Result of FASTA (ccds) for pF1KB5571
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5571, 918 aa
  1>>>pF1KB5571 918 - 918 aa - 918 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7211+/-0.00106; mu= 14.1987+/- 0.064
 mean_var=99.6002+/-19.580, 0's: 0 Z-trim(105.7): 109  B-trim: 80 in 1/50
 Lambda= 0.128512
 statistics sampled from 8437 (8548) to 8437 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.624), E-opt: 0.2 (0.263), width:  16
 Scan time:  4.310

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS3971.1 IL6ST gene_id:3572|Hs108|chr5           ( 918) 6194 1159.7       0
CCDS54856.1 IL6ST gene_id:3572|Hs108|chr5          ( 857) 2913 551.4 2.7e-156
CCDS47209.1 IL6ST gene_id:3572|Hs108|chr5          ( 329) 2186 416.4 4.4e-116
CCDS56366.1 IL31RA gene_id:133396|Hs108|chr5       ( 662)  909 179.8 1.5e-44
CCDS56365.1 IL31RA gene_id:133396|Hs108|chr5       ( 681)  909 179.8 1.5e-44
CCDS75245.1 IL31RA gene_id:133396|Hs108|chr5       ( 745)  909 179.8 1.7e-44
CCDS3970.2 IL31RA gene_id:133396|Hs108|chr5        ( 764)  909 179.8 1.7e-44
CCDS56367.1 IL31RA gene_id:133396|Hs108|chr5       ( 622)  774 154.7 4.9e-37
CCDS75244.1 IL31RA gene_id:133396|Hs108|chr5       ( 582)  730 146.6 1.3e-34
CCDS412.1 CSF3R gene_id:1441|Hs108|chr1            ( 783)  701 141.2 7.1e-33
CCDS413.1 CSF3R gene_id:1441|Hs108|chr1            ( 836)  701 141.3 7.5e-33
CCDS414.1 CSF3R gene_id:1441|Hs108|chr1            ( 863)  678 137.0 1.5e-31
CCDS72805.1 IL12RB2 gene_id:3595|Hs108|chr1        ( 635)  587 120.1 1.4e-26
CCDS58006.1 IL12RB2 gene_id:3595|Hs108|chr1        ( 659)  587 120.1 1.4e-26
CCDS638.1 IL12RB2 gene_id:3595|Hs108|chr1          ( 862)  587 120.1 1.8e-26
CCDS3927.1 LIFR gene_id:3977|Hs108|chr5            (1097)  562 115.5 5.4e-25
CCDS58007.1 IL12RB2 gene_id:3595|Hs108|chr1        ( 776)  498 103.6 1.5e-21
CCDS32962.1 CRLF1 gene_id:9244|Hs108|chr19         ( 422)  453 95.1 2.9e-19
CCDS30740.1 LEPR gene_id:3953|Hs108|chr1           ( 896)  385 82.7 3.4e-15
CCDS55604.1 LEPR gene_id:3953|Hs108|chr1           ( 906)  385 82.7 3.5e-15
CCDS30741.1 LEPR gene_id:3953|Hs108|chr1           ( 958)  385 82.7 3.6e-15
CCDS631.1 LEPR gene_id:3953|Hs108|chr1             (1165)  385 82.7 4.3e-15


>>CCDS3971.1 IL6ST gene_id:3572|Hs108|chr5                (918 aa)
 initn: 6194 init1: 6194 opt: 6194  Z-score: 6206.7  bits: 1159.7 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6194; 100.0% identity (100.0% similar) in 918 aa overlap (1-918:1-918)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MLTLQTWLVQALFIFLTTESTGELLDPCGYISPESPVVQLHSNFTAVCVLKEKCMDYFHV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 MLTLQTWLVQALFIFLTTESTGELLDPCGYISPESPVVQLHSNFTAVCVLKEKCMDYFHV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 NANYIVWKTNHFTIPKEQYTIINRTASSVTFTDIASLNIQLTCNILTFGQLEQNVYGITI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 NANYIVWKTNHFTIPKEQYTIINRTASSVTFTDIASLNIQLTCNILTFGQLEQNVYGITI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 ISGLPPEKPKNLSCIVNEGKKMRCEWDGGRETHLETNFTLKSEWATHKFADCKAKRDTPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 ISGLPPEKPKNLSCIVNEGKKMRCEWDGGRETHLETNFTLKSEWATHKFADCKAKRDTPT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 SCTVDYSTVYFVNIEVWVEAENALGKVTSDHINFDPVYKVKPNPPHNLSVINSEELSSIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 SCTVDYSTVYFVNIEVWVEAENALGKVTSDHINFDPVYKVKPNPPHNLSVINSEELSSIL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 KLTWTNPSIKSVIILKYNIQYRTKDASTWSQIPPEDTASTRSSFTVQDLKPFTEYVFRIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 KLTWTNPSIKSVIILKYNIQYRTKDASTWSQIPPEDTASTRSSFTVQDLKPFTEYVFRIR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 CMKEDGKGYWSDWSEEASGITYEDRPSKAPSFWYKIDPSHTQGYRTVQLVWKTLPPFEAN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 CMKEDGKGYWSDWSEEASGITYEDRPSKAPSFWYKIDPSHTQGYRTVQLVWKTLPPFEAN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 GKILDYEVTLTRWKSHLQNYTVNATKLTVNLTNDRYLATLTVRNLVGKSDAAVLTIPACD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 GKILDYEVTLTRWKSHLQNYTVNATKLTVNLTNDRYLATLTVRNLVGKSDAAVLTIPACD
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 FQATHPVMDLKAFPKDNMLWVEWTTPRESVKKYILEWCVLSDKAPCITDWQQEDGTVHRT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 FQATHPVMDLKAFPKDNMLWVEWTTPRESVKKYILEWCVLSDKAPCITDWQQEDGTVHRT
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 YLRGNLAESKCYLITVTPVYADGPGSPESIKAYLKQAPPSKGPTVRTKKVGKNEAVLEWD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 YLRGNLAESKCYLITVTPVYADGPGSPESIKAYLKQAPPSKGPTVRTKKVGKNEAVLEWD
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 QLPVDVQNGFIRNYTIFYRTIIGNETAVNVDSSHTEYTLSSLTSDTLYMVRMAAYTDEGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 QLPVDVQNGFIRNYTIFYRTIIGNETAVNVDSSHTEYTLSSLTSDTLYMVRMAAYTDEGG
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB5 KDGPEFTFTTPKFAQGEIEAIVVPVCLAFLLTTLLGVLFCFNKRDLIKKHIWPNVPDPSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 KDGPEFTFTTPKFAQGEIEAIVVPVCLAFLLTTLLGVLFCFNKRDLIKKHIWPNVPDPSK
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB5 SHIAQWSPHTPPRHNFNSKDQMYSDGNFTDVSVVEIEANDKKPFPEDLKSLDLFKKEKIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 SHIAQWSPHTPPRHNFNSKDQMYSDGNFTDVSVVEIEANDKKPFPEDLKSLDLFKKEKIN
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB5 TEGHSSGIGGSSCMSSSRPSISSSDENESSQNTSSTVQYSTVVHSGYRHQVPSVQVFSRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 TEGHSSGIGGSSCMSSSRPSISSSDENESSQNTSSTVQYSTVVHSGYRHQVPSVQVFSRS
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB5 ESTQPLLDSEERPEDLQLVDHVDGGDGILPRQQYFKQNCSQHESSPDISHFERSKQVSSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 ESTQPLLDSEERPEDLQLVDHVDGGDGILPRQQYFKQNCSQHESSPDISHFERSKQVSSV
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB5 NEEDFVRLKQQISDHISQSCGSGQMKMFQEVSAADAFGPGTEGQVERFETVGMEAATDEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS39 NEEDFVRLKQQISDHISQSCGSGQMKMFQEVSAADAFGPGTEGQVERFETVGMEAATDEG
              850       860       870       880       890       900

              910        
pF1KB5 MPKSYLPQTVRQGGYMPQ
       ::::::::::::::::::
CCDS39 MPKSYLPQTVRQGGYMPQ
              910        

>>CCDS54856.1 IL6ST gene_id:3572|Hs108|chr5               (857 aa)
 initn: 2912 init1: 2912 opt: 2913  Z-score: 2919.6  bits: 551.4 E(32554): 2.7e-156
Smith-Waterman score: 5619; 93.4% identity (93.4% similar) in 918 aa overlap (1-918:1-857)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MLTLQTWLVQALFIFLTTESTGELLDPCGYISPESPVVQLHSNFTAVCVLKEKCMDYFHV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MLTLQTWLVQALFIFLTTESTGELLDPCGYISPESPVVQLHSNFTAVCVLKEKCMDYFHV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 NANYIVWKTNHFTIPKEQYTIINRTASSVTFTDIASLNIQLTCNILTFGQLEQNVYGITI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NANYIVWKTNHFTIPKEQYTIINRTASSVTFTDIASLNIQLTCNILTFGQLEQNVYGITI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 ISGLPPEKPKNLSCIVNEGKKMRCEWDGGRETHLETNFTLKSEWATHKFADCKAKRDTPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ISGLPPEKPKNLSCIVNEGKKMRCEWDGGRETHLETNFTLKSEWATHKFADCKAKRDTPT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 SCTVDYSTVYFVNIEVWVEAENALGKVTSDHINFDPVYKVKPNPPHNLSVINSEELSSIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SCTVDYSTVYFVNIEVWVEAENALGKVTSDHINFDPVYKVKPNPPHNLSVINSEELSSIL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 KLTWTNPSIKSVIILKYNIQYRTKDASTWSQIPPEDTASTRSSFTVQDLKPFTEYVFRIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KLTWTNPSIKSVIILKYNIQYRTKDASTWSQIPPEDTASTRSSFTVQDLKPFTEYVFRIR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 CMKEDGKGYWSDWSEEASGITYEDRPSKAPSFWYKIDPSHTQGYRTVQLVWKTLPPFEAN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 CMKEDGKGYWSDWSEEASGITYEDRPSKAPSFWYKIDPSHTQGYRTVQLVWKTLPPFEAN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 GKILDYEVTLTRWKSHLQNYTVNATKLTVNLTNDRYLATLTVRNLVGKSDAAVLTIPACD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GKILDYEVTLTRWKSHLQNYTVNATKLTVNLTNDRYLATLTVRNLVGKSDAAVLTIPACD
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 FQATHPVMDLKAFPKDNMLWVEWTTPRESVKKYILEWCVLSDKAPCITDWQQEDGTVHRT
       ::                                                          
CCDS54 FQ----------------------------------------------------------
                                                                   

              490       500       510       520       530       540
pF1KB5 YLRGNLAESKCYLITVTPVYADGPGSPESIKAYLKQAPPSKGPTVRTKKVGKNEAVLEWD
          :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ---GNLAESKCYLITVTPVYADGPGSPESIKAYLKQAPPSKGPTVRTKKVGKNEAVLEWD
               430       440       450       460       470         

              550       560       570       580       590       600
pF1KB5 QLPVDVQNGFIRNYTIFYRTIIGNETAVNVDSSHTEYTLSSLTSDTLYMVRMAAYTDEGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QLPVDVQNGFIRNYTIFYRTIIGNETAVNVDSSHTEYTLSSLTSDTLYMVRMAAYTDEGG
     480       490       500       510       520       530         

              610       620       630       640       650       660
pF1KB5 KDGPEFTFTTPKFAQGEIEAIVVPVCLAFLLTTLLGVLFCFNKRDLIKKHIWPNVPDPSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KDGPEFTFTTPKFAQGEIEAIVVPVCLAFLLTTLLGVLFCFNKRDLIKKHIWPNVPDPSK
     540       550       560       570       580       590         

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pF1KB5 SHIAQWSPHTPPRHNFNSKDQMYSDGNFTDVSVVEIEANDKKPFPEDLKSLDLFKKEKIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SHIAQWSPHTPPRHNFNSKDQMYSDGNFTDVSVVEIEANDKKPFPEDLKSLDLFKKEKIN
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pF1KB5 TEGHSSGIGGSSCMSSSRPSISSSDENESSQNTSSTVQYSTVVHSGYRHQVPSVQVFSRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TEGHSSGIGGSSCMSSSRPSISSSDENESSQNTSSTVQYSTVVHSGYRHQVPSVQVFSRS
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pF1KB5 ESTQPLLDSEERPEDLQLVDHVDGGDGILPRQQYFKQNCSQHESSPDISHFERSKQVSSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ESTQPLLDSEERPEDLQLVDHVDGGDGILPRQQYFKQNCSQHESSPDISHFERSKQVSSV
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pF1KB5 NEEDFVRLKQQISDHISQSCGSGQMKMFQEVSAADAFGPGTEGQVERFETVGMEAATDEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NEEDFVRLKQQISDHISQSCGSGQMKMFQEVSAADAFGPGTEGQVERFETVGMEAATDEG
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              910        
pF1KB5 MPKSYLPQTVRQGGYMPQ
       ::::::::::::::::::
CCDS54 MPKSYLPQTVRQGGYMPQ
     840       850       

>>CCDS47209.1 IL6ST gene_id:3572|Hs108|chr5               (329 aa)
 initn: 2186 init1: 2186 opt: 2186  Z-score: 2197.5  bits: 416.4 E(32554): 4.4e-116
Smith-Waterman score: 2186; 100.0% identity (100.0% similar) in 324 aa overlap (1-324:1-324)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MLTLQTWLVQALFIFLTTESTGELLDPCGYISPESPVVQLHSNFTAVCVLKEKCMDYFHV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MLTLQTWLVQALFIFLTTESTGELLDPCGYISPESPVVQLHSNFTAVCVLKEKCMDYFHV
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pF1KB5 NANYIVWKTNHFTIPKEQYTIINRTASSVTFTDIASLNIQLTCNILTFGQLEQNVYGITI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NANYIVWKTNHFTIPKEQYTIINRTASSVTFTDIASLNIQLTCNILTFGQLEQNVYGITI
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pF1KB5 ISGLPPEKPKNLSCIVNEGKKMRCEWDGGRETHLETNFTLKSEWATHKFADCKAKRDTPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ISGLPPEKPKNLSCIVNEGKKMRCEWDGGRETHLETNFTLKSEWATHKFADCKAKRDTPT
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pF1KB5 SCTVDYSTVYFVNIEVWVEAENALGKVTSDHINFDPVYKVKPNPPHNLSVINSEELSSIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SCTVDYSTVYFVNIEVWVEAENALGKVTSDHINFDPVYKVKPNPPHNLSVINSEELSSIL
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pF1KB5 KLTWTNPSIKSVIILKYNIQYRTKDASTWSQIPPEDTASTRSSFTVQDLKPFTEYVFRIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KLTWTNPSIKSVIILKYNIQYRTKDASTWSQIPPEDTASTRSSFTVQDLKPFTEYVFRIR
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pF1KB5 CMKEDGKGYWSDWSEEASGITYEDRPSKAPSFWYKIDPSHTQGYRTVQLVWKTLPPFEAN
       ::::::::::::::::::::::::                                    
CCDS47 CMKEDGKGYWSDWSEEASGITYEDNIASF                               
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>>CCDS56366.1 IL31RA gene_id:133396|Hs108|chr5            (662 aa)
 initn: 736 init1: 507 opt: 909  Z-score: 913.3  bits: 179.8 E(32554): 1.5e-44
Smith-Waterman score: 909; 29.6% identity (61.7% similar) in 551 aa overlap (126-666:35-581)

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pF1KB5 SLNIQLTCNILTFGQLEQNVYGITIISGLPPEKPKNLSCIVNEGKKMRCEWDGGRETHLE
                                     : ::.:.::.    :.. : :. :.::   
CCDS56 PQPSCVNLGMMWTWALWMLPSLCKFSLAALPAKPENISCVYYYRKNLTCTWSPGKETSY-
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pF1KB5 TNFTLKSEWAT-HKFADCKAKRDTP---TSCTVDYSTVYFV-NIEVWVEAENALGKVTSD
       :..:.:  .:  .:  .: .. .:    .::.     . .  :  . :::::. : . : 
CCDS56 TQYTVKRTYAFGEKHDNCTTNSSTSENRASCSFFLPRITIPDNYTIEVEAENGDGVIKS-
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pF1KB5 HINFDPVYKV-KPNPPHNLSVINSEELSSILKLTWTNPSIKSVII-LKYNIQYRTKDAST
       :...  . .. : .::. . :     .. .... : .: .  :   :::....:: ....
CCDS56 HMTYWRLENIAKTEPPKIFRVKPVLGIKRMIQIEWIKPELAPVSSDLKYTLRFRTVNSTS
            130       140       150       160       170       180  

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pF1KB5 WSQIP-PEDTASTRSSFTVQDLKPFTEYVFRIRCMKEDGKGYWSDWSEEASGITYEDRPS
       : ..   ..  .  .....  :.::::::. .::  ...: .:::::.:  :.: :. : 
CCDS56 WMEVNFAKNRKDKNQTYNLTGLQPFTEYVIALRCAVKESK-FWSDWSQEKMGMTEEEAPC
            190       200       210       220        230       240 

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pF1KB5 KAPSFWYKIDPSHTQGYRTVQLVWKTLPPFEANGKILDYEVTLTRWKSHLQNYTVNAT--
           .:  . :....: : :.:.::      .  : : :..     ..   . :.:.:  
CCDS56 GLE-LWRVLKPAEADGRRPVRLLWKKARGAPVLEKTLGYNIWYYPESNTNLTETMNTTNQ
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pF1KB5 KLTVNLTNDRYLATLTVRNLVGKSDAAVLTIPACDFQATHPVMDLKAFPKDNMLWVEWTT
       .: ..: .. . ...   : .::: .:.: ::: . .. . .  ..:   ...: :.: .
CCDS56 QLELHLGGESFWVSMISYNSLGKSPVATLRIPAIQEKSFQCIEVMQACVAEDQLVVKWQS
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pF1KB5 PRESVKKYILEWCVLSDKAPCITDWQQEDGTVHRTYLRGNLAESKCYLITVTPVYADGPG
          .:. ...::    :. :   .:.. . ... :  . .:    :: :.: :.  :  :
CCDS56 SALDVNTWMIEWFPDVDSEPTTLSWESVSQATNWTIQQDKLKPFWCYNISVYPMLHDKVG
              370       380       390       400       410       420

         510       520       530       540       550       560     
pF1KB5 SPESIKAYLKQAPPSKGPTVRTKKVGKNEAVLEWDQLPVDVQNGFIRNYTIFYRTIIGNE
        : ::.:: :.. ::.:: ......: . ... : ..: . ..:.: ::::::..  :. 
CCDS56 EPYSIQAYAKEGVPSEGPETKVENIGVKTVTITWKEIPKSERKGIICNYTIFYQAEGGKG
              430       440       450       460       470       480

         570       580       590       600       610       620     
pF1KB5 TAVNVDSSHTEYTLSSLTSDTLYMVRMAAYTDEGGKDGPEFTFTTPKFAQGEIEAIVVPV
        . .:.::  .: : ::   : :.:.. : :. :: .:  ..: : .:.  ::  :.  .
CCDS56 FSKTVNSSILQYGLESLKRKTSYIVQVMASTSAGGTNGTSINFKTLSFSVFEIILITSLI
              490       500       510       520       530       540

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pF1KB5 CLAFLLTTLLGVLFCFNKRDLIKKHIWPNVPDPSKSHIAQWSPHTPPRHNFNSKDQMYSD
         ..:.  .: : . ..: . . .  ::.::.:..: :: :                   
CCDS56 GGGLLILIILTVAYGLKKPNKLTHLCWPTVPNPAESSIATWHGDDFKDKLNLKESDDSVN
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pF1KB5 GNFTDVSVVEIEANDKKPFPEDLKSLDLFKKEKINTEGHSSGIGGSSCMSSSRPSISSSD
                                                                   
CCDS56 TEDRILKPCSTPSDKLVIDKLVVNFGNVLQEIFTDEARTGQENNLGGEKNGTRILSSCPT
              610       620       630       640       650       660

>>CCDS56365.1 IL31RA gene_id:133396|Hs108|chr5            (681 aa)
 initn: 736 init1: 507 opt: 909  Z-score: 913.1  bits: 179.8 E(32554): 1.5e-44
Smith-Waterman score: 909; 29.6% identity (61.7% similar) in 551 aa overlap (126-666:54-600)

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pF1KB5 SLNIQLTCNILTFGQLEQNVYGITIISGLPPEKPKNLSCIVNEGKKMRCEWDGGRETHLE
                                     : ::.:.::.    :.. : :. :.::   
CCDS56 PQPSCVNLGMMWTWALWMLPSLCKFSLAALPAKPENISCVYYYRKNLTCTWSPGKETSY-
            30        40        50        60        70        80   

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pF1KB5 TNFTLKSEWAT-HKFADCKAKRDTP---TSCTVDYSTVYFV-NIEVWVEAENALGKVTSD
       :..:.:  .:  .:  .: .. .:    .::.     . .  :  . :::::. : . : 
CCDS56 TQYTVKRTYAFGEKHDNCTTNSSTSENRASCSFFLPRITIPDNYTIEVEAENGDGVIKS-
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pF1KB5 HINFDPVYKV-KPNPPHNLSVINSEELSSILKLTWTNPSIKSVII-LKYNIQYRTKDAST
       :...  . .. : .::. . :     .. .... : .: .  :   :::....:: ....
CCDS56 HMTYWRLENIAKTEPPKIFRVKPVLGIKRMIQIEWIKPELAPVSSDLKYTLRFRTVNSTS
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pF1KB5 WSQIP-PEDTASTRSSFTVQDLKPFTEYVFRIRCMKEDGKGYWSDWSEEASGITYEDRPS
       : ..   ..  .  .....  :.::::::. .::  ...: .:::::.:  :.: :. : 
CCDS56 WMEVNFAKNRKDKNQTYNLTGLQPFTEYVIALRCAVKESK-FWSDWSQEKMGMTEEEAPC
             210       220       230       240        250       260

       330       340       350       360       370       380       
pF1KB5 KAPSFWYKIDPSHTQGYRTVQLVWKTLPPFEANGKILDYEVTLTRWKSHLQNYTVNAT--
           .:  . :....: : :.:.::      .  : : :..     ..   . :.:.:  
CCDS56 GLE-LWRVLKPAEADGRRPVRLLWKKARGAPVLEKTLGYNIWYYPESNTNLTETMNTTNQ
               270       280       290       300       310         

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pF1KB5 KLTVNLTNDRYLATLTVRNLVGKSDAAVLTIPACDFQATHPVMDLKAFPKDNMLWVEWTT
       .: ..: .. . ...   : .::: .:.: ::: . .. . .  ..:   ...: :.: .
CCDS56 QLELHLGGESFWVSMISYNSLGKSPVATLRIPAIQEKSFQCIEVMQACVAEDQLVVKWQS
     320       330       340       350       360       370         

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pF1KB5 PRESVKKYILEWCVLSDKAPCITDWQQEDGTVHRTYLRGNLAESKCYLITVTPVYADGPG
          .:. ...::    :. :   .:.. . ... :  . .:    :: :.: :.  :  :
CCDS56 SALDVNTWMIEWFPDVDSEPTTLSWESVSQATNWTIQQDKLKPFWCYNISVYPMLHDKVG
     380       390       400       410       420       430         

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pF1KB5 SPESIKAYLKQAPPSKGPTVRTKKVGKNEAVLEWDQLPVDVQNGFIRNYTIFYRTIIGNE
        : ::.:: :.. ::.:: ......: . ... : ..: . ..:.: ::::::..  :. 
CCDS56 EPYSIQAYAKEGVPSEGPETKVENIGVKTVTITWKEIPKSERKGIICNYTIFYQAEGGKG
     440       450       460       470       480       490         

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pF1KB5 TAVNVDSSHTEYTLSSLTSDTLYMVRMAAYTDEGGKDGPEFTFTTPKFAQGEIEAIVVPV
        . .:.::  .: : ::   : :.:.. : :. :: .:  ..: : .:.  ::  :.  .
CCDS56 FSKTVNSSILQYGLESLKRKTSYIVQVMASTSAGGTNGTSINFKTLSFSVFEIILITSLI
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>>CCDS75245.1 IL31RA gene_id:133396|Hs108|chr5            (745 aa)
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          .:. ...::    :. :   .:.. . ... :  . .:    :: :.: :.  :  :
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        : ::.:: :.. ::.:: ......: . ... : ..: . ..:.: ::::::..  :. 
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pF1KB5 CLAFLLTTLLGVLFCFNKRDLIKKHIWPNVPDPSKSHIAQWSPHTPPRHNFNSKDQMYSD
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CCDS39 PQPSCVNLGMMWTWALWMLPSLCKFSLAALPAKPENISCVYYYRKNLTCTWSPGKETSY-
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pF1KB5 TNFTLKSEWAT-HKFADCKAKRDTP---TSCTVDYSTVYFV-NIEVWVEAENALGKVTSD
       :..:.:  .:  .:  .: .. .:    .::.     . .  :  . :::::. : . : 
CCDS39 TQYTVKRTYAFGEKHDNCTTNSSTSENRASCSFFLPRITIPDNYTIEVEAENGDGVIKS-
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CCDS39 SALDVNTWMIEWFPDVDSEPTTLSWESVSQATNWTIQQDKLKPFWCYNISVYPMLHDKVG
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pF1KB5 TAVNVDSSHTEYTLSSLTSDTLYMVRMAAYTDEGGKDGPEFTFTTPKFAQGEIEAIVVPV
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pF1KB5 CLAFLLTTLLGVLFCFNKRDLIKKHIWPNVPDPSKSHIAQWSPHTPPRHNFNSKDQMYSD
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CCDS39 GGGLLILIILTVAYGLKKPNKLTHLCWPTVPNPAESSIATWHGDDFKDKLNLKESDDSVN
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pF1KB5 GNFTDVSVVEIEANDKKPFPEDLKSLDLFKKEKINTEGHSSGIGGSSCMSSSRPSISSSD
                                                                   
CCDS39 TEDRILKPCSTPSDKLVIDKLVVNFGNVLQEIFTDEARTGQENNLGGEKNGYVTCPFRPD
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>>CCDS56367.1 IL31RA gene_id:133396|Hs108|chr5            (622 aa)
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CCDS56                     MTYWRLENIAKTEPPKIFRVKPVLGIKRMIQIEWIKPELA
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pF1KB5 SVII-LKYNIQYRTKDASTWSQIP-PEDTASTRSSFTVQDLKPFTEYVFRIRCMKEDGKG
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CCDS56 PVSSDLKYTLRFRTVNSTSWMEVNFAKNRKDKNQTYNLTGLQPFTEYVIALRCAVKESK-
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pF1KB5 YWSDWSEEASGITYEDRPSKAPSFWYKIDPSHTQGYRTVQLVWKTLPPFEANGKILDYEV
       .:::::.:  :.: :. :     .:  . :....: : :.:.::      .  : : :..
CCDS56 FWSDWSQEKMGMTEEEAPCGLE-LWRVLKPAEADGRRPVRLLWKKARGAPVLEKTLGYNI
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pF1KB5 TLTRWKSHLQNYTVNAT--KLTVNLTNDRYLATLTVRNLVGKSDAAVLTIPACDFQATHP
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CCDS56 WYYPESNTNLTETMNTTNQQLELHLGGESFWVSMISYNSLGKSPVATLRIPAIQEKSFQC
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pF1KB5 VMDLKAFPKDNMLWVEWTTPRESVKKYILEWCVLSDKAPCITDWQQEDGTVHRTYLRGNL
       .  ..:   ...: :.: .   .:. ...::    :. :   .:.. . ... :  . .:
CCDS56 IEVMQACVAEDQLVVKWQSSALDVNTWMIEWFPDVDSEPTTLSWESVSQATNWTIQQDKL
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pF1KB5 AESKCYLITVTPVYADGPGSPESIKAYLKQAPPSKGPTVRTKKVGKNEAVLEWDQLPVDV
           :: :.: :.  :  : : ::.:: :.. ::.:: ......: . ... : ..: . 
CCDS56 KPFWCYNISVYPMLHDKVGEPYSIQAYAKEGVPSEGPETKVENIGVKTVTITWKEIPKSE
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pF1KB5 QNGFIRNYTIFYRTIIGNETAVNVDSSHTEYTLSSLTSDTLYMVRMAAYTDEGGKDGPEF
       ..:.: ::::::..  :.  . .:.::  .: : ::   : :.:.. : :. :: .:  .
CCDS56 RKGIICNYTIFYQAEGGKGFSKTVNSSILQYGLESLKRKTSYIVQVMASTSAGGTNGTSI
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pF1KB5 TFTTPKFAQGEIEAIVVPVCLAFLLTTLLGVLFCFNKRDLIKKHIWPNVPDPSKSHIAQW
       .: : .:.  ::  :.  .  ..:.  .: : . ..: . . .  ::.::.:..: :: :
CCDS56 NFKTLSFSVFEIILITSLIGGGLLILIILTVAYGLKKPNKLTHLCWPTVPNPAESSIATW
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pF1KB5 SPHTPPRHNFNSKDQMYSDGNFTDVSVVEIEANDKKPFPEDLKSLDLFKKEKINTEGHSS
                                                                   
CCDS56 HGDDFKDKLNLKESDDSVNTEDRILKPCSTPSDKLVIDKLVVNFGNVLQEIFTDEARTGQ
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>>CCDS75244.1 IL31RA gene_id:133396|Hs108|chr5            (582 aa)
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CCDS75 PQPSCVNLGMMWTWALWMLPSLCKFSLAALPAKPENISCVYYYRKNLTCTWSPGKETSY-
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pF1KB5 TNFTLKSEWAT-HKFADCKAKRDTP---TSCTVDYSTVYFV-NIEVWVEAENALGKVTSD
       :..:.:  .:  .:  .: .. .:    .::.     . .  :  . :::::. : . : 
CCDS75 TQYTVKRTYAFGEKHDNCTTNSSTSENRASCSFFLPRITIPDNYTIEVEAENGDGVIKS-
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pF1KB5 HINFDPVYKV-KPNPPHNLSVINSEELSSILKLTWTNPSIKSVII-LKYNIQYRTKDAST
       :...  . .. : .::. . :     .. .... : .: .  :   :::....:: ....
CCDS75 HMTYWRLENIAKTEPPKIFRVKPVLGIKRMIQIEWIKPELAPVSSDLKYTLRFRTVNSTS
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pF1KB5 WSQIP-PEDTASTRSSFTVQDLKPFTEYVFRIRCMKEDGKGYWSDWSEEASGITYEDRPS
       : ..   ..  .  .....  :.::::::. .::  ...: .:::::.:  :.: :. : 
CCDS75 WMEVNFAKNRKDKNQTYNLTGLQPFTEYVIALRCAVKESK-FWSDWSQEKMGMTEEEAPC
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pF1KB5 KAPSFWYKIDPSHTQGYRTVQLVWKTLPPFEANGKILDYEVTLTRWKSHLQNYTVNAT--
        .  .:  . :....: : :.:.::      .  : : :..     ..   . :.:.:  
CCDS75 -GLELWRVLKPAEADGRRPVRLLWKKARGAPVLEKTLGYNIWYYPESNTNLTETMNTTNQ
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pF1KB5 KLTVNLTNDRYLATLTVRNLVGKSDAAVLTIPACDFQATHPVMDLKAFPKDNMLWVEWTT
       .: ..: .. . ...   : .::: .:.: ::: . .. . .  ..:   ...: :.: .
CCDS75 QLELHLGGESFWVSMISYNSLGKSPVATLRIPAIQEKSFQCIEVMQACVAEDQLVVKWQS
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pF1KB5 PRESVKKYILEWCVLSDKAPCITDWQQEDGTVHRTYLRGNLAESKCYLITVTPVYADGPG
          .:. ...::    :. :   .:.. . ... :  . .:    :: :.: :.  :  :
CCDS75 SALDVNTWMIEWFPDVDSEPTTLSWESVSQATNWTIQQDKLKPFWCYNISVYPMLHDKVG
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pF1KB5 SPESIKAYLKQAPPSKGPTVRTKKVGKNEAVLEWDQLPVDVQNGFIRNYTIFYRTIIGNE
        : ::.:: :.. ::.:: ......: . ... : ..: . ..:.: ::::::.      
CCDS75 EPYSIQAYAKEGVPSEGPETKVENIGVKTVTITWKEIPKSERKGIICNYTIFYQAEGGKG
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pF1KB5 TAVNVDSSHTEYTLSSLTSDTLYMVRMAAYTDEGGKDGPEFTFTTPKFAQGEIEAIVVPV
                                                                   
CCDS75 FCKHAHSEVEKNPKPQIDAMDRPVVGMAPPSHCDLQPGMNHLASLNLSENGAKSTHLLGF
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>>CCDS412.1 CSF3R gene_id:1441|Hs108|chr1                 (783 aa)
 initn: 715 init1: 212 opt: 701  Z-score: 703.7  bits: 141.2 E(32554): 7.1e-33
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pF1KB5     MLTLQTWLVQALFIFLTTESTGELLDPCGYISPESPVVQLHSNFTAVCVLKEKCMD
                ::   ::.:.:   :    :. ::.::  .:.:.: . .:: :..:..:  
CCDS41 MARLGNCSLTW--AALIILLLPGS----LEECGHISVSAPIVHLGDPITASCIIKQNCS-
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pF1KB5 YFHVNAN-YIVWKTNHFTIP--KEQYTIINRTASSVTFTDIASLNIQLTCNILTFGQLEQ
         :.. .  :.:. .    :  ..:    .   : .:.  .   .  :.:  :..:.  :
CCDS41 --HLDPEPQILWRLGAELQPGGRQQRLSDGTQESIITLPHLNHTQAFLSCC-LNWGNSLQ
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pF1KB5 NVYGITIISGLPPEKPKNLSCIVN-EGKKMRCEWDGGRETHLETNFTLKS-------EWA
        .  . . .: ::  :.::::..:   ... :.:. : :::: :.:::::       .  
CCDS41 ILDQVELRAGYPPAIPHNLSCLMNLTTSSLICQWEPGPETHLPTSFTLKSFKSRGNCQTQ
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pF1KB5 THKFADCKAKRDTPTSCTVDYS-TVYFVNIEVWVEAENALGKVTSDHINFDPVYKVKPNP
         .. :: . .:  . : .  .  . . :. .::.::::::   : .. .::.  :: .:
CCDS41 GDSILDC-VPKDGQSHCCIPRKHLLLYQNMGIWVQAENALGTSMSPQLCLDPMDVVKLEP
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pF1KB5 PHNLSVINSEELS----SILKLTWT--NPSIKSVIILKYNIQYRT-KDASTWSQIPPEDT
       :   ..  : : .    . :.: :   .:...  :  : .....  .  ..:. . :   
CCDS41 PMLRTMDPSPEAAPPQAGCLQLCWEPWQPGLH--INQKCELRHKPQRGEASWALVGPLPL
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pF1KB5 ASTRSSFTVQDLKPFTEYVFRIRCMKEDGKGYWSDWSEEASGITYEDRPSKAPSFWYK--
        . .  . .  : : : :...:::..    :.:::::      : :  :.   . :..  
CCDS41 EALQ--YELCGLLPATAYTLQIRCIRWPLPGHWSDWSPSLELRTTERAPTVRLDTWWRQR
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pF1KB5 -IDPSHTQGYRTVQLVWKTLPPFEANGKILDYEVTLTRWKSHLQNYTV----NATKL--T
        .::      ::::: :: .:  : .:.:  : :.   :.   :  ..    :.:.:  :
CCDS41 QLDP------RTVQLFWKPVPLEEDSGRIQGYVVS---WRPSGQAGAILPLCNTTELSCT
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pF1KB5 VNLTNDRYLATLTVRNLVGKSDAAVLTIPACDFQATHPVMD-LKAFPKD-NMLWVEWTTP
        .: ..   ..:.. : .: :  .    :.   ..  :..  :.:. .: . ::: :  :
CCDS41 FHLPSEAQEVALVAYNSAGTSRPT----PVVFSESRGPALTRLHAMARDPHSLWVGWEPP
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pF1KB5 RESVKKYILEWCVLSDKAPCITD-WQQE-DGTVHRTYLRGNLAESKCYLITVTPVYADGP
           . :..:: .   .:   .  :..: .: .    :. :.   . : : :::.: :  
CCDS41 NPWPQGYVIEWGLGPPSASNSNKTWRMEQNGRATGFLLKENIRPFQLYEIIVTPLYQDTM
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pF1KB5 GSPESIKAYLKQAPPSKGPTVRTKKVGKNEAVLEWDQLPVDVQNGFIRNYTIFYRTIIGN
       :  . . :: ..  ::..: .. :..::. : :::   : .. .. . .::::. .  ..
CCDS41 GPSQHVYAYSQEMAPSHAPELHLKHIGKTWAQLEWVPEPPELGKSPLTHYTIFWTNAQNQ
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pF1KB5 ETAVNVDSSHTEYTLSSLTSDTLYMVRMAAYTDEGGKDGPEFTFTTPKFAQGEIEAIVVP
         .. ...:   ..: .:   .:: ... : .. :. ..  .:. :     .:.. :.  
CCDS41 SFSAILNASSRGFVLHGLEPASLYHIHLMAASQAGATNSTVLTLMTLTPEGSELHIILGL
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pF1KB5 VCLAFLLTTLLGV--LFCFNKRDLIKKHIWPNVPDPSKSHIAQWSPHTPPRHNFNSKDQM
         : .::: : :.  : :  .:   :. .::.::::..: ...: :    .  :    :.
CCDS41 FGLLLLLTCLCGTAWLCCSPNR---KNPLWPSVPDPAHSSLGSWVPTIMEEDAF----QL
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pF1KB5 YSDGNFTDVSVVEIEANDKKPFPEDLKSLDLFKKEKINTEGHSSGIGGSSCMSSSRPSIS
        . :.   .... .: ..::: :                                     
CCDS41 PGLGTPPITKLTVLEEDEKKPVPWESHNSSETCGLPTLVQTYVLQGDPRAVSTQPQSQSG
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918 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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