Result of FASTA (ccds) for pF1KB7113
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7113, 270 aa
  1>>>pF1KB7113 270 - 270 aa - 270 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9941+/-0.00072; mu= 16.7139+/- 0.043
 mean_var=62.4321+/-12.598, 0's: 0 Z-trim(109.6): 21  B-trim: 167 in 1/49
 Lambda= 0.162319
 statistics sampled from 10953 (10974) to 10953 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.715), E-opt: 0.2 (0.337), width:  16
 Scan time:  2.390

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS384.1 GJB3 gene_id:2707|Hs108|chr1             ( 270) 1908 454.9 2.7e-128
CCDS383.1 GJB4 gene_id:127534|Hs108|chr1           ( 266) 1085 262.2 2.8e-70
CCDS382.1 GJB5 gene_id:2709|Hs108|chr1             ( 273) 1051 254.2 7.1e-68
CCDS9290.1 GJB2 gene_id:2706|Hs108|chr13           ( 226)  884 215.1 3.6e-56
CCDS9291.1 GJB6 gene_id:10804|Hs108|chr13          ( 261)  868 211.4 5.5e-55
CCDS5008.1 GJB7 gene_id:375519|Hs108|chr6          ( 223)  865 210.6 7.8e-55
CCDS14408.1 GJB1 gene_id:2705|Hs108|chrX           ( 283)  850 207.2 1.1e-53
CCDS30669.1 GJA4 gene_id:2701|Hs108|chr1           ( 333)  477 119.9 2.4e-27
CCDS58547.1 GJD3 gene_id:125111|Hs108|chr17        ( 294)  470 118.2 6.9e-27
CCDS30834.1 GJA8 gene_id:2703|Hs108|chr1           ( 433)  463 116.6 2.9e-26
CCDS9289.1 GJA3 gene_id:2700|Hs108|chr13           ( 435)  443 112.0 7.5e-25
CCDS5123.1 GJA1 gene_id:2697|Hs108|chr6            ( 382)  436 110.3 2.1e-24
CCDS5025.1 GJA10 gene_id:84694|Hs108|chr6          ( 543)  431 109.2 6.3e-24
CCDS34697.1 GJC3 gene_id:349149|Hs108|chr7         ( 279)  425 107.6 9.8e-24
CCDS929.1 GJA5 gene_id:2702|Hs108|chr1             ( 358)  414 105.1 7.1e-23
CCDS432.1 GJA9 gene_id:81025|Hs108|chr1            ( 515)  412 104.8 1.3e-22
CCDS1569.1 GJC2 gene_id:57165|Hs108|chr1           ( 439)  357 91.8 8.8e-19
CCDS11487.1 GJC1 gene_id:10052|Hs108|chr17         ( 396)  342 88.3 9.2e-18
CCDS10040.1 GJD2 gene_id:57369|Hs108|chr15         ( 321)  338 87.3 1.5e-17
CCDS7191.1 GJD4 gene_id:219770|Hs108|chr10         ( 370)  266 70.5   2e-12


>>CCDS384.1 GJB3 gene_id:2707|Hs108|chr1                  (270 aa)
 initn: 1908 init1: 1908 opt: 1908  Z-score: 2416.7  bits: 454.9 E(32554): 2.7e-128
Smith-Waterman score: 1908; 100.0% identity (100.0% similar) in 270 aa overlap (1-270:1-270)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MDWKTLQALLSGVNKYSTAFGRIWLSVVFVFRVLVYVVAAERVWGDEQKDFDCNTKQPGC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 MDWKTLQALLSGVNKYSTAFGRIWLSVVFVFRVLVYVVAAERVWGDEQKDFDCNTKQPGC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 TNVCYDNYFPISNIRLWALQLIFVTCPSLLVILHVAYREERERRHRQKHGDQCAKLYDNA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 TNVCYDNYFPISNIRLWALQLIFVTCPSLLVILHVAYREERERRHRQKHGDQCAKLYDNA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 GKKHGGLWWTYLFSLIFKLIIEFLFLYLLHTLWHGFNMPRLVQCANVAPCPNIVDCYIAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 GKKHGGLWWTYLFSLIFKLIIEFLFLYLLHTLWHGFNMPRLVQCANVAPCPNIVDCYIAR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 PTEKKIFTYFMVGASAVCIVLTICELCYLICHRVLRGLHKDKPRGGCSPSSSASRASTCR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 PTEKKIFTYFMVGASAVCIVLTICELCYLICHRVLRGLHKDKPRGGCSPSSSASRASTCR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270
pF1KB7 CHHKLVEAGEVDPDPGNNKLQASAPNLTPI
       ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 CHHKLVEAGEVDPDPGNNKLQASAPNLTPI
              250       260       270

>>CCDS383.1 GJB4 gene_id:127534|Hs108|chr1                (266 aa)
 initn: 1038 init1: 833 opt: 1085  Z-score: 1375.2  bits: 262.2 E(32554): 2.8e-70
Smith-Waterman score: 1085; 59.6% identity (81.1% similar) in 270 aa overlap (1-265:1-259)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MDWKTLQALLSGVNKYSTAFGRIWLSVVFVFRVLVYVVAAERVWGDEQKDFDCNTKQPGC
       :.:  ::.::::::::::...::::::::.:::::::::::.:: :::::: ::::::::
CCDS38 MNWAFLQGLLSGVNKYSTVLSRIWLSVVFIFRVLVYVVAAEEVWDDEQKDFVCNTKQPGC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 TNVCYDNYFPISNIRLWALQLIFVTCPSLLVILHVAYREERERRHRQKHGDQCAKLYDNA
        :::::..::.:..::::::::.::::::::..::::::::::.:. ::: .  .:::: 
CCDS38 PNVCYDEFFPVSHVRLWALQLILVTCPSLLVVMHVAYREERERKHHLKHGPNAPSLYDNL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 GKKHGGLWWTYLFSLIFKLIIEFLFLYLLHTLWHGFNMPRLVQCANVAPCPNIVDCYIAR
       .::.::::::::.:::::  ..  :::..: :.. ..:::.: :. : :::. :::::.:
CCDS38 SKKRGGLWWTYLLSLIFKAAVDAGFLYIFHRLYKDYDMPRVVACS-VEPCPHTVDCYISR
              130       140       150       160        170         

              190       200       210         220        230       
pF1KB7 PTEKKIFTYFMVGASAVCIVLTICELCYLICHRVLR--GLHKDKPRGG-CSPSSSASRAS
       :::::.:::::: ..:.::.:.. :. ::. .: ..  : .. .::   : :.       
CCDS38 PTEKKVFTYFMVTTAAICILLNLSEVFYLVGKRCMEIFGPRHRRPRCRECLPD-------
     180       190       200       210       220       230         

       240       250       260         270  
pF1KB7 TCRCHHKLVEAGEVDPDPGNNKLQ--ASAPNLTPI  
       ::   . : ..:.  :. ::. :.  .:::       
CCDS38 TCP-PYVLSQGGH--PEDGNSVLMKAGSAPVDAGGYP
             240         250       260      

>>CCDS382.1 GJB5 gene_id:2709|Hs108|chr1                  (273 aa)
 initn: 1016 init1: 800 opt: 1051  Z-score: 1332.0  bits: 254.2 E(32554): 7.1e-68
Smith-Waterman score: 1051; 57.1% identity (85.8% similar) in 240 aa overlap (1-240:1-239)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MDWKTLQALLSGVNKYSTAFGRIWLSVVFVFRVLVYVVAAERVWGDEQKDFDCNTKQPGC
       :.:. ...::::::::::::::::::.::.::::::.:.:::::.:..:::::::.::::
CCDS38 MNWSIFEGLLSGVNKYSTAFGRIWLSLVFIFRVLVYLVTAERVWSDDHKDFDCNTRQPGC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 TNVCYDNYFPISNIRLWALQLIFVTCPSLLVILHVAYREERERRHRQKHGDQCAKLYDNA
       .:::.:..::.:..::::::::.::::::::..:::::: .:.:::. ::.. ..:: : 
CCDS38 SNVCFDEFFPVSHVRLWALQLILVTCPSLLVVMHVAYREVQEKRHREAHGENSGRLYLNP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 GKKHGGLWWTYLFSLIFKLIIEFLFLYLLHTLWHGFNMPRLVQCANVAPCPNIVDCYIAR
       :::.:::::::. ::.::  ... :::..:...  . .: .:.: .. ::::::::.:..
CCDS38 GKKRGGLWWTYVCSLVFKASVDIAFLYVFHSFYPKYILPPVVKC-HADPCPNIVDCFISK
              130       140       150       160        170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 PTEKKIFTYFMVGASAVCIVLTICELCYLICHRVLRGLHKDKPRGGCSPSSSASRASTCR
       :.::.::: :::...:.::.:.. :: ::. .:  . :   : .. :.     . .:.:.
CCDS38 PSEKNIFTLFMVATAAICILLNLVELIYLVSKRCHECLAARKAQAMCTGHHPHGTTSSCK
     180       190       200       210       220       230         

              250       260       270    
pF1KB7 CHHKLVEAGEVDPDPGNNKLQASAPNLTPI    
                                         
CCDS38 QDDLLSGDLIFLGSDSHPPLLPDRPRDHVKKTIL
     240       250       260       270   

>>CCDS9290.1 GJB2 gene_id:2706|Hs108|chr13                (226 aa)
 initn: 886 init1: 538 opt: 884  Z-score: 1121.9  bits: 215.1 E(32554): 3.6e-56
Smith-Waterman score: 884; 54.6% identity (80.8% similar) in 229 aa overlap (1-223:1-225)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MDWKTLQALLSGVNKYSTAFGRIWLSVVFVFRVLVYVVAAERVWGDEQKDFDCNTKQPGC
       ::: :::..:.::::.::..:.:::.:.:.::... ::::..:::::: :: ::: ::::
CCDS92 MDWGTLQTILGGVNKHSTSIGKIWLTVLFIFRIMILVVAAKEVWGDEQADFVCNTLQPGC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 TNVCYDNYFPISNIRLWALQLIFVTCPSLLVILHVAYREERERRHRQKHGDQCAKLYDNA
        :::::.:::::.:::::::::::. :.::: .:::::.....:.  : :.  ... :  
CCDS92 KNVCYDHYFPISHIRLWALQLIFVSTPALLVAMHVAYRRHEKKRKFIK-GEIKSEFKDIE
               70        80        90       100        110         

                    130       140       150       160       170    
pF1KB7 GKK------HGGLWWTYLFSLIFKLIIEFLFLYLLHTLWHGFNMPRLVQCANVAPCPNIV
         :      .:.:::::  :..:..:.:  :.:...... ::.: :::.: :. :::: :
CCDS92 EIKTQKVRIEGSLWWTYTSSIFFRVIFEAAFMYVFYVMYDGFSMQRLVKC-NAWPCPNTV
     120       130       140       150       160        170        

          180       190       200       210       220       230    
pF1KB7 DCYIARPTEKKIFTYFMVGASAVCIVLTICELCYLICHRVLRGLHKDKPRGGCSPSSSAS
       ::...::::: .:: ::...:..::.:.. :::::.  :   :  : ::           
CCDS92 DCFVSRPTEKTVFTVFMIAVSGICILLNVTELCYLLI-RYCSGKSK-KPV          
      180       190       200       210        220                 

          240       250       260       270
pF1KB7 RASTCRCHHKLVEAGEVDPDPGNNKLQASAPNLTPI

>>CCDS9291.1 GJB6 gene_id:10804|Hs108|chr13               (261 aa)
 initn: 785 init1: 513 opt: 868  Z-score: 1100.7  bits: 211.4 E(32554): 5.5e-55
Smith-Waterman score: 868; 51.6% identity (82.4% similar) in 221 aa overlap (1-213:1-220)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MDWKTLQALLSGVNKYSTAFGRIWLSVVFVFRVLVYVVAAERVWGDEQKDFDCNTKQPGC
       ::: ::.....::::.::..:..:..:.:.:::.. ::::..::::::.:: ::: ::::
CCDS92 MDWGTLHTFIGGVNKHSTSIGKVWITVIFIFRVMILVVAAQEVWGDEQEDFVCNTLQPGC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90        100       110         
pF1KB7 TNVCYDNYFPISNIRLWALQLIFVTCPSLLVILHVAY-REERERRHRQKHGDQCAKLYDN
        :::::..::.:.:::::::::::. :.::: .:::: :.:  :. :. .  .  :  ..
CCDS92 KNVCYDHFFPVSHIRLWALQLIFVSTPALLVAMHVAYYRHETTRKFRRGEKRNDFKDIED
               70        80        90       100       110       120

     120           130       140       150       160       170     
pF1KB7 AGKKH----GGLWWTYLFSLIFKLIIEFLFLYLLHTLWHGFNMPRLVQCANVAPCPNIVD
         :..    :.:::::  :..:..:.:  :.:... :..:...: ...:. . ::::.::
CCDS92 IKKQKVRIEGSLWWTYTSSIFFRIIFEAAFMYVFYFLYNGYHLPWVLKCG-IDPCPNLVD
              130       140       150       160       170          

         180       190       200          210       220       230  
pF1KB7 CYIARPTEKKIFTYFMVGASAVCIVLTICELCYL---ICHRVLRGLHKDKPRGGCSPSSS
       :.:.::::: .:: ::..::..:..:.. :::::   .: :                   
CCDS92 CFISRPTEKTVFTIFMISASVICMLLNVAELCYLLLKVCFRRSKRAQTQKNHPNHALKES
     180       190       200       210       220       230         

            240       250       260       270
pF1KB7 ASRASTCRCHHKLVEAGEVDPDPGNNKLQASAPNLTPI
                                             
CCDS92 KQNEMNELISDSGQNAITGFPS                
     240       250       260                 

>>CCDS5008.1 GJB7 gene_id:375519|Hs108|chr6               (223 aa)
 initn: 855 init1: 539 opt: 865  Z-score: 1097.9  bits: 210.6 E(32554): 7.8e-55
Smith-Waterman score: 865; 59.0% identity (81.4% similar) in 210 aa overlap (1-210:1-202)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MDWKTLQALLSGVNKYSTAFGRIWLSVVFVFRVLVYVVAAERVWGDEQKDFDCNTKQPGC
       :.:  :. ::::::::::. : :::.::::::.:::.::::.:: ::::.:.::..::::
CCDS50 MSWMFLRDLLSGVNKYSTGTGWIWLAVVFVFRLLVYMVAAEHVWKDEQKEFECNSRQPGC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 TNVCYDNYFPISNIRLWALQLIFVTCPSLLVILHVAYREERERRHRQKHGDQCAKLYDNA
        :::.:..::::..::::::::.:. :::::.:::::.: ::.:::.:       :: . 
CCDS50 KNVCFDDFFPISQVRLWALQLIMVSTPSLLVVLHVAYHEGREKRHRKK-------LYVSP
               70        80        90       100              110   

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 GKKHGGLWWTYLFSLIFKLIIEFLFLYLLHTLWHGFNMPRLVQCANVAPCPNIVDCYIAR
       :   ::::..::.::: :  .:. :: :.. :. ::..: :..: .. :::: :::.:..
CCDS50 GTMDGGLWYAYLISLIVKTGFEIGFLVLFYKLYDGFSVPYLIKC-DLKPCPNTVDCFISK
           120       130       140       150        160       170  

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 PTEKKIFTYFMVGASAVCIVLTICELCYLICHRVLRGLHKDKPRGGCSPSSSASRASTCR
       :::: ::  :.: .: .::::.. :: .:.                              
CCDS50 PTEKTIFILFLVITSCLCIVLNFIELSFLVLKCFIKCCLQKYLKKPQVLSV         
            180       190       200       210       220            

>>CCDS14408.1 GJB1 gene_id:2705|Hs108|chrX                (283 aa)
 initn: 839 init1: 500 opt: 850  Z-score: 1077.4  bits: 207.2 E(32554): 1.1e-53
Smith-Waterman score: 850; 51.1% identity (80.3% similar) in 233 aa overlap (1-223:1-227)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MDWKTLQALLSGVNKYSTAFGRIWLSVVFVFRVLVYVVAAERVWGDEQKDFDCNTKQPGC
       :.:  : .::::::..:::.::.::::.:.::..: ::::: :::::...: ::: ::::
CCDS14 MNWTGLYTLLSGVNRHSTAIGRVWLSVIFIFRIMVLVVAAESVWGDEKSSFICNTLQPGC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100         110        
pF1KB7 TNVCYDNYFPISNIRLWALQLIFVTCPSLLVILHVAYREERERR--HRQKHGDQCAKLYD
       ..::::..::::..:::.::::.:. :.::: .:::.... :..  . . :::    :. 
CCDS14 NSVCYDQFFPISHVRLWSLQLILVSTPALLVAMHVAHQQHIEKKMLRLEGHGD---PLHL
               70        80        90       100       110          

      120            130       140       150       160       170   
pF1KB7 NAGKKH-----GGLWWTYLFSLIFKLIIEFLFLYLLHTLWHGFNMPRLVQCANVAPCPNI
       .  :.:     : :::::..:..:.:..: .:.:... :. :. : :::.: .: :::: 
CCDS14 EEVKRHKVHISGTLWWTYVISVVFRLLFEAVFMYVFYLLYPGYAMVRLVKC-DVYPCPNT
       120       130       140       150       160        170      

           180       190       200       210          220       230
pF1KB7 VDCYIARPTEKKIFTYFMVGASAVCIVLTICELCYLI---CHRVLRGLHKDKPRGGCSPS
       :::...::::: .:: ::..::..::.:.. :. :::   : :  :. ....:       
CCDS14 VDCFVSRPTEKTVFTVFMLAASGICIILNVAEVVYLIIRACAR--RAQRRSNPPSRKGSG
        180       190       200       210         220       230    

              240       250       260       270         
pF1KB7 SSASRASTCRCHHKLVEAGEVDPDPGNNKLQASAPNLTPI         
                                                        
CCDS14 FGHRLSPEYKQNEINKLLSEQDGSLKDILRRSPGTGAGLAEKSDRCSAC
          240       250       260       270       280   

>>CCDS30669.1 GJA4 gene_id:2701|Hs108|chr1                (333 aa)
 initn: 740 init1: 477 opt: 477  Z-score: 604.3  bits: 119.9 E(32554): 2.4e-27
Smith-Waterman score: 677; 40.0% identity (64.5% similar) in 290 aa overlap (2-266:3-290)

                10        20        30        40        50         
pF1KB7  MDWKTLQALLSGVNKYSTAFGRIWLSVVFVFRVLVYVVAAERVWGDEQKDFDCNTKQPG
         ::  :. ::. :...::. :.:::.:.:.::.:.  .:.: ::::::.::.::: :::
CCDS30 MGDWGFLEKLLDQVQEHSTVVGKIWLTVLFIFRILILGLAGESVWGDEQSDFECNTAQPG
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB7 CTNVCYDNYFPISNIRLWALQLIFVTCPSLLVILHVAYREERERRHRQKHGD--------
       :::::::. ::::.:: :.::..::. :.:. . :: :  .::.: :::.:.        
CCDS30 CTNVCYDQAFPISHIRYWVLQFLFVSTPTLVYLGHVIYLSRREERLRQKEGELRALPAKD
               70        80        90       100       110       120

                            120       130       140       150      
pF1KB7 ------------QCAKLY---DNAGKKHGGLWWTYLFSLIFKLIIEFLFLYLLHTLWHGF
                   : ::.    :.  . .:.:  ::. :.. : ..:  :::    :. :.
CCDS30 PQVERALAAVERQMAKISVAEDGRLRIRGALMGTYVASVLCKSVLEAGFLYGQWRLY-GW
              130       140       150       160       170          

        160       170       180       190       200       210      
pF1KB7 NMPRLVQCANVAPCPNIVDCYIARPTEKKIFTYFMVGASAVCIVLTICELCYLICHRVLR
       .:  .  :   :::: .:::...::::: ::  ::. .. . .::.. :: .:.:. . :
CCDS30 TMEPVFVCQR-APCPYLVDCFVSRPTEKTIFIIFMLVVGLISLVLNLLELVHLLCRCLSR
     180        190       200       210       220       230        

        220       230       240        250        260       270    
pF1KB7 GLHKDKPRGGCSPSSSASRASTCRCHHKL-VEAGEVDPD-PGNNKLQASAPNLTPI    
       :..  . . .   ....:   : .    : :  :  .:  :  : :..:  :        
CCDS30 GMRARQGQDAPPTQGTSSDPYTDQVFFYLPVGQGPSSPPCPTYNGLSSSEQNWANLTTEE
      240       250       260       270       280       290        

CCDS30 RLASSRPPLFLDPPPQNGQKPPSRPSSSASKKQYV
      300       310       320       330   

>>CCDS58547.1 GJD3 gene_id:125111|Hs108|chr17             (294 aa)
 initn: 463 init1: 286 opt: 470  Z-score: 596.2  bits: 118.2 E(32554): 6.9e-27
Smith-Waterman score: 482; 31.9% identity (58.6% similar) in 273 aa overlap (2-269:3-255)

                10        20        30        40        50         
pF1KB7  MDWKTLQALLSGVNKYSTAFGRIWLSVVFVFRVLVYVVAAERVWGDEQKDFDCNTKQPG
         .:  : .::..:.  :   ::.:: :...::.:: ....  :. :::..: ::: :::
CCDS58 MGEWAFLGSLLDAVQLQSPLVGRLWLVVMLIFRILVLATVGGAVFEDEQEEFVCNTLQPG
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB7 CTNVCYDNYFPISNIRLWALQLIFVTCPSLLVILHVAYREERERRHRQKHGDQCAKLYDN
       : ..:::  ::.:. :.: ....... : .: ...  .:  .:    .  . :::    .
CCDS58 CRQTCYDRAFPVSHYRFWLFHILLLSAPPVLFVVYSMHRAGKEAGGAEA-AAQCAPGLPE
               70        80        90       100        110         

     120       130            140       150       160       170    
pF1KB7 AGKKHGGLWWT-----YLFSLIFKLIIEFLFLYLLHTLWHGFNMPRLVQCANVAPCPNIV
       :     .:        ::.:. ..:. :. ::   ..: .:: .     ::.  :::. :
CCDS58 AQCAPCALRARRARRCYLLSVALRLLAELTFLGG-QALLYGFRVAPHFACAG-PPCPHTV
     120       130       140       150        160       170        

          180       190       200       210       220       230    
pF1KB7 DCYIARPTEKKIFTYFMVGASAVCIVLTICELCYLICHRVLRGLHKDKPRGGCSPSSSAS
       ::...::::: .:. :. ... .  .:.. :: .:        : : .::.:        
CCDS58 DCFVSRPTEKTVFVLFYFAVGLLSALLSVAELGHL--------LWKGRPRAG-------E
       180       190       200       210               220         

          240       250       260       270                        
pF1KB7 RASTCRCHHKLVEAGEVDPDPGNNKLQASAPNLTPI                        
       : . :   :.  :: .. : :       . :.  :                         
CCDS58 RDNRCNRAHE--EAQKLLPPPPPPPPPPALPSRRPGPEPCAPPAYAHPAPASLRECGSGR
            230         240       250       260       270       280

CCDS58 GKASPATGRRDLAI
              290    

>>CCDS30834.1 GJA8 gene_id:2703|Hs108|chr1                (433 aa)
 initn: 635 init1: 455 opt: 463  Z-score: 584.9  bits: 116.6 E(32554): 2.9e-26
Smith-Waterman score: 649; 43.3% identity (69.0% similar) in 245 aa overlap (2-225:3-245)

                10        20        30        40        50         
pF1KB7  MDWKTLQALLSGVNKYSTAFGRIWLSVVFVFRVLVYVVAAERVWGDEQKDFDCNTKQPG
         ::. :  .:  ::..::..::.::.:.:.::.:.  .::: ::::::.:: :::.:::
CCDS30 MGDWSFLGNILEEVNEHSTVIGRVWLTVLFIFRILILGTAAEFVWGDEQSDFVCNTQQPG
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90         100             110 
pF1KB7 CTNVCYDNYFPISNIRLWALQLIFVTCPSLLVILHVAY--REERERRHR------QKHG-
       : :::::. ::::.::::.::.:::. :::. . :...  : :..:. :      :. : 
CCDS30 CENVCYDEAFPISHIRLWVLQIIFVSTPSLMYVGHAVHYVRMEEKRKSREAEELGQQAGT
               70        80        90       100       110       120

                    120           130       140       150       160
pF1KB7 ----DQCA--KLYDNAGKKH----GGLWWTYLFSLIFKLIIEFLFLYLLHTLWHGFNMPR
           :: .  :   . : :.    : :  ::.  .::: ..:  :. . : . .:: .  
CCDS30 NGGPDQGSVKKSSGSKGTKKFRLEGTLLRTYICHIIFKTLFEVGFI-VGHYFLYGFRILP
              130       140       150       160        170         

              170       180       190       200       210       220
pF1KB7 LVQCANVAPCPNIVDCYIARPTEKKIFTYFMVGASAVCIVLTICELCYLICHRVLRGLHK
       : .:.   ::::.:::...::::: ::  ::.....: . :.. :: .:  . .  .:..
CCDS30 LYRCSRW-PCPNVVDCFVSRPTEKTIFILFMLSVASVSLFLNVMELGHLGLKGIRSALKR
     180        190       200       210       220       230        

                230       240       250       260       270        
pF1KB7 --DKPRGGCSPSSSASRASTCRCHHKLVEAGEVDPDPGNNKLQASAPNLTPI        
         ..: :                                                     
CCDS30 PVEQPLGEIPEKSLHSIAVSSIQKAKGYQLLEEEKIVSHYFPLTEVGMVETSPLPAKPFN
      240       250       260       270       280       290        




270 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Fri Nov  4 04:51:24 2016 done: Fri Nov  4 04:51:24 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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