Result of FASTA (omim) for pF1KB6007
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6007, 834 aa
  1>>>pF1KB6007 834 - 834 aa - 834 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5384+/-0.000529; mu= 14.1413+/- 0.032
 mean_var=130.1379+/-26.671, 0's: 0 Z-trim(110.6): 205  B-trim: 197 in 1/53
 Lambda= 0.112427
 statistics sampled from 18744 (19002) to 18744 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.581), E-opt: 0.2 (0.223), width:  16
 Scan time: 10.810

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_031394 (OMIM: 605182) ras GTPase-activating pro ( 834) 5599 921.1       0
XP_011533144 (OMIM: 605182) PREDICTED: ras GTPase- ( 802) 5391 887.4       0
XP_011533143 (OMIM: 605182) PREDICTED: ras GTPase- ( 802) 5391 887.4       0
NP_001307751 (OMIM: 605182) ras GTPase-activating  ( 802) 5391 887.4       0
NP_006497 (OMIM: 601589) ras GTPase-activating pro ( 849) 3531 585.7 2.9e-166
NP_001290174 (OMIM: 601589) ras GTPase-activating  ( 850) 3522 584.3  8e-166
NP_001290175 (OMIM: 601589) ras GTPase-activating  ( 853) 3504 581.3 6.1e-165
XP_016862458 (OMIM: 601589) PREDICTED: ras GTPase- ( 871) 3497 580.2 1.4e-164
XP_011511361 (OMIM: 601589) PREDICTED: ras GTPase- ( 853) 3488 578.7 3.7e-164
XP_016862457 (OMIM: 601589) PREDICTED: ras GTPase- ( 872) 3488 578.7 3.7e-164
NP_001307750 (OMIM: 605182) ras GTPase-activating  ( 451) 3030 504.2 5.3e-142
XP_016875928 (OMIM: 605182) PREDICTED: ras GTPase- ( 451) 3030 504.2 5.3e-142
XP_016875927 (OMIM: 605182) PREDICTED: ras GTPase- ( 451) 3030 504.2 5.3e-142
XP_016862459 (OMIM: 601589) PREDICTED: ras GTPase- ( 707) 2665 445.2 4.9e-124
XP_016862460 (OMIM: 601589) PREDICTED: ras GTPase- ( 573) 2243 376.6 1.7e-103
XP_016862461 (OMIM: 601589) PREDICTED: ras GTPase- ( 442) 1821 308.1 5.6e-83
NP_008920 (OMIM: 607943) ras GTPase-activating pro ( 803)  816 145.3   1e-33
XP_016867150 (OMIM: 607943) PREDICTED: ras GTPase- ( 840)  816 145.3 1.1e-33
XP_011514025 (OMIM: 607943) PREDICTED: ras GTPase- ( 682)  626 114.4 1.7e-24
NP_001073346 (OMIM: 607943) ras GTPase-activating  ( 757)  625 114.3 2.1e-24
XP_016867151 (OMIM: 607943) PREDICTED: ras GTPase- ( 794)  625 114.3 2.2e-24
NP_001180450 (OMIM: 604118) rasGAP-activating-like ( 776)  465 88.4 1.4e-16
XP_011537156 (OMIM: 604118) PREDICTED: rasGAP-acti ( 447)  450 85.7   5e-16
XP_011516573 (OMIM: 609205) PREDICTED: disabled ho (1065)  435 83.6 5.1e-15
XP_016869789 (OMIM: 609205) PREDICTED: disabled ho (1065)  435 83.6 5.1e-15
NP_619723 (OMIM: 609205) disabled homolog 2-intera (1065)  435 83.6 5.1e-15
XP_011516572 (OMIM: 609205) PREDICTED: disabled ho (1065)  435 83.6 5.1e-15
XP_005251781 (OMIM: 609205) PREDICTED: disabled ho (1128)  435 83.7 5.3e-15
XP_011516569 (OMIM: 609205) PREDICTED: disabled ho (1131)  435 83.7 5.3e-15
NP_115941 (OMIM: 609205) disabled homolog 2-intera (1132)  435 83.7 5.3e-15
XP_016869788 (OMIM: 609205) PREDICTED: disabled ho (1141)  435 83.7 5.3e-15
XP_011516568 (OMIM: 609205) PREDICTED: disabled ho (1153)  435 83.7 5.4e-15
XP_011516567 (OMIM: 609205) PREDICTED: disabled ho (1160)  435 83.7 5.4e-15
XP_005251778 (OMIM: 609205) PREDICTED: disabled ho (1161)  435 83.7 5.4e-15
XP_016869787 (OMIM: 609205) PREDICTED: disabled ho (1164)  435 83.7 5.4e-15
XP_011516566 (OMIM: 609205) PREDICTED: disabled ho (1182)  435 83.7 5.5e-15
XP_005251776 (OMIM: 609205) PREDICTED: disabled ho (1189)  435 83.7 5.5e-15
XP_016858344 (OMIM: 606136) PREDICTED: ras GTPase- (1138)  434 83.5 5.9e-15
NP_004832 (OMIM: 606136) ras GTPase-activating pro (1139)  434 83.5   6e-15
XP_005245679 (OMIM: 606136) PREDICTED: ras GTPase- (1142)  434 83.5   6e-15
XP_016858343 (OMIM: 606136) PREDICTED: ras GTPase- (1145)  434 83.5   6e-15
XP_016858342 (OMIM: 606136) PREDICTED: ras GTPase- (1234)  434 83.5 6.3e-15
NP_733793 (OMIM: 606136) ras GTPase-activating pro (1280)  434 83.5 6.5e-15
XP_011508469 (OMIM: 606136) PREDICTED: ras GTPase- (1287)  434 83.5 6.5e-15
XP_011508468 (OMIM: 606136) PREDICTED: ras GTPase- (1290)  434 83.5 6.5e-15
XP_016858341 (OMIM: 606136) PREDICTED: ras GTPase- (1409)  434 83.6   7e-15
XP_016858340 (OMIM: 606136) PREDICTED: ras GTPase- (1412)  434 83.6   7e-15
XP_016858339 (OMIM: 606136) PREDICTED: ras GTPase- (1416)  434 83.6   7e-15
XP_016858338 (OMIM: 606136) PREDICTED: ras GTPase- (1419)  434 83.6   7e-15
NP_006763 (OMIM: 603384,612621) ras/Rap GTPase-act (1343)  427 82.4 1.5e-14


>>NP_031394 (OMIM: 605182) ras GTPase-activating protein  (834 aa)
 initn: 5599 init1: 5599 opt: 5599  Z-score: 4918.8  bits: 921.1 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 5599; 100.0% identity (100.0% similar) in 834 aa overlap (1-834:1-834)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MAVEDEGLRVFQSVKIKIGEAKNLPSYPGPSKMRDCYCTVNLDQEEVFRTKIVEKSLCPF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 MAVEDEGLRVFQSVKIKIGEAKNLPSYPGPSKMRDCYCTVNLDQEEVFRTKIVEKSLCPF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 YGEDFYCEIPRSFRHLSFYIFDRDVFRRDSIIGKVAIQKEDLQKYHNRDTWFQLQHVDAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 YGEDFYCEIPRSFRHLSFYIFDRDVFRRDSIIGKVAIQKEDLQKYHNRDTWFQLQHVDAD
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 SEVQGKVHLELRLSEVITDTGVVCHKLATRIVECQGLPIVNGQCDPYATVTLAGPFRSEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 SEVQGKVHLELRLSEVITDTGVVCHKLATRIVECQGLPIVNGQCDPYATVTLAGPFRSEA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 KKTKVKRKTNNPQFDEVFYFEVTRPCSYSKKSHFDFEEEDVDKLEIRVDLWNASNLKFGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 KKTKVKRKTNNPQFDEVFYFEVTRPCSYSKKSHFDFEEEDVDKLEIRVDLWNASNLKFGD
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 EFLGELRIPLKVLRQSSSYEAWYFLQPRDNGSKSLKPDDLGSLRLNVVYTEDHVFSSDYY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 EFLGELRIPLKVLRQSSSYEAWYFLQPRDNGSKSLKPDDLGSLRLNVVYTEDHVFSSDYY
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 SPLRDLLLKSADVEPVSASAAHILGEVCREKQEAAVPLVRLFLHYGRVVPFISAIASAEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 SPLRDLLLKSADVEPVSASAAHILGEVCREKQEAAVPLVRLFLHYGRVVPFISAIASAEV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 KRTQDPNTIFRGNSLASKCIDETMKLAGMHYLHVTLKPAIEEICQSHKPCEIDPVKLKDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 KRTQDPNTIFRGNSLASKCIDETMKLAGMHYLHVTLKPAIEEICQSHKPCEIDPVKLKDG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB6 ENLENNMENLRQYVDRVFHAITESGVSCPTVMCDIFFSLREAAAKRFQDDPDVRYTAVSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 ENLENNMENLRQYVDRVFHAITESGVSCPTVMCDIFFSLREAAAKRFQDDPDVRYTAVSS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB6 FIFLRFFAPAILSPNLFQLTPHHTDPQTSRTLTLISKTVQTLGSLSKSKSASFKESYMAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 FIFLRFFAPAILSPNLFQLTPHHTDPQTSRTLTLISKTVQTLGSLSKSKSASFKESYMAT
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB6 FYEFFNEQKYADAVKNFLDLISSSGRRDPKSVEQPIVLKEGFMIKRAQGRKRFGMKNFKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 FYEFFNEQKYADAVKNFLDLISSSGRRDPKSVEQPIVLKEGFMIKRAQGRKRFGMKNFKK
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB6 RWFRLTNHEFTYHKSKGDQPLYSIPIENILAVEKLEEESFKMKNMFQVIQPERALYIQAN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 RWFRLTNHEFTYHKSKGDQPLYSIPIENILAVEKLEEESFKMKNMFQVIQPERALYIQAN
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB6 NCVEAKDWIDILTKVSQCNQKRLTVYHPSAYLSGHWLCCRAPSDSAPGCSPCTGGLPANI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 NCVEAKDWIDILTKVSQCNQKRLTVYHPSAYLSGHWLCCRAPSDSAPGCSPCTGGLPANI
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB6 QLDIDGDRETERIYSLFNLYMSKLEKMQEACGSKSVYDGPEQEEYSTFVIDDPQETYKTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 QLDIDGDRETERIYSLFNLYMSKLEKMQEACGSKSVYDGPEQEEYSTFVIDDPQETYKTL
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830    
pF1KB6 KQVIAGVGALEQEHAQYKRDKFKKTKYGSQEHPIGDKSFQNYIRQQSETSTHSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_031 KQVIAGVGALEQEHAQYKRDKFKKTKYGSQEHPIGDKSFQNYIRQQSETSTHSI
              790       800       810       820       830    

>>XP_011533144 (OMIM: 605182) PREDICTED: ras GTPase-acti  (802 aa)
 initn: 5391 init1: 5391 opt: 5391  Z-score: 4736.7  bits: 887.4 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 5391; 100.0% identity (100.0% similar) in 802 aa overlap (33-834:1-802)

             10        20        30        40        50        60  
pF1KB6 VEDEGLRVFQSVKIKIGEAKNLPSYPGPSKMRDCYCTVNLDQEEVFRTKIVEKSLCPFYG
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011                               MRDCYCTVNLDQEEVFRTKIVEKSLCPFYG
                                             10        20        30

             70        80        90       100       110       120  
pF1KB6 EDFYCEIPRSFRHLSFYIFDRDVFRRDSIIGKVAIQKEDLQKYHNRDTWFQLQHVDADSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EDFYCEIPRSFRHLSFYIFDRDVFRRDSIIGKVAIQKEDLQKYHNRDTWFQLQHVDADSE
               40        50        60        70        80        90

            130       140       150       160       170       180  
pF1KB6 VQGKVHLELRLSEVITDTGVVCHKLATRIVECQGLPIVNGQCDPYATVTLAGPFRSEAKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VQGKVHLELRLSEVITDTGVVCHKLATRIVECQGLPIVNGQCDPYATVTLAGPFRSEAKK
              100       110       120       130       140       150

            190       200       210       220       230       240  
pF1KB6 TKVKRKTNNPQFDEVFYFEVTRPCSYSKKSHFDFEEEDVDKLEIRVDLWNASNLKFGDEF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TKVKRKTNNPQFDEVFYFEVTRPCSYSKKSHFDFEEEDVDKLEIRVDLWNASNLKFGDEF
              160       170       180       190       200       210

            250       260       270       280       290       300  
pF1KB6 LGELRIPLKVLRQSSSYEAWYFLQPRDNGSKSLKPDDLGSLRLNVVYTEDHVFSSDYYSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LGELRIPLKVLRQSSSYEAWYFLQPRDNGSKSLKPDDLGSLRLNVVYTEDHVFSSDYYSP
              220       230       240       250       260       270

            310       320       330       340       350       360  
pF1KB6 LRDLLLKSADVEPVSASAAHILGEVCREKQEAAVPLVRLFLHYGRVVPFISAIASAEVKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LRDLLLKSADVEPVSASAAHILGEVCREKQEAAVPLVRLFLHYGRVVPFISAIASAEVKR
              280       290       300       310       320       330

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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TQDPNTIFRGNSLASKCIDETMKLAGMHYLHVTLKPAIEEICQSHKPCEIDPVKLKDGEN
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LENNMENLRQYVDRVFHAITESGVSCPTVMCDIFFSLREAAAKRFQDDPDVRYTAVSSFI
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FLRFFAPAILSPNLFQLTPHHTDPQTSRTLTLISKTVQTLGSLSKSKSASFKESYMATFY
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EFFNEQKYADAVKNFLDLISSSGRRDPKSVEQPIVLKEGFMIKRAQGRKRFGMKNFKKRW
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FRLTNHEFTYHKSKGDQPLYSIPIENILAVEKLEEESFKMKNMFQVIQPERALYIQANNC
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VEAKDWIDILTKVSQCNQKRLTVYHPSAYLSGHWLCCRAPSDSAPGCSPCTGGLPANIQL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DIDGDRETERIYSLFNLYMSKLEKMQEACGSKSVYDGPEQEEYSTFVIDDPQETYKTLKQ
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VIAGVGALEQEHAQYKRDKFKKTKYGSQEHPIGDKSFQNYIRQQSETSTHSI
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>>XP_011533143 (OMIM: 605182) PREDICTED: ras GTPase-acti  (802 aa)
 initn: 5391 init1: 5391 opt: 5391  Z-score: 4736.7  bits: 887.4 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 5391; 100.0% identity (100.0% similar) in 802 aa overlap (33-834:1-802)

             10        20        30        40        50        60  
pF1KB6 VEDEGLRVFQSVKIKIGEAKNLPSYPGPSKMRDCYCTVNLDQEEVFRTKIVEKSLCPFYG
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011                               MRDCYCTVNLDQEEVFRTKIVEKSLCPFYG
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             70        80        90       100       110       120  
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EDFYCEIPRSFRHLSFYIFDRDVFRRDSIIGKVAIQKEDLQKYHNRDTWFQLQHVDADSE
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VQGKVHLELRLSEVITDTGVVCHKLATRIVECQGLPIVNGQCDPYATVTLAGPFRSEAKK
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TKVKRKTNNPQFDEVFYFEVTRPCSYSKKSHFDFEEEDVDKLEIRVDLWNASNLKFGDEF
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LGELRIPLKVLRQSSSYEAWYFLQPRDNGSKSLKPDDLGSLRLNVVYTEDHVFSSDYYSP
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pF1KB6 LRDLLLKSADVEPVSASAAHILGEVCREKQEAAVPLVRLFLHYGRVVPFISAIASAEVKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LRDLLLKSADVEPVSASAAHILGEVCREKQEAAVPLVRLFLHYGRVVPFISAIASAEVKR
              280       290       300       310       320       330

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pF1KB6 TQDPNTIFRGNSLASKCIDETMKLAGMHYLHVTLKPAIEEICQSHKPCEIDPVKLKDGEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TQDPNTIFRGNSLASKCIDETMKLAGMHYLHVTLKPAIEEICQSHKPCEIDPVKLKDGEN
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pF1KB6 LENNMENLRQYVDRVFHAITESGVSCPTVMCDIFFSLREAAAKRFQDDPDVRYTAVSSFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LENNMENLRQYVDRVFHAITESGVSCPTVMCDIFFSLREAAAKRFQDDPDVRYTAVSSFI
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FLRFFAPAILSPNLFQLTPHHTDPQTSRTLTLISKTVQTLGSLSKSKSASFKESYMATFY
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EFFNEQKYADAVKNFLDLISSSGRRDPKSVEQPIVLKEGFMIKRAQGRKRFGMKNFKKRW
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FRLTNHEFTYHKSKGDQPLYSIPIENILAVEKLEEESFKMKNMFQVIQPERALYIQANNC
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pF1KB6 VEAKDWIDILTKVSQCNQKRLTVYHPSAYLSGHWLCCRAPSDSAPGCSPCTGGLPANIQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VEAKDWIDILTKVSQCNQKRLTVYHPSAYLSGHWLCCRAPSDSAPGCSPCTGGLPANIQL
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pF1KB6 DIDGDRETERIYSLFNLYMSKLEKMQEACGSKSVYDGPEQEEYSTFVIDDPQETYKTLKQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DIDGDRETERIYSLFNLYMSKLEKMQEACGSKSVYDGPEQEEYSTFVIDDPQETYKTLKQ
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pF1KB6 VIAGVGALEQEHAQYKRDKFKKTKYGSQEHPIGDKSFQNYIRQQSETSTHSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VIAGVGALEQEHAQYKRDKFKKTKYGSQEHPIGDKSFQNYIRQQSETSTHSI
              760       770       780       790       800  

>>NP_001307751 (OMIM: 605182) ras GTPase-activating prot  (802 aa)
 initn: 5391 init1: 5391 opt: 5391  Z-score: 4736.7  bits: 887.4 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 5391; 100.0% identity (100.0% similar) in 802 aa overlap (33-834:1-802)

             10        20        30        40        50        60  
pF1KB6 VEDEGLRVFQSVKIKIGEAKNLPSYPGPSKMRDCYCTVNLDQEEVFRTKIVEKSLCPFYG
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001                               MRDCYCTVNLDQEEVFRTKIVEKSLCPFYG
                                             10        20        30

             70        80        90       100       110       120  
pF1KB6 EDFYCEIPRSFRHLSFYIFDRDVFRRDSIIGKVAIQKEDLQKYHNRDTWFQLQHVDADSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EDFYCEIPRSFRHLSFYIFDRDVFRRDSIIGKVAIQKEDLQKYHNRDTWFQLQHVDADSE
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pF1KB6 VQGKVHLELRLSEVITDTGVVCHKLATRIVECQGLPIVNGQCDPYATVTLAGPFRSEAKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VQGKVHLELRLSEVITDTGVVCHKLATRIVECQGLPIVNGQCDPYATVTLAGPFRSEAKK
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TKVKRKTNNPQFDEVFYFEVTRPCSYSKKSHFDFEEEDVDKLEIRVDLWNASNLKFGDEF
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LGELRIPLKVLRQSSSYEAWYFLQPRDNGSKSLKPDDLGSLRLNVVYTEDHVFSSDYYSP
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LRDLLLKSADVEPVSASAAHILGEVCREKQEAAVPLVRLFLHYGRVVPFISAIASAEVKR
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pF1KB6 TQDPNTIFRGNSLASKCIDETMKLAGMHYLHVTLKPAIEEICQSHKPCEIDPVKLKDGEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TQDPNTIFRGNSLASKCIDETMKLAGMHYLHVTLKPAIEEICQSHKPCEIDPVKLKDGEN
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pF1KB6 LENNMENLRQYVDRVFHAITESGVSCPTVMCDIFFSLREAAAKRFQDDPDVRYTAVSSFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LENNMENLRQYVDRVFHAITESGVSCPTVMCDIFFSLREAAAKRFQDDPDVRYTAVSSFI
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pF1KB6 FLRFFAPAILSPNLFQLTPHHTDPQTSRTLTLISKTVQTLGSLSKSKSASFKESYMATFY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FLRFFAPAILSPNLFQLTPHHTDPQTSRTLTLISKTVQTLGSLSKSKSASFKESYMATFY
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pF1KB6 EFFNEQKYADAVKNFLDLISSSGRRDPKSVEQPIVLKEGFMIKRAQGRKRFGMKNFKKRW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EFFNEQKYADAVKNFLDLISSSGRRDPKSVEQPIVLKEGFMIKRAQGRKRFGMKNFKKRW
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pF1KB6 FRLTNHEFTYHKSKGDQPLYSIPIENILAVEKLEEESFKMKNMFQVIQPERALYIQANNC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FRLTNHEFTYHKSKGDQPLYSIPIENILAVEKLEEESFKMKNMFQVIQPERALYIQANNC
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pF1KB6 VEAKDWIDILTKVSQCNQKRLTVYHPSAYLSGHWLCCRAPSDSAPGCSPCTGGLPANIQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VEAKDWIDILTKVSQCNQKRLTVYHPSAYLSGHWLCCRAPSDSAPGCSPCTGGLPANIQL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DIDGDRETERIYSLFNLYMSKLEKMQEACGSKSVYDGPEQEEYSTFVIDDPQETYKTLKQ
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VIAGVGALEQEHAQYKRDKFKKTKYGSQEHPIGDKSFQNYIRQQSETSTHSI
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NP_006 YSLRQMATQRFPNDPHVQYSAVSSFVFLRFFAVAVVSPHTFHLRPHHPDAQTIRTLTLIS
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pF1KB6 QPIVLKEGFMIKRAQGRKRFGMKNFKKRWFRLTNHEFTYHKSKGDQPLYSIPIENILAVE
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NP_006 EPVHLKEGEMYKRAQGRTRIGKKNFKKRWFCLTSRELTYHKQPGKDAIYTIPVKNILAVE
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pF1KB6 KLEEESFKMKNMFQVIQPERALYIQANNCVEAKDWIDILTKVSQCNQKRLTVYHPSAYLS
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NP_006 KLEESSFNKKNMFQVIHTEKPLYVQANNCVEANEWIDVLCRVSRCNQNRLSFYHPSVYLN
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pF1KB6 GHWLCCRAPSDSAPGCSPCTGGLPANIQLDIDGDRETERIYSLFNLYMSKLEKMQEACGS
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pF1KB6 KSVYDGPEQE--EYSTFVIDDPQETYKTLKQVIAGVGALEQEHAQYKRDKFKKTKYGSQE
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NP_006 IAVYQGPQKEPDDYSNFVIEDSVTTFKTIQQIKSIIEKLDEPHEKYRKKRSSSAKYGSKE
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NP_006 NPIVGKAS               
                              

>>NP_001290174 (OMIM: 601589) ras GTPase-activating prot  (850 aa)
 initn: 2923 init1: 1943 opt: 3522  Z-score: 3098.0  bits: 584.3 E(85289): 8e-166
Smith-Waterman score: 3522; 61.5% identity (87.0% similar) in 818 aa overlap (8-818:34-849)

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NP_001 AAPAAAAASSEAPAASATAEPEAGDQDSREVRVLQSLRGKICEAKNLLPYLGPHKMRDCF
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NP_001 CTINLDQEEVYRTQVVEKSLSPFFSEEFYFEIPRTFQYLSFYVYDKNVLQRDLRIGKVAI
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pF1KB6 PIVNGQ-CDPYATVTLAGPFRSEAKKTKVKRKTNNPQFDEVFYFEVTRPCSYSKKSHFDF
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NP_001 EEEDIEKLEIRIDLWNNGNL-VQDVFLGEIKVPVNVLRTDSSHQAWYLLQPRDNGNKSSK
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NP_001 TDDLGSLRLNICYTEDYVLPSEYYGPLKTLLLKSPDVQPISASAAYILSEICRDKNDAVL
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pF1KB6 PLVRLFLHYGRVVPFISAIASAEVKRTQDPNTIFRGNSLASKCIDETMKLAGMHYLHVTL
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NP_001 PLVRLLLHHDKLVPFATAVAELDLKDTQDANTIFRGNSLATRCLDEMMKIVGGHYLKVTL
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pF1KB6 KPAIEEICQSHKPCEIDPVKLKDGENLENNMENLRQYVDRVFHAITESGVSCPTVMCDIF
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NP_001 KPILDEICDSSKSCEIDPIKLKEGDNVENNKENLRYYVDKLFNTIVKSSMSCPTVMCDIF
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pF1KB6 FSLREAAAKRFQDDPDVRYTAVSSFIFLRFFAPAILSPNLFQLTPHHTDPQTSRTLTLIS
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NP_001 YSLRQMATQRFPNDPHVQYSAVSSFVFLRFFAVAVVSPHTFHLRPHHPDAQTIRTLTLIS
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pF1KB6 KTVQTLGS---LSKSKSASFKESYMATFYEFFNEQKYADAVKNFLDLISSSGRRDPKSVE
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NP_001 KTIQTLGSWGSLSKSKS-SFKETFMCEFFKMFQEEGYIIAVKKFLDEISSTETKESSGTS
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pF1KB6 QPIVLKEGFMIKRAQGRKRFGMKNFKKRWFRLTNHEFTYHKSKGDQP-LYSIPIENILAV
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NP_001 EPVHLKEGEMYKRAQGRTRIGKKNFKKRWFCLTSRELTYHKQPGSKDAIYTIPVKNILAV
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pF1KB6 EKLEEESFKMKNMFQVIQPERALYIQANNCVEAKDWIDILTKVSQCNQKRLTVYHPSAYL
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NP_001 EKLEESSFNKKNMFQVIHTEKPLYVQANNCVEANEWIDVLCRVSRCNQNRLSFYHPSVYL
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pF1KB6 SGHWLCCRAPSDSAPGCSPCTGGLPANIQLDIDGDRETERIYSLFNLYMSKLEKMQEACG
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NP_001 NGNWLCCQETGENTLGCKPCTAGVPADIQIDIDEDRETERIYSLFTLSLLKLQKMEEACG
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pF1KB6 SKSVYDGPEQE--EYSTFVIDDPQETYKTLKQVIAGVGALEQEHAQYKRDKFKKTKYGSQ
       . .::.::..:  .::.:::.:   :.::..:. . .  :.. : .:.. . ...::::.
NP_001 TIAVYQGPQKEPDDYSNFVIEDSVTTFKTIQQIKSIIEKLDEPHEKYRKKRSSSAKYGSK
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pF1KB6 EHPIGDKSFQNYIRQQSETSTHSI
       :.::  :.                
NP_001 ENPIVGKAS               
             850               

>>NP_001290175 (OMIM: 601589) ras GTPase-activating prot  (853 aa)
 initn: 3057 init1: 1943 opt: 3504  Z-score: 3082.2  bits: 581.3 E(85289): 6.1e-165
Smith-Waterman score: 3504; 61.1% identity (86.6% similar) in 821 aa overlap (8-818:34-852)

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pF1KB6 CTVNLDQEEVFRTKIVEKSLCPFYGEDFYCEIPRSFRHLSFYIFDRDVFRRDSIIGKVAI
       ::.:::::::.::..::::: ::..:.:: ::::.:..::::..:..:..::  ::::::
NP_001 CTINLDQEEVYRTQVVEKSLSPFFSEEFYFEIPRTFQYLSFYVYDKNVLQRDLRIGKVAI
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       .:::: .. ...:::.:: ::..:::::::::::.:.:.::..:.::..:...:  :.::
NP_001 KKEDLCNHSGKETWFSLQPVDSNSEVQGKVHLELKLNELITENGTVCQQLVVHIKACHGL
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       :..::: :::::::.:.:: :.. ::::::.::.::::.:.:::::::  ::..::.:. 
NP_001 PLINGQSCDPYATVSLVGPSRNDQKKTKVKKKTSNPQFNEIFYFEVTRSSSYTRKSQFQV
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pF1KB6 EEEDVDKLEIRVDLWNASNLKFGDEFLGELRIPLKVLRQSSSYEAWYFLQPRDNGSKSLK
       ::::..:::::.:::: .::   : ::::...:..::: .::..:::.:::::::.:: :
NP_001 EEEDIEKLEIRIDLWNNGNL-VQDVFLGEIKVPVNVLRTDSSHQAWYLLQPRDNGNKSSK
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pF1KB6 PDDLGSLRLNVVYTEDHVFSSDYYSPLRDLLLKSADVEPVSASAAHILGEVCREKQEAAV
        :::::::::. ::::.:. :.::.::. ::::: ::.:.:::::.::.:.::.:..:..
NP_001 TDDLGSLRLNICYTEDYVLPSEYYGPLKTLLLKSPDVQPISASAAYILSEICRDKNDAVL
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pF1KB6 PLVRLFLHYGRVVPFISAIASAEVKRTQDPNTIFRGNSLASKCIDETMKLAGMHYLHVTL
       :::::.::. ..::: .:.:  ..: ::: ::::::::::..:.:: ::..: :::.:::
NP_001 PLVRLLLHHDKLVPFATAVAELDLKDTQDANTIFRGNSLATRCLDEMMKIVGGHYLKVTL
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pF1KB6 KPAIEEICQSHKPCEIDPVKLKDGENLENNMENLRQYVDRVFHAITESGVSCPTVMCDIF
       :: ..:::.: : :::::.:::.:.:.::: :::: :::..:..:..:..::::::::::
NP_001 KPILDEICDSSKSCEIDPIKLKEGDNVENNKENLRYYVDKLFNTIVKSSMSCPTVMCDIF
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pF1KB6 FSLREAAAKRFQDDPDVRYTAVSSFIFLRFFAPAILSPNLFQLTPHHTDPQTSRTLTLIS
       .:::. :..:: .:: :.:.:::::.:::::: :..::. :.: ::: : :: :::::::
NP_001 YSLRQMATQRFPNDPHVQYSAVSSFVFLRFFAVAVVSPHTFHLRPHHPDAQTIRTLTLIS
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pF1KB6 KTVQTLGS---LSKSKSASFKESYMATFYEFFNEQKYADAVKNFLDLISSSGRRDPKSVE
       ::.:::::   :::::: ::::..:  :...:.:. :  :::.::: :::.  .. ... 
NP_001 KTIQTLGSWGSLSKSKS-SFKETFMCEFFKMFQEEGYIIAVKKFLDEISSTETKESSGTS
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pF1KB6 QPIVLKEGFMIKRAQGRKRFGMKNFKKRWFRLTNHEFTYHKS----KGDQPLYSIPIENI
       .:. :::: : :::::: :.: :::::::: ::..:.::::.    .  . .:.::..::
NP_001 EPVHLKEGEMYKRAQGRTRIGKKNFKKRWFCLTSRELTYHKQPEFIERKDAIYTIPVKNI
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pF1KB6 LAVEKLEEESFKMKNMFQVIQPERALYIQANNCVEAKDWIDILTKVSQCNQKRLTVYHPS
       :::::::: ::. :::::::. :. ::.::::::::..:::.: .::.:::.::. ::::
NP_001 LAVEKLEESSFNKKNMFQVIHTEKPLYVQANNCVEANEWIDVLCRVSRCNQNRLSFYHPS
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pF1KB6 AYLSGHWLCCRAPSDSAPGCSPCTGGLPANIQLDIDGDRETERIYSLFNLYMSKLEKMQE
       .::.:.::::.  .... ::.:::.:.::.::.::: :::::::::::.: . ::.::.:
NP_001 VYLNGNWLCCQETGENTLGCKPCTAGVPADIQIDIDEDRETERIYSLFTLSLLKLQKMEE
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pF1KB6 ACGSKSVYDGPEQE--EYSTFVIDDPQETYKTLKQVIAGVGALEQEHAQYKRDKFKKTKY
       :::. .::.::..:  .::.:::.:   :.::..:. . .  :.. : .:.. . ...::
NP_001 ACGTIAVYQGPQKEPDDYSNFVIEDSVTTFKTIQQIKSIIEKLDEPHEKYRKKRSSSAKY
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pF1KB6 GSQEHPIGDKSFQNYIRQQSETSTHSI
       ::.:.::  :.                
NP_001 GSKENPIVGKAS               
             850                  

>>XP_016862458 (OMIM: 601589) PREDICTED: ras GTPase-acti  (871 aa)
 initn: 2943 init1: 1909 opt: 3497  Z-score: 3076.0  bits: 580.2 E(85289): 1.4e-164
Smith-Waterman score: 3497; 61.7% identity (87.1% similar) in 805 aa overlap (20-818:68-870)

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pF1KB6 TKIVEKSLCPFYGEDFYCEIPRSFRHLSFYIFDRDVFRRDSIIGKVAIQKEDLQKYHNRD
       :..::::: ::..:.:: ::::.:..::::..:..:..::  ::::::.:::: .. ...
XP_016 TQVVEKSLSPFFSEEFYFEIPRTFQYLSFYVYDKNVLQRDLRIGKVAIKKEDLCNHSGKE
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pF1KB6 TWFQLQHVDADSEVQGKVHLELRLSEVITDTGVVCHKLATRIVECQGLPIVNGQ-CDPYA
       :::.:: ::..:::::::::::.:.:.::..:.::..:...:  :.:::..::: :::::
XP_016 TWFSLQPVDSNSEVQGKVHLELKLNELITENGTVCQQLVVHIKACHGLPLINGQSCDPYA
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pF1KB6 TVTLAGPFRSEAKKTKVKRKTNNPQFDEVFYFEVTRPCSYSKKSHFDFEEEDVDKLEIRV
       ::.:.:: :.. ::::::.::.::::.:.:::::::  ::..::.:. ::::..:::::.
XP_016 TVSLVGPSRNDQKKTKVKKKTSNPQFNEIFYFEVTRSSSYTRKSQFQVEEEDIEKLEIRI
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pF1KB6 DLWNASNLKFGDEFLGELRIPLKVLRQSSSYEAWYFLQPRDNGSKSLKPDDLGSLRLNVV
       :::: .::   : ::::...:..::: .::..:::.:::::::.:: : :::::::::. 
XP_016 DLWNNGNL-VQDVFLGEIKVPVNVLRTDSSHQAWYLLQPRDNGNKSSKTDDLGSLRLNIC
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pF1KB6 YTEDHVFSSDYYSPLRDLLLKSADVEPVSASAAHILGEVCREKQEAAVPLVRLFLHYGRV
       ::::.:. :.::.::. ::::: ::.:.:::::.::.:.::.:..:..:::::.::. ..
XP_016 YTEDYVLPSEYYGPLKTLLLKSPDVQPISASAAYILSEICRDKNDAVLPLVRLLLHHDKL
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pF1KB6 VPFISAIASAEVKRTQDPNTIFRGNSLASKCIDETMKLAGMHYLHVTLKPAIEEICQSHK
       ::: .:.:  ..: ::: ::::::::::..:.:: ::..: :::.::::: ..:::.: :
XP_016 VPFATAVAELDLKDTQDANTIFRGNSLATRCLDEMMKIVGGHYLKVTLKPILDEICDSSK
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pF1KB6 PCEIDPVKLKDGENLENNMENLRQYVDRVFHAITESGVSCPTVMCDIFFSLREAAAKRFQ
        :::::.:::.:.:.::: :::: :::..:..:..:..::::::::::.:::. :..:: 
XP_016 SCEIDPIKLKEGDNVENNKENLRYYVDKLFNTIVKSSMSCPTVMCDIFYSLRQMATQRFP
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pF1KB6 DDPDVRYTAVSSFIFLRFFAPAILSPNLFQLTPHHTDPQTSRTLTLISKTVQTLGS---L
       .:: :.:.:::::.:::::: :..::. :.: ::: : :: :::::::::.:::::   :
XP_016 NDPHVQYSAVSSFVFLRFFAVAVVSPHTFHLRPHHPDAQTIRTLTLISKTIQTLGSWGSL
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pF1KB6 SKSKSASFKESYMATFYEFFNEQKYADAVKNFLDLISSSGRRDPKSVEQPIVLKEGFMIK
       ::::: ::::..:  :...:.:. :  :::.::: :::.  .. ... .:. :::: : :
XP_016 SKSKS-SFKETFMCEFFKMFQEEGYIIAVKKFLDEISSTETKESSGTSEPVHLKEGEMYK
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pF1KB6 RAQGRKRFGMKNFKKRWFRLTNHEFTYHKSKGDQPLYSIPIENILAVEKLEEESFKMKNM
       ::::: :.: :::::::: ::..:.::::. : . .:.::..:::::::::: ::. :::
XP_016 RAQGRTRIGKKNFKKRWFCLTSRELTYHKQPGKDAIYTIPVKNILAVEKLEESSFNKKNM
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pF1KB6 FQVIQPERALYIQANNCVEAKDWIDILTKVSQCNQKRLTVYHPSAYLSGHWLCCRAPSDS
       ::::. :. ::.::::::::..:::.: .::.:::.::. ::::.::.:.::::.  ...
XP_016 FQVIHTEKPLYVQANNCVEANEWIDVLCRVSRCNQNRLSFYHPSVYLNGNWLCCQETGEN
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pF1KB6 APGCSPCTGGLPANIQLDIDGDRETERIYSLFNLYMSKLEKMQEACGSKSVYDGPEQE--
       . ::.:::.:.::.::.::: :::::::::::.: . ::.::.::::. .::.::..:  
XP_016 TLGCKPCTAGVPADIQIDIDEDRETERIYSLFTLSLLKLQKMEEACGTIAVYQGPQKEPD
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pF1KB6 EYSTFVIDDPQETYKTLKQVIAGVGALEQEHAQYKRDKFKKTKYGSQEHPIGDKSFQNYI
       .::.:::.:   :.::..:. . .  :.. : .:.. . ...::::.:.::  :.     
XP_016 DYSNFVIEDSVTTFKTIQQIKSIIEKLDEPHEKYRKKRSSSAKYGSKENPIVGKAS    
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           830    
pF1KB6 RQQSETSTHSI

>>XP_011511361 (OMIM: 601589) PREDICTED: ras GTPase-acti  (853 aa)
 initn: 3032 init1: 1909 opt: 3488  Z-score: 3068.2  bits: 578.7 E(85289): 3.7e-164
Smith-Waterman score: 3488; 61.7% identity (87.1% similar) in 806 aa overlap (20-818:49-852)

                          10        20        30        40         
pF1KB6            MAVEDEGLRVFQSVKIKIGEAKNLPSYPGPSKMRDCYCTVNLDQEEVFR
                                     :::::  : :: :::::.::.:::::::.:
XP_011 VGLSFKKKSKLCRRETSKKKERLKNKKAESEAKNLLPYLGPHKMRDCFCTINLDQEEVYR
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pF1KB6 TKIVEKSLCPFYGEDFYCEIPRSFRHLSFYIFDRDVFRRDSIIGKVAIQKEDLQKYHNRD
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834 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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