seq1 = pF1KA0030.tfa, 2712 bp seq2 = pF1KA0030/gi568815595f_127499317.tfa (gi568815595f:127499317_127721770), 222454 bp >pF1KA0030 2712 >gi568815595f:127499317_127721770 (Chr3) 1-236 (99995-100231) 98% -> 237-412 (105292-105467) 100% -> 413-673 (105580-105840) 99% -> 674-893 (106802-107021) 100% -> 894-1101 (107294-107501) 100% -> 1102-1236 (109066-109200) 100% -> 1237-1428 (109516-109707) 100% -> 1429-1522 (116546-116639) 100% -> 1523-1773 (117552-117802) 100% -> 1774-1900 (117963-118089) 100% -> 1901-2013 (118653-118765) 100% -> 2014-2265 (119711-119962) 100% -> 2266-2448 (121382-121564) 100% -> 2449-2604 (121757-121912) 100% -> 2605-2712 (122347-122454) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGGC GGAATCATCGGAATCCTTCACCATGGCATCCAGCCCGGCCCAGC | ||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 99995 CTTGCAGGAATCATCGGAATCCTTCACCATGGCATCCAGCCCGGCCCAGC 50 . : . : . : . : . : 50 GTCGGCGAGGCAATGATCCTCTCACCTCCAGCCCTGGCCGAAGCTCCCGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100045 GTCGGCGAGGCAATGATCCTCTCACCTCCAGCCCTGGCCGAAGCTCCCGG 100 . : . : . : . : . : 100 CGTACTGATGCCCTCACCTCCAGCCCTGGCCGTGACCTTCCACCATTTGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100095 CGTACTGATGCCCTCACCTCCAGCCCTGGCCGTGACCTTCCACCATTTGA 150 . : . : . : . : . : 150 GGATGAGTCCGAGGGGCTCCTAGGCACAGAGGGGCCCCTGGAGGAAGAAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100145 GGATGAGTCCGAGGGGCTCCTAGGCACAGAGGGGCCCCTGGAGGAAGAAG 200 . : . : . : . : . : 200 AGGATGGAGAGGAGCTCATTGGAGATGGCATGGAAAG GGAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||| 100195 AGGATGGAGAGGAGCTCATTGGAGATGGCATGGAAAGGTA...CAGGGAC 250 . : . : . : . : . : 241 TACCGCGCCATCCCAGAGCTGGACGCCTATGAGGCCGAGGGACTGGCTCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105296 TACCGCGCCATCCCAGAGCTGGACGCCTATGAGGCCGAGGGACTGGCTCT 300 . : . : . : . : . : 291 GGATGATGAGGACGTAGAGGAGCTGACGGCCAGTCAGAGGGAGGCAGCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105346 GGATGATGAGGACGTAGAGGAGCTGACGGCCAGTCAGAGGGAGGCAGCAG 350 . : . : . : . : . : 341 AGCGGGCCATGCGGCAGCGTGACCGGGAGGCTGGCCGGGGCCTGGGCCGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105396 AGCGGGCCATGCGGCAGCGTGACCGGGAGGCTGGCCGGGGCCTGGGCCGC 400 . : . : . : . : . : 391 ATGCGCCGTGGGCTCCTGTATG ACAGCGATGAGGAGGACGA ||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||| 105446 ATGCGCCGTGGGCTCCTGTATGGTA...CAGACAGCGATGAGGAGGACGA 450 . : . : . : . : . : 432 GGAGCGCCCTGCCCGCAAGCGCCGCCAGGTGGAGCGGGCCACGGAGGACG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105599 GGAGCGCCCTGCCCGCAAGCGCCGCCAGGTGGAGCGGGCCACGGAGGACG 500 . : . : . : . : . : 482 GCGAGGAGGACGAGGAGATGATTGAGAGCATCGAGAACCTGGAGGATCTC |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| 105649 GCGAGGAGGACGAGGAGATGATCGAGAGCATCGAGAACCTGGAGGATCTC 550 . : . : . : . : . : 532 AAAGGCCACTCTGTGCGCGAGTGGGTGAGCATGGCGGGCCCCCGGCTGGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105699 AAAGGCCACTCTGTGCGCGAGTGGGTGAGCATGGCGGGCCCCCGGCTGGA 600 . : . : . : . : . : 582 GATCCACCACCGCTTCAAGAACTTCCTGCGCACTCACGTCGACAGCCACG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 105749 GATCCACCACCGCTTCAAGAACTTCCTGCGCACTCACGTCGACAGCCACG 650 . : . : . : . : . : 632 GCCACAACGTCTTCAAGGAGCGCATCAGCGACATGTGCAAAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>> 105799 GCCACAACGTCTTCAAGGAGCGCATCAGCGACATGTGCAAAGGTG...TA 700 . : . : . : . : . : 674 AGAACCGTGAGAGCCTGGTGGTGAACTATGAGGACTTGGCAGCCAGGGA >||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 106801 GAGAACCGTGAGAGCCTGGTGGTGAACTATGAGGACTTGGCAGCCAGGGA 750 . : . : . : . : . : 723 GCACGTGCTGGCCTACTTCCTGCCTGAGGCACCGGCGGAGCTGCTGCAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 106851 GCACGTGCTGGCCTACTTCCTGCCTGAGGCACCGGCGGAGCTGCTGCAGA 800 . : . : . : . : . : 773 TCTTTGATGAGGCTGCCCTGGAGGTGGTACTGGCCATGTACCCCAAGTAC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 106901 TCTTTGATGAGGCTGCCCTGGAGGTGGTACTGGCCATGTACCCCAAGTAC 850 . : . : . : . : . : 823 GACCGCATCACCAACCACATCCATGTCCGCATCTCCCACCTGCCTCTGGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 106951 GACCGCATCACCAACCACATCCATGTCCGCATCTCCCACCTGCCTCTGGT 900 . : . : . : . : . : 873 GGAGGAGCTGCGCTCGCTGAG GCAGCTGCATCTGAACCAGC |||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||| 107001 GGAGGAGCTGCGCTCGCTGAGGTG...CAGGCAGCTGCATCTGAACCAGC 950 . : . : . : . : . : 914 TGATCCGCACCAGTGGGGTGGTGACCAGCTGCACTGGCGTCCTGCCCCAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107314 TGATCCGCACCAGTGGGGTGGTGACCAGCTGCACTGGCGTCCTGCCCCAG 1000 . : . : . : . : . : 964 CTCAGCATGGTCAAGTACAACTGCAACAAGTGCAATTTCGTCCTGGGTCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107364 CTCAGCATGGTCAAGTACAACTGCAACAAGTGCAATTTCGTCCTGGGTCC 1050 . : . : . : . : . : 1014 TTTCTGCCAGTCCCAGAACCAGGAGGTGAAACCAGGCTCCTGTCCTGAGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 107414 TTTCTGCCAGTCCCAGAACCAGGAGGTGAAACCAGGCTCCTGTCCTGAGT 1100 . : . : . : . : . : 1064 GCCAGTCGGCCGGCCCCTTTGAGGTCAACATGGAGGAG ACC ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||| 107464 GCCAGTCGGCCGGCCCCTTTGAGGTCAACATGGAGGAGGTG...CAGACC 1150 . : . : . : . : . : 1105 ATCTATCAGAACTACCAGCGTATCCGAATCCAGGAGAGTCCAGGCAAAGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 109069 ATCTATCAGAACTACCAGCGTATCCGAATCCAGGAGAGTCCAGGCAAAGT 1200 . : . : . : . : . : 1155 GGCGGCTGGCCGGCTGCCCCGCTCCAAGGACGCCATTCTCCTCGCAGATC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 109119 GGCGGCTGGCCGGCTGCCCCGCTCCAAGGACGCCATTCTCCTCGCAGATC 1250 . : . : . : . : . : 1205 TGGTGGACAGCTGCAAGCCAGGAGACGAGATA GAGCTGACT ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||| 109169 TGGTGGACAGCTGCAAGCCAGGAGACGAGATAGTA...CAGGAGCTGACT 1300 . : . : . : . : . : 1246 GGCATCTATCACAACAACTATGATGGCTCCCTCAACACTGCCAATGGCTT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 109525 GGCATCTATCACAACAACTATGATGGCTCCCTCAACACTGCCAATGGCTT 1350 . : . : . : . : . : 1296 CCCTGTCTTTGCCACTGTCATCCTAGCCAACCACGTGGCCAAGAAGGACA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 109575 CCCTGTCTTTGCCACTGTCATCCTAGCCAACCACGTGGCCAAGAAGGACA 1400 . : . : . : . : . : 1346 ACAAGGTTGCTGTAGGGGAACTGACCGATGAAGATGTGAAGATGATCACT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 109625 ACAAGGTTGCTGTAGGGGAACTGACCGATGAAGATGTGAAGATGATCACT 1450 . : . : . : . : . : 1396 AGCCTCTCCAAGGATCAGCAGATCGGAGAGAAG ATCTTTGC |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||| 109675 AGCCTCTCCAAGGATCAGCAGATCGGAGAGAAGGTA...CAGATCTTTGC 1500 . : . : . : . : . : 1437 CAGCATTGCTCCTTCCATCTATGGTCATGAAGACATCAAGAGAGGCCTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116554 CAGCATTGCTCCTTCCATCTATGGTCATGAAGACATCAAGAGAGGCCTGG 1550 . : . : . : . : . : 1487 CTCTGGCCCTGTTCGGAGGGGAGCCCAAAAACCCAG GTGGC ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||| 116604 CTCTGGCCCTGTTCGGAGGGGAGCCCAAAAACCCAGGTG...CAGGTGGC 1600 . : . : . : . : . : 1528 AAGCACAAGGTACGTGGTGATATCAACGTGCTCTTGTGCGGAGACCCTGG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 117557 AAGCACAAGGTACGTGGTGATATCAACGTGCTCTTGTGCGGAGACCCTGG 1650 . : . : . : . : . : 1578 CACAGCGAAGTCGCAGTTTCTCAAGTATATTGAGAAAGTGTCCAGCCGAG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 117607 CACAGCGAAGTCGCAGTTTCTCAAGTATATTGAGAAAGTGTCCAGCCGAG 1700 . : . : . : . : . : 1628 CCATCTTCACCACTGGCCAGGGGGCGTCGGCTGTGGGCCTCACGGCGTAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 117657 CCATCTTCACCACTGGCCAGGGGGCGTCGGCTGTGGGCCTCACGGCGTAT 1750 . : . : . : . : . : 1678 GTCCAGCGGCACCCTGTCAGCAGGGAGTGGACCTTGGAGGCTGGGGCCCT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 117707 GTCCAGCGGCACCCTGTCAGCAGGGAGTGGACCTTGGAGGCTGGGGCCCT 1800 . : . : . : . : . : 1728 GGTTCTGGCTGACCGAGGAGTGTGTCTCATTGATGAATTTGACAAG ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>. 117757 GGTTCTGGCTGACCGAGGAGTGTGTCTCATTGATGAATTTGACAAGGTG. 1850 . : . : . : . : . : 1774 ATGAATGACCAGGACAGAACCAGCATCCATGAGGCCATGGAGCAA ..>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 117807 ..CAGATGAATGACCAGGACAGAACCAGCATCCATGAGGCCATGGAGCAA 1900 . : . : . : . : . : 1819 CAGAGCATCTCCATCTCGAAGGCTGGCATCGTCACCTCCCTGCAGGCTCG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 118008 CAGAGCATCTCCATCTCGAAGGCTGGCATCGTCACCTCCCTGCAGGCTCG 1950 . : . : . : . : . : 1869 CTGCACGGTCATTGCTGCCGCCAACCCCATAG GAGGGCGCT ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||| 118058 CTGCACGGTCATTGCTGCCGCCAACCCCATAGGTG...CAGGAGGGCGCT 2000 . : . : . : . : . : 1910 ACGACCCCTCGCTGACTTTCTCTGAGAACGTGGACCTCACAGAGCCCATC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 118662 ACGACCCCTCGCTGACTTTCTCTGAGAACGTGGACCTCACAGAGCCCATC 2050 . : . : . : . : . : 1960 ATCTCACGCTTTGACATCCTGTGTGTGGTGAGGGACACCGTGGACCCAGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 118712 ATCTCACGCTTTGACATCCTGTGTGTGGTGAGGGACACCGTGGACCCAGT 2100 . : . : . : . : . : 2010 CCAG GACGAGATGCTGGCCCGCTTCGTGGTGGGCAGCCACG ||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 118762 CCAGGTA...TAGGACGAGATGCTGGCCCGCTTCGTGGTGGGCAGCCACG 2150 . : . : . : . : . : 2051 TCAGACACCACCCCAGCAACAAGGAGGAGGAGGGGCTGGCCAATGGCAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 119748 TCAGACACCACCCCAGCAACAAGGAGGAGGAGGGGCTGGCCAATGGCAGC 2200 . : . : . : . : . : 2101 GCTGCTGAGCCCGCCATGCCCAACACGTATGGCGTGGAGCCCCTGCCCCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 119798 GCTGCTGAGCCCGCCATGCCCAACACGTATGGCGTGGAGCCCCTGCCCCA 2250 . : . : . : . : . : 2151 GGAGGTCCTGAAGAAGTACATCATCTACGCCAAGGAGAGGGTCCACCCGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 119848 GGAGGTCCTGAAGAAGTACATCATCTACGCCAAGGAGAGGGTCCACCCGA 2300 . : . : . : . : . : 2201 AGCTCAACCAGATGGACCAGGACAAGGTGGCCAAGATGTACAGTGACCTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 119898 AGCTCAACCAGATGGACCAGGACAAGGTGGCCAAGATGTACAGTGACCTG 2350 . : . : . : . : . : 2251 AGGAAAGAATCTATG GCGACAGGCAGCATCCCCATTACGGT |||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||| 119948 AGGAAAGAATCTATGGTG...CAGGCGACAGGCAGCATCCCCATTACGGT 2400 . : . : . : . : . : 2292 GCGGCACATCGAGTCCATGATCCGCATGGCGGAGGCCCACGCGCGCATCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 121408 GCGGCACATCGAGTCCATGATCCGCATGGCGGAGGCCCACGCGCGCATCC 2450 . : . : . : . : . : 2342 ATCTGCGGGACTATGTGATCGAAGACGACGTCAACATGGCCATCCGCGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 121458 ATCTGCGGGACTATGTGATCGAAGACGACGTCAACATGGCCATCCGCGTG 2500 . : . : . : . : . : 2392 ATGCTGGAGAGCTTCATAGACACACAGAAGTTCAGCGTCATGCGCAGCAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 121508 ATGCTGGAGAGCTTCATAGACACACAGAAGTTCAGCGTCATGCGCAGCAT 2550 . : . : . : . : . : 2442 GCGCAAG ACTTTTGCCCGCTACCTTTCATTCCGGCGTGACA |||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||| 121558 GCGCAAGGTG...CAGACTTTTGCCCGCTACCTTTCATTCCGGCGTGACA 2600 . : . : . : . : . : 2483 ACAATGAGCTGTTGCTCTTCATACTGAAGCAGTTAGTGGCAGAGCAGGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 121791 ACAATGAGCTGTTGCTCTTCATACTGAAGCAGTTAGTGGCAGAGCAGGTG 2650 . : . : . : . : . : 2533 ACATATCAGCGCAACCGCTTTGGGGCCCAGCAGGACACTATTGAGGTCCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 121841 ACATATCAGCGCAACCGCTTTGGGGCCCAGCAGGACACTATTGAGGTCCC 2700 . : . : . : . : . : 2583 TGAGAAGGACTTGGTGGATAAG GCTCGTCAGATCAACATCC ||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||| 121891 TGAGAAGGACTTGGTGGATAAGGTA...CAGGCTCGTCAGATCAACATCC 2750 . : . : . : . : . : 2624 ACAACCTCTCTGCATTTTATGACAGTGAGCTCTTCAGGATGAACAAGTTC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 122366 ACAACCTCTCTGCATTTTATGACAGTGAGCTCTTCAGGATGAACAAGTTC 2800 . : . : . : . 2674 AGCCACGACCTGAAAAGGAAAATGATCCTGCAGCAGTTC ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 122416 AGCCACGACCTGAAAAGGAAAATGATCCTGCAGCAGTTC