Result of FASTA (ccds) for pF1KA0600
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KA0600, 1037 aa
  1>>>pF1KA0600 1037 - 1037 aa - 1037 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.1698+/-0.000988; mu= -3.3202+/- 0.060
 mean_var=330.2135+/-66.488, 0's: 0 Z-trim(115.2): 54  B-trim: 0 in 0/54
 Lambda= 0.070579
 statistics sampled from 15677 (15727) to 15677 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.774), E-opt: 0.2 (0.483), width:  16
 Scan time:  4.990

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS45696.1 HDAC5 gene_id:10014|Hs108|chr17        (1122) 4507 473.3 1.3e-132
CCDS32663.1 HDAC5 gene_id:10014|Hs108|chr17        (1123) 4495 472.1 2.9e-132
CCDS2529.1 HDAC4 gene_id:9759|Hs108|chr2           (1084) 1792 196.8   2e-49
CCDS83163.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7          (1025) 1773 194.9 7.4e-49
CCDS47554.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7          (1066) 1726 190.1 2.1e-47
CCDS47553.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7          (1069) 1726 190.1 2.1e-47
CCDS41776.1 HDAC7 gene_id:51564|Hs108|chr12        ( 954) 1609 178.2 7.5e-44
CCDS47555.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7          (1011) 1585 175.7 4.3e-43
CCDS81685.1 HDAC7 gene_id:51564|Hs108|chr12        ( 974) 1569 174.1 1.3e-42
CCDS8756.2 HDAC7 gene_id:51564|Hs108|chr12         ( 991) 1569 174.1 1.3e-42
CCDS56467.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7          ( 562) 1544 171.4 4.8e-42
CCDS47557.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7          ( 590) 1319 148.5   4e-35
CCDS75565.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7          ( 549)  793 94.9   5e-19
CCDS56468.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7          ( 513)  745 90.0 1.4e-17
CCDS56466.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7          ( 546)  741 89.6 1.9e-17
CCDS56465.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7          ( 588)  741 89.6 2.1e-17
CCDS14306.1 HDAC6 gene_id:10013|Hs108|chrX         (1215)  732 88.9 6.9e-17
CCDS14088.1 HDAC10 gene_id:83933|Hs108|chr22       ( 669)  722 87.7 8.7e-17


>>CCDS45696.1 HDAC5 gene_id:10014|Hs108|chr17             (1122 aa)
 initn: 4506 init1: 4506 opt: 4507  Z-score: 2494.6  bits: 473.3 E(32554): 1.3e-132
Smith-Waterman score: 6346; 92.0% identity (92.0% similar) in 1069 aa overlap (1-984:1-1069)

               10        20        30        40        50        60
pF1KA0 MNSPNESDGMSGREPSLEILPRTSLHSIPVTVEVKPVLPRAMPSSMGGGGGGSPSPVELR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MNSPNESDGMSGREPSLEILPRTSLHSIPVTVEVKPVLPRAMPSSMGGGGGGSPSPVELR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KA0 GALVGSVDPTLREQQLQQELLALKQQQQLQKQLLFAEFQKQHDHLTRQHEVQLQKHLKQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GALVGSVDPTLREQQLQQELLALKQQQQLQKQLLFAEFQKQHDHLTRQHEVQLQKHLKQQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KA0 QEMLAAKQQQEMLAAKRQQELEQQRQREQQRQEELEKQRLEQQLLILRNKEKSKESAIAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QEMLAAKQQQEMLAAKRQQELEQQRQREQQRQEELEKQRLEQQLLILRNKEKSKESAIAS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KA0 TEVKLRLQEFLLSKSKEPTPGGLNHSLPQHPKCWGAHHASLDQSSPPQSGPPGTPPSYKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TEVKLRLQEFLLSKSKEPTPGGLNHSLPQHPKCWGAHHASLDQSSPPQSGPPGTPPSYKL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KA0 PLPGPYDSRDDFPLRKTASEPNLKVRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGTVISTFKKRAVEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PLPGPYDSRDDFPLRKTASEPNLKVRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGTVISTFKKRAVEI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KA0 TGAGPGASSVCNSAPGSGPSSPNSSHSTIAENGFTGSVPNIPTEMLPQHRALPLDSSPNQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TGAGPGASSVCNSAPGSGPSSPNSSHSTIAENGFTGSVPNIPTEMLPQHRALPLDSSPNQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KA0 FSLYTSPSLPNISLGLQATVTVTNSHLTASPKLSTQQEAERQALQSLRQGGTLTGKFMST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FSLYTSPSLPNISLGLQATVTVTNSHLTASPKLSTQQEAERQALQSLRQGGTLTGKFMST
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KA0 SSIPGCLLGVALEGDGSPHGHASLLQHVLLLEQARQQSTLIAVPLHGQSPLVTGERVATS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SSIPGCLLGVALEGDGSPHGHASLLQHVLLLEQARQQSTLIAVPLHGQSPLVTGERVATS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KA0 MRTVGKLPRHRPLSRTQSSPLPQSPQALQQLVMQQQHQQFLEKQKQQQLQLGKILTKTGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MRTVGKLPRHRPLSRTQSSPLPQSPQALQQLVMQQQHQQFLEKQKQQQLQLGKILTKTGE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KA0 LPRQPTTHPEETEEELTEQQEVLLGEGALTMPREGSTESESTQEDLEEEDEEDDGEEEED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LPRQPTTHPEETEEELTEQQEVLLGEGALTMPREGSTESESTQEDLEEEDEEDDGEEEED
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KA0 CIQVKDEEGESGAEEGPDLEEPGAGYKKLFSDAQPLQPLQVYQAPLSLATVPHQALGRTQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 CIQVKDEEGESGAEEGPDLEEPGAGYKKLFSDAQPLQPLQVYQAPLSLATVPHQALGRTQ
              610       620       630       640       650       660

              670       680                                        
pF1KA0 SSPAAPGGMKSPPDQPVKHLFTTG------------------------------------
       ::::::::::::::::::::::::                                    
CCDS45 SSPAAPGGMKSPPDQPVKHLFTTGVVYDTFMLKHQCMCGNTHVHPEHAGRIQSIWSRLQE
              670       680       690       700       710       720

                                                           690     
pF1KA0 -------------------------------------------------PISQKMYAVLP
                                                        :::::::::::
CCDS45 TGLLSKCERIRGRKATLDEIQTVHSEYHTLLYGTSPLNRQKLDSKKLLGPISQKMYAVLP
              730       740       750       760       770       780

         700       710       720       730       740       750     
pF1KA0 CGGIGVDSDTVWNEMHSSSAVRMAVGCLLELAFKVAAGELKNGFAIIRPPGHHAEESTAM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 CGGIGVDSDTVWNEMHSSSAVRMAVGCLLELAFKVAAGELKNGFAIIRPPGHHAEESTAM
              790       800       810       820       830       840

         760       770       780       790       800       810     
pF1KA0 GFCFFNSVAITAKLLQQKLNVGKVLIVDWDIHHGNGTQQAFYNDPSVLYISLHRYDNGNF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GFCFFNSVAITAKLLQQKLNVGKVLIVDWDIHHGNGTQQAFYNDPSVLYISLHRYDNGNF
              850       860       870       880       890       900

         820       830       840       850       860       870     
pF1KA0 FPGSGAPEEVGGGPGVGYNVNVAWTGGVDPPIGDVEYLTAFRTVVMPIAHEFSPDVVLVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FPGSGAPEEVGGGPGVGYNVNVAWTGGVDPPIGDVEYLTAFRTVVMPIAHEFSPDVVLVS
              910       920       930       940       950       960

         880       890       900       910       920       930     
pF1KA0 AGFDAVEGHLSPLGGYSVTARCFGHLTRQLMTLAGGRVVLALEGGHDLTAICDASEACVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AGFDAVEGHLSPLGGYSVTARCFGHLTRQLMTLAGGRVVLALEGGHDLTAICDASEACVS
              970       980       990      1000      1010      1020

         940       950       960       970       980       990     
pF1KA0 ALLSVELQPLDEAVLQQKPNINAVATLEKVIEIQSKHWSCVQKFAAGLGRSLREAQAGET
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::           
CCDS45 ALLSVELQPLDEAVLQQKPNINAVATLEKVIEIQSKHWSCVQKFAAGLGRSLREAQAGET
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

        1000      1010      1020      1030       
pF1KA0 EEAETVSAMALLSVGAEQAQAAAAREHSPRPAEEPMEQEPAL
                                                 
CCDS45 EEAETVSAMALLSVGAEQAQAAAAREHSPRPAEEPMEQEPAL
             1090      1100      1110      1120  

>>CCDS32663.1 HDAC5 gene_id:10014|Hs108|chr17             (1123 aa)
 initn: 4460 init1: 4460 opt: 4495  Z-score: 2487.9  bits: 472.1 E(32554): 2.9e-132
Smith-Waterman score: 6334; 92.0% identity (92.0% similar) in 1070 aa overlap (1-984:1-1070)

                10        20        30        40        50         
pF1KA0 MNSPNES-DGMSGREPSLEILPRTSLHSIPVTVEVKPVLPRAMPSSMGGGGGGSPSPVEL
       ::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MNSPNESADGMSGREPSLEILPRTSLHSIPVTVEVKPVLPRAMPSSMGGGGGGSPSPVEL
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KA0 RGALVGSVDPTLREQQLQQELLALKQQQQLQKQLLFAEFQKQHDHLTRQHEVQLQKHLKQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RGALVGSVDPTLREQQLQQELLALKQQQQLQKQLLFAEFQKQHDHLTRQHEVQLQKHLKQ
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KA0 QQEMLAAKQQQEMLAAKRQQELEQQRQREQQRQEELEKQRLEQQLLILRNKEKSKESAIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QQEMLAAKQQQEMLAAKRQQELEQQRQREQQRQEELEKQRLEQQLLILRNKEKSKESAIA
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KA0 STEVKLRLQEFLLSKSKEPTPGGLNHSLPQHPKCWGAHHASLDQSSPPQSGPPGTPPSYK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 STEVKLRLQEFLLSKSKEPTPGGLNHSLPQHPKCWGAHHASLDQSSPPQSGPPGTPPSYK
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260       270       280       290         
pF1KA0 LPLPGPYDSRDDFPLRKTASEPNLKVRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGTVISTFKKRAVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LPLPGPYDSRDDFPLRKTASEPNLKVRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGTVISTFKKRAVE
              250       260       270       280       290       300

     300       310       320       330       340       350         
pF1KA0 ITGAGPGASSVCNSAPGSGPSSPNSSHSTIAENGFTGSVPNIPTEMLPQHRALPLDSSPN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ITGAGPGASSVCNSAPGSGPSSPNSSHSTIAENGFTGSVPNIPTEMLPQHRALPLDSSPN
              310       320       330       340       350       360

     360       370       380       390       400       410         
pF1KA0 QFSLYTSPSLPNISLGLQATVTVTNSHLTASPKLSTQQEAERQALQSLRQGGTLTGKFMS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QFSLYTSPSLPNISLGLQATVTVTNSHLTASPKLSTQQEAERQALQSLRQGGTLTGKFMS
              370       380       390       400       410       420

     420       430       440       450       460       470         
pF1KA0 TSSIPGCLLGVALEGDGSPHGHASLLQHVLLLEQARQQSTLIAVPLHGQSPLVTGERVAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TSSIPGCLLGVALEGDGSPHGHASLLQHVLLLEQARQQSTLIAVPLHGQSPLVTGERVAT
              430       440       450       460       470       480

     480       490       500       510       520       530         
pF1KA0 SMRTVGKLPRHRPLSRTQSSPLPQSPQALQQLVMQQQHQQFLEKQKQQQLQLGKILTKTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SMRTVGKLPRHRPLSRTQSSPLPQSPQALQQLVMQQQHQQFLEKQKQQQLQLGKILTKTG
              490       500       510       520       530       540

     540       550       560       570       580       590         
pF1KA0 ELPRQPTTHPEETEEELTEQQEVLLGEGALTMPREGSTESESTQEDLEEEDEEDDGEEEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ELPRQPTTHPEETEEELTEQQEVLLGEGALTMPREGSTESESTQEDLEEEDEEDDGEEEE
              550       560       570       580       590       600

     600       610       620       630       640       650         
pF1KA0 DCIQVKDEEGESGAEEGPDLEEPGAGYKKLFSDAQPLQPLQVYQAPLSLATVPHQALGRT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DCIQVKDEEGESGAEEGPDLEEPGAGYKKLFSDAQPLQPLQVYQAPLSLATVPHQALGRT
              610       620       630       640       650       660

     660       670       680                                       
pF1KA0 QSSPAAPGGMKSPPDQPVKHLFTTG-----------------------------------
       :::::::::::::::::::::::::                                   
CCDS32 QSSPAAPGGMKSPPDQPVKHLFTTGVVYDTFMLKHQCMCGNTHVHPEHAGRIQSIWSRLQ
              670       680       690       700       710       720

                                                            690    
pF1KA0 --------------------------------------------------PISQKMYAVL
                                                         ::::::::::
CCDS32 ETGLLSKCERIRGRKATLDEIQTVHSEYHTLLYGTSPLNRQKLDSKKLLGPISQKMYAVL
              730       740       750       760       770       780

          700       710       720       730       740       750    
pF1KA0 PCGGIGVDSDTVWNEMHSSSAVRMAVGCLLELAFKVAAGELKNGFAIIRPPGHHAEESTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PCGGIGVDSDTVWNEMHSSSAVRMAVGCLLELAFKVAAGELKNGFAIIRPPGHHAEESTA
              790       800       810       820       830       840

          760       770       780       790       800       810    
pF1KA0 MGFCFFNSVAITAKLLQQKLNVGKVLIVDWDIHHGNGTQQAFYNDPSVLYISLHRYDNGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MGFCFFNSVAITAKLLQQKLNVGKVLIVDWDIHHGNGTQQAFYNDPSVLYISLHRYDNGN
              850       860       870       880       890       900

          820       830       840       850       860       870    
pF1KA0 FFPGSGAPEEVGGGPGVGYNVNVAWTGGVDPPIGDVEYLTAFRTVVMPIAHEFSPDVVLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FFPGSGAPEEVGGGPGVGYNVNVAWTGGVDPPIGDVEYLTAFRTVVMPIAHEFSPDVVLV
              910       920       930       940       950       960

          880       890       900       910       920       930    
pF1KA0 SAGFDAVEGHLSPLGGYSVTARCFGHLTRQLMTLAGGRVVLALEGGHDLTAICDASEACV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SAGFDAVEGHLSPLGGYSVTARCFGHLTRQLMTLAGGRVVLALEGGHDLTAICDASEACV
              970       980       990      1000      1010      1020

          940       950       960       970       980       990    
pF1KA0 SALLSVELQPLDEAVLQQKPNINAVATLEKVIEIQSKHWSCVQKFAAGLGRSLREAQAGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::          
CCDS32 SALLSVELQPLDEAVLQQKPNINAVATLEKVIEIQSKHWSCVQKFAAGLGRSLREAQAGE
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

         1000      1010      1020      1030       
pF1KA0 TEEAETVSAMALLSVGAEQAQAAAAREHSPRPAEEPMEQEPAL
                                                  
CCDS32 TEEAETVSAMALLSVGAEQAQAAAAREHSPRPAEEPMEQEPAL
             1090      1100      1110      1120   

>>CCDS2529.1 HDAC4 gene_id:9759|Hs108|chr2                (1084 aa)
 initn: 2641 init1: 1745 opt: 1792  Z-score: 1000.7  bits: 196.8 E(32554): 2e-49
Smith-Waterman score: 3418; 53.4% identity (72.7% similar) in 1119 aa overlap (25-1037:25-1084)

               10        20        30         40        50         
pF1KA0 MNSPNESDGMSGREPSLEILPRTSLHSIPVTVEVKPVLP-RAMPSSMGGGGGGSPSPVEL
                               .. .: ::.:  .:: .. ::..         :..:
CCDS25 MSSQSHPDGLSGRDQPVELLNPARVNHMPSTVDVATALPLQVAPSAV---------PMDL
               10        20        30        40                 50 

      60           70        80        90       100       110      
pF1KA0 RGALVGSV---DPTLREQQLQQELLALKQQQQLQKQLLFAEFQKQHDHLTRQHEVQLQKH
       :     :.   .:.:::::::::::::::.::.:.:.:.::::.::..:.::::.::..:
CCDS25 RLDHQFSLPVAEPALREQQLQQELLALKQKQQIQRQILIAEFQRQHEQLSRQHEAQLHEH
              60        70        80        90       100       110 

        120       130       140       150        160       170     
pF1KA0 LKQQQEMLAAKQQQEMLAAKRQQELEQQRQREQQRQE-ELEKQRLEQQLLILRNKEKSKE
       .:::::::: :.:::.:        :.::. :..::: :::::. ::.:  :.::::.::
CCDS25 IKQQQEMLAMKHQQELL--------EHQRKLERHRQEQELEKQHREQKLQQLKNKEKGKE
             120               130       140       150       160   

         180       190       200       210         220       230   
pF1KA0 SAIASTEVKLRLQEFLLSKSKEPTPGGLNHSLPQHPKCW-G-AHHASLDQSSPPQSGPPG
       ::.::::::..::::.:.:.:  .  .::: . . :. : : ..:.:::::::::::   
CCDS25 SAVASTEVKMKLQEFVLNKKKALAHRNLNHCISSDPRYWYGKTQHSSLDQSSPPQSG---
           170       180       190       200       210       220   

           240       250       260       270       280       290   
pF1KA0 TPPSYKLPLPGPYDSRDDFPLRKTASEPNLKVRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGTVISTF
       .  ::. :. : ::..:::::::::::::::.:::::::::::::::::::::: :....
CCDS25 VSTSYNHPVLGMYDAKDDFPLRKTASEPNLKLRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGPVVTAL
              230       240       250       260       270       280

           300       310       320        330       340       350  
pF1KA0 KKRAVEITGAGPGASSVCNSAPGSGPSSPNSSHSTI-AENGFTGSVPNIPTEMLPQHRAL
       ::: ...:      .:.:.:::::::::::.: ... ::::.. .::.::.:    :: .
CCDS25 KKRPLDVT------DSACSSAPGSGPSSPNNSSGSVSAENGIAPAVPSIPAETSLAHRLV
                    290       300       310       320       330    

            360       370       380       390       400       410  
pF1KA0 PLDSSPNQFSLYTSPSLPNISLGLQATVTVTNSHLTASPKLSTQQEAERQALQSLRQGGT
         ..:   . ::::::::::.::: ::          :   . ::.::: .: .:.:  .
CCDS25 AREGSAAPLPLYTSPSLPNITLGLPAT--------GPSAGTAGQQDAERLTLPALQQRLS
          340       350       360               370       380      

            420       430       440       450       460            
pF1KA0 LTGKFMSTSSIPGCLLGVALEGDGSPHGHASLLQHVLLLEQARQQSTLI----AVPLHGQ
       :   : .:   :  :    :: ::.  .:. ::::..::::   :. :.    :.:::.:
CCDS25 L---FPGTHLTPY-LSTSPLERDGGA-AHSPLLQHMVLLEQPPAQAPLVTGLGALPLHAQ
           390        400        410       420       430       440 

      470       480       490       500       510       520        
pF1KA0 SPLVTGERVATSMRTVGKLPRHRPLSRTQSSPLPQSPQALQQLVMQQQHQQFLEKQKQQ-
       : :: ..::. :..   :: .::::.::::.::::. ::::.::.::::::::::.::: 
CCDS25 S-LVGADRVSPSIH---KLRQHRPLGRTQSAPLPQNAQALQHLVIQQQHQQFLEKHKQQF
              450          460       470       480       490       

          530       540       550       560       570        580   
pF1KA0 ---QLQLGKILTKTGELPRQPTTHPEETEEELTEQQEVLLGEGALT-MPREGSTESESTQ
          :::..::. : .:  ::: .::::::::: :.: .:: :  :  .:  :. :... :
CCDS25 QQQQLQMNKIIPKPSEPARQPESHPEETEEELREHQ-ALLDEPYLDRLP--GQKEAHA-Q
       500       510       520       530        540         550    

           590       600       610       620       630       640   
pF1KA0 EDLEEEDEEDDGEEEEDCIQVKDEEGESGAEEGPDLEEPGAGYKKLFSDAQPLQPLQVYQ
         .. ..:  ...:::       .: : : .. :. .:     . :. . : .. :. ::
CCDS25 AGVQVKQEPIESDEEE---AEPPREVEPGQRQ-PSEQELLFRQQALLLEQQRIHQLRNYQ
           560          570       580        590       600         

           650            660          670                         
pF1KA0 APLSLATVP-----HQALGRTQSSPAA---PGGMKSPPDQP------------VKH----
       : .  : .:     :. :.:.:::::.   : ... :: .:            .::    
CCDS25 ASMEAAGIPVSFGGHRPLSRAQSSPASATFPVSVQEPPTKPRFTTGLVYDTLMLKHQCTC
     610       620       630       640       650       660         

                                                         680       
pF1KA0 ----------------------------------------------------LFTTGPIS
                                                           :. :.:..
CCDS25 GSSSSHPEHAGRIQSIWSRLQETGLRGKCECIRGRKATLEELQTVHSEAHTLLYGTNPLN
     670       680       690       700       710       720         

        690                   700       710       720       730    
pF1KA0 -QKM------------YAVLPCGGIGVDSDTVWNEMHSSSAVRMAVGCLLELAFKVAAGE
        ::.            .. :::::.::::::.:::.::..:.:.::::..::.::::.::
CCDS25 RQKLDSKKLLGSLASVFVRLPCGGVGVDSDTIWNEVHSAGAARLAVGCVVELVFKVATGE
     730       740       750       760       770       780         

          740       750       760       770       780       790    
pF1KA0 LKNGFAIIRPPGHHAEESTAMGFCFFNSVAITAKLLQQKLNVGKVLIVDWDIHHGNGTQQ
       ::::::..::::::::::: ::::.:::::..::::::.:.:.:.::::::.::::::::
CCDS25 LKNGFAVVRPPGHHAEESTPMGFCYFNSVAVAAKLLQQRLSVSKILIVDWDVHHGNGTQQ
     790       800       810       820       830       840         

          800       810       820       830       840       850    
pF1KA0 AFYNDPSVLYISLHRYDNGNFFPGSGAPEEVGGGPGVGYNVNVAWTGGVDPPIGDVEYLT
       :::.::::::.::::::.::::::::::.::: :::::.:::.:.:::.:::.::.:::.
CCDS25 AFYSDPSVLYMSLHRYDDGNFFPGSGAPDEVGTGPGVGFNVNMAFTGGLDPPMGDAEYLA
     850       860       870       880       890       900         

          860       870       880       890       900       910    
pF1KA0 AFRTVVMPIAHEFSPDVVLVSAGFDAVEGHLSPLGGYSVTARCFGHLTRQLMTLAGGRVV
       :::::::::: ::.:::::::.:::::::: .:::::...:::::.::.::: :::::.:
CCDS25 AFRTVVMPIASEFAPDVVLVSSGFDAVEGHPTPLGGYNLSARCFGYLTKQLMGLAGGRIV
     910       920       930       940       950       960         

          920       930       940       950       960       970    
pF1KA0 LALEGGHDLTAICDASEACVSALLSVELQPLDEAVLQQKPNINAVATLEKVIEIQSKHWS
       ::::::::::::::::::::::::. ::.:: : ::::.:: ::: ..:::.::.::.: 
CCDS25 LALEGGHDLTAICDASEACVSALLGNELDPLPEKVLQQRPNANAVRSMEKVMEIHSKYWR
     970       980       990      1000      1010      1020         

          980       990      1000      1010      1020      1030    
pF1KA0 CVQKFAAGLGRSLREAQAGETEEAETVSAMALLSVGAEQAQAAAAREHSPRPAEEPMEQE
       :.:. ..  :::: :::. :.::::::.::: ::::.. :.         :: :::::.:
CCDS25 CLQRTTSTAGRSLIEAQTCENEEAETVTAMASLSVGVKPAEK--------RPDEEPMEEE
    1030      1040      1050      1060      1070              1080 

          
pF1KA0 PAL
       : :
CCDS25 PPL
          

>>CCDS83163.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7               (1025 aa)
 initn: 2587 init1: 1633 opt: 1773  Z-score: 990.6  bits: 194.9 E(32554): 7.4e-49
Smith-Waterman score: 3063; 50.2% identity (67.3% similar) in 1122 aa overlap (25-1037:1-1025)

               10        20        30        40        50          
pF1KA0 MNSPNESDGMSGREPSLEILPRTSLHSIPVTVEVKPVLPRAMPSSMGGGGGGSP-SPVEL
                               .::.  .:.::  .:           :  : ::..:
CCDS83                         MHSMISSVDVKSEVPV----------GLEPISPLDL
                                       10                  20      

      60           70        80        90       100       110      
pF1KA0 RGAL---VGSVDPTLREQQLQQELLALKQQQQLQKQLLFAEFQKQHDHLTRQHEVQLQKH
       :  :   .  :::..::.::::::: ..::::.:::::.:::::::..:::::..:::.:
CCDS83 RTDLRMMMPVVDPVVREKQLQQELLLIQQQQQIQKQLLIAEFQKQHENLTRQHQAQLQEH
         30        40        50        60        70        80      

        120       130       140       150       160       170      
pF1KA0 LKQQQEMLAAKQQQEMLAAKRQQELEQQRQREQQRQEELEKQRLEQQLLILRNKEKSKES
       .: :::.:: :::::.:  ...:.::::::     ..:.:..: ::::  ::.:....: 
CCDS83 IKLQQELLAIKQQQELL--EKEQKLEQQRQ-----EQEVERHRREQQLPPLRGKDRGRER
         90       100         110            120       130         

        180       190         200       210         220       230  
pF1KA0 AIASTEVKLRLQEFLLSKS--KEPTPGGLNHSLPQHPKCW--GAHHASLDQSSPPQSGPP
       :.:::::: .:::::::::  :.   .: :::. .::: :  .:::.:::::::: :   
CCDS83 AVASTEVKQKLQEFLLSKSATKDTPTNGKNHSVSRHPKLWYTAAHHTSLDQSSPPLS---
     140       150       160       170       180       190         

            240       250       260       270       280       290  
pF1KA0 GTPPSYKLPLPGPYDSRDDFPLRKTASEPNLKVRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGTVIST
       :: ::::  :::  :..:::::::: :                                 
CCDS83 GTSPSYKYTLPGAQDAKDDFPLRKTES---------------------------------
        200       210       220                                    

            300       310       320        330       340           
pF1KA0 FKKRAVEITGAGPGASSVCNSAPGSGPSSPNSSHS-TIAENGFTGSVPNIP--TEMLPQH
                       :: .:.:::::::::.. . ...::  :. .:  :   .:. :.
CCDS83 ----------------SVSSSSPGSGPSSPNNGPTGSVTENE-TSVLPPTPHAEQMVSQQ
                           230       240        250       260      

     350       360       370       380       390       400         
pF1KA0 RALPLDSSPNQFSLYTSPSLPNISLGLQATVTVTNSHLTASPKLSTQQEAERQALQSLRQ
       : :  ..: : .:::::::::::.::: :.     :.:.:: .:. .:. :    :.:::
CCDS83 RILIHEDSMNLLSLYTSPSLPNITLGLPAV----PSQLNASNSLKEKQKCET---QTLRQ
        270       280       290           300       310            

     410       420       430       440       450       460         
pF1KA0 GGTLTGKFMSTSSIPGCLLGVALEGDGSPHGHASLLQHVLLLEQARQQSTLIA--VPLHG
       :  : :.. ..    .    :.:::     .: .::::.:: :: :::. :.:  :::: 
CCDS83 GVPLPGQYGGSIPASSSHPHVTLEGKPPNSSHQALLQHLLLKEQMRQQKLLVAGGVPLHP
     320       330       340       350       360       370         

       470       480       490       500       510       520       
pF1KA0 QSPLVTGERVATSMRTVGKLPRHRPLSRTQSSPLPQSPQALQQLVMQQQHQQFLEKQKQ-
       ::::.: ::.. ..: . ::::::::.::::.:::::  .: :::.::::::::::::: 
CCDS83 QSPLATKERISPGIRGTHKLPRHRPLNRTQSAPLPQS--TLAQLVIQQQHQQFLEKQKQY
     380       390       400       410         420       430       

         530       540       550       560       570       580     
pF1KA0 -QQLQLGKILTKTGELPRQPTTHPEETEEELTEQQEVLLGEGALTMPREGSTESESTQED
        ::....:.:.:. :  .:: .: ::.::::        :. :.   :  :. ..::. :
CCDS83 QQQIHMNKLLSKSIEQLKQPGSHLEEAEEELQ-------GDQAMQEDRAPSS-GNSTRSD
       440       450       460              470       480          

         590       600       610       620       630            640
pF1KA0 LEEEDEEDDGEEEEDCIQVKDEEGESGAEEGPDLEEPGAGYKKLFSDAQPLQP-----LQ
              ::   .   ..::.:  .:  .:  ...:  .: .  : .   :.:     :.
CCDS83 --SSACVDDTLGQVGAVKVKEEPVDS--DEDAQIQEMESGEQAAFMQQPFLEPTHTRALS
       490       500       510         520       530       540     

              650           660          670                       
pF1KA0 VYQAPLSLATVP----HQALGRTQSSPAA---PGGMKSPPDQP------------VKH--
       : ::::. . .     :. ..::.:::::   :    . : ::            .::  
CCDS83 VRQAPLAAVGMDGLEKHRLVSRTHSSPAASVLPHPAMDRPLQPGSATGIAYDPLMLKHQC
         550       560       570       580       590       600     

                                                           680     
pF1KA0 ------------------------------------------------------LFTTGP
                                                             :. :.:
CCDS83 VCGNSTTHPEHAGRIQSIWSRLQETGLLNKCERIQGRKASLEEIQLVHSEHHSLLYGTNP
         610       620       630       640       650       660     

                       690       700       710       720       730 
pF1KA0 I--------------SQKMYAVLPCGGIGVDSDTVWNEMHSSSAVRMAVGCLLELAFKVA
       .              :::... :::::.::::::.:::.:::.:.::::::..::: :::
CCDS83 LDGQKLDPRILLGDDSQKFFSSLPCGGLGVDSDTIWNELHSSGAARMAVGCVIELASKVA
         670       680       690       700       710       720     

             740       750       760       770       780       790 
pF1KA0 AGELKNGFAIIRPPGHHAEESTAMGFCFFNSVAITAKLLQQKLNVGKVLIVDWDIHHGNG
       .::::::::..:::::::::::::::::::::::::: :...::..:.:::: :.:::::
CCDS83 SGELKNGFAVVRPPGHHAEESTAMGFCFFNSVAITAKYLRDQLNISKILIVDLDVHHGNG
         730       740       750       760       770       780     

             800       810       820       830       840       850 
pF1KA0 TQQAFYNDPSVLYISLHRYDNGNFFPGSGAPEEVGGGPGVGYNVNVAWTGGVDPPIGDVE
       :::::: :::.:::::::::.::::::::::.::: : : :::.:.:::::.:::.::::
CCDS83 TQQAFYADPSILYISLHRYDEGNFFPGSGAPNEVGTGLGEGYNINIAWTGGLDPPMGDVE
         790       800       810       820       830       840     

             860       870       880       890       900       910 
pF1KA0 YLTAFRTVVMPIAHEFSPDVVLVSAGFDAVEGHLSPLGGYSVTARCFGHLTRQLMTLAGG
       :: ::::.: :.:.::.::.:::::::::.:::  :::::.:::.::::::.:::::: :
CCDS83 YLEAFRTIVKPVAKEFDPDMVLVSAGFDALEGHTPPLGGYKVTAKCFGHLTKQLMTLADG
         850       860       870       880       890       900     

             920       930       940       950       960       970 
pF1KA0 RVVLALEGGHDLTAICDASEACVSALLSVELQPLDEAVLQQKPNINAVATLEKVIEIQSK
       :::::::::::::::::::::::.:::. ::.:: : .:.:.::.::: .:.:.::::::
CCDS83 RVVLALEGGHDLTAICDASEACVNALLGNELEPLAEDILHQSPNMNAVISLQKIIEIQSK
         910       920       930       940       950       960     

             980       990      1000      1010      1020      1030 
pF1KA0 HWSCVQKFAAGLGRSLREAQAGETEEAETVSAMALLSVGAEQAQAAAAREHSPRPAEEPM
       .:. :.  :.  : .:  ::    ::.:::::.: :.: .::     :.: : : : :::
CCDS83 YWKSVRMVAVPRGCALAGAQL--QEETETVSALASLTVDVEQP---FAQEDS-RTAGEPM
         970       980         990      1000         1010          

             
pF1KA0 EQEPAL
       :.::::
CCDS83 EEEPAL
    1020     

>>CCDS47554.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7               (1066 aa)
 initn: 2482 init1: 1633 opt: 1726  Z-score: 964.5  bits: 190.1 E(32554): 2.1e-47
Smith-Waterman score: 3355; 54.0% identity (71.5% similar) in 1096 aa overlap (51-1037:17-1066)

               30        40        50         60           70      
pF1KA0 PRTSLHSIPVTVEVKPVLPRAMPSSMGGGGGGSP-SPVELRGAL---VGSVDPTLREQQL
                                     :  : ::..::  :   .  :::..::.::
CCDS47               MHSMISSVDVKSEVPVGLEPISPLDLRTDLRMMMPVVDPVVREKQL
                             10        20        30        40      

         80        90       100       110       120       130      
pF1KA0 QQELLALKQQQQLQKQLLFAEFQKQHDHLTRQHEVQLQKHLKQQQEMLAAKQQQEMLAAK
       ::::: ..::::.:::::.:::::::..:::::..:::.:.:   :.:: :::::.:  .
CCDS47 QQELLLIQQQQQIQKQLLIAEFQKQHENLTRQHQAQLQEHIK---ELLAIKQQQELL--E
         50        60        70        80           90       100   

        140       150       160       170       180       190      
pF1KA0 RQQELEQQRQREQQRQEELEKQRLEQQLLILRNKEKSKESAIASTEVKLRLQEFLLSKS-
       ..:.::::::     ..:.:..: ::::  ::.:....: :.:::::: .::::::::: 
CCDS47 KEQKLEQQRQ-----EQEVERHRREQQLPPLRGKDRGRERAVASTEVKQKLQEFLLSKSA
             110            120       130       140       150      

          200       210         220       230       240       250  
pF1KA0 -KEPTPGGLNHSLPQHPKCW--GAHHASLDQSSPPQSGPPGTPPSYKLPLPGPYDSRDDF
        :.   .: :::. .::: :  .:::.:::::::: ::   : ::::  :::  :..:::
CCDS47 TKDTPTNGKNHSVSRHPKLWYTAAHHTSLDQSSPPLSG---TSPSYKYTLPGAQDAKDDF
        160       170       180       190          200       210   

            260       270       280       290       300       310  
pF1KA0 PLRKTASEPNLKVRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGTVISTFKKRAVEITGAGPGASSVCN
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::.:...::::  :.:      ::: .
CCDS47 PLRKTASEPNLKVRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGNVVTSFKKRMFEVT-----ESSVSS
           220       230       240       250       260             

            320        330       340         350       360         
pF1KA0 SAPGSGPSSPNSSHS-TIAENGFTGSVPNIP--TEMLPQHRALPLDSSPNQFSLYTSPSL
       :.:::::::::.. . ...::  :. .:  :   .:. :.: :  ..: : .::::::::
CCDS47 SSPGSGPSSPNNGPTGSVTENE-TSVLPPTPHAEQMVSQQRILIHEDSMNLLSLYTSPSL
      270       280       290        300       310       320       

     370       380       390       400       410       420         
pF1KA0 PNISLGLQATVTVTNSHLTASPKLSTQQEAERQALQSLRQGGTLTGKFMSTSSIPGCLLG
       :::.::: :.     :.:.:: .:. .:. :    :.::::  : :.. ..    .    
CCDS47 PNITLGLPAV----PSQLNASNSLKEKQKCE---TQTLRQGVPLPGQYGGSIPASSSHPH
       330           340       350          360       370       380

     430       440       450       460         470       480       
pF1KA0 VALEGDGSPHGHASLLQHVLLLEQARQQSTLIA--VPLHGQSPLVTGERVATSMRTVGKL
       :.:::     .: .::::.:: :: :::. :.:  :::: ::::.: ::.. ..: . ::
CCDS47 VTLEGKPPNSSHQALLQHLLLKEQMRQQKLLVAGGVPLHPQSPLATKERISPGIRGTHKL
              390       400       410       420       430       440

       490       500       510       520         530       540     
pF1KA0 PRHRPLSRTQSSPLPQSPQALQQLVMQQQHQQFLEKQKQ--QQLQLGKILTKTGELPRQP
       ::::::.::::.:::::  .: :::.:::::::::::::  ::....:.:.:. :  .::
CCDS47 PRHRPLNRTQSAPLPQS--TLAQLVIQQQHQQFLEKQKQYQQQIHMNKLLSKSIEQLKQP
              450         460       470       480       490        

         550       560       570       580       590       600     
pF1KA0 TTHPEETEEELTEQQEVLLGEGALTMPREGSTESESTQEDLEEEDEEDDGEEEEDCIQVK
        .: ::.::::        :. :.   :  :. ..::. :       ::   .   ..::
CCDS47 GSHLEEAEEELQ-------GDQAMQEDRAPSS-GNSTRSD--SSACVDDTLGQVGAVKVK
      500       510              520        530         540        

         610       620       630            640       650          
pF1KA0 DEEGESGAEEGPDLEEPGAGYKKLFSDAQPLQP-----LQVYQAPLSLATVP----HQAL
       .:  .:  .:  ...:  .: .  : .   :.:     :.: ::::. . .     :. .
CCDS47 EEPVDS--DEDAQIQEMESGEQAAFMQQPFLEPTHTRALSVRQAPLAAVGMDGLEKHRLV
      550         560       570       580       590       600      

        660          670                                           
pF1KA0 GRTQSSPAA---PGGMKSPPDQP------------VKH----------------------
       .::.:::::   :    . : ::            .::                      
CCDS47 SRTHSSPAASVLPHPAMDRPLQPGSATGIAYDPLMLKHQCVCGNSTTHPEHAGRIQSIWS
        610       620       630       640       650       660      

                                       680                     690 
pF1KA0 ----------------------------------LFTTGPI--------------SQKMY
                                         :. :.:.              :::..
CCDS47 RLQETGLLNKCERIQGRKASLEEIQLVHSEHHSLLYGTNPLDGQKLDPRILLGDDSQKFF
        670       680       690       700       710       720      

             700       710       720       730       740       750 
pF1KA0 AVLPCGGIGVDSDTVWNEMHSSSAVRMAVGCLLELAFKVAAGELKNGFAIIRPPGHHAEE
       . :::::.::::::.:::.:::.:.::::::..::: :::.::::::::..:::::::::
CCDS47 SSLPCGGLGVDSDTIWNELHSSGAARMAVGCVIELASKVASGELKNGFAVVRPPGHHAEE
        730       740       750       760       770       780      

             760       770       780       790       800       810 
pF1KA0 STAMGFCFFNSVAITAKLLQQKLNVGKVLIVDWDIHHGNGTQQAFYNDPSVLYISLHRYD
       ::::::::::::::::: :...::..:.:::: :.::::::::::: :::.:::::::::
CCDS47 STAMGFCFFNSVAITAKYLRDQLNISKILIVDLDVHHGNGTQQAFYADPSILYISLHRYD
        790       800       810       820       830       840      

             820       830       840       850       860       870 
pF1KA0 NGNFFPGSGAPEEVGGGPGVGYNVNVAWTGGVDPPIGDVEYLTAFRTVVMPIAHEFSPDV
       .::::::::::.::: : : :::.:.:::::.:::.:::::: ::::.: :.:.::.::.
CCDS47 EGNFFPGSGAPNEVGTGLGEGYNINIAWTGGLDPPMGDVEYLEAFRTIVKPVAKEFDPDM
        850       860       870       880       890       900      

             880       890       900       910       920       930 
pF1KA0 VLVSAGFDAVEGHLSPLGGYSVTARCFGHLTRQLMTLAGGRVVLALEGGHDLTAICDASE
       :::::::::.:::  :::::.:::.::::::.:::::: :::::::::::::::::::::
CCDS47 VLVSAGFDALEGHTPPLGGYKVTAKCFGHLTKQLMTLADGRVVLALEGGHDLTAICDASE
        910       920       930       940       950       960      

             940       950       960       970       980       990 
pF1KA0 ACVSALLSVELQPLDEAVLQQKPNINAVATLEKVIEIQSKHWSCVQKFAAGLGRSLREAQ
       :::.:::. ::.:: : .:.:.::.::: .:.:.::::::.:. :.  :.  : .:  ::
CCDS47 ACVNALLGNELEPLAEDILHQSPNMNAVISLQKIIEIQSKYWKSVRMVAVPRGCALAGAQ
        970       980       990      1000      1010      1020      

            1000      1010      1020      1030       
pF1KA0 AGETEEAETVSAMALLSVGAEQAQAAAAREHSPRPAEEPMEQEPAL
           ::.:::::.: :.: .::     :.: : : : ::::.::::
CCDS47 L--QEETETVSALASLTVDVEQP---FAQEDS-RTAGEPMEEEPAL
         1030      1040         1050       1060      

>>CCDS47553.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7               (1069 aa)
 initn: 2830 init1: 1633 opt: 1726  Z-score: 964.5  bits: 190.1 E(32554): 2.1e-47
Smith-Waterman score: 3383; 54.2% identity (71.7% similar) in 1096 aa overlap (51-1037:17-1069)

               30        40        50         60           70      
pF1KA0 PRTSLHSIPVTVEVKPVLPRAMPSSMGGGGGGSP-SPVELRGAL---VGSVDPTLREQQL
                                     :  : ::..::  :   .  :::..::.::
CCDS47               MHSMISSVDVKSEVPVGLEPISPLDLRTDLRMMMPVVDPVVREKQL
                             10        20        30        40      

         80        90       100       110       120       130      
pF1KA0 QQELLALKQQQQLQKQLLFAEFQKQHDHLTRQHEVQLQKHLKQQQEMLAAKQQQEMLAAK
       ::::: ..::::.:::::.:::::::..:::::..:::.:.: :::.:: :::::.:  .
CCDS47 QQELLLIQQQQQIQKQLLIAEFQKQHENLTRQHQAQLQEHIKLQQELLAIKQQQELL--E
         50        60        70        80        90       100      

        140       150       160       170       180       190      
pF1KA0 RQQELEQQRQREQQRQEELEKQRLEQQLLILRNKEKSKESAIASTEVKLRLQEFLLSKS-
       ..:.::::::     ..:.:..: ::::  ::.:....: :.:::::: .::::::::: 
CCDS47 KEQKLEQQRQ-----EQEVERHRREQQLPPLRGKDRGRERAVASTEVKQKLQEFLLSKSA
          110            120       130       140       150         

          200       210         220       230       240       250  
pF1KA0 -KEPTPGGLNHSLPQHPKCW--GAHHASLDQSSPPQSGPPGTPPSYKLPLPGPYDSRDDF
        :.   .: :::. .::: :  .:::.:::::::: ::   : ::::  :::  :..:::
CCDS47 TKDTPTNGKNHSVSRHPKLWYTAAHHTSLDQSSPPLSG---TSPSYKYTLPGAQDAKDDF
     160       170       180       190          200       210      

            260       270       280       290       300       310  
pF1KA0 PLRKTASEPNLKVRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGTVISTFKKRAVEITGAGPGASSVCN
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::.:...::::  :.:      ::: .
CCDS47 PLRKTASEPNLKVRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGNVVTSFKKRMFEVT-----ESSVSS
        220       230       240       250       260            270 

            320        330       340         350       360         
pF1KA0 SAPGSGPSSPNSSHS-TIAENGFTGSVPNIP--TEMLPQHRALPLDSSPNQFSLYTSPSL
       :.:::::::::.. . ...::  :. .:  :   .:. :.: :  ..: : .::::::::
CCDS47 SSPGSGPSSPNNGPTGSVTENE-TSVLPPTPHAEQMVSQQRILIHEDSMNLLSLYTSPSL
             280       290        300       310       320       330

     370       380       390       400       410       420         
pF1KA0 PNISLGLQATVTVTNSHLTASPKLSTQQEAERQALQSLRQGGTLTGKFMSTSSIPGCLLG
       :::.::: :.     :.:.:: .:. .:. :    :.::::  : :.. ..    .    
CCDS47 PNITLGLPAV----PSQLNASNSLKEKQKCE---TQTLRQGVPLPGQYGGSIPASSSHPH
              340           350          360       370       380   

     430       440       450       460         470       480       
pF1KA0 VALEGDGSPHGHASLLQHVLLLEQARQQSTLIA--VPLHGQSPLVTGERVATSMRTVGKL
       :.:::     .: .::::.:: :: :::. :.:  :::: ::::.: ::.. ..: . ::
CCDS47 VTLEGKPPNSSHQALLQHLLLKEQMRQQKLLVAGGVPLHPQSPLATKERISPGIRGTHKL
           390       400       410       420       430       440   

       490       500       510       520         530       540     
pF1KA0 PRHRPLSRTQSSPLPQSPQALQQLVMQQQHQQFLEKQKQ--QQLQLGKILTKTGELPRQP
       ::::::.::::.:::::  .: :::.:::::::::::::  ::....:.:.:. :  .::
CCDS47 PRHRPLNRTQSAPLPQS--TLAQLVIQQQHQQFLEKQKQYQQQIHMNKLLSKSIEQLKQP
           450       460         470       480       490       500 

         550       560       570       580       590       600     
pF1KA0 TTHPEETEEELTEQQEVLLGEGALTMPREGSTESESTQEDLEEEDEEDDGEEEEDCIQVK
        .: ::.::::        :. :.   :  :. ..::. :       ::   .   ..::
CCDS47 GSHLEEAEEELQ-------GDQAMQEDRAPSS-GNSTRSD--SSACVDDTLGQVGAVKVK
             510              520        530         540       550 

         610       620       630            640       650          
pF1KA0 DEEGESGAEEGPDLEEPGAGYKKLFSDAQPLQP-----LQVYQAPLSLATVP----HQAL
       .:  .:  .:  ...:  .: .  : .   :.:     :.: ::::. . .     :. .
CCDS47 EEPVDS--DEDAQIQEMESGEQAAFMQQPFLEPTHTRALSVRQAPLAAVGMDGLEKHRLV
               560       570       580       590       600         

        660          670                                           
pF1KA0 GRTQSSPAA---PGGMKSPPDQP------------VKH----------------------
       .::.:::::   :    . : ::            .::                      
CCDS47 SRTHSSPAASVLPHPAMDRPLQPGSATGIAYDPLMLKHQCVCGNSTTHPEHAGRIQSIWS
     610       620       630       640       650       660         

                                       680                     690 
pF1KA0 ----------------------------------LFTTGPI--------------SQKMY
                                         :. :.:.              :::..
CCDS47 RLQETGLLNKCERIQGRKASLEEIQLVHSEHHSLLYGTNPLDGQKLDPRILLGDDSQKFF
     670       680       690       700       710       720         

             700       710       720       730       740       750 
pF1KA0 AVLPCGGIGVDSDTVWNEMHSSSAVRMAVGCLLELAFKVAAGELKNGFAIIRPPGHHAEE
       . :::::.::::::.:::.:::.:.::::::..::: :::.::::::::..:::::::::
CCDS47 SSLPCGGLGVDSDTIWNELHSSGAARMAVGCVIELASKVASGELKNGFAVVRPPGHHAEE
     730       740       750       760       770       780         

             760       770       780       790       800       810 
pF1KA0 STAMGFCFFNSVAITAKLLQQKLNVGKVLIVDWDIHHGNGTQQAFYNDPSVLYISLHRYD
       ::::::::::::::::: :...::..:.:::: :.::::::::::: :::.:::::::::
CCDS47 STAMGFCFFNSVAITAKYLRDQLNISKILIVDLDVHHGNGTQQAFYADPSILYISLHRYD
     790       800       810       820       830       840         

             820       830       840       850       860       870 
pF1KA0 NGNFFPGSGAPEEVGGGPGVGYNVNVAWTGGVDPPIGDVEYLTAFRTVVMPIAHEFSPDV
       .::::::::::.::: : : :::.:.:::::.:::.:::::: ::::.: :.:.::.::.
CCDS47 EGNFFPGSGAPNEVGTGLGEGYNINIAWTGGLDPPMGDVEYLEAFRTIVKPVAKEFDPDM
     850       860       870       880       890       900         

             880       890       900       910       920       930 
pF1KA0 VLVSAGFDAVEGHLSPLGGYSVTARCFGHLTRQLMTLAGGRVVLALEGGHDLTAICDASE
       :::::::::.:::  :::::.:::.::::::.:::::: :::::::::::::::::::::
CCDS47 VLVSAGFDALEGHTPPLGGYKVTAKCFGHLTKQLMTLADGRVVLALEGGHDLTAICDASE
     910       920       930       940       950       960         

             940       950       960       970       980       990 
pF1KA0 ACVSALLSVELQPLDEAVLQQKPNINAVATLEKVIEIQSKHWSCVQKFAAGLGRSLREAQ
       :::.:::. ::.:: : .:.:.::.::: .:.:.::::::.:. :.  :.  : .:  ::
CCDS47 ACVNALLGNELEPLAEDILHQSPNMNAVISLQKIIEIQSKYWKSVRMVAVPRGCALAGAQ
     970       980       990      1000      1010      1020         

            1000      1010      1020      1030       
pF1KA0 AGETEEAETVSAMALLSVGAEQAQAAAAREHSPRPAEEPMEQEPAL
           ::.:::::.: :.: .::     :.: : : : ::::.::::
CCDS47 L--QEETETVSALASLTVDVEQP---FAQEDS-RTAGEPMEEEPAL
    1030        1040      1050          1060         

>>CCDS41776.1 HDAC7 gene_id:51564|Hs108|chr12             (954 aa)
 initn: 1965 init1: 1563 opt: 1609  Z-score: 900.8  bits: 178.2 E(32554): 7.5e-44
Smith-Waterman score: 1842; 39.0% identity (61.9% similar) in 995 aa overlap (123-1037:58-952)

            100       110       120       130       140       150  
pF1KA0 LLFAEFQKQHDHLTRQHEVQLQKHLKQQQEMLAAKQQQEMLAAKRQQELEQQRQREQQR-
                                     .:: .. :..        :.:::. : .: 
CCDS41 PCADTPGPQPQPMDLRVGQRPPVEPPPEPTLLALQRPQRLHHHLFLAGLQQQRSVEPMRL
        30        40        50        60        70        80       

                  160       170       180       190       200      
pF1KA0 -----QEELEKQRLEQQLLILRNKEKSKESAIASTEVKLRLQEFLLSKSKEPTPGGLNHS
            . ::.    ::.:  : .:.:::.::.::. :: .: : .:.:..    ..:...
CCDS41 SMDTPMPELQVGPQEQELRQLLHKDKSKRSAVASSVVKQKLAEVILKKQQ----AALERT
        90       100       110       120       130           140   

        210       220       230       240        250       260     
pF1KA0 LPQHPKCWGAHHASLDQSSPPQSGPPGTPPSYKLPLPG-PYDSRDDFPLRKTASEPNLKV
       .  ::.  :  . .:.     ...  .   :.  :.:. : :  . ::::::.::::::.
CCDS41 V--HPNSPGIPYRTLEPLET-EGATRSMLSSFLPPVPSLPSDPPEHFPLRKTVSEPNLKL
             150       160        170       180       190       200

         270       280       290       300       310       320     
pF1KA0 RSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGTVISTFKKRAVEITGAGPGASSVCNSAPGSGPSSPNSS
       : . :... :::..::::....    ....: .:  : .  .::   :.:.:: ::::.:
CCDS41 RYKPKKSL-ERRKNPLLRKESAP--PSLRRRPAETLGDSSPSSS---STPASGCSSPNDS
               210       220         230       240          250    

         330       340       350       360       370       380     
pF1KA0 HSTIAENGFTGSVPNIPTEMLPQHRALPLDSSPNQFSLYTSPSLPNISLGLQATVTVTNS
            :.:     ::                                             
CCDS41 -----EHG-----PN---------------------------------------------
                                                                   

         390       400       410       420       430        440    
pF1KA0 HLTASPKLSTQQEAERQALQSLRQGGTLTGKFMSTSSIPGCLLGVALEGDGS-PHGHASL
            : :... ...:..  .:   : . :.  .   .:    :.  :. :. :    : 
CCDS41 -----PILGSEADSDRRTHPTLGPRGPILGSPHTPLFLPH---GLEPEAGGTLP----SR
          260       270       280       290          300           

          450       460       470       480       490       500    
pF1KA0 LQHVLLLEQARQQSTLIAVPLHGQSPLVTGERVATSMRTVGKLPRHRPLSRTQSSPLPQS
       :: .:::. . ... :..::  :  :.  .. . :. :  :.   : :::::.: ::: :
CCDS41 LQPILLLDPSGSHAPLLTVPGLGPLPFHFAQSLMTTERLSGS-GLHWPLSRTRSEPLPPS
       310       320       330       340        350       360      

          510       520       530       540          550           
pF1KA0 PQALQQLVMQQQHQQFLEKQKQQQLQLGKILTKTGELPRQ---PTTHPEETE--------
         :          :  ::. : . .:. :  .: .: ::    :...  ::.        
CCDS41 ATAPPP---PGPMQPRLEQLKTH-VQVIKRSAKPSEKPRLRQIPSAEDLETDGGGPGQVV
        370          380        390       400       410       420  

           560       570        580       590           600        
pF1KA0 EELTEQQEVLLGEGALTMPR-EGSTESESTQEDLEEEDEEDDGEEEE----DCIQVKDEE
       ..  :..:  ::.:   .:. .: .  ..  . :  :...  :.  .    : . .   .
CCDS41 DDGLEHRE--LGHG---QPEARGPAPLQQHPQVLLWEQQRLAGRLPRGSTGDTVLLPLAQ
            430            440       450       460       470       

      610                 620       630       640                  
pF1KA0 GE----SGAEEGP------DLEEPGAGYKKLFSDAQPLQPLQ-----VYQAPL-------
       :     : :. .:      .  ::..  . : :.  : . :      .:.. .       
CCDS41 GGHRPLSRAQSSPAAPASLSAPEPASQARVLSSSETPARTLPFTTGLIYDSVMLKHQCSC
       480       490       500       510       520       530       

         650       660         670                        680      
pF1KA0 -SLATVPHQALGRTQS--SPAAPGGMKSPPD------------QPV---KH--LFTTGPI
        . .  :..: :: ::  :     :..:  .            : :   .:  :. :.:.
CCDS41 GDNSRHPEHA-GRIQSIWSRLQERGLRSQCECLRGRKASLEELQSVHSERHVLLYGTNPL
       540        550       560       570       580       590      

                      690       700       710       720       730  
pF1KA0 S--------------QKMYAVLPCGGIGVDSDTVWNEMHSSSAVRMAVGCLLELAFKVAA
       :              :.:...:::::.:::.::.:::.:::.:.: :.: . .::::::.
CCDS41 SRLKLDNGKLAGLLAQRMFVMLPCGGVGVDTDTIWNELHSSNAARWAAGSVTDLAFKVAS
        600       610       620       630       640       650      

            740       750       760       770       780       790  
pF1KA0 GELKNGFAIIRPPGHHAEESTAMGFCFFNSVAITAKLLQQKLNVGKVLIVDWDIHHGNGT
        :::::::..:::::::..::::::::::::::. . :::. ...:.::::::.::::::
CCDS41 RELKNGFAVVRPPGHHADHSTAMGFCFFNSVAIACRQLQQQSKASKILIVDWDVHHGNGT
        660       670       680       690       700       710      

            800       810       820       830       840       850  
pF1KA0 QQAFYNDPSVLYISLHRYDNGNFFPGSGAPEEVGGGPGVGYNVNVAWTGGVDPPIGDVEY
       ::.::.:::::::::::.:.::::::::: .:::.: : :.::::::.::.:::.:: ::
CCDS41 QQTFYQDPSVLYISLHRHDDGNFFPGSGAVDEVGAGSGEGFNVNVAWAGGLDPPMGDPEY
        720       730       740       750       760       770      

            860       870       880       890       900       910  
pF1KA0 LTAFRTVVMPIAHEFSPDVVLVSAGFDAVEGHLSPLGGYSVTARCFGHLTRQLMTLAGGR
       :.::: ::::::.:::::.:::::::::.::: .::::: :.:.:::..:.:::.:::: 
CCDS41 LAAFRIVVMPIAREFSPDLVLVSAGFDAAEGHPAPLGGYHVSAKCFGYMTQQLMNLAGGA
        780       790       800       810       820       830      

            920       930       940       950       960       970  
pF1KA0 VVLALEGGHDLTAICDASEACVSALLSVELQPLDEAVLQQKPNINAVATLEKVIEIQSKH
       ::::::::::::::::::::::.:::. ...::.:   .::::.::. .:: ::...::.
CCDS41 VVLALEGGHDLTAICDASEACVAALLGNRVDPLSEEGWKQKPNLNAIRSLEAVIRVHSKY
        840       850       860       870       880       890      

            980       990      1000      1010      1020      1030  
pF1KA0 WSCVQKFAAGLGRSLREAQAGETEEAETVSAMALLSVGAEQAQAAAAREHSPRPAEEPME
       :.:.:..:.     . .. ... ::.:.:.:.: ::::    .         ::.:. .:
CCDS41 WGCMQRLASCPDSWVPRVPGADKEEVEAVTALASLSVGILAED---------RPSEQLVE
        900       910       920       930                940       

              
pF1KA0 QEPAL  
       .:  .  
CCDS41 EEEPMNL
       950    

>>CCDS47555.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7               (1011 aa)
 initn: 2429 init1: 1580 opt: 1585  Z-score: 887.2  bits: 175.7 E(32554): 4.3e-43
Smith-Waterman score: 3214; 54.3% identity (71.9% similar) in 1029 aa overlap (51-970:17-1005)

               30        40        50         60           70      
pF1KA0 PRTSLHSIPVTVEVKPVLPRAMPSSMGGGGGGSP-SPVELRGAL---VGSVDPTLREQQL
                                     :  : ::..::  :   .  :::..::.::
CCDS47               MHSMISSVDVKSEVPVGLEPISPLDLRTDLRMMMPVVDPVVREKQL
                             10        20        30        40      

         80        90       100       110       120       130      
pF1KA0 QQELLALKQQQQLQKQLLFAEFQKQHDHLTRQHEVQLQKHLKQQQEMLAAKQQQEMLAAK
       ::::: ..::::.:::::.:::::::..:::::..:::.:.:   :.:: :::::.:  .
CCDS47 QQELLLIQQQQQIQKQLLIAEFQKQHENLTRQHQAQLQEHIK---ELLAIKQQQELL--E
         50        60        70        80           90       100   

        140       150       160       170       180       190      
pF1KA0 RQQELEQQRQREQQRQEELEKQRLEQQLLILRNKEKSKESAIASTEVKLRLQEFLLSKS-
       ..:.::::::     ..:.:..: ::::  ::.:....: :.:::::: .::::::::: 
CCDS47 KEQKLEQQRQ-----EQEVERHRREQQLPPLRGKDRGRERAVASTEVKQKLQEFLLSKSA
             110            120       130       140       150      

          200       210         220       230       240       250  
pF1KA0 -KEPTPGGLNHSLPQHPKCW--GAHHASLDQSSPPQSGPPGTPPSYKLPLPGPYDSRDDF
        :.   .: :::. .::: :  .:::.:::::::: :   :: ::::  :::  :..:::
CCDS47 TKDTPTNGKNHSVSRHPKLWYTAAHHTSLDQSSPPLS---GTSPSYKYTLPGAQDAKDDF
        160       170       180       190          200       210   

            260       270       280       290       300       310  
pF1KA0 PLRKTASEPNLKVRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGTVISTFKKRAVEITGAGPGASSVCN
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::.:...::::  :.:      ::: .
CCDS47 PLRKTASEPNLKVRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGNVVTSFKKRMFEVT-----ESSVSS
           220       230       240       250       260             

            320        330       340         350       360         
pF1KA0 SAPGSGPSSPNSSHS-TIAENGFTGSVPNIP--TEMLPQHRALPLDSSPNQFSLYTSPSL
       :.:::::::::.. . ...::  :. .:  :   .:. :.: :  ..: : .::::::::
CCDS47 SSPGSGPSSPNNGPTGSVTENE-TSVLPPTPHAEQMVSQQRILIHEDSMNLLSLYTSPSL
      270       280       290        300       310       320       

     370       380       390       400       410       420         
pF1KA0 PNISLGLQATVTVTNSHLTASPKLSTQQEAERQALQSLRQGGTLTGKFMSTSSIPGCLLG
       :::.::: :.     :.:.:: .:. .:. : :   .::::  : :.. ..    .    
CCDS47 PNITLGLPAV----PSQLNASNSLKEKQKCETQ---TLRQGVPLPGQYGGSIPASSSHPH
       330           340       350          360       370       380

     430       440       450       460         470       480       
pF1KA0 VALEGDGSPHGHASLLQHVLLLEQARQQSTLIA--VPLHGQSPLVTGERVATSMRTVGKL
       :.:::     .: .::::.:: :: :::. :.:  :::: ::::.: ::.. ..: . ::
CCDS47 VTLEGKPPNSSHQALLQHLLLKEQMRQQKLLVAGGVPLHPQSPLATKERISPGIRGTHKL
              390       400       410       420       430       440

       490       500       510       520         530       540     
pF1KA0 PRHRPLSRTQSSPLPQSPQALQQLVMQQQHQQFLEKQKQ--QQLQLGKILTKTGELPRQP
       ::::::.::::.:::::  .: :::.:::::::::::::  ::....:.:.:. :  .::
CCDS47 PRHRPLNRTQSAPLPQS--TLAQLVIQQQHQQFLEKQKQYQQQIHMNKLLSKSIEQLKQP
              450         460       470       480       490        

         550       560       570       580       590       600     
pF1KA0 TTHPEETEEELTEQQEVLLGEGALTMPREGSTESESTQEDLEEEDEEDDGEEEEDCIQVK
        .: ::.::::        :. :.   :  :. ..::. :       ::   .   ..::
CCDS47 GSHLEEAEEELQ-------GDQAMQEDRAPSS-GNSTRSD--SSACVDDTLGQVGAVKVK
      500       510              520        530         540        

         610       620       630            640       650          
pF1KA0 DEEGESGAEEGPDLEEPGAGYKKLFSDAQPLQP-----LQVYQAPLSLATVP----HQAL
       .:  .:  .:  ...:  .: .  : .   :.:     :.: ::::. . .     :. .
CCDS47 EEPVDS--DEDAQIQEMESGEQAAFMQQPFLEPTHTRALSVRQAPLAAVGMDGLEKHRLV
      550         560       570       580       590       600      

        660          670                                           
pF1KA0 GRTQSSPAA---PGGMKSPPDQP------------VKH----------------------
       .::.:::::   :    . : ::            .::                      
CCDS47 SRTHSSPAASVLPHPAMDRPLQPGSATGIAYDPLMLKHQCVCGNSTTHPEHAGRIQSIWS
        610       620       630       640       650       660      

                                       680                     690 
pF1KA0 ----------------------------------LFTTGPI--------------SQKMY
                                         :. :.:.              :::..
CCDS47 RLQETGLLNKCERIQGRKASLEEIQLVHSEHHSLLYGTNPLDGQKLDPRILLGDDSQKFF
        670       680       690       700       710       720      

             700       710       720       730       740       750 
pF1KA0 AVLPCGGIGVDSDTVWNEMHSSSAVRMAVGCLLELAFKVAAGELKNGFAIIRPPGHHAEE
       . :::::.::::::.:::.:::.:.::::::..::: :::.::::::::..:::::::::
CCDS47 SSLPCGGLGVDSDTIWNELHSSGAARMAVGCVIELASKVASGELKNGFAVVRPPGHHAEE
        730       740       750       760       770       780      

             760       770       780       790       800       810 
pF1KA0 STAMGFCFFNSVAITAKLLQQKLNVGKVLIVDWDIHHGNGTQQAFYNDPSVLYISLHRYD
       ::::::::::::::::: :...::..:.:::: :.::::::::::: :::.:::::::::
CCDS47 STAMGFCFFNSVAITAKYLRDQLNISKILIVDLDVHHGNGTQQAFYADPSILYISLHRYD
        790       800       810       820       830       840      

             820       830       840       850       860       870 
pF1KA0 NGNFFPGSGAPEEVGGGPGVGYNVNVAWTGGVDPPIGDVEYLTAFRTVVMPIAHEFSPDV
       .::::::::::.::: : : :::.:.:::::.:::.:::::: ::::.: :.:.::.::.
CCDS47 EGNFFPGSGAPNEVGTGLGEGYNINIAWTGGLDPPMGDVEYLEAFRTIVKPVAKEFDPDM
        850       860       870       880       890       900      

             880       890       900       910       920       930 
pF1KA0 VLVSAGFDAVEGHLSPLGGYSVTARCFGHLTRQLMTLAGGRVVLALEGGHDLTAICDASE
       :::::::::.:::  :::::.:::.::::::.:::::: :::::::::::::::::::::
CCDS47 VLVSAGFDALEGHTPPLGGYKVTAKCFGHLTKQLMTLADGRVVLALEGGHDLTAICDASE
        910       920       930       940       950       960      

             940       950       960       970       980       990 
pF1KA0 ACVSALLSVELQPLDEAVLQQKPNINAVATLEKVIEIQSKHWSCVQKFAAGLGRSLREAQ
       :::.:::. ::.:: : .:.:.::.::: .:.:.:::::                     
CCDS47 ACVNALLGNELEPLAEDILHQSPNMNAVISLQKIIEIQSMSLKFS               
        970       980       990      1000      1010                

            1000      1010      1020      1030       
pF1KA0 AGETEEAETVSAMALLSVGAEQAQAAAAREHSPRPAEEPMEQEPAL

>>CCDS81685.1 HDAC7 gene_id:51564|Hs108|chr12             (974 aa)
 initn: 1965 init1: 1563 opt: 1569  Z-score: 878.6  bits: 174.1 E(32554): 1.3e-42
Smith-Waterman score: 1949; 40.1% identity (63.6% similar) in 995 aa overlap (123-1037:41-972)

            100       110       120       130       140       150  
pF1KA0 LLFAEFQKQHDHLTRQHEVQLQKHLKQQQEMLAAKQQQEMLAAKRQQELEQQRQREQQR-
                                     .:: .. :..        :.:::. : .: 
CCDS81 PCADTPGPQPQPMDLRVGQRPPVEPPPEPTLLALQRPQRLHHHLFLAGLQQQRSVEPMRL
               20        30        40        50        60        70

                  160       170       180       190       200      
pF1KA0 -----QEELEKQRLEQQLLILRNKEKSKESAIASTEVKLRLQEFLLSKSKEPTPGGLNHS
            . ::.    ::.:  : .:.:::.::.::. :: .: : .:.:..    ..:...
CCDS81 SMDTPMPELQVGPQEQELRQLLHKDKSKRSAVASSVVKQKLAEVILKKQQ----AALERT
               80        90       100       110       120          

        210       220       230       240        250       260     
pF1KA0 LPQHPKCWGAHHASLDQSSPPQSGPPGTPPSYKLPLPG-PYDSRDDFPLRKTASEPNLKV
       .  ::.  :  . .:.     ...  .   :.  :.:. : :  . ::::::.::::::.
CCDS81 V--HPNSPGIPYRTLEPLET-EGATRSMLSSFLPPVPSLPSDPPEHFPLRKTVSEPNLKL
          130       140        150       160       170       180   

         270       280       290       300       310       320     
pF1KA0 RSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGTVISTFKKRAVEITGAGPGASSVCNSAPGSGPSSPNSS
       : . :... :::..::::..  ..  ....: .:  : .  .::   :.:.:: ::::.:
CCDS81 RYKPKKSL-ERRKNPLLRKE--SAPPSLRRRPAETLGDSSPSSS---STPASGCSSPNDS
           190        200         210       220          230       

         330       340       350       360       370       380     
pF1KA0 HSTIAENGFTGSVPNIPTEMLPQHRALPLDSSPNQFSLYTSPSLPNISLGLQATVTVTNS
       .         :  : . .: :  .:    ..:   :.: :   :: :.::: :       
CCDS81 EH--------GPNPILGSEALLGQRLRLQETSVAPFALPTVSLLPAITLGLPA-------
               240       250       260       270       280         

         390       400       410       420       430        440    
pF1KA0 HLTASPKLSTQQEAERQALQSLRQGGTLTGKFMSTSSIPGCLLGVALEGDGS-PHGHASL
            :   .. ...:..  .:   : . :.  .   .:    :.  :. :. :    : 
CCDS81 -----P---ARADSDRRTHPTLGPRGPILGSPHTPLFLPH---GLEPEAGGTLP----SR
                    290       300       310          320           

          450       460       470       480       490       500    
pF1KA0 LQHVLLLEQARQQSTLIAVPLHGQSPLVTGERVATSMRTVGKLPRHRPLSRTQSSPLPQS
       :: .:::. . ... :..::  :  :.  .. . :. :  :.   : :::::.: ::: :
CCDS81 LQPILLLDPSGSHAPLLTVPGLGPLPFHFAQSLMTTERLSGS-GLHWPLSRTRSEPLPPS
       330       340       350       360        370       380      

          510       520       530       540          550           
pF1KA0 PQALQQLVMQQQHQQFLEKQKQQQLQLGKILTKTGELPRQ---PTTHPEETE--------
         :          :  :: : . ..:. :  .: .: ::    :...  ::.        
CCDS81 ATAPPP---PGPMQPRLE-QLKTHVQVIKRSAKPSEKPRLRQIPSAEDLETDGGGPGQVV
        390          400        410       420       430       440  

           560       570        580       590           600        
pF1KA0 EELTEQQEVLLGEGALTMPR-EGSTESESTQEDLEEEDEEDDGEEEE----DCIQVKDEE
       ..  :..:  ::.:   .:. .: .  ..  . :  :...  :.  .    : . .   .
CCDS81 DDGLEHRE--LGHG---QPEARGPAPLQQHPQVLLWEQQRLAGRLPRGSTGDTVLLPLAQ
            450            460       470       480       490       

      610                 620       630       640                  
pF1KA0 GE----SGAEEGP------DLEEPGAGYKKLFSDAQPLQPLQ-----VYQAPL-------
       :     : :. .:      .  ::..  . : :.  : . :      .:.. .       
CCDS81 GGHRPLSRAQSSPAAPASLSAPEPASQARVLSSSETPARTLPFTTGLIYDSVMLKHQCSC
       500       510       520       530       540       550       

         650       660         670                        680      
pF1KA0 -SLATVPHQALGRTQS--SPAAPGGMKSPPD------------QPV---KH--LFTTGPI
        . .  :..: :: ::  :     :..:  .            : :   .:  :. :.:.
CCDS81 GDNSRHPEHA-GRIQSIWSRLQERGLRSQCECLRGRKASLEELQSVHSERHVLLYGTNPL
       560        570       580       590       600       610      

                      690       700       710       720       730  
pF1KA0 S--------------QKMYAVLPCGGIGVDSDTVWNEMHSSSAVRMAVGCLLELAFKVAA
       :              :.:...:::::.:::.::.:::.:::.:.: :.: . .::::::.
CCDS81 SRLKLDNGKLAGLLAQRMFVMLPCGGVGVDTDTIWNELHSSNAARWAAGSVTDLAFKVAS
        620       630       640       650       660       670      

            740       750       760       770       780       790  
pF1KA0 GELKNGFAIIRPPGHHAEESTAMGFCFFNSVAITAKLLQQKLNVGKVLIVDWDIHHGNGT
        :::::::..:::::::..::::::::::::::. . :::. ...:.::::::.::::::
CCDS81 RELKNGFAVVRPPGHHADHSTAMGFCFFNSVAIACRQLQQQSKASKILIVDWDVHHGNGT
        680       690       700       710       720       730      

            800       810       820       830       840       850  
pF1KA0 QQAFYNDPSVLYISLHRYDNGNFFPGSGAPEEVGGGPGVGYNVNVAWTGGVDPPIGDVEY
       ::.::.:::::::::::.:.::::::::: .:::.: : :.::::::.::.:::.:: ::
CCDS81 QQTFYQDPSVLYISLHRHDDGNFFPGSGAVDEVGAGSGEGFNVNVAWAGGLDPPMGDPEY
        740       750       760       770       780       790      

            860       870       880       890       900       910  
pF1KA0 LTAFRTVVMPIAHEFSPDVVLVSAGFDAVEGHLSPLGGYSVTARCFGHLTRQLMTLAGGR
       :.::: ::::::.:::::.:::::::::.::: .::::: :.:.:::..:.:::.:::: 
CCDS81 LAAFRIVVMPIAREFSPDLVLVSAGFDAAEGHPAPLGGYHVSAKCFGYMTQQLMNLAGGA
        800       810       820       830       840       850      

            920       930       940       950       960       970  
pF1KA0 VVLALEGGHDLTAICDASEACVSALLSVELQPLDEAVLQQKPNINAVATLEKVIEIQSKH
       ::::::::::::::::::::::.:::. ...::.:   .::::.::. .:: ::...::.
CCDS81 VVLALEGGHDLTAICDASEACVAALLGNRVDPLSEEGWKQKPNLNAIRSLEAVIRVHSKY
        860       870       880       890       900       910      

            980       990      1000      1010      1020      1030  
pF1KA0 WSCVQKFAAGLGRSLREAQAGETEEAETVSAMALLSVGAEQAQAAAAREHSPRPAEEPME
       :.:.:..:.     . .. ... ::.:.:.:.: ::::    .         ::.:. .:
CCDS81 WGCMQRLASCPDSWVPRVPGADKEEVEAVTALASLSVGILAED---------RPSEQLVE
        920       930       940       950                960       

              
pF1KA0 QEPAL  
       .:  .  
CCDS81 EEEPMNL
       970    

>>CCDS8756.2 HDAC7 gene_id:51564|Hs108|chr12              (991 aa)
 initn: 1965 init1: 1563 opt: 1569  Z-score: 878.5  bits: 174.1 E(32554): 1.3e-42
Smith-Waterman score: 1949; 40.1% identity (63.6% similar) in 995 aa overlap (123-1037:58-989)

            100       110       120       130       140       150  
pF1KA0 LLFAEFQKQHDHLTRQHEVQLQKHLKQQQEMLAAKQQQEMLAAKRQQELEQQRQREQQR-
                                     .:: .. :..        :.:::. : .: 
CCDS87 PCADTPGPQPQPMDLRVGQRPPVEPPPEPTLLALQRPQRLHHHLFLAGLQQQRSVEPMRL
        30        40        50        60        70        80       

                  160       170       180       190       200      
pF1KA0 -----QEELEKQRLEQQLLILRNKEKSKESAIASTEVKLRLQEFLLSKSKEPTPGGLNHS
            . ::.    ::.:  : .:.:::.::.::. :: .: : .:.:..    ..:...
CCDS87 SMDTPMPELQVGPQEQELRQLLHKDKSKRSAVASSVVKQKLAEVILKKQQ----AALERT
        90       100       110       120       130           140   

        210       220       230       240        250       260     
pF1KA0 LPQHPKCWGAHHASLDQSSPPQSGPPGTPPSYKLPLPG-PYDSRDDFPLRKTASEPNLKV
       .  ::.  :  . .:.     ...  .   :.  :.:. : :  . ::::::.::::::.
CCDS87 V--HPNSPGIPYRTLEPLET-EGATRSMLSSFLPPVPSLPSDPPEHFPLRKTVSEPNLKL
             150       160        170       180       190       200

         270       280       290       300       310       320     
pF1KA0 RSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGTVISTFKKRAVEITGAGPGASSVCNSAPGSGPSSPNSS
       : . :... :::..::::..  ..  ....: .:  : .  .::   :.:.:: ::::.:
CCDS87 RYKPKKSL-ERRKNPLLRKE--SAPPSLRRRPAETLGDSSPSSS---STPASGCSSPNDS
               210         220       230       240          250    

         330       340       350       360       370       380     
pF1KA0 HSTIAENGFTGSVPNIPTEMLPQHRALPLDSSPNQFSLYTSPSLPNISLGLQATVTVTNS
       .         :  : . .: :  .:    ..:   :.: :   :: :.::: :       
CCDS87 EH--------GPNPILGSEALLGQRLRLQETSVAPFALPTVSLLPAITLGLPA-------
                  260       270       280       290                

         390       400       410       420       430        440    
pF1KA0 HLTASPKLSTQQEAERQALQSLRQGGTLTGKFMSTSSIPGCLLGVALEGDGS-PHGHASL
            :   .. ...:..  .:   : . :.  .   .:    :.  :. :. :    : 
CCDS87 -----P---ARADSDRRTHPTLGPRGPILGSPHTPLFLPH---GLEPEAGGTLP----SR
          300          310       320       330          340        

          450       460       470       480       490       500    
pF1KA0 LQHVLLLEQARQQSTLIAVPLHGQSPLVTGERVATSMRTVGKLPRHRPLSRTQSSPLPQS
       :: .:::. . ... :..::  :  :.  .. . :. :  :.   : :::::.: ::: :
CCDS87 LQPILLLDPSGSHAPLLTVPGLGPLPFHFAQSLMTTERLSGS-GLHWPLSRTRSEPLPPS
          350       360       370       380        390       400   

          510       520       530       540          550           
pF1KA0 PQALQQLVMQQQHQQFLEKQKQQQLQLGKILTKTGELPRQ---PTTHPEETE--------
         :          :  :: : . ..:. :  .: .: ::    :...  ::.        
CCDS87 ATAPPP---PGPMQPRLE-QLKTHVQVIKRSAKPSEKPRLRQIPSAEDLETDGGGPGQVV
              410        420       430       440       450         

           560       570        580       590           600        
pF1KA0 EELTEQQEVLLGEGALTMPR-EGSTESESTQEDLEEEDEEDDGEEEE----DCIQVKDEE
       ..  :..:  ::.:   .:. .: .  ..  . :  :...  :.  .    : . .   .
CCDS87 DDGLEHRE--LGHG---QPEARGPAPLQQHPQVLLWEQQRLAGRLPRGSTGDTVLLPLAQ
     460         470          480       490       500       510    

      610                 620       630       640                  
pF1KA0 GE----SGAEEGP------DLEEPGAGYKKLFSDAQPLQPLQ-----VYQAPL-------
       :     : :. .:      .  ::..  . : :.  : . :      .:.. .       
CCDS87 GGHRPLSRAQSSPAAPASLSAPEPASQARVLSSSETPARTLPFTTGLIYDSVMLKHQCSC
          520       530       540       550       560       570    

         650       660         670                        680      
pF1KA0 -SLATVPHQALGRTQS--SPAAPGGMKSPPD------------QPV---KH--LFTTGPI
        . .  :..: :: ::  :     :..:  .            : :   .:  :. :.:.
CCDS87 GDNSRHPEHA-GRIQSIWSRLQERGLRSQCECLRGRKASLEELQSVHSERHVLLYGTNPL
          580        590       600       610       620       630   

                      690       700       710       720       730  
pF1KA0 S--------------QKMYAVLPCGGIGVDSDTVWNEMHSSSAVRMAVGCLLELAFKVAA
       :              :.:...:::::.:::.::.:::.:::.:.: :.: . .::::::.
CCDS87 SRLKLDNGKLAGLLAQRMFVMLPCGGVGVDTDTIWNELHSSNAARWAAGSVTDLAFKVAS
           640       650       660       670       680       690   

            740       750       760       770       780       790  
pF1KA0 GELKNGFAIIRPPGHHAEESTAMGFCFFNSVAITAKLLQQKLNVGKVLIVDWDIHHGNGT
        :::::::..:::::::..::::::::::::::. . :::. ...:.::::::.::::::
CCDS87 RELKNGFAVVRPPGHHADHSTAMGFCFFNSVAIACRQLQQQSKASKILIVDWDVHHGNGT
           700       710       720       730       740       750   

            800       810       820       830       840       850  
pF1KA0 QQAFYNDPSVLYISLHRYDNGNFFPGSGAPEEVGGGPGVGYNVNVAWTGGVDPPIGDVEY
       ::.::.:::::::::::.:.::::::::: .:::.: : :.::::::.::.:::.:: ::
CCDS87 QQTFYQDPSVLYISLHRHDDGNFFPGSGAVDEVGAGSGEGFNVNVAWAGGLDPPMGDPEY
           760       770       780       790       800       810   

            860       870       880       890       900       910  
pF1KA0 LTAFRTVVMPIAHEFSPDVVLVSAGFDAVEGHLSPLGGYSVTARCFGHLTRQLMTLAGGR
       :.::: ::::::.:::::.:::::::::.::: .::::: :.:.:::..:.:::.:::: 
CCDS87 LAAFRIVVMPIAREFSPDLVLVSAGFDAAEGHPAPLGGYHVSAKCFGYMTQQLMNLAGGA
           820       830       840       850       860       870   

            920       930       940       950       960       970  
pF1KA0 VVLALEGGHDLTAICDASEACVSALLSVELQPLDEAVLQQKPNINAVATLEKVIEIQSKH
       ::::::::::::::::::::::.:::. ...::.:   .::::.::. .:: ::...::.
CCDS87 VVLALEGGHDLTAICDASEACVAALLGNRVDPLSEEGWKQKPNLNAIRSLEAVIRVHSKY
           880       890       900       910       920       930   

            980       990      1000      1010      1020      1030  
pF1KA0 WSCVQKFAAGLGRSLREAQAGETEEAETVSAMALLSVGAEQAQAAAAREHSPRPAEEPME
       :.:.:..:.     . .. ... ::.:.:.:.: ::::    .         ::.:. .:
CCDS87 WGCMQRLASCPDSWVPRVPGADKEEVEAVTALASLSVGILAED---------RPSEQLVE
           940       950       960       970                980    

              
pF1KA0 QEPAL  
       .:  .  
CCDS87 EEEPMNL
          990 




1037 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Fri Nov  4 00:49:14 2016 done: Fri Nov  4 00:49:15 2016
 Total Scan time:  4.990 Total Display time:  0.400

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com