Result of FASTA (ccds) for pF1KB9517
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9517, 565 aa
  1>>>pF1KB9517 565 - 565 aa - 565 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.2621+/-0.000833; mu= 8.1971+/- 0.051
 mean_var=203.1151+/-39.725, 0's: 0 Z-trim(115.2): 101  B-trim: 0 in 0/54
 Lambda= 0.089992
 statistics sampled from 15666 (15767) to 15666 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.782), E-opt: 0.2 (0.484), width:  16
 Scan time:  4.100

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS7845.1 PTPN5 gene_id:84867|Hs108|chr11         ( 565) 3918 521.0 1.5e-147
CCDS60746.1 PTPN5 gene_id:84867|Hs108|chr11        ( 541) 3758 500.2 2.7e-141
CCDS41626.1 PTPN5 gene_id:84867|Hs108|chr11        ( 533) 3015 403.7 2.9e-112
CCDS44945.1 PTPRR gene_id:5801|Hs108|chr12         ( 412) 1362 189.0 9.6e-48
CCDS55847.1 PTPRR gene_id:5801|Hs108|chr12         ( 451) 1362 189.0   1e-47
CCDS55848.1 PTPRR gene_id:5801|Hs108|chr12         ( 545) 1362 189.1 1.2e-47
CCDS8998.1 PTPRR gene_id:5801|Hs108|chr12          ( 657) 1362 189.2 1.4e-47
CCDS1422.1 PTPN7 gene_id:5778|Hs108|chr1           ( 399) 1137 159.8 5.8e-39
CCDS1423.2 PTPN7 gene_id:5778|Hs108|chr1           ( 465) 1134 159.5 8.5e-39
CCDS75517.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6          (1439)  648 96.8 1.9e-19
CCDS5137.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6           (1440)  648 96.8 1.9e-19
CCDS42874.1 PTPRT gene_id:11122|Hs108|chr20        (1441)  645 96.4 2.6e-19
CCDS68127.1 PTPRT gene_id:11122|Hs108|chr20        (1460)  645 96.4 2.6e-19
CCDS78179.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6          (1462)  629 94.3 1.1e-18
CCDS47473.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6          (1446)  626 93.9 1.4e-18
CCDS11840.1 PTPRM gene_id:5797|Hs108|chr18         (1452)  621 93.3 2.2e-18
CCDS58613.1 PTPRM gene_id:5797|Hs108|chr18         (1465)  621 93.3 2.2e-18
CCDS75813.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9          (1496)  602 90.8 1.3e-17
CCDS55288.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9          (1502)  602 90.8 1.3e-17
CCDS55289.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9          (1505)  602 90.8 1.3e-17
CCDS6472.2 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9           (1505)  602 90.8 1.3e-17
CCDS55290.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9          (1506)  602 90.8 1.3e-17
CCDS43786.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9          (1912)  602 90.9 1.5e-17
CCDS12139.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19         (1501)  599 90.4 1.7e-17
CCDS74265.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19         (1505)  599 90.4 1.7e-17
CCDS12140.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19         (1910)  599 90.5   2e-17
CCDS45930.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19         (1948)  599 90.5   2e-17
CCDS53754.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12         ( 377)  578 87.2 3.9e-17
CCDS44837.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12         ( 405)  578 87.2 4.1e-17
CCDS490.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1            (1898)  588 89.1 5.3e-17
CCDS489.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1            (1907)  588 89.1 5.3e-17
CCDS8674.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12          (1188)  578 87.6 9.2e-17
CCDS8675.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12          (1216)  578 87.6 9.4e-17
CCDS13039.1 PTPRA gene_id:5786|Hs108|chr20         ( 793)  573 86.8 1.1e-16
CCDS13038.1 PTPRA gene_id:5786|Hs108|chr20         ( 802)  573 86.8 1.1e-16
CCDS1398.2 PTPRC gene_id:5788|Hs108|chr1           (1145)  563 85.7 3.5e-16
CCDS1397.2 PTPRC gene_id:5788|Hs108|chr1           (1306)  563 85.7 3.8e-16
CCDS7945.1 PTPRJ gene_id:5795|Hs108|chr11          (1337)  558 85.1 6.1e-16
CCDS335.1 PTPRU gene_id:10076|Hs108|chr1           (1436)  557 85.0   7e-16
CCDS334.1 PTPRU gene_id:10076|Hs108|chr1           (1446)  557 85.0   7e-16
CCDS53290.1 PTPRU gene_id:10076|Hs108|chr1         (1433)  555 84.7 8.4e-16
CCDS5592.1 PTPN12 gene_id:5782|Hs108|chr7          ( 780)  549 83.7 9.1e-16
CCDS7658.1 PTPRE gene_id:5791|Hs108|chr10          ( 642)  547 83.4 9.5e-16
CCDS7657.1 PTPRE gene_id:5791|Hs108|chr10          ( 700)  547 83.4   1e-15
CCDS73501.1 PTPRQ gene_id:374462|Hs108|chr12       (2299)  554 84.7 1.3e-15
CCDS863.1 PTPN22 gene_id:26191|Hs108|chr1          ( 807)  543 82.9 1.6e-15
CCDS44098.2 PTPRU gene_id:10076|Hs108|chr1         (1440)  537 82.4 4.2e-15
CCDS55845.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12         (1907)  538 82.6 4.8e-15
CCDS55846.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12         (1907)  538 82.6 4.8e-15
CCDS44944.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12         (1997)  538 82.6   5e-15


>>CCDS7845.1 PTPN5 gene_id:84867|Hs108|chr11              (565 aa)
 initn: 3918 init1: 3918 opt: 3918  Z-score: 2762.3  bits: 521.0 E(32554): 1.5e-147
Smith-Waterman score: 3918; 100.0% identity (100.0% similar) in 565 aa overlap (1-565:1-565)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MNYEGARSERENHAADDSEGGALDMCCSERLPGLPQPIVMEALDEAEGLQDSQREMPPPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MNYEGARSERENHAADDSEGGALDMCCSERLPGLPQPIVMEALDEAEGLQDSQREMPPPP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 PPSPPSDPAQKPPPRGAGSHSLTVRSSLCLFAASQFLLACGVLWFSGYGHIWSQNATNLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 PPSPPSDPAQKPPPRGAGSHSLTVRSSLCLFAASQFLLACGVLWFSGYGHIWSQNATNLV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 SSLLTLLKQLEPTAWLDSGTWGVPSLLLVFLSVGLVLVTTLVWHLLRTPPEPPTPLPPED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 SSLLTLLKQLEPTAWLDSGTWGVPSLLLVFLSVGLVLVTTLVWHLLRTPPEPPTPLPPED
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 RRQSVSRQPSFTYSEWMEEKIEDDFLDLDPVPETPVFDCVMDIKPEADPTSLTVKSMGLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 RRQSVSRQPSFTYSEWMEEKIEDDFLDLDPVPETPVFDCVMDIKPEADPTSLTVKSMGLQ
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 ERRGSNVSLTLDMCTPGCNEEGFGYLMSPREESAREYLLSASRVLQAEELHEKALDPFLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 ERRGSNVSLTLDMCTPGCNEEGFGYLMSPREESAREYLLSASRVLQAEELHEKALDPFLL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 QAEFFEIPMNFVDPKEYDIPGLVRKNRYKTILPNPHSRVCLTSPDPDDPLSSYINANYIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 QAEFFEIPMNFVDPKEYDIPGLVRKNRYKTILPNPHSRVCLTSPDPDDPLSSYINANYIR
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 GYGGEEKVYIATQGPIVSTVADFWRMVWQEHTPIIVMITNIEEMNEKCTEYWPEEQVAYD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 GYGGEEKVYIATQGPIVSTVADFWRMVWQEHTPIIVMITNIEEMNEKCTEYWPEEQVAYD
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 GVEITVQKVIHTEDYRLRLISLKSGTEERGLKHYWFTSWPDQKTPDRAPPLLHLVREVEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 GVEITVQKVIHTEDYRLRLISLKSGTEERGLKHYWFTSWPDQKTPDRAPPLLHLVREVEE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB9 AAQQEGPHCAPIIVHCSAGIGRTGCFIATSICCQQLRQEGVVDILKTTCQLRQDRGGMIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 AAQQEGPHCAPIIVHCSAGIGRTGCFIATSICCQQLRQEGVVDILKTTCQLRQDRGGMIQ
              490       500       510       520       530       540

              550       560     
pF1KB9 TCEQYQFVHHVMSLYEKQLSHQSPE
       :::::::::::::::::::::::::
CCDS78 TCEQYQFVHHVMSLYEKQLSHQSPE
              550       560     

>>CCDS60746.1 PTPN5 gene_id:84867|Hs108|chr11             (541 aa)
 initn: 3758 init1: 3758 opt: 3758  Z-score: 2650.3  bits: 500.2 E(32554): 2.7e-141
Smith-Waterman score: 3758; 100.0% identity (100.0% similar) in 541 aa overlap (25-565:1-541)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MNYEGARSERENHAADDSEGGALDMCCSERLPGLPQPIVMEALDEAEGLQDSQREMPPPP
                               ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60                         MCCSERLPGLPQPIVMEALDEAEGLQDSQREMPPPP
                                       10        20        30      

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 PPSPPSDPAQKPPPRGAGSHSLTVRSSLCLFAASQFLLACGVLWFSGYGHIWSQNATNLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 PPSPPSDPAQKPPPRGAGSHSLTVRSSLCLFAASQFLLACGVLWFSGYGHIWSQNATNLV
         40        50        60        70        80        90      

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 SSLLTLLKQLEPTAWLDSGTWGVPSLLLVFLSVGLVLVTTLVWHLLRTPPEPPTPLPPED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SSLLTLLKQLEPTAWLDSGTWGVPSLLLVFLSVGLVLVTTLVWHLLRTPPEPPTPLPPED
        100       110       120       130       140       150      

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 RRQSVSRQPSFTYSEWMEEKIEDDFLDLDPVPETPVFDCVMDIKPEADPTSLTVKSMGLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 RRQSVSRQPSFTYSEWMEEKIEDDFLDLDPVPETPVFDCVMDIKPEADPTSLTVKSMGLQ
        160       170       180       190       200       210      

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 ERRGSNVSLTLDMCTPGCNEEGFGYLMSPREESAREYLLSASRVLQAEELHEKALDPFLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 ERRGSNVSLTLDMCTPGCNEEGFGYLMSPREESAREYLLSASRVLQAEELHEKALDPFLL
        220       230       240       250       260       270      

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 QAEFFEIPMNFVDPKEYDIPGLVRKNRYKTILPNPHSRVCLTSPDPDDPLSSYINANYIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 QAEFFEIPMNFVDPKEYDIPGLVRKNRYKTILPNPHSRVCLTSPDPDDPLSSYINANYIR
        280       290       300       310       320       330      

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 GYGGEEKVYIATQGPIVSTVADFWRMVWQEHTPIIVMITNIEEMNEKCTEYWPEEQVAYD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 GYGGEEKVYIATQGPIVSTVADFWRMVWQEHTPIIVMITNIEEMNEKCTEYWPEEQVAYD
        340       350       360       370       380       390      

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 GVEITVQKVIHTEDYRLRLISLKSGTEERGLKHYWFTSWPDQKTPDRAPPLLHLVREVEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 GVEITVQKVIHTEDYRLRLISLKSGTEERGLKHYWFTSWPDQKTPDRAPPLLHLVREVEE
        400       410       420       430       440       450      

              490       500       510       520       530       540
pF1KB9 AAQQEGPHCAPIIVHCSAGIGRTGCFIATSICCQQLRQEGVVDILKTTCQLRQDRGGMIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 AAQQEGPHCAPIIVHCSAGIGRTGCFIATSICCQQLRQEGVVDILKTTCQLRQDRGGMIQ
        460       470       480       490       500       510      

              550       560     
pF1KB9 TCEQYQFVHHVMSLYEKQLSHQSPE
       :::::::::::::::::::::::::
CCDS60 TCEQYQFVHHVMSLYEKQLSHQSPE
        520       530       540 

>>CCDS41626.1 PTPN5 gene_id:84867|Hs108|chr11             (533 aa)
 initn: 3015 init1: 3015 opt: 3015  Z-score: 2129.0  bits: 403.7 E(32554): 2.9e-112
Smith-Waterman score: 3627; 94.3% identity (94.3% similar) in 565 aa overlap (1-565:1-533)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MNYEGARSERENHAADDSEGGALDMCCSERLPGLPQPIVMEALDEAEGLQDSQREMPPPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MNYEGARSERENHAADDSEGGALDMCCSERLPGLPQPIVMEALDEAEGLQDSQREMPPPP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 PPSPPSDPAQKPPPRGAGSHSLTVRSSLCLFAASQFLLACGVLWFSGYGHIWSQNATNLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::                      
CCDS41 PPSPPSDPAQKPPPRGAGSHSLTVRSSLCLFAASQFLL----------------------
               70        80        90                              

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 SSLLTLLKQLEPTAWLDSGTWGVPSLLLVFLSVGLVLVTTLVWHLLRTPPEPPTPLPPED
                 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ----------EPTAWLDSGTWGVPSLLLVFLSVGLVLVTTLVWHLLRTPPEPPTPLPPED
                100       110       120       130       140        

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 RRQSVSRQPSFTYSEWMEEKIEDDFLDLDPVPETPVFDCVMDIKPEADPTSLTVKSMGLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RRQSVSRQPSFTYSEWMEEKIEDDFLDLDPVPETPVFDCVMDIKPEADPTSLTVKSMGLQ
      150       160       170       180       190       200        

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 ERRGSNVSLTLDMCTPGCNEEGFGYLMSPREESAREYLLSASRVLQAEELHEKALDPFLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ERRGSNVSLTLDMCTPGCNEEGFGYLMSPREESAREYLLSASRVLQAEELHEKALDPFLL
      210       220       230       240       250       260        

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 QAEFFEIPMNFVDPKEYDIPGLVRKNRYKTILPNPHSRVCLTSPDPDDPLSSYINANYIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QAEFFEIPMNFVDPKEYDIPGLVRKNRYKTILPNPHSRVCLTSPDPDDPLSSYINANYIR
      270       280       290       300       310       320        

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 GYGGEEKVYIATQGPIVSTVADFWRMVWQEHTPIIVMITNIEEMNEKCTEYWPEEQVAYD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GYGGEEKVYIATQGPIVSTVADFWRMVWQEHTPIIVMITNIEEMNEKCTEYWPEEQVAYD
      330       340       350       360       370       380        

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 GVEITVQKVIHTEDYRLRLISLKSGTEERGLKHYWFTSWPDQKTPDRAPPLLHLVREVEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GVEITVQKVIHTEDYRLRLISLKSGTEERGLKHYWFTSWPDQKTPDRAPPLLHLVREVEE
      390       400       410       420       430       440        

              490       500       510       520       530       540
pF1KB9 AAQQEGPHCAPIIVHCSAGIGRTGCFIATSICCQQLRQEGVVDILKTTCQLRQDRGGMIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 AAQQEGPHCAPIIVHCSAGIGRTGCFIATSICCQQLRQEGVVDILKTTCQLRQDRGGMIQ
      450       460       470       480       490       500        

              550       560     
pF1KB9 TCEQYQFVHHVMSLYEKQLSHQSPE
       :::::::::::::::::::::::::
CCDS41 TCEQYQFVHHVMSLYEKQLSHQSPE
      510       520       530   

>>CCDS44945.1 PTPRR gene_id:5801|Hs108|chr12              (412 aa)
 initn: 1316 init1: 870 opt: 1362  Z-score: 970.7  bits: 189.0 E(32554): 9.6e-48
Smith-Waterman score: 1362; 60.1% identity (80.2% similar) in 338 aa overlap (229-563:78-410)

      200       210       220       230       240       250        
pF1KB9 EKIEDDFLDLDPVPETPVFDCVMDIKPEADPTSLTVKSMGLQERRGSNVSLTLDMCTPGC
                                     :. . .: .:::::::::::::::: . : 
CCDS44 EQAPKVLNVVVDPQGRGAPEIKATTATSVCPSPFKMKPIGLQERRGSNVSLTLDMSSLG-
        50        60        70        80        90       100       

      260       270       280       290       300       310        
pF1KB9 NEEGFGYLMSPREESAREYLLSASRVLQAEELHEKALDPFLLQAEFFEIPMNFVDPKEYD
       : : :  . .:::. : ::: ::::.:   .:.. . .  :::.::.::::::::::: :
CCDS44 NIEPFVSIPTPREKVAMEYLQSASRILTRSQLRDVVASSHLLQSEFMEIPMNFVDPKEID
        110       120       130       140       150       160      

      320       330       340       350       360       370        
pF1KB9 IPGLVRKNRYKTILPNPHSRVCLTSPDPDDPLSSYINANYIRGYGGEEKVYIATQGPIVS
       ::    ::::::::::: :::::   .  : ::.::::::::::.:.::..::::::...
CCDS44 IPRHGTKNRYKTILPNPLSRVCLRPKNVTDSLSTYINANYIRGYSGKEKAFIATQGPMIN
        170       180       190       200       210       220      

      380       390       400       410       420       430        
pF1KB9 TVADFWRMVWQEHTPIIVMITNIEEMNEKCTEYWPEEQVAYDGVEITVQKVIHTEDYRLR
       :: :::.::::: .:.:::::...: ::::. ::::..  :  ::. : .: . ..: .:
CCDS44 TVDDFWQMVWQEDSPVIVMITKLKEKNEKCVLYWPEKRGIYGKVEVLVISVNECDNYTIR
        230       240       250       260       270       280      

      440       450       460       470       480          490     
pF1KB9 LISLKSGTEERGLKHYWFTSWPDQKTPDRAPPLLHLVREVEE---AAQQEGPHCAPIIVH
        . ::.:.. . .::::.:::::.:::: : :::.:. .:::   :.: .::    ..::
CCDS44 NLVLKQGSHTQHVKHYWYTSWPDHKTPDSAQPLLQLMLDVEEDRLASQGRGP----VVVH
        290       300       310       320       330           340  

         500       510       520       530       540       550     
pF1KB9 CSAGIGRTGCFIATSICCQQLRQEGVVDILKTTCQLRQDRGGMIQTCEQYQFVHHVMSLY
       :::::::::::::::: ::::..::::: :. .::::.:::::.:: :::.::::.. ::
CCDS44 CSAGIGRTGCFIATSIGCQQLKEEGVVDALSIVCQLRMDRGGMVQTSEQYEFVHHALCLY
            350       360       370       380       390       400  

         560     
pF1KB9 EKQLSHQSPE
       :..:: ..  
CCDS44 ESRLSAETVQ
            410  

>>CCDS55847.1 PTPRR gene_id:5801|Hs108|chr12              (451 aa)
 initn: 1316 init1: 870 opt: 1362  Z-score: 970.1  bits: 189.0 E(32554): 1e-47
Smith-Waterman score: 1388; 50.6% identity (71.7% similar) in 445 aa overlap (135-563:17-449)

          110       120       130       140       150       160    
pF1KB9 FSGYGHIWSQNATNLVSSLLTLLKQLEPTAWLDSGTWGVPSLLLVFLSVGLVLVTTLVWH
                                     :   : ..:    ..:::. ...:: :.  
CCDS55               MNQKNVLQGQHEADKIWSKEGFYAV----VIFLSIFVIIVTCLMI-
                             10        20            30        40  

          170        180       190       200       210       220   
pF1KB9 LLRTPPEPPTPL-PPEDRRQSVSRQPSFTYSEWMEEKIEDDFLDLDPVPETPVFDCVMDI
       : :   .    :   ... : .  .:        : :   .... . .:.  :.. :.: 
CCDS55 LYRLKERFQLSLRQDKEKNQEIHLSPITLQPALSEAKTVHSMVQPEQAPK--VLNVVVDP
              50        60        70        80        90           

                       230       240       250       260       270 
pF1KB9 K----PEAD--------PTSLTVKSMGLQERRGSNVSLTLDMCTPGCNEEGFGYLMSPRE
       .    ::          :. . .: .:::::::::::::::: . : : : :  . .:::
CCDS55 QGRGAPEIKATTATSVCPSPFKMKPIGLQERRGSNVSLTLDMSSLG-NIEPFVSIPTPRE
     100       110       120       130       140        150        

             280       290       300       310       320       330 
pF1KB9 ESAREYLLSASRVLQAEELHEKALDPFLLQAEFFEIPMNFVDPKEYDIPGLVRKNRYKTI
       . : ::: ::::.:   .:.. . .  :::.::.::::::::::: :::    :::::::
CCDS55 KVAMEYLQSASRILTRSQLRDVVASSHLLQSEFMEIPMNFVDPKEIDIPRHGTKNRYKTI
      160       170       180       190       200       210        

             340       350       360       370       380       390 
pF1KB9 LPNPHSRVCLTSPDPDDPLSSYINANYIRGYGGEEKVYIATQGPIVSTVADFWRMVWQEH
       :::: :::::   .  : ::.::::::::::.:.::..::::::...:: :::.::::: 
CCDS55 LPNPLSRVCLRPKNVTDSLSTYINANYIRGYSGKEKAFIATQGPMINTVDDFWQMVWQED
      220       230       240       250       260       270        

             400       410       420       430       440       450 
pF1KB9 TPIIVMITNIEEMNEKCTEYWPEEQVAYDGVEITVQKVIHTEDYRLRLISLKSGTEERGL
       .:.:::::...: ::::. ::::..  :  ::. : .: . ..: .: . ::.:.. . .
CCDS55 SPVIVMITKLKEKNEKCVLYWPEKRGIYGKVEVLVISVNECDNYTIRNLVLKQGSHTQHV
      280       290       300       310       320       330        

             460       470       480          490       500        
pF1KB9 KHYWFTSWPDQKTPDRAPPLLHLVREVEE---AAQQEGPHCAPIIVHCSAGIGRTGCFIA
       ::::.:::::.:::: : :::.:. .:::   :.: .::    ..:::::::::::::::
CCDS55 KHYWYTSWPDHKTPDSAQPLLQLMLDVEEDRLASQGRGP----VVVHCSAGIGRTGCFIA
      340       350       360       370           380       390    

      510       520       530       540       550       560     
pF1KB9 TSICCQQLRQEGVVDILKTTCQLRQDRGGMIQTCEQYQFVHHVMSLYEKQLSHQSPE
       ::: ::::..::::: :. .::::.:::::.:: :::.::::.. :::..:: ..  
CCDS55 TSIGCQQLKEEGVVDALSIVCQLRMDRGGMVQTSEQYEFVHHALCLYESRLSAETVQ
          400       410       420       430       440       450 

>>CCDS55848.1 PTPRR gene_id:5801|Hs108|chr12              (545 aa)
 initn: 1316 init1: 870 opt: 1362  Z-score: 969.0  bits: 189.1 E(32554): 1.2e-47
Smith-Waterman score: 1388; 50.6% identity (71.7% similar) in 445 aa overlap (135-563:111-543)

          110       120       130       140       150       160    
pF1KB9 FSGYGHIWSQNATNLVSSLLTLLKQLEPTAWLDSGTWGVPSLLLVFLSVGLVLVTTLVWH
                                     :   : ..:    ..:::. ...:: :.  
CCDS55 VLHQSLSQFGITEVSPEKNVLQGQHEADKIWSKEGFYAV----VIFLSIFVIIVTCLMI-
               90       100       110           120       130      

          170        180       190       200       210       220   
pF1KB9 LLRTPPEPPTPL-PPEDRRQSVSRQPSFTYSEWMEEKIEDDFLDLDPVPETPVFDCVMDI
       : :   .    :   ... : .  .:        : :   .... . .:.  :.. :.: 
CCDS55 LYRLKERFQLSLRQDKEKNQEIHLSPITLQPALSEAKTVHSMVQPEQAPK--VLNVVVDP
         140       150       160       170       180         190   

                       230       240       250       260       270 
pF1KB9 K----PEAD--------PTSLTVKSMGLQERRGSNVSLTLDMCTPGCNEEGFGYLMSPRE
       .    ::          :. . .: .:::::::::::::::: . : : : :  . .:::
CCDS55 QGRGAPEIKATTATSVCPSPFKMKPIGLQERRGSNVSLTLDMSSLG-NIEPFVSIPTPRE
           200       210       220       230        240       250  

             280       290       300       310       320       330 
pF1KB9 ESAREYLLSASRVLQAEELHEKALDPFLLQAEFFEIPMNFVDPKEYDIPGLVRKNRYKTI
       . : ::: ::::.:   .:.. . .  :::.::.::::::::::: :::    :::::::
CCDS55 KVAMEYLQSASRILTRSQLRDVVASSHLLQSEFMEIPMNFVDPKEIDIPRHGTKNRYKTI
            260       270       280       290       300       310  

             340       350       360       370       380       390 
pF1KB9 LPNPHSRVCLTSPDPDDPLSSYINANYIRGYGGEEKVYIATQGPIVSTVADFWRMVWQEH
       :::: :::::   .  : ::.::::::::::.:.::..::::::...:: :::.::::: 
CCDS55 LPNPLSRVCLRPKNVTDSLSTYINANYIRGYSGKEKAFIATQGPMINTVDDFWQMVWQED
            320       330       340       350       360       370  

             400       410       420       430       440       450 
pF1KB9 TPIIVMITNIEEMNEKCTEYWPEEQVAYDGVEITVQKVIHTEDYRLRLISLKSGTEERGL
       .:.:::::...: ::::. ::::..  :  ::. : .: . ..: .: . ::.:.. . .
CCDS55 SPVIVMITKLKEKNEKCVLYWPEKRGIYGKVEVLVISVNECDNYTIRNLVLKQGSHTQHV
            380       390       400       410       420       430  

             460       470       480          490       500        
pF1KB9 KHYWFTSWPDQKTPDRAPPLLHLVREVEE---AAQQEGPHCAPIIVHCSAGIGRTGCFIA
       ::::.:::::.:::: : :::.:. .:::   :.: .::    ..:::::::::::::::
CCDS55 KHYWYTSWPDHKTPDSAQPLLQLMLDVEEDRLASQGRGP----VVVHCSAGIGRTGCFIA
            440       450       460       470           480        

      510       520       530       540       550       560     
pF1KB9 TSICCQQLRQEGVVDILKTTCQLRQDRGGMIQTCEQYQFVHHVMSLYEKQLSHQSPE
       ::: ::::..::::: :. .::::.:::::.:: :::.::::.. :::..:: ..  
CCDS55 TSIGCQQLKEEGVVDALSIVCQLRMDRGGMVQTSEQYEFVHHALCLYESRLSAETVQ
      490       500       510       520       530       540     

>>CCDS8998.1 PTPRR gene_id:5801|Hs108|chr12               (657 aa)
 initn: 1316 init1: 870 opt: 1362  Z-score: 968.0  bits: 189.2 E(32554): 1.4e-47
Smith-Waterman score: 1388; 50.6% identity (71.7% similar) in 445 aa overlap (135-563:223-655)

          110       120       130       140       150       160    
pF1KB9 FSGYGHIWSQNATNLVSSLLTLLKQLEPTAWLDSGTWGVPSLLLVFLSVGLVLVTTLVWH
                                     :   : ..:    ..:::. ...:: :.  
CCDS89 VLHQSLSQFGITEVSPEKNVLQGQHEADKIWSKEGFYAV----VIFLSIFVIIVTCLMI-
            200       210       220       230           240        

          170        180       190       200       210       220   
pF1KB9 LLRTPPEPPTPL-PPEDRRQSVSRQPSFTYSEWMEEKIEDDFLDLDPVPETPVFDCVMDI
       : :   .    :   ... : .  .:        : :   .... . .:.  :.. :.: 
CCDS89 LYRLKERFQLSLRQDKEKNQEIHLSPITLQPALSEAKTVHSMVQPEQAPK--VLNVVVDP
       250       260       270       280       290         300     

                       230       240       250       260       270 
pF1KB9 K----PEAD--------PTSLTVKSMGLQERRGSNVSLTLDMCTPGCNEEGFGYLMSPRE
       .    ::          :. . .: .:::::::::::::::: . : : : :  . .:::
CCDS89 QGRGAPEIKATTATSVCPSPFKMKPIGLQERRGSNVSLTLDMSSLG-NIEPFVSIPTPRE
         310       320       330       340       350        360    

             280       290       300       310       320       330 
pF1KB9 ESAREYLLSASRVLQAEELHEKALDPFLLQAEFFEIPMNFVDPKEYDIPGLVRKNRYKTI
       . : ::: ::::.:   .:.. . .  :::.::.::::::::::: :::    :::::::
CCDS89 KVAMEYLQSASRILTRSQLRDVVASSHLLQSEFMEIPMNFVDPKEIDIPRHGTKNRYKTI
          370       380       390       400       410       420    

             340       350       360       370       380       390 
pF1KB9 LPNPHSRVCLTSPDPDDPLSSYINANYIRGYGGEEKVYIATQGPIVSTVADFWRMVWQEH
       :::: :::::   .  : ::.::::::::::.:.::..::::::...:: :::.::::: 
CCDS89 LPNPLSRVCLRPKNVTDSLSTYINANYIRGYSGKEKAFIATQGPMINTVDDFWQMVWQED
          430       440       450       460       470       480    

             400       410       420       430       440       450 
pF1KB9 TPIIVMITNIEEMNEKCTEYWPEEQVAYDGVEITVQKVIHTEDYRLRLISLKSGTEERGL
       .:.:::::...: ::::. ::::..  :  ::. : .: . ..: .: . ::.:.. . .
CCDS89 SPVIVMITKLKEKNEKCVLYWPEKRGIYGKVEVLVISVNECDNYTIRNLVLKQGSHTQHV
          490       500       510       520       530       540    

             460       470       480          490       500        
pF1KB9 KHYWFTSWPDQKTPDRAPPLLHLVREVEE---AAQQEGPHCAPIIVHCSAGIGRTGCFIA
       ::::.:::::.:::: : :::.:. .:::   :.: .::    ..:::::::::::::::
CCDS89 KHYWYTSWPDHKTPDSAQPLLQLMLDVEEDRLASQGRGP----VVVHCSAGIGRTGCFIA
          550       560       570       580           590       600

      510       520       530       540       550       560     
pF1KB9 TSICCQQLRQEGVVDILKTTCQLRQDRGGMIQTCEQYQFVHHVMSLYEKQLSHQSPE
       ::: ::::..::::: :. .::::.:::::.:: :::.::::.. :::..:: ..  
CCDS89 TSIGCQQLKEEGVVDALSIVCQLRMDRGGMVQTSEQYEFVHHALCLYESRLSAETVQ
              610       620       630       640       650       

>>CCDS1422.1 PTPN7 gene_id:5778|Hs108|chr1                (399 aa)
 initn: 1123 init1: 495 opt: 1137  Z-score: 813.0  bits: 159.8 E(32554): 5.8e-39
Smith-Waterman score: 1139; 46.0% identity (70.3% similar) in 404 aa overlap (177-564:7-399)

        150       160       170       180       190       200      
pF1KB9 LLVFLSVGLVLVTTLVWHLLRTPPEPPTPLPPEDRRQSVSRQPSFTYSEWMEEKIEDDFL
                                     : .. :..  :  ::  . :. :       
CCDS14                         MGASFWPIRQAREQQRRALSFRQTSWLSEP------
                                       10        20        30      

        210       220       230                      240       250 
pF1KB9 DLDPVPETPVFDCVMDIKPEADPTSLTV---------------KSMGLQERRGSNVSLTL
        : :.:.  . . .   . .:.: .:..               : . :::::::::.: :
CCDS14 PLGPAPHLSMVQ-AHGGRSRAQPLTLSLGAAMTQPPPEKTPAKKHVRLQERRGSNVALML
               40         50        60        70        80         

             260       270       280       290       300       310 
pF1KB9 DMCTPGCNEEGFGYLMSPREESAREYLLSASRVLQAEELHEKALDPFLLQAEFFEIPMNF
       :. . :  :  .  . .::: . . .: .:.. :    :...  .:  :. ::..:: ::
CCDS14 DVRSLGAVEP-ICSVNTPREVTLH-FLRTAGHPLTRWALQRQPPSPKQLEEEFLKIPSNF
      90        100       110        120       130       140       

             320       330       340       350       360       370 
pF1KB9 VDPKEYDIPGLVRKNRYKTILPNPHSRVCLTSPDPDDPLSSYINANYIRGYGGEEKVYIA
       :.:.. :::: . :.:::::::::.:::::   . ..  ..:::::::::: :.::::::
CCDS14 VSPEDLDIPGHASKDRYKTILPNPQSRVCLGRAQSQED-GDYINANYIRGYDGKEKVYIA
       150       160       170       180        190       200      

             380       390       400       410       420       430 
pF1KB9 TQGPIVSTVADFWRMVWQEHTPIIVMITNIEEMNEKCTEYWPEEQVAYDGVEITVQKVIH
       ::::. .::.:::.:::::.. .:::.:...: .:::..::: :. .:   .: .: . .
CCDS14 TQGPMPNTVSDFWEMVWQEEVSLIVMLTQLREGKEKCVHYWPTEEETYGPFQIRIQDMKE
        210       220       230       240       250       260      

             440       450       460       470       480       490 
pF1KB9 TEDYRLRLISLKSGTEERGLKHYWFTSWPDQKTPDRAPPLLHLVREVEEAAQQEGPHCAP
         .: .: ....   :.:..::  :..:::..::. : :::.:: ::::. .  . : .:
CCDS14 CPEYTVRQLTIQYQEERRSVKHILFSAWPDHQTPESAGPLLRLVAEVEESPET-AAHPGP
        270       280       290       300       310        320     

             500       510       520       530       540       550 
pF1KB9 IIVHCSAGIGRTGCFIATSICCQQLRQEGVVDILKTTCQLRQDRGGMIQTCEQYQFVHHV
       :.:::::::::::::::: : ::::. .: ::::  .:::: :::::::: :::::.::.
CCDS14 IVVHCSAGIGRTGCFIATRIGCQQLKARGEVDILGIVCQLRLDRGGMIQTAEQYQFLHHT
         330       340       350       360       370       380     

             560      
pF1KB9 MSLYEKQLSHQ-SPE
       ..::  :: .. :: 
CCDS14 LALYAGQLPEEPSP 
         390          

>>CCDS1423.2 PTPN7 gene_id:5778|Hs108|chr1                (465 aa)
 initn: 1123 init1: 495 opt: 1134  Z-score: 810.0  bits: 159.5 E(32554): 8.5e-39
Smith-Waterman score: 1134; 51.6% identity (76.0% similar) in 341 aa overlap (225-564:132-465)

          200       210       220       230       240       250    
pF1KB9 EWMEEKIEDDFLDLDPVPETPVFDCVMDIKPEADPTSLTVKSMGLQERRGSNVSLTLDMC
                                     ::  :..   : . :::::::::.: ::. 
CCDS14 PHLSMVQAHGGRSRAQPLTLSLGAAMTQPPPEKTPAK---KHVRLQERRGSNVALMLDVR
             110       120       130          140       150        

          260       270       280       290       300       310    
pF1KB9 TPGCNEEGFGYLMSPREESAREYLLSASRVLQAEELHEKALDPFLLQAEFFEIPMNFVDP
       . :  :  .  . .::: . . .: .:.. :    :...  .:  :. ::..:: :::.:
CCDS14 SLGAVEP-ICSVNTPREVTLH-FLRTAGHPLTRWALQRQPPSPKQLEEEFLKIPSNFVSP
      160        170        180       190       200       210      

          320       330       340       350       360       370    
pF1KB9 KEYDIPGLVRKNRYKTILPNPHSRVCLTSPDPDDPLSSYINANYIRGYGGEEKVYIATQG
       .. :::: . :.:::::::::.:::::   . ..  ..:::::::::: :.:::::::::
CCDS14 EDLDIPGHASKDRYKTILPNPQSRVCLGRAQSQED-GDYINANYIRGYDGKEKVYIATQG
        220       230       240       250        260       270     

          380       390       400       410       420       430    
pF1KB9 PIVSTVADFWRMVWQEHTPIIVMITNIEEMNEKCTEYWPEEQVAYDGVEITVQKVIHTED
       :. .::.:::.:::::.. .:::.:...: .:::..::: :. .:   .: .: . .  .
CCDS14 PMPNTVSDFWEMVWQEEVSLIVMLTQLREGKEKCVHYWPTEEETYGPFQIRIQDMKECPE
         280       290       300       310       320       330     

          440       450       460       470       480       490    
pF1KB9 YRLRLISLKSGTEERGLKHYWFTSWPDQKTPDRAPPLLHLVREVEEAAQQEGPHCAPIIV
       : .: ....   :.:..::  :..:::..::. : :::.:: ::::. .  . : .::.:
CCDS14 YTVRQLTIQYQEERRSVKHILFSAWPDHQTPESAGPLLRLVAEVEESPETAA-HPGPIVV
         340       350       360       370       380        390    

          500       510       520       530       540       550    
pF1KB9 HCSAGIGRTGCFIATSICCQQLRQEGVVDILKTTCQLRQDRGGMIQTCEQYQFVHHVMSL
       ::::::::::::::: : ::::. .: ::::  .:::: :::::::: :::::.::...:
CCDS14 HCSAGIGRTGCFIATRIGCQQLKARGEVDILGIVCQLRLDRGGMIQTAEQYQFLHHTLAL
          400       410       420       430       440       450    

          560      
pF1KB9 YEKQLSHQ-SPE
       :  :: .. :: 
CCDS14 YAGQLPEEPSP 
          460      

>>CCDS75517.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6               (1439 aa)
 initn: 698 init1: 309 opt: 648  Z-score: 462.4  bits: 96.8 E(32554): 1.9e-19
Smith-Waterman score: 648; 40.5% identity (65.3% similar) in 291 aa overlap (268-552:856-1138)

       240       250       260       270       280       290       
pF1KB9 GLQERRGSNVSLTLDMCTPGCNEEGFGYLMSPREESAREYLLSASRVLQAEELHEKALDP
                                     :: . .  .  . .. .::  .:  :. : 
CCDS75 NFSPRYENHSATAESSRLLDVPRYLCEGTESPYQTGQLHPAIRVADLLQHINLM-KTSDS
         830       840       850       860       870        880    

       300          310       320       330       340       350    
pF1KB9 FLLQAE---FFEIPMNFVDPKEYDIPGLVRKNRYKTILPNPHSRVCLTSPDPDDPLSSYI
       . .. :   :::      :  . :      :::: .:.   :::: : .:  ::: :.::
CCDS75 YGFKEEYESFFEGQSASWDVAKKDQNRA--KNRYGNIIAYDHSRVIL-QPVEDDPSSDYI
          890       900       910         920        930       940 

          360       370       380       390       400        410   
pF1KB9 NANYIRGYGGEEKVYIATQGPIVSTVADFWRMVWQEHTPIIVMITNIEEMNE-KCTEYWP
       ::::: ::  . . :::::::.  :: :::::.:::..  :::.::. :... :: .:::
CCDS75 NANYIDGYQ-RPSHYIATQGPVHETVYDFWRMIWQEQSACIVMVTNLVEVGRVKCYKYWP
             950        960       970       980       990      1000

           420       430       440         450       460       470 
pF1KB9 EEQVAYDGVEITVQKVIHTEDYRLRLISL-KSGTEE-RGLKHYWFTSWPDQKTPDRAPPL
       ..  .:   ..:  ..    .: .: ..: . : .: : .:.. ::.:::. .: .:  :
CCDS75 DDTEVYGDFKVTCVEMEPLAEYVVRTFTLERRGYNEIREVKQFHFTGWPDHGVPYHATGL
             1010      1020      1030      1040      1050      1060

             480       490       500       510       520       530 
pF1KB9 LHLVREVEEAAQQEGPHCAPIIVHCSAGIGRTGCFIATSICCQQLRQEGVVDILKTTCQL
       : ..:.:. .   . :  .::.:::::: :::::.:. .:  .. ..:::::: . .  :
CCDS75 LSFIRRVKLS---NPPSAGPIVVHCSAGAGRTGCYIVIDIMLDMAEREGVVDIYNCVKAL
             1070         1080      1090      1100      1110       

             540       550       560                               
pF1KB9 RQDRGGMIQTCEQYQFVHHVMSLYEKQLSHQSPE                          
       :. : .:.:: ::: :.: ..                                       
CCDS75 RSRRINMVQTEEQYIFIHDAILEACLCGETAIPVCEFKAAYFDMIRIDSQTNSSHLKDEF
      1120      1130      1140      1150      1160      1170       




565 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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