Result of FASTA (omim) for pF1KSDA1027
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA1027, 2541 aa
  1>>>pF1KSDA1027 2541 - 2541 aa - 2541 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5158+/-0.000508; mu= 15.7634+/- 0.032
 mean_var=138.1304+/-28.258, 0's: 0 Z-trim(111.3): 251  B-trim: 992 in 1/55
 Lambda= 0.109126
 statistics sampled from 19620 (19894) to 19620 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.568), E-opt: 0.2 (0.233), width:  16
 Scan time: 22.100

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_006280 (OMIM: 186745) talin-1 [Homo sapiens]    (2541) 16015 2535.1       0
NP_055874 (OMIM: 607349) talin-2 [Homo sapiens]    (2542) 12507 1982.8       0
XP_016878157 (OMIM: 607349) PREDICTED: talin-2 iso (2542) 12507 1982.8       0
XP_006720780 (OMIM: 607349) PREDICTED: talin-2 iso (2557) 12120 1921.9       0
XP_016878156 (OMIM: 607349) PREDICTED: talin-2 iso (2557) 12120 1921.9       0
XP_005254768 (OMIM: 607349) PREDICTED: talin-2 iso (2557) 12120 1921.9       0
XP_005254765 (OMIM: 607349) PREDICTED: talin-2 iso (2557) 12120 1921.9       0
XP_005254767 (OMIM: 607349) PREDICTED: talin-2 iso (2557) 12120 1921.9       0
XP_005254769 (OMIM: 607349) PREDICTED: talin-2 iso (2557) 12120 1921.9       0
XP_016878155 (OMIM: 607349) PREDICTED: talin-2 iso (2557) 12120 1921.9       0
XP_016878154 (OMIM: 607349) PREDICTED: talin-2 iso (2557) 12120 1921.9       0
XP_005254770 (OMIM: 607349) PREDICTED: talin-2 iso (2557) 12120 1921.9       0
XP_005254772 (OMIM: 607349) PREDICTED: talin-2 iso (2557) 12120 1921.9       0
XP_005254771 (OMIM: 607349) PREDICTED: talin-2 iso (2557) 12120 1921.9       0
XP_016878158 (OMIM: 607349) PREDICTED: talin-2 iso (2512) 6807 1085.5       0
XP_005250362 (OMIM: 176807,601767) PREDICTED: hunt (1003)  382 73.7 1.4e-11
XP_005250361 (OMIM: 176807,601767) PREDICTED: hunt (1008)  382 73.7 1.4e-11
XP_016867588 (OMIM: 176807,601767) PREDICTED: hunt (1023)  382 73.7 1.4e-11
XP_011514418 (OMIM: 176807,601767) PREDICTED: hunt (1037)  382 73.7 1.5e-11
NP_005329 (OMIM: 176807,601767) huntingtin-interac (1037)  382 73.7 1.5e-11
XP_011537265 (OMIM: 605613) PREDICTED: huntingtin- (1056)  372 72.1 4.4e-11
NP_003950 (OMIM: 605613) huntingtin-interacting pr (1068)  372 72.1 4.5e-11
NP_072088 (OMIM: 615466) mesoderm development cand ( 362)  362 70.3 5.5e-11
NP_001230127 (OMIM: 176807,601767) huntingtin-inte ( 986)  284 58.3 6.2e-07
NP_002821 (OMIM: 176878) tyrosine-protein phosphat ( 926)  241 51.5 6.4e-05
XP_016860089 (OMIM: 176878) PREDICTED: tyrosine-pr ( 926)  241 51.5 6.4e-05
NP_002897 (OMIM: 179410,611022) radixin isoform 2  ( 583)  235 50.4 8.4e-05
NP_001247421 (OMIM: 179410,611022) radixin isoform ( 604)  235 50.4 8.7e-05
NP_001247422 (OMIM: 179410,611022) radixin isoform ( 604)  235 50.4 8.7e-05
XP_016884299 (OMIM: 101000,162091,607174,607379) P ( 552)  233 50.1  0.0001
XP_016884298 (OMIM: 101000,162091,607174,607379) P ( 557)  233 50.1  0.0001
NP_057502 (OMIM: 101000,162091,607174,607379) merl ( 590)  233 50.1 0.00011
NP_861970 (OMIM: 101000,162091,607174,607379) merl ( 590)  233 50.1 0.00011
NP_861546 (OMIM: 101000,162091,607174,607379) merl ( 590)  233 50.1 0.00011
NP_000259 (OMIM: 101000,162091,607174,607379) merl ( 595)  233 50.1 0.00011
XP_016860087 (OMIM: 176878) PREDICTED: tyrosine-pr ( 933)  235 50.5 0.00012
XP_016885035 (OMIM: 309845) PREDICTED: moesin isof ( 566)  231 49.8 0.00013
XP_016885034 (OMIM: 309845) PREDICTED: moesin isof ( 566)  231 49.8 0.00013
NP_002435 (OMIM: 309845) moesin [Homo sapiens]     ( 577)  231 49.8 0.00013
XP_005262326 (OMIM: 309845) PREDICTED: moesin isof ( 578)  231 49.8 0.00013
XP_011529261 (OMIM: 309845) PREDICTED: moesin isof ( 610)  231 49.8 0.00014
XP_016860088 (OMIM: 176878) PREDICTED: tyrosine-pr ( 933)  229 49.6 0.00024
XP_011509862 (OMIM: 176878) PREDICTED: tyrosine-pr ( 933)  229 49.6 0.00024
NP_001104547 (OMIM: 123900) ezrin [Homo sapiens]   ( 586)  223 48.5 0.00031
NP_003370 (OMIM: 123900) ezrin [Homo sapiens]      ( 586)  223 48.5 0.00031
XP_016860086 (OMIM: 176878) PREDICTED: tyrosine-pr ( 940)  223 48.6 0.00046
XP_016860085 (OMIM: 176878) PREDICTED: tyrosine-pr ( 940)  223 48.6 0.00046
NP_861966 (OMIM: 101000,162091,607174,607379) merl ( 548)  217 47.6 0.00057
XP_016865178 (OMIM: 612141) PREDICTED: band 4.1-li ( 658)  217 47.6 0.00066
XP_011541835 (OMIM: 612141) PREDICTED: band 4.1-li ( 680)  217 47.6 0.00068


>>NP_006280 (OMIM: 186745) talin-1 [Homo sapiens]         (2541 aa)
 initn: 16015 init1: 16015 opt: 16015  Z-score: 13624.2  bits: 2535.1 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 16015; 100.0% identity (100.0% similar) in 2541 aa overlap (1-2541:1-2541)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MVALSLKISIGNVVKTMQFEPSTMVYDACRIIRERIPEAPAGPPSDFGLFLSDDDPKKGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MVALSLKISIGNVVKTMQFEPSTMVYDACRIIRERIPEAPAGPPSDFGLFLSDDDPKKGI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD WLEAGKALDYYMLRNGDTMEYRKKQRPLKIRMLDGTVKTIMVDDSKTVTDMLMTICARIG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 WLEAGKALDYYMLRNGDTMEYRKKQRPLKIRMLDGTVKTIMVDDSKTVTDMLMTICARIG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD ITNHDEYSLVRELMEEKKEEITGTLRKDKTLLRDEKKMEKLKQKLHTDDELNWLDHGRTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 ITNHDEYSLVRELMEEKKEEITGTLRKDKTLLRDEKKMEKLKQKLHTDDELNWLDHGRTL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD REQGVEEHETLLLRRKFFYSDQNVDSRDPVQLNLLYVQARDDILNGSHPVSFDKACEFAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 REQGVEEHETLLLRRKFFYSDQNVDSRDPVQLNLLYVQARDDILNGSHPVSFDKACEFAG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD FQCQIQFGPHNEQKHKAGFLDLKDFLPKEYVKQKGERKIFQAHKNCGQMSEIEAKVRYVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 FQCQIQFGPHNEQKHKAGFLDLKDFLPKEYVKQKGERKIFQAHKNCGQMSEIEAKVRYVK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD LARSLKTYGVSFFLVKEKMKGKNKLVPRLLGITKECVMRVDEKTKEVIQEWNLTNIKRWA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LARSLKTYGVSFFLVKEKMKGKNKLVPRLLGITKECVMRVDEKTKEVIQEWNLTNIKRWA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD ASPKSFTLDFGDYQDGYYSVQTTEGEQIAQLIAGYIDIILKKKKSKDHFGLEGDEESTML
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 ASPKSFTLDFGDYQDGYYSVQTTEGEQIAQLIAGYIDIILKKKKSKDHFGLEGDEESTML
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD EDSVSPKKSTVLQQQYNRVGKVEHGSVALPAIMRSGASGPENFQVGSMPPAQQQITSGQM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 EDSVSPKKSTVLQQQYNRVGKVEHGSVALPAIMRSGASGPENFQVGSMPPAQQQITSGQM
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD HRGHMPPLTSAQQALTGTINSSMQAVQAAQATLDDFDTLPPLGQDAASKAWRKNKMDESK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 HRGHMPPLTSAQQALTGTINSSMQAVQAAQATLDDFDTLPPLGQDAASKAWRKNKMDESK
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD HEIHSQVDAITAGTASVVNLTAGDPAETDYTAVGCAVTTISSNLTEMSRGVKLLAALLED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 HEIHSQVDAITAGTASVVNLTAGDPAETDYTAVGCAVTTISSNLTEMSRGVKLLAALLED
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD EGGSGRPLLQAAKGLAGAVSELLRSAQPASAEPRQNLLQAAGNVGQASGELLQQIGESDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 EGGSGRPLLQAAKGLAGAVSELLRSAQPASAEPRQNLLQAAGNVGQASGELLQQIGESDT
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD DPHFQDALMQLAKAVASAAAALVLKAKSVAQRTEDSGLQTQVIAAATQCALSTSQLVACT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 DPHFQDALMQLAKAVASAAAALVLKAKSVAQRTEDSGLQTQVIAAATQCALSTSQLVACT
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD KVVAPTISSPVCQEQLVEAGRLVAKAVEGCVSASQAATEDGQLLRGVGAAATAVTQALNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 KVVAPTISSPVCQEQLVEAGRLVAKAVEGCVSASQAATEDGQLLRGVGAAATAVTQALNE
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD LLQHVKAHATGAGPAGRYDQATDTILTVTENIFSSMGDAGEMVRQARILAQATSDLVNAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LLQHVKAHATGAGPAGRYDQATDTILTVTENIFSSMGDAGEMVRQARILAQATSDLVNAI
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD KADAEGESDLENSRKLLSAAKILADATAKMVEAAKGAAAHPDSEEQQQRLREAAEGLRMA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 KADAEGESDLENSRKLLSAAKILADATAKMVEAAKGAAAHPDSEEQQQRLREAAEGLRMA
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD TNAAAQNAIKKKLVQRLEHAAKQAAASATQTIAAAQHAASTPKASAGPQPLLVQSCKAVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 TNAAAQNAIKKKLVQRLEHAAKQAAASATQTIAAAQHAASTPKASAGPQPLLVQSCKAVA
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD EQIPLLVQGVRGSQAQPDSPSAQLALIAASQSFLQPGGKMVAAAKASVPTIQDQASAMQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 EQIPLLVQGVRGSQAQPDSPSAQLALIAASQSFLQPGGKMVAAAKASVPTIQDQASAMQL
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD SQCAKNLGTALAELRTAAQKAQEACGPLEMDSALSVVQNLEKDLQEVKAAARDGKLKPLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 SQCAKNLGTALAELRTAAQKAQEACGPLEMDSALSVVQNLEKDLQEVKAAARDGKLKPLP
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KSD GETMEKCTQDLGNSTKAVSSAIAQLLGEVAQGNENYAGIAARDVAGGLRSLAQAARGVAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 GETMEKCTQDLGNSTKAVSSAIAQLLGEVAQGNENYAGIAARDVAGGLRSLAQAARGVAA
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KSD LTSDPAVQAIVLDTASDVLDKASSLIEEAKKAAGHPGDPESQQRLAQVAKAVTQALNRCV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LTSDPAVQAIVLDTASDVLDKASSLIEEAKKAAGHPGDPESQQRLAQVAKAVTQALNRCV
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KSD SCLPGQRDVDNALRAVGDASKRLLSDSLPPSTGTFQEAQSRLNEAAAGLNQAATELVQAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 SCLPGQRDVDNALRAVGDASKRLLSDSLPPSTGTFQEAQSRLNEAAAGLNQAATELVQAS
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KSD RGTPQDLARASGRFGQDFSTFLEAGVEMAGQAPSQEDRAQVVSNLKGISMSSSKLLLAAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 RGTPQDLARASGRFGQDFSTFLEAGVEMAGQAPSQEDRAQVVSNLKGISMSSSKLLLAAK
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KSD ALSTDPAAPNLKSQLAAAARAVTDSINQLITMCTQQAPGQKECDNALRELETVRELLENP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 ALSTDPAAPNLKSQLAAAARAVTDSINQLITMCTQQAPGQKECDNALRELETVRELLENP
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KSD VQPINDMSYFGCLDSVMENSKVLGEAMTGISQNAKNGNLPEFGDAISTASKALCGFTEAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 VQPINDMSYFGCLDSVMENSKVLGEAMTGISQNAKNGNLPEFGDAISTASKALCGFTEAA
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KSD AQAAYLVGVSDPNSQAGQQGLVEPTQFARANQAIQMACQSLGEPGCTQAQVLSAATIVAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 AQAAYLVGVSDPNSQAGQQGLVEPTQFARANQAIQMACQSLGEPGCTQAQVLSAATIVAK
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KSD HTSALCNSCRLASARTTNPTAKRQFVQSAKEVANSTANLVKTIKALDGAFTEENRAQCRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 HTSALCNSCRLASARTTNPTAKRQFVQSAKEVANSTANLVKTIKALDGAFTEENRAQCRA
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KSD ATAPLLEAVDNLSAFASNPEFSSIPAQISPEGRAAMEPIVISAKTMLESAGGLIQTARAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 ATAPLLEAVDNLSAFASNPEFSSIPAQISPEGRAAMEPIVISAKTMLESAGGLIQTARAL
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1630      1640      1650      1660      1670      1680
pF1KSD AVNPRDPPSWSVLAGHSRTVSDSIKKLITSMRDKAPGQLECETAIAALNSCLRDLDQASL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 AVNPRDPPSWSVLAGHSRTVSDSIKKLITSMRDKAPGQLECETAIAALNSCLRDLDQASL
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

             1690      1700      1710      1720      1730      1740
pF1KSD AAVSQQLAPREGISQEALHTQMLTAVQEISHLIEPLANAARAEASQLGHKVSQMAQYFEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 AAVSQQLAPREGISQEALHTQMLTAVQEISHLIEPLANAARAEASQLGHKVSQMAQYFEP
             1690      1700      1710      1720      1730      1740

             1750      1760      1770      1780      1790      1800
pF1KSD LTLAAVGAASKTLSHPQQMALLDQTKTLAESALQLLYTAKEAGGNPKQAAHTQEALEEAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LTLAAVGAASKTLSHPQQMALLDQTKTLAESALQLLYTAKEAGGNPKQAAHTQEALEEAV
             1750      1760      1770      1780      1790      1800

             1810      1820      1830      1840      1850      1860
pF1KSD QMMTEAVEDLTTTLNEAASAAGVVGGMVDSITQAINQLDEGPMGEPEGSFVDYQTTMVRT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 QMMTEAVEDLTTTLNEAASAAGVVGGMVDSITQAINQLDEGPMGEPEGSFVDYQTTMVRT
             1810      1820      1830      1840      1850      1860

             1870      1880      1890      1900      1910      1920
pF1KSD AKAIAVTVQEMVTKSNTSPEELGPLANQLTSDYGRLASEAKPAAVAAENEEIGSHIKHRV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 AKAIAVTVQEMVTKSNTSPEELGPLANQLTSDYGRLASEAKPAAVAAENEEIGSHIKHRV
             1870      1880      1890      1900      1910      1920

             1930      1940      1950      1960      1970      1980
pF1KSD QELGHGCAALVTKAGALQCSPSDAYTKKELIECARRVSEKVSHVLAALQAGNRGTQACIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 QELGHGCAALVTKAGALQCSPSDAYTKKELIECARRVSEKVSHVLAALQAGNRGTQACIT
             1930      1940      1950      1960      1970      1980

             1990      2000      2010      2020      2030      2040
pF1KSD AASAVSGIIADLDTTIMFATAGTLNREGTETFADHREGILKTAKVLVEDTKVLVQNAAGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 AASAVSGIIADLDTTIMFATAGTLNREGTETFADHREGILKTAKVLVEDTKVLVQNAAGS
             1990      2000      2010      2020      2030      2040

             2050      2060      2070      2080      2090      2100
pF1KSD QEKLAQAAQSSVATITRLADVVKLGAASLGAEDPETQVVLINAVKDVAKALGDLISATKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 QEKLAQAAQSSVATITRLADVVKLGAASLGAEDPETQVVLINAVKDVAKALGDLISATKA
             2050      2060      2070      2080      2090      2100

             2110      2120      2130      2140      2150      2160
pF1KSD AAGKVGDDPAVWQLKNSAKVMVTNVTSLLKTVKAVEDEATKGTRALEATTEHIRQELAVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 AAGKVGDDPAVWQLKNSAKVMVTNVTSLLKTVKAVEDEATKGTRALEATTEHIRQELAVF
             2110      2120      2130      2140      2150      2160

             2170      2180      2190      2200      2210      2220
pF1KSD CSPEPPAKTSTPEDFIRMTKGITMATAKAVAAGNSCRQEDVIATANLSRRAIADMLRACK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 CSPEPPAKTSTPEDFIRMTKGITMATAKAVAAGNSCRQEDVIATANLSRRAIADMLRACK
             2170      2180      2190      2200      2210      2220

             2230      2240      2250      2260      2270      2280
pF1KSD EAAYHPEVAPDVRLRALHYGRECANGYLELLDHVLLTLQKPSPELKQQLTGHSKRVAGSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 EAAYHPEVAPDVRLRALHYGRECANGYLELLDHVLLTLQKPSPELKQQLTGHSKRVAGSV
             2230      2240      2250      2260      2270      2280

             2290      2300      2310      2320      2330      2340
pF1KSD TELIQAAEAMKGTEWVDPEDPTVIAENELLGAAAAIEAAAKKLEQLKPRAKPKEADESLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 TELIQAAEAMKGTEWVDPEDPTVIAENELLGAAAAIEAAAKKLEQLKPRAKPKEADESLN
             2290      2300      2310      2320      2330      2340

             2350      2360      2370      2380      2390      2400
pF1KSD FEEQILEAAKSIAAATSALVKAASAAQRELVAQGKVGAIPANALDDGQWSQGLISAARMV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 FEEQILEAAKSIAAATSALVKAASAAQRELVAQGKVGAIPANALDDGQWSQGLISAARMV
             2350      2360      2370      2380      2390      2400

             2410      2420      2430      2440      2450      2460
pF1KSD AAATNNLCEAANAAVQGHASQEKLISSAKQVAASTAQLLVACKVKADQDSEAMKRLQAAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 AAATNNLCEAANAAVQGHASQEKLISSAKQVAASTAQLLVACKVKADQDSEAMKRLQAAG
             2410      2420      2430      2440      2450      2460

             2470      2480      2490      2500      2510      2520
pF1KSD NAVKRASDNLVKAAQKAAAFEEQENETVVVKEKMVGGIAQIIAAQEEMLRKERELEEARK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 NAVKRASDNLVKAAQKAAAFEEQENETVVVKEKMVGGIAQIIAAQEEMLRKERELEEARK
             2470      2480      2490      2500      2510      2520

             2530      2540 
pF1KSD KLAQIRQQQYKFLPSELRDEH
       :::::::::::::::::::::
NP_006 KLAQIRQQQYKFLPSELRDEH
             2530      2540 

>>NP_055874 (OMIM: 607349) talin-2 [Homo sapiens]         (2542 aa)
 initn: 5388 init1: 5087 opt: 12507  Z-score: 10639.4  bits: 1982.8 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 12507; 76.1% identity (93.2% similar) in 2543 aa overlap (1-2540:1-2540)

               10          20        30        40        50        
pF1KSD MVALSLKISIG--NVVKTMQFEPSTMVYDACRIIRERIPEAPAGPPSDFGLFLSDDDPKK
       :::::::: .   :::::::::::: ::::::.::::.::: .:  ::.::::::.::.:
NP_055 MVALSLKICVRHCNVVKTMQFEPSTAVYDACRVIRERVPEAQTGQASDYGLFLSDEDPRK
               10        20        30        40        50        60

       60        70        80        90       100       110        
pF1KSD GIWLEAGKALDYYMLRNGDTMEYRKKQRPLKIRMLDGTVKTIMVDDSKTVTDMLMTICAR
       :::::::..:::::::::: .::.::::: :::::::.:::.:::::::: ..:.:::.:
NP_055 GIWLEAGRTLDYYMLRNGDILEYKKKQRPQKIRMLDGSVKTVMVDDSKTVGELLVTICSR
               70        80        90       100       110       120

      120       130       140       150       160       170        
pF1KSD IGITNHDEYSLVRELMEEKKEEITGTLRKDKTLLRDEKKMEKLKQKLHTDDELNWLDHGR
       :::::..::::..: .:::::: ::::.::.::::::.:::::: ::::::.::::::.:
NP_055 IGITNYEEYSLIQETIEEKKEEGTGTLKKDRTLLRDERKMEKLKAKLHTDDDLNWLDHSR
              130       140       150       160       170       180

      180       190       200       210       220       230        
pF1KSD TLREQGVEEHETLLLRRKFFYSDQNVDSRDPVQLNLLYVQARDDILNGSHPVSFDKACEF
       :.:::::.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
NP_055 TFREQGVDENETLLLRRKFFYSDQNVDSRDPVQLNLLYVQARDDILNGSHPVSFEKACEF
              190       200       210       220       230       240

      240       250       260       270        280       290       
pF1KSD AGFQCQIQFGPHNEQKHKAGFLDLKDFLPKEYVKQKG-ERKIFQAHKNCGQMSEIEAKVR
       .::: ::::::: :.::: ::::::.::::::.::.: :..::: :::::.::::::::.
NP_055 GGFQAQIQFGPHVEHKHKPGFLDLKEFLPKEYIKQRGAEKRIFQEHKNCGEMSEIEAKVK
              250       260       270       280       290       300

       300       310       320       330       340       350       
pF1KSD YVKLARSLKTYGVSFFLVKEKMKGKNKLVPRLLGITKECVMRVDEKTKEVIQEWNLTNIK
       ::::::::.::::::::::::::::::::::::::::. :::::::::::.::: ::..:
NP_055 YVKLARSLRTYGVSFFLVKEKMKGKNKLVPRLLGITKDSVMRVDEKTKEVLQEWPLTTVK
              310       320       330       340       350       360

       360       370       380       390       400       410       
pF1KSD RWAASPKSFTLDFGDYQDGYYSVQTTEGEQIAQLIAGYIDIILKKKKSKDHFGLEGDEES
       ::::::::::::::.::..::::::::::::.::::::::::::::.:::.:::::::::
NP_055 RWAASPKSFTLDFGEYQESYYSVQTTEGEQISQLIAGYIDIILKKKQSKDRFGLEGDEES
              370       380       390       400       410       420

       420       430       440       450       460       470       
pF1KSD TMLEDSVSPKKSTVLQQQYNRVGKVEHGSVALPAIMRSGASGPENFQVGSMPPAQQQITS
       ::::.::::::::.::::.::.::.:::::::::.::::.::::.:.:::::  :::.  
NP_055 TMLEESVSPKKSTILQQQFNRTGKAEHGSVALPAVMRSGSSGPETFNVGSMPSPQQQVMV
              430       440       450       460       470       480

       480       490       500       510       520       530       
pF1KSD GQMHRGHMPPLTSAQQALTGTINSSMQAVQAAQATLDDFDTLPPLGQDAASKAWRKNKMD
       :::::::::::::::::: ::::.::.::: ::  :...:.::::::: ::..: .::.:
NP_055 GQMHRGHMPPLTSAQQALMGTINTSMHAVQQAQDDLSELDSLPPLGQDMASRVWVQNKVD
              490       500       510       520       530       540

       540       550       560       570       580       590       
pF1KSD ESKHEIHSQVDAITAGTASVVNLTAGDPAETDYTAVGCAVTTISSNLTEMSRGVKLLAAL
       :::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::::::::::.::::::::
NP_055 ESKHEIHSQVDAITAGTASVVNLTAGDPADTDYTAVGCAITTISSNLTEMSKGVKLLAAL
              550       560       570       580       590       600

       600       610       620       630       640       650       
pF1KSD LEDEGGSGRPLLQAAKGLAGAVSELLRSAQPASAEPRQNLLQAAGNVGQASGELLQQIGE
       ..:: :::. ::.::. ::::::.::...::.:.::::..: :::..:::::.::.::::
NP_055 MDDEVGSGEDLLRAARTLAGAVSDLLKAVQPTSGEPRQTVLTAAGSIGQASGDLLRQIGE
              610       620       630       640       650       660

       660       670       680       690       700       710       
pF1KSD SDTDPHFQDALMQLAKAVASAAAALVLKAKSVAQRTEDSGLQTQVIAAATQCALSTSQLV
       ..:: .:::.::.::::::.::: ::::::.::: .::. ::..::::::::::::::::
NP_055 NETDERFQDVLMSLAKAVANAAAMLVLKAKNVAQVAEDTVLQNRVIAAATQCALSTSQLV
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pF1KSD ACTKVVAPTISSPVCQEQLVEAGRLVAKAVEGCVSASQAATEDGQLLRGVGAAATAVTQA
       ::.:::.::::::::::::.:::.:: ..::.:: : :::: :..::. :.:::..:.::
NP_055 ACAKVVSPTISSPVCQEQLIEAGKLVDRSVENCVRACQAATTDSELLKQVSAAASVVSQA
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pF1KSD LNELLQHVKAHATGAGPAGRYDQATDTILTVTENIFSSMGDAGEMVRQARILAQATSDLV
       :..:::::.  :. . : ::::::::::. :::.::::::::::::::::.:::::::::
NP_055 LHDLLQHVRQFASRGEPIGRYDQATDTIMCVTESIFSSMGDAGEMVRQARVLAQATSDLV
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       :.:::::::::::::.:.::: :::::::.:::::::.:.:: . :  :. : : :::::
NP_055 RVATNAAAQNAIKKKIVNRLEVAAKQAAAAATQTIAASQNAAVSNKNPAAQQQL-VQSCK
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NP_055 AVADHIPQLVQGVRGSQAQAEDLSAQLALIISSQNFLQPGSKMVSSAKAAVPTVSDQAAA
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       ::::::::::.:.:::::::.:::.:::::.:.::::..::.:...::..: :: ...::
NP_055 MQLSQCAKNLATSLAELRTASQKAHEACGPMEIDSALNTVQTLKNELQDAKMAAVESQLK
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       ::::::.:::.::::...:::.:..::::  .:::::.:.:.:::..: .:..:::::::
NP_055 PLPGETLEKCAQDLGSTSKAVGSSMAQLLTCAAQGNEHYTGVAARETAQALKTLAQAARG
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       ::: :.:::.   .::.: ::.. .. ::.:::.:   ::: : :::::::::::...::
NP_055 VAASTTDPAAAHAMLDSARDVMEGSAMLIQEAKQALIAPGDAERQQRLAQVAKAVSHSLN
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       .:.::   .:: :::.:..::. ::.::.:::::: ..::. ::..:::.:::.::::::
NP_055 HATRGQSGELAAASGKFSDDFDEFLDAGIEMAGQAQTKEDQIQVIGNLKNISMASSKLLL
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pF1KSD AAKALSTDPAAPNLKSQLAAAARAVTDSINQLITMCTQQAPGQKECDNALRELETVRELL
       :::.::.::.::: :. :::::::::.:::::::.:::::::::::::::::::::. .:
NP_055 AAKSLSVDPGAPNAKNLLAAAARAVTESINQLITLCTQQAPGQKECDNALRELETVKGML
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       .:: .:..:.::: :..:::::::::::.:.:::::::.:.:: ::. .. :::::::.:
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       :: :::::.:::.::.:::::::: ::::::: ::  :.:::..::::::::.. ::.::
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       :.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::.::::::::::::::::::.:::
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       .:.:::::::::::::::::::::.:::::::::::::::.::::: :::::::::::::
NP_055 TLDFEEQILEAAKSIAAATSALVKSASAAQRELVAQGKVGSIPANAADDGQWSQGLISAA
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       :::::::..:::::::.::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::.:::
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NP_055 AAGNAVKRASDNLVRAAQKAA-FGKADDDDVVVKTKFVGGIAQIIAAQEEMLKKERELEE
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       :::::::::::::::::.:::..  
NP_055 ARKKLAQIRQQQYKFLPTELREDEG
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>>XP_016878157 (OMIM: 607349) PREDICTED: talin-2 isoform  (2542 aa)
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XP_016 ESKHEIHSQVDAITAGTASVVNLTAGDPADTDYTAVGCAITTISSNLTEMSKGVKLLAAL
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XP_005 ESKHEIHSQVDAITAGTASVVNLTAGDPADTDYTAVGCAITTISSNLTEMSKGVKLLAAL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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