        40        50       
pF1KB7    MPVMKGLLAPQNTFLDTIATRFDGTHSNFLLANAQGTRGFPIVYCSDGFCELTGYGR
              .::.:::::::..:. : . :  ::.:.::: .  .:::: .::::.:.:: :
CCDS31 MTMAGGRRGLVAPQNTFLENIVRRSNDT--NFVLGNAQIV-DWPIVYSNDGFCKLSGYHR
               10        20          30         40        50       

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pF1KB7 TEVMQKTCSCRFLYGPETSEPALQRLHKALEGHQEHRAEICFYRKDGSAFWCLLDMMPIK
       .:::::. .: :.::  :.. .........:... .  :: .:.:. .  : .. . ::.
CCDS31 AEVMQKSSTCSFMYGELTDKDTIEKVRQTFENYEMNSFEILMYKKNRTPVWFFVKIAPIR
        60        70        80        90       100       110       

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pF1KB7 NEMGEVVLFLFSFKDITQSGSPGLGPQGGRGDSNHENSLGRRGATWKFRSARRRSRTVLH
       ::. .::::: .:.:::   .:            ...:    :   ..  :   :: ::.
CCDS31 NEQDKVVLFLCTFSDITAFKQP-----------IEDDSCKGWGKFARLTRALTSSRGVLQ
       120       130                  140       150       160      

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pF1KB7 RLTGHFGRRGQGGMKANN--NVFEPKPSV-PEYKVASVGGSRCLLLHYSVSKAIWDGLIL
       .:.    ..:..  : .   .:..   .. :.::  .      ..::: : :. :: .::
CCDS31 QLAPSV-QKGENVHKHSRLAEVLQLGSDILPQYKQEAPKTPPHIILHYCVFKTTWDWIIL
        170        180       190       200       210       220     

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pF1KB7 LATFYVAVTVPYNVCFSGDDDTPITSRHTLVSDIAVEMLFILDIILNFRTTYVSQSGQVI
       . :::.:. ::::: :.    :  ..   :: :  :...:..::.:::.::.:. .:.::
CCDS31 ILTFYTAILVPYNVSFK----TRQNNVAWLVVDSIVDVIFLVDIVLNFHTTFVGPAGEVI
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CCDS31 DHYIEYGAAVLVLLVCVFGLAAHWMACIWYSIGDYEIFDEDTKTIRNNSWLYQLAMDIGT
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CCDS31 PYQFNGSGSGKWEGGPSKNSVYISSLYFTMTSLTSVGFGNIAPSTDIEKIFAVAIMMIGS
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CCDS31 SEILRILTSRRSSQSPQELFEISRPQSPESERDIFGAS                      
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CCDS97 PYRYNTSAGIWEGGPSKDSLYVSSLYFTMTSLTTIGFGNIAPTTDVEKMFSVAMMMVGSL
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CCDS97 LYATIFGNVTTIFQQMYANTNRYHEMLNNVRDFLKLYQVPKGLSERVMDYIVSTWSMSKG
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>>CCDS45122.1 KCNH5 gene_id:27133|Hs108|chr14             (611 aa)
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Smith-Waterman score: 1559; 41.2% identity (72.3% similar) in 629 aa overlap (1-613:1-607)

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pF1KB7 MPVMK-GLLAPQNTFLDTIATRFDGTHSNFLLANAQGTRGFPIVYCSDGFCELTGYGRTE
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CCDS45 MPGGKRGLVAPQNTFLENIVRR--SSESSFLLGNAQ-IVDWPVVYSNDGFCKLSGYHRAD
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CCDS45 HEKVVLFLCTFKDIT------LFKQPIEDDST-------KGWT-KFARLTRALTNSRSVL
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