Result of FASTA (ccds) for pF1KB5523
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5523, 2472 aa
  1>>>pF1KB5523 2472 - 2472 aa - 2472 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.0359+/-0.00238; mu= -0.4910+/- 0.141
 mean_var=375.3398+/-82.550, 0's: 0 Z-trim(101.9): 150  B-trim: 241 in 1/48
 Lambda= 0.066201
 statistics sampled from 6637 (6729) to 6637 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.49), E-opt: 0.2 (0.207), width:  16
 Scan time:  7.590

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS6905.1 SPTAN1 gene_id:6709|Hs108|chr9          (2472) 16018 1547.3       0
CCDS48036.1 SPTAN1 gene_id:6709|Hs108|chr9         (2477) 15998 1545.4       0
CCDS75914.1 SPTAN1 gene_id:6709|Hs108|chr9         (2452) 9241 900.0       0
CCDS41423.1 SPTA1 gene_id:6708|Hs108|chr1          (2419) 4031 402.4 1.4e-110
CCDS33199.1 SPTBN1 gene_id:6711|Hs108|chr2         (2155) 1889 197.8 4.9e-49
CCDS33198.1 SPTBN1 gene_id:6711|Hs108|chr2         (2364) 1889 197.9 5.2e-49
CCDS61599.1 SPTBN5 gene_id:51332|Hs108|chr15       (3674) 1781 187.7 9.2e-46
CCDS8150.1 SPTBN2 gene_id:6712|Hs108|chr11         (2390) 1733 183.0 1.6e-44
CCDS12559.1 SPTBN4 gene_id:57731|Hs108|chr19       (2564) 1344 145.8 2.6e-33
CCDS32100.1 SPTB gene_id:6710|Hs108|chr14          (2137) 1082 120.7 7.7e-26
CCDS32099.1 SPTB gene_id:6710|Hs108|chr14          (2328) 1082 120.8 8.2e-26
CCDS9792.1 ACTN1 gene_id:87|Hs108|chr14            ( 892) 1005 113.1 6.7e-24
CCDS12518.1 ACTN4 gene_id:81|Hs108|chr19           ( 911)  997 112.3 1.2e-23
CCDS73053.1 ACTN2 gene_id:88|Hs108|chr1            ( 686)  852 98.3 1.4e-19
CCDS60455.1 ACTN2 gene_id:88|Hs108|chr1            ( 894)  852 98.4 1.7e-19
CCDS1613.1 ACTN2 gene_id:88|Hs108|chr1             ( 894)  852 98.4 1.7e-19
CCDS45129.1 ACTN1 gene_id:87|Hs108|chr14           ( 887)  850 98.2 1.9e-19
CCDS45130.1 ACTN1 gene_id:87|Hs108|chr14           ( 914)  776 91.2 2.6e-17
CCDS76439.1 ACTN3 gene_id:89|Hs108|chr11           ( 944)  764 90.1 5.9e-17
CCDS42569.1 SPTBN4 gene_id:57731|Hs108|chr19       ( 678)  665 80.5 3.3e-14


>>CCDS6905.1 SPTAN1 gene_id:6709|Hs108|chr9               (2472 aa)
 initn: 16018 init1: 16018 opt: 16018  Z-score: 8286.0  bits: 1547.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 16018; 100.0% identity (100.0% similar) in 2472 aa overlap (1-2472:1-2472)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MDPSGVKVLETAEDIQERRQQVLDRYHRFKELSTLRRQKLEDSYRFQFFQRDAEELEKWI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 MDPSGVKVLETAEDIQERRQQVLDRYHRFKELSTLRRQKLEDSYRFQFFQRDAEELEKWI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 QEKLQIASDENYKDPTNLQGKLQKHQAFEAEVQANSGAIVKLDETGNLMISEGHFASETI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 QEKLQIASDENYKDPTNLQGKLQKHQAFEAEVQANSGAIVKLDETGNLMISEGHFASETI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 RTRLMELHRQWELLLEKMREKGIKLLQAQKLVQYLRECEDVMDWINDKEAIVTSEELGQD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 RTRLMELHRQWELLLEKMREKGIKLLQAQKLVQYLRECEDVMDWINDKEAIVTSEELGQD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 LEHVEVLQKKFEEFQTDMAAHEERVNEVNQFAAKLIQEQHPEEELIKTKQDEVNAAWQRL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 LEHVEVLQKKFEEFQTDMAAHEERVNEVNQFAAKLIQEQHPEEELIKTKQDEVNAAWQRL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 KGLALQRQGKLFGAAEVQRFNRDVDETISWIKEKEQLMASDDFGRDLASVQALLRKHEGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 KGLALQRQGKLFGAAEVQRFNRDVDETISWIKEKEQLMASDDFGRDLASVQALLRKHEGL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 ERDLAALEDKVKALCAEADRLQQSHPLSATQIQVKREELITNWEQIRTLAAERHARLNDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 ERDLAALEDKVKALCAEADRLQQSHPLSATQIQVKREELITNWEQIRTLAAERHARLNDS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 YRLQRFLADFRDLTSWVTEMKALINADELASDVAGAEALLDRHQEHKGEIDAHEDSFKSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 YRLQRFLADFRDLTSWVTEMKALINADELASDVAGAEALLDRHQEHKGEIDAHEDSFKSA
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 DESGQALLAAGHYASDEVREKLTVLSEERAALLELWELRRQQYEQCMDLQLFYRDTEQVD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 DESGQALLAAGHYASDEVREKLTVLSEERAALLELWELRRQQYEQCMDLQLFYRDTEQVD
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 NWMSKQEAFLLNEDLGDSLDSVEALLKKHEDFEKSLSAQEEKITALDEFATKLIQNNHYA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 NWMSKQEAFLLNEDLGDSLDSVEALLKKHEDFEKSLSAQEEKITALDEFATKLIQNNHYA
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 MEDVATRRDALLSRRNALHERAMRRRAQLADSFHLQQFFRDSDELKSWVNEKMKTATDEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 MEDVATRRDALLSRRNALHERAMRRRAQLADSFHLQQFFRDSDELKSWVNEKMKTATDEA
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB5 YKDPSNLQGKVQKHQAFEAELSANQSRIDALEKAGQKLIDVNHYAKDEVAARMNEVISLW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 YKDPSNLQGKVQKHQAFEAELSANQSRIDALEKAGQKLIDVNHYAKDEVAARMNEVISLW
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB5 KKLLEATELKGIKLREANQQQQFNRNVEDIELWLYEVEGHLASDDYGKDLTNVQNLQKKH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 KKLLEATELKGIKLREANQQQQFNRNVEDIELWLYEVEGHLASDDYGKDLTNVQNLQKKH
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB5 ALLEADVAAHQDRIDGITIQARQFQDAGHFDAENIKKKQEALVARYEALKEPMVARKQKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 ALLEADVAAHQDRIDGITIQARQFQDAGHFDAENIKKKQEALVARYEALKEPMVARKQKL
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB5 ADSLRLQQLFRDVEDEETWIREKEPIAASTNRGKDLIGVQNLLKKHQALQAEIAGHEPRI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 ADSLRLQQLFRDVEDEETWIREKEPIAASTNRGKDLIGVQNLLKKHQALQAEIAGHEPRI
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB5 KAVTQKGNAMVEEGHFAAEDVKAKLHELNQKWEALKAKASQRRQDLEDSLQAQQYFADAN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 KAVTQKGNAMVEEGHFAAEDVKAKLHELNQKWEALKAKASQRRQDLEDSLQAQQYFADAN
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB5 EAESWMREKEPIVGSTDYGKDEDSAEALLKKHEALMSDLSAYGSSIQALREQAQSCRQQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 EAESWMREKEPIVGSTDYGKDEDSAEALLKKHEALMSDLSAYGSSIQALREQAQSCRQQV
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB5 APTDDETGKELVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVNDRQGFVPAAY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 APTDDETGKELVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVNDRQGFVPAAY
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KB5 VKKLDPAQSASRENLLEEQGSIALRQEQIDNQTRITKEAGSVSLRMKQVEELYHSLLELG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 VKKLDPAQSASRENLLEEQGSIALRQEQIDNQTRITKEAGSVSLRMKQVEELYHSLLELG
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KB5 EKRKGMLEKSCKKFMLFREANELQQWINEKEAALTSEEVGADLEQVEVLQKKFDDFQKDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 EKRKGMLEKSCKKFMLFREANELQQWINEKEAALTSEEVGADLEQVEVLQKKFDDFQKDL
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KB5 KANESRLKDINKVAEDLESEGLMAEEVQAVQQQEVYGMMPRDETDSKTASPWKSARLMVH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 KANESRLKDINKVAEDLESEGLMAEEVQAVQQQEVYGMMPRDETDSKTASPWKSARLMVH
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KB5 TVATFNSIKELNERWRSLQQLAEERSQLLGSAHEVQRFHRDADETKEWIEEKNQALNTDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 TVATFNSIKELNERWRSLQQLAEERSQLLGSAHEVQRFHRDADETKEWIEEKNQALNTDN
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KB5 YGHDLASVQALQRKHEGFERDLAALGDKVNSLGETAERLIQSHPESAEDLQEKCTELNQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 YGHDLASVQALQRKHEGFERDLAALGDKVNSLGETAERLIQSHPESAEDLQEKCTELNQA
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KB5 WSSLGKRADQRKAKLGDSHDLQRFLSDFRDLMSWINGIRGLVSSDELAKDVTGAEALLER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 WSSLGKRADQRKAKLGDSHDLQRFLSDFRDLMSWINGIRGLVSSDELAKDVTGAEALLER
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KB5 HQEHRTEIDARAGTFQAFEQFGQQLLAHGHYASPEIKQKLDILDQERADLEKAWVQRRMM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 HQEHRTEIDARAGTFQAFEQFGQQLLAHGHYASPEIKQKLDILDQERADLEKAWVQRRMM
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KB5 LDQCLELQLFHRDCEQAENWMAAREAFLNTEDKGDSLDSVEALIKKHEDFDKAINVQEEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 LDQCLELQLFHRDCEQAENWMAAREAFLNTEDKGDSLDSVEALIKKHEDFDKAINVQEEK
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KB5 IAALQAFADQLIAAGHYAKGDISSRRNEVLDRWRRLKAQMIEKRSKLGESQTLQQFSRDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 IAALQAFADQLIAAGHYAKGDISSRRNEVLDRWRRLKAQMIEKRSKLGESQTLQQFSRDV
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KB5 DEIEAWISEKLQTASDESYKDPTNIQSKHQKHQAFEAELHANADRIRGVIDMGNSLIERG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 DEIEAWISEKLQTASDESYKDPTNIQSKHQKHQAFEAELHANADRIRGVIDMGNSLIERG
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1630      1640      1650      1660      1670      1680
pF1KB5 ACAGSEDAVKARLAALADQWQFLVQKSAEKSQKLKEANKQQNFNTGIKDFDFWLSEVEAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 ACAGSEDAVKARLAALADQWQFLVQKSAEKSQKLKEANKQQNFNTGIKDFDFWLSEVEAL
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CCDS69 ENVKSSEEIESAFRALSSEGKPYVTKEELYQNLTREQADYCVSHMKPYVDGKGRELPTAF
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CCDS69 DYVEFTRSLFVN
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Smith-Waterman score: 15998; 99.8% identity (99.8% similar) in 2477 aa overlap (1-2472:1-2477)

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CCDS48 LPTAFDYVEFTRSLFVN
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CCDS75 ALLEADVAAHQDRIDGITIQARQFQDAGHFDAENIKKKQEALVARYEALKEPMVARKQKL
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CCDS75 KAVTQKGNAMVEEGHFAAEDVKAKLHELNQKWEALKAKASQRRQDLEDSLQAQQYFADAN
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CCDS75 DYVEFTRSLFVN
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CCDS41 DADDLGKWIMEKVNILTDKSYEDPTNIQGKYQKHQSLEAEVQTKSRLMSELEKTREERFT
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CCDS41 MGHSAHEETKAHIEELRHLWDLLLELTLEKGDQLLRALKFQQYVQECADILEWIGDKEAI
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CCDS41 ATSVELGEDWERTEVLHKKFEDFQVELVAKEGRVVEVNQYANECAEENHPDLPLIQSKQN
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pF1KB5 EVNAAWQRLKGLALQRQGKLFGAAEVQRFNRDVDETISWIKEKEQLMASDDFGRDLASVQ
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CCDS41 EVNAAWERLRGLALQRQKALSNAANLQRFKRDVTEAIQWIKEKEPVLTSEDYGKDLVASE
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CCDS41 GLFHSHKGLERNLAVMSDKVKELCAKAEKLTLSHPSDAPQIQEMKEDLVSSWEHIRALAT
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        :. .:. .:  .:: .:: .:..:..:  : :::::: .::::.:.::::::.:: :::
CCDS41 SRYEKLQATYWYHRFSSDFDELSGWMNEKTAAINADELPTDVAGGEVLLDRHQQHKHEID
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pF1KB5 AHEDSFKSADESGQALLAAGHYASDEVREKLTVLSEERAALLELWELRRQQYEQCMDLQL
       ...: :.::::.:: :. :.: ::::::::. .:... .::::::. :..:::::.:..:
CCDS41 SYDDRFQSADETGQDLVNANHEASDEVREKMEILDNNWTALLELWDERHRQYEQCLDFHL
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       ::::.::::.:::.::::: :::::.:: :.::::.::::::....:::::: ..:. ::
CCDS41 FYRDSEQVDSWMSRQEAFLENEDLGNSLGSAEALLQKHEDFEEAFTAQEEKIITVDKTAT
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pF1KB5 KLIQNNHYAMEDVATRRDALLSRRNALHERAMRRRAQLADSFHLQQFFRDSDELKSWVNE
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CCDS41 KLIGDDHYDSENIKAIRDGLLARRDALREKAATRRRLLKESLLLQKLYEDSDDLKNWINK
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CCDS41 KKKLADDEDYKDIQNLKSRVQKQQVFEKELAVNKTQLENIQKTGQEMIEGGHYASDNVTT
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CCDS41 RLSEVASLWEELLEATKQKGTQLHEANQQLQFENNAEDLQRWLEDVEWQVTSEDYGKGLA
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CCDS41 EVQNRLRKHGLLESAVAARQDQVDILTDLAAYFEEIGHPDSKDIRARQESLVCRFEALKE
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CCDS41 FQQYLADLHEAETWIREKEPIVDNTNYGADEEAAGALLKKHEAFLLDLNSFGDSMKALRN
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       ::..:.:: .::..  .:.. :.::::.: .:::::::::::.::::.: ::::::::. 
CCDS41 QANACQQQQAAPVEGVAGEQRVMALYDFQARSPREVTMKKGDVLTLLSSINKDWWKVEAA
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CCDS41 DHQGIVPAVYVRRLAHDEFPMLPQRRR---EEPGNITQRQEQIENQ--------------
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CCDS41 ------YRSLLDRAEERRRRLLQRYNEFLLAYEAGDMLEWIQEKKA----ENTGVELDDV
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CCDS41 WELQKKFDEFQKDLNTNEPRLRDINKVADDLLFEGLLTPEGAQIRQ--------------
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CCDS41 -----------------------ELNSRWGSLQRLADEQRQLLGSAHAVEVFHREADDTK
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CCDS41 EQIEKKCQALSAADPGSDLFSVQALQRRHEGFERDLVPLGDKVTILGETAERLSESHPDA
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CCDS41 TEDLQRQKMELNEAWEDLQGRTKDRKESLNEAQKFYLFLSKARDLQNWISSIGGMVSSQE
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CCDS41 LAEDLTGIEILLERHQEHRADMEAEAPTFQALEDFSAELIDSGHHASPEIEKKLQAVKLE
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CCDS41 RDDLEKAWEKRKKILDQCLELQMFQGNCDQVESWMVARENSLRSDDKS-SLDSLEALMKK
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CCDS41 RDDLDKAITAQEGKITDLEHFAESLIADEHYAKEEIATRLQRVLDRWKALKAQLIDERTK
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CCDS41 LGDYANLKQFYRDLEELEEWISEMLPTACDESYKDATNIQRKYLKHQTFAHEVDGRSEQV
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CCDS41 HGVINLGNSLIECSACDGNEEAMKEQLEQLKEHWDHLLERTNDKGKKLNEASRQQRFNTS
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CCDS41 IRDFEFWLSEAETLLAMKDQARDLASAGNLLKKHQLLEREMLAREDALKDLNTLAEDLLS
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CCDS41 SGTFNVDQIVKKKDNVNKRFLNVQELAAAHHEKLKEAYALFQFFQDLDDEESWIEEKLIR
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CCDS41 VSSQDYGRDLQGVQNLLKKHKRLEGELVAHEPAIQNVLDMAEKLKDKAAVGQEEIQLRLA
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CCDS41 QFVEHWEKLKELAKARGLKLEESLEYLQFMQNAEEEEAWINEKNALAVRGDCGDTLAATQ
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pF1KB5 GLLKKHEAFETDFTVHKDRVNDVCTNGQDLIKKNNHHE---ENISSKMKGLNGKVSDLEK
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CCDS41 SLLMKHEALENDFAVHETRVQNVCAQGEDILNKVLQEESQNKEISSKIEALNEKTPSLAK
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CCDS41 AIAAWKLQLEDDYAFQEFNWKADVVEAWIADKETSLKTNGNGADLGDFLTLLAKQDTLDA
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CCDS41 SLQSFQQERLPEITDLKDKLISAQHNQSKAIEERYAALLKRWEQLLEASAVHRQKLLEKQ
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CCDS41 LPLQKAEDLFVEFAHKASALNNWCEKMEENLSEPVHCVSLNEIRQLQKDHEDFLASLARA
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CCDS41 QADFKCLLELDQQIKALGVPSSPYTWLTVEVLERTWKHLSDIIEEREQELQKEEARQVKN
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CCDS41 FEMCQEFEQNASTFLQWILETRAYFLDGS-LLKETGTLESQLEANKRKQKEIQAMKRQLT
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CCDS41 KIVDLGDNLEDALILDIKY---STIGLAQQWDQLYQLGLRMQHNLEQQIQAKDIKGVSEE
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CCDS41 TLKEFSTIYKHFDENLTGRLTHKEFRSCLRGLNYYLPMVEEDEHEPKFEKFLDAVDPGRK
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CCDS41 GYVSLEDYTAFLIDKESENIKSSDEIENAFQALA-EGKSYITKEDMKQALTPEQVSFCAT
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pF1KB5 HMKPYVDGKGRELPTAFDYVEFTRSLFVN
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CCDS41 HMQQYMDPRGRSHLSGYDYVGFTNSYFGN
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CCDS33 ANEEKINAVVETGRRLVSDGNINSDRIQEKVDSIDDRHRKNRETASELLMRLKDNRDLQK
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CCDS33 FLQDCQELSLWINEKMLTAQDMSYDEARNLHSKWLKHQAFMAELASNKEWLDKIEKEGMQ
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CCDS33 LISEKPETEAVVKEKLTGLHKMWEVLESTTQTKAQRLFDANKAELFTQSCADLDKWLHGL
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CCDS33 ESQIQSDDYGKDLTSVNILLKKQQMLENQMEVRKKEIEELQSQAQALSQEGK-STDEVDS
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CCDS33 KRLTVQTKFMELLEPLNERKHNLLASKEIHQFNRDVEDEILWVGERMPLATSTDHGHNLQ
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CCDS33 -------HSDAATIAEWKDG---------------LNEAWADLLELIDTRTQILAASYEL
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CCDS33 HKFYHDAKEIFGRIQDKHKKL-PEELGRDQNTVETLQRMHTTFEHDIQALGTQVRQLQED
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CCDS33 AARLQAAYAGDKADDIQKRENEVLEAWKSLLDACESRRVRLVDTGDKFRFFSMVRDLMLW
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CCDS33 MEDVIRQIEAQEKPRDVSSVELLMNNHQGIKAEIDARNDSFTTCIELGKSLLARKHYASE
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CCDS33 EIKEKLLQLTEKRKEMIDKWEDRWEWLRLILEVHQFSRDASVAEAWLLGQEPYLSSREIG
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CCDS33 QSVDEVEKLIKRHEAFEKSAATWDERFSALERLTTLELLEV---------RRQQEEEERK
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CCDS33 RRPPSP--EPSTKVSEEAESQQ-QWDTSKGEQ-VSQNGLPAEQGSPRVSYRSQT-YQNYK
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pF1KB5 AFEAELHANADRIRGVIDMGNSLIERGACAGSEDAVKARLAALADQWQFLVQKSAEKSQK
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CCDS33 NFNSRRTASDQPWSGL                                            
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>>CCDS33198.1 SPTBN1 gene_id:6711|Hs108|chr2              (2364 aa)
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CCDS33 EASLLHQFQADADDIDAWMLDILKIVSSSDVGHDEYSTQSLVKKHKDVAEEIANYRPTLD
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CCDS33 TLHEQASALPQE-HAESPDVRGRLSGIEERYKEVAELTRLRKQALQDTLALYKMFSEADA
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CCDS33 CELWIDEKEQWLNNMQIPEKLEDLEVIQHRFESLEPEMNNQASRVAVVNQIARQLMHSGH
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pF1KB5 PEEELIKTKQDEVNAAWQRLKGLALQRQGKLFGAAEVQRFNRDVDETISWIKEKEQLMAS
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CCDS33 PSEKEIKAQQDKLNTRWSQFRELVDRKKDALLSALSIQNYHLECNETKSWIREKTKVIES
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pF1KB5 -DDFGRDLASVQALLRKHEGLERDLAALEDKVKALCAEADRLQQSHPLSATQIQVKREEL
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CCDS33 TQDLGNDLAGVMALQRKLTGMERDLVAIEAKLSDLQKEAEKLESEHPDQAQAILSRLAEI
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CCDS33 SDVWEEMKTTLKNREASLGEASKLQQFLRDLDDFQSWLSRTQTAIASEDMPNTLTEAEKL
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CCDS33 LTQHENIKNEIDNYEEDYQKMRDMGE-MVTQGQTDAQYMFLRQRLQALDTGWNELHKMWE
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CCDS33 NRQNLLSQSHAYQQFLRDTKQAEAFLNNQEYVLAHTEMPTTLEGAEAAIKKQEDFMTTMD
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CCDS33 ANEEKINAVVETGRRLVSDGNINSDRIQEKVDSIDDRHRKNRETASELLMRLKDNRDLQK
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CCDS33 FLQDCQELSLWINEKMLTAQDMSYDEARNLHSKWLKHQAFMAELASNKEWLDKIEKEGMQ
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CCDS33 LISEKPETEAVVKEKLTGLHKMWEVLESTTQTKAQRLFDANKAELFTQSCADLDKWLHGL
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CCDS33 ESQIQSDDYGKDLTSVNILLKKQQMLENQMEVRKKEIEELQSQAQALSQEGK-STDEVDS
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CCDS33 KRLTVQTKFMELLEPLNERKHNLLASKEIHQFNRDVEDEILWVGERMPLATSTDHGHNLQ
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pF1KB5 KEAGSVSLRMKQVEELYHSLLELGEKRKGMLEKSCKKFMLFREANELQQWINEKEAALTS
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CCDS33 -----ISMRQSKVDKLYAGLKDLAEERRGKLDERHRLFQLNREVDDLEQWIAEREVVAGS
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pF1KB5 EEVGADLEQVEVLQKKFDDFQKDL-KANESRLKDINKVAEDLESEGLMAEEVQAVQQQEV
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CCDS33 HELGQDYEHVTMLQERFREFARDTGNIGQERVDTVNHLADELINSG--------------
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CCDS33 -------HSDAATIAEWKDG---------------LNEAWADLLELIDTRTQILAASYEL
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CCDS33 HKFYHDAKEIFGRIQDKHKKL-PEELGRDQNTVETLQRMHTTFEHDIQALGTQVRQLQED
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pF1KB5 AERLIQSHP-ESAEDLQEKCTELNQAWSSLGKRADQRKAKLGDSHDLQRFLSDFRDLMSW
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CCDS33 AARLQAAYAGDKADDIQKRENEVLEAWKSLLDACESRRVRLVDTGDKFRFFSMVRDLMLW
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pF1KB5 INGIRGLVSSDELAKDVTGAEALLERHQEHRTEIDARAGTFQAFEQFGQQLLAHGHYASP
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CCDS33 MEDVIRQIEAQEKPRDVSSVELLMNNHQGIKAEIDARNDSFTTCIELGKSLLARKHYASE
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       :::.::  : ..: ..   : .:   :   ::.. : ::   :: :. ..: .:.... :
CCDS33 EIKEKLLQLTEKRKEMIDKWEDRWEWLRLILEVHQFSRDASVAEAWLLGQEPYLSSREIG
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       .:.: :: :::.:: :.:.  . .:...::. ..  .:. . .  . .  .::       
CCDS33 QSVDEVEKLIKRHEAFEKSAATWDERFSALERLTTLELLEVRRQQEEEERKRRPPSPEPS
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pF1KB5 ------NEVLDRWRRLKAQMIEKRSKLGESQTLQQFSRDVDEIEAWISEKLQ-TASDESY
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CCDS33 TKVSEEAESQQQWDTSKGEQV-SQNGLPAEQGSPRMAETVDTSEMVNGATEQRTSSKESS
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pF1KB5 KDPTNIQSKHQKHQAFEAELHANADRIRGVIDMGNSLIERGACAGSEDAVKARLAALADQ
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CCDS33 PIPSPTSDRKAKTALPAQSAATLPARTQETPSAQMEGFLNRKHEWEAHNKKASSRSWHNV
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CCDS61 KHEVFLKVLTAQDKKEAALRERLKTLRRPRVRDRLPILLQRRMRVKELAESRGHALHASL
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CCDS61 LMASFTQAATQAEDWIQAWAQQLKEPV--PPGDLRDKLKPLLKHQAFEAEVQAHEEVMTS
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CCDS61 VAKKGEALLAQSHPRAGEVSQRLQGLRKHWEDLRQAMALRGQELEDRRNFLEFLQRVDLA
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CCDS61 EAWIQEKEVKMNVGDLGQDLEHCLQLRRRLREFRGNSAGDTVGDACIRSISDLSLQL-KN
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CCDS61 RDPEEVKIICQRRSQLNNRWASFHGNLLRYQQQLEGALEIHVLSRELDNVTKRIQEKEAL
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CCDS61 IQALDCGKDLESVQRLLRKHEELEREVHPIQAQVESLEREVGRLCQRSPEAAHGLRHRQQ
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        .:..::: :.:.:.  ::.. :  .:: ::.:::  :...:. :. : .: ..:   :.
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CCDS61 AVRHLQEQHQNLESEMSSHEALTRVVLGTGYKLVQAGHFAAHEVAARVQQLEKAMAHLRA
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CCDS61 -----------------------IERLQ--QTAA---LLE---------------SRKNP
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CCDS61 DYGQDLEGVKVLEEKFDAFRK---------------------------EVQSLGQAKVYA
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CCDS61 FQQAAAELQGRMQEKTALMKGEDGGHSLSSVRTLQQQHRRLERELEAMEKEVARLQTEAC
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       :: : :: .   :    .....::..:  .:..:   :... . . ::.  ..:..: . 
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>--
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CCDS61 RNPGPWSEASCHPGPGDAWKMALPAEPDPDFDPNTILQTQDHLSQDYESLRALAQLRRAR
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CCDS61 WAEVSSSAEQLRQRYPGNSTQIQRQQEELSQRWGQLEALKREKAVQLAHSVEVCSFLQEC
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CCDS61 GPTQVQLRDVLLQLEALQPGSSEDTCHALQLAQKKTLVLERRVHFLQSVV--VKVEEPGY
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CCDS61 LRVLGQQGQELKVLWEQRQQWLQEGLELQKFGREVDGFTATCANHQAWLHLDNLGEDVRE
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CCDS61 ALSLLQQHREFGRLLSTLGPRAEALRAHGEKLVQSQHPAAHTVREQLQSIQAQWTRLQGR
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CCDS61 SEQRRRQLLASLQLQEWKQDVAELMQWMEEKGLMAAHEPSGARRNILQTLKRHEAAESEL
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        :.. .   ....:  .::..:. ... .:  ..::.:::  :..  ..:..:::..:::
CCDS81 LWMDEVNLQMDAQERPRDVSSADLVIKNQQGIKAEIEARADRFSSCIDMGKELLARSHYA
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       . ::..::. :. .: .  . : ..   :.  ::. .: ::  .:: :. ..: .. . .
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CCDS12 EL---WIGEKEQWLLSMRVPDSLDDVEVVQHRFESLDQEMNSLMGRVLDVNHTVQELVEG
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CCDS12 GHPSSDEVRSCQDHLNSRWNRIVELVEQRKEEMSAVLLVENHVLEVAEVRAQVREKRR--
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CCDS12 AVESAPRAGGALQWRLS---GLEAALQALEPRQAALLEEAALLAERFPAQAARLHQGAEE
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CCDS12 LGAEWGALASAAQACGEAVAAAGRLQRFLHDLDAFLDWLVRAQEAAGGSEGPLPNSLEEA
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CCDS12 DALLARHAALKEEVDQREEDYARIVAASEALLAADGAELGPGLALDEWLPHLELGWHKLL
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CCDS12 GLWEARREALVQAHIYQLFLRDLRQALVVLRNQEMALSGAELPGTVESVEEALKQHRDFL
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CCDS12 TTMELSQQKMQVAVQAAEGLLRQGNIYGEQAQEAVTRLLEKNQENQLRAQQWMQKLHDQL
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CCDS12 ELQHFLRDCHELDGWIHEKMLMARDGTREDNHKLHKRWLRHQAFMAELAQNKEWLEKIER
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        ::.:.. .      :  ...:. . : .:  .:. :. .: ::.. .:. ..  ...  
CCDS12 EGQQLMQEKPELAASVRKKLGEIRQCWAELESTTQAKARQLFEASKADQLVQSFAELDKK
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CCDS12 LLHMESQLQDVDPGGDLATVNSQLKKLQSMESQVEEWYREVGELQAQTAALPLEPASK--
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CCDS12 -ELVGERQNAVGERLVRLLEPLQERRRLLLASKELHQVAHDLDDELAWVQERLPLAMQTE
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CCDS12 RGNGLQAVQQHIKKNQGLRREIQAHGPRLEEVLERAGALASLRSPEAEAVRRGLEQLQSA
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CCDS12 WAGLREAAERRQQVLDAAFQVEQYYFDVAEVEAWLGEQELLMMSEDKGKDEQSTLQLLKK
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CCDS12 HLQLEQGVENYEESIAQLSRQ---CR----------------------------------
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          .::.  . :                                          .:::  
CCDS12 ---ALLEMGHPD------------------------------------------SEQI--
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CCDS12 -----------SRRQSQVDRLYVALKELGEERRVALEQQYWLYQLSRQVSELEHWIAEKE
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CCDS12 VVAGSPELGQDFEHVSVLQEKFSEF-----ASET---------------GMAGRERLAAV
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CCDS12 NQMVDELIECGHTAAATMAEWKDG---------------LNEAWAELLELMGTRAQLLAA
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CCDS12 SRELHKFFSDARELQGQIEEKRRRLPRLTTPPEPRPSASSMQRTLRAFEHDLQLLVSQVR
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CCDS32 EKLQQVMSRRKEMNEKWEARWERLRMLLEVCQFSRDASVAEAWLIAQEPYLASGDFGHTV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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