Result of FASTA (omim) for pF1KB1338
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB1338, 605 aa
  1>>>pF1KB1338 605 - 605 aa - 605 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.4463+/-0.00038; mu= -8.9390+/- 0.024
 mean_var=354.3922+/-73.585, 0's: 0 Z-trim(123.4): 39  B-trim: 544 in 1/59
 Lambda= 0.068129
 statistics sampled from 43223 (43272) to 43223 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.8), E-opt: 0.2 (0.507), width:  16
 Scan time: 14.160

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_060427 (OMIM: 607264) epsin-3 [Homo sapiens]    ( 632) 2700 279.4 2.6e-74
XP_005258886 (OMIM: 607262) PREDICTED: epsin-1 iso ( 576) 1324 144.1 1.3e-33
NP_001123544 (OMIM: 607262) epsin-1 isoform b [Hom ( 576) 1324 144.1 1.3e-33
XP_016882212 (OMIM: 607262) PREDICTED: epsin-1 iso ( 636) 1324 144.1 1.4e-33
XP_016882213 (OMIM: 607262) PREDICTED: epsin-1 iso ( 636) 1324 144.1 1.4e-33
XP_011525182 (OMIM: 607262) PREDICTED: epsin-1 iso ( 575) 1322 143.9 1.4e-33
NP_001308192 (OMIM: 607262) epsin-1 isoform d [Hom ( 575) 1322 143.9 1.4e-33
NP_683723 (OMIM: 607263) epsin-2 isoform a [Homo s ( 584) 1116 123.6 1.8e-27
NP_055779 (OMIM: 607263) epsin-2 isoform b [Homo s ( 641) 1006 112.9 3.5e-24
NP_037465 (OMIM: 607262) epsin-1 isoform c [Homo s ( 550) 1001 112.3 4.4e-24
XP_016882211 (OMIM: 607262) PREDICTED: epsin-1 iso ( 550) 1001 112.3 4.4e-24
XP_011525183 (OMIM: 607262) PREDICTED: epsin-1 iso ( 551)  998 112.0 5.4e-24
XP_016882214 (OMIM: 607262) PREDICTED: epsin-1 iso ( 611)  998 112.1 5.8e-24
NP_001123543 (OMIM: 607262) epsin-1 isoform a [Hom ( 662)  998 112.1 6.2e-24
NP_055481 (OMIM: 607265) clathrin interactor 1 iso ( 625)  598 72.8 4.1e-12
NP_001182484 (OMIM: 607265) clathrin interactor 1  ( 643)  576 70.6 1.9e-11
XP_016865576 (OMIM: 607265) PREDICTED: clathrin in ( 518)  564 69.4 3.5e-11
NP_001182485 (OMIM: 607265) clathrin interactor 1  ( 625)  560 69.0 5.4e-11
XP_011533003 (OMIM: 607265) PREDICTED: clathrin in ( 536)  558 68.8 5.5e-11
XP_016865577 (OMIM: 607265) PREDICTED: clathrin in ( 468)  553 68.2 6.9e-11
NP_001096134 (OMIM: 607263) epsin-2 isoform c [Hom ( 356)  345 47.7   8e-05


>>NP_060427 (OMIM: 607264) epsin-3 [Homo sapiens]         (632 aa)
 initn: 2695 init1: 2695 opt: 2700  Z-score: 1455.1  bits: 279.4 E(85289): 2.6e-74
Smith-Waterman score: 4013; 95.6% identity (95.6% similar) in 632 aa overlap (1-605:1-632)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB1 MTTSALRRQVKNIVHNYSEAEIKVREATSNDPWGPPSSLMSEIADLTFNTVAFTEVMGML
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 MTTSALRRQVKNIVHNYSEAEIKVREATSNDPWGPPSSLMSEIADLTFNTVAFTEVMGML
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB1 WRRLNDSGKNWRHVYKALTLLDYLLKTGSERVAHQCRENLYTIQTLKDFQYIDRDGKDQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 WRRLNDSGKNWRHVYKALTLLDYLLKTGSERVAHQCRENLYTIQTLKDFQYIDRDGKDQG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB1 VNVREKVKQVMALLKDEERLRQERTHALKTKERMALEGIGIGSGQLGFSRRYGEDYSRSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 VNVREKVKQVMALLKDEERLRQERTHALKTKERMALEGIGIGSGQLGFSRRYGEDYSRSR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220                    
pF1KB1 GSPSSYNSSSSSPRYTSDLEQARPQTSGEEELQLQLALAMSREEAEK-------------
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::             
NP_060 GSPSSYNSSSSSPRYTSDLEQARPQTSGEEELQLQLALAMSREEAEKPVPPASHRDEDLQ
              190       200       210       220       230       240

                     230       240       250       260       270   
pF1KB1 --------------EVRSWQGDGSPMANGAGAVVHHQRDREPEREERKEEEKLKTSQSSI
                     ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 LQLALRLSRQEHEKEVRSWQGDGSPMANGAGAVVHHQRDREPEREERKEEEKLKTSQSSI
              250       260       270       280       290       300

           280       290       300       310       320       330   
pF1KB1 LDLADIFVPALAPPSTHCSADPWDIPGFRPNTEASGSSWGPSADPWSPIPSGTVLSRSQP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 LDLADIFVPALAPPSTHCSADPWDIPGFRPNTEASGSSWGPSADPWSPIPSGTVLSRSQP
              310       320       330       340       350       360

           340       350       360       370       380       390   
pF1KB1 WDLTPMLSSSEPWGRTPVLPAGPPTTDPWALNSPHHKLPSTGADPWGASLETSDTPGGAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 WDLTPMLSSSEPWGRTPVLPAGPPTTDPWALNSPHHKLPSTGADPWGASLETSDTPGGAS
              370       380       390       400       410       420

           400       410       420       430       440       450   
pF1KB1 TFDPFAKPPESTETKEGLEQALPSGKPSSPVELDLFGDPSPSSKQNGTKEPDALDLGILG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 TFDPFAKPPESTETKEGLEQALPSGKPSSPVELDLFGDPSPSSKQNGTKEPDALDLGILG
              430       440       450       460       470       480

           460       470       480       490       500       510   
pF1KB1 EALTQPSKEARACRTPESFLGPSASSLVNLDSLVKAPQVAKTRNPFLTGLSAPSPTNPFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 EALTQPSKEARACRTPESFLGPSASSLVNLDSLVKAPQVAKTRNPFLTGLSAPSPTNPFG
              490       500       510       520       530       540

           520       530       540       550       560       570   
pF1KB1 AGETGRPTLNQMRTGSPALGLAGGPVGAPLGSMTYSASLPLPLSSVPAGLTLPASVSVFP
       ::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 AGEPGRPTLNQMRTGSPALGLAGGPVGAPLGSMTYSASLPLPLSSVPAGLTLPASVSVFP
              550       560       570       580       590       600

           580       590       600     
pF1KB1 QAGAFAPQPLLPTPSSAGPRPPPPQTGTNPFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 QAGAFAPQPLLPTPSSAGPRPPPPQTGTNPFL
              610       620       630  

>>XP_005258886 (OMIM: 607262) PREDICTED: epsin-1 isoform  (576 aa)
 initn: 1236 init1: 876 opt: 1324  Z-score: 724.7  bits: 144.1 E(85289): 1.3e-33
Smith-Waterman score: 1433; 44.6% identity (65.2% similar) in 623 aa overlap (1-568:1-571)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB1 MTTSALRRQVKNIVHNYSEAEIKVREATSNDPWGPPSSLMSEIADLTFNTVAFTEVMGML
       :.::.::::.::::::::::::::::::::::::: :::::::::::.:.:::.:.:.:.
XP_005 MSTSSLRRQMKNIVHNYSEAEIKVREATSNDPWGPSSSLMSEIADLTYNVVAFSEIMSMI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB1 WRRLNDSGKNWRHVYKALTLLDYLLKTGSERVAHQCRENLYTIQTLKDFQYIDRDGKDQG
       :.:::: ::::::::::.::..::.:::::::..::.::.:..::::::::.::::::::
XP_005 WKRLNDHGKNWRHVYKAMTLMEYLIKTGSERVSQQCKENMYAVQTLKDFQYVDRDGKDQG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB1 VNVREKVKQVMALLKDEERLRQERTHALKTKERMALEGIGIGSGQLGFSRRYGEDYSRSR
       ::::::.::..:::.::.:::.::.:::::::..:                       . 
XP_005 VNVREKAKQLVALLRDEDRLREERAHALKTKEKLA-----------------------QT
              130       140       150                              

              190       200       210       220       230       240
pF1KB1 GSPSSYNSSSSSPRYTSDLEQARPQTSGEEELQLQLALAMSREEAEKEVRSWQGDGSPMA
       .. ::   .:. :    . ::: ::.:::::::::::::::.:::..       : . . 
XP_005 ATASSAAVGSGPP---PEAEQAWPQSSGEEELQLQLALAMSKEEADQPPSCGPEDDAQL-
       160       170          180       190       200       210    

              250       260                   270       280        
pF1KB1 NGAGAVVHHQRDREPEREERKEEEKLKTS------------QSSILDLADIFV-PALAPP
       . : .. ....:.: :: .: .. .:. .            .::..::::.:. :: :: 
XP_005 QLALSLSREEHDKE-ERIRRGDDLRLQMAIEESKRETGGKEESSLMDLADVFTAPAPAP-
           220        230       240       250       260       270  

       290       300           310            320        330       
pF1KB1 STHCSADPWDIPGFR----PNTEASGSSWG-----PSADPWS-PIPSGTVLSRSQPW-DL
           ..:::  :.      :..  ... ::     :.::::. : :.    . ..::   
XP_005 ----TTDPWGGPAPMAAAVPTAAPTSDPWGGPPVPPAADPWGGPAPTP---ASGDPWRPA
                 280       290       300       310          320    

        340       350        360              370           380    
pF1KB1 TPMLSSSEPWGRTPVLPAGP-PTTDPWA-------LNSPHHKLPSTGA----DPWGASLE
       .:   : .::: ::.  ::  :: :::.       ...:  . : : :    ::::.:  
XP_005 APAGPSVDPWGGTPAPAAGEGPTPDPWGSSDGGVPVSGPSASDPWTPAPAFSDPWGGS-P
          330       340       350       360       370       380    

          390       400       410       420       430       440    
pF1KB1 TSDTPGGASTFDPFAKPPESTETKEGLEQALPSGKPSSPVELDLFGDPSPSSKQNGTKEP
       .. . .:...   :   :.     . :. :::..  ::  ::.:..   :.      . :
XP_005 AKPSTNGTTAAGGFDTEPDEFSDFDRLRTALPTSG-SSAGELELLAGEVPA------RSP
           390       400       410        420       430            

              450       460             470       480           490
pF1KB1 DALDL----GILGEALTQPSKEARAC------RTPESFLGPSASSLVNLDSLVK----AP
        :.:.    : :.::. .:   :         .::::::::.:. ::.:::::.    .:
XP_005 GAFDMSGVRGSLAEAVGSPPPAATPTPTPPTRKTPESFLGPNAA-LVDLDSLVSRPGPTP
        440       450       460       470       480        490     

              500          510       520       530       540       
pF1KB1 QVAKTRNPFLTG---LSAPSPTNPFGAGETGRPTLNQMRTGSPALGLAGGPVG--APLGS
         ::. :::: :    ..:: ::::  .  .  ::::.:  ::.  . :.:    .:::.
XP_005 PGAKASNPFLPGGGPATGPSVTNPFQPAPPATLTLNQLRL-SPVPPVPGAPPTYISPLGG
         500       510       520       530        540       550    

         550       560       570       580       590       600     
pF1KB1 MTYSASLPLPLSSVPAGLTLPASVSVFPQAGAFAPQPLLPTPSSAGPRPPPPQTGTNPFL
          . .:: :.  .: :   : .                                     
XP_005 ---GPGLP-PM--MPPGPPAPNTNPFLL                                
              560         570                                      

>>NP_001123544 (OMIM: 607262) epsin-1 isoform b [Homo sa  (576 aa)
 initn: 1236 init1: 876 opt: 1324  Z-score: 724.7  bits: 144.1 E(85289): 1.3e-33
Smith-Waterman score: 1433; 44.6% identity (65.2% similar) in 623 aa overlap (1-568:1-571)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB1 MTTSALRRQVKNIVHNYSEAEIKVREATSNDPWGPPSSLMSEIADLTFNTVAFTEVMGML
       :.::.::::.::::::::::::::::::::::::: :::::::::::.:.:::.:.:.:.
NP_001 MSTSSLRRQMKNIVHNYSEAEIKVREATSNDPWGPSSSLMSEIADLTYNVVAFSEIMSMI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB1 WRRLNDSGKNWRHVYKALTLLDYLLKTGSERVAHQCRENLYTIQTLKDFQYIDRDGKDQG
       :.:::: ::::::::::.::..::.:::::::..::.::.:..::::::::.::::::::
NP_001 WKRLNDHGKNWRHVYKAMTLMEYLIKTGSERVSQQCKENMYAVQTLKDFQYVDRDGKDQG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB1 VNVREKVKQVMALLKDEERLRQERTHALKTKERMALEGIGIGSGQLGFSRRYGEDYSRSR
       ::::::.::..:::.::.:::.::.:::::::..:                       . 
NP_001 VNVREKAKQLVALLRDEDRLREERAHALKTKEKLA-----------------------QT
              130       140       150                              

              190       200       210       220       230       240
pF1KB1 GSPSSYNSSSSSPRYTSDLEQARPQTSGEEELQLQLALAMSREEAEKEVRSWQGDGSPMA
       .. ::   .:. :    . ::: ::.:::::::::::::::.:::..       : . . 
NP_001 ATASSAAVGSGPP---PEAEQAWPQSSGEEELQLQLALAMSKEEADQPPSCGPEDDAQL-
       160       170          180       190       200       210    

              250       260                   270       280        
pF1KB1 NGAGAVVHHQRDREPEREERKEEEKLKTS------------QSSILDLADIFV-PALAPP
       . : .. ....:.: :: .: .. .:. .            .::..::::.:. :: :: 
NP_001 QLALSLSREEHDKE-ERIRRGDDLRLQMAIEESKRETGGKEESSLMDLADVFTAPAPAP-
           220        230       240       250       260       270  

       290       300           310            320        330       
pF1KB1 STHCSADPWDIPGFR----PNTEASGSSWG-----PSADPWS-PIPSGTVLSRSQPW-DL
           ..:::  :.      :..  ... ::     :.::::. : :.    . ..::   
NP_001 ----TTDPWGGPAPMAAAVPTAAPTSDPWGGPPVPPAADPWGGPAPTP---ASGDPWRPA
                 280       290       300       310          320    

        340       350        360              370           380    
pF1KB1 TPMLSSSEPWGRTPVLPAGP-PTTDPWA-------LNSPHHKLPSTGA----DPWGASLE
       .:   : .::: ::.  ::  :: :::.       ...:  . : : :    ::::.:  
NP_001 APAGPSVDPWGGTPAPAAGEGPTPDPWGSSDGGVPVSGPSASDPWTPAPAFSDPWGGS-P
          330       340       350       360       370       380    

          390       400       410       420       430       440    
pF1KB1 TSDTPGGASTFDPFAKPPESTETKEGLEQALPSGKPSSPVELDLFGDPSPSSKQNGTKEP
       .. . .:...   :   :.     . :. :::..  ::  ::.:..   :.      . :
NP_001 AKPSTNGTTAAGGFDTEPDEFSDFDRLRTALPTSG-SSAGELELLAGEVPA------RSP
           390       400       410        420       430            

              450       460             470       480           490
pF1KB1 DALDL----GILGEALTQPSKEARAC------RTPESFLGPSASSLVNLDSLVK----AP
        :.:.    : :.::. .:   :         .::::::::.:. ::.:::::.    .:
NP_001 GAFDMSGVRGSLAEAVGSPPPAATPTPTPPTRKTPESFLGPNAA-LVDLDSLVSRPGPTP
        440       450       460       470       480        490     

              500          510       520       530       540       
pF1KB1 QVAKTRNPFLTG---LSAPSPTNPFGAGETGRPTLNQMRTGSPALGLAGGPVG--APLGS
         ::. :::: :    ..:: ::::  .  .  ::::.:  ::.  . :.:    .:::.
NP_001 PGAKASNPFLPGGGPATGPSVTNPFQPAPPATLTLNQLRL-SPVPPVPGAPPTYISPLGG
         500       510       520       530        540       550    

         550       560       570       580       590       600     
pF1KB1 MTYSASLPLPLSSVPAGLTLPASVSVFPQAGAFAPQPLLPTPSSAGPRPPPPQTGTNPFL
          . .:: :.  .: :   : .                                     
NP_001 ---GPGLP-PM--MPPGPPAPNTNPFLL                                
              560         570                                      

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                                             10        20        30
pF1KB1                               MTTSALRRQVKNIVHNYSEAEIKVREATSN
                                     :.::.::::.::::::::::::::::::::
XP_016 CQHLPQPSSGSRPISPRIGALCPLLLQPGTMSTSSLRRQMKNIVHNYSEAEIKVREATSN
               40        50        60        70        80        90

               40        50        60        70        80        90
pF1KB1 DPWGPPSSLMSEIADLTFNTVAFTEVMGMLWRRLNDSGKNWRHVYKALTLLDYLLKTGSE
       ::::: :::::::::::.:.:::.:.:.:.:.:::: ::::::::::.::..::.:::::
XP_016 DPWGPSSSLMSEIADLTYNVVAFSEIMSMIWKRLNDHGKNWRHVYKAMTLMEYLIKTGSE
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              100       110       120       130       140       150
pF1KB1 RVAHQCRENLYTIQTLKDFQYIDRDGKDQGVNVREKVKQVMALLKDEERLRQERTHALKT
       ::..::.::.:..::::::::.::::::::::::::.::..:::.::.:::.::.:::::
XP_016 RVSQQCKENMYAVQTLKDFQYVDRDGKDQGVNVREKAKQLVALLRDEDRLREERAHALKT
              160       170       180       190       200       210

              160       170       180       190       200       210
pF1KB1 KERMALEGIGIGSGQLGFSRRYGEDYSRSRGSPSSYNSSSSSPRYTSDLEQARPQTSGEE
       ::..:                       . .. ::   .:. :    . ::: ::.::::
XP_016 KEKLA-----------------------QTATASSAAVGSGPP---PEAEQAWPQSSGEE
                                     220       230          240    

              220       230       240       250       260          
pF1KB1 ELQLQLALAMSREEAEKEVRSWQGDGSPMANGAGAVVHHQRDREPEREERKEEEKLKTS-
       :::::::::::.:::..       : . . . : .. ....:.: :: .: .. .:. . 
XP_016 ELQLQLALAMSKEEADQPPSCGPEDDAQL-QLALSLSREEHDKE-ERIRRGDDLRLQMAI
          250       260       270        280        290       300  

                270       280        290       300           310   
pF1KB1 -----------QSSILDLADIFV-PALAPPSTHCSADPWDIPGFR----PNTEASGSSWG
                  .::..::::.:. :: ::     ..:::  :.      :..  ... ::
XP_016 EESKRETGGKEESSLMDLADVFTAPAPAP-----TTDPWGGPAPMAAAVPTAAPTSDPWG
            310       320       330            340       350       

                320        330        340       350        360     
pF1KB1 -----PSADPWS-PIPSGTVLSRSQPW-DLTPMLSSSEPWGRTPVLPAGP-PTTDPWA--
            :.::::. : :.    . ..::   .:   : .::: ::.  ::  :: :::.  
XP_016 GPPVPPAADPWGGPAPTP---ASGDPWRPAAPAGPSVDPWGGTPAPAAGEGPTPDPWGSS
       360       370          380       390       400       410    

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pF1KB1 -----LNSPHHKLPSTGA----DPWGASLETSDTPGGASTFDPFAKPPESTETKEGLEQA
            ...:  . : : :    ::::.:  .. . .:...   :   :.     . :. :
XP_016 DGGVPVSGPSASDPWTPAPAFSDPWGGS-PAKPSTNGTTAAGGFDTEPDEFSDFDRLRTA
          420       430       440        450       460       470   

          420       430       440           450       460          
pF1KB1 LPSGKPSSPVELDLFGDPSPSSKQNGTKEPDALDL----GILGEALTQPSKEARAC----
       ::..  ::  ::.:..   :.      . : :.:.    : :.::. .:   :       
XP_016 LPTSG-SSAGELELLAGEVPA------RSPGAFDMSGVRGSLAEAVGSPPPAATPTPTPP
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pF1KB1 --RTPESFLGPSASSLVNLDSLVK----APQVAKTRNPFLTG---LSAPSPTNPFGAGET
         .::::::::.:. ::.:::::.    .:  ::. :::: :    ..:: ::::  .  
XP_016 TRKTPESFLGPNAA-LVDLDSLVSRPGPTPPGAKASNPFLPGGGPATGPSVTNPFQPAPP
        530       540        550       560       570       580     

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pF1KB1 GRPTLNQMRTGSPALGLAGGPVG--APLGSMTYSASLPLPLSSVPAGLTLPASVSVFPQA
       .  ::::.:  ::.  . :.:    .:::.   . .:: :.  .: :   : .       
XP_016 ATLTLNQLRL-SPVPPVPGAPPTYISPLGG---GPGLP-PM--MPPGPPAPNTNPFLL  
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         580       590       600     
pF1KB1 GAFAPQPLLPTPSSAGPRPPPPQTGTNPFL

>>XP_016882213 (OMIM: 607262) PREDICTED: epsin-1 isoform  (636 aa)
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                                             10        20        30
pF1KB1                               MTTSALRRQVKNIVHNYSEAEIKVREATSN
                                     :.::.::::.::::::::::::::::::::
XP_016 CQHLPQPSSGSRPISPRIGALCPLLLQPGTMSTSSLRRQMKNIVHNYSEAEIKVREATSN
               40        50        60        70        80        90

               40        50        60        70        80        90
pF1KB1 DPWGPPSSLMSEIADLTFNTVAFTEVMGMLWRRLNDSGKNWRHVYKALTLLDYLLKTGSE
       ::::: :::::::::::.:.:::.:.:.:.:.:::: ::::::::::.::..::.:::::
XP_016 DPWGPSSSLMSEIADLTYNVVAFSEIMSMIWKRLNDHGKNWRHVYKAMTLMEYLIKTGSE
              100       110       120       130       140       150

              100       110       120       130       140       150
pF1KB1 RVAHQCRENLYTIQTLKDFQYIDRDGKDQGVNVREKVKQVMALLKDEERLRQERTHALKT
       ::..::.::.:..::::::::.::::::::::::::.::..:::.::.:::.::.:::::
XP_016 RVSQQCKENMYAVQTLKDFQYVDRDGKDQGVNVREKAKQLVALLRDEDRLREERAHALKT
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              160       170       180       190       200       210
pF1KB1 KERMALEGIGIGSGQLGFSRRYGEDYSRSRGSPSSYNSSSSSPRYTSDLEQARPQTSGEE
       ::..:                       . .. ::   .:. :    . ::: ::.::::
XP_016 KEKLA-----------------------QTATASSAAVGSGPP---PEAEQAWPQSSGEE
                                     220       230          240    

              220       230       240       250       260          
pF1KB1 ELQLQLALAMSREEAEKEVRSWQGDGSPMANGAGAVVHHQRDREPEREERKEEEKLKTS-
       :::::::::::.:::..       : . . . : .. ....:.: :: .: .. .:. . 
XP_016 ELQLQLALAMSKEEADQPPSCGPEDDAQL-QLALSLSREEHDKE-ERIRRGDDLRLQMAI
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                270       280        290       300           310   
pF1KB1 -----------QSSILDLADIFV-PALAPPSTHCSADPWDIPGFR----PNTEASGSSWG
                  .::..::::.:. :: ::     ..:::  :.      :..  ... ::
XP_016 EESKRETGGKEESSLMDLADVFTAPAPAP-----TTDPWGGPAPMAAAVPTAAPTSDPWG
            310       320       330            340       350       

                320        330        340       350        360     
pF1KB1 -----PSADPWS-PIPSGTVLSRSQPW-DLTPMLSSSEPWGRTPVLPAGP-PTTDPWA--
            :.::::. : :.    . ..::   .:   : .::: ::.  ::  :: :::.  
XP_016 GPPVPPAADPWGGPAPTP---ASGDPWRPAAPAGPSVDPWGGTPAPAAGEGPTPDPWGSS
       360       370          380       390       400       410    

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pF1KB1 -----LNSPHHKLPSTGA----DPWGASLETSDTPGGASTFDPFAKPPESTETKEGLEQA
            ...:  . : : :    ::::.:  .. . .:...   :   :.     . :. :
XP_016 DGGVPVSGPSASDPWTPAPAFSDPWGGS-PAKPSTNGTTAAGGFDTEPDEFSDFDRLRTA
          420       430       440        450       460       470   

          420       430       440           450       460          
pF1KB1 LPSGKPSSPVELDLFGDPSPSSKQNGTKEPDALDL----GILGEALTQPSKEARAC----
       ::..  ::  ::.:..   :.      . : :.:.    : :.::. .:   :       
XP_016 LPTSG-SSAGELELLAGEVPA------RSPGAFDMSGVRGSLAEAVGSPPPAATPTPTPP
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          470       480           490       500          510       
pF1KB1 --RTPESFLGPSASSLVNLDSLVK----APQVAKTRNPFLTG---LSAPSPTNPFGAGET
         .::::::::.:. ::.:::::.    .:  ::. :::: :    ..:: ::::  .  
XP_016 TRKTPESFLGPNAA-LVDLDSLVSRPGPTPPGAKASNPFLPGGGPATGPSVTNPFQPAPP
        530       540        550       560       570       580     

       520       530       540         550       560       570     
pF1KB1 GRPTLNQMRTGSPALGLAGGPVG--APLGSMTYSASLPLPLSSVPAGLTLPASVSVFPQA
       .  ::::.:  ::.  . :.:    .:::.   . .:: :.  .: :   : .       
XP_016 ATLTLNQLRL-SPVPPVPGAPPTYISPLGG---GPGLP-PM--MPPGPPAPNTNPFLL  
         590        600       610           620         630        

         580       590       600     
pF1KB1 GAFAPQPLLPTPSSAGPRPPPPQTGTNPFL

>>XP_011525182 (OMIM: 607262) PREDICTED: epsin-1 isoform  (575 aa)
 initn: 1236 init1: 876 opt: 1322  Z-score: 723.6  bits: 143.9 E(85289): 1.4e-33
Smith-Waterman score: 1433; 44.9% identity (64.7% similar) in 623 aa overlap (1-568:1-570)

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       .. ::   .:. :    . ::: ::.:::::::::::::::.:::..       : . . 
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       . : .. ....:.: :: .: .. .:. .            .::..::::.:. :: :: 
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           ..:::  :.      :..  ... ::     :.::::. : :.    . ..::   
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       .:   : .::: ::.  ::  :: :::.       ...:  . : : :    ::::.:  
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         .: :  .:   :   :.     . :. :::..  ::  ::.:..   :.      . :
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        :.:.    : :.::. .:   :         .::::::::.:. ::.:::::.    .:
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         ::. :::: :    ..:: ::::  .  .  ::::.:  ::.  . :.:    .:::.
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          . .:: :.  .: :   : .                                     
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>>NP_001308192 (OMIM: 607262) epsin-1 isoform d [Homo sa  (575 aa)
 initn: 1236 init1: 876 opt: 1322  Z-score: 723.6  bits: 143.9 E(85289): 1.4e-33
Smith-Waterman score: 1433; 44.9% identity (64.7% similar) in 623 aa overlap (1-568:1-570)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB1 MTTSALRRQVKNIVHNYSEAEIKVREATSNDPWGPPSSLMSEIADLTFNTVAFTEVMGML
       :.::.::::.::::::::::::::::::::::::: :::::::::::.:.:::.:.:.:.
NP_001 MSTSSLRRQMKNIVHNYSEAEIKVREATSNDPWGPSSSLMSEIADLTYNVVAFSEIMSMI
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       :.:::: ::::::::::.::..::.:::::::..::.::.:..::::::::.::::::::
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       .. ::   .:. :    . ::: ::.:::::::::::::::.:::..       : . . 
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NP_001 KPSTNG--TTAGGFDTEPDEFSDFDRLRTALPTSG-SSAGELELLAGEVPA------RSP
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        :.:.    : :.::. .:   :         .::::::::.:. ::.:::::.    .:
NP_001 GAFDMSGVRGSLAEAVGSPPPAATPTPTPPTRKTPESFLGPNAA-LVDLDSLVSRPGPTP
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          . .:: :.  .: :   : .                                     
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>>NP_683723 (OMIM: 607263) epsin-2 isoform a [Homo sapie  (584 aa)
 initn: 1123 init1: 929 opt: 1116  Z-score: 614.1  bits: 123.6 E(85289): 1.8e-27
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pF1KB1 MTTSALRRQVKNIVHNYSEAEIKVREATSNDPWGPPSSLMSEIADLTFNTVAFTEVMGML
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NP_683 MTTSSIRRQMKNIVNNYSEAEIKVREATSNDPWGPSSSLMTEIADLTYNVVAFSEIMSMV
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       :.:::: :::::::::::::::::.::::::::.:::::...::::::::::::::::::
NP_683 WKRLNDHGKNWRHVYKALTLLDYLIKTGSERVAQQCRENIFAIQTLKDFQYIDRDGKDQG
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       .::::: ::..:::::::::. ::..:::::::::  . :.::.:. :.:  ..      
NP_683 INVREKSKQLVALLKDEERLKAERAQALKTKERMAQVATGMGSNQITFGRGSSQPNLSTS
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pF1KB1 ----DYSRSRGSPSSYNSSSSSPRYTSDLEQARPQTSGEEELQLQLALAMSREEAEKEVR
           .:... :::.::..:.: :: .:.::::::::::::::::::::::::: ::.: :
NP_683 HSEQEYGKAGGSPASYHGSTS-PRVSSELEQARPQTSGEEELQLQLALAMSREVAEQEER
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pF1KB1 SWQGDGSPMANGAGAVVHHQRDREPEREERKEEEKLKTSQSSILDLADIFVPALAPPSTH
         .::   .      .. ..  :.  .  .:.:.    .:...::: : . :. .: . .
NP_683 LRRGDDLRLQ-----MALEESRRDTVKIPKKKEHGSLPQQTTLLDLMDAL-PSSGPAAQK
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pF1KB1 CSADPWDIPGFRPNTEASGSSWGPSADPWSPIPSGTVLSRSQPWDL--TPMLSSSEPWGR
         :.::   :   .:. . . ::  : :          : :.::    :   .: .::: 
NP_683 --AEPW---GPSASTNQT-NPWGGPAAP---------ASTSDPWPSFGTKPAASIDPWG-
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pF1KB1 TPV---LPAGPPTTDPWALNS-PHHKLPSTGADPWGASLETSDTPGGASTFDPFAKPPES
       .:.   . . : ..:::: .. :  .  . ..: ::: . :.   . ...:. :..   .
NP_683 VPTGATVQSVPKNSDPWAASQQPASSAGKRASDAWGA-VSTTKPVSVSGSFELFSNLNGT
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pF1KB1 TETKEGLEQALPSGKPSSPVELDLFGDPSPSSKQNGTKEPDALDLGILGEALTQPSKEAR
        .   .  . : ..: ..    .:     :: ..:::  :: ..   :  : ..::. ::
NP_683 IKDDFSEFDNLRTSKKTAESVTSL-----PS-QNNGTTSPDPFESQPLTVASSKPSS-AR
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pF1KB1 ACRTPESFLGPSASSLVNLDSLVKAPQV-AKTRNPFLT-GLSAPS-PTNPFGAGETGRPT
         .::::::::.:. ::::::::  :   :.. ::::. :  : : :.::: ...    :
NP_683 --KTPESFLGPNAA-LVNLDSLVTRPAPPAQSLNPFLAPGAPATSAPVNPFQVNQPQPLT
       450       460        470       480       490       500      

             530         540       550       560       570         
pF1KB1 LNQMRTGSPALGLAG--GPVGAPLGSMTYSASLPLPLSSVPAGLTLPASVSVFPQAGAFA
       :::.: :::.:: .   :: :  . ::.  ::.    :..:      .. :. : . :  
NP_683 LNQLR-GSPVLGTSTSFGP-GPGVESMAV-ASMT---SAAPQPALGATGSSLTPLGPA--
        510        520        530           540       550          

     580       590        600       
pF1KB1 PQPLLPTPSSAGPRPPPPQ-TGT-NPFL 
          ..   .:.:  :   : ::: :::: 
NP_683 ---MMNMVGSVGIPPSAAQATGTTNPFLL
         560       570       580    

>>NP_055779 (OMIM: 607263) epsin-2 isoform b [Homo sapie  (641 aa)
 initn: 1123 init1: 929 opt: 1006  Z-score: 555.1  bits: 112.9 E(85289): 3.5e-24
Smith-Waterman score: 1400; 43.7% identity (63.9% similar) in 664 aa overlap (1-575:1-629)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB1 MTTSALRRQVKNIVHNYSEAEIKVREATSNDPWGPPSSLMSEIADLTFNTVAFTEVMGML
       ::::..:::.::::.:::::::::::::::::::: ::::.::::::.:.:::.:.:.:.
NP_055 MTTSSIRRQMKNIVNNYSEAEIKVREATSNDPWGPSSSLMTEIADLTYNVVAFSEIMSMV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB1 WRRLNDSGKNWRHVYKALTLLDYLLKTGSERVAHQCRENLYTIQTLKDFQYIDRDGKDQG
       :.:::: :::::::::::::::::.::::::::.:::::...::::::::::::::::::
NP_055 WKRLNDHGKNWRHVYKALTLLDYLIKTGSERVAQQCRENIFAIQTLKDFQYIDRDGKDQG
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pF1KB1 VNVREKVKQVMALLKDEERLRQERTHALKTKERMALEGIGIGSGQLGFSRRYGE------
       .::::: ::..:::::::::. ::..:::::::::  . :.::.:. :.:  ..      
NP_055 INVREKSKQLVALLKDEERLKAERAQALKTKERMAQVATGMGSNQITFGRGSSQPNLSTS
              130       140       150       160       170       180

              180                                                  
pF1KB1 ----DYSRSRGSPSSYNSS-----------------------------------------
           .:... :::.::..:                                         
NP_055 HSEQEYGKAGGSPASYHGSPEASLCPQHRTGAPLGQSEELQPLSQRHPFLPHLGLASRPN
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                    190       200       210       220       230    
pF1KB1 ---------------SSSPRYTSDLEQARPQTSGEEELQLQLALAMSREEAEKEVRSWQG
                      ..::: .:.::::::::::::::::::::::::: ::.: :  .:
NP_055 GDWSQPCLTCDRAARATSPRVSSELEQARPQTSGEEELQLQLALAMSREVAEQEERLRRG
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          240       250       260       270       280       290    
pF1KB1 DGSPMANGAGAVVHHQRDREPEREERKEEEKLKTSQSSILDLADIFVPALAPPSTHCSAD
       :   .      .....: :.  .  .:.:.    .:...::: : . :. .: .   .:.
NP_055 DDLRLQ----MALEESR-RDTVKIPKKKEHGSLPQQTTLLDLMDAL-PSSGPAAQ--KAE
                  310        320       330       340          350  

          300       310       320       330         340       350  
pF1KB1 PWDIPGFRPNTEASGSSWGPSADPWSPIPSGTVLSRSQPWDL--TPMLSSSEPWGRTPV-
       ::  :.   :   . . ::  : :          : :.::    :   .: .::: .:. 
NP_055 PWG-PSASTN---QTNPWGGPAAP---------ASTSDPWPSFGTKPAASIDPWG-VPTG
             360          370                380       390         

               360        370       380       390       400        
pF1KB1 --LPAGPPTTDPWALNS-PHHKLPSTGADPWGASLETSDTPGGASTFDPFAKPPESTETK
         . . : ..:::: .. :  .  . ..: ::: . :.   . ...:. :..   . .  
NP_055 ATVQSVPKNSDPWAASQQPASSAGKRASDAWGA-VSTTKPVSVSGSFELFSNLNGTIKDD
      400       410       420       430        440       450       

      410       420       430       440       450       460        
pF1KB1 EGLEQALPSGKPSSPVELDLFGDPSPSSKQNGTKEPDALDLGILGEALTQPSKEARACRT
        .  . : ..: ..    .:   :   :..:::  :: ..   :  : ..::. ::  .:
NP_055 FSEFDNLRTSKKTAESVTSL---P---SQNNGTTSPDPFESQPLTVASSKPSS-AR--KT
       460       470             480       490       500           

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pF1KB1 PESFLGPSASSLVNLDSLVKAPQV-AKTRNPFLT-GLSAPS-PTNPFGAGETGRPTLNQM
       :::::::.:. ::::::::  :   :.. ::::. :  : : :.::: ...    ::::.
NP_055 PESFLGPNAA-LVNLDSLVTRPAPPAQSLNPFLAPGAPATSAPVNPFQVNQPQPLTLNQL
      510        520       530       540       550       560       

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pF1KB1 RTGSPALGLAG--GPVGAPLGSM---TYSASLPLPL-----SSV----PAGLTLPASVSV
       : :::.:: .   :: :  . ::   ..... : :      ::.    :: ... .::..
NP_055 R-GSPVLGTSTSFGP-GPGVESMAVASMTSAAPQPALGATGSSLTPLGPAMMNMVGSVGI
        570       580        590       600       610       620     

             580       590       600     
pF1KB1 FPQAGAFAPQPLLPTPSSAGPRPPPPQTGTNPFL
        :.:                              
NP_055 PPSAAQATGTTNPFLL                  
         630       640                   

>>NP_037465 (OMIM: 607262) epsin-1 isoform c [Homo sapie  (550 aa)
 initn: 1257 init1: 876 opt: 1001  Z-score: 553.4  bits: 112.3 E(85289): 4.4e-24
Smith-Waterman score: 1440; 46.0% identity (64.3% similar) in 611 aa overlap (1-568:1-545)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB1 MTTSALRRQVKNIVHNYSEAEIKVREATSNDPWGPPSSLMSEIADLTFNTVAFTEVMGML
       :.::.::::.::::::::::::::::::::::::: :::::::::::.:.:::.:.:.:.
NP_037 MSTSSLRRQMKNIVHNYSEAEIKVREATSNDPWGPSSSLMSEIADLTYNVVAFSEIMSMI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB1 WRRLNDSGKNWRHVYKALTLLDYLLKTGSERVAHQCRENLYTIQTLKDFQYIDRDGKDQG
       :.:::: ::::::::::.::..::.:::::::..::.::.:..::::::::.::::::::
NP_037 WKRLNDHGKNWRHVYKAMTLMEYLIKTGSERVSQQCKENMYAVQTLKDFQYVDRDGKDQG
               70        80        90       100       110       120

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pF1KB1 VNVREKVKQVMALLKDEERLRQERTHALKTKERMALEGIGIGSGQLGFSRRYGEDYSRSR
       ::::::.::..:::.::.:::.::.:::::::..:                       . 
NP_037 VNVREKAKQLVALLRDEDRLREERAHALKTKEKLA-----------------------QT
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              190       200       210       220       230       240
pF1KB1 GSPSSYNSSSSSPRYTSDLEQARPQTSGEEELQLQLALAMSREEAEKEVRSWQGDGSPMA
       .. ::   .:. :    . ::: ::.:::::::::::::::.:::..: :  .::   . 
NP_037 ATASSAAVGSGPP---PEAEQAWPQSSGEEELQLQLALAMSKEEADQEERIRRGDDLRLQ
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pF1KB1 NGAGAVVHHQRDREPEREERKEEEKLKTSQSSILDLADIFV-PALAPPSTHCSADPWDIP
        .          .: .::   .::      ::..::::.:. :: ::     ..:::  :
NP_037 MAI---------EESKRETGGKEE------SSLMDLADVFTAPAPAP-----TTDPWGGP
                   220             230       240            250    

     300           310            320        330        340        
pF1KB1 GFR----PNTEASGSSWG-----PSADPWS-PIPSGTVLSRSQPW-DLTPMLSSSEPWGR
       .      :..  ... ::     :.::::. : :.    . ..::   .:   : .::: 
NP_037 APMAAAVPTAAPTSDPWGGPPVPPAADPWGGPAPTP---ASGDPWRPAAPAGPSVDPWGG
          260       270       280       290          300       310 

      350        360              370           380       390      
pF1KB1 TPVLPAGP-PTTDPWA-------LNSPHHKLPSTGA----DPWGASLETSDTPGGASTFD
       ::.  ::  :: :::.       ...:  . : : :    ::::.:    .: :  .:  
NP_037 TPAPAAGEGPTPDPWGSSDGGVPVSGPSASDPWTPAPAFSDPWGGSPAKPSTNG--TTAG
             320       330       340       350       360           

        400       410       420       430       440           450  
pF1KB1 PFAKPPESTETKEGLEQALPSGKPSSPVELDLFGDPSPSSKQNGTKEPDALDL----GIL
        :   :.     . :. :::..  ::  ::.:..   :.      . : :.:.    : :
NP_037 GFDTEPDEFSDFDRLRTALPTSG-SSAGELELLAGEVPA------RSPGAFDMSGVRGSL
     370       380       390        400             410       420  

            460             470       480           490       500  
pF1KB1 GEALTQPSKEARAC------RTPESFLGPSASSLVNLDSLVK----APQVAKTRNPFLTG
       .::. .:   :         .::::::::.:. ::.:::::.    .:  ::. :::: :
NP_037 AEAVGSPPPAATPTPTPPTRKTPESFLGPNAA-LVDLDSLVSRPGPTPPGAKASNPFLPG
            430       440       450        460       470       480 

               510       520       530       540         550       
pF1KB1 ---LSAPSPTNPFGAGETGRPTLNQMRTGSPALGLAGGPVG--APLGSMTYSASLPLPLS
           ..:: ::::  .  .  ::::.:  ::.  . :.:    .:::.   . .:: :. 
NP_037 GGPATGPSVTNPFQPAPPATLTLNQLRL-SPVPPVPGAPPTYISPLGG---GPGLP-PM-
             490       500        510       520          530       

       560       570       580       590       600     
pF1KB1 SVPAGLTLPASVSVFPQAGAFAPQPLLPTPSSAGPRPPPPQTGTNPFL
        .: :   : .                                     
NP_037 -MPPGPPAPNTNPFLL                                
          540       550                                




605 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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