Result of FASTA (omim) for pF1KA0868
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0868, 1331 aa
  1>>>pF1KA0868 1331 - 1331 aa - 1331 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3624+/-0.00058; mu= 17.6076+/- 0.036
 mean_var=114.2572+/-21.915, 0's: 0 Z-trim(109.5): 309  B-trim: 51 in 1/48
 Lambda= 0.119987
 statistics sampled from 17323 (17671) to 17323 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.542), E-opt: 0.2 (0.207), width:  16
 Scan time: 12.020

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_054860 (OMIM: 604569,610042,612100) contactin-a (1331) 9171 1600.4       0
XP_016867439 (OMIM: 604569,610042,612100) PREDICTE ( 714) 4818 846.7       0
XP_006712321 (OMIM: 610519) PREDICTED: contactin-a (1307) 4438 781.1       0
NP_570129 (OMIM: 610519) contactin-associated prot (1306) 4421 778.2       0
NP_207837 (OMIM: 610518) contactin-associated prot (1308) 4253 749.1 4.7e-215
XP_011521705 (OMIM: 610518) PREDICTED: contactin-a (1283) 4247 748.0 9.5e-215
NP_001309110 (OMIM: 610518) contactin-associated p (1307) 4233 745.6 5.2e-214
NP_001309117 (OMIM: 610518) contactin-associated p (1273) 4113 724.9 9.1e-208
NP_387504 (OMIM: 610517) contactin-associated prot (1288) 4107 723.8 1.9e-207
NP_001309118 (OMIM: 610518) contactin-associated p (1220) 3966 699.4  4e-200
NP_001309109 (OMIM: 610518) contactin-associated p (1179) 3783 667.7 1.3e-190
XP_016858805 (OMIM: 610519) PREDICTED: contactin-a (1227) 3570 630.8 1.7e-179
NP_001309108 (OMIM: 610518) contactin-associated p (1228) 3376 597.3 2.2e-169
NP_003623 (OMIM: 602346,616286) contactin-associat (1384) 3322 588.0 1.6e-166
XP_016880727 (OMIM: 602346,616286) PREDICTED: cont (1384) 3322 588.0 1.6e-166
XP_005257805 (OMIM: 602346,616286) PREDICTED: cont (1308) 3198 566.5 4.4e-160
XP_016879294 (OMIM: 610518) PREDICTED: contactin-a ( 999) 3144 557.0 2.4e-157
NP_001309120 (OMIM: 610518) contactin-associated p ( 999) 3144 557.0 2.4e-157
NP_620481 (OMIM: 610518) contactin-associated prot (1235) 2988 530.1 3.7e-149
NP_001309119 (OMIM: 610518) contactin-associated p (1260) 2988 530.1 3.8e-149
NP_001309116 (OMIM: 610518) contactin-associated p ( 836) 2692 478.7 7.3e-134
NP_001309107 (OMIM: 610518) contactin-associated p (1258) 1473 267.9 3.3e-70
XP_016877291 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1541)  557 109.4 2.1e-22
XP_016860816 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1466)  542 106.7 1.2e-21
XP_016877294 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1464)  540 106.4 1.6e-21
XP_016877292 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1468)  540 106.4 1.6e-21
NP_001317124 (OMIM: 600567) neurexin 3 isoform 5 [ (1571)  540 106.4 1.6e-21
XP_011535672 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1575)  540 106.4 1.6e-21
XP_016877284 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1675)  540 106.4 1.7e-21
XP_016877283 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1675)  540 106.4 1.7e-21
XP_011535668 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1679)  540 106.4 1.7e-21
NP_001317011 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1496)  519 102.8   2e-20
NP_001317006 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1499)  519 102.8   2e-20
XP_011531477 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1495)  517 102.4 2.5e-20
XP_016860800 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1508)  517 102.4 2.5e-20
XP_016860805 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1502)  513 101.7   4e-20
NP_001317025 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1437)  449 90.6 8.5e-17
NP_001317016 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1440)  449 90.6 8.5e-17
NP_001317024 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1460)  448 90.5 9.7e-17
XP_005274459 (OMIM: 600566) PREDICTED: neurexin-2- (1503)  446 90.1 1.3e-16
NP_001317017 (OMIM: 600565,614325,614332) neurexin (1447)  444 89.8 1.5e-16
XP_016877295 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1462)  429 87.2 9.4e-16
XP_016877287 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1666)  429 87.2   1e-15
XP_016877285 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1667)  429 87.2   1e-15
XP_016860807 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1499)  423 86.2   2e-15
XP_011531485 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1225)  421 85.7 2.2e-15
XP_011531480 (OMIM: 600565,614325,614332) PREDICTE (1484)  421 85.8 2.5e-15
XP_016877290 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1544)  420 85.6 2.9e-15
XP_016877293 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1467)  403 82.7 2.1e-14
XP_016877282 (OMIM: 600567) PREDICTED: neurexin 3  (1678)  403 82.7 2.4e-14


>>NP_054860 (OMIM: 604569,610042,612100) contactin-assoc  (1331 aa)
 initn: 9171 init1: 9171 opt: 9171  Z-score: 8582.7  bits: 1600.4 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 9171; 100.0% identity (100.0% similar) in 1331 aa overlap (1-1331:1-1331)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MQAAPRAGCGAALLLWIVSSCLCRAWTAPSTSQKCDEPLVSGLPHVAFSSSSSISGSYSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 MQAAPRAGCGAALLLWIVSSCLCRAWTAPSTSQKCDEPLVSGLPHVAFSSSSSISGSYSP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 GYAKINKRGGAGGWSPSDSDHYQWLQVDFGNRKQISAIATQGRYSSSDWVTQYRMLYSDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 GYAKINKRGGAGGWSPSDSDHYQWLQVDFGNRKQISAIATQGRYSSSDWVTQYRMLYSDT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 GRNWKPYHQDGNIWAFPGNINSDGVVRHELQHPIIARYVRIVPLDWNGEGRIGLRIEVYG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 GRNWKPYHQDGNIWAFPGNINSDGVVRHELQHPIIARYVRIVPLDWNGEGRIGLRIEVYG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 CSYWADVINFDGHVVLPYRFRNKKMKTLKDVIALNFKTSESEGVILHGEGQQGDYITLEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 CSYWADVINFDGHVVLPYRFRNKKMKTLKDVIALNFKTSESEGVILHGEGQQGDYITLEL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 KKAKLVLSLNLGSNQLGPIYGHTSVMTGSLLDDHHWHSVVIERQGRSINLTLDRSMQHFR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 KKAKLVLSLNLGSNQLGPIYGHTSVMTGSLLDDHHWHSVVIERQGRSINLTLDRSMQHFR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 TNGEFDYLDLDYEITFGGIPFSGKPSSSSRKNFKGCMESINYNGVNITDLARRKKLEPSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 TNGEFDYLDLDYEITFGGIPFSGKPSSSSRKNFKGCMESINYNGVNITDLARRKKLEPSN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 VGNLSFSCVEPYTVPVFFNATSYLEVPGRLNQDLFSVSFQFRTWNPNGLLVFSHFADNLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 VGNLSFSCVEPYTVPVFFNATSYLEVPGRLNQDLFSVSFQFRTWNPNGLLVFSHFADNLG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 NVEIDLTESKVGVHINITQTKMSQIDISSGSGLNDGQWHEVRFLAKENFAILTIDGDEAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 NVEIDLTESKVGVHINITQTKMSQIDISSGSGLNDGQWHEVRFLAKENFAILTIDGDEAS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 AVRTNSPLQVKTGEKYFFGGFLNQMNNSSHSVLQPSFQGCMQLIQVDDQLVNLYEVAQRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 AVRTNSPLQVKTGEKYFFGGFLNQMNNSSHSVLQPSFQGCMQLIQVDDQLVNLYEVAQRK
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 PGSFANVSIDMCAIIDRCVPNHCEHGGKCSQTWDSFKCTCDETGYSGATCHNSIYEPSCE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 PGSFANVSIDMCAIIDRCVPNHCEHGGKCSQTWDSFKCTCDETGYSGATCHNSIYEPSCE
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 AYKHLGQTSNYYWIDPDGSGPLGPLKVYCNMTEDKVWTIVSHDLQMQTPVVGYNPEKYSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 AYKHLGQTSNYYWIDPDGSGPLGPLKVYCNMTEDKVWTIVSHDLQMQTPVVGYNPEKYSV
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KA0 TQLVYSASMDQISAITDSAEYCEQYVSYFCKMSRLLNTPDGSPYTWWVGKANEKHYYWGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 TQLVYSASMDQISAITDSAEYCEQYVSYFCKMSRLLNTPDGSPYTWWVGKANEKHYYWGG
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KA0 SGPGIQKCACGIERNCTDPKYYCNCDADYKQWRKDAGFLSYKDHLPVSQVVVGDTDRQGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 SGPGIQKCACGIERNCTDPKYYCNCDADYKQWRKDAGFLSYKDHLPVSQVVVGDTDRQGS
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KA0 EAKLSVGPLRCQGDRNYWNAASFPNPSSYLHFSTFQGETSADISFYFKTLTPWGVFLENM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 EAKLSVGPLRCQGDRNYWNAASFPNPSSYLHFSTFQGETSADISFYFKTLTPWGVFLENM
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KA0 GKEDFIKLELKSATEVSFSFDVGNGPVEIVVRSPTPLNDDQWHRVTAERNVKQASLQVDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 GKEDFIKLELKSATEVSFSFDVGNGPVEIVVRSPTPLNDDQWHRVTAERNVKQASLQVDR
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KA0 LPQQIRKAPTEGHTRLELYSQLFVGGAGGQQGFLGCIRSLRMNGVTLDLEERAKVTSGFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 LPQQIRKAPTEGHTRLELYSQLFVGGAGGQQGFLGCIRSLRMNGVTLDLEERAKVTSGFI
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KA0 SGCSGHCTSYGTNCENGGKCLERYHGYSCDCSNTAYDGTFCNKDVGAFFEEGMWLRYNFQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 SGCSGHCTSYGTNCENGGKCLERYHGYSCDCSNTAYDGTFCNKDVGAFFEEGMWLRYNFQ
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KA0 APATNARDSSSRVDNAPDQQNSHPDLAQEEIRFSFSTTKAPCILLYISSFTTDFLAVLVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 APATNARDSSSRVDNAPDQQNSHPDLAQEEIRFSFSTTKAPCILLYISSFTTDFLAVLVK
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KA0 PTGSLQIRYNLGGTREPYNIDVDHRNMANGQPHSVNITRHEKTIFLKLDHYPSVSYHLPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 PTGSLQIRYNLGGTREPYNIDVDHRNMANGQPHSVNITRHEKTIFLKLDHYPSVSYHLPS
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KA0 SSDTLFNSPKSLFLGKVIETGKIDQEIHKYNTPGFTGCLSRVQFNQIAPLKAALRQTNAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 SSDTLFNSPKSLFLGKVIETGKIDQEIHKYNTPGFTGCLSRVQFNQIAPLKAALRQTNAS
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KA0 AHVHIQGELVESNCGASPLTLSPMSSATDPWHLDHLDSASADFPYNPGQGQAIRNGVNRN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 AHVHIQGELVESNCGASPLTLSPMSSATDPWHLDHLDSASADFPYNPGQGQAIRNGVNRN
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KA0 SAIIGGVIAVVIFTILCTLVFLIRYMFRHKGTYHTNEAKGAESAESADAAIMNNDPNFTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 SAIIGGVIAVVIFTILCTLVFLIRYMFRHKGTYHTNEAKGAESAESADAAIMNNDPNFTE
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330 
pF1KA0 TIDESKKEWLI
       :::::::::::
NP_054 TIDESKKEWLI
             1330 

>>XP_016867439 (OMIM: 604569,610042,612100) PREDICTED: c  (714 aa)
 initn: 4818 init1: 4818 opt: 4818  Z-score: 4514.1  bits: 846.7 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 4818; 100.0% identity (100.0% similar) in 699 aa overlap (1-699:1-699)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MQAAPRAGCGAALLLWIVSSCLCRAWTAPSTSQKCDEPLVSGLPHVAFSSSSSISGSYSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MQAAPRAGCGAALLLWIVSSCLCRAWTAPSTSQKCDEPLVSGLPHVAFSSSSSISGSYSP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 GYAKINKRGGAGGWSPSDSDHYQWLQVDFGNRKQISAIATQGRYSSSDWVTQYRMLYSDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GYAKINKRGGAGGWSPSDSDHYQWLQVDFGNRKQISAIATQGRYSSSDWVTQYRMLYSDT
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pF1KA0 GRNWKPYHQDGNIWAFPGNINSDGVVRHELQHPIIARYVRIVPLDWNGEGRIGLRIEVYG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GRNWKPYHQDGNIWAFPGNINSDGVVRHELQHPIIARYVRIVPLDWNGEGRIGLRIEVYG
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pF1KA0 CSYWADVINFDGHVVLPYRFRNKKMKTLKDVIALNFKTSESEGVILHGEGQQGDYITLEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CSYWADVINFDGHVVLPYRFRNKKMKTLKDVIALNFKTSESEGVILHGEGQQGDYITLEL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KKAKLVLSLNLGSNQLGPIYGHTSVMTGSLLDDHHWHSVVIERQGRSINLTLDRSMQHFR
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pF1KA0 TNGEFDYLDLDYEITFGGIPFSGKPSSSSRKNFKGCMESINYNGVNITDLARRKKLEPSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TNGEFDYLDLDYEITFGGIPFSGKPSSSSRKNFKGCMESINYNGVNITDLARRKKLEPSN
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pF1KA0 VGNLSFSCVEPYTVPVFFNATSYLEVPGRLNQDLFSVSFQFRTWNPNGLLVFSHFADNLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VGNLSFSCVEPYTVPVFFNATSYLEVPGRLNQDLFSVSFQFRTWNPNGLLVFSHFADNLG
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pF1KA0 NVEIDLTESKVGVHINITQTKMSQIDISSGSGLNDGQWHEVRFLAKENFAILTIDGDEAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NVEIDLTESKVGVHINITQTKMSQIDISSGSGLNDGQWHEVRFLAKENFAILTIDGDEAS
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pF1KA0 AVRTNSPLQVKTGEKYFFGGFLNQMNNSSHSVLQPSFQGCMQLIQVDDQLVNLYEVAQRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AVRTNSPLQVKTGEKYFFGGFLNQMNNSSHSVLQPSFQGCMQLIQVDDQLVNLYEVAQRK
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pF1KA0 PGSFANVSIDMCAIIDRCVPNHCEHGGKCSQTWDSFKCTCDETGYSGATCHNSIYEPSCE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PGSFANVSIDMCAIIDRCVPNHCEHGGKCSQTWDSFKCTCDETGYSGATCHNSIYEPSCE
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pF1KA0 AYKHLGQTSNYYWIDPDGSGPLGPLKVYCNMTEDKVWTIVSHDLQMQTPVVGYNPEKYSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AYKHLGQTSNYYWIDPDGSGPLGPLKVYCNMTEDKVWTIVSHDLQMQTPVVGYNPEKYSV
              610       620       630       640       650       660

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pF1KA0 TQLVYSASMDQISAITDSAEYCEQYVSYFCKMSRLLNTPDGSPYTWWVGKANEKHYYWGG
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::                     
XP_016 TQLVYSASMDQISAITDSAEYCEQYVSYFCKMSRLLNTPGLLICRIADARKRSG      
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pF1KA0 SGPGIQKCACGIERNCTDPKYYCNCDADYKQWRKDAGFLSYKDHLPVSQVVVGDTDRQGS

>>XP_006712321 (OMIM: 610519) PREDICTED: contactin-assoc  (1307 aa)
 initn: 4064 init1: 3352 opt: 4438  Z-score: 4155.0  bits: 781.1 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 4603; 50.8% identity (78.3% similar) in 1314 aa overlap (30-1331:25-1307)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MQAAPRAGCGAALLLWIVSSCLCRAWTAPSTSQKCDEPLVSGLPHVAFSSSSSISGSYSP
                                    .:. .::.::.: :  .::::::...:..::
XP_006      MDSLPRLTSVLTLLFSGLWHLGLTATNYNCDDPLASLLSPMAFSSSSDLTGTHSP
                    10        20        30        40        50     

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 GYAKINKRGGAGGWSPSDSDHYQWLQVDFGNRKQISAIATQGRYSSSDWVTQYRMLYSDT
         :..: : :.:::::.::.  ::::.:.::: .:.:.::::::.::::::.: ...:::
XP_006 --AQLNWRVGTGGWSPADSNAQQWLQMDLGNRVEITAVATQGRYGSSDWVTSYSLMFSDT
            60        70        80        90       100       110   

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 GRNWKPYHQDGNIWAFPGNINSDGVVRHELQHPIIARYVRIVPLDWNGEGRIGLRIEVYG
       ::::: :.:. .::.: ::.:.:.::.:.: : . ::.::.:::.::  :.::.:.::::
XP_006 GRNWKQYKQEDSIWTFAGNMNADSVVHHKLLHSVRARFVRFVPLEWNPSGKIGMRVEVYG
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pF1KA0 CSYWADVINFDGHVVLPYRFRNKKMKTLKDVIALNFKTSESEGVILHGEGQQGDYITLEL
       ::: .:: .:::.  : ::: .: :.::::::.:.::. ...::..:::::.::.:::::
XP_006 CSYKSDVADFDGRSSLLYRFNQKLMSTLKDVISLKFKSMQGDGVLFHGEGQRGDHITLEL
           180       190       200       210       220       230   

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pF1KA0 KKAKLVLSLNLGSNQLGPIYGHTSVMTGSLLDDHHWHSVVIERQGRSINLTLDRSMQHFR
       .:..:.: ::::...     .  :.  ::::::.:::::.::: :...:.:.:.  ::::
XP_006 QKGRLALHLNLGDSKARLSSSLPSATLGSLLDDQHWHSVLIERVGKQVNFTVDKHTQHFR
           240       250       260       270       280       290   

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pF1KA0 TNGEFDYLDLDYEITFGGIPFSGKPSSSSRKNFKGCMESINYNGVNITDLARRKKLEPSN
       :.:: : ::.:::..:::::  :::..  .:::.::.:.. :::::: :::.:.: .  .
XP_006 TKGETDALDIDYELSFGGIPVPGKPGTFLKKNFHGCIENLYYNGVNIIDLAKRRKHQIYT
           300       310       320       330       340       350   

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pF1KA0 VGNLSFSCVEPYTVPV-FFNAT-SYLEVPGRLNQDLFSVSFQFRTWNPNGLLVFSHFADN
       :::..::: ::  ::. : :.. ::: .::  . : .:::::::::: .:::. ......
XP_006 VGNVTFSCSEPQIVPITFVNSSGSYLLLPGTPQIDGLSVSFQFRTWNKDGLLLSTELSEG
           360       370       380       390       400       410   

      420       430       440         450       460       470      
pF1KA0 LGNVEIDLTESKVGVHINITQTKMSQ--IDISSGSGLNDGQWHEVRFLAKENFAILTIDG
        :.. ..:   . :. . ..  ::..   .: .::.:::: :: : . :..:   ::.: 
XP_006 SGTLLLSL---EGGI-LRLVIQKMTERVAEILTGSNLNDGLWHSVSINARRNRITLTLDD
           420           430       440       450       460         

        480       490       500       510         520       530    
pF1KA0 DEASAVRTNSPLQVKTGEKYFFGGFLNQMNNSSHSVLQP--SFQGCMQLIQVDDQLVNLY
       . :  .  .. .:. .:..:.:::  .....:.   :.:  .:::::.:: .:.:  .: 
XP_006 EAAPPAPDSTWVQIYSGNSYYFGGCPDNLTDSQ--CLNPIKAFQGCMRLIFIDNQPKDLI
     470       480       490       500         510       520       

          540       550       560       570       580       590    
pF1KA0 EVAQRKPGSFANVSIDMCAIIDRCVPNHCEHGGKCSQTWDSFKCTCDETGYSGATCHNSI
        : : . :.:... ::.:.: :::.::.:::::.:::.: .: :.:..:.:.::::::::
XP_006 SVQQGSLGNFSDLHIDLCSIKDRCLPNYCEHGGSCSQSWTTFYCNCSDTSYTGATCHNSI
       530       540       550       560       570       580       

          600       610       620       630       640       650    
pF1KA0 YEPSCEAYKHLGQTSNYYWIDPDGSGPLGPLKVYCNMTEDKVWTIVSHDLQMQTPVVGYN
       :: :::.:.: :.:.....:: :::::::::.::::.::::.:: :.:.    : : : :
XP_006 YEQSCEVYRHQGNTAGFFYIDSDGSGPLGPLQVYCNITEDKIWTSVQHNNTELTRVRGAN
       590       600       610       620       630       640       

          660       670       680       690       700       710    
pF1KA0 PEKYSVTQLVYSASMDQISAITDSAEYCEQYVSYFCKMSRLLNTPDGSPYTWWVGKANEK
       :::  .  : :..::.:. :. :..:.::: :.: :. :::::::::.:.:::.:..::.
XP_006 PEKPYAMALDYGGSMEQLEAVIDGSEHCEQEVAYHCRRSRLLNTPDGTPFTWWIGRSNER
       650       660       670       680       690       700       

          720       730       740       750       760       770    
pF1KA0 HYYWGGSGPGIQKCACGIERNCTDPKYYCNCDADYKQWRKDAGFLSYKDHLPVSQVVVGD
       : ::::: ::.:.: ::....: : ...::::::  .: .:.::::.::::::.:.:. :
XP_006 HPYWGGSPPGVQQCECGLDESCLDIQHFCNCDADKDEWTNDTGFLSFKDHLPVTQIVITD
       710       720       730       740       750       760       

          780       790       800       810       820       830    
pF1KA0 TDRQGSEAKLSVGPLRCQGDRNYWNAASFPNPSSYLHFSTFQGETSADISFYFKTLTPWG
       :::..:::   .::::: ::: .:::.:: . .::::: ::..: ::::::.::: .  :
XP_006 TDRSNSEAAWRIGPLRCYGDRRFWNAVSFYTEASYLHFPTFHAEFSADISFFFKTTALSG
       770       780       790       800       810       820       

          840       850       860       870       880       890    
pF1KA0 VFLENMGKEDFIKLELKSATEVSFSFDVGNGPVEIVVRSPTPLNDDQWHRVTAERNVKQA
       :::::.: .:::.::..: .:..:..::::::::.::.::. :::.::: : ::::.:..
XP_006 VFLENLGIKDFIRLEISSPSEITFAIDVGNGPVELVVQSPSLLNDNQWHYVRAERNLKET
       830       840       850       860       870       880       

          900       910       920        930       940       950   
pF1KA0 SLQVDRLPQQIRKAPTEGHTRLELYSQLFVGGAGG-QQGFLGCIRSLRMNGVTLDLEERA
       ::::: ::.. :..  ::: ::.: :::::::... :.:::::::::..::  .::::::
XP_006 SLQVDNLPRSTRETSEEGHFRLQLNSQLFVGGTSSRQKGFLGCIRSLHLNGQKMDLEERA
       890       900       910       920       930       940       

           960       970       980       990      1000      1010   
pF1KA0 KVTSGFISGCSGHCTSYGTNCENGGKCLERYHGYSCDCSNTAYDGTFCNKDVGAFFEEGM
       :::::   :: :::.:::. :.:::::.:...:: :::.:. :.: ::.:.:.: :: : 
XP_006 KVTSGVRPGCPGHCSSYGSICHNGGKCVEKHNGYLCDCTNSPYEGPFCKKEVSAVFEAGT
       950       960       970       980       990      1000       

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pF1KA0 WLRYNFQAP---ATNARDSSSRV--DNAPDQQNSHPDLAQEEIRFSFSTTKAPCILLYIS
        . : :: :   . :   ::: .  :.::...:         : .:: ::.:: .::.:.
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      1010      1020      1030      1040               1050        

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pF1KA0 SFTTDFLAVLVKPTGSLQIRYNLGGTREPYNIDVDHRNMANGQPHSVNITRHEKTIFLKL
       : . ::..::.  .::::.::.:.  .: . . .:  :.:: . : ..:.:. . . ...
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pF1KA0 DHYPSVSYHLPSSSDTLFNSPKSLFLGKVIETGKIDQEIHKYNTPGFTGCLSRVQFNQIA
       :.   .::..  : .. :   .:: :::: :.  .:.:. : :. ::.::.: ::.:.::
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      1120        1130      1140      1150      1160      1170     

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pF1KA0 PLKAALRQTNASAHVHIQGELVESNCGASPLTLSPMSSATDPWHLDHLDSASADFPYNPG
       :::::::.... : : ..: :.::.::   .. : ....:       . :.:  :  .  
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pF1KA0 QGQAIRNGVNRNSAIIGGVIAVVIFTILCTLVFLIRYMFRHKGTYHTNEAKGAESAESAD
       . . . :.:  .::.:::::::::: :.: . .. :....:: ...:.. :  :  :. :
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pF1KA0 AAIMNNDPNFTETIDESKKEWLI
       ...  :. .. .:..: :.:..:
XP_006 SSF-RNEIDLQNTVSECKREYFI
         1290      1300       

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NP_570      MDSLPRLTSVLTLLFSGLWHLGLTATNYNCDDPLASLLSPMAFSSSSDLTGTHSP
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         :..: : :.:::::.::.  ::::.:.::: .:.:.::::::.::::::.: ...:::
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       ::::: :.:. .::.: ::.:.:.::.:.: : . ::.::.:::.::  :.::.:.::::
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       ::: .:: .:::.  : ::: .: :.::::::.:.::. ...::..:::::.::.:::::
NP_570 CSYKSDVADFDGRSSLLYRFNQKLMSTLKDVISLKFKSMQGDGVLFHGEGQRGDHITLEL
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       .:..:.: ::::...     .  :.  ::::::.:::::.::: :...:.:.:.  ::::
NP_570 QKGRLALHLNLGDSKARLSSSLPSATLGSLLDDQHWHSVLIERVGKQVNFTVDKHTQHFR
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pF1KA0 TNGEFDYLDLDYEITFGGIPFSGKPSSSSRKNFKGCMESINYNGVNITDLARRKKLEPSN
       :.:: : ::.:::..:::::  :::..  .:::.::.:.. :::::: :::.:.: .  .
NP_570 TKGETDALDIDYELSFGGIPVPGKPGTFLKKNFHGCIENLYYNGVNIIDLAKRRKHQIYT
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pF1KA0 VGNLSFSCVEPYTVPV-FFNAT-SYLEVPGRLNQDLFSVSFQFRTWNPNGLLVFSHFADN
        ::..::: ::  ::. : :.. ::: .::  . : .:::::::::: .:::. ......
NP_570 -GNVTFSCSEPQIVPITFVNSSGSYLLLPGTPQIDGLSVSFQFRTWNKDGLLLSTELSEG
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pF1KA0 LGNVEIDLTESKVGVHINITQTKMSQ--IDISSGSGLNDGQWHEVRFLAKENFAILTIDG
        :.. ..:   . :. . ..  ::..   .: .::.:::: :: : . :..:   ::.: 
NP_570 SGTLLLSL---EGGI-LRLVIQKMTERVAEILTGSNLNDGLWHSVSINARRNRITLTLDD
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pF1KA0 DEASAVRTNSPLQVKTGEKYFFGGFLNQMNNSSHSVLQP--SFQGCMQLIQVDDQLVNLY
       . :  .  .. .:. .:..:.:::  .....:.   :.:  .:::::.:: .:.:  .: 
NP_570 EAAPPAPDSTWVQIYSGNSYYFGGCPDNLTDSQ--CLNPIKAFQGCMRLIFIDNQPKDLI
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pF1KA0 EVAQRKPGSFANVSIDMCAIIDRCVPNHCEHGGKCSQTWDSFKCTCDETGYSGATCHNSI
        : : . :.:... ::.:.: :::.::.:::::.:::.: .: :.:..:.:.::::::::
NP_570 SVQQGSLGNFSDLHIDLCSIKDRCLPNYCEHGGSCSQSWTTFYCNCSDTSYTGATCHNSI
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       :: :::.:.: :.:.....:: :::::::::.::::.::::.:: :.:.    : : : :
NP_570 YEQSCEVYRHQGNTAGFFYIDSDGSGPLGPLQVYCNITEDKIWTSVQHNNTELTRVRGAN
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       :::  .  : :..::.:. :. :..:.::: :.: :. :::::::::.:.:::.:..::.
NP_570 PEKPYAMALDYGGSMEQLEAVIDGSEHCEQEVAYHCRRSRLLNTPDGTPFTWWIGRSNER
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       : ::::: ::.:.: ::....: : ...::::::  .: .:.::::.::::::.:.:. :
NP_570 HPYWGGSPPGVQQCECGLDESCLDIQHFCNCDADKDEWTNDTGFLSFKDHLPVTQIVITD
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pF1KA0 TDRQGSEAKLSVGPLRCQGDRNYWNAASFPNPSSYLHFSTFQGETSADISFYFKTLTPWG
       :::..:::   .::::: ::: .:::.:: . .::::: ::..: ::::::.::: .  :
NP_570 TDRSNSEAAWRIGPLRCYGDRRFWNAVSFYTEASYLHFPTFHAEFSADISFFFKTTALSG
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pF1KA0 VFLENMGKEDFIKLELKSATEVSFSFDVGNGPVEIVVRSPTPLNDDQWHRVTAERNVKQA
       :::::.: .:::.::..: .:..:..::::::::.::.::. :::.::: : ::::.:..
NP_570 VFLENLGIKDFIRLEISSPSEITFAIDVGNGPVELVVQSPSLLNDNQWHYVRAERNLKET
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pF1KA0 SLQVDRLPQQIRKAPTEGHTRLELYSQLFVGGAGG-QQGFLGCIRSLRMNGVTLDLEERA
       ::::: ::.. :..  ::: ::.: :::::::... :.:::::::::..::  .::::::
NP_570 SLQVDNLPRSTRETSEEGHFRLQLNSQLFVGGTSSRQKGFLGCIRSLHLNGQKMDLEERA
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pF1KA0 KVTSGFISGCSGHCTSYGTNCENGGKCLERYHGYSCDCSNTAYDGTFCNKDVGAFFEEGM
       :::::   :: :::.:::. :.:::::.:...:: :::.:. :.: ::.:.:.: :: : 
NP_570 KVTSGVRPGCPGHCSSYGSICHNGGKCVEKHNGYLCDCTNSPYEGPFCKKEVSAVFEAGT
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pF1KA0 WLRYNFQAP---ATNARDSSSRV--DNAPDQQNSHPDLAQEEIRFSFSTTKAPCILLYIS
        . : :: :   . :   ::: .  :.::...:         : .:: ::.:: .::.:.
NP_570 SVTYMFQEPYPVTKNISLSSSAIYTDSAPSKEN---------IALSFVTTQAPSLLLFIN
       1010      1020      1030               1040      1050       

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pF1KA0 SFTTDFLAVLVKPTGSLQIRYNLGGTREPYNIDVDHRNMANGQPHSVNITRHEKTIFLKL
       : . ::..::.  .::::.::.:.  .: . . .:  :.:: . : ..:.:. . . ...
NP_570 SSSQDFVVVLLCKNGSLQVRYHLN-KEETHVFTIDADNFANRRMHHLKINREGRELTIQM
      1060      1070      1080       1090      1100      1110      

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pF1KA0 DHYPSVSYHLPSSSDTLFNSPKSLFLGKVIETGKIDQEIHKYNTPGFTGCLSRVQFNQIA
       :.   .::..  : .. :   .:: :::: :.  .:.:. : :. ::.::.: ::.:.::
NP_570 DQQLRLSYNF--SPEVEFRVIRSLTLGKVTENLGLDSEVAKANAMGFAGCMSSVQYNHIA
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pF1KA0 PLKAALRQTNASAHVHIQGELVESNCGASPLTLSPMSSATDPWHLDHLDSASADFPYNPG
       :::::::.... : : ..: :.::.::   .. : ....:       . :.:  :  .  
NP_570 PLKAALRHATV-APVTVHGTLTESSCGF--MVDSDVNAVTT------VHSSSDPFG-KTD
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pF1KA0 QGQAIRNGVNRNSAIIGGVIAVVIFTILCTLVFLIRYMFRHKGTYHTNEAKGAESAESAD
       . . . :.:  .::.:::::::::: :.: . .. :....:: ...:.. :  :  :. :
NP_570 EREPLTNAVRSDSAVIGGVIAVVIFIIFCIIGIMTRFLYQHKQSHRTSQMKEKEYPENLD
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     1310      1320      1330 
pF1KA0 AAIMNNDPNFTETIDESKKEWLI
       ...  :. .. .:..: :.:..:
NP_570 SSF-RNEIDLQNTVSECKREYFI
          1290      1300      

>>NP_207837 (OMIM: 610518) contactin-associated protein-  (1308 aa)
 initn: 3009 init1: 1345 opt: 4253  Z-score: 3981.9  bits: 749.1 E(85289): 4.7e-215
Smith-Waterman score: 4411; 48.4% identity (76.2% similar) in 1325 aa overlap (10-1330:6-1307)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MQAAPRAGCGAALLLWIVSSCLCRAWTAPSTSQKCDEPLVSGLPHVAFSSSSSISGSYSP
                ::.:   .. :      .  ..:  ::.::::.::...::::: .:.:..:
NP_207     MGSVTGAVLKTLLLLSTQNWNRVEAGNSYDCDDPLVSALPQASFSSSSELSSSHGP
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pF1KA0 GYAKINKRGGAGGWSPSDSDHYQWLQVDFGNRKQISAIATQGRYSSSDWVTQYRMLYSDT
       :.:..:.: :::::::  :..:::::.:.:.: ...:.:::: :.::.:::.: ...::.
NP_207 GFARLNRRDGAGGWSPLVSNKYQWLQIDLGERMEVTAVATQGGYGSSNWVTSYLLMFSDS
         60        70        80        90       100       110      

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pF1KA0 GRNWKPYHQDGNIWAFPGNINSDGVVRHELQHPIIARYVRIVPLDWNGEGRIGLRIEVYG
       : ::: :.:. .::.: :: :.:.:: ..::  : ::..:..::.:: .::::.::::.:
NP_207 GWNWKQYRQEDSIWGFSGNANADSVVYYRLQPSIKARFLRFIPLEWNPKGRIGMRIEVFG
        120       130       140       150       160       170      

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pF1KA0 CSYWADVINFDGHVVLPYRFRNKKMKTLKDVIALNFKTSESEGVILHGEGQQGDYITLEL
       :.: ..:...::.  : ::: .:... .::.:.:.::: .:.:..:: :: .::.:::.:
NP_207 CAYRSEVVDLDGKSSLLYRFDQKSLSPIKDIISLKFKTMQSDGILLHREGPNGDHITLQL
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pF1KA0 KKAKLVLSLNLGSNQLGPIYGHTSVMTGSLLDDHHWHSVVIERQGRSINLTLDRSMQHFR
       ..:.: : .: :  .:      ...  ::::::.:::::.:.: :...:.:.:.  .::.
NP_207 RRARLFLLINSGEAKLPSTSTLVNLTLGSLLDDQHWHSVLIQRLGKQVNFTVDEHRHHFH
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pF1KA0 TNGEFDYLDLDYEITFGGIPFSGKPSSSSRKNFKGCMESINYNGVNITDLARRKKLEPSN
       . :::. ..:::::.:::::  ::  :  ..::.::.:.. ::::.: :::...: .   
NP_207 ARGEFNLMNLDYEISFGGIPAPGKSVSFPHRNFHGCLENLYYNGVDIIDLAKQQKPQIIA
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pF1KA0 VGNLSFSCVEPYTVPV-FFNATSYLEVPGRLNQDLFSVSFQFRTWNPNGLLVFSHFADNL
       .::.:::: .: ..:: :... ::: .:   ...  :..:::::::  :::.::..    
NP_207 MGNVSFSCSQPQSMPVTFLSSRSYLALPDFSGEEEVSATFQFRTWNKAGLLLFSELQLIS
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pF1KA0 GNVEIDLTESKVGVHINITQTKMSQIDISSGSGLNDGQWHEVRFLAKENFAILTIDGDEA
       :.. . :...:.  . :. :      ::..:  ::::::: : . ::.:   ...::. :
NP_207 GGILLFLSDGKL--KSNLYQPGKLPSDITAGVELNDGQWHSVSLSAKKNHLSVAVDGQMA
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       ::.   .: :. .:  :.:::  ..  .:. .    .:::::.::... ..:.:  : : 
NP_207 SAAPLLGPEQIYSGGTYYFGGCPDKSFGSKCKSPLGGFQGCMRLISISGKVVDLISVQQG
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pF1KA0 KPGSFANVSIDMCAIIDRCVPNHCEHGGKCSQTWDSFKCTCDETGYSGATCHNSIYEPSC
       . :.:....:: :.: :::.::.:::::.:::.:..:.:.: .::: :::::::::: ::
NP_207 SLGNFSDLQIDSCGISDRCLPNYCEHGGECSQSWSTFHCNCTNTGYRGATCHNSIYEQSC
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       ::::: :.::..:.:: :::::: :. .::::::  .:::..:. .  : : . :::.  
NP_207 EAYKHRGNTSGFYYIDSDGSGPLEPFLLYCNMTET-AWTIIQHNGSDLTRVRNTNPENPY
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       .  . : :::.:..:  . ::.:::  .:.:: :::.:  ::.: .::::..:: . :::
NP_207 AGFFEYVASMEQLQATINRAEHCEQEFTYYCKKSRLVNKQDGTPLSWWVGRTNETQTYWG
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       ::.: .:::.::.: :: : .:::::::: ..: .:.:.:.::.::::...:. :: :  
NP_207 GSSPDLQKCTCGLEGNCIDSQYYCNCDADRNEWTNDTGLLAYKEHLPVTKIVITDTGRLH
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NP_207 SEAAYKLGPLLCQGDRSFWNSASFDTEASYLHFPTFHGELSADVSFFFKTTASSGVFLEN
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pF1KA0 MGKEDFIKLELKSATEVSFSFDVGNGPVEIVVRSPTPLNDDQWHRVTAERNVKQASLQVD
       .:  :::..::.: : :.::::::::: :: :.::: .::.:::.: .:::.:.::::::
NP_207 LGIADFIRIELRSPTVVTFSFDVGNGPFEISVQSPTHFNDNQWHHVRVERNMKEASLQVD
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pF1KA0 FISGCSGHCTSYGTNCENGGKCLERYHGYSCDCSNTAYDGTFCNKDVGAFFEEGMWLRYN
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NP_207 VQPGCRGHCSSYGKLCRNGGKCRERPIGFFCDCTFSAYTGPFCSNEISAYFGSGSSVIYN
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       ::     ...:::..       . : :  :..: :.::: ::..: .::..:::  ..:.
NP_207 FQENYLLSKNSSSHA------ASFHGDMKLSREMIKFSFRTTRTPSLLLFVSSFYKEYLS
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       :..  .:::::::.:.  .::  .. : .:::.:: : . :.:.: ..:...:     . 
NP_207 VIIAKNGSLQIRYKLNKYQEPDVVNFDFKNMADGQLHHIMINREEGVVFIEIDDNRRRQV
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pF1KA0 HLPSSSDTLFNSPKSLFLGKVIETGKIDQEIHKYNTPGFTGCLSRVQFNQIAPLKAALRQ
       ::  :: : :.. ::: ::...: . .::.    .. ::::::: ::....:::::::. 
NP_207 HL--SSGTEFSAVKSLVLGRILEHSDVDQDTALAGAQGFTGCLSAVQLSHVAPLKAALHP
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       .. .  : . :...::.: :.: : .     :  .  ::  :.. :   .:     . :.
NP_207 SHPDP-VTVTGHVTESSCMAQPGTDATSRERTHSFA-DH--SGTID-DREP-----LANA
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pF1KA0 VNRNSAIIGGVIAVVIFTILCTLVFLIRYMFRHKGTYHTNEAKGAESAESADAAIMNNDP
       .. .::.:::.:::::: .::  .. .: ....:  :. .::: .:...::.: ..... 
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pF1KA0 NFTETIDESKKEWLI
       :. ....:..::.. 
NP_207 NIQNAVNENQKEYFF
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>>XP_011521705 (OMIM: 610518) PREDICTED: contactin-assoc  (1283 aa)
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Smith-Waterman score: 4405; 48.8% identity (76.8% similar) in 1300 aa overlap (35-1330:6-1282)

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XP_011                          MWNYDCDDPLVSALPQASFSSSSELSSSHGPGFAR
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       .:.: :::::::  :..:::::.:.:.: ...:.:::: :.::.:::.: ...::.: ::
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       : :.:. .::.: :: :.:.:: ..::  : ::..:..::.:: .::::.::::.::.: 
XP_011 KQYRQEDSIWGFSGNANADSVVYYRLQPSIKARFLRFIPLEWNPKGRIGMRIEVFGCAYR
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       ..:...::.  : ::: .:... .::.:.:.::: .:.:..:: :: .::.:::.:..:.
XP_011 SEVVDLDGKSSLLYRFDQKSLSPIKDIISLKFKTMQSDGILLHREGPNGDHITLQLRRAR
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       : : .: :  .:      ...  ::::::.:::::.:.: :...:.:.:.  .::.. ::
XP_011 LFLLINSGEAKLPSTSTLVNLTLGSLLDDQHWHSVLIQRLGKQVNFTVDEHRHHFHARGE
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XP_011 SFSCSQPQSMPVTFLSSRSYLALPDFSGEEEVSATFQFRTWNKAGLLLFSELQLISGGIL
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       . :...:.  . :. :      ::..:  ::::::: : . ::.:   ...::. :::. 
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XP_011 LLGPEQIYSGGTYYFGGCPDKSFGSKCKSPLGGFQGCMRLISISGKVVDLISVQQGSLGN
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XP_011 EYVASMEQLQATINRAEHCEQEFTYYCKKSRLVNKQDGTPLSWWVGRTNETQTYWGGSSP
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       :.: ..:...::.  : ::: .:... .::.:.:.::: .:.:..:: :: .::.:::.:
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       ..:.: : .: :  .:      ...  ::::::.:::::.:.: :...:.:.:.  .::.
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       . :::. ..:::::.:::::  ::  :  ..::.::.:.. ::::.: :::...: .   
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       :.. . :...:.  . :. :      ::..:  ::::::: : . ::.:   ...::. :
NP_001 GGILLFLSDGKL--KSNLYQPGKLPSDITAGVELNDGQWHSVSLSAKKNHLSVAVDGQMA
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NP_001 SLGNFSDLQIDSCGISDRCLPNYCEHGGECSQSWSTFHCNCTNTGYRGATCHNSIYEQSC
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       :::  ..::: :::::..::.::: . .::::: ::.:: :::.::.::: .  ::::::
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NP_001 FQENYLLSKNSSSHA------ASFHGDMKLSREMIKFSFRTTRTPSLLLFVSSFYKEYLS
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NP_001 VIIAKNGSLQIRYKLNKYQEPDVVNFDFKNMADGQLHHIMINREEGVVFIEIDDNRRRQV
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       ::  :: : :.. ::: ::...: . .::.                         .::  
NP_001 HL--SSGTEFSAVKSLVLGRILEHSDVDQD-------------------------TAL--
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NP_001 ---------AGHVTESSCMAQPGTDATSRERTHSFA-DH--SGTID-DREP-----LANA
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       :. ....:..::.. 
NP_001 NIQNAVNENQKEYFF
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NP_387           MASVAWAVLKVLLLLPTQTWSPVGAGNPPDCDAPLASALPRSSFSSSSEL
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NP_387 LMFSDGGRNWKQYRREESIWGFPGNTNADSVVHYRLQPPFEARFLRFLPLAWNPRGRIGM
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NP_387 RIEVYGCAYKSEVVYFDGQSALLYRLDKKPLKPIRDVISLKFKAMQSNGILLHREGQHGN
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pF1KA0 YITLELKKAKLVLSLNLGSNQLGPIYGHTSVMTGSLLDDHHWHSVVIERQGRSINLTLDR
       .::::: :.:::. :: :. .:    . ...  ::::::.:::::.::    ..:.:.:.
NP_387 HITLELIKGKLVFFLNSGNAKLPSTIAPVTLTLGSLLDDQHWHSVLIELLDTQVNFTVDK
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pF1KA0 SMQHFRTNGEFDYLDLDYEITFGGIPFSGKPSSSSRKNFKGCMESINYNGVNITDLARRK
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NP_387 HTHHFQAKGDSSYLDLNFEISFGGIPTPGRSRAFRRKSFHGCLENLYYNGVDVTELAKKH
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       : .   .::.:::: .: :::: :... ::: .::  ..:  ::.:::::::  : :.:.
NP_387 KPQILMMGNVSFSCPQPQTVPVTFLSSRSYLALPGNSGEDKVSVTFQFRTWNRAGHLLFG
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pF1KA0 HFADNLGNVEIDLTESKVGVHINITQTKMSQIDISSGSGLNDGQWHEVRFLAKENFAILT
       ..  . :.  . : ..:  ..... :  .:  ....:.:::::::: : : :: .   ..
NP_387 ELRRGSGSFVLFLKDGK--LKLSLFQPGQSPRNVTAGAGLNDGQWHSVSFSAKWSHMNVV
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pF1KA0 IDGDEASAVRTNSPLQVKTGEKYFFGGFLNQMNNSSHSVLQPSFQGCMQLIQVDDQLVNL
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NP_387 VDDD--TAVQPLVAVLIDSGDTYYFGGCLDNSSGSGCKSPLGGFQGCLRLITIGDKAVDP
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       .:: ::::.:: :. :. :.:: ::::::::. :::::: : .::.:.:     . . : 
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        . .  :.....:.:.  :. . .. :: ::: ..  :  .:  .. ::.: .::::..:
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       : :  :::: :  :::.::.: :: : .:::::::  ..: .:.  :: :.::::.:.:.
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        ::::::.:::... ::..::.::.: ::::.:: :  :.:::::::::..:::.:::::
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       :: :: :   ::.:::..::  :.:::.: :. .: .:::. .:::: ::.....:.:  
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       :  . :.::   : ...::: :..       : :  :..: : .:: ::..: .:::.::
NP_387 GSSMTYHFQEHYTLSENSSSLVSSL------HRDVTLTREMITLSFRTTRTPSLLLYVSS
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       :  ..:.:..  .:::::::.:   ..:  .  : .:::.:: :.:.:.:.: .......
NP_387 FYEEYLSVILANNGSLQIRYKLDRHQNPDAFTFDFKNMADGQLHQVKINREEAVVMVEVN
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       .  :.. ..  :: : ::. :::.::::.:..  : . ..  : ::::::: :.:.. ::
NP_387 Q--STKKQVILSSGTEFNAVKSLILGKVLEAAGADPDTRRAATSGFTGCLSAVRFGRAAP
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       :::::: .. : .: ..:...  . :.:.  . ::    .         :. ::      
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       .:. . :.  :.::.:::::::::: .::  .. :: .....   . ::.: ... :   
NP_387 EGEPLVNADRRDSAVIGGVIAVVIFILLCITAIAIR-IYQQRKLRKENESKVSKKEEC  
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       .:::: .: ..:: :... ::: .:   ...  :..:::::::  :::.::..    :..
NP_001 VSFSCSQPQSMPVTFLSSRSYLALPDFSGEEEVSATFQFRTWNKAGLLLFSELQLISGGI
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          .: :. .:  :.:::  ..  .:. .    .:::::.::... ..:.:  : : . :
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       :: :.::..:.:: :::::: :. .::::::  .:::..:. .  : : . :::.  .  
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NP_001 AYKLGPLLCQGDRSFWNSASFDTEASYLHFPTFHGELSADVSFFFKTTASSGVFLENLGI
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NP_001 PKTQPAPADGHVLLQLNSQLFVGGTATRQRGFLGCIRSLQLNGMTLDLEERAQVTPEVQP
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       :: :::.:::  :.::::: ::  :. :::. .:: : ::.....:.:  :  . :::: 
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           ...:::..       . : :  :..: :.::: ::..: .::..:::  ..:.:..
NP_001 NYLLSKNSSSHA------ASFHGDMKLSREMIKFSFRTTRTPSLLLFVSSFYKEYLSVII
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         .:::::::.:.  .::  .. : .:::.:: : . :.:.: ..:...:     . :: 
NP_001 AKNGSLQIRYKLNKYQEPDVVNFDFKNMADGQLHHIMINREEGVVFIEIDDNRRRQVHL-
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        :: : :.. ::: ::...: . .::.    .. ::::::: ::....:::::::. .. 
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pF1KA0 SAHVHIQGELVESNCGASPLTLSPMSSATDPWHLDHLDSASADFPYNPGQGQAIRNGVNR
       .  : . :...::.: :.: : .     :  .  ::  :.. :   .:     . :... 
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       .::.:::.:::::: .::  .. .: ....:  :. .::: .:...::.: ..... :. 
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       ....:..::.. 
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