Result of FASTA (omim) for pF1KB5390
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5390, 920 aa
  1>>>pF1KB5390 920 - 920 aa - 920 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4868+/-0.000367; mu= 15.9515+/- 0.023
 mean_var=100.2061+/-19.968, 0's: 0 Z-trim(116.6): 216  B-trim: 1709 in 2/54
 Lambda= 0.128123
 statistics sampled from 27666 (27920) to 27666 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.665), E-opt: 0.2 (0.327), width:  16
 Scan time: 12.370

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_004642 (OMIM: 300050) ubiquitin carboxyl-termin ( 963) 6318 1178.8       0
XP_011542290 (OMIM: 300050) PREDICTED: ubiquitin c ( 690) 4769 892.4       0
XP_005272731 (OMIM: 300050) PREDICTED: ubiquitin c ( 690) 4769 892.4       0
NP_955475 (OMIM: 603486) ubiquitin carboxyl-termin ( 916) 2651 501.0 1.1e-140
NP_003354 (OMIM: 603486) ubiquitin carboxyl-termin ( 963) 2241 425.2 7.4e-118
XP_006719781 (OMIM: 604731) PREDICTED: ubiquitin c ( 775) 1461 281.0 1.5e-74
XP_016875773 (OMIM: 604731) PREDICTED: ubiquitin c ( 860) 1461 281.0 1.7e-74
XP_016875774 (OMIM: 604731) PREDICTED: ubiquitin c ( 860) 1461 281.0 1.7e-74
NP_006304 (OMIM: 604731) ubiquitin carboxyl-termin ( 952) 1461 281.1 1.8e-74
NP_001239007 (OMIM: 604731) ubiquitin carboxyl-ter ( 981) 1461 281.1 1.9e-74
XP_005269318 (OMIM: 604731) PREDICTED: ubiquitin c ( 648) 1169 227.0 2.4e-58
XP_016880723 (OMIM: 607740) PREDICTED: ubiquitin c (1288)  938 184.5   3e-45
XP_011523681 (OMIM: 607740) PREDICTED: ubiquitin c (1327)  938 184.5 3.1e-45
XP_016880722 (OMIM: 607740) PREDICTED: ubiquitin c (1558)  938 184.5 3.5e-45
XP_011523680 (OMIM: 607740) PREDICTED: ubiquitin c (1572)  938 184.5 3.5e-45
XP_011523678 (OMIM: 607740) PREDICTED: ubiquitin c (1601)  938 184.5 3.6e-45
NP_115971 (OMIM: 607740) ubiquitin carboxyl-termin (1604)  938 184.5 3.6e-45
XP_011523677 (OMIM: 607740) PREDICTED: ubiquitin c (1608)  938 184.5 3.6e-45
XP_011523676 (OMIM: 607740) PREDICTED: ubiquitin c (1615)  938 184.5 3.6e-45
XP_011523675 (OMIM: 607740) PREDICTED: ubiquitin c (1618)  938 184.5 3.6e-45
XP_011523674 (OMIM: 607740) PREDICTED: ubiquitin c (1620)  938 184.5 3.6e-45
XP_011523673 (OMIM: 607740) PREDICTED: ubiquitin c (1634)  938 184.5 3.6e-45
XP_016861124 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c ( 871)  886 174.8 1.7e-42
XP_005264888 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1268)  886 174.9 2.3e-42
XP_016861123 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1270)  886 174.9 2.3e-42
XP_016861122 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1281)  886 174.9 2.3e-42
XP_016861120 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1283)  886 174.9 2.3e-42
XP_016861121 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1283)  886 174.9 2.3e-42
XP_016861119 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1285)  886 174.9 2.3e-42
XP_016861118 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1303)  886 174.9 2.4e-42
XP_016861117 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1305)  886 174.9 2.4e-42
XP_016861116 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1307)  886 174.9 2.4e-42
XP_016861115 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1318)  886 174.9 2.4e-42
NP_006668 (OMIM: 614471) ubiquitin carboxyl-termin (1318)  886 174.9 2.4e-42
XP_016861114 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1320)  886 174.9 2.4e-42
XP_005264887 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1322)  886 174.9 2.4e-42
XP_016861113 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1332)  886 174.9 2.4e-42
XP_006713015 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1367)  886 174.9 2.5e-42
XP_006713014 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1368)  886 174.9 2.5e-42
XP_006713013 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1369)  886 174.9 2.5e-42
XP_016861112 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1369)  886 174.9 2.5e-42
XP_016861110 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1371)  886 174.9 2.5e-42
XP_016861111 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1371)  886 174.9 2.5e-42
NP_001186091 (OMIM: 614471) ubiquitin carboxyl-ter (1372)  886 174.9 2.5e-42
XP_006713012 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1373)  886 174.9 2.5e-42
XP_016861109 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1381)  886 174.9 2.5e-42
XP_006713011 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1382)  886 174.9 2.5e-42
XP_016861108 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1383)  886 174.9 2.5e-42
NP_001186090 (OMIM: 614471) ubiquitin carboxyl-ter (1384)  886 174.9 2.5e-42
XP_016861107 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1384)  886 174.9 2.5e-42


>>NP_004642 (OMIM: 300050) ubiquitin carboxyl-terminal h  (963 aa)
 initn: 6318 init1: 6318 opt: 6318  Z-score: 6309.8  bits: 1178.8 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 6318; 100.0% identity (100.0% similar) in 920 aa overlap (1-920:44-963)

                                             10        20        30
pF1KB5                               MATVAANPAAAAAAVAAAAAVTEDREPQHE
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 RFRDQNPEVAVEGRLPISHSCVGCRRERTAMATVAANPAAAAAAVAAAAAVTEDREPQHE
            20        30        40        50        60        70   

               40        50        60        70        80        90
pF1KB5 ELPGLDSQWRQIENGESGRERPLRAGESWFLVEKHWYKQWEAYVQGGDQDSSTFPGCINN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ELPGLDSQWRQIENGESGRERPLRAGESWFLVEKHWYKQWEAYVQGGDQDSSTFPGCINN
            80        90       100       110       120       130   

              100       110       120       130       140       150
pF1KB5 ATLFQDEINWRLKEGLVEGEDYVLLPAAAWHYLVSWYGLEHGQPPIERKVIELPNIQKVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ATLFQDEINWRLKEGLVEGEDYVLLPAAAWHYLVSWYGLEHGQPPIERKVIELPNIQKVE
           140       150       160       170       180       190   

              160       170       180       190       200       210
pF1KB5 VYPVELLLVRHNDLGKSHTVQFSHTDSIGLVLRTARERFLVEPQEDTRLWAKNSEGSLDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VYPVELLLVRHNDLGKSHTVQFSHTDSIGLVLRTARERFLVEPQEDTRLWAKNSEGSLDR
           200       210       220       230       240       250   

              220       230       240       250       260       270
pF1KB5 LYDTHITVLDAALETGQLIIMETRKKDGTWPSAQLHVMNNNMSEEDEDFKGQPGICGLTN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LYDTHITVLDAALETGQLIIMETRKKDGTWPSAQLHVMNNNMSEEDEDFKGQPGICGLTN
           260       270       280       290       300       310   

              280       290       300       310       320       330
pF1KB5 LGNTCFMNSALQCLSNVPQLTEYFLNNCYLEELNFRNPLGMKGEIAEAYADLVKQAWSGH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LGNTCFMNSALQCLSNVPQLTEYFLNNCYLEELNFRNPLGMKGEIAEAYADLVKQAWSGH
           320       330       340       350       360       370   

              340       350       360       370       380       390
pF1KB5 HRSIVPHVFKNKVGHFASQFLGYQQHDSQELLSFLLDGLHEDLNRVKKKEYVELCDAAGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 HRSIVPHVFKNKVGHFASQFLGYQQHDSQELLSFLLDGLHEDLNRVKKKEYVELCDAAGR
           380       390       400       410       420       430   

              400       410       420       430       440       450
pF1KB5 PDQEVAQEAWQNHKRRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPDCGNVSVTFDPFCYLSVPLPISHK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 PDQEVAQEAWQNHKRRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPDCGNVSVTFDPFCYLSVPLPISHK
           440       450       460       470       480       490   

              460       470       480       490       500       510
pF1KB5 RVLEVFFIPMDPRRKPEQHRLVVPKKGKISDLCVALSKHTGISPERMMVADVFSHRFYKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 RVLEVFFIPMDPRRKPEQHRLVVPKKGKISDLCVALSKHTGISPERMMVADVFSHRFYKL
           500       510       520       530       540       550   

              520       530       540       550       560       570
pF1KB5 YQLEEPLSSILDRDDIFVYEVSGRIEAIEGSREDIVVPVYLRERTPARDYNNSYYGLMLF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 YQLEEPLSSILDRDDIFVYEVSGRIEAIEGSREDIVVPVYLRERTPARDYNNSYYGLMLF
           560       570       580       590       600       610   

              580       590       600       610       620       630
pF1KB5 GHPLLVSVPRDRFTWEGLYNVLMYRLSRYVTKPNSDDEDDGDEKEDDEEDKDDVPGPSTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GHPLLVSVPRDRFTWEGLYNVLMYRLSRYVTKPNSDDEDDGDEKEDDEEDKDDVPGPSTG
           620       630       640       650       660       670   

              640       650       660       670       680       690
pF1KB5 GSLRDPEPEQAGPSSGVTNRCPFLLDNCLGTSQWPPRRRRKQLFTLQTVNSNGTSDRTTS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GSLRDPEPEQAGPSSGVTNRCPFLLDNCLGTSQWPPRRRRKQLFTLQTVNSNGTSDRTTS
           680       690       700       710       720       730   

              700       710       720       730       740       750
pF1KB5 PEEVHAQPYIAIDWEPEMKKRYYDEVEAEGYVKHDCVGYVMKKAPVRLQECIELFTTVET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 PEEVHAQPYIAIDWEPEMKKRYYDEVEAEGYVKHDCVGYVMKKAPVRLQECIELFTTVET
           740       750       760       770       780       790   

              760       770       780       790       800       810
pF1KB5 LEKENPWYCPSCKQHQLATKKLDLWMLPEILIIHLKRFSYTKFSREKLDTLVEFPIRDLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LEKENPWYCPSCKQHQLATKKLDLWMLPEILIIHLKRFSYTKFSREKLDTLVEFPIRDLD
           800       810       820       830       840       850   

              820       830       840       850       860       870
pF1KB5 FSEFVIQPQNESNPELYKYDLIAVSNHYGGMRDGHYTTFACNKDSGQWHYFDDNSVSPVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 FSEFVIQPQNESNPELYKYDLIAVSNHYGGMRDGHYTTFACNKDSGQWHYFDDNSVSPVN
           860       870       880       890       900       910   

              880       890       900       910       920
pF1KB5 ENQIESKAAYVLFYQRQDVARRLLSPAGSSGAPASPACSSPPSSEFMDVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ENQIESKAAYVLFYQRQDVARRLLSPAGSSGAPASPACSSPPSSEFMDVN
           920       930       940       950       960   

>>XP_011542290 (OMIM: 300050) PREDICTED: ubiquitin carbo  (690 aa)
 initn: 4769 init1: 4769 opt: 4769  Z-score: 4764.5  bits: 892.4 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 4769; 100.0% identity (100.0% similar) in 690 aa overlap (231-920:1-690)

              210       220       230       240       250       260
pF1KB5 AKNSEGSLDRLYDTHITVLDAALETGQLIIMETRKKDGTWPSAQLHVMNNNMSEEDEDFK
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011                               METRKKDGTWPSAQLHVMNNNMSEEDEDFK
                                             10        20        30

              270       280       290       300       310       320
pF1KB5 GQPGICGLTNLGNTCFMNSALQCLSNVPQLTEYFLNNCYLEELNFRNPLGMKGEIAEAYA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GQPGICGLTNLGNTCFMNSALQCLSNVPQLTEYFLNNCYLEELNFRNPLGMKGEIAEAYA
               40        50        60        70        80        90

              330       340       350       360       370       380
pF1KB5 DLVKQAWSGHHRSIVPHVFKNKVGHFASQFLGYQQHDSQELLSFLLDGLHEDLNRVKKKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DLVKQAWSGHHRSIVPHVFKNKVGHFASQFLGYQQHDSQELLSFLLDGLHEDLNRVKKKE
              100       110       120       130       140       150

              390       400       410       420       430       440
pF1KB5 YVELCDAAGRPDQEVAQEAWQNHKRRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPDCGNVSVTFDPFCY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YVELCDAAGRPDQEVAQEAWQNHKRRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPDCGNVSVTFDPFCY
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pF1KB5 LSVPLPISHKRVLEVFFIPMDPRRKPEQHRLVVPKKGKISDLCVALSKHTGISPERMMVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LSVPLPISHKRVLEVFFIPMDPRRKPEQHRLVVPKKGKISDLCVALSKHTGISPERMMVA
              220       230       240       250       260       270

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pF1KB5 DVFSHRFYKLYQLEEPLSSILDRDDIFVYEVSGRIEAIEGSREDIVVPVYLRERTPARDY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DVFSHRFYKLYQLEEPLSSILDRDDIFVYEVSGRIEAIEGSREDIVVPVYLRERTPARDY
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NNSYYGLMLFGHPLLVSVPRDRFTWEGLYNVLMYRLSRYVTKPNSDDEDDGDEKEDDEED
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pF1KB5 KDDVPGPSTGGSLRDPEPEQAGPSSGVTNRCPFLLDNCLGTSQWPPRRRRKQLFTLQTVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KDDVPGPSTGGSLRDPEPEQAGPSSGVTNRCPFLLDNCLGTSQWPPRRRRKQLFTLQTVN
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SNGTSDRTTSPEEVHAQPYIAIDWEPEMKKRYYDEVEAEGYVKHDCVGYVMKKAPVRLQE
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CIELFTTVETLEKENPWYCPSCKQHQLATKKLDLWMLPEILIIHLKRFSYTKFSREKLDT
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LVEFPIRDLDFSEFVIQPQNESNPELYKYDLIAVSNHYGGMRDGHYTTFACNKDSGQWHY
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pF1KB5 FDDNSVSPVNENQIESKAAYVLFYQRQDVARRLLSPAGSSGAPASPACSSPPSSEFMDVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FDDNSVSPVNENQIESKAAYVLFYQRQDVARRLLSPAGSSGAPASPACSSPPSSEFMDVN
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>>XP_005272731 (OMIM: 300050) PREDICTED: ubiquitin carbo  (690 aa)
 initn: 4769 init1: 4769 opt: 4769  Z-score: 4764.5  bits: 892.4 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 4769; 100.0% identity (100.0% similar) in 690 aa overlap (231-920:1-690)

              210       220       230       240       250       260
pF1KB5 AKNSEGSLDRLYDTHITVLDAALETGQLIIMETRKKDGTWPSAQLHVMNNNMSEEDEDFK
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005                               METRKKDGTWPSAQLHVMNNNMSEEDEDFK
                                             10        20        30

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pF1KB5 GQPGICGLTNLGNTCFMNSALQCLSNVPQLTEYFLNNCYLEELNFRNPLGMKGEIAEAYA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GQPGICGLTNLGNTCFMNSALQCLSNVPQLTEYFLNNCYLEELNFRNPLGMKGEIAEAYA
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pF1KB5 DLVKQAWSGHHRSIVPHVFKNKVGHFASQFLGYQQHDSQELLSFLLDGLHEDLNRVKKKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DLVKQAWSGHHRSIVPHVFKNKVGHFASQFLGYQQHDSQELLSFLLDGLHEDLNRVKKKE
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pF1KB5 YVELCDAAGRPDQEVAQEAWQNHKRRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPDCGNVSVTFDPFCY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 YVELCDAAGRPDQEVAQEAWQNHKRRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPDCGNVSVTFDPFCY
              160       170       180       190       200       210

              450       460       470       480       490       500
pF1KB5 LSVPLPISHKRVLEVFFIPMDPRRKPEQHRLVVPKKGKISDLCVALSKHTGISPERMMVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LSVPLPISHKRVLEVFFIPMDPRRKPEQHRLVVPKKGKISDLCVALSKHTGISPERMMVA
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pF1KB5 DVFSHRFYKLYQLEEPLSSILDRDDIFVYEVSGRIEAIEGSREDIVVPVYLRERTPARDY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DVFSHRFYKLYQLEEPLSSILDRDDIFVYEVSGRIEAIEGSREDIVVPVYLRERTPARDY
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pF1KB5 NNSYYGLMLFGHPLLVSVPRDRFTWEGLYNVLMYRLSRYVTKPNSDDEDDGDEKEDDEED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NNSYYGLMLFGHPLLVSVPRDRFTWEGLYNVLMYRLSRYVTKPNSDDEDDGDEKEDDEED
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pF1KB5 KDDVPGPSTGGSLRDPEPEQAGPSSGVTNRCPFLLDNCLGTSQWPPRRRRKQLFTLQTVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KDDVPGPSTGGSLRDPEPEQAGPSSGVTNRCPFLLDNCLGTSQWPPRRRRKQLFTLQTVN
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pF1KB5 SNGTSDRTTSPEEVHAQPYIAIDWEPEMKKRYYDEVEAEGYVKHDCVGYVMKKAPVRLQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SNGTSDRTTSPEEVHAQPYIAIDWEPEMKKRYYDEVEAEGYVKHDCVGYVMKKAPVRLQE
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pF1KB5 CIELFTTVETLEKENPWYCPSCKQHQLATKKLDLWMLPEILIIHLKRFSYTKFSREKLDT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 CIELFTTVETLEKENPWYCPSCKQHQLATKKLDLWMLPEILIIHLKRFSYTKFSREKLDT
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pF1KB5 LVEFPIRDLDFSEFVIQPQNESNPELYKYDLIAVSNHYGGMRDGHYTTFACNKDSGQWHY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LVEFPIRDLDFSEFVIQPQNESNPELYKYDLIAVSNHYGGMRDGHYTTFACNKDSGQWHY
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pF1KB5 FDDNSVSPVNENQIESKAAYVLFYQRQDVARRLLSPAGSSGAPASPACSSPPSSEFMDVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FDDNSVSPVNENQIESKAAYVLFYQRQDVARRLLSPAGSSGAPASPACSSPPSSEFMDVN
              640       650       660       670       680       690

>>NP_955475 (OMIM: 603486) ubiquitin carboxyl-terminal h  (916 aa)
 initn: 2506 init1: 1343 opt: 2651  Z-score: 2646.8  bits: 501.0 E(85289): 1.1e-140
Smith-Waterman score: 2711; 48.1% identity (72.6% similar) in 910 aa overlap (36-909:12-901)

          10        20        30        40        50        60     
pF1KB5 ANPAAAAAAVAAAAAVTEDREPQHEELPGLDSQWRQIENGESGRERPLRAGESWFLVEKH
                                     :.. .. : :   :   :. : .:.:....
NP_955                    MAEGGGCRERPDAETQKSELGPLMRTT-LQRGAQWYLIDSR
                                  10        20         30        40

          70               80        90       100       110        
pF1KB5 WYKQWEAYVQGGDQ-------DSSTFPGCINNATLFQDEINWRLKEGLVEGEDYVLLPAA
       :.:::. :: : :.       . . ::: :.:. ::.:  .  ::: :..  ::::.:. 
NP_955 WFKQWKKYV-GFDSWDMYNVGEHNLFPGPIDNSGLFSDPESQTLKEHLIDELDYVLVPTE
                50        60        70        80        90         

      120       130       140          150       160       170     
pF1KB5 AWHYLVSWYGLEHGQPPIERKVIE---LPNIQKVEVYPVELLLVRHNDLGKSHTVQFSHT
       ::. :..:::  .:: :: :::.:   . .  ::::: .:: : ...:  .  . .::..
NP_955 AWNKLLNWYGCVEGQQPIVRKVVEHGLFVKHCKVEVYLLELKLCENSDPTNVLSCHFSKA
     100       110       120       130       140       150         

         180       190       200       210       220       230     
pF1KB5 DSIGLVLRTARERFLVEPQEDTRLWAKNSEGSLDRLYDTHITVLDAALETGQLIIMETRK
       :.:. . .  :. : .  ...:::: :   .. ..:     :: ::.:  ::....: ..
NP_955 DTIATIEKEMRKLFNIPAERETRLWNKYMSNTYEQLSKLDNTVQDAGLYQGQVLVIEPQN
     160       170       180       190       200       210         

         240       250            260       270       280       290
pF1KB5 KDGTWPSAQLHVMNNNMS-----EEDEDFKGQPGICGLTNLGNTCFMNSALQCLSNVPQL
       .:::::   :.  ....:     .:  . . :::.::: :::::::::::::::::.  :
NP_955 EDGTWPRQTLQSNGSGFSASYNCQEPPSSHIQPGLCGLGNLGNTCFMNSALQCLSNTAPL
     220       230       240       250       260       270         

              300       310       320       330       340       350
pF1KB5 TEYFLNNCYLEELNFRNPLGMKGEIAEAYADLVKQAWSGHHRSIVPHVFKNKVGHFASQF
       :.:::.. :  :.:  ::::::::::::::.:.:: :::.   ..:..::..::.:: ::
NP_955 TDYFLKDEYEAEINRDNPLGMKGEIAEAYAELIKQMWSGRDAHVAPRMFKTQVGRFAPQF
     280       290       300       310       320       330         

              360       370       380       390       400       410
pF1KB5 LGYQQHDSQELLSFLLDGLHEDLNRVKKKEYVELCDAAGRPDQEVAQEAWQNHKRRNDSV
        ::::.::::::.:::::::::::::::: :.:: :: ::::  ::.:::.::. :::::
NP_955 SGYQQQDSQELLAFLLDGLHEDLNRVKKKPYLELKDANGRPDAVVAKEAWENHRLRNDSV
     340       350       360       370       380       390         

              420       430       440       450       460       470
pF1KB5 IVDTFHGLFKSTLVCPDCGNVSVTFDPFCYLSVPLPISHKRVLEVFFIPMDPRRKPEQHR
       ::::::::::::::::.:..:::::::::::..:::... ::.:::..: ::. .: :.:
NP_955 IVDTFHGLFKSTLVCPECAKVSVTFDPFCYLTLPLPLKKDRVMEVFLVPADPHCRPTQYR
     400       410       420       430       440       450         

              480       490       500       510       520       530
pF1KB5 LVVPKKGKISDLCVALSKHTGISPERMMVADVFSHRFYKLYQLEEPLSSILDRDDIFVYE
       ..::  : .:::: :::. .::. : :.::::..:::.:..:..: :. :. ::::::::
NP_955 VTVPLMGAVSDLCEALSRLSGIAAENMVVADVYNHRFHKIFQMDEGLNHIMPRDDIFVYE
     460       470       480       490       500       510         

              540       550       560       570       580       590
pF1KB5 VSGRIEAIEGSREDIVVPVYLRERTPARDYNNSYYGLMLFGHPLLVSVPRDRFTWEGLYN
       : .   ...:: : ...:::.:::  .:  ..:  .  :.:.:::.:::. ..: :.::.
NP_955 VCS--TSVDGS-ECVTLPVYFRERK-SRPSSTSSAS-ALYGQPLLLSVPKHKLTLESLYQ
     520          530       540        550        560       570    

              600                610       620       630       640 
pF1KB5 VLMYRLSRYVTKPNSDDED---------DGDEKEDDEEDKDDVPGPSTGGSLRDPEPEQA
       ..  :.:::: .:  :.           .:...  . ::....     :   ..   :  
NP_955 AVCDRISRYVKQPLPDEFGSSPLEPGACNGSRNSCEGEDEEEMEHQEEG---KEQLSETE
          580       590       600       610       620          630 

             650       660       670       680       690           
pF1KB5 GPSSGVTNRCPFLLDNCLGTSQWPPRRRRKQLFTLQTVNSNGTSDRTTSPEE-----VHA
       : .    .  :    .    .:  :.:    :::.. ::: ::.: ..   .     ...
NP_955 GSGEDEPGNDPSETTQKKIKGQPCPKR----LFTFSLVNSYGTADINSLAADGKLLKLNS
             640       650           660       670       680       

        700       710       720       730           740       750  
pF1KB5 QPYIAIDWEPEMKKRYYDEVEAEGYVKHDCVGYVM----KKAPVRLQECIELFTTVETLE
       .  .:.::. : .. :::: :.:.: ::  :....    ::. : :..:::::::.::: 
NP_955 RSTLAMDWDSETRRLYYDEQESEAYEKH--VSMLQPQKKKKTTVALRDCIELFTTMETLG
       690       700       710         720       730       740     

            760       770       780       790       800       810  
pF1KB5 KENPWYCPSCKQHQLATKKLDLWMLPEILIIHLKRFSYTKFSREKLDTLVEFPIRDLDFS
       ...:::::.::.:: ::::.::: ::.::..:::::::... :.::::.:::::: :..:
NP_955 EHDPWYCPNCKKHQQATKKFDLWSLPKILVVHLKRFSYNRYWRDKLDTVVEFPIRGLNMS
         750       760       770       780       790       800     

            820       830       840       850       860       870  
pF1KB5 EFVIQPQNESNPELYKYDLIAVSNHYGGMRDGHYTTFACNKDSGQWHYFDDNSVSPVNEN
       ::: . .  . :  : :::::::::::.:  ::::..: :: .:.:.::::..:: ..:.
NP_955 EFVCNLS--ARP--YVYDLIAVSNHYGAMGVGHYTAYAKNKLNGKWYYFDDSNVSLASED
         810           820       830       840       850       860 

            880          890       900       910       920    
pF1KB5 QIESKAAYVLFYQRQD---VARRLLSPAGSSGAPASPACSSPPSSEFMDVN    
       :: .::::::::::.:        :: .::: . . :. :               
NP_955 QIVTKAAYVLFYQRRDDEFYKTPSLSSSGSSDGGTRPSSSQQGFGDDEACSMDTN
             870       880       890       900       910      

>>NP_003354 (OMIM: 603486) ubiquitin carboxyl-terminal h  (963 aa)
 initn: 2417 init1: 1343 opt: 2241  Z-score: 2236.9  bits: 425.2 E(85289): 7.4e-118
Smith-Waterman score: 2618; 46.0% identity (69.3% similar) in 957 aa overlap (36-909:12-948)

          10        20        30        40        50        60     
pF1KB5 ANPAAAAAAVAAAAAVTEDREPQHEELPGLDSQWRQIENGESGRERPLRAGESWFLVEKH
                                     :.. .. : :   :   :. : .:.:....
NP_003                    MAEGGGCRERPDAETQKSELGPLMRTT-LQRGAQWYLIDSR
                                  10        20         30        40

          70               80        90       100       110        
pF1KB5 WYKQWEAYVQGGDQ-------DSSTFPGCINNATLFQDEINWRLKEGLVEGEDYVLLPAA
       :.:::. :: : :.       . . ::: :.:. ::.:  .  ::: :..  ::::.:. 
NP_003 WFKQWKKYV-GFDSWDMYNVGEHNLFPGPIDNSGLFSDPESQTLKEHLIDELDYVLVPTE
                50        60        70        80        90         

      120       130       140          150       160       170     
pF1KB5 AWHYLVSWYGLEHGQPPIERKVIE---LPNIQKVEVYPVELLLVRHNDLGKSHTVQFSHT
       ::. :..:::  .:: :: :::.:   . .  ::::: .:: : ...:  .  . .::..
NP_003 AWNKLLNWYGCVEGQQPIVRKVVEHGLFVKHCKVEVYLLELKLCENSDPTNVLSCHFSKA
     100       110       120       130       140       150         

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pF1KB5 DSIGLVLRTARERFLVEPQEDTRLWAKNSEGSLDRLYDTHITVLDAALETGQLIIMETRK
       :.:. . .  :. : .  ...:::: :   .. ..:     :: ::.:  ::....: ..
NP_003 DTIATIEKEMRKLFNIPAERETRLWNKYMSNTYEQLSKLDNTVQDAGLYQGQVLVIEPQN
     160       170       180       190       200       210         

         240                                     250               
pF1KB5 KDGTWP------------------------------SAQLHVMNNNMS------------
       .:::::                              ::.: . ... :            
NP_003 EDGTWPRQTLQSKSSTAPSRNFTTSPKSSASPYSSVSASLIANGDSTSTCGMHSSGVSRG
     220       230       240       250       260       270         

                     260       270       280       290       300   
pF1KB5 ----------EEDEDFKGQPGICGLTNLGNTCFMNSALQCLSNVPQLTEYFLNNCYLEEL
                 .:  . . :::.::: :::::::::::::::::.  ::.:::.. :  :.
NP_003 GSGFSASYNCQEPPSSHIQPGLCGLGNLGNTCFMNSALQCLSNTAPLTDYFLKDEYEAEI
     280       290       300       310       320       330         

           310       320       330       340       350       360   
pF1KB5 NFRNPLGMKGEIAEAYADLVKQAWSGHHRSIVPHVFKNKVGHFASQFLGYQQHDSQELLS
       :  ::::::::::::::.:.:: :::.   ..:..::..::.:: :: ::::.::::::.
NP_003 NRDNPLGMKGEIAEAYAELIKQMWSGRDAHVAPRMFKTQVGRFAPQFSGYQQQDSQELLA
     340       350       360       370       380       390         

           370       380       390       400       410       420   
pF1KB5 FLLDGLHEDLNRVKKKEYVELCDAAGRPDQEVAQEAWQNHKRRNDSVIVDTFHGLFKSTL
       :::::::::::::::: :.:: :: ::::  ::.:::.::. ::::::::::::::::::
NP_003 FLLDGLHEDLNRVKKKPYLELKDANGRPDAVVAKEAWENHRLRNDSVIVDTFHGLFKSTL
     400       410       420       430       440       450         

           430       440       450       460       470       480   
pF1KB5 VCPDCGNVSVTFDPFCYLSVPLPISHKRVLEVFFIPMDPRRKPEQHRLVVPKKGKISDLC
       :::.:..:::::::::::..:::... ::.:::..: ::. .: :.:..::  : .::::
NP_003 VCPECAKVSVTFDPFCYLTLPLPLKKDRVMEVFLVPADPHCRPTQYRVTVPLMGAVSDLC
     460       470       480       490       500       510         

           490       500       510       520       530       540   
pF1KB5 VALSKHTGISPERMMVADVFSHRFYKLYQLEEPLSSILDRDDIFVYEVSGRIEAIEGSRE
        :::. .::. : :.::::..:::.:..:..: :. :. ::::::::: .   ...:: :
NP_003 EALSRLSGIAAENMVVADVYNHRFHKIFQMDEGLNHIMPRDDIFVYEVCS--TSVDGS-E
     520       530       540       550       560         570       

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pF1KB5 DIVVPVYLRERTPARDYNNSYYGLMLFGHPLLVSVPRDRFTWEGLYNVLMYRLSRYVTKP
        ...:::.:::  .:  ..:  .  :.:.:::.:::. ..: :.::...  :.:::: .:
NP_003 CVTLPVYFRERK-SRPSSTSSAS-ALYGQPLLLSVPKHKLTLESLYQAVCDRISRYVKQP
        580        590        600       610       620       630    

                    610       620       630       640       650    
pF1KB5 NSDDED---------DGDEKEDDEEDKDDVPGPSTGGSLRDPEPEQAGPSSGVTNRCPFL
         :.           .:...  . ::....     :   ..   :  : .    .  :  
NP_003 LPDEFGSSPLEPGACNGSRNSCEGEDEEEMEHQEEG---KEQLSETEGSGEDEPGNDPSE
          640       650       660       670          680       690 

          660       670       680       690            700         
pF1KB5 LDNCLGTSQWPPRRRRKQLFTLQTVNSNGTSDRTTSPEE-----VHAQPYIAIDWEPEMK
         .    .:  :.:    :::.. ::: ::.: ..   .     ....  .:.::. : .
NP_003 TTQKKIKGQPCPKR----LFTFSLVNSYGTADINSLAADGKLLKLNSRSTLAMDWDSETR
             700           710       720       730       740       

     710       720       730           740       750       760     
pF1KB5 KRYYDEVEAEGYVKHDCVGYVM----KKAPVRLQECIELFTTVETLEKENPWYCPSCKQH
       . :::: :.:.: ::  :....    ::. : :..:::::::.::: ...:::::.::.:
NP_003 RLYYDEQESEAYEKH--VSMLQPQKKKKTTVALRDCIELFTTMETLGEHDPWYCPNCKKH
       750       760         770       780       790       800     

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pF1KB5 QLATKKLDLWMLPEILIIHLKRFSYTKFSREKLDTLVEFPIRDLDFSEFVIQPQNESNPE
       : ::::.::: ::.::..:::::::... :.::::.:::::: :..:::: . .  . : 
NP_003 QQATKKFDLWSLPKILVVHLKRFSYNRYWRDKLDTVVEFPIRGLNMSEFVCNLS--ARP-
         810       820       830       840       850         860   

         830       840       850       860       870       880     
pF1KB5 LYKYDLIAVSNHYGGMRDGHYTTFACNKDSGQWHYFDDNSVSPVNENQIESKAAYVLFYQ
        : :::::::::::.:  ::::..: :: .:.:.::::..:: ..:.:: .:::::::::
NP_003 -YVYDLIAVSNHYGAMGVGHYTAYAKNKLNGKWYYFDDSNVSLASEDQIVTKAAYVLFYQ
             870       880       890       900       910       920 

            890       900       910       920    
pF1KB5 RQD---VARRLLSPAGSSGAPASPACSSPPSSEFMDVN    
       :.:        :: .::: . . :. :               
NP_003 RRDDEFYKTPSLSSSGSSDGGTRPSSSQQGFGDDEACSMDTN
             930       940       950       960   

>>XP_006719781 (OMIM: 604731) PREDICTED: ubiquitin carbo  (775 aa)
 initn: 1932 init1: 1308 opt: 1461  Z-score: 1459.2  bits: 281.0 E(85289): 1.5e-74
Smith-Waterman score: 1943; 42.9% identity (66.9% similar) in 758 aa overlap (53-721:24-770)

             30        40        50        60        70            
pF1KB5 EDREPQHEELPGLDSQWRQIENGESGRERPLRAGESWFLVEKHWYKQWEAYV--------
                                     :: :..:.::...:.:::. ::        
XP_006        MAEGGAADLDTQRSDIATLLKTSLRKGDTWYLVDSRWFKQWKKYVGFDSWDKY
                      10        20        30        40        50   

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pF1KB5 QGGDQDSSTFPGCINNATLFQDEINWRLKEGLVEGEDYVLLPAAAWHYLVSWYGLEHGQP
       : :::.  ..:: :.:. :..:     ::: :..  ::.:::. .:. ::::: : .:: 
XP_006 QMGDQN--VYPGPIDNSGLLKDGDAQSLKEHLIDELDYILLPTEGWNKLVSWYTLMEGQE
              60        70        80        90       100       110 

          140          150       160       170       180       190 
pF1KB5 PIERKVIELPNIQK---VEVYPVELLLVRHNDLGKSHTVQFSHTDSIGLVLRTARERFLV
       :: :::.:   . :   :::: .:: : .......  : .::..:.:  . .  :. : .
XP_006 PIARKVVEQGMFVKHCKVEVYLTELKLCENGNMNNVVTRRFSKADTIDTIEKEIRKIFSI
             120       130       140       150       160       170 

             200       210       220       230       240           
pF1KB5 EPQEDTRLWAKNSEGSLDRLYDTHITVLDAALETGQLIIMETRKKDGTWP----------
         ...:::: :   .... :     :. ::.:  ::....: ...:::::          
XP_006 PDEKETRLWNKYMSNTFEPLNKPDSTIQDAGLYQGQVLVIEQKNEDGTWPRGPSTPKSPG
             180       190       200       210       220       230 

                            250                   260              
pF1KB5 ---------------SAQLHVMNN-NMSE-----------EDEDFK--G----QPGICGL
                      : . . ::: :...           .. :..  :    :::.:::
XP_006 ASNFSTLPKISPSSLSNNYNNMNNRNVKNSNYCLPSYTAYKNYDYSEPGRNNEQPGLCGL
             240       250       260       270       280       290 

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pF1KB5 TNLGNTCFMNSALQCLSNVPQLTEYFLNNCYLEELNFRNPLGMKGEIAEAYADLVKQAWS
       .:::::::::::.:::::.: :::::::. : ::::: :::::.::::..::.:.:: ::
XP_006 SNLGNTCFMNSAIQCLSNTPPLTEYFLNDKYQEELNFDNPLGMRGEIAKSYAELIKQMWS
             300       310       320       330       340       350 

      330       340       350       360       370       380        
pF1KB5 GHHRSIVPHVFKNKVGHFASQFLGYQQHDSQELLSFLLDGLHEDLNRVKKKEYVELCDAA
       :.   ..:..::..::.:: :: ::::.: ::::.::::::::::::..:: :..: :: 
XP_006 GKFSYVTPRAFKTQVGRFAPQFSGYQQQDCQELLAFLLDGLHEDLNRIRKKPYIQLKDAD
             360       370       380       390       400       410 

      390       400       410       420       430       440        
pF1KB5 GRPDQEVAQEAWQNHKRRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPDCGNVSVTFDPFCYLSVPLPIS
       ::::. ::.:::.:: .::::.::: ::::::::::::.:...::::::::::..:::..
XP_006 GRPDKVVAEEAWENHLKRNDSIIVDIFHGLFKSTLVCPECAKISVTFDPFCYLTLPLPMK
             420       430       440       450       460       470 

      450       460       470       480       490       500        
pF1KB5 HKRVLEVFFIPMDPRRKPEQHRLVVPKKGKISDLCVALSKHTGISPERMMVADVFSHRFY
       ..:.:::... :::  :: :...:::: :.: :::.:::  .::  ..:.:.:...:::.
XP_006 KERTLEVYLVRMDPLTKPMQYKVVVPKIGNILDLCTALSALSGIPADKMIVTDIYNHRFH
             480       490       500       510       520       530 

      510       520       530       540       550       560        
pF1KB5 KLYQLEEPLSSILDRDDIFVYEVSGRIEAIEGSREDIVVPVYLRERTPARDYNNSYYGLM
       ... ..: ::::..::::.:.:..  :.  : . : ...:: :::.    .:.. . :  
XP_006 RIFAMDENLSSIMERDDIYVFEIN--INRTEDT-EHVIIPVCLREKFRHSSYTH-HTGSS
             540       550         560        570       580        

      570       580       590       600       610                  
pF1KB5 LFGHPLLVSVPRDRFTWEGLYNVLMYRLSRYVTKPNSDDEDDGD----------------
       :::.:.:..:::.  : . :::.:. :. :::   .  .: .:.                
XP_006 LFGQPFLMAVPRNN-TEDKLYNLLLLRMCRYVKISTETEETEGSLHCCKDQNINGNGPNG
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pF1KB5 --EKEDDEEDKDDVPGPSTGGSLRDP---EPEQAGPSSGVTNRCPFLL---DNCLGTSQW
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         ...:  :::.:  : ..:.    . .  : .            ..:.::.:..::::.
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       ::  :: :                                                    
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pF1KB5 QNESNPELYKYDLIAVSNHYGGMRDGHYTTFACNKDSGQWHYFDDNSVSPVNENQIESKA
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XP_016 AYVLFYQRQDTFSGTGFFPLDRETKGASAATGIPLESDEDSNDNDNDIENENCMHTN
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>>XP_016875774 (OMIM: 604731) PREDICTED: ubiquitin carbo  (860 aa)
 initn: 2336 init1: 1308 opt: 1461  Z-score: 1458.5  bits: 281.0 E(85289): 1.7e-74
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pF1KB5 CPSCKQHQLATKKLDLWMLPEILIIHLKRFSYTKFSREKLDTLVEFPIRDLDFSEFVIQP
       ::.::.:: :::::::: :: .:..:::::::... :.::::::.::: :::.:::.:.:
XP_016 CPNCKEHQQATKKLDLWSLPPVLVVHLKRFSYSRYMRDKLDTLVDFPINDLDMSEFLINP
       690       700       710       720       730       740       

      820       830       840       850       860       870        
pF1KB5 QNESNPELYKYDLIAVSNHYGGMRDGHYTTFACNKDSGQWHYFDDNSVSPVNENQIESKA
       .  ..:   .:.:::::::::::  ::::.:: :::.:.:.::::.::: ..:.:: :::
XP_016 N--AGPC--RYNLIAVSNHYGGMGGGHYTAFAKNKDDGKWYYFDDSSVSTASEDQIVSKA
         750         760       770       780       790       800   

      880        890       900       910       920              
pF1KB5 AYVLFYQRQDV-ARRLLSPAGSSGAPASPACSSPPSSEFMDVN              
       ::::::::::. .   . :       :: : . :  :.                   
XP_016 AYVLFYQRQDTFSGTGFFPLDRETKGASAATGIPLESDEDSNDNDNDIENENCMHTN
           810       820       830       840       850       860

>>NP_006304 (OMIM: 604731) ubiquitin carboxyl-terminal h  (952 aa)
 initn: 2578 init1: 1308 opt: 1461  Z-score: 1457.8  bits: 281.1 E(85289): 1.8e-74
Smith-Waterman score: 2743; 47.4% identity (71.0% similar) in 925 aa overlap (53-915:24-933)

             30        40        50        60        70            
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                                     :: :..:.::...:.:::. ::        
NP_006        MAEGGAADLDTQRSDIATLLKTSLRKGDTWYLVDSRWFKQWKKYVGFDSWDKY
                      10        20        30        40        50   

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pF1KB5 QGGDQDSSTFPGCINNATLFQDEINWRLKEGLVEGEDYVLLPAAAWHYLVSWYGLEHGQP
       : :::.  ..:: :.:. :..:     ::: :..  ::.:::. .:. ::::: : .:: 
NP_006 QMGDQN--VYPGPIDNSGLLKDGDAQSLKEHLIDELDYILLPTEGWNKLVSWYTLMEGQE
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pF1KB5 PIERKVIELPNIQK---VEVYPVELLLVRHNDLGKSHTVQFSHTDSIGLVLRTARERFLV
       :: :::.:   . :   :::: .:: : .......  : .::..:.:  . .  :. : .
NP_006 PIARKVVEQGMFVKHCKVEVYLTELKLCENGNMNNVVTRRFSKADTIDTIEKEIRKIFSI
             120       130       140       150       160       170 

             200       210       220       230       240           
pF1KB5 EPQEDTRLWAKNSEGSLDRLYDTHITVLDAALETGQLIIMETRKKDGTWPSAQL--HVMN
         ...:::: :   .... :     :. ::.:  ::....: ...::::: .    .: :
NP_006 PDEKETRLWNKYMSNTFEPLNKPDSTIQDAGLYQGQVLVIEQKNEDGTWPRGPSTPNVKN
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pF1KB5 NNM------SEEDEDFK--G----QPGICGLTNLGNTCFMNSALQCLSNVPQLTEYFLNN
       .:.      . .. :..  :    :::.:::.:::::::::::.:::::.: :::::::.
NP_006 SNYCLPSYTAYKNYDYSEPGRNNEQPGLCGLSNLGNTCFMNSAIQCLSNTPPLTEYFLND
             240       250       260       270       280       290 

       300       310       320       330       340       350       
pF1KB5 CYLEELNFRNPLGMKGEIAEAYADLVKQAWSGHHRSIVPHVFKNKVGHFASQFLGYQQHD
        : ::::: :::::.::::..::.:.:: :::.   ..:..::..::.:: :: ::::.:
NP_006 KYQEELNFDNPLGMRGEIAKSYAELIKQMWSGKFSYVTPRAFKTQVGRFAPQFSGYQQQD
             300       310       320       330       340       350 

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pF1KB5 SQELLSFLLDGLHEDLNRVKKKEYVELCDAAGRPDQEVAQEAWQNHKRRNDSVIVDTFHG
        ::::.::::::::::::..:: :..: :: ::::. ::.:::.:: .::::.::: :::
NP_006 CQELLAFLLDGLHEDLNRIRKKPYIQLKDADGRPDKVVAEEAWENHLKRNDSIIVDIFHG
             360       370       380       390       400       410 

       420       430       440       450       460       470       
pF1KB5 LFKSTLVCPDCGNVSVTFDPFCYLSVPLPISHKRVLEVFFIPMDPRRKPEQHRLVVPKKG
       :::::::::.:...::::::::::..:::....:.:::... :::  :: :...:::: :
NP_006 LFKSTLVCPECAKISVTFDPFCYLTLPLPMKKERTLEVYLVRMDPLTKPMQYKVVVPKIG
             420       430       440       450       460       470 

       480       490       500       510       520       530       
pF1KB5 KISDLCVALSKHTGISPERMMVADVFSHRFYKLYQLEEPLSSILDRDDIFVYEVSGRIEA
       .: :::.:::  .::  ..:.:.:...:::.... ..: ::::..::::.:.:..  :. 
NP_006 NILDLCTALSALSGIPADKMIVTDIYNHRFHRIFAMDENLSSIMERDDIYVFEIN--INR
             480       490       500       510       520           

       540       550       560       570       580       590       
pF1KB5 IEGSREDIVVPVYLRERTPARDYNNSYYGLMLFGHPLLVSVPRDRFTWEGLYNVLMYRLS
        : . : ...:: :::.    .:.. . :  :::.:.:..:::.  : . :::.:. :. 
NP_006 TEDT-EHVIIPVCLREKFRHSSYTH-HTGSSLFGQPFLMAVPRNN-TEDKLYNLLLLRMC
     530        540       550        560       570        580      

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pF1KB5 RYVTKPNSDDEDDGD------------------EKEDDEEDKDDVPGPSTGGSLRDP---
       :::   .  .: .:.                  :. .  : . : :   .. . . :   
NP_006 RYVKISTETEETEGSLHCCKDQNINGNGPNGIHEEGSPSEMETDEPDDESSQDQELPSEN
        590       600       610       620       630       640      

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pF1KB5 EPEQAGPSSGVTNRCPFLL---DNCLGTSQWPPRRRRKQLFTLQTVNSNGTSDRTTSPEE
       :  :.  : :  :     :   :.: :  :   ...:  :::.:  : ..:.    . . 
NP_006 ENSQSEDSVGGDNDSENGLCTEDTCKG--QLTGHKKR--LFTFQFNNLGNTDINYIKDDT
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pF1KB5 VHAQ-----------PYIAIDWEPEMKKRYYDEVEAEGYVKHDCVGYVMKKAP-VRLQEC
        : .            ..:.::.:..::::.::  :: . ::. : :   : : :.:..:
NP_006 RHIRFDDRQLRLDERSFLALDWDPDLKKRYFDENAAEDFEKHESVEYKPPKKPFVKLKDC
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pF1KB5 IELFTTVETLEKENPWYCPSCKQHQLATKKLDLWMLPEILIIHLKRFSYTKFSREKLDTL
       :::::: : :  :.:::::.::.:: :::::::: :: .:..:::::::... :.:::::
NP_006 IELFTTKEKLGAEDPWYCPNCKEHQQATKKLDLWSLPPVLVVHLKRFSYSRYMRDKLDTL
            770       780       790       800       810       820  

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pF1KB5 VEFPIRDLDFSEFVIQPQNESNPELYKYDLIAVSNHYGGMRDGHYTTFACNKDSGQWHYF
       :.::: :::.:::.:.:  ...:   .:.:::::::::::  ::::.:: :::.:.:.::
NP_006 VDFPINDLDMSEFLINP--NAGPC--RYNLIAVSNHYGGMGGGHYTAFAKNKDDGKWYYF
            830         840         850       860       870        

             870       880        890       900       910       920
pF1KB5 DDNSVSPVNENQIESKAAYVLFYQRQDV-ARRLLSPAGSSGAPASPACSSPPSSEFMDVN
       ::.::: ..:.:: :::::::::::::. .   . :       :: : . :  :.     
NP_006 DDSSVSTASEDQIVSKAAYVLFYQRQDTFSGTGFFPLDRETKGASAATGIPLESDEDSND
      880       890       900       910       920       930        

NP_006 NDNDIENENCMHTN
      940       950  

>>NP_001239007 (OMIM: 604731) ubiquitin carboxyl-termina  (981 aa)
 initn: 2578 init1: 1308 opt: 1461  Z-score: 1457.6  bits: 281.1 E(85289): 1.9e-74
Smith-Waterman score: 2692; 46.1% identity (69.1% similar) in 954 aa overlap (53-915:24-962)

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pF1KB5 EDREPQHEELPGLDSQWRQIENGESGRERPLRAGESWFLVEKHWYKQWEAYV--------
                                     :: :..:.::...:.:::. ::        
NP_001        MAEGGAADLDTQRSDIATLLKTSLRKGDTWYLVDSRWFKQWKKYVGFDSWDKY
                      10        20        30        40        50   

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pF1KB5 QGGDQDSSTFPGCINNATLFQDEINWRLKEGLVEGEDYVLLPAAAWHYLVSWYGLEHGQP
       : :::.  ..:: :.:. :..:     ::: :..  ::.:::. .:. ::::: : .:: 
NP_001 QMGDQN--VYPGPIDNSGLLKDGDAQSLKEHLIDELDYILLPTEGWNKLVSWYTLMEGQE
              60        70        80        90       100       110 

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pF1KB5 PIERKVIELPNIQK---VEVYPVELLLVRHNDLGKSHTVQFSHTDSIGLVLRTARERFLV
       :: :::.:   . :   :::: .:: : .......  : .::..:.:  . .  :. : .
NP_001 PIARKVVEQGMFVKHCKVEVYLTELKLCENGNMNNVVTRRFSKADTIDTIEKEIRKIFSI
             120       130       140       150       160       170 

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pF1KB5 EPQEDTRLWAKNSEGSLDRLYDTHITVLDAALETGQLIIMETRKKDGTWP----------
         ...:::: :   .... :     :. ::.:  ::....: ...:::::          
NP_001 PDEKETRLWNKYMSNTFEPLNKPDSTIQDAGLYQGQVLVIEQKNEDGTWPRGPSTPKSPG
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pF1KB5 ---------------SAQLHVMNN-NMSE-----------EDEDFK--G----QPGICGL
                      : . . ::: :...           .. :..  :    :::.:::
NP_001 ASNFSTLPKISPSSLSNNYNNMNNRNVKNSNYCLPSYTAYKNYDYSEPGRNNEQPGLCGL
             240       250       260       270       280       290 

      270       280       290       300       310       320        
pF1KB5 TNLGNTCFMNSALQCLSNVPQLTEYFLNNCYLEELNFRNPLGMKGEIAEAYADLVKQAWS
       .:::::::::::.:::::.: :::::::. : ::::: :::::.::::..::.:.:: ::
NP_001 SNLGNTCFMNSAIQCLSNTPPLTEYFLNDKYQEELNFDNPLGMRGEIAKSYAELIKQMWS
             300       310       320       330       340       350 

      330       340       350       360       370       380        
pF1KB5 GHHRSIVPHVFKNKVGHFASQFLGYQQHDSQELLSFLLDGLHEDLNRVKKKEYVELCDAA
       :.   ..:..::..::.:: :: ::::.: ::::.::::::::::::..:: :..: :: 
NP_001 GKFSYVTPRAFKTQVGRFAPQFSGYQQQDCQELLAFLLDGLHEDLNRIRKKPYIQLKDAD
             360       370       380       390       400       410 

      390       400       410       420       430       440        
pF1KB5 GRPDQEVAQEAWQNHKRRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPDCGNVSVTFDPFCYLSVPLPIS
       ::::. ::.:::.:: .::::.::: ::::::::::::.:...::::::::::..:::..
NP_001 GRPDKVVAEEAWENHLKRNDSIIVDIFHGLFKSTLVCPECAKISVTFDPFCYLTLPLPMK
             420       430       440       450       460       470 

      450       460       470       480       490       500        
pF1KB5 HKRVLEVFFIPMDPRRKPEQHRLVVPKKGKISDLCVALSKHTGISPERMMVADVFSHRFY
       ..:.:::... :::  :: :...:::: :.: :::.:::  .::  ..:.:.:...:::.
NP_001 KERTLEVYLVRMDPLTKPMQYKVVVPKIGNILDLCTALSALSGIPADKMIVTDIYNHRFH
             480       490       500       510       520       530 

      510       520       530       540       550       560        
pF1KB5 KLYQLEEPLSSILDRDDIFVYEVSGRIEAIEGSREDIVVPVYLRERTPARDYNNSYYGLM
       ... ..: ::::..::::.:.:..  :.  : . : ...:: :::.    .:.. . :  
NP_001 RIFAMDENLSSIMERDDIYVFEIN--INRTEDT-EHVIIPVCLREKFRHSSYTH-HTGSS
             540       550         560        570       580        

      570       580       590       600       610                  
pF1KB5 LFGHPLLVSVPRDRFTWEGLYNVLMYRLSRYVTKPNSDDEDDGD----------------
       :::.:.:..:::.  : . :::.:. :. :::   .  .: .:.                
NP_001 LFGQPFLMAVPRNN-TEDKLYNLLLLRMCRYVKISTETEETEGSLHCCKDQNINGNGPNG
       590       600        610       620       630       640      

              620       630          640       650          660    
pF1KB5 --EKEDDEEDKDDVPGPSTGGSLRDP---EPEQAGPSSGVTNRCPFLL---DNCLGTSQW
         :. .  : . : :   .. . . :   :  :.  : :  :     :   :.: :  : 
NP_001 IHEEGSPSEMETDEPDDESSQDQELPSENENSQSEDSVGGDNDSENGLCTEDTCKG--QL
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