Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA1027
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA1027, 2541 aa
  1>>>pF1KSDA1027 2541 - 2541 aa - 2541 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4309+/-0.00123; mu= 15.9819+/- 0.074
 mean_var=120.4486+/-23.837, 0's: 0 Z-trim(103.8): 66  B-trim: 3 in 1/51
 Lambda= 0.116862
 statistics sampled from 7542 (7607) to 7542 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.564), E-opt: 0.2 (0.234), width:  16
 Scan time:  6.620

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS35009.1 TLN1 gene_id:7094|Hs108|chr9           (2541) 16015 2713.1       0
CCDS32261.1 TLN2 gene_id:83660|Hs108|chr15         (2542) 12507 2121.7       0
CCDS34669.1 HIP1 gene_id:3092|Hs108|chr7           (1037)  382 77.3 4.7e-13
CCDS31922.1 HIP1R gene_id:9026|Hs108|chr12         (1068)  372 75.6 1.6e-12
CCDS10316.1 MESDC1 gene_id:59274|Hs108|chr15       ( 362)  362 73.7   2e-12


>>CCDS35009.1 TLN1 gene_id:7094|Hs108|chr9                (2541 aa)
 initn: 16015 init1: 16015 opt: 16015  Z-score: 14586.1  bits: 2713.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 16015; 100.0% identity (100.0% similar) in 2541 aa overlap (1-2541:1-2541)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MVALSLKISIGNVVKTMQFEPSTMVYDACRIIRERIPEAPAGPPSDFGLFLSDDDPKKGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MVALSLKISIGNVVKTMQFEPSTMVYDACRIIRERIPEAPAGPPSDFGLFLSDDDPKKGI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD WLEAGKALDYYMLRNGDTMEYRKKQRPLKIRMLDGTVKTIMVDDSKTVTDMLMTICARIG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 WLEAGKALDYYMLRNGDTMEYRKKQRPLKIRMLDGTVKTIMVDDSKTVTDMLMTICARIG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD ITNHDEYSLVRELMEEKKEEITGTLRKDKTLLRDEKKMEKLKQKLHTDDELNWLDHGRTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 ITNHDEYSLVRELMEEKKEEITGTLRKDKTLLRDEKKMEKLKQKLHTDDELNWLDHGRTL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD REQGVEEHETLLLRRKFFYSDQNVDSRDPVQLNLLYVQARDDILNGSHPVSFDKACEFAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 REQGVEEHETLLLRRKFFYSDQNVDSRDPVQLNLLYVQARDDILNGSHPVSFDKACEFAG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD FQCQIQFGPHNEQKHKAGFLDLKDFLPKEYVKQKGERKIFQAHKNCGQMSEIEAKVRYVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 FQCQIQFGPHNEQKHKAGFLDLKDFLPKEYVKQKGERKIFQAHKNCGQMSEIEAKVRYVK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD LARSLKTYGVSFFLVKEKMKGKNKLVPRLLGITKECVMRVDEKTKEVIQEWNLTNIKRWA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LARSLKTYGVSFFLVKEKMKGKNKLVPRLLGITKECVMRVDEKTKEVIQEWNLTNIKRWA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD ASPKSFTLDFGDYQDGYYSVQTTEGEQIAQLIAGYIDIILKKKKSKDHFGLEGDEESTML
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 ASPKSFTLDFGDYQDGYYSVQTTEGEQIAQLIAGYIDIILKKKKSKDHFGLEGDEESTML
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD EDSVSPKKSTVLQQQYNRVGKVEHGSVALPAIMRSGASGPENFQVGSMPPAQQQITSGQM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 EDSVSPKKSTVLQQQYNRVGKVEHGSVALPAIMRSGASGPENFQVGSMPPAQQQITSGQM
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD HRGHMPPLTSAQQALTGTINSSMQAVQAAQATLDDFDTLPPLGQDAASKAWRKNKMDESK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 HRGHMPPLTSAQQALTGTINSSMQAVQAAQATLDDFDTLPPLGQDAASKAWRKNKMDESK
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD HEIHSQVDAITAGTASVVNLTAGDPAETDYTAVGCAVTTISSNLTEMSRGVKLLAALLED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 HEIHSQVDAITAGTASVVNLTAGDPAETDYTAVGCAVTTISSNLTEMSRGVKLLAALLED
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD EGGSGRPLLQAAKGLAGAVSELLRSAQPASAEPRQNLLQAAGNVGQASGELLQQIGESDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 EGGSGRPLLQAAKGLAGAVSELLRSAQPASAEPRQNLLQAAGNVGQASGELLQQIGESDT
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD DPHFQDALMQLAKAVASAAAALVLKAKSVAQRTEDSGLQTQVIAAATQCALSTSQLVACT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 DPHFQDALMQLAKAVASAAAALVLKAKSVAQRTEDSGLQTQVIAAATQCALSTSQLVACT
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD KVVAPTISSPVCQEQLVEAGRLVAKAVEGCVSASQAATEDGQLLRGVGAAATAVTQALNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 KVVAPTISSPVCQEQLVEAGRLVAKAVEGCVSASQAATEDGQLLRGVGAAATAVTQALNE
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD LLQHVKAHATGAGPAGRYDQATDTILTVTENIFSSMGDAGEMVRQARILAQATSDLVNAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LLQHVKAHATGAGPAGRYDQATDTILTVTENIFSSMGDAGEMVRQARILAQATSDLVNAI
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD KADAEGESDLENSRKLLSAAKILADATAKMVEAAKGAAAHPDSEEQQQRLREAAEGLRMA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 KADAEGESDLENSRKLLSAAKILADATAKMVEAAKGAAAHPDSEEQQQRLREAAEGLRMA
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD TNAAAQNAIKKKLVQRLEHAAKQAAASATQTIAAAQHAASTPKASAGPQPLLVQSCKAVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 TNAAAQNAIKKKLVQRLEHAAKQAAASATQTIAAAQHAASTPKASAGPQPLLVQSCKAVA
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD EQIPLLVQGVRGSQAQPDSPSAQLALIAASQSFLQPGGKMVAAAKASVPTIQDQASAMQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 EQIPLLVQGVRGSQAQPDSPSAQLALIAASQSFLQPGGKMVAAAKASVPTIQDQASAMQL
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD SQCAKNLGTALAELRTAAQKAQEACGPLEMDSALSVVQNLEKDLQEVKAAARDGKLKPLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SQCAKNLGTALAELRTAAQKAQEACGPLEMDSALSVVQNLEKDLQEVKAAARDGKLKPLP
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KSD GETMEKCTQDLGNSTKAVSSAIAQLLGEVAQGNENYAGIAARDVAGGLRSLAQAARGVAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 GETMEKCTQDLGNSTKAVSSAIAQLLGEVAQGNENYAGIAARDVAGGLRSLAQAARGVAA
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KSD LTSDPAVQAIVLDTASDVLDKASSLIEEAKKAAGHPGDPESQQRLAQVAKAVTQALNRCV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LTSDPAVQAIVLDTASDVLDKASSLIEEAKKAAGHPGDPESQQRLAQVAKAVTQALNRCV
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KSD SCLPGQRDVDNALRAVGDASKRLLSDSLPPSTGTFQEAQSRLNEAAAGLNQAATELVQAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SCLPGQRDVDNALRAVGDASKRLLSDSLPPSTGTFQEAQSRLNEAAAGLNQAATELVQAS
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KSD RGTPQDLARASGRFGQDFSTFLEAGVEMAGQAPSQEDRAQVVSNLKGISMSSSKLLLAAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 RGTPQDLARASGRFGQDFSTFLEAGVEMAGQAPSQEDRAQVVSNLKGISMSSSKLLLAAK
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KSD ALSTDPAAPNLKSQLAAAARAVTDSINQLITMCTQQAPGQKECDNALRELETVRELLENP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 ALSTDPAAPNLKSQLAAAARAVTDSINQLITMCTQQAPGQKECDNALRELETVRELLENP
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KSD VQPINDMSYFGCLDSVMENSKVLGEAMTGISQNAKNGNLPEFGDAISTASKALCGFTEAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 VQPINDMSYFGCLDSVMENSKVLGEAMTGISQNAKNGNLPEFGDAISTASKALCGFTEAA
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KSD AQAAYLVGVSDPNSQAGQQGLVEPTQFARANQAIQMACQSLGEPGCTQAQVLSAATIVAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 AQAAYLVGVSDPNSQAGQQGLVEPTQFARANQAIQMACQSLGEPGCTQAQVLSAATIVAK
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KSD HTSALCNSCRLASARTTNPTAKRQFVQSAKEVANSTANLVKTIKALDGAFTEENRAQCRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 HTSALCNSCRLASARTTNPTAKRQFVQSAKEVANSTANLVKTIKALDGAFTEENRAQCRA
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KSD ATAPLLEAVDNLSAFASNPEFSSIPAQISPEGRAAMEPIVISAKTMLESAGGLIQTARAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 ATAPLLEAVDNLSAFASNPEFSSIPAQISPEGRAAMEPIVISAKTMLESAGGLIQTARAL
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1630      1640      1650      1660      1670      1680
pF1KSD AVNPRDPPSWSVLAGHSRTVSDSIKKLITSMRDKAPGQLECETAIAALNSCLRDLDQASL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 AVNPRDPPSWSVLAGHSRTVSDSIKKLITSMRDKAPGQLECETAIAALNSCLRDLDQASL
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

             1690      1700      1710      1720      1730      1740
pF1KSD AAVSQQLAPREGISQEALHTQMLTAVQEISHLIEPLANAARAEASQLGHKVSQMAQYFEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 AAVSQQLAPREGISQEALHTQMLTAVQEISHLIEPLANAARAEASQLGHKVSQMAQYFEP
             1690      1700      1710      1720      1730      1740

             1750      1760      1770      1780      1790      1800
pF1KSD LTLAAVGAASKTLSHPQQMALLDQTKTLAESALQLLYTAKEAGGNPKQAAHTQEALEEAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LTLAAVGAASKTLSHPQQMALLDQTKTLAESALQLLYTAKEAGGNPKQAAHTQEALEEAV
             1750      1760      1770      1780      1790      1800

             1810      1820      1830      1840      1850      1860
pF1KSD QMMTEAVEDLTTTLNEAASAAGVVGGMVDSITQAINQLDEGPMGEPEGSFVDYQTTMVRT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 QMMTEAVEDLTTTLNEAASAAGVVGGMVDSITQAINQLDEGPMGEPEGSFVDYQTTMVRT
             1810      1820      1830      1840      1850      1860

             1870      1880      1890      1900      1910      1920
pF1KSD AKAIAVTVQEMVTKSNTSPEELGPLANQLTSDYGRLASEAKPAAVAAENEEIGSHIKHRV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 AKAIAVTVQEMVTKSNTSPEELGPLANQLTSDYGRLASEAKPAAVAAENEEIGSHIKHRV
             1870      1880      1890      1900      1910      1920

             1930      1940      1950      1960      1970      1980
pF1KSD QELGHGCAALVTKAGALQCSPSDAYTKKELIECARRVSEKVSHVLAALQAGNRGTQACIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 QELGHGCAALVTKAGALQCSPSDAYTKKELIECARRVSEKVSHVLAALQAGNRGTQACIT
             1930      1940      1950      1960      1970      1980

             1990      2000      2010      2020      2030      2040
pF1KSD AASAVSGIIADLDTTIMFATAGTLNREGTETFADHREGILKTAKVLVEDTKVLVQNAAGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 AASAVSGIIADLDTTIMFATAGTLNREGTETFADHREGILKTAKVLVEDTKVLVQNAAGS
             1990      2000      2010      2020      2030      2040

             2050      2060      2070      2080      2090      2100
pF1KSD QEKLAQAAQSSVATITRLADVVKLGAASLGAEDPETQVVLINAVKDVAKALGDLISATKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 QEKLAQAAQSSVATITRLADVVKLGAASLGAEDPETQVVLINAVKDVAKALGDLISATKA
             2050      2060      2070      2080      2090      2100

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pF1KSD AAGKVGDDPAVWQLKNSAKVMVTNVTSLLKTVKAVEDEATKGTRALEATTEHIRQELAVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 AAGKVGDDPAVWQLKNSAKVMVTNVTSLLKTVKAVEDEATKGTRALEATTEHIRQELAVF
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pF1KSD CSPEPPAKTSTPEDFIRMTKGITMATAKAVAAGNSCRQEDVIATANLSRRAIADMLRACK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 CSPEPPAKTSTPEDFIRMTKGITMATAKAVAAGNSCRQEDVIATANLSRRAIADMLRACK
             2170      2180      2190      2200      2210      2220

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pF1KSD EAAYHPEVAPDVRLRALHYGRECANGYLELLDHVLLTLQKPSPELKQQLTGHSKRVAGSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 EAAYHPEVAPDVRLRALHYGRECANGYLELLDHVLLTLQKPSPELKQQLTGHSKRVAGSV
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pF1KSD TELIQAAEAMKGTEWVDPEDPTVIAENELLGAAAAIEAAAKKLEQLKPRAKPKEADESLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 TELIQAAEAMKGTEWVDPEDPTVIAENELLGAAAAIEAAAKKLEQLKPRAKPKEADESLN
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pF1KSD FEEQILEAAKSIAAATSALVKAASAAQRELVAQGKVGAIPANALDDGQWSQGLISAARMV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 FEEQILEAAKSIAAATSALVKAASAAQRELVAQGKVGAIPANALDDGQWSQGLISAARMV
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pF1KSD AAATNNLCEAANAAVQGHASQEKLISSAKQVAASTAQLLVACKVKADQDSEAMKRLQAAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 AAATNNLCEAANAAVQGHASQEKLISSAKQVAASTAQLLVACKVKADQDSEAMKRLQAAG
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pF1KSD NAVKRASDNLVKAAQKAAAFEEQENETVVVKEKMVGGIAQIIAAQEEMLRKERELEEARK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NAVKRASDNLVKAAQKAAAFEEQENETVVVKEKMVGGIAQIIAAQEEMLRKERELEEARK
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             2530      2540 
pF1KSD KLAQIRQQQYKFLPSELRDEH
       :::::::::::::::::::::
CCDS35 KLAQIRQQQYKFLPSELRDEH
             2530      2540 

>>CCDS32261.1 TLN2 gene_id:83660|Hs108|chr15              (2542 aa)
 initn: 5388 init1: 5087 opt: 12507  Z-score: 11389.7  bits: 2121.7 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 12507; 76.1% identity (93.2% similar) in 2543 aa overlap (1-2540:1-2540)

               10          20        30        40        50        
pF1KSD MVALSLKISIG--NVVKTMQFEPSTMVYDACRIIRERIPEAPAGPPSDFGLFLSDDDPKK
       :::::::: .   :::::::::::: ::::::.::::.::: .:  ::.::::::.::.:
CCDS32 MVALSLKICVRHCNVVKTMQFEPSTAVYDACRVIRERVPEAQTGQASDYGLFLSDEDPRK
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       60        70        80        90       100       110        
pF1KSD GIWLEAGKALDYYMLRNGDTMEYRKKQRPLKIRMLDGTVKTIMVDDSKTVTDMLMTICAR
       :::::::..:::::::::: .::.::::: :::::::.:::.:::::::: ..:.:::.:
CCDS32 GIWLEAGRTLDYYMLRNGDILEYKKKQRPQKIRMLDGSVKTVMVDDSKTVGELLVTICSR
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pF1KSD IGITNHDEYSLVRELMEEKKEEITGTLRKDKTLLRDEKKMEKLKQKLHTDDELNWLDHGR
       :::::..::::..: .:::::: ::::.::.::::::.:::::: ::::::.::::::.:
CCDS32 IGITNYEEYSLIQETIEEKKEEGTGTLKKDRTLLRDERKMEKLKAKLHTDDDLNWLDHSR
              130       140       150       160       170       180

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pF1KSD TLREQGVEEHETLLLRRKFFYSDQNVDSRDPVQLNLLYVQARDDILNGSHPVSFDKACEF
       :.:::::.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS32 TFREQGVDENETLLLRRKFFYSDQNVDSRDPVQLNLLYVQARDDILNGSHPVSFEKACEF
              190       200       210       220       230       240

      240       250       260       270        280       290       
pF1KSD AGFQCQIQFGPHNEQKHKAGFLDLKDFLPKEYVKQKG-ERKIFQAHKNCGQMSEIEAKVR
       .::: ::::::: :.::: ::::::.::::::.::.: :..::: :::::.::::::::.
CCDS32 GGFQAQIQFGPHVEHKHKPGFLDLKEFLPKEYIKQRGAEKRIFQEHKNCGEMSEIEAKVK
              250       260       270       280       290       300

       300       310       320       330       340       350       
pF1KSD YVKLARSLKTYGVSFFLVKEKMKGKNKLVPRLLGITKECVMRVDEKTKEVIQEWNLTNIK
       ::::::::.::::::::::::::::::::::::::::. :::::::::::.::: ::..:
CCDS32 YVKLARSLRTYGVSFFLVKEKMKGKNKLVPRLLGITKDSVMRVDEKTKEVLQEWPLTTVK
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pF1KSD RWAASPKSFTLDFGDYQDGYYSVQTTEGEQIAQLIAGYIDIILKKKKSKDHFGLEGDEES
       ::::::::::::::.::..::::::::::::.::::::::::::::.:::.:::::::::
CCDS32 RWAASPKSFTLDFGEYQESYYSVQTTEGEQISQLIAGYIDIILKKKQSKDRFGLEGDEES
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       420       430       440       450       460       470       
pF1KSD TMLEDSVSPKKSTVLQQQYNRVGKVEHGSVALPAIMRSGASGPENFQVGSMPPAQQQITS
       ::::.::::::::.::::.::.::.:::::::::.::::.::::.:.:::::  :::.  
CCDS32 TMLEESVSPKKSTILQQQFNRTGKAEHGSVALPAVMRSGSSGPETFNVGSMPSPQQQVMV
              430       440       450       460       470       480

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pF1KSD GQMHRGHMPPLTSAQQALTGTINSSMQAVQAAQATLDDFDTLPPLGQDAASKAWRKNKMD
       :::::::::::::::::: ::::.::.::: ::  :...:.::::::: ::..: .::.:
CCDS32 GQMHRGHMPPLTSAQQALMGTINTSMHAVQQAQDDLSELDSLPPLGQDMASRVWVQNKVD
              490       500       510       520       530       540

       540       550       560       570       580       590       
pF1KSD ESKHEIHSQVDAITAGTASVVNLTAGDPAETDYTAVGCAVTTISSNLTEMSRGVKLLAAL
       :::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::::::::::.::::::::
CCDS32 ESKHEIHSQVDAITAGTASVVNLTAGDPADTDYTAVGCAITTISSNLTEMSKGVKLLAAL
              550       560       570       580       590       600

       600       610       620       630       640       650       
pF1KSD LEDEGGSGRPLLQAAKGLAGAVSELLRSAQPASAEPRQNLLQAAGNVGQASGELLQQIGE
       ..:: :::. ::.::. ::::::.::...::.:.::::..: :::..:::::.::.::::
CCDS32 MDDEVGSGEDLLRAARTLAGAVSDLLKAVQPTSGEPRQTVLTAAGSIGQASGDLLRQIGE
              610       620       630       640       650       660

       660       670       680       690       700       710       
pF1KSD SDTDPHFQDALMQLAKAVASAAAALVLKAKSVAQRTEDSGLQTQVIAAATQCALSTSQLV
       ..:: .:::.::.::::::.::: ::::::.::: .::. ::..::::::::::::::::
CCDS32 NETDERFQDVLMSLAKAVANAAAMLVLKAKNVAQVAEDTVLQNRVIAAATQCALSTSQLV
              670       680       690       700       710       720

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pF1KSD ACTKVVAPTISSPVCQEQLVEAGRLVAKAVEGCVSASQAATEDGQLLRGVGAAATAVTQA
       ::.:::.::::::::::::.:::.:: ..::.:: : :::: :..::. :.:::..:.::
CCDS32 ACAKVVSPTISSPVCQEQLIEAGKLVDRSVENCVRACQAATTDSELLKQVSAAASVVSQA
              730       740       750       760       770       780

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pF1KSD LNELLQHVKAHATGAGPAGRYDQATDTILTVTENIFSSMGDAGEMVRQARILAQATSDLV
       :..:::::.  :. . : ::::::::::. :::.::::::::::::::::.:::::::::
CCDS32 LHDLLQHVRQFASRGEPIGRYDQATDTIMCVTESIFSSMGDAGEMVRQARVLAQATSDLV
              790       800       810       820       830       840

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pF1KSD NAIKADAEGESDLENSRKLLSAAKILADATAKMVEAAKGAAAHPDSEEQQQRLREAAEGL
       ::...:::.: :.:::.:::.:::.:::.::.::::::::::.:..:.::::::::::::
CCDS32 NAMRSDAEAEIDMENSKKLLAAAKLLADSTARMVEAAKGAAANPENEDQQQRLREAAEGL
              850       860       870       880       890       900

       900       910       920       930       940       950       
pF1KSD RMATNAAAQNAIKKKLVQRLEHAAKQAAASATQTIAAAQHAASTPKASAGPQPLLVQSCK
       :.:::::::::::::.:.::: :::::::.:::::::.:.:: . :  :. : : :::::
CCDS32 RVATNAAAQNAIKKKIVNRLEVAAKQAAAAATQTIAASQNAAVSNKNPAAQQQL-VQSCK
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pF1KSD AVAEQIPLLVQGVRGSQAQPDSPSAQLALIAASQSFLQPGGKMVAAAKASVPTIQDQASA
       :::..:: ::::::::::: .. ::::::: .::.:::::.:::..:::.:::..:::.:
CCDS32 AVADHIPQLVQGVRGSQAQAEDLSAQLALIISSQNFLQPGSKMVSSAKAAVPTVSDQAAA
     960       970       980       990      1000      1010         

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pF1KSD MQLSQCAKNLGTALAELRTAAQKAQEACGPLEMDSALSVVQNLEKDLQEVKAAARDGKLK
       ::::::::::.:.:::::::.:::.:::::.:.::::..::.:...::..: :: ...::
CCDS32 MQLSQCAKNLATSLAELRTASQKAHEACGPMEIDSALNTVQTLKNELQDAKMAAVESQLK
    1020      1030      1040      1050      1060      1070         

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pF1KSD PLPGETMEKCTQDLGNSTKAVSSAIAQLLGEVAQGNENYAGIAARDVAGGLRSLAQAARG
       ::::::.:::.::::...:::.:..::::  .:::::.:.:.:::..: .:..:::::::
CCDS32 PLPGETLEKCAQDLGSTSKAVGSSMAQLLTCAAQGNEHYTGVAARETAQALKTLAQAARG
    1080      1090      1100      1110      1120      1130         

      1140      1150      1160      1170      1180      1190       
pF1KSD VAALTSDPAVQAIVLDTASDVLDKASSLIEEAKKAAGHPGDPESQQRLAQVAKAVTQALN
       ::: :.:::.   .::.: ::.. .. ::.:::.:   ::: : :::::::::::...::
CCDS32 VAASTTDPAAAHAMLDSARDVMEGSAMLIQEAKQALIAPGDAERQQRLAQVAKAVSHSLN
    1140      1150      1160      1170      1180      1190         

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pF1KSD RCVSCLPGQRDVDNALRAVGDASKRLLSDSLPPSTGTFQEAQSRLNEAAAGLNQAATELV
        ::.:::::.::: ::...:..::.:: :::::::  ::::::.::.::: :::.: :.:
CCDS32 NCVNCLPGQKDVDVALKSIGESSKKLLVDSLPPSTKPFQEAQSELNQAAADLNQSAGEVV
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pF1KSD QASRGTPQDLARASGRFGQDFSTFLEAGVEMAGQAPSQEDRAQVVSNLKGISMSSSKLLL
       .:.::   .:: :::.:..::. ::.::.:::::: ..::. ::..:::.:::.::::::
CCDS32 HATRGQSGELAAASGKFSDDFDEFLDAGIEMAGQAQTKEDQIQVIGNLKNISMASSKLLL
    1260      1270      1280      1290      1300      1310         

      1320      1330      1340      1350      1360      1370       
pF1KSD AAKALSTDPAAPNLKSQLAAAARAVTDSINQLITMCTQQAPGQKECDNALRELETVRELL
       :::.::.::.::: :. :::::::::.:::::::.:::::::::::::::::::::. .:
CCDS32 AAKSLSVDPGAPNAKNLLAAAARAVTESINQLITLCTQQAPGQKECDNALRELETVKGML
    1320      1330      1340      1350      1360      1370         

      1380      1390      1400      1410      1420      1430       
pF1KSD ENPVQPINDMSYFGCLDSVMENSKVLGEAMTGISQNAKNGNLPEFGDAISTASKALCGFT
       .:: .:..:.::: :..:::::::::::.:.:::::::.:.:: ::. .. :::::::.:
CCDS32 DNPNEPVSDLSYFDCIESVMENSKVLGESMAGISQNAKTGDLPAFGECVGIASKALCGLT
    1380      1390      1400      1410      1420      1430         

      1440      1450      1460      1470      1480      1490       
pF1KSD EAAAQAAYLVGVSDPNSQAGQQGLVEPTQFARANQAIQMACQSLGEPGCTQAQVLSAATI
       :::::::::::.::::::::.::::.: ::::::::::::::.: .:: . .::::::::
CCDS32 EAAAQAAYLVGISDPNSQAGHQGLVDPIQFARANQAIQMACQNLVDPGSSPSQVLSAATI
    1440      1450      1460      1470      1480      1490         

      1500      1510      1520      1530      1540      1550       
pF1KSD VAKHTSALCNSCRLASARTTNPTAKRQFVQSAKEVANSTANLVKTIKALDGAFTEENRAQ
       ::::::::::.::.::..:.::.:::.:::::::::::::::::::::::: :.:.:: .
CCDS32 VAKHTSALCNACRIASSKTANPVAKRHFVQSAKEVANSTANLVKTIKALDGDFSEDNRNK
    1500      1510      1520      1530      1540      1550         

      1560      1570      1580      1590      1600      1610       
pF1KSD CRAATAPLLEAVDNLSAFASNPEFSSIPAQISPEGRAAMEPIVISAKTMLESAGGLIQTA
       :: :::::.:::.::.:::::::: ::::::: ::  :.:::..::::::::.. ::.::
CCDS32 CRIATAPLIEAVENLTAFASNPEFVSIPAQISSEGSQAQEPILVSAKTMLESSSYLIRTA
    1560      1570      1580      1590      1600      1610         

      1620      1630      1640      1650      1660      1670       
pF1KSD RALAVNPRDPPSWSVLAGHSRTVSDSIKKLITSMRDKAPGQLECETAIAALNSCLRDLDQ
       :.::.::.:::.::::::::.:::::::.::::.::::::: ::. .: ..: :.::..:
CCDS32 RSLAINPKDPPTWSVLAGHSHTVSDSIKSLITSIRDKAPGQRECDYSIDGINRCIRDIEQ
    1620      1630      1640      1650      1660      1670         

      1680      1690      1700      1710      1720      1730       
pF1KSD ASLAAVSQQLAPREGISQEALHTQMLTAVQEISHLIEPLANAARAEASQLGHKVSQMAQY
       ::::::::.:: :. :: :::. :. ..::::.:::.:.:.:::.::.::::::.:.:.:
CCDS32 ASLAAVSQSLATRDDISVEALQEQLTSVVQEIGHLIDPIATAARGEAAQLGHKVTQLASY
    1680      1690      1700      1710      1720      1730         

      1740      1750      1760      1770      1780      1790       
pF1KSD FEPLTLAAVGAASKTLSHPQQMALLDQTKTLAESALQLLYTAKEAGGNPKQAAHTQEALE
       :::: :::::.::: :.: :::..:::::::::::::.::.:::.::::: : ::..:. 
CCDS32 FEPLILAAVGVASKILDHQQQMTVLDQTKTLAESALQMLYAAKEGGGNPK-AQHTHDAIT
    1740      1750      1760      1770      1780       1790        

      1800      1810      1820      1830      1840      1850       
pF1KSD EAVQMMTEAVEDLTTTLNEAASAAGVVGGMVDSITQAINQLDEGPMGEPEGSFVDYQTTM
       ::.:.: :::.:. .::::::: .:.::::::.:..:...::::   ::.:.:::::::.
CCDS32 EAAQLMKEAVDDIMVTLNEAASEVGLVGGMVDAIAEAMSKLDEGTPPEPKGTFVDYQTTV
     1800      1810      1820      1830      1840      1850        

      1860      1870      1880      1890      1900      1910       
pF1KSD VRTAKAIAVTVQEMVTKSNTSPEELGPLANQLTSDYGRLASEAKPAAVAAENEEIGSHIK
       :. .::::::.:::.::: :.::::: ::.:.:::::.:: ... ::..:: :::: .:.
CCDS32 VKYSKAIAVTAQEMMTKSVTNPEELGGLASQMTSDYGHLAFQGQMAAATAEPEEIGFQIR
     1860      1870      1880      1890      1900      1910        

      1920      1930      1940      1950      1960      1970       
pF1KSD HRVQELGHGCAALVTKAGALQCSPSDAYTKKELIECARRVSEKVSHVLAALQAGNRGTQA
        :::.:::::  :: ::::::  :.:.:::.::::::: :.:::: ::.::::::.::::
CCDS32 TRVQDLGHGCIFLVQKAGALQVCPTDSYTKRELIECARAVTEKVSLVLSALQAGNKGTQA
     1920      1930      1940      1950      1960      1970        

      1980      1990      2000      2010      2020      2030       
pF1KSD CITAASAVSGIIADLDTTIMFATAGTLNREGTETFADHREGILKTAKVLVEDTKVLVQNA
       :::::.:::::::::::::::::::::: :..::::::::.::::::.::::::.::..:
CCDS32 CITAATAVSGIIADLDTTIMFATAGTLNAENSETFADHRENILKTAKALVEDTKLLVSGA
     1980      1990      2000      2010      2020      2030        

      2040      2050      2060      2070      2080      2090       
pF1KSD AGSQEKLAQAAQSSVATITRLADVVKLGAASLGAEDPETQVVLINAVKDVAKALGDLISA
       :.. .:::::::::.::::.::.::::::::::..:::::::::::.:::::::.:::::
CCDS32 ASTPDKLAQAAQSSAATITQLAEVVKLGAASLGSDDPETQVVLINAIKDVAKALSDLISA
     2040      2050      2060      2070      2080      2090        

      2100      2110      2120      2130      2140      2150       
pF1KSD TKAAAGKVGDDPAVWQLKNSAKVMVTNVTSLLKTVKAVEDEATKGTRALEATTEHIRQEL
       ::.::.:  :::...:::..:::::::::::::::::::::::.:::::::: : :.:::
CCDS32 TKGAASKPVDDPSMYQLKGAAKVMVTNVTSLLKTVKAVEDEATRGTRALEATIECIKQEL
     2100      2110      2120      2130      2140      2150        

      2160      2170      2180      2190      2200      2210       
pF1KSD AVFCSPEPPAKTSTPEDFIRMTKGITMATAKAVAAGNSCRQEDVIATANLSRRAIADMLR
       .:: : . : :::.::. ::::::::::::::::::::::::::::::::::.:..::: 
CCDS32 TVFQSKDVPEKTSSPEESIRMTKGITMATAKAVAAGNSCRQEDVIATANLSRKAVSDMLT
     2160      2170      2180      2190      2200      2210        

      2220      2230      2240      2250      2260      2270       
pF1KSD ACKEAAYHPEVAPDVRLRALHYGRECANGYLELLDHVLLTLQKPSPELKQQLTGHSKRVA
       :::.:..::.:. .:: :::..: ::. :::.::.:::. ::::.::.::::.. :::::
CCDS32 ACKQASFHPDVSDEVRTRALRFGTECTLGYLDLLEHVLVILQKPTPEFKQQLAAFSKRVA
     2220      2230      2240      2250      2260      2270        

      2280      2290      2300      2310      2320      2330       
pF1KSD GSVTELIQAAEAMKGTEWVDPEDPTVIAENELLGAAAAIEAAAKKLEQLKPRAKPKEADE
       :.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::.::::::::::::::::::.:::
CCDS32 GAVTELIQAAEAMKGTEWVDPEDPTVIAETELLGAAASIEAAAKKLEQLKPRAKPKQADE
     2280      2290      2300      2310      2320      2330        

      2340      2350      2360      2370      2380      2390       
pF1KSD SLNFEEQILEAAKSIAAATSALVKAASAAQRELVAQGKVGAIPANALDDGQWSQGLISAA
       .:.:::::::::::::::::::::.:::::::::::::::.::::: :::::::::::::
CCDS32 TLDFEEQILEAAKSIAAATSALVKSASAAQRELVAQGKVGSIPANAADDGQWSQGLISAA
     2340      2350      2360      2370      2380      2390        

      2400      2410      2420      2430      2440      2450       
pF1KSD RMVAAATNNLCEAANAAVQGHASQEKLISSAKQVAASTAQLLVACKVKADQDSEAMKRLQ
       :::::::..:::::::.::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS32 RMVAAATSSLCEAANASVQGHASEEKLISSAKQVAASTAQLLVACKVKADQDSEAMRRLQ
     2400      2410      2420      2430      2440      2450        

      2460      2470      2480      2490      2500      2510       
pF1KSD AAGNAVKRASDNLVKAAQKAAAFEEQENETVVVKEKMVGGIAQIIAAQEEMLRKERELEE
       ::::::::::::::.:::::: : . ... :::: :.:::::::::::::::.:::::::
CCDS32 AAGNAVKRASDNLVRAAQKAA-FGKADDDDVVVKTKFVGGIAQIIAAQEEMLKKERELEE
     2460      2470       2480      2490      2500      2510       

      2520      2530      2540  
pF1KSD ARKKLAQIRQQQYKFLPSELRDEH 
       :::::::::::::::::.:::..  
CCDS32 ARKKLAQIRQQQYKFLPTELREDEG
      2520      2530      2540  

>>CCDS34669.1 HIP1 gene_id:3092|Hs108|chr7                (1037 aa)
 initn: 341 init1: 252 opt: 382  Z-score: 347.8  bits: 77.3 E(32554): 4.7e-13
Smith-Waterman score: 426; 23.2% identity (56.8% similar) in 680 aa overlap (1873-2532:364-1011)

           1850      1860      1870      1880      1890      1900  
pF1KSD MGEPEGSFVDYQTTMVRTAKAIAVTVQEMVTKSNTSPEELGPLANQLTSDYGRLASEAKP
                                     ...... .:   : ..:  . . :  .:. 
CCDS34 DMDASQQNLFDNKFDDIFGSSFSSDPFNFNSQNGVNKDEKDHLIERLYREISGL--KAQL
           340       350       360       370       380         390 

           1910      1920      1930      1940       1950      1960 
pF1KSD AAVAAENEEIGSHIKHRVQELGHGCAALVTKAGALQCSPSDA-YTKKELIECARRVSEKV
         . .:....  ..: .:.::    : :. .    : . .:  . . :: :  ::  : .
CCDS34 ENMKTESQRVVLQLKGHVSELE---ADLAEQQHLRQQAADDCEFLRAELDEL-RRQREDT
             400       410          420       430       440        

            1970      1980      1990      2000      2010           
pF1KSD SHVLAALQAGNRGTQACITAASAVSGIIADLDTTIMFATAGTLNREGTETFADHREGI--
        ..  .:.  .: .::     : ..   ..:  .   :     : : :.  .  :..   
CCDS34 EKAQRSLSEIERKAQANEQRYSKLKEKYSELVQN--HADLLRKNAEVTKQVSMARQAQVD
       450       460       470       480         490       500     

    2020      2030        2040        2050      2060      2070     
pF1KSD LKTAKVLVEDT--KVLVQNAAGSQEKLA--QAAQSSVATITRLADVVKLGAASLGAEDPE
       :.  :  .::.  ..  :.   .::.:   .. .. .::  :  .:.. :.   .:.   
CCDS34 LEREKKELEDSLERISDQGQRKTQEQLEVLESLKQELATSQRELQVLQ-GSLETSAQ---
         510       520       530       540       550        560    

        2080      2090      2100      2110       2120      2130    
pF1KSD TQVVLINAVKDVAKALGDLISATKAAAGKVGDDPAVWQ-LKNSAKVMVTNVTSLLKTVKA
       ...       .. :   .:.:.   :: .  .  :. . :...   ....  :. . .: 
CCDS34 SEANWAAEFAELEKERDSLVSG---AAHREEELSALRKELQDTQLKLASTEESMCQLAKD
             570       580          590       600       610        

         2140      2150      2160        2170      2180            
pF1KSD VEDEATKGTRALEATTEHIRQELAVFCSPEPP--AKTSTPEDFIRMTKGITMATA---KA
        .     :.:    ..:.. :. :.    :::  . ... . ..  . .:.       :.
CCDS34 QRKMLLVGSRK---AAEQVIQD-ALNQLEEPPLISCAGSADHLLSTVTSISSCIEQLEKS
      620          630        640       650       660       670    

    2190            2200      2210      2220      2230      2240   
pF1KSD VAAGNSCRQE------DVIATANLSRRAIADMLRACKEAAYHPEVAPDVRLRALHYGREC
        .   .: ..      ..   :.:.  :::    .: .:   :: : ..     .:::: 
CCDS34 WSQYLACPEDISGLLHSITLLAHLTSDAIAHGATTCLRAP--PEPADSLTEACKQYGRET
          680       690       700       710         720       730  

          2250      2260      2270      2280      2290      2300   
pF1KSD ANGYLELLDHVLLTLQKPSPELKQQLTGHSKRVAGSVTELIQAAEAMKGTEWVDPEDPTV
         .::  :..     .  :  ... :.    .. .   ::.  .  .:  :  :      
CCDS34 L-AYLASLEEEGSLENADSTAMRNCLS----KIKAIGEELLPRGLDIKQEELGD------
             740       750           760       770       780       

          2310      2320      2330      2340      2350      2360   
pF1KSD IAENELLGAAAAIEAAAKKLEQLKPRAKPKEADESLNFEEQILEAAKSIAAATSALVKAA
       ....:. ...::::.:. ..:..  ...  ..  .:. .:.::    :.  : ..:. :.
CCDS34 LVDKEMAATSAAIETATARIEEMLSKSRAGDTGVKLEVNERILGCCTSLMQAIQVLIVAS
             790       800       810       820       830       840 

          2370      2380       2390      2400      2410      2420  
pF1KSD SAAQRELVAQGKVGAIPANAL-DDGQWSQGLISAARMVAAATNNLCEAANAAVQGHASQE
       .  :::.: .:.  : : .    ...:..:::::.. :. ... . .::. .:::... :
CCDS34 KDLQREIVESGRGTASPKEFYAKNSRWTEGLISASKAVGWGATVMVDAADLVVQGRGKFE
             850       860       870       880       890       900 

           2430      2440      2450      2460      2470      2480  
pF1KSD KLISSAKQVAASTAQLLVACKVKADQDSEAMKRLQAAGNAVKRASDNLVKAAQKAAAFEE
       .:.  ....:::::::..: :::::.::  . .:: :. .:..:. ..: .. .. .  :
CCDS34 ELMVCSHEIAASTAQLVAASKVKADKDSPNLAQLQQASRGVNQATAGVVASTISGKSQIE
             910       920       930       940       950       960 

           2490      2500      2510      2520      2530      2540  
pF1KSD QENETVVVKEKMVGGIAQIIAAQEEMLRKERELEEARKKLAQIRQQQYKFLPSELRDEH 
       . ..    .  ..    : . .: ..:. : ::.. :.::...:...:..          
CCDS34 ETDNMDFSSMTLTQIKRQEMDSQVRVLELENELQKERQKLGELRKKHYELAGVAEGWEEG
             970       980       990      1000      1010      1020 

CCDS34 TEASPPTLQEVVTEKE
            1030       

>>CCDS31922.1 HIP1R gene_id:9026|Hs108|chr12              (1068 aa)
 initn: 304 init1: 229 opt: 372  Z-score: 338.5  bits: 75.6 E(32554): 1.6e-12
Smith-Waterman score: 432; 22.6% identity (52.8% similar) in 913 aa overlap (1632-2530:160-1009)

            1610      1620      1630      1640      1650      1660 
pF1KSD SAKTMLESAGGLIQTARALAVNPRDPPSWSVLAGHSRTVSDSIKKLITSMRDKAPGQLEC
                                     ::   . :  ..: .: . : :     ..:
CCDS31 VNVYTKLLLTKISFHLKHPQFPAGLEVTDEVLEKAAGTDVNNIFQLTVEMFD----YMDC
     130       140       150       160       170       180         

            1670      1680            1690      1700      1710     
pF1KSD ETAIAALNSCLRDLDQASLAAVSQ------QLAPREGISQEALHTQMLTAVQEISHLIEP
       :  ..  .: .:.:. :   ::::      .:::   . :.  :    :.     .:.  
CCDS31 ELKLS--ESVFRQLNTA--IAVSQMSSGQCRLAPLIQVIQDCSHLYHYTV-----KLLFK
         190         200         210       220       230           

        1720      1730      1740      1750      1760      1770     
pF1KSD LANAARAEASQLGHKVSQMAQYFEPLTLAAVGAASKTLSHPQQMALLDQTKTLAESALQL
       : .   :.. : ::. ... . :. :       ::  :   .    : :   : :.  ..
CCDS31 LHSCLPADTLQ-GHR-DRFHEQFHSLR-NFFRRASDMLYFKR----LIQIPRLPEGPPNF
        240        250        260        270           280         

        1780      1790      1800      1810      1820      1830     
pF1KSD LYTAKEAGGNPKQAAHTQEALEEAVQMMTEAVEDLTTTLNEAASAAGVVGGMVDSITQAI
       :           .:.   : .. .: .  :: ::     .:  .   .  :   .   ..
CCDS31 L-----------RASALAEHIKPVVVIPEEAPED-----EEPENLIEISTGPPAGEPVVV
     290                  300       310            320       330   

        1840      1850      1860       1870      1880      1890    
pF1KSD NQLDEGPMGEPEGSFVDYQTTMVRTAK-AIAVTVQEMVTKSNTSPEELGPLANQLTSDYG
        .: .  .: :.::  : .  .... :  . .  .:.   .  . . .. : .:...  :
CCDS31 ADLFDQTFGPPNGSVKDDRDLQIESLKREVEMLRSELEKIKLEAQRYIAQLKSQVNALEG
           340       350       360       370       380       390   

         1900       1910       1920       1930      1940      1950 
pF1KSD RLASEAKPAAVA-AENEEIGSHIKH-RVQEL-GHGCAALVTKAGALQCSPSDAYTKKELI
       .:  . :    : ..::..  .. . :. .: :.   .:  .:   . : ..:  .: : 
CCDS31 ELEEQRKQKQKALVDNEQLRHELAQLRAAQLEGERSQGLREEA-ERKASATEARYNK-LK
           400       410       420       430        440        450 

            1960      1970      1980      1990      2000      2010 
pF1KSD ECARRVSEKVSHVLAALQAGNRGTQACITAASAVSGIIADLDTTIMFATAGTLNREGTET
       :   . :: : :: : :   :  :   .:...  .  .: .   . : .   ..::.   
CCDS31 E---KHSELV-HVHAELLRKNADTAKQLTVTQQSQEEVARVKEQLAFQVE-QVKRESELK
                 460       470       480       490        500      

            2020      2030      2040      2050      2060      2070 
pF1KSD FADHREGILKTAKVLVEDTKVLVQNAAGSQEKLAQAAQSSVATITRLADVVKLGAASLGA
       . .. . . :  . :   .  :    : .:: :... ::.    .:: :...    .:..
CCDS31 LEEKSDQLEKLKRELEAKAGEL----ARAQEALSHTEQSKSELSSRL-DTLSAEKDALSG
        510       520           530       540        550       560 

            2080      2090      2100      2110      2120      2130 
pF1KSD EDPETQVVLINAVKDVAKALGDLISATKAAAGKVGDDPAVWQLKNSAKVMVTNVTSLLKT
          . .. :. : . : .. . :    . .. . :.  .    ..: .  . .   ::  
CCDS31 AVRQREADLLAAQSLVRETEAALSREQQRSSQEQGELQGRLAERESQEQGLRQ--RLLDE
             570       580       590       600       610           

             2140      2150      2160      2170      2180      2190
pF1KSD VKAV-EDEATKGTRALEATTEHIRQELAVFCSPEPPAKTSTPEDFIRMTKGITMATAKAV
         :: .  :....  :. .. .. . : . :.  :   .:  .. .  .. .  . :. .
CCDS31 QFAVLRGAAAEAAGILQDAVSKLDDPLHLRCTSSPDYLVSRAQEALDAVSTLEEGHAQYL
     620       630       640       650       660       670         

             2200      2210      2220      2230      2240      2250
pF1KSD AAGNSCRQEDVIATANLSRRAIADMLRACKEAAYHPEVAPDVRLRALHYGRECANGYLEL
       ..  .     : : . .:. :   .. .   .   :    :   : .   :::.   :::
CCDS31 TSLADASAL-VAALTRFSHLAADTIINGGATSHLAPTDPAD---RLIDTCRECGARALEL
     680        690       700       710          720       730     

             2260      2270      2280      2290       2300         
pF1KSD LDHVLLTLQKPSPELKQQLTGHSKRVAGSVTELIQAAEAMKGTEW-VDPEDPTVIAENEL
       . .  :  :.   ... .:      :   .  ..: .. .:     :  :.  .....:.
CCDS31 MGQ--LQDQQALRHMQASL------VRTPLQGILQLGQELKPKSLDVRQEELGAVVDKEM
           740       750             760       770       780       

    2310      2320      2330      2340      2350      2360         
pF1KSD LGAAAAIEAAAKKLEQLKPRAKPKEADESLNFEEQILEAAKSIAAATSALVKAASAAQRE
        ...:::: :....:..  .:.   .  .:. .:.::..  ..  :   :: .... :.:
CCDS31 AATSAAIEDAVRRIEDMMNQARHASSGVKLEVNERILNSCTDLMKAIRLLVTTSTSLQKE
       790       800       810       820       830       840       

    2370      2380        2390      2400      2410      2420       
pF1KSD LVAQGKVGAIPANAL--DDGQWSQGLISAARMVAAATNNLCEAANAAVQGHASQEKLISS
       .: .:. ::   . .   ...:..:::::.. :. ....: :::. .:   .. :.::  
CCDS31 IVESGR-GAATQQEFYAKNSRWTEGLISASKAVGWGATQLVEAADKVVLHTGKYEELIVC
       850        860       870       880       890       900      

      2430      2440      2450      2460      2470      2480       
pF1KSD AKQVAASTAQLLVACKVKADQDSEAMKRLQAAGNAVKRASDNLVKAAQKAAAFEEQENET
       ....:::::::..: ::::.. :  ..:::  . .:.. . :.: .....    :...  
CCDS31 SHEIAASTAQLVAASKVKANKHSPHLSRLQECSRTVNERAANVVASTKSGQEQIEDRDTM
        910       920       930       940       950       960      

      2490      2500      2510      2520      2530      2540       
pF1KSD VVVKEKMVGGIAQIIAAQEEMLRKERELEEARKKLAQIRQQQYKFLPSELRDEH      
            ...    : . .: ..:. :. ::  : .:...:.:.:                 
CCDS31 DFSGLSLIKLKKQEMETQVRVLELEKTLEAERMRLGELRKQHYVLAGASGSPGEEVAIRP
        970       980       990      1000      1010      1020      

CCDS31 STAPRSVTTKKPPLAQKPSVAPRQDHQLDKKDGIYPAQLVNY
       1030      1040      1050      1060        

>>CCDS10316.1 MESDC1 gene_id:59274|Hs108|chr15            (362 aa)
 initn: 272 init1: 186 opt: 362  Z-score: 336.7  bits: 73.7 E(32554): 2e-12
Smith-Waterman score: 363; 25.7% identity (59.8% similar) in 311 aa overlap (1323-1624:3-313)

           1300      1310      1320      1330      1340            
pF1KSD PSQEDRAQVVSNLKGISMSSSKLLLAAKALSTDPAAPNLKSQLAAAARAVTDSINQ----
                                     : . . :. ..   : : :.  . .:    
CCDS10                             MASGSAGKPTGEAASPAPASAIGGASSQPRKR
                                           10        20        30  

     1350       1360      1370      1380       1390      1400      
pF1KSD LITMCTQ-QAPGQKECDNALRELETVRELLENPVQP-INDMSYFGCLDSVMENSKVLGEA
       :...: . ..  :   :  :   :.   :.:.:..   .  :.  : :...  .: :.  
CCDS10 LVSVCDHCKGKMQLVADLLLLSSEARPVLFEGPASSGAGAESFEQCRDTIIARTKGLSIL
             40        50        60        70        80        90  

       1410      1420      1430      1440      1450      1460      
pF1KSD MTGISQNAKNGNLPEFGDAISTASKALCGFTEAAAQAAYLVGVSDPNSQAGQQGLVEPTQ
          .... . : . : ::..   .  . ..:: .:.::::..:. :..: .: :::.  .
CCDS10 THDVQSQLNMGRFGEAGDSLVELGDLVVSLTECSAHAAYLAAVATPGAQPAQPGLVDRYR
            100       110       120       130       140       150  

       1470      1480         1490      1500      1510      1520   
pF1KSD FARANQAIQMACQSL-GEP--GCTQAQVLSAATIVAKHTSALCNSCRLASARTTNPTAKR
        .:  . ....:  : . :    :   .: ..  .... . : ..: ::: .. .  ...
CCDS10 VTRCRHEVEQGCAVLRATPLADMTPQLLLEVSQGLSRNLKFLTDACALASDKSRDRFSRE
            160       170       180       190       200       210  

          1530      1540      1550      1560      1570      1580   
pF1KSD QFVQSAKEVANSTANLVKTIKALDGAFTEENRAQCRAATAPLLEAVDNLSAFASNPEFSS
       ::  ..: ...:.. :.  .. .  : .:  :..:   ..::..::. : .::..:.: .
CCDS10 QFKLGVKCMSTSASALLACVREVKVAPSELARSRCALFSGPLVQAVSALVGFATEPQFLG
            220       230       240       250       260       270  

          1590      1600      1610      1620      1630      1640   
pF1KSD IPAQISPEGRAAMEPIVISAKTMLESAGGLIQTARALAVNPRDPPSWSVLAGHSRTVSDS
         : .: ::.:..  :. .: ... .   : :  : :: .:                   
CCDS10 RAAAVSAEGKAVQTAILGGAMSVVSACVLLTQCLRDLAQHPDGGAKMSDHRERLRNSACA
            280       290       300       310       320       330  

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pF1KSD IKKLITSMRDKAPGQLECETAIAALNSCLRDLDQASLAAVSQQLAPREGISQEALHTQML
                                                                   
CCDS10 VSEGCTLLSQALRERSSPRTLPPVNSNSVN                              
            340       350       360                                




2541 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 18:58:38 2016 done: Thu Nov  3 18:58:40 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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