Result of FASTA (omim) for
pF1KB5508
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5508, 543 aa
1>>>pF1KB5508 543 - 543 aa - 543 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1778+/-0.000402; mu= 19.7044+/- 0.025
mean_var=78.9251+/-14.898, 0's: 0 Z-trim(112.8): 101 B-trim: 28 in 1/54
Lambda= 0.144367
statistics sampled from 21755 (21856) to 21755 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.626), E-opt: 0.2 (0.256), width: 16
Scan time: 8.020
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_055416 (OMIM: 605890) EH domain-containing prot ( 543) 3628 765.7 0
NP_001269373 (OMIM: 605888) EH domain-containing p ( 534) 2608 553.3 7e-157
NP_006786 (OMIM: 605888) EH domain-containing prot ( 534) 2608 553.3 7e-157
XP_011543041 (OMIM: 605888) PREDICTED: EH domain-c ( 534) 2608 553.3 7e-157
NP_055415 (OMIM: 605891) EH domain-containing prot ( 535) 2608 553.3 7.1e-157
NP_001269374 (OMIM: 605888) EH domain-containing p ( 548) 2608 553.3 7.2e-157
NP_644670 (OMIM: 605892) EH domain-containing prot ( 541) 2496 529.9 7.5e-150
XP_016877589 (OMIM: 605892) PREDICTED: EH domain-c ( 453) 2133 454.3 3.8e-127
XP_011531108 (OMIM: 605891) PREDICTED: EH domain-c ( 322) 1484 319.0 1.4e-86
NP_001310597 (OMIM: 604992) sarcalumenin isoform 2 ( 431) 727 161.4 5.2e-39
XP_016879017 (OMIM: 604992) PREDICTED: sarcalumeni ( 431) 727 161.4 5.2e-39
NP_001310596 (OMIM: 604992) sarcalumenin isoform 2 ( 431) 727 161.4 5.2e-39
XP_016879018 (OMIM: 604992) PREDICTED: sarcalumeni ( 431) 727 161.4 5.2e-39
NP_001092284 (OMIM: 604992) sarcalumenin isoform 1 ( 473) 727 161.4 5.5e-39
XP_016879016 (OMIM: 604992) PREDICTED: sarcalumeni ( 857) 727 161.7 8.6e-39
XP_016856106 (OMIM: 600051) PREDICTED: epidermal g ( 828) 347 82.5 5.6e-15
XP_016856105 (OMIM: 600051) PREDICTED: epidermal g ( 865) 347 82.5 5.8e-15
NP_001972 (OMIM: 600051) epidermal growth factor r ( 896) 347 82.5 6e-15
XP_016856104 (OMIM: 600051) PREDICTED: epidermal g ( 933) 347 82.5 6.1e-15
NP_001245305 (OMIM: 616826) epidermal growth facto ( 601) 344 81.8 6.8e-15
XP_016882581 (OMIM: 616826) PREDICTED: epidermal g ( 750) 344 81.8 8e-15
NP_001245304 (OMIM: 616826) epidermal growth facto ( 754) 344 81.8 8.1e-15
XP_016882580 (OMIM: 616826) PREDICTED: epidermal g ( 796) 344 81.9 8.4e-15
XP_016882579 (OMIM: 616826) PREDICTED: epidermal g ( 797) 344 81.9 8.4e-15
XP_016882578 (OMIM: 616826) PREDICTED: epidermal g ( 845) 344 81.9 8.8e-15
NP_067058 (OMIM: 616826) epidermal growth factor r ( 864) 344 81.9 8.9e-15
XP_016882577 (OMIM: 616826) PREDICTED: epidermal g ( 874) 344 81.9 9e-15
NP_001245303 (OMIM: 616826) epidermal growth facto ( 910) 344 81.9 9.3e-15
XP_016882576 (OMIM: 616826) PREDICTED: epidermal g ( 915) 344 81.9 9.3e-15
XP_016882575 (OMIM: 616826) PREDICTED: epidermal g ( 926) 344 81.9 9.4e-15
XP_011527995 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1020) 266 65.7 7.9e-10
XP_016883930 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1025) 266 65.7 7.9e-10
XP_011527994 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1107) 266 65.7 8.4e-10
XP_016883929 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1112) 266 65.7 8.4e-10
NP_001317940 (OMIM: 602442) intersectin-1 isoform (1144) 266 65.7 8.6e-10
NP_001317937 (OMIM: 602442) intersectin-1 isoform (1149) 266 65.7 8.6e-10
NP_001317941 (OMIM: 602442) intersectin-1 isoform (1178) 266 65.8 8.8e-10
XP_016883927 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1183) 266 65.8 8.8e-10
NP_001317938 (OMIM: 602442) intersectin-1 isoform (1215) 266 65.8 9e-10
NP_001001132 (OMIM: 602442) intersectin-1 isoform (1220) 266 65.8 9e-10
XP_016883925 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1608) 266 65.9 1.1e-09
XP_016883924 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1613) 266 65.9 1.1e-09
XP_016883923 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1645) 266 65.9 1.1e-09
XP_016883922 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1650) 266 65.9 1.1e-09
XP_016883921 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1660) 266 65.9 1.1e-09
XP_016883920 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1665) 266 65.9 1.1e-09
XP_016883919 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1679) 266 65.9 1.1e-09
XP_016883918 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1684) 266 65.9 1.1e-09
NP_001317939 (OMIM: 602442) intersectin-1 isoform (1716) 266 65.9 1.2e-09
NP_003015 (OMIM: 602442) intersectin-1 isoform ITS (1721) 266 65.9 1.2e-09
>>NP_055416 (OMIM: 605890) EH domain-containing protein (543 aa)
initn: 3628 init1: 3628 opt: 3628 Z-score: 4085.5 bits: 765.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3628; 100.0% identity (100.0% similar) in 543 aa overlap (1-543:1-543)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MFSWLKRGGARGQQPEAIRTVTSALKELYRTKLLPLEEHYRFGAFHSPALEDADFDGKPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MFSWLKRGGARGQQPEAIRTVTSALKELYRTKLLPLEEHYRFGAFHSPALEDADFDGKPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 VLVAGQYSTGKTSFIQYLLEQEVPGSRVGPEPTTDCFVAVMHGDTEGTVPGNALVVDPDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VLVAGQYSTGKTSFIQYLLEQEVPGSRVGPEPTTDCFVAVMHGDTEGTVPGNALVVDPDK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 PFRKLNPFGNTFLNRFMCAQLPNQVLESISIIDTPGILSGAKQRVSRGYDFPAVLRWFAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PFRKLNPFGNTFLNRFMCAQLPNQVLESISIIDTPGILSGAKQRVSRGYDFPAVLRWFAE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 RVDLIILLFDAHKLEISDEFSEAIGALRGHEDKIRVVLNKADMVETQQLMRVYGALMWAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 RVDLIILLFDAHKLEISDEFSEAIGALRGHEDKIRVVLNKADMVETQQLMRVYGALMWAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GKVVGTPEVLRVYIGSFWSQPLLVPDNRRLFELEEQDLFRDIQGLPRHAALRKLNDLVKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GKVVGTPEVLRVYIGSFWSQPLLVPDNRRLFELEEQDLFRDIQGLPRHAALRKLNDLVKR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 ARLVRVHAYIISYLKKEMPSVFGKENKKKQLILKLPVIFAKIQLEHHISPGDFPDCQKMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ARLVRVHAYIISYLKKEMPSVFGKENKKKQLILKLPVIFAKIQLEHHISPGDFPDCQKMQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 ELLMAHDFTKFHSLKPKLLEALDEMLTHDIAKLMPLLRQEELESTEVGVQGGAFEGTHMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ELLMAHDFTKFHSLKPKLLEALDEMLTHDIAKLMPLLRQEELESTEVGVQGGAFEGTHMG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 PFVERGPDEAMEDGEEGSDDEAEWVVTKDKSKYDEIFYNLAPADGKLSGSKAKTWMVGTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PFVERGPDEAMEDGEEGSDDEAEWVVTKDKSKYDEIFYNLAPADGKLSGSKAKTWMVGTK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 LPNSVLGRIWKLSDVDRDGMLDDEEFALASHLIEAKLEGHGLPANLPRRLVPPSKRRHKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LPNSVLGRIWKLSDVDRDGMLDDEEFALASHLIEAKLEGHGLPANLPRRLVPPSKRRHKG
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 SAE
:::
NP_055 SAE
>>NP_001269373 (OMIM: 605888) EH domain-containing prote (534 aa)
initn: 2598 init1: 2122 opt: 2608 Z-score: 2937.5 bits: 553.3 E(85289): 7e-157
Smith-Waterman score: 2608; 71.5% identity (90.0% similar) in 540 aa overlap (1-539:1-534)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MFSWLKRGGARGQQPEAIRTVTSALKELYRTKLLPLEEHYRFGAFHSPALEDADFDGKPM
::::... . : ..:: ..::. .:..:: ::::::::::: ::::::::::::.:::
NP_001 MFSWVSKDARRKKEPELFQTVAEGLRQLYAQKLLPLEEHYRFHEFHSPALEDADFDNKPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 VLVAGQYSTGKTSFIQYLLEQEVPGSRVGPEPTTDCFVAVMHGDTEGTVPGNALVVDPDK
::..::::::::.::..:.::. :: :.::::::: :.::::: :::.:::::::::: .
NP_001 VLLVGQYSTGKTTFIRHLIEQDFPGMRIGPEPTTDSFIAVMHGPTEGVVPGNALVVDPRR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 PFRKLNPFGNTFLNRFMCAQLPNQVLESISIIDTPGILSGAKQRVSRGYDFPAVLRWFAE
:::::: :::.:::::::::::: ::.::::::::::::: :::.:::::: :::.::::
NP_001 PFRKLNAFGNAFLNRFMCAQLPNPVLDSISIIDTPGILSGEKQRISRGYDFAAVLEWFAE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 RVDLIILLFDAHKLEISDEFSEAIGALRGHEDKIRVVLNKADMVETQQLMRVYGALMWAL
::: ::::::::::.:::::::.: ::..:::::::::::::..::::::::::::::.:
NP_001 RVDRIILLFDAHKLDISDEFSEVIKALKNHEDKIRVVLNKADQIETQQLMRVYGALMWSL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GKVVGTPEVLRVYIGSFWSQPLLVPDNRRLFELEEQDLFRDIQGLPRHAALRKLNDLVKR
::...::::.:::::::::.:::.::::.::: ::::::.:::.:::.:::::::::.::
NP_001 GKIINTPEVVRVYIGSFWSHPLLIPDNRKLFEAEEQDLFKDIQSLPRNAALRKLNDLIKR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 ARLVRVHAYIISYLKKEMPSVFGKENKKKQLILKLPVIFAKIQLEHHISPGDFPDCQKMQ
:::..::::::: ::::::.:::::.:::.:. .: :. ::. ::.:::::::. .:::
NP_001 ARLAKVHAYIISSLKKEMPNVFGKESKKKELVNNLGEIYQKIEREHQISPGDFPSLRKMQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB5 ELLMAHDFTKFHSLKPKLLEALDEMLTHDIAKLMPLLRQEE-LESTEVGVQGGAFEGTHM
:::...::.::..::::::...:.::..:::.:: ..:::: : ..: :.::::.::
NP_001 ELLQTQDFSKFQALKPKLLDTVDDMLANDIARLMVMVRQEESLMPSQV-VKGGAFDGTMN
370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 GPFVERGPDEAMEDGEEGSDDEAEWVVTKDKSKYDEIFYNLAPADGKLSGSKAKTWMVGT
::: : . : . :: :: .:::: ::: ::::::.:.:..::..:..:: :: .
NP_001 GPF---GHGYG-EGAGEGIDD-VEWVVGKDKPTYDEIFYTLSPVNGKITGANAKKEMVKS
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 KLPNSVLGRIWKLSDVDRDGMLDDEEFALASHLIEAKLEGHGLPANLPRRLVPPSKRRHK
::::.:::.::::.:::.::.:::::::::.:::..::::: :::.:: .:::::::::.
NP_001 KLPNTVLGKIWKLADVDKDGLLDDEEFALANHLIKVKLEGHELPADLPPHLVPPSKRRHE
480 490 500 510 520 530
540
pF1KB5 GSAE
>>NP_006786 (OMIM: 605888) EH domain-containing protein (534 aa)
initn: 2598 init1: 2122 opt: 2608 Z-score: 2937.5 bits: 553.3 E(85289): 7e-157
Smith-Waterman score: 2608; 71.5% identity (90.0% similar) in 540 aa overlap (1-539:1-534)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MFSWLKRGGARGQQPEAIRTVTSALKELYRTKLLPLEEHYRFGAFHSPALEDADFDGKPM
::::... . : ..:: ..::. .:..:: ::::::::::: ::::::::::::.:::
NP_006 MFSWVSKDARRKKEPELFQTVAEGLRQLYAQKLLPLEEHYRFHEFHSPALEDADFDNKPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 VLVAGQYSTGKTSFIQYLLEQEVPGSRVGPEPTTDCFVAVMHGDTEGTVPGNALVVDPDK
::..::::::::.::..:.::. :: :.::::::: :.::::: :::.:::::::::: .
NP_006 VLLVGQYSTGKTTFIRHLIEQDFPGMRIGPEPTTDSFIAVMHGPTEGVVPGNALVVDPRR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 PFRKLNPFGNTFLNRFMCAQLPNQVLESISIIDTPGILSGAKQRVSRGYDFPAVLRWFAE
:::::: :::.:::::::::::: ::.::::::::::::: :::.:::::: :::.::::
NP_006 PFRKLNAFGNAFLNRFMCAQLPNPVLDSISIIDTPGILSGEKQRISRGYDFAAVLEWFAE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 RVDLIILLFDAHKLEISDEFSEAIGALRGHEDKIRVVLNKADMVETQQLMRVYGALMWAL
::: ::::::::::.:::::::.: ::..:::::::::::::..::::::::::::::.:
NP_006 RVDRIILLFDAHKLDISDEFSEVIKALKNHEDKIRVVLNKADQIETQQLMRVYGALMWSL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GKVVGTPEVLRVYIGSFWSQPLLVPDNRRLFELEEQDLFRDIQGLPRHAALRKLNDLVKR
::...::::.:::::::::.:::.::::.::: ::::::.:::.:::.:::::::::.::
NP_006 GKIINTPEVVRVYIGSFWSHPLLIPDNRKLFEAEEQDLFKDIQSLPRNAALRKLNDLIKR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 ARLVRVHAYIISYLKKEMPSVFGKENKKKQLILKLPVIFAKIQLEHHISPGDFPDCQKMQ
:::..::::::: ::::::.:::::.:::.:. .: :. ::. ::.:::::::. .:::
NP_006 ARLAKVHAYIISSLKKEMPNVFGKESKKKELVNNLGEIYQKIEREHQISPGDFPSLRKMQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB5 ELLMAHDFTKFHSLKPKLLEALDEMLTHDIAKLMPLLRQEE-LESTEVGVQGGAFEGTHM
:::...::.::..::::::...:.::..:::.:: ..:::: : ..: :.::::.::
NP_006 ELLQTQDFSKFQALKPKLLDTVDDMLANDIARLMVMVRQEESLMPSQV-VKGGAFDGTMN
370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 GPFVERGPDEAMEDGEEGSDDEAEWVVTKDKSKYDEIFYNLAPADGKLSGSKAKTWMVGT
::: : . : . :: :: .:::: ::: ::::::.:.:..::..:..:: :: .
NP_006 GPF---GHGYG-EGAGEGIDD-VEWVVGKDKPTYDEIFYTLSPVNGKITGANAKKEMVKS
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 KLPNSVLGRIWKLSDVDRDGMLDDEEFALASHLIEAKLEGHGLPANLPRRLVPPSKRRHK
::::.:::.::::.:::.::.:::::::::.:::..::::: :::.:: .:::::::::.
NP_006 KLPNTVLGKIWKLADVDKDGLLDDEEFALANHLIKVKLEGHELPADLPPHLVPPSKRRHE
480 490 500 510 520 530
540
pF1KB5 GSAE
>>XP_011543041 (OMIM: 605888) PREDICTED: EH domain-conta (534 aa)
initn: 2598 init1: 2122 opt: 2608 Z-score: 2937.5 bits: 553.3 E(85289): 7e-157
Smith-Waterman score: 2608; 71.5% identity (90.0% similar) in 540 aa overlap (1-539:1-534)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MFSWLKRGGARGQQPEAIRTVTSALKELYRTKLLPLEEHYRFGAFHSPALEDADFDGKPM
::::... . : ..:: ..::. .:..:: ::::::::::: ::::::::::::.:::
XP_011 MFSWVSKDARRKKEPELFQTVAEGLRQLYAQKLLPLEEHYRFHEFHSPALEDADFDNKPM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 VLVAGQYSTGKTSFIQYLLEQEVPGSRVGPEPTTDCFVAVMHGDTEGTVPGNALVVDPDK
::..::::::::.::..:.::. :: :.::::::: :.::::: :::.:::::::::: .
XP_011 VLLVGQYSTGKTTFIRHLIEQDFPGMRIGPEPTTDSFIAVMHGPTEGVVPGNALVVDPRR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 PFRKLNPFGNTFLNRFMCAQLPNQVLESISIIDTPGILSGAKQRVSRGYDFPAVLRWFAE
:::::: :::.:::::::::::: ::.::::::::::::: :::.:::::: :::.::::
XP_011 PFRKLNAFGNAFLNRFMCAQLPNPVLDSISIIDTPGILSGEKQRISRGYDFAAVLEWFAE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 RVDLIILLFDAHKLEISDEFSEAIGALRGHEDKIRVVLNKADMVETQQLMRVYGALMWAL
::: ::::::::::.:::::::.: ::..:::::::::::::..::::::::::::::.:
XP_011 RVDRIILLFDAHKLDISDEFSEVIKALKNHEDKIRVVLNKADQIETQQLMRVYGALMWSL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GKVVGTPEVLRVYIGSFWSQPLLVPDNRRLFELEEQDLFRDIQGLPRHAALRKLNDLVKR
::...::::.:::::::::.:::.::::.::: ::::::.:::.:::.:::::::::.::
XP_011 GKIINTPEVVRVYIGSFWSHPLLIPDNRKLFEAEEQDLFKDIQSLPRNAALRKLNDLIKR
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pF1KB5 ARLVRVHAYIISYLKKEMPSVFGKENKKKQLILKLPVIFAKIQLEHHISPGDFPDCQKMQ
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XP_011 ARLAKVHAYIISSLKKEMPNVFGKESKKKELVNNLGEIYQKIEREHQISPGDFPSLRKMQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB5 ELLMAHDFTKFHSLKPKLLEALDEMLTHDIAKLMPLLRQEE-LESTEVGVQGGAFEGTHM
:::...::.::..::::::...:.::..:::.:: ..:::: : ..: :.::::.::
XP_011 ELLQTQDFSKFQALKPKLLDTVDDMLANDIARLMVMVRQEESLMPSQV-VKGGAFDGTMN
370 380 390 400 410
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pF1KB5 GPFVERGPDEAMEDGEEGSDDEAEWVVTKDKSKYDEIFYNLAPADGKLSGSKAKTWMVGT
::: : . : . :: :: .:::: ::: ::::::.:.:..::..:..:: :: .
XP_011 GPF---GHGYG-EGAGEGIDD-VEWVVGKDKPTYDEIFYTLSPVNGKITGANAKKEMVKS
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pF1KB5 KLPNSVLGRIWKLSDVDRDGMLDDEEFALASHLIEAKLEGHGLPANLPRRLVPPSKRRHK
::::.:::.::::.:::.::.:::::::::.:::..::::: :::.:: .:::::::::.
XP_011 KLPNTVLGKIWKLADVDKDGLLDDEEFALANHLIKVKLEGHELPADLPPHLVPPSKRRHE
480 490 500 510 520 530
540
pF1KB5 GSAE
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10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MFSWLKRGGARGQQPEAIRTVTSALKELYRTKLLPLEEHYRFGAFHSPALEDADFDGKPM
::::: : ..::...::. .::.::..::::::::::: ::::::::::::.:::
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pF1KB5 VLVAGQYSTGKTSFIQYLLEQEVPGSRVGPEPTTDCFVAVMHGDTEGTVPGNALVVDPDK
::..::::::::.::.:::::. :: :.::::::: :.:::.:: :: .::::::::: :
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:::::: :::.:::::.:::::: ::::::.::::::::: :::.:::::: :::.::::
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pF1KB5 RVDLIILLFDAHKLEISDEFSEAIGALRGHEDKIRVVLNKADMVETQQLMRVYGALMWAL
::: ::::::::::.:::::::.: ::..::::.::::::::..::::::::::::::.:
NP_055 RVDRIILLFDAHKLDISDEFSEVIKALKNHEDKMRVVLNKADQIETQQLMRVYGALMWSL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GKVVGTPEVLRVYIGSFWSQPLLVPDNRRLFELEEQDLFRDIQGLPRHAALRKLNDLVKR
::.:.::::.:::::::::.:::.::::.::: ::::::::::.:::.:::::::::.::
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pF1KB5 ARLVRVHAYIISYLKKEMPSVFGKENKKKQLILKLPVIFAKIQLEHHISPGDFPDCQKMQ
:::..::::::: :::::::::::.::::.:. .: :...:. ::.:::::::. ..::
NP_055 ARLAKVHAYIISSLKKEMPSVFGKDNKKKELVNNLAEIYGRIEREHQISPGDFPNLKRMQ
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pF1KB5 ELLMAHDFTKFHSLKPKLLEALDEMLTHDIAKLMPLLRQEELESTEVGVQGGAFEGTHMG
. :.:.::.::. :: ::::..:.::.::::.:: :.:::: . :.::::::: :
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pF1KB5 PFVERGPDEAMEDGEEGSDDEAEWVVTKDKSKYDEIFYNLAPADGKLSGSKAKTWMVGTK
:: : . : . :: :: :::::..:: ::::::.:.:.:::..:..:: :: .:
NP_055 PF---GHGYG-EGAGEGIDD-AEWVVARDKPMYDEIFYTLSPVDGKITGANAKKEMVRSK
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pF1KB5 LPNSVLGRIWKLSDVDRDGMLDDEEFALASHLIEAKLEGHGLPANLPRRLVPPSKRRHKG
:::::::.::::.:.:.::::::.:::::.:::..::::: :: .:: .:.:::::.
NP_055 LPNSVLGKIWKLADIDKDGMLDDDEFALANHLIKVKLEGHELPNELPAHLLPPSKRKVAE
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pF1KB5 SAE
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Smith-Waterman score: 2608; 71.5% identity (90.0% similar) in 540 aa overlap (1-539:15-548)
10 20 30 40
pF1KB5 MFSWLKRGGARGQQPEAIRTVTSALKELYRTKLLPLEEHYRFGAFH
::::... . : ..:: ..::. .:..:: ::::::::::: ::
NP_001 MEQPGTAASPVSGSMFSWVSKDARRKKEPELFQTVAEGLRQLYAQKLLPLEEHYRFHEFH
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pF1KB5 SPALEDADFDGKPMVLVAGQYSTGKTSFIQYLLEQEVPGSRVGPEPTTDCFVAVMHGDTE
::::::::::.:::::..::::::::.::..:.::. :: :.::::::: :.::::: ::
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pF1KB5 GTVPGNALVVDPDKPFRKLNPFGNTFLNRFMCAQLPNQVLESISIIDTPGILSGAKQRVS
:.:::::::::: .:::::: :::.:::::::::::: ::.::::::::::::: :::.:
NP_001 GVVPGNALVVDPRRPFRKLNAFGNAFLNRFMCAQLPNPVLDSISIIDTPGILSGEKQRIS
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pF1KB5 RGYDFPAVLRWFAERVDLIILLFDAHKLEISDEFSEAIGALRGHEDKIRVVLNKADMVET
::::: :::.::::::: ::::::::::.:::::::.: ::..:::::::::::::..::
NP_001 RGYDFAAVLEWFAERVDRIILLFDAHKLDISDEFSEVIKALKNHEDKIRVVLNKADQIET
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pF1KB5 QQLMRVYGALMWALGKVVGTPEVLRVYIGSFWSQPLLVPDNRRLFELEEQDLFRDIQGLP
::::::::::::.:::...::::.:::::::::.:::.::::.::: ::::::.:::.::
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pF1KB5 HISPGDFPDCQKMQELLMAHDFTKFHSLKPKLLEALDEMLTHDIAKLMPLLRQEE-LEST
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pF1KB5 EVGVQGGAFEGTHMGPFVERGPDEAMEDGEEGSDDEAEWVVTKDKSKYDEIFYNLAPADG
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pF1KB5 KLSGSKAKTWMVGTKLPNSVLGRIWKLSDVDRDGMLDDEEFALASHLIEAKLEGHGLPAN
:..:..:: :: .::::.:::.::::.:::.::.:::::::::.:::..::::: :::.
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pF1KB5 LPRRLVPPSKRRHKGSAE
:: .:::::::::.
NP_001 LPPHLVPPSKRRHE
540
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pF1KB5 MFSWLKR--GG-ARGQQPEAIRTVTSALKELYRTKLLPLEEHYRFGAFHSPALEDADFDG
::::. : :: :. .:..:::..:. :: :.::::: ::: :::::::::::..
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NP_644 KPMILLVGQYSTGKTTFIRYLLEQDFPGMRIGPEPTTDSFIAVMYGETEGSTPGNALVVD
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pF1KB5 PDKPFRKLNPFGNTFLNRFMCAQLPNQVLESISIIDTPGILSGAKQRVSRGYDFPAVLRW
: ::::::. :::.:::::::.:::::::.:::.::.:::::: :::.:::::: ::.:
NP_644 PKKPFRKLSRFGNAFLNRFMCSQLPNQVLKSISVIDSPGILSGEKQRISRGYDFCQVLQW
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pF1KB5 FAERVDLIILLFDAHKLEISDEFSEAIGALRGHEDKIRVVLNKADMVETQQLMRVYGALM
:::::: ::::::::::.::::::::: :.::..:::::::::::.:.::::::::::::
NP_644 FAERVDRIILLFDAHKLDISDEFSEAIKAFRGQDDKIRVVLNKADQVDTQQLMRVYGALM
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pF1KB5 WALGKVVGTPEVLRVYIGSFWSQPLLVPDNRRLFELEEQDLFRDIQGLPRHAALRKLNDL
:.::::..:::::::::::::.::: ::::::: : ::::::::.::..::.::::::
NP_644 WSLGKVINTPEVLRVYIGSFWAQPLQNTDNRRLFEAEAQDLFRDIQSLPQKAAVRKLNDL
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pF1KB5 VKRARLVRVHAYIISYLKKEMPSVFGKENKKKQLILKLPVIFAKIQLEHHISPGDFPDCQ
.:::::..:::::::::::::::::::::::..:: .:: :. ..: :..:: ::::. .
NP_644 IKRARLAKVHAYIISYLKKEMPSVFGKENKKRELISRLPEIYIQLQREYQISAGDFPEVK
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pF1KB5 KMQELLMAHDFTKFHSLKPKLLEALDEMLTHDIAKLMPLLRQEELESTEVGVQGGAFEGT
::: : .::::::::::::.::.:.::.. :. :: :. ::: . ::::::.::
NP_644 AMQEQLENYDFTKFHSLKPKLIEAVDNMLSNKISPLMNLISQEETSTPTQLVQGGAFDGT
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pF1KB5 HMGPFVERGPDEAMEDGEEGSDDEAEWVVTKDKSKYDEIFYNLAPADGKLSGSKAKTWMV
::: ..: :. ..::.:.: ::::.::: :::.::.:.: .::.:: .:: ::
NP_644 TEGPF-NQGYGEG---AKEGADEE-EWVVAKDKPVYDELFYTLSPINGKISGVNAKKEMV
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pF1KB5 GTKLPNSVLGRIWKLSDVDRDGMLDDEEFALASHLIEAKLEGHGLPANLPRRLVPPSKRR
.::::::::.::::.: : :::::.::::::.:::. ::.:. ::..:: .:::::.:.
NP_644 TSKLPNSVLGKIWKLADCDCDGMLDEEEFALAKHLIKIKLDGYELPSSLPPHLVPPSHRK
480 490 500 510 520 530
540
pF1KB5 HKGSAE
.:.
NP_644 SLPKAD
540
>>XP_016877589 (OMIM: 605892) PREDICTED: EH domain-conta (453 aa)
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pF1KB5 GKPMVLVAGQYSTGKTSFIQYLLEQEVPGSRVGPEPTTDCFVAVMHGDTEGTVPGNALVV
:.::::::: :.:::.:.:::..:::::::
XP_016 MRIGPEPTTDSFIAVMYGETEGSTPGNALVV
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pF1KB5 DPDKPFRKLNPFGNTFLNRFMCAQLPNQVLESISIIDTPGILSGAKQRVSRGYDFPAVLR
:: ::::::. :::.:::::::.:::::::.:::.::.:::::: :::.:::::: ::.
XP_016 DPKKPFRKLSRFGNAFLNRFMCSQLPNQVLKSISVIDSPGILSGEKQRISRGYDFCQVLQ
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pF1KB5 WFAERVDLIILLFDAHKLEISDEFSEAIGALRGHEDKIRVVLNKADMVETQQLMRVYGAL
::::::: ::::::::::.::::::::: :.::..:::::::::::.:.:::::::::::
XP_016 WFAERVDRIILLFDAHKLDISDEFSEAIKAFRGQDDKIRVVLNKADQVDTQQLMRVYGAL
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pF1KB5 MWALGKVVGTPEVLRVYIGSFWSQPLLVPDNRRLFELEEQDLFRDIQGLPRHAALRKLND
::.::::..:::::::::::::.::: ::::::: : ::::::::.::..::.:::::
XP_016 MWSLGKVINTPEVLRVYIGSFWAQPLQNTDNRRLFEAEAQDLFRDIQSLPQKAAVRKLND
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pF1KB5 LVKRARLVRVHAYIISYLKKEMPSVFGKENKKKQLILKLPVIFAKIQLEHHISPGDFPDC
:.:::::..:::::::::::::::::::::::..:: .:: :. ..: :..:: ::::.
XP_016 LIKRARLAKVHAYIISYLKKEMPSVFGKENKKRELISRLPEIYIQLQREYQISAGDFPEV
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pF1KB5 QKMQELLMAHDFTKFHSLKPKLLEALDEMLTHDIAKLMPLLRQEELESTEVGVQGGAFEG
. ::: : .::::::::::::.::.:.::.. :. :: :. ::: . ::::::.:
XP_016 KAMQEQLENYDFTKFHSLKPKLIEAVDNMLSNKISPLMNLISQEETSTPTQLVQGGAFDG
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pF1KB5 THMGPFVERGPDEAMEDGEEGSDDEAEWVVTKDKSKYDEIFYNLAPADGKLSGSKAKTWM
: ::: ..: :. ..: :: ::::.::: :::.::.:.: .::.:: .:: :
XP_016 TTEGPF-NQGYGEGAKEGA----DEEEWVVAKDKPVYDELFYTLSPINGKISGVNAKKEM
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pF1KB5 VGTKLPNSVLGRIWKLSDVDRDGMLDDEEFALASHLIEAKLEGHGLPANLPRRLVPPSKR
: .::::::::.::::.: : :::::.::::::.:::. ::.:. ::..:: .:::::.:
XP_016 VTSKLPNSVLGKIWKLADCDCDGMLDEEEFALAKHLIKIKLDGYELPSSLPPHLVPPSHR
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540
pF1KB5 RHKGSAE
. .:.
XP_016 KSLPKAD
450
>>XP_011531108 (OMIM: 605891) PREDICTED: EH domain-conta (322 aa)
initn: 1478 init1: 1018 opt: 1484 Z-score: 1675.2 bits: 319.0 E(85289): 1.4e-86
Smith-Waterman score: 1484; 68.5% identity (88.3% similar) in 324 aa overlap (214-537:1-319)
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pF1KB5 LIILLFDAHKLEISDEFSEAIGALRGHEDKIRVVLNKADMVETQQLMRVYGALMWALGKV
.::::::::..::::::::::::::.:::.
XP_011 MRVVLNKADQIETQQLMRVYGALMWSLGKI
10 20 30
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 VGTPEVLRVYIGSFWSQPLLVPDNRRLFELEEQDLFRDIQGLPRHAALRKLNDLVKRARL
:.::::.:::::::::.:::.::::.::: ::::::::::.:::.:::::::::.:::::
XP_011 VNTPEVIRVYIGSFWSHPLLIPDNRKLFEAEEQDLFRDIQSLPRNAALRKLNDLIKRARL
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pF1KB5 VRVHAYIISYLKKEMPSVFGKENKKKQLILKLPVIFAKIQLEHHISPGDFPDCQKMQELL
..::::::: :::::::::::.::::.:. .: :...:. ::.:::::::. ..::. :
XP_011 AKVHAYIISSLKKEMPSVFGKDNKKKELVNNLAEIYGRIEREHQISPGDFPNLKRMQDQL
100 110 120 130 140 150
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pF1KB5 MAHDFTKFHSLKPKLLEALDEMLTHDIAKLMPLLRQEELESTEVGVQGGAFEGTHMGPFV
.:.::.::. :: ::::..:.::.::::.:: :.:::: . :.::::::: :::
XP_011 QAQDFSKFQPLKSKLLEVVDDMLAHDIAQLMVLVRQEESQRPIQMVKGGAFEGTLHGPF-
160 170 180 190 200
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pF1KB5 ERGPDEAMEDGEEGSDDEAEWVVTKDKSKYDEIFYNLAPADGKLSGSKAKTWMVGTKLPN
: . : . :: :: :::::..:: ::::::.:.:.:::..:..:: :: .::::
XP_011 --GHGYG-EGAGEGIDD-AEWVVARDKPMYDEIFYTLSPVDGKITGANAKKEMVRSKLPN
210 220 230 240 250 260
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pF1KB5 SVLGRIWKLSDVDRDGMLDDEEFALASHLIEAKLEGHGLPANLPRRLVPPSKRRHKGSAE
::::.::::.:.:.::::::.:::::.:::..::::: :: .:: .:.:::::.
XP_011 SVLGKIWKLADIDKDGMLDDDEFALANHLIKVKLEGHELPNELPAHLLPPSKRKVAE
270 280 290 300 310 320
>>NP_001310597 (OMIM: 604992) sarcalumenin isoform 2 [Ho (431 aa)
initn: 511 init1: 374 opt: 727 Z-score: 821.4 bits: 161.4 E(85289): 5.2e-39
Smith-Waterman score: 734; 32.4% identity (68.1% similar) in 389 aa overlap (21-394:14-401)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MFSWLKRGGARGQQPEAIRTVTSALKELYRTKLLPLEEHYRFGAFHSPALEDADFDGKPM
: . :...:.... :::. :... ... . :... .:::
NP_001 MLNEDKPSDDYSAVLQRLRKIYHSSIKPLEQSYKYNELRQHEITDGEITSKPM
10 20 30 40 50
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pF1KB5 VLVAGQYSTGKTSFIQYLLEQEVPGSRV--GPEPTTDCFVAVMHGDTEGTVPGNALVVDP
:: : .:.::...:.::: : .. : ::::. :...::: :. : ....:
NP_001 VLFLGPWSVGKSTMINYLLGLENTRYQLYTGAEPTTSEFTVLMHGPKLKTIEGIVMAADS
60 70 80 90 100 110
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