Result of FASTA (ccds) for pF1KB5645
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5645, 1170 aa
  1>>>pF1KB5645 1170 - 1170 aa - 1170 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5360+/-0.00136; mu= 18.2411+/- 0.081
 mean_var=209.1887+/-39.679, 0's: 0 Z-trim(108.2): 193  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.088676
 statistics sampled from 9842 (10052) to 9842 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.651), E-opt: 0.2 (0.309), width:  16
 Scan time:  5.010

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS32194.1 THBS1 gene_id:7057|Hs108|chr15         (1170) 8531 1106.1       0
CCDS34574.1 THBS2 gene_id:7058|Hs108|chr6          (1172) 5578 728.3 2.6e-209
CCDS12385.1 COMP gene_id:1311|Hs108|chr19          ( 757) 2502 334.5 5.9e-91
CCDS58034.1 THBS3 gene_id:7059|Hs108|chr1          ( 836) 2422 324.3 7.5e-88
CCDS72937.1 THBS3 gene_id:7059|Hs108|chr1          ( 947) 2422 324.4   8e-88
CCDS1099.1 THBS3 gene_id:7059|Hs108|chr1           ( 956) 2422 324.4 8.1e-88
CCDS78027.1 THBS4 gene_id:7060|Hs108|chr5          ( 870) 2364 316.9 1.3e-85
CCDS4049.1 THBS4 gene_id:7060|Hs108|chr5           ( 961) 2364 317.0 1.4e-85
CCDS30956.1 HMCN1 gene_id:83872|Hs108|chr1         (5635)  705 105.8   3e-21
CCDS64985.1 ADGRB1 gene_id:575|Hs108|chr8          (1584)  601 91.7 1.5e-17
CCDS4968.1 ADGRB3 gene_id:577|Hs108|chr6           (1522)  568 87.5 2.7e-16
CCDS14282.1 CFP gene_id:5199|Hs108|chrX            ( 469)  543 83.6 1.2e-15
CCDS72746.1 ADGRB2 gene_id:576|Hs108|chr1          (1551)  540 83.9 3.2e-15
CCDS72747.1 ADGRB2 gene_id:576|Hs108|chr1          (1584)  540 83.9 3.3e-15
CCDS3875.1 SEMA5A gene_id:9037|Hs108|chr5          (1074)  474 75.3   9e-13
CCDS74995.1 SEMA5B gene_id:54437|Hs108|chr3        (1057)  460 73.5 3.1e-12
CCDS35491.1 SEMA5B gene_id:54437|Hs108|chr3        (1151)  459 73.4 3.6e-12
CCDS58848.1 SEMA5B gene_id:54437|Hs108|chr3        (1205)  459 73.4 3.7e-12


>>CCDS32194.1 THBS1 gene_id:7057|Hs108|chr15              (1170 aa)
 initn: 8531 init1: 8531 opt: 8531  Z-score: 5913.0  bits: 1106.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 8531; 99.9% identity (100.0% similar) in 1170 aa overlap (1-1170:1-1170)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MGLAWGLGVLFLMHVCGTNRIPESGGDNSVFDIFELTGAARKGSGRRLVKGPDPSSPAFR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MGLAWGLGVLFLMHVCGTNRIPESGGDNSVFDIFELTGAARKGSGRRLVKGPDPSSPAFR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 IEDANLIPPVPDDKFQDLVDAVRAEKGFLLLASLRQMKKTRGTLLALERKDHSGQVFSVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IEDANLIPPVPDDKFQDLVDAVRAEKGFLLLASLRQMKKTRGTLLALERKDHSGQVFSVV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 SNGKAGTLDLSLTVQGKQHVVSVEEALLATGQWKSITLFVQEDRAQLYIDCEKMENAELD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SNGKAGTLDLSLTVQGKQHVVSVEEALLATGQWKSITLFVQEDRAQLYIDCEKMENAELD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 VPIQSVFTRDLASIARLRIAKGGVNDNFQGVLQNVRFVFGTTPEDILRNKGCSSSTSVLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VPIQSVFTRDLASIARLRIAKGGVNDNFQGVLQNVRFVFGTTPEDILRNKGCSSSTSVLL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 TLDNNVVNGSSPAIRTNYIGHKTKDLQAICGISCDELSSMVLELRGLRTIVTTLQDSIRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TLDNNVVNGSSPAIRTNYIGHKTKDLQAICGISCDELSSMVLELRGLRTIVTTLQDSIRK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 VTEENKELANELRRPPLCYHNGVQYRNNEEWTVDSCTECHCQNSVTICKKVSCPIMPCSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VTEENKELANELRRPPLCYHNGVQYRNNEEWTVDSCTECHCQNSVTICKKVSCPIMPCSN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 ATVPDGECCPRCWPSDSADDGWSPWSEWTSCSTSCGNGIQQRGRSCDSLNNRCEGSSVQT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ATVPDGECCPRCWPSDSADDGWSPWSEWTSCSTSCGNGIQQRGRSCDSLNNRCEGSSVQT
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 RTCHIQECDKRFKQDGGWSHWSPWSSCSVTCGDGVITRIRLCNSPSPQMNGKPCEGEARE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RTCHIQECDKRFKQDGGWSHWSPWSSCSVTCGDGVITRIRLCNSPSPQMNGKPCEGEARE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 TKACKKDACPINGGWGPWSPWDICSVTCGGGVQKRSRLCNNPTPQFGGKDCVGDVTENQI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TKACKKDACPINGGWGPWSPWDICSVTCGGGVQKRSRLCNNPTPQFGGKDCVGDVTENQI
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 CNKQDCPIDGCLSNPCFAGVKCTSYPDGSWKCGACPPGYSGNGIQCTDVDECKEVPDACF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CNKQDCPIDGCLSNPCFAGVKCTSYPDGSWKCGACPPGYSGNGIQCTDVDECKEVPDACF
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB5 NHNGEHRCENTDPGYNCLPCPPRFTGSQPFGQGVEHATANKQVCKPRNPCTDGTHDCNKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NHNGEHRCENTDPGYNCLPCPPRFTGSQPFGQGVEHATANKQVCKPRNPCTDGTHDCNKN
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB5 AKCNYLGHYSDPMYRCECKPGYAGNGIICGEDTDLDGWPSENLVCVANATYHCKKDNCPN
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS32 AKCNYLGHYSDPMYRCECKPGYAGNGIICGEDTDLDGWPNENLVCVANATYHCKKDNCPN
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB5 LPNSGQEDYDKDGIGDACDDDDDNDKIPDDRDNCPFHYNPAQYDYDRDDVGDRCDNCPYN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LPNSGQEDYDKDGIGDACDDDDDNDKIPDDRDNCPFHYNPAQYDYDRDDVGDRCDNCPYN
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB5 HNPDQADTDNNGEGDACAADIDGDGILNERDNCQYVYNVDQRDTDMDGVGDQCDNCPLEH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HNPDQADTDNNGEGDACAADIDGDGILNERDNCQYVYNVDQRDTDMDGVGDQCDNCPLEH
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB5 NPDQLDSDSDRIGDTCDNNQDIDEDGHQNNLDNCPYVPNANQADHDKDGKGDACDHDDDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NPDQLDSDSDRIGDTCDNNQDIDEDGHQNNLDNCPYVPNANQADHDKDGKGDACDHDDDN
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB5 DGIPDDKDNCRLVPNPDQKDSDGDGRGDACKDDFDHDSVPDIDDICPENVDISETDFRRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DGIPDDKDNCRLVPNPDQKDSDGDGRGDACKDDFDHDSVPDIDDICPENVDISETDFRRF
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB5 QMIPLDPKGTSQNDPNWVVRHQGKELVQTVNCDPGLAVGYDEFNAVDFSGTFFINTERDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QMIPLDPKGTSQNDPNWVVRHQGKELVQTVNCDPGLAVGYDEFNAVDFSGTFFINTERDD
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KB5 DYAGFVFGYQSSSRFYVVMWKQVTQSYWDTNPTRAQGYSGLSVKVVNSTTGPGEHLRNAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DYAGFVFGYQSSSRFYVVMWKQVTQSYWDTNPTRAQGYSGLSVKVVNSTTGPGEHLRNAL
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KB5 WHTGNTPGQVRTLWHDPRHIGWKDFTAYRWRLSHRPKTGFIRVVMYEGKKIMADSGPIYD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 WHTGNTPGQVRTLWHDPRHIGWKDFTAYRWRLSHRPKTGFIRVVMYEGKKIMADSGPIYD
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170
pF1KB5 KTYAGGRLGLFVFSQEMVFFSDLKYECRDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KTYAGGRLGLFVFSQEMVFFSDLKYECRDP
             1150      1160      1170

>>CCDS34574.1 THBS2 gene_id:7058|Hs108|chr6               (1172 aa)
 initn: 5432 init1: 4955 opt: 5578  Z-score: 3871.3  bits: 728.3 E(32554): 2.6e-209
Smith-Waterman score: 5612; 61.6% identity (83.0% similar) in 1176 aa overlap (3-1169:1-1171)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MGLAWGLGVLFLMHVCGTNRIPESGGDNSVFDIFELTGAARKGSGRRLVKGPDPSSPAFR
         ..: : ::. . :  ...  ..  :.. ::.: ...  ::  : .  .::::. ::.:
CCDS34   MVWRL-VLLALWVWPSTQAGHQDKDTT-FDLFSISNINRKTIGAKQFRGPDPGVPAYR
                  10        20         30        40        50      

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 IEDANLIPPVPDDKFQDLVDAVRAEKGFLLLASLRQMKKTRGTLLALERKDHSGQVFSVV
       .   . ::::  : .. ..  .: ..::.: :.:.:  :.::::::::    : . : .:
CCDS34 FVRFDYIPPVNADDLSKITKIMRQKEGFFLTAQLKQDGKSRGTLLALEGPGLSQRQFEIV
         60        70        80        90       100       110      

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 SNGKAGTLDLSLTVQGKQHVVSVEEALLATGQWKSITLFVQEDRAQLYIDCEKMENAELD
       ::: : ::::.  ..: .::::.:.. :: .:::..:. :  .  .:.. :. ...  ::
CCDS34 SNGPADTLDLTYWIDGTRHVVSLEDVGLADSQWKNVTVQVAGETYSLHVGCDLIDSFALD
        120       130       140       150       160       170      

              190       200        210       220       230         
pF1KB5 VPIQSVFTRDLASIARLRIAKGGVNDN-FQGVLQNVRFVFGTTPEDILRNKGCSSSTSVL
        :.   . .  :  .:. .:::.. .. :.:.::::..:: .. :::: .:::... .. 
CCDS34 EPF---YEHLQAEKSRMYVAKGSARESHFRGLLQNVHLVFENSVEDILSKKGCQQGQGAE
           180       190       200       210       220       230   

     240         250       260       270       280       290       
pF1KB5 LTL--DNNVVNGSSPAIRTNYIGHKTKDLQAICGISCDELSSMVLELRGLRTIVTTLQDS
       ..   .:. .   .: . :.:.: ...    .:  ::.::..:: :: ::...:. :...
CCDS34 INAISENTETLRLGPHVTTEYVGPSSERRPEVCERSCEELGNMVQELSGLHVLVNQLSEN
           240       250       260       270       280       290   

       300       310             320       330       340       350 
pF1KB5 IRKVTEENKELANELRRPP------LCYHNGVQYRNNEEWTVDSCTECHCQNSVTICKKV
       ...:...:. : . .  ::       :...:  . .:: :.::::: : :..  :::...
CCDS34 LKRVSNDNQFLWELIGGPPKTRNMSACWQDGRFFAENETWVVDSCTTCTCKKFKTICHQI
           300       310       320       330       340       350   

             360       370       380       390       400       410 
pF1KB5 SCPIMPCSNATVPDGECCPRCWPSDSADDGWSPWSEWTSCSTSCGNGIQQRGRSCDSLNN
       .::   :.. .  .::::: :  : ....:::::.:::.::..::.: ::::::::  .:
CCDS34 TCPPATCASPSFVEGECCPSCLHSVDGEEGWSPWAEWTQCSVTCGSGTQQRGRSCDVTSN
           360       370       380       390       400       410   

             420       430       440       450       460       470 
pF1KB5 RCEGSSVQTRTCHIQECDKRFKQDGGWSHWSPWSSCSVTCGDGVITRIRLCNSPSPQMNG
        : : :.:::.: ...:: :..::::::::::::::::::: : :::::::::: :::.:
CCDS34 TCLGPSIQTRACSLSKCDTRIRQDGGWSHWSPWSSCSVTCGVGNITRIRLCNSPVPQMGG
           420       430       440       450       460       470   

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pF1KB5 KPCEGEARETKACKKDACPINGGWGPWSPWDICSVTCGGGVQKRSRLCNNPTPQFGGKDC
       : :.: .::::::.   :::.: :.:::::. :.:::.::...:.:.::.: ::.::: :
CCDS34 KNCKGSGRETKACQGAPCPIDGRWSPWSPWSACTVTCAGGIRERTRVCNSPEPQYGGKAC
           480       490       500       510       520       530   

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pF1KB5 VGDVTENQICNKQDCPIDGCLSNPCFAGVKCTSYPDGSWKCGACPPGYSGNGIQCTDVDE
       :::: : :.:::..::.::::::::: :..:.:.:::::.::.:: :. ::: .: :.::
CCDS34 VGDVQERQMCNKRSCPVDGCLSNPCFPGAQCSSFPDGSWSCGSCPVGFLGNGTHCEDLDE
           540       550       560       570       580       590   

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pF1KB5 CKEVPDACFNHNGEHRCENTDPGYNCLPCPPRFTGSQPFGQGVEHATANKQVCKPRNPCT
       :  ::: ::. .   :: ::.::..:::::::. :.:: : :.: : ..::::.:.::: 
CCDS34 CALVPDICFSTSKVPRCVNTQPGFHCLPCPPRYRGNQPVGVGLEAAKTEKQVCEPENPCK
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pF1KB5 DGTHDCNKNAKCNYLGHYSDPMYRCECKPGYAGNGIICGEDTDLDGWPSENLVCVANATY
       : ::.:.:.:.: ::::.:::::.:::. ::::.:.:::::.::::::. ::::..::::
CCDS34 DKTHNCHKHAECIYLGHFSDPMYKCECQTGYAGDGLICGEDSDLDGWPNLNLVCATNATY
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pF1KB5 HCKKDNCPNLPNSGQEDYDKDGIGDACDDDDDNDKIPDDRDNCPFHYNPAQYDYDRDDVG
       :: :::::.::::::::.:::::::::::::::: . :..::: . .:: : :::.:.::
CCDS34 HCIKDNCPHLPNSGQEDFDKDGIGDACDDDDDNDGVTDEKDNCQLLFNPRQADYDKDEVG
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pF1KB5 DRCDNCPYNHNPDQADTDNNGEGDACAADIDGDGILNERDNCQYVYNVDQRDTDMDGVGD
       :::::::: ::: : :::::::::::..::::: ..:::::: ::::.:::::: :::::
CCDS34 DRCDNCPYVHNPAQIDTDNNGEGDACSVDIDGDDVFNERDNCPYVYNTDQRDTDGDGVGD
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pF1KB5 QCDNCPLEHNPDQLDSDSDRIGDTCDNNQDIDEDGHQNNLDNCPYVPNANQADHDKDGKG
       .:::::: ::::: : :.: .:: ::::.:::.:::::: :::::. ::::::::.::.:
CCDS34 HCDNCPLVHNPDQTDVDNDLVGDQCDNNEDIDDDGHQNNQDNCPYISNANQADHDRDGQG
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pF1KB5 DACDHDDDNDGIPDDKDNCRLVPNPDQKDSDGDGRGDACKDDFDHDSVPDIDDICPENVD
       :::: ::::::.:::.:::::: ::::.: ::::::: ::::::.:..:::::.::::  
CCDS34 DACDPDDDNDGVPDDRDNCRLVFNPDQEDLDGDGRGDICKDDFDNDNIPDIDDVCPENNA
           900       910       920       930       940       950   

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pF1KB5 ISETDFRRFQMIPLDPKGTSQNDPNWVVRHQGKELVQTVNCDPGLAVGYDEFNAVDFSGT
       ::::::: :::.:::::::.: :::::.::::::::::.: :::.:::.:::..::::::
CCDS34 ISETDFRNFQMVPLDPKGTTQIDPNWVIRHQGKELVQTANSDPGIAVGFDEFGSVDFSGT
           960       970       980       990      1000      1010   

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pF1KB5 FFINTERDDDYAGFVFGYQSSSRFYVVMWKQVTQSYWDTNPTRAQGYSGLSVKVVNSTTG
       :..::.::::::::::::::::::::::::::::.::. .:::: ::::.:.::::::::
CCDS34 FYVNTDRDDDYAGFVFGYQSSSRFYVVMWKQVTQTYWEDQPTRAYGYSGVSLKVVNSTTG
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pF1KB5 PGEHLRNALWHTGNTPGQVRTLWHDPRHIGWKDFTAYRWRLSHRPKTGFIRVVMYEGKKI
        ::::::::::::::::::::::::::.:::::.:::::.:.::::::.:::...:::..
CCDS34 TGEHLRNALWHTGNTPGQVRTLWHDPRNIGWKDYTAYRWHLTHRPKTGYIRVLVHEGKQV
          1080      1090      1100      1110      1120      1130   

            1140      1150      1160      1170
pF1KB5 MADSGPIYDKTYAGGRLGLFVFSQEMVFFSDLKYECRDP
       :::::::::.:::::::::::::::::.:::::::::: 
CCDS34 MADSGPIYDQTYAGGRLGLFVFSQEMVYFSDLKYECRDI
          1140      1150      1160      1170  

>>CCDS12385.1 COMP gene_id:1311|Hs108|chr19               (757 aa)
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Smith-Waterman score: 2620; 53.6% identity (71.6% similar) in 666 aa overlap (547-1169:87-743)

        520       530       540       550       560       570      
pF1KB5 RLCNNPTPQFGGKDCVGDVTENQICNKQDCPIDGCLSNPCFAGVKCTSYPDGSWKCGACP
                                     :.  :  . :: :: : .  .:. .:: ::
CCDS12 REITFLKNTVMECDACGMQQSVRTGLPSVRPLLHCAPGFCFPGVACIQTESGA-RCGPCP
         60        70        80        90       100        110     

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pF1KB5 PGYSGNGIQCTDVDECKEVPDACFNHNGEHRCENTDPGYNCLPCPPRFTGSQPFGQGVEH
        :..::: .::::.::.  :  :: .    :: ::.::. :  ::: ..:    : :.  
CCDS12 AGFTGNGSHCTDVNECNAHP--CFPRV---RCINTSPGFRCEACPPGYSGPTHQGVGLAF
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pF1KB5 ATANKQVCKPRNPCTDGTHDCNKNAKC-NYLGHYS-------------------------
       : ::::::   : :  : :.:  :. : :  : ..                         
CCDS12 AKANKQVCTDINECETGQHNCVPNSVCINTRGSFQCGPCQPGFVGDQASGCQRRAQRFCP
              180       190       200       210       220       230

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pF1KB5 -----------------DPMYRCECKPGYAGNGIICGEDTDLDGWPSENLVCVANATYHC
                        :    : :  :.:::::.::.::::::.:.:.: :      .:
CCDS12 DGSPSECHEHADCVLERDGSRSCVCAVGWAGNGILCGRDTDLDGFPDEKLRC---PERQC
              240       250       260       270       280          

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pF1KB5 KKDNCPNLPNSGQEDYDKDGIGDACDDDDDNDKIPDDRDNCPFHYNPAQYDYDRDDVGDR
       .:::: ..::::::: :.:::::::: : :.: .:...::::.  :: : . :.:  :: 
CCDS12 RKDNCVTVPNSGQEDVDRDGIGDACDPDADGDGVPNEKDNCPLVRNPDQRNTDEDKWGDA
       290       300       310       320       330       340       

           780       790       800       810       820       830   
pF1KB5 CDNCPYNHNPDQADTDNNGEGDACAADIDGDGILNERDNCQYVYNVDQRDTDMDGVGDQC
       ::::  ..: :: :::..:.::::  ::::: : :. :::  : : ::.:.: ::.:: :
CCDS12 CDNCRSQKNDDQKDTDQDGRGDACDDDIDGDRIRNQADNCPRVPNSDQKDSDGDGIGDAC
       350       360       370       380       390       400       

           840       850       860       870       880       890   
pF1KB5 DNCPLEHNPDQLDSDSDRIGDTCDNNQDIDEDGHQNNLDNCPYVPNANQADHDKDGKGDA
       :::: . :::: : : : .::.::..:: : ::::.. :::: :::. : : :.::.:::
CCDS12 DNCPQKSNPDQADVDHDFVGDACDSDQDQDGDGHQDSRDNCPTVPNSAQEDSDHDGQGDA
       410       420       430       440       450       460       

           900       910       920       930       940       950   
pF1KB5 CDHDDDNDGIPDDKDNCRLVPNPDQKDSDGDGRGDACKDDFDHDSVPDIDDICPENVDIS
       :: ::::::.::..::::::::: :.:.: :: ::.:.:::: :.: :  :.::::....
CCDS12 CDDDDDNDGVPDSRDNCRLVPNPGQEDADRDGVGDVCQDDFDADKVVDKIDVCPENAEVT
       470       480       490       500       510       520       

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pF1KB5 ETDFRRFQMIPLDPKGTSQNDPNWVVRHQGKELVQTVNCDPGLAVGYDEFNAVDFSGTFF
        :::: :: . :::.: .: :::::: .::.:.:::.: ::::::::  ::.::: ::: 
CCDS12 LTDFRAFQTVVLDPEGDAQIDPNWVVLNQGREIVQTMNSDPGLAVGYTAFNGVDFEGTFH
       530       540       550       560       570       580       

          1020      1030      1040      1050      1060      1070   
pF1KB5 INTERDDDYAGFVFGYQSSSRFYVVMWKQVTQSYWDTNPTRAQGYSGLSVKVVNSTTGPG
       .::  :::::::.::::.:: ::::::::. :.::..:: :: .  :...:.:.:.::::
CCDS12 VNTVTDDDYAGFIFGYQDSSSFYVVMWKQMEQTYWQANPFRAVAEPGIQLKAVKSSTGPG
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pF1KB5 EHLRNALWHTGNTPGQVRTLWHDPRHIGWKDFTAYRWRLSHRPKTGFIRVVMYEGKKIMA
       :.:::::::::.: .::: ::.:::..::::  .::: :.:::..:.::: .::: ...:
CCDS12 EQLRNALWHTGDTESQVRLLWKDPRNVGWKDKKSYRWFLQHRPQVGYIRVRFYEGPELVA
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          1140      1150      1160      1170             
pF1KB5 DSGPIYDKTYAGGRLGLFVFSQEMVFFSDLKYECRDP             
       ::. . : :. :::::.: :::: .....:.:.: :              
CCDS12 DSNVVLDTTMRGGRLGVFCFSQENIIWANLRYRCNDTIPEDYETHQLRQA
       710       720       730       740       750       

>>CCDS58034.1 THBS3 gene_id:7059|Hs108|chr1               (836 aa)
 initn: 2130 init1: 1253 opt: 2422  Z-score: 1690.7  bits: 324.3 E(32554): 7.5e-88
Smith-Waterman score: 2575; 52.3% identity (71.4% similar) in 682 aa overlap (535-1169:143-818)

          510       520       530       540       550       560    
pF1KB5 SVTCGGGVQKRSRLCNNPTPQFGGKDCVGDVTENQICNKQDCPIDGCLSNPCFAGVKCTS
                                     . : :.:. ..   . :  :::: :: :  
CCDS58 TQLTLFNQILVELRDDIRDQVKEMSLIRNTIMECQVCGFHE-QRSHCSPNPCFRGVDCME
            120       130       140       150        160       170 

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pF1KB5 -YPDGSWKCGACPPGYSGNGIQCTDVDECKEVPDACFNHNGEHRCENTDPGYNCLPCPPR
        :   ...:: :::: .::: .:.:..:: .. : ::  ..   : :: ::..:  ::  
CCDS58 VYEYPGYRCGPCPPGLQGNGTHCSDINECAHA-DPCFPGSS---CINTMPGFHCEACPRG
             180       190       200        210          220       

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pF1KB5 FTGSQPFGQGVEHATANKQVCKPRNPCTDGTHD-CNKNAKCN--------------YLGH
       . :.:  : :...: :.::::.  . :.::..  :. :. :.              .::.
CCDS58 YKGTQVSGVGIDYARASKQVCNDIDECNDGNNGGCDPNSICTNTVGSFKCGPCRLGFLGN
       230       240       250       260       270       280       

      670                                  680       690       700 
pF1KB5 YSD----------PMYR-----------------CECKPGYAGNGIICGEDTDLDGWPSE
        :.          : .                  :.:. :.:::: .:: :::.::.:..
CCDS58 QSQGCLPARTCHSPAHSPCHIHAHCLFERNGAVSCQCNVGWAGNGNVCGTDTDIDGYPDQ
       290       300       310       320       330       340       

             710       720       730       740       750       760 
pF1KB5 NLVCVANATYHCKKDNCPNLPNSGQEDYDKDGIGDACDDDDDNDKIPDDRDNCPFHYNPA
        : :. : . :::.:::   ::::::: :.::.:: :::: :.: : . .::: .  :  
CCDS58 ALPCMDN-NKHCKQDNCLLTPNSGQEDADNDGVGDQCDDDADGDGIKNVEDNCRLFPNKD
       350        360       370       380       390       400      

             770       780       790       800       810       820 
pF1KB5 QYDYDRDDVGDRCDNCPYNHNPDQADTDNNGEGDACAADIDGDGILNERDNCQYVYNVDQ
       : . : :. :: :::::   : :: :::.:::::::  :.::::: :  :::  : :  :
CCDS58 QQNSDTDSFGDACDNCPNVPNNDQKDTDGNGEGDACDNDVDGDGIPNGLDNCPKVPNPLQ
        410       420       430       440       450       460      

             830       840       850       860       870       880 
pF1KB5 RDTDMDGVGDQCDNCPLEHNPDQLDSDSDRIGDTCDNNQDIDEDGHQNNLDNCPYVPNAN
        : : ::::: ::.::   :: : :.::: .::.::.:.: : ::::.. :::: .::..
CCDS58 TDRDEDGVGDACDSCPEMSNPTQTDADSDLVGDVCDTNEDSDGDGHQDTKDNCPQLPNSS
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CCDS72 FRRQLLQGRV
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CCDS10 AVVDPLDVCPESAEVTLTDFRAYQTVVLDPEGDAQIDPNWVVLNQGMEIVQTMNSDPGLA
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CCDS10 QPGLQLKAVTSVSGPGEHLRNALWHTGHTPDQVRLLWTDPRNVGWRDKTSYRWQLLHRPQ
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       .:.::: .::: ...:::: : : .. :::::.: :::: ...:.:.:.: :        
CCDS10 VGYIRVKLYEGPQLVADSGVIIDTSMRGGRLGVFCFSQENIIWSNLQYRCNDTVPEDFEP
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CCDS10 FRRQLLQGRV
        950      

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       .::::   : :. :::::.: :::: ...:.:::.: :                   
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CCDS30 NVAGSSSTSTKLTVHVPPRIRSTEGHYTVNENSQAILPCVADGIP--TPAINWKKDNVLL
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pF1KB5 ASL--RQMKKTRGTLLALERKDHSGQVFSVVSNGKAG--TLDLSLTVQGKQHVVSVEEAL
       :.:  .   .  : :.  .   ...  .. :.:. ::  :  .::::    ::. .   :
CCDS30 ANLLGKYTAEPYGELILENVVLEDSGFYTCVANNAAGEDTHTVSLTV----HVLPTFTEL
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          .. .. ... :  .     :      ..:  . . ..::  ..   : :.    .:.
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pF1KB5 ----NDNFQGVLQNVRFVFGTTPEDILRNKGCSSSTSVL---LTLDNNVVNGSSPAIRTN
            .:  : .. . ::.   :  ....   :.    :     :. .: .  .:.:. :
CCDS30 YVCTAENSVGFVKAIGFVYVKEPP-VFKGDYPSNWIEPLGGNAILNCEVKGDPTPTIQWN
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pF1KB5 YIG------HKTKDLQ----AICG-ISCD--ELSSMVLELRGL--RTIVTTLQDSIRKVT
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       :  . . :   .  : :  .: . . .  :. .. .    .. :.. .. :  :   .. 
CCDS30 EPVETVINAGGKIILNCQATG-EPQPTITWSRQGHSISW-DDRVNVLSNNSLYIADAQKE
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       :. : :  :. :.::...::: :          : ...  .::. :. .:  :       
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CCDS64 GNPCEGPEKQTKFCNIALCPGR-AVDGNWNEWSSWSACSASCSQGRQQRTRECNGPS--Y
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CCDS64 GGAECQGHWVETRDCFLQQCPVDGKWQAWASWGSCSVTCGAGSQRRERVCSGPF--FGGA
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