Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5702
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5702, 906 aa
1>>>pF1KB5702 906 - 906 aa - 906 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5171+/-0.00122; mu= 14.9626+/- 0.073
mean_var=88.0791+/-17.365, 0's: 0 Z-trim(102.7): 26 B-trim: 96 in 1/49
Lambda= 0.136659
statistics sampled from 7044 (7060) to 7044 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.558), E-opt: 0.2 (0.217), width: 16
Scan time: 2.440
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34243.1 CTNNA1 gene_id:1495|Hs108|chr5 ( 906) 5735 1141.7 0
CCDS78064.1 CTNNA1 gene_id:1495|Hs108|chr5 ( 841) 5149 1026.1 0
CCDS42703.2 CTNNA2 gene_id:1496|Hs108|chr2 ( 905) 4756 948.7 0
CCDS62944.1 CTNNA2 gene_id:1496|Hs108|chr2 ( 953) 4278 854.4 0
CCDS54371.1 CTNNA2 gene_id:1496|Hs108|chr2 ( 860) 3976 794.9 0
CCDS7269.1 CTNNA3 gene_id:29119|Hs108|chr10 ( 895) 3492 699.5 7.3e-201
CCDS75315.1 CTNNA1 gene_id:1495|Hs108|chr5 ( 536) 3396 680.4 2.3e-195
CCDS62945.1 CTNNA2 gene_id:1496|Hs108|chr2 ( 584) 3105 623.1 4.7e-178
CCDS74531.1 CTNNA2 gene_id:1496|Hs108|chr2 ( 537) 3035 609.3 6.2e-174
CCDS69638.1 CTNNAL1 gene_id:8727|Hs108|chr9 ( 718) 606 130.4 1.2e-29
CCDS6775.1 CTNNAL1 gene_id:8727|Hs108|chr9 ( 734) 606 130.4 1.2e-29
>>CCDS34243.1 CTNNA1 gene_id:1495|Hs108|chr5 (906 aa)
initn: 5735 init1: 5735 opt: 5735 Z-score: 6109.5 bits: 1141.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5735; 100.0% identity (100.0% similar) in 906 aa overlap (1-906:1-906)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MTAVHAGNINFKWDPKSLEIRTLAVERLLEPLVTQVTTLVNTNSKGPSNKKRGRSKKAHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MTAVHAGNINFKWDPKSLEIRTLAVERLLEPLVTQVTTLVNTNSKGPSNKKRGRSKKAHV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LAASVEQATENFLEKGDKIAKESQFLKEELVAAVEDVRKQGDLMKAAAGEFADDPCSSVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LAASVEQATENFLEKGDKIAKESQFLKEELVAAVEDVRKQGDLMKAAAGEFADDPCSSVK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 RGNMVRAARALLSAVTRLLILADMADVYKLLVQLKVVEDGILKLRNAGNEQDLGIQYKAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RGNMVRAARALLSAVTRLLILADMADVYKLLVQLKVVEDGILKLRNAGNEQDLGIQYKAL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 KPEVDKLNIMAAKRQQELKDVGHRDQMAAARGILQKNVPILYTASQACLQHPDVAAYKAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KPEVDKLNIMAAKRQQELKDVGHRDQMAAARGILQKNVPILYTASQACLQHPDVAAYKAN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 RDLIYKQLQQAVTGISNAAQATASDDASQHQGGGGGELAYALNNFDKQIIVDPLSFSEER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RDLIYKQLQQAVTGISNAAQATASDDASQHQGGGGGELAYALNNFDKQIIVDPLSFSEER
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 FRPSLEERLESIISGAALMADSSCTRDDRRERIVAECNAVRQALQDLLSEYMGNAGRKER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FRPSLEERLESIISGAALMADSSCTRDDRRERIVAECNAVRQALQDLLSEYMGNAGRKER
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 SDALNSAIDKMTKKTRDLRRQLRKAVMDHVSDSFLETNVPLLVLIEAAKNGNEKEVKEYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SDALNSAIDKMTKKTRDLRRQLRKAVMDHVSDSFLETNVPLLVLIEAAKNGNEKEVKEYA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 QVFREHANKLIEVANLACSISNNEEGVKLVRMSASQLEALCPQVINAALALAAKPQSKLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QVFREHANKLIEVANLACSISNNEEGVKLVRMSASQLEALCPQVINAALALAAKPQSKLA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 QENMDLFKEQWEKQVRVLTDAVDDITSIDDFLAVSENHILEDVNKCVIALQEKDVDGLDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QENMDLFKEQWEKQVRVLTDAVDDITSIDDFLAVSENHILEDVNKCVIALQEKDVDGLDR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 TAGAIRGRAARVIHVVTSEMDNYEPGVYTEKVLEATKLLSNTVMPRFTEQVEAAVEALSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TAGAIRGRAARVIHVVTSEMDNYEPGVYTEKVLEATKLLSNTVMPRFTEQVEAAVEALSS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 DPAQPMDENEFIDASRLVYDGIRDIRKAVLMIRTPEELDDSDFETEDFDVRSRTSVQTED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DPAQPMDENEFIDASRLVYDGIRDIRKAVLMIRTPEELDDSDFETEDFDVRSRTSVQTED
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 DQLIAGQSARAIMAQLPQEQKAKIAEQVASFQEEKSKLDAEVSKWDDSGNDIIVLAKQMC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DQLIAGQSARAIMAQLPQEQKAKIAEQVASFQEEKSKLDAEVSKWDDSGNDIIVLAKQMC
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 MIMMEMTDFTRGKGPLKNTSDVISAAKKIAEAGSRMDKLGRTIADHCPDSACKQDLLAYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MIMMEMTDFTRGKGPLKNTSDVISAAKKIAEAGSRMDKLGRTIADHCPDSACKQDLLAYL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB5 QRIALYCHQLNICSKVKAEVQNLGGELVVSGVDSAMSLIQAAKNLMNAVVQTVKASYVAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QRIALYCHQLNICSKVKAEVQNLGGELVVSGVDSAMSLIQAAKNLMNAVVQTVKASYVAS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB5 TKYQKSQGMASLNLPAVSWKMKAPEKKPLVKREKQDETQTKIKRASQKKHVNPVQALSEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TKYQKSQGMASLNLPAVSWKMKAPEKKPLVKREKQDETQTKIKRASQKKHVNPVQALSEF
850 860 870 880 890 900
pF1KB5 KAMDSI
::::::
CCDS34 KAMDSI
>>CCDS78064.1 CTNNA1 gene_id:1495|Hs108|chr5 (841 aa)
initn: 5147 init1: 5147 opt: 5149 Z-score: 5485.6 bits: 1026.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5149; 98.8% identity (99.4% similar) in 823 aa overlap (1-823:1-823)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MTAVHAGNINFKWDPKSLEIRTLAVERLLEPLVTQVTTLVNTNSKGPSNKKRGRSKKAHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MTAVHAGNINFKWDPKSLEIRTLAVERLLEPLVTQVTTLVNTNSKGPSNKKRGRSKKAHV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LAASVEQATENFLEKGDKIAKESQFLKEELVAAVEDVRKQGDLMKAAAGEFADDPCSSVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 LAASVEQATENFLEKGDKIAKESQFLKEELVAAVEDVRKQGDLMKAAAGEFADDPCSSVK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 RGNMVRAARALLSAVTRLLILADMADVYKLLVQLKVVEDGILKLRNAGNEQDLGIQYKAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 RGNMVRAARALLSAVTRLLILADMADVYKLLVQLKVVEDGILKLRNAGNEQDLGIQYKAL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 KPEVDKLNIMAAKRQQELKDVGHRDQMAAARGILQKNVPILYTASQACLQHPDVAAYKAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 KPEVDKLNIMAAKRQQELKDVGHRDQMAAARGILQKNVPILYTASQACLQHPDVAAYKAN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 RDLIYKQLQQAVTGISNAAQATASDDASQHQGGGGGELAYALNNFDKQIIVDPLSFSEER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 RDLIYKQLQQAVTGISNAAQATASDDASQHQGGGGGELAYALNNFDKQIIVDPLSFSEER
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 FRPSLEERLESIISGAALMADSSCTRDDRRERIVAECNAVRQALQDLLSEYMGNAGRKER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 FRPSLEERLESIISGAALMADSSCTRDDRRERIVAECNAVRQALQDLLSEYMGNAGRKER
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 SDALNSAIDKMTKKTRDLRRQLRKAVMDHVSDSFLETNVPLLVLIEAAKNGNEKEVKEYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 SDALNSAIDKMTKKTRDLRRQLRKAVMDHVSDSFLETNVPLLVLIEAAKNGNEKEVKEYA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 QVFREHANKLIEVANLACSISNNEEGVKLVRMSASQLEALCPQVINAALALAAKPQSKLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 QVFREHANKLIEVANLACSISNNEEGVKLVRMSASQLEALCPQVINAALALAAKPQSKLA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 QENMDLFKEQWEKQVRVLTDAVDDITSIDDFLAVSENHILEDVNKCVIALQEKDVDGLDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 QENMDLFKEQWEKQVRVLTDAVDDITSIDDFLAVSENHILEDVNKCVIALQEKDVDGLDR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 TAGAIRGRAARVIHVVTSEMDNYEPGVYTEKVLEATKLLSNTVMPRFTEQVEAAVEALSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 TAGAIRGRAARVIHVVTSEMDNYEPGVYTEKVLEATKLLSNTVMPRFTEQVEAAVEALSS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 DPAQPMDENEFIDASRLVYDGIRDIRKAVLMIRTPEELDDSDFETEDFDVRSRTSVQTED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 DPAQPMDENEFIDASRLVYDGIRDIRKAVLMIRTPEELDDSDFETEDFDVRSRTSVQTED
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 DQLIAGQSARAIMAQLPQEQKAKIAEQVASFQEEKSKLDAEVSKWDDSGNDIIVLAKQMC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 DQLIAGQSARAIMAQLPQEQKAKIAEQVASFQEEKSKLDAEVSKWDDSGNDIIVLAKQMC
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 MIMMEMTDFTRGKGPLKNTSDVISAAKKIAEAGSRMDKLGRTIADHCPDSACKQDLLAYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MIMMEMTDFTRGKGPLKNTSDVISAAKKIAEAGSRMDKLGRTIADHCPDSACKQDLLAYL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB5 QRIALYCHQLNICSKVKAEVQNLGGELVVSGVDSAMSLIQAAKNLMNAVVQTVKASYVAS
::::::::::::::::::::::::::::::: .. . .:. :
CCDS78 QRIALYCHQLNICSKVKAEVQNLGGELVVSGNCDTCGALQGLKGWPPPLCWPLTGWTAPC
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB5 TKYQKSQGMASLNLPAVSWKMKAPEKKPLVKREKQDETQTKIKRASQKKHVNPVQALSEF
CCDS78 P
>>CCDS42703.2 CTNNA2 gene_id:1496|Hs108|chr2 (905 aa)
initn: 2419 init1: 2419 opt: 4756 Z-score: 5066.3 bits: 948.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4756; 82.4% identity (94.5% similar) in 899 aa overlap (9-905:8-904)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MTAVHAGNINFKWDPKSLEIRTLAVERLLEPLVTQVTTLVNTNSKGPSNKKRGRSKKAHV
: .::::::::::::.::::::::::::::::::..::::.::.::::::::
CCDS42 MTSATSPIILKWDPKSLEIRTLTVERLLEPLVTQVTTLVNTSNKGPSGKKKGRSKKAHV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LAASVEQATENFLEKGDKIAKESQFLKEELVAAVEDVRKQGDLMKAAAGEFADDPCSSVK
:::::::::.::::::..:::::: ::::::::::::::::. :. :..:::::::::::
CCDS42 LAASVEQATQNFLEKGEQIAKESQDLKEELVAAVEDVRKQGETMRIASSEFADDPCSSVK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 RGNMVRAARALLSAVTRLLILADMADVYKLLVQLKVVEDGILKLRNAGNEQDLGIQYKAL
::.::::::::::::::::::::::::..:: .::.::... ..:: :::::. ..: .
CCDS42 RGTMVRAARALLSAVTRLLILADMADVMRLLSHLKIVEEALEAVKNATNEQDLANRFKEF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 KPEVDKLNIMAAKRQQELKDVGHRDQMAAARGILQKNVPILYTASQACLQHPDVAAYKAN
:. ::: .::.::::::: ::.:::::: :.::. .::::::: :.:::::: .::
CCDS42 GKEMVKLNYVAARRQQELKDPHCRDEMAAARGALKKNATMLYTASQAFLRHPDVAATRAN
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KB5 RDLIYKQLQQAVTGISNAAQATA-SDDASQHQGGGGGELAYALNNFDKQIIVDPLSFSEE
:: ..::.:.:..:::::::::. .:.:. : : : ::: :::.::..::.::..:::
CCDS42 RDYVFKQVQEAIAGISNAAQATSPTDEAKGHTGIG--ELAAALNEFDNKIILDPMTFSEA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 RFRPSLEERLESIISGAALMADSSCTRDDRRERIVAECNAVRQALQDLLSEYMGNAGRKE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.::::
CCDS42 RFRPSLEERLESIISGAALMADSSCTRDDRRERIVAECNAVRQALQDLLSEYMNNTGRKE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 RSDALNSAIDKMTKKTRDLRRQLRKAVMDHVSDSFLETNVPLLVLIEAAKNGNEKEVKEY
..: :: :::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS42 KGDPLNIAIDKMTKKTRDLRRQLRKAVMDHISDSFLETNVPLLVLIEAAKSGNEKEVKEY
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 AQVFREHANKLIEVANLACSISNNEEGVKLVRMSASQLEALCPQVINAALALAAKPQSKL
:::::::::::.:::::::::::::::::::::.:.:...::::::::::.:::.::::.
CCDS42 AQVFREHANKLVEVANLACSISNNEEGVKLVRMAATQIDSLCPQVINAALTLAARPQSKV
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 AQENMDLFKEQWEKQVRVLTDAVDDITSIDDFLAVSENHILEDVNKCVIALQEKDVDGLD
::.:::.::.::::::::::.:::::::.::::.::::::::::::::::::: ::: ::
CCDS42 AQDNMDVFKDQWEKQVRVLTEAVDDITSVDDFLSVSENHILEDVNKCVIALQEGDVDTLD
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 RTAGAIRGRAARVIHVVTSEMDNYEPGVYTEKVLEATKLLSNTVMPRFTEQVEAAVEALS
:::::::::::::::....::.::: :::::::::::::::.::::::.::::.:.::::
CCDS42 RTAGAIRGRAARVIHIINAEMENYEAGVYTEKVLEATKLLSETVMPRFAEQVEVAIEALS
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 SDPAQPMDENEFIDASRLVYDGIRDIRKAVLMIRTPEEL-DDSDFETEDFDVRSRTSVQT
.. ::..::::::::::::::.:::::::::::::::: :::::: ::.::::::::::
CCDS42 ANVPQPFEENEFIDASRLVYDGVRDIRKAVLMIRTPEELEDDSDFEQEDYDVRSRTSVQT
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 EDDQLIAGQSARAIMAQLPQEQKAKIAEQVASFQEEKSKLDAEVSKWDDSGNDIIVLAKQ
:::::::::::::::::::::.:::::::: :..:::::::::.:::::::::::::::
CCDS42 EDDQLIAGQSARAIMAQLPQEEKAKIAEQVEIFHQEKSKLDAEVAKWDDSGNDIIVLAKQ
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KB5 MCMIMMEMTDFTRGKGPLKNTSDVISAAKKIAEAGSRMDKLGRTIADHCPDSACKQDLLA
:::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::.:..::.::::::::::::
CCDS42 MCMIMMEMTDFTRGKGPLKNTSDVINAAKKIAEAGSRMDKLARAVADQCPDSACKQDLLA
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KB5 YLQRIALYCHQLNICSKVKAEVQNLGGELVVSGVDSAMSLIQAAKNLMNAVVQTVKASYV
:::::::::::::::::::::::::::::.:::.::: :::::::::::::: :::::::
CCDS42 YLQRIALYCHQLNICSKVKAEVQNLGGELIVSGLDSATSLIQAAKNLMNAVVLTVKASYV
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KB5 ASTKYQKSQGMASLNLPAVSWKMKAPEKKPLVKREKQDETQTKIKRASQKKHVNPVQALS
::::::: : :..: :.:::::::::::::::::: .: ::...:.:::::..::::::
CCDS42 ASTKYQKVYGTAAVNSPVVSWKMKAPEKKPLVKREKPEEFQTRVRRGSQKKHISPVQALS
840 850 860 870 880 890
900
pF1KB5 EFKAMDSI
:::::::
CCDS42 EFKAMDSF
900
>>CCDS62944.1 CTNNA2 gene_id:1496|Hs108|chr2 (953 aa)
initn: 2521 init1: 2055 opt: 4278 Z-score: 4556.7 bits: 854.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4553; 78.1% identity (89.6% similar) in 931 aa overlap (9-889:8-936)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MTAVHAGNINFKWDPKSLEIRTLAVERLLEPLVTQVTTLVNTNSKGPSNKKRGRSKKAHV
: .::::::::::::.::::::::::::::::::..::::.::.::::::::
CCDS62 MTSATSPIILKWDPKSLEIRTLTVERLLEPLVTQVTTLVNTSNKGPSGKKKGRSKKAHV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LAASVEQATENFLEKGDKIAKESQFLKEELVAAVEDVRKQGDLMKAAAGEFADDPCSSVK
:::::::::.::::::..:::::: ::::::::::::::::. :. :..:::::::::::
CCDS62 LAASVEQATQNFLEKGEQIAKESQDLKEELVAAVEDVRKQGETMRIASSEFADDPCSSVK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 RGNMVRAARALLSAVTRLLILADMADVYKLLVQLKVVEDGILKLRNAGNEQDLGIQYKAL
::.::::::::::::::::::::::::..:: .::.::... ..:: :::::. ..: .
CCDS62 RGTMVRAARALLSAVTRLLILADMADVMRLLSHLKIVEEALEAVKNATNEQDLANRFKEF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 KPEVDKLNIMAAKRQQELKDVGHRDQMAAARGILQKNVPILYTASQACLQHPDVAAYKAN
:. ::: .::.::::::: ::.:::::: :.::. .::::::: :.:::::: .::
CCDS62 GKEMVKLNYVAARRQQELKDPHCRDEMAAARGALKKNATMLYTASQAFLRHPDVAATRAN
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KB5 RDLIYKQLQQAVTGISNAAQATA-SDDASQHQGGGGGELAYALNNFDKQIIVDPLSFSEE
:: ..::.:.:..:::::::::. .:.:. : : : ::: :::.::..::.::..:::
CCDS62 RDYVFKQVQEAIAGISNAAQATSPTDEAKGHTGIG--ELAAALNEFDNKIILDPMTFSEA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 RFRPSLEERLESIISGAALMADSSCTRDDRRERIVAECNAVRQALQDLLSEYMGNAGRKE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.::::
CCDS62 RFRPSLEERLESIISGAALMADSSCTRDDRRERIVAECNAVRQALQDLLSEYMNNTGRKE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 RSDALNSAIDKMTKKTRDLRRQLRKAVMDHVSDSFLETNVPLLVLIEAAKNGNEKEVKEY
..: :: :::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS62 KGDPLNIAIDKMTKKTRDLRRQLRKAVMDHISDSFLETNVPLLVLIEAAKSGNEKEVKEY
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 AQVFREHANKLIEVANLACSISNNEEGVKLVRMSASQLEALCPQVINAALALAAKPQSKL
:::::::::::.:::::::::::::::::::::.:.:...::::::::::.:::.::::.
CCDS62 AQVFREHANKLVEVANLACSISNNEEGVKLVRMAATQIDSLCPQVINAALTLAARPQSKV
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 AQENMDLFKEQWEKQVRVLTDAVDDITSIDDFLAVSENHILEDVNKCVIALQEKDVDGLD
::.:::.::.::::::::::.:::::::.::::.::::::::::::::::::: ::: ::
CCDS62 AQDNMDVFKDQWEKQVRVLTEAVDDITSVDDFLSVSENHILEDVNKCVIALQEGDVDTLD
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 RTAGAIRGRAARVIHVVTSEMDNYEPGVYTEKVLEATKLLSNTVMPRFTEQVEAAVEALS
:::::::::::::::....::.::: :::::::::::::::.::::::.::::.:.::::
CCDS62 RTAGAIRGRAARVIHIINAEMENYEAGVYTEKVLEATKLLSETVMPRFAEQVEVAIEALS
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 SDPAQPMDENEFIDASRLVYDGIRDIRKAVLMIRTPEEL-DDSDFETEDFDVRSRTSVQT
.. ::..::::::::::::::.:::::::::::::::: :::::: ::.::::::::::
CCDS62 ANVPQPFEENEFIDASRLVYDGVRDIRKAVLMIRTPEELEDDSDFEQEDYDVRSRTSVQT
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 EDDQLIAGQSARAIMAQLPQEQKAKIAEQVASFQEEKSKLDAEVSKWDDSGNDIIVLAKQ
:::::::::::::::::::::.:::::::: :..:::::::::.:::::::::::::::
CCDS62 EDDQLIAGQSARAIMAQLPQEEKAKIAEQVEIFHQEKSKLDAEVAKWDDSGNDIIVLAKQ
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KB5 MCMIMMEMTDFTRGKGPLKNTSDVISAAKKIAEAGSRMDKLGRTIADHCPDSACKQDLLA
:::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::.:..::.::::::::::::
CCDS62 MCMIMMEMTDFTRGKGPLKNTSDVINAAKKIAEAGSRMDKLARAVADQCPDSACKQDLLA
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810
pF1KB5 YLQRIALYCHQLNICSKVKAEVQNLGGELVVSG---------------------------
:::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS62 YLQRIALYCHQLNICSKVKAEVQNLGGELIVSGTGVQSTFTTFYEVDCDVIDGGRASQLS
780 790 800 810 820 830
820 830 840 850
pF1KB5 ---------------------VDSAMSLIQAAKNLMNAVVQTVKASYVASTKYQKSQGMA
.::: :::::::::::::: :::::::::::::: : :
CCDS62 THLPTCAEGAPIGSGSSDSSMLDSATSLIQAAKNLMNAVVLTVKASYVASTKYQKVYGTA
840 850 860 870 880 890
860 870 880 890 900
pF1KB5 SLNLPAVSWKMKAPEKKPLVKREKQDETQTKIKRASQKKHVNPVQALSEFKAMDSI
..: :.:::::::::::::::::: .: ::...:.::::
CCDS62 AVNSPVVSWKMKAPEKKPLVKREKPEEFQTRVRRGSQKKHISPVQALSEFKAMDSF
900 910 920 930 940 950
>>CCDS54371.1 CTNNA2 gene_id:1496|Hs108|chr2 (860 aa)
initn: 3673 init1: 2055 opt: 3976 Z-score: 4235.6 bits: 794.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4350; 77.8% identity (89.5% similar) in 899 aa overlap (9-905:8-859)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MTAVHAGNINFKWDPKSLEIRTLAVERLLEPLVTQVTTLVNTNSKGPSNKKRGRSKKAHV
: .::::::::::::.::::::::::::::::::..::::.::.::::::::
CCDS54 MTSATSPIILKWDPKSLEIRTLTVERLLEPLVTQVTTLVNTSNKGPSGKKKGRSKKAHV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LAASVEQATENFLEKGDKIAKESQFLKEELVAAVEDVRKQGDLMKAAAGEFADDPCSSVK
:::::::::.::::::..:::::: ::::::::::::::::. :. :..:::::::::::
CCDS54 LAASVEQATQNFLEKGEQIAKESQDLKEELVAAVEDVRKQGETMRIASSEFADDPCSSVK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 RGNMVRAARALLSAVTRLLILADMADVYKLLVQLKVVEDGILKLRNAGNEQDLGIQYKAL
::.::::::::::::::::::::::::..:: .::.::... ..:: :::::. ..: .
CCDS54 RGTMVRAARALLSAVTRLLILADMADVMRLLSHLKIVEEALEAVKNATNEQDLANRFKEF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 KPEVDKLNIMAAKRQQELKDVGHRDQMAAARGILQKNVPILYTASQACLQHPDVAAYKAN
:. ::: .::.::::::: ::.:::::: :.::. .::::::: :.:::::: .::
CCDS54 GKEMVKLNYVAARRQQELKDPHCRDEMAAARGALKKNATMLYTASQAFLRHPDVAATRAN
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KB5 RDLIYKQLQQAVTGISNAAQATA-SDDASQHQGGGGGELAYALNNFDKQIIVDPLSFSEE
:: ..::.:.:..:::::::::. .:.:. : : : ::: :::.::..::.::..:::
CCDS54 RDYVFKQVQEAIAGISNAAQATSPTDEAKGHTGIG--ELAAALNEFDNKIILDPMTFSEA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 RFRPSLEERLESIISGAALMADSSCTRDDRRERIVAECNAVRQALQDLLSEYMGNAGRKE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.::::
CCDS54 RFRPSLEERLESIISGAALMADSSCTRDDRRERIVAECNAVRQALQDLLSEYMNNTGRKE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 RSDALNSAIDKMTKKTRDLRRQLRKAVMDHVSDSFLETNVPLLVLIEAAKNGNEKEVKEY
..: :: :::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS54 KGDPLNIAIDKMTKKTRDLRRQLRKAVMDHISDSFLETNVPLLVLIEAAKSGNEKEVKEY
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 AQVFREHANKLIEVANLACSISNNEEGVKLVRMSASQLEALCPQVINAALALAAKPQSKL
:::::::::::.:::::::::::::::::::::.:.:...::::::::::.:::.::::.
CCDS54 AQVFREHANKLVEVANLACSISNNEEGVKLVRMAATQIDSLCPQVINAALTLAARPQSKV
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 AQENMDLFKEQWEKQVRVLTDAVDDITSIDDFLAVSENHILEDVNKCVIALQEKDVDGLD
::.:::.::.::::::::::.:::::::.::::.::::::::::::::::::: ::: ::
CCDS54 AQDNMDVFKDQWEKQVRVLTEAVDDITSVDDFLSVSENHILEDVNKCVIALQEGDVDTLD
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 RTAGAIRGRAARVIHVVTSEMDNYEPGVYTEKVLEATKLLSNTVMPRFTEQVEAAVEALS
:::::::::::::::....::.::: :::::::::::::::.::::::.::::.:.::::
CCDS54 RTAGAIRGRAARVIHIINAEMENYEAGVYTEKVLEATKLLSETVMPRFAEQVEVAIEALS
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 SDPAQPMDENEFIDASRLVYDGIRDIRKAVLMIRTPEEL-DDSDFETEDFDVRSRTSVQT
.. ::..::::::::::::::.:::::::::::::::: :::::: ::.::::::::::
CCDS54 ANVPQPFEENEFIDASRLVYDGVRDIRKAVLMIRTPEELEDDSDFEQEDYDVRSRTSVQT
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 EDDQLIAGQSARAIMAQLPQEQKAKIAEQVASFQEEKSKLDAEVSKWDDSGNDIIVLAKQ
:::::::::::::::::::::.:::::::: :..:::::::::.:::::::::::::::
CCDS54 EDDQLIAGQSARAIMAQLPQEEKAKIAEQVEIFHQEKSKLDAEVAKWDDSGNDIIVLAKQ
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KB5 MCMIMMEMTDFTRGKGPLKNTSDVISAAKKIAEAGSRMDKLGRTIADHCPDSACKQDLLA
:::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::.:..::
CCDS54 MCMIMMEMTDFTRGKGPLKNTSDVINAAKKIAEAGSRMDKLARAVAD-------------
720 730 740 750 760
780 790 800 810 820 830
pF1KB5 YLQRIALYCHQLNICSKVKAEVQNLGGELVVSGVDSAMSLIQAAKNLMNAVVQTVKASYV
:: ::: :::::::::::::: :::::::
CCDS54 ----------QL----------------------DSATSLIQAAKNLMNAVVLTVKASYV
770 780 790
840 850 860 870 880 890
pF1KB5 ASTKYQKSQGMASLNLPAVSWKMKAPEKKPLVKREKQDETQTKIKRASQKKHVNPVQALS
::::::: : :..: :.:::::::::::::::::: .: ::...:.:::::..::::::
CCDS54 ASTKYQKVYGTAAVNSPVVSWKMKAPEKKPLVKREKPEEFQTRVRRGSQKKHISPVQALS
800 810 820 830 840 850
900
pF1KB5 EFKAMDSI
:::::::
CCDS54 EFKAMDSF
860
>>CCDS7269.1 CTNNA3 gene_id:29119|Hs108|chr10 (895 aa)
initn: 3379 init1: 1696 opt: 3492 Z-score: 3719.6 bits: 699.5 E(32554): 7.3e-201
Smith-Waterman score: 3492; 59.7% identity (87.5% similar) in 894 aa overlap (9-901:7-890)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MTAVHAGNINFKWDPKSLEIRTLAVERLLEPLVTQVTTLVNTNSKGPSNKKRGRSKKAHV
:... ::..:...:..::.:::::. ::::::: ..::..:.::::.: :
CCDS72 MSAETPITLNIDPQDLQVQTFTVEKLLEPLIIQVTTLVNC-PQNPSSRKKGRSKRASV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LAASVEQATENFLEKGDKIAKESQFLKEELVAAVEDVRKQGDLMKAAAGEFADDPCSSVK
: ::::.:: :.:.::.:::.:. ::.::.:..:.:::... .:..: .:.:::: :
CCDS72 LLASVEEATWNLLDKGEKIAQEATVLKDELTASLEEVRKESEALKVSAERFTDDPCFLPK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 RGNMVRAARALLSAVTRLLILADMADVYKLLVQLKVVEDGILKLRNAGNEQDLGIQYKAL
: .:.::::::.::::::::::: ::. :: .... . . .:.:..:..:: :. :
CCDS72 REAVVQAARALLAAVTRLLILADMIDVMCLLQHVSAFQRTFESLKNVANKSDLQKTYQKL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 KPEVDKLNIMAAKRQQELKDVGHRDQMAAARGILQKNVPILYTASQACLQHPDVAAYKAN
:...:. .: ::::.::. ..::..:.::. :..: :.:.. .:::.: :::. ::.
CCDS72 GKELENLDYLAFKRQQDLKSPNQRDEIAGARASLKENSPLLHSICSACLEHSDVASLKAS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 RDLIYKQLQQAVTGISNAAQATASDDASQHQGGGGGELAYALNNFDKQIIVDPLSFSEER
.: . ...:.:.. ::::.:. .. . .. :. ::..... :...::. .::.
CCDS72 KDTVCEEIQNALNVISNASQGI--QNMTTPPEPQAATLGSALDELENLIVLNPLTVTEEE
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 FRPSLEERLESIISGAALMADSSCTRDDRRERIVAECNAVRQALQDLLSEYMGNAGRKER
.:::::.:::.:::::::.:::::::: .::::.:::::.::::::::::::.:::.:::
CCDS72 IRPSLEKRLEAIISGAALLADSSCTRDLHRERIIAECNAIRQALQDLLSEYMNNAGKKER
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 SDALNSAIDKMTKKTRDLRRQLRKAVMDHVSDSFLETNVPLLVLIEAAKNGNEKEVKEYA
:..:: :.:.: :::::::::::::..::::::::.:.::::::::::::: :::.::::
CCDS72 SNTLNIALDNMCKKTRDLRRQLRKAIIDHVSDSFLDTTVPLLVLIEAAKNGREKEIKEYA
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 QVFREHANKLIEVANLACSISNNEEGVKLVRMSASQLEALCPQVINAALALAAKPQSKLA
.:.::...:.::::::::.:.::.:.:.:...:..::.::::.:::::::::.:.:. .
CCDS72 AIFHEHTSRLVEVANLACSMSTNEDGIKIVKIAANHLETLCPQIINAALALAARPKSQAV
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 QENMDLFKEQWEKQVRVLTDAVDDITSIDDFLAVSENHILEDVNKCVIALQEKDVDGLDR
...:...:. ::....:::.::::::::::::::::.:::::::::.:::...:.:.:::
CCDS72 KNTMEMYKRTWENHIHVLTEAVDDITSIDDFLAVSESHILEDVNKCIIALRDQDADNLDR
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 TAGAIRGRAARVIHVVTSEMDNYEPGVYTEKVLEATKLLSNTVMPRFTEQVEAAVEALSS
.::::::::::: :.::.:::.::::.::: :.. ...:..::.:.:. ::..:.::::.
CCDS72 AAGAIRGRAARVAHIVTGEMDSYEPGAYTEGVMRNVNFLTSTVIPEFVTQVNVALEALSK
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650
pF1KB5 DPAQPMDENEFIDASRLVYDGIRDIRKAVLMIRTPEELDD-SDFETEDFDVRSRTSVQTE
. . .:.:.:.: :. .:: :.::: .:.::::::::.: ::.: :. .:::.::.:::
CCDS72 SSLNVLDDNQFVDISKKIYDTIHDIRCSVMMIRTPEELEDVSDLE-EEHEVRSHTSIQTE
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 DDQLIAGQSARAIMAQLPQEQKAKIAEQVASFQEEKSKLDAEVSKWDDSGNDIIVLAKQM
:.. :: :.:::. .: :::::::.:.. :::::::. :::..::::::::.:
CCDS72 ------GKTDRAKMTQLPEAEKEKIAEQVADFKKVKSKLDAEIEIWDDTSNDIIVLAKNM
660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KB5 CMIMMEMTDFTRGKGPLKNTSDVISAAKKIAEAGSRMDKLGRTIADHCPDSACKQDLLAY
::::::::::::::::::.:.::: ::: :.:.::::: :.: ::..::: .::::::::
CCDS72 CMIMMEMTDFTRGKGPLKHTTDVIYAAKMISESGSRMDVLARQIANQCPDPSCKQDLLAY
710 720 730 740 750 760
780 790 800 810 820 830
pF1KB5 LQRIALYCHQLNICSKVKAEVQNLGGELVVSGVDSAMSLIQAAKNLMNAVVQTVKASYVA
:..: .: :::.:::.::::.:::::::..:..::. :::::::::::::::::: ::.:
CCDS72 LEQIKFYSHQLKICSQVKAEIQNLGGELIMSALDSVTSLIQAAKNLMNAVVQTVKMSYIA
770 780 790 800 810 820
840 850 860 870 880 890
pF1KB5 STKYQKSQGMASLNLPAVSWKMKAPEKKPLVKREKQDETQTKIKRASQKKHVNPVQALSE
::: . :. :. :.: :.:::: ::::.:::: .:: . ..:.: ::...:.:..::
CCDS72 STKIIRIQSPAGPRHPVVMWRMKAPAKKPLIKREKPEETCAAVRRGSAKKKIHPLQVMSE
830 840 850 860 870 880
900
pF1KB5 FKAMDSI
:.
CCDS72 FRGRQIY
890
>>CCDS75315.1 CTNNA1 gene_id:1495|Hs108|chr5 (536 aa)
initn: 3396 init1: 3396 opt: 3396 Z-score: 3620.9 bits: 680.4 E(32554): 2.3e-195
Smith-Waterman score: 3396; 100.0% identity (100.0% similar) in 536 aa overlap (371-906:1-536)
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 RQALQDLLSEYMGNAGRKERSDALNSAIDKMTKKTRDLRRQLRKAVMDHVSDSFLETNVP
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MTKKTRDLRRQLRKAVMDHVSDSFLETNVP
10 20 30
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 LLVLIEAAKNGNEKEVKEYAQVFREHANKLIEVANLACSISNNEEGVKLVRMSASQLEAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LLVLIEAAKNGNEKEVKEYAQVFREHANKLIEVANLACSISNNEEGVKLVRMSASQLEAL
40 50 60 70 80 90
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 CPQVINAALALAAKPQSKLAQENMDLFKEQWEKQVRVLTDAVDDITSIDDFLAVSENHIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 CPQVINAALALAAKPQSKLAQENMDLFKEQWEKQVRVLTDAVDDITSIDDFLAVSENHIL
100 110 120 130 140 150
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 EDVNKCVIALQEKDVDGLDRTAGAIRGRAARVIHVVTSEMDNYEPGVYTEKVLEATKLLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 EDVNKCVIALQEKDVDGLDRTAGAIRGRAARVIHVVTSEMDNYEPGVYTEKVLEATKLLS
160 170 180 190 200 210
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 NTVMPRFTEQVEAAVEALSSDPAQPMDENEFIDASRLVYDGIRDIRKAVLMIRTPEELDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NTVMPRFTEQVEAAVEALSSDPAQPMDENEFIDASRLVYDGIRDIRKAVLMIRTPEELDD
220 230 240 250 260 270
650 660 670 680 690 700
pF1KB5 SDFETEDFDVRSRTSVQTEDDQLIAGQSARAIMAQLPQEQKAKIAEQVASFQEEKSKLDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SDFETEDFDVRSRTSVQTEDDQLIAGQSARAIMAQLPQEQKAKIAEQVASFQEEKSKLDA
280 290 300 310 320 330
710 720 730 740 750 760
pF1KB5 EVSKWDDSGNDIIVLAKQMCMIMMEMTDFTRGKGPLKNTSDVISAAKKIAEAGSRMDKLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 EVSKWDDSGNDIIVLAKQMCMIMMEMTDFTRGKGPLKNTSDVISAAKKIAEAGSRMDKLG
340 350 360 370 380 390
770 780 790 800 810 820
pF1KB5 RTIADHCPDSACKQDLLAYLQRIALYCHQLNICSKVKAEVQNLGGELVVSGVDSAMSLIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RTIADHCPDSACKQDLLAYLQRIALYCHQLNICSKVKAEVQNLGGELVVSGVDSAMSLIQ
400 410 420 430 440 450
830 840 850 860 870 880
pF1KB5 AAKNLMNAVVQTVKASYVASTKYQKSQGMASLNLPAVSWKMKAPEKKPLVKREKQDETQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 AAKNLMNAVVQTVKASYVASTKYQKSQGMASLNLPAVSWKMKAPEKKPLVKREKQDETQT
460 470 480 490 500 510
890 900
pF1KB5 KIKRASQKKHVNPVQALSEFKAMDSI
::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 KIKRASQKKHVNPVQALSEFKAMDSI
520 530
>>CCDS62945.1 CTNNA2 gene_id:1496|Hs108|chr2 (584 aa)
initn: 3113 init1: 1596 opt: 3105 Z-score: 3310.2 bits: 623.1 E(32554): 4.7e-178
Smith-Waterman score: 3105; 86.6% identity (96.6% similar) in 551 aa overlap (356-905:33-583)
330 340 350 360 370 380
pF1KB5 RDDRRERIVAECNAVRQALQDLLSEYMGNAGRKERSDALNSAIDKMTKKTRDLRRQLRKA
::::..: :: :::::::::::::::::::
CCDS62 GWRRPLQSVGKVCEKNMKTSEMHTMSGAQTGRKEKGDPLNIAIDKMTKKTRDLRRQLRKA
10 20 30 40 50 60
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 VMDHVSDSFLETNVPLLVLIEAAKNGNEKEVKEYAQVFREHANKLIEVANLACSISNNEE
::::.:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS62 VMDHISDSFLETNVPLLVLIEAAKSGNEKEVKEYAQVFREHANKLVEVANLACSISNNEE
70 80 90 100 110 120
450 460 470 480 490 500
pF1KB5 GVKLVRMSASQLEALCPQVINAALALAAKPQSKLAQENMDLFKEQWEKQVRVLTDAVDDI
:::::::.:.:...::::::::::.:::.::::.::.:::.::.::::::::::.:::::
CCDS62 GVKLVRMAATQIDSLCPQVINAALTLAARPQSKVAQDNMDVFKDQWEKQVRVLTEAVDDI
130 140 150 160 170 180
510 520 530 540 550 560
pF1KB5 TSIDDFLAVSENHILEDVNKCVIALQEKDVDGLDRTAGAIRGRAARVIHVVTSEMDNYEP
::.::::.::::::::::::::::::: ::: :::::::::::::::::....::.:::
CCDS62 TSVDDFLSVSENHILEDVNKCVIALQEGDVDTLDRTAGAIRGRAARVIHIINAEMENYEA
190 200 210 220 230 240
570 580 590 600 610 620
pF1KB5 GVYTEKVLEATKLLSNTVMPRFTEQVEAAVEALSSDPAQPMDENEFIDASRLVYDGIRDI
:::::::::::::::.::::::.::::.:.::::.. ::..::::::::::::::.:::
CCDS62 GVYTEKVLEATKLLSETVMPRFAEQVEVAIEALSANVPQPFEENEFIDASRLVYDGVRDI
250 260 270 280 290 300
630 640 650 660 670 680
pF1KB5 RKAVLMIRTPEEL-DDSDFETEDFDVRSRTSVQTEDDQLIAGQSARAIMAQLPQEQKAKI
::::::::::::: :::::: ::.:::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS62 RKAVLMIRTPEELEDDSDFEQEDYDVRSRTSVQTEDDQLIAGQSARAIMAQLPQEEKAKI
310 320 330 340 350 360
690 700 710 720 730 740
pF1KB5 AEQVASFQEEKSKLDAEVSKWDDSGNDIIVLAKQMCMIMMEMTDFTRGKGPLKNTSDVIS
:::: :..:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS62 AEQVEIFHQEKSKLDAEVAKWDDSGNDIIVLAKQMCMIMMEMTDFTRGKGPLKNTSDVIN
370 380 390 400 410 420
750 760 770 780 790 800
pF1KB5 AAKKIAEAGSRMDKLGRTIADHCPDSACKQDLLAYLQRIALYCHQLNICSKVKAEVQNLG
:::::::::::::::.:..::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 AAKKIAEAGSRMDKLARAVADQCPDSACKQDLLAYLQRIALYCHQLNICSKVKAEVQNLG
430 440 450 460 470 480
810 820 830 840 850 860
pF1KB5 GELVVSGVDSAMSLIQAAKNLMNAVVQTVKASYVASTKYQKSQGMASLNLPAVSWKMKAP
:::.:::.::: :::::::::::::: :::::::::::::: : :..: :.::::::::
CCDS62 GELIVSGLDSATSLIQAAKNLMNAVVLTVKASYVASTKYQKVYGTAAVNSPVVSWKMKAP
490 500 510 520 530 540
870 880 890 900
pF1KB5 EKKPLVKREKQDETQTKIKRASQKKHVNPVQALSEFKAMDSI
:::::::::: .: ::...:.:::::..:::::::::::::
CCDS62 EKKPLVKREKPEEFQTRVRRGSQKKHISPVQALSEFKAMDSF
550 560 570 580
>>CCDS74531.1 CTNNA2 gene_id:1496|Hs108|chr2 (537 aa)
initn: 1531 init1: 1531 opt: 3035 Z-score: 3236.2 bits: 609.3 E(32554): 6.2e-174
Smith-Waterman score: 3035; 86.9% identity (96.8% similar) in 536 aa overlap (371-905:1-536)
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 RQALQDLLSEYMGNAGRKERSDALNSAIDKMTKKTRDLRRQLRKAVMDHVSDSFLETNVP
:::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS74 MTKKTRDLRRQLRKAVMDHISDSFLETNVP
10 20 30
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 LLVLIEAAKNGNEKEVKEYAQVFREHANKLIEVANLACSISNNEEGVKLVRMSASQLEAL
:::::::::.::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::.:.:...:
CCDS74 LLVLIEAAKSGNEKEVKEYAQVFREHANKLVEVANLACSISNNEEGVKLVRMAATQIDSL
40 50 60 70 80 90
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 CPQVINAALALAAKPQSKLAQENMDLFKEQWEKQVRVLTDAVDDITSIDDFLAVSENHIL
:::::::::.:::.::::.::.:::.::.::::::::::.:::::::.::::.:::::::
CCDS74 CPQVINAALTLAARPQSKVAQDNMDVFKDQWEKQVRVLTEAVDDITSVDDFLSVSENHIL
100 110 120 130 140 150
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 EDVNKCVIALQEKDVDGLDRTAGAIRGRAARVIHVVTSEMDNYEPGVYTEKVLEATKLLS
:::::::::::: ::: :::::::::::::::::....::.::: :::::::::::::::
CCDS74 EDVNKCVIALQEGDVDTLDRTAGAIRGRAARVIHIINAEMENYEAGVYTEKVLEATKLLS
160 170 180 190 200 210
590 600 610 620 630
pF1KB5 NTVMPRFTEQVEAAVEALSSDPAQPMDENEFIDASRLVYDGIRDIRKAVLMIRTPEEL-D
.::::::.::::.:.::::.. ::..::::::::::::::.:::::::::::::::: :
CCDS74 ETVMPRFAEQVEVAIEALSANVPQPFEENEFIDASRLVYDGVRDIRKAVLMIRTPEELED
220 230 240 250 260 270
640 650 660 670 680 690
pF1KB5 DSDFETEDFDVRSRTSVQTEDDQLIAGQSARAIMAQLPQEQKAKIAEQVASFQEEKSKLD
::::: ::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::: :..::::::
CCDS74 DSDFEQEDYDVRSRTSVQTEDDQLIAGQSARAIMAQLPQEEKAKIAEQVEIFHQEKSKLD
280 290 300 310 320 330
700 710 720 730 740 750
pF1KB5 AEVSKWDDSGNDIIVLAKQMCMIMMEMTDFTRGKGPLKNTSDVISAAKKIAEAGSRMDKL
:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::
CCDS74 AEVAKWDDSGNDIIVLAKQMCMIMMEMTDFTRGKGPLKNTSDVINAAKKIAEAGSRMDKL
340 350 360 370 380 390
760 770 780 790 800 810
pF1KB5 GRTIADHCPDSACKQDLLAYLQRIALYCHQLNICSKVKAEVQNLGGELVVSGVDSAMSLI
.:..::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::: :::
CCDS74 ARAVADQCPDSACKQDLLAYLQRIALYCHQLNICSKVKAEVQNLGGELIVSGLDSATSLI
400 410 420 430 440 450
820 830 840 850 860 870
pF1KB5 QAAKNLMNAVVQTVKASYVASTKYQKSQGMASLNLPAVSWKMKAPEKKPLVKREKQDETQ
::::::::::: :::::::::::::: : :..: :.:::::::::::::::::: .: :
CCDS74 QAAKNLMNAVVLTVKASYVASTKYQKVYGTAAVNSPVVSWKMKAPEKKPLVKREKPEEFQ
460 470 480 490 500 510
880 890 900
pF1KB5 TKIKRASQKKHVNPVQALSEFKAMDSI
:...:.:::::..:::::::::::::
CCDS74 TRVRRGSQKKHISPVQALSEFKAMDSF
520 530
>>CCDS69638.1 CTNNAL1 gene_id:8727|Hs108|chr9 (718 aa)
initn: 617 init1: 283 opt: 606 Z-score: 646.0 bits: 130.4 E(32554): 1.2e-29
Smith-Waterman score: 606; 26.7% identity (65.0% similar) in 520 aa overlap (6-508:19-525)
10 20 30 40
pF1KB5 MTAVHAGNINFKWDPKSLEIRTLAVERLLEPLVTQVTTLVNTNSKGP
.:. .: : ..:::.: .::. : :::.:.:::.: ..
CCDS69 MAASPGPAGVGGAGAVYGSGSSGFALD-SGLEIKTRSVEQTLLPLVSQITTLINHKD---
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 SNKKRGRSKKA-HVLAASVEQATENFLEKGDKIAKESQFLKEELVAAVEDVRKQGDLMKA
..:: .. .: . .. .:. :. :.. :. ::.:. ::::. : .... :. . :
CCDS69 NTKKSDKTLQAIQRVGQAVNLAVGRFVKVGEAIANENWDLKEEINIACIEAKQAGETIAA
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150
pF1KB5 AA-----GEFADDPCSSV--KRGNMVRAARALLSAVTRLLILADMADVYKLLVQLKVVED
. ... .: .. . ....::: :::.::..:.::: . . ..... . :
CCDS69 LTDITNLNHLESDGQITIFTDKTGVIKAARLLLSSVTKVLLLADRVVIKQIITSRNKVLA
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 GILKLRNAGNEQDLGIQYKALKPEVDKLNIMAAKRQQELKDVGHRDQMAAARGILQKNVP
. .:..... :.. .. . :. .. ... ::..::: .. .:::::..:.: .
CCDS69 TMERLEKVNSFQEFVQIFSQFGNEMVEFAHLSGDRQNDLKDEKKKAKMAAARAVLEKCTM
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 ILYTASQACLQHPDVAAYKANRDLIYKQLQQA----VTGISNAAQATASDDASQHQGGGG
.: :::..::.::. . . :.. .. ... : . ... .: .: :
CCDS69 MLLTASKTCLRHPNCESAHKNKEGVFDRMKVALDKVIEIVTDCKPNGETDISSISIFTGI
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 GELAYALNNFDKQIIVDPLSFSEERFRPSLEERLESIISGAALMADSSCTRDDRRERIVA
:. . .. . ... . :.: . .:: :: . . ..::. : ..::::.
CCDS69 KEFKMNIEALRENLYFQ----SKENLSVTLEVILERMED----FTDSAYTSHEHRERILE
300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 ECNAVRQALQDLLSEYMGNAGRKERSDA--LNSAIDKMTKKTRDLRRQLRKAVMDHVSD-
. .:. ::.:.: .. ..: .: : :. .: :.... .:...:.... . ..:
CCDS69 LSTQARMELQQLISVWIQAQSKKTKSIAEELELSILKISHSLNELKKELHSTATQLAADL
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 -SFLETNVPLLVLIEAAKNGNEKEVKEYAQVFREHANKLIEVANLACSISNNEEGVKLVR
.. .: : .: .. .:: . . ::: . :. ..:.:. : ::..: ....
CCDS69 LKYHADHVVLKALKLTGVEGNLEALAEYACKLSEQKEQLVETCRLLRHISGTEP-LEITC
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 MSASQ-LEALCPQVINAALALAAKPQSKLAQENMDLFKEQWEKQVRVLTDAVDDITSIDD
. : . ... :.:.:: .:. .:.::.:.::.:.: : ::.:. .. . .:...
CCDS69 IHAEETFQVTGQQIISAAETLTLHPSSKIAKENLDVFCEAWESQISDMSTLLREINDVFE
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550 560 570
pF1KB5 FLAVSENHILEDVNKCVIALQEKDVDGLDRTAGAIRGRAARVIHVVTSEMDNYEPGVYTE
CCDS69 GRRGEKYGYLSLPKPMKNNANLKSLKPDKPDSEEQAKIAKLGLKLGLLTSDADCEIEKWE
530 540 550 560 570 580
906 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 18:03:37 2016 done: Thu Nov 3 18:03:37 2016
Total Scan time: 2.440 Total Display time: 0.180
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]