Result of FASTA (ccds) for pF1KB5263
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5263, 379 aa
  1>>>pF1KB5263 379 - 379 aa - 379 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7675+/-0.00118; mu= -0.9136+/- 0.068
 mean_var=254.7311+/-57.798, 0's: 0 Z-trim(108.0): 647  B-trim: 102 in 1/50
 Lambda= 0.080359
 statistics sampled from 9167 (9955) to 9167 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.669), E-opt: 0.2 (0.306), width:  16
 Scan time:  2.860

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS10672.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16         ( 379) 2542 308.4 6.6e-84
CCDS42149.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16         ( 357) 2281 278.2 8.1e-75
CCDS13795.1 MAPK1 gene_id:5594|Hs108|chr22         ( 360) 2109 258.2 8.2e-69
CCDS42148.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16         ( 335) 1741 215.5 5.4e-56
CCDS11206.1 MAPK7 gene_id:5598|Hs108|chr17         ( 816) 1158 148.3 2.3e-35
CCDS4816.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6          ( 360) 1084 139.4 4.8e-33
CCDS4815.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6          ( 360) 1071 137.9 1.4e-32
CCDS14090.1 MAPK11 gene_id:5600|Hs108|chr22        ( 364) 1065 137.2 2.2e-32
CCDS4818.1 MAPK13 gene_id:5603|Hs108|chr6          ( 365) 1005 130.2 2.8e-30
CCDS14089.1 MAPK12 gene_id:6300|Hs108|chr22        ( 367)  955 124.4 1.6e-28
CCDS11207.1 MAPK7 gene_id:5598|Hs108|chr17         ( 677)  906 119.0 1.2e-26
CCDS42437.1 MAPK4 gene_id:5596|Hs108|chr18         ( 587)  894 117.6 2.9e-26
CCDS43410.1 MAPK9 gene_id:5601|Hs108|chr5          ( 382)  887 116.6 3.8e-26
CCDS4454.1 MAPK9 gene_id:5601|Hs108|chr5           ( 424)  887 116.6 4.1e-26
CCDS43247.1 MAPK10 gene_id:5602|Hs108|chr4         ( 422)  884 116.3 5.2e-26
CCDS3612.1 MAPK10 gene_id:5602|Hs108|chr4          ( 426)  884 116.3 5.2e-26
CCDS34026.1 MAPK10 gene_id:5602|Hs108|chr4         ( 464)  884 116.3 5.5e-26
CCDS7225.1 MAPK8 gene_id:5599|Hs108|chr10          ( 384)  868 114.4 1.8e-25
CCDS7224.1 MAPK8 gene_id:5599|Hs108|chr10          ( 427)  868 114.4 1.9e-25
CCDS7226.1 MAPK8 gene_id:5599|Hs108|chr10          ( 384)  856 113.0 4.6e-25
CCDS7223.1 MAPK8 gene_id:5599|Hs108|chr10          ( 427)  856 113.0   5e-25
CCDS43409.1 MAPK9 gene_id:5601|Hs108|chr5          ( 382)  855 112.9   5e-25
CCDS4453.1 MAPK9 gene_id:5601|Hs108|chr5           ( 424)  855 112.9 5.3e-25
CCDS6409.2 MAPK15 gene_id:225689|Hs108|chr8        ( 544)  855 113.0 6.4e-25
CCDS11224.2 NLK gene_id:51701|Hs108|chr17          ( 527)  847 112.1 1.2e-24
CCDS10147.1 MAPK6 gene_id:5597|Hs108|chr15         ( 721)  842 111.6 2.2e-24
CCDS4817.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6          ( 307)  821 108.8 6.5e-24
CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17          ( 305)  666 90.9 1.7e-18
CCDS77188.1 MAPK4 gene_id:5596|Hs108|chr18         ( 233)  661 90.2 2.1e-18
CCDS8898.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12           ( 298)  663 90.5 2.1e-18
CCDS82937.1 MAPK10 gene_id:5602|Hs108|chr4         ( 319)  649 88.9 6.8e-18
CCDS47748.1 CDK5 gene_id:1020|Hs108|chr7           ( 292)  641 87.9 1.2e-17
CCDS3999.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5            ( 346)  631 86.9   3e-17
CCDS53819.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12         ( 523)  633 87.3 3.5e-17
CCDS9061.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12          ( 523)  631 87.0 4.1e-17
CCDS44408.1 CDK1 gene_id:983|Hs108|chr10           ( 297)  622 85.8 5.6e-17
CCDS47356.1 MAPK9 gene_id:5601|Hs108|chr5          ( 242)  617 85.1 7.3e-17
CCDS4949.1 ICK gene_id:22858|Hs108|chr6            ( 632)  623 86.2 8.8e-17
CCDS14276.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX          ( 496)  619 85.6   1e-16
CCDS48101.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX          ( 502)  619 85.6   1e-16
CCDS72682.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1          ( 748)  622 86.1 1.1e-16
CCDS72684.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1          ( 782)  622 86.2 1.1e-16
CCDS72683.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1          ( 795)  622 86.2 1.1e-16
CCDS55408.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX          ( 570)  619 85.7 1.1e-16
CCDS75398.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6            ( 583)  619 85.7 1.2e-16
CCDS4516.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6             ( 623)  619 85.7 1.2e-16
CCDS75399.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6            ( 648)  619 85.7 1.2e-16
CCDS44043.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1       ( 770)  618 85.7 1.5e-16
CCDS81254.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1       ( 779)  618 85.7 1.5e-16
CCDS44042.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1       ( 780)  618 85.7 1.5e-16


>>CCDS10672.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16              (379 aa)
 initn: 2542 init1: 2542 opt: 2542  Z-score: 1619.9  bits: 308.4 E(32554): 6.6e-84
Smith-Waterman score: 2542; 100.0% identity (100.0% similar) in 379 aa overlap (1-379:1-379)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MAAAAAQGGGGGEPRRTEGVGPGVPGEVEMVKGQPFDVGPRYTQLQYIGEGAYGMVSSAY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MAAAAAQGGGGGEPRRTEGVGPGVPGEVEMVKGQPFDVGPRYTQLQYIGEGAYGMVSSAY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 DHVRKTRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIQILLRFRHENVIGIRDILRASTLEAMRDVYI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DHVRKTRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIQILLRFRHENVIGIRDILRASTLEAMRDVYI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 VQDLMETDLYKLLKSQQLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLINTTCDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VQDLMETDLYKLLKSQQLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLINTTCDL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 KICDFGLARIADPEHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KICDFGLARIADPEHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 NRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINMKARNYLQSLPSKTKVAWAKLFPKSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINMKARNYLQSLPSKTKVAWAKLFPKSD
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 SKALDLLDRMLTFNPNKRITVEEALAHPYLEQYYDPTDEPVAEEPFTFAMELDDLPKERL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SKALDLLDRMLTFNPNKRITVEEALAHPYLEQYYDPTDEPVAEEPFTFAMELDDLPKERL
              310       320       330       340       350       360

              370         
pF1KB5 KELIFQETARFQPGVLEAP
       :::::::::::::::::::
CCDS10 KELIFQETARFQPGVLEAP
              370         

>>CCDS42149.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16              (357 aa)
 initn: 2277 init1: 2277 opt: 2281  Z-score: 1456.7  bits: 278.2 E(32554): 8.1e-75
Smith-Waterman score: 2281; 98.8% identity (99.4% similar) in 345 aa overlap (1-345:1-344)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MAAAAAQGGGGGEPRRTEGVGPGVPGEVEMVKGQPFDVGPRYTQLQYIGEGAYGMVSSAY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MAAAAAQGGGGGEPRRTEGVGPGVPGEVEMVKGQPFDVGPRYTQLQYIGEGAYGMVSSAY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 DHVRKTRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIQILLRFRHENVIGIRDILRASTLEAMRDVYI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DHVRKTRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIQILLRFRHENVIGIRDILRASTLEAMRDVYI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 VQDLMETDLYKLLKSQQLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLINTTCDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VQDLMETDLYKLLKSQQLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLINTTCDL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 KICDFGLARIADPEHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KICDFGLARIADPEHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 NRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINMKARNYLQSLPSKTKVAWAKLFPKSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 NRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINMKARNYLQSLPSKTKVAWAKLFPKSD
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 SKALDLLDRMLTFNPNKRITVEEALAHPYLEQYYDPTDEPVAEEPFTFAMELDDLPKERL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :.. :               
CCDS42 SKALDLLDRMLTFNPNKRITVEEALAHPYLEQYYDPTDE-VGQSPAAVGLGAGEQGGT  
              310       320       330        340       350         

              370         
pF1KB5 KELIFQETARFQPGVLEAP

>>CCDS13795.1 MAPK1 gene_id:5594|Hs108|chr22              (360 aa)
 initn: 2138 init1: 2105 opt: 2109  Z-score: 1348.9  bits: 258.2 E(32554): 8.2e-69
Smith-Waterman score: 2109; 86.5% identity (94.4% similar) in 356 aa overlap (19-374:8-357)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MAAAAAQGGGGGEPRRTEGVGPGVPGEVEMVKGQPFDVGPRYTQLQYIGEGAYGMVSSAY
                         :.::      :::.:: ::::::::.:.:::::::::: :::
CCDS13            MAAAAAAGAGP------EMVRGQVFDVGPRYTNLSYIGEGAYGMVCSAY
                          10              20        30        40   

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 DHVRKTRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIQILLRFRHENVIGIRDILRASTLEAMRDVYI
       :.: :.:::::::::::::::::::::::.:::::::::.::: ::.:: :.: :.::::
CCDS13 DNVNKVRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIKILLRFRHENIIGINDIIRAPTIEQMKDVYI
            50        60        70        80        90       100   

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 VQDLMETDLYKLLKSQQLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLINTTCDL
       ::::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS13 VQDLMETDLYKLLKTQHLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLLNTTCDL
           110       120       130       140       150       160   

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 KICDFGLARIADPEHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLS
       :::::::::.:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KICDFGLARVADPDHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLS
           170       180       190       200       210       220   

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 NRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINMKARNYLQSLPSKTKVAWAKLFPKSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::: ::: :.:: : .:::..:
CCDS13 NRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINLKARNYLLSLPHKNKVPWNRLFPNAD
           230       240       250       260       270       280   

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 SKALDLLDRMLTFNPNKRITVEEALAHPYLEQYYDPTDEPVAEEPFTFAMELDDLPKERL
       ::::::::.::::::.::: ::.:::::::::::::.:::.:: :: : :::::::::.:
CCDS13 SKALDLLDKMLTFNPHKRIEVEQALAHPYLEQYYDPSDEPIAEAPFKFDMELDDLPKEKL
           290       300       310       320       330       340   

              370         
pF1KB5 KELIFQETARFQPGVLEAP
       :::::.::::::::     
CCDS13 KELIFEETARFQPGYRS  
           350       360  

>>CCDS42148.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16              (335 aa)
 initn: 1776 init1: 1741 opt: 1741  Z-score: 1118.7  bits: 215.5 E(32554): 5.4e-56
Smith-Waterman score: 2152; 88.4% identity (88.4% similar) in 379 aa overlap (1-379:1-335)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MAAAAAQGGGGGEPRRTEGVGPGVPGEVEMVKGQPFDVGPRYTQLQYIGEGAYGMVSSAY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MAAAAAQGGGGGEPRRTEGVGPGVPGEVEMVKGQPFDVGPRYTQLQYIGEGAYGMVSSAY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 DHVRKTRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIQILLRFRHENVIGIRDILRASTLEAMRDVYI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DHVRKTRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIQILLRFRHENVIGIRDILRASTLEAMRDVYI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 VQDLMETDLYKLLKSQQLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLINTTCDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VQDLMETDLYKLLKSQQLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLINTTCDL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 KICDFGLARIADPEHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KICDFGLARIADPEHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 NRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINMKARNYLQSLPSKTKVAWAKLFPKSD
       ::::::::::::::::::                                          
CCDS42 NRPIFPGKHYLDQLNHIL------------------------------------------
              250                                                  

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 SKALDLLDRMLTFNPNKRITVEEALAHPYLEQYYDPTDEPVAEEPFTFAMELDDLPKERL
         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 --ALDLLDRMLTFNPNKRITVEEALAHPYLEQYYDPTDEPVAEEPFTFAMELDDLPKERL
        260       270       280       290       300       310      

              370         
pF1KB5 KELIFQETARFQPGVLEAP
       :::::::::::::::::::
CCDS42 KELIFQETARFQPGVLEAP
        320       330     

>>CCDS11206.1 MAPK7 gene_id:5598|Hs108|chr17              (816 aa)
 initn: 1074 init1: 601 opt: 1158  Z-score: 748.5  bits: 148.3 E(32554): 2.3e-35
Smith-Waterman score: 1158; 51.0% identity (76.5% similar) in 341 aa overlap (36-372:49-389)

          10        20        30        40        50        60     
pF1KB5 AQGGGGGEPRRTEGVGPGVPGEVEMVKGQPFDVGPRYTQLQYIGEGAYGMVSSAYDHVRK
                                     :::: .:  .. ::.::::.::::  ..  
CCDS11 GPVKAEPAHTAASVAAKNLALLKARSFDVTFDVGDEYEIIETIGNGAYGVVSSARRRLTG
       20        30        40        50        60        70        

          70         80        90       100       110        120   
pF1KB5 TRVAIKKI-SPFEHQTYCQRTLREIQILLRFRHENVIGIRDILRAST-LEAMRDVYIVQD
        .:::::: . :.  :  .:::::..:: .:.:.:.:.:.:::: ..    ...::.: :
CCDS11 QQVAIKKIPNAFDVVTNAKRTLRELKILKHFKHDNIIAIKDILRPTVPYGEFKSVYVVLD
       80        90       100       110       120       130        

           130        140       150       160       170       180  
pF1KB5 LMETDLYKLLKSQQ-LSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLINTTCDLKI
       :::.::.....:.: :. .:. :::::.::::::.:::.:.::::::::::.: .:.:::
CCDS11 LMESDLHQIIHSSQPLTLEHVRYFLYQLLRGLKYMHSAQVIHRDLKPSNLLVNENCELKI
      140       150       160       170       180       190        

             190       200       210       220       230       240 
pF1KB5 CDFGLAR-IADPEHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSN
        :::.:: .     .:  :.:::::::::::::.::. . ::..::.::::::..:::. 
CCDS11 GDFGMARGLCTSPAEHQYFMTEYVATRWYRAPELMLSLHEYTQAIDLWSVGCIFGEMLAR
      200       210       220       230       240       250        

             250       260       270       280       290       300 
pF1KB5 RPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINMKARNYLQSLPSKTKVAWAKLFPKSDS
       : .::::.:. ::. :. .::.::   .. .   ..: :.:::: .  : :  ..: .: 
CCDS11 RQLFPGKNYVHQLQLIMMVLGTPSPAVIQAVGAERVRAYIQSLPPRQPVPWETVYPGADR
      260       270       280       290       300       310        

             310       320       330       340       350       360 
pF1KB5 KALDLLDRMLTFNPNKRITVEEALAHPYLEQYYDPTDEPVAEEPFTFAMELDDLPKERLK
       .::.:: ::: :.:. ::..  :: ::.: .:.:: :::    :: ::.. . : .::.:
CCDS11 QALSLLGRMLRFEPSARISAAAALRHPFLAKYHDPDDEPDCAPPFDFAFDREALTRERIK
      320       330       340       350       360       370        

             370                                                   
pF1KB5 ELIFQETARFQPGVLEAP                                          
       : :  :   :.                                                 
CCDS11 EAIVAEIEDFHARREGIRQQIRFQPSLQPVASEPGCPDVEMPSPWAPSGDCAMESPPPAP
      380       390       400       410       420       430        

>>CCDS4816.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6               (360 aa)
 initn: 1045 init1: 516 opt: 1084  Z-score: 706.7  bits: 139.4 E(32554): 4.8e-33
Smith-Waterman score: 1084; 49.1% identity (75.3% similar) in 344 aa overlap (36-377:18-354)

          10        20        30        40        50        60     
pF1KB5 AQGGGGGEPRRTEGVGPGVPGEVEMVKGQPFDVGPRYTQLQYIGEGAYGMVSSAYDHVRK
                                     ..:  :: .:. .: :::: : .:.:    
CCDS48              MSQERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTG
                            10        20        30        40       

          70         80        90       100        110       120   
pF1KB5 TRVAIKKIS-PFEHQTYCQRTLREIQILLRFRHENVIGIRDILR-ASTLEAMRDVYIVQD
        :::.::.: ::.   . .:: ::...: ...::::::. :..  : .:: . :::.:  
CCDS48 LRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTH
        50        60        70        80        90       100       

           130       140       150       160       170       180   
pF1KB5 LMETDLYKLLKSQQLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLINTTCDLKIC
       :: .:: ...: :.:..::. ...:::::::::::::...::::::::: .:  :.::: 
CCDS48 LMGADLNNIVKCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKIL
       110       120       130       140       150       160       

           190       200       210       220       230       240   
pF1KB5 DFGLARIADPEHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSNRP
       :::::: .: :      .: :::::::::::::::   :....::::::::.::.:..: 
CCDS48 DFGLARHTDDE------MTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRT
       170             180       190       200       210       220 

           250       260       270       280       290       300   
pF1KB5 IFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINMKARNYLQSLPSKTKVAWAKLFPKSDSKA
       .:::  ..:::. :: ..:.:. : :. : . .::::.::: .  :. .:..:  ..  :
CCDS48 LFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLA
             230       240       250       260       270       280 

           310       320       330       340       350       360   
pF1KB5 LDLLDRMLTFNPNKRITVEEALAHPYLEQYYDPTDEPVAEEPFTFAMELDDLPKERLKEL
       .:::..::... .::::. .:::: :. ::.:: :::::. :.  ..:  ::  .. : :
CCDS48 VDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVAD-PYDQSFESRDLLIDEWKSL
             290       300       310       320        330       340

           370             
pF1KB5 IFQETARFQPGVLEAP    
        ..:.  : :  :.      
CCDS48 TYDEVISFVPPPLDQEEMES
              350       360

>>CCDS4815.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6               (360 aa)
 initn: 1032 init1: 503 opt: 1071  Z-score: 698.5  bits: 137.9 E(32554): 1.4e-32
Smith-Waterman score: 1071; 48.0% identity (74.7% similar) in 344 aa overlap (36-377:18-354)

          10        20        30        40        50        60     
pF1KB5 AQGGGGGEPRRTEGVGPGVPGEVEMVKGQPFDVGPRYTQLQYIGEGAYGMVSSAYDHVRK
                                     ..:  :: .:. .: :::: : .:.:    
CCDS48              MSQERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTG
                            10        20        30        40       

          70         80        90       100        110       120   
pF1KB5 TRVAIKKIS-PFEHQTYCQRTLREIQILLRFRHENVIGIRDILR-ASTLEAMRDVYIVQD
        :::.::.: ::.   . .:: ::...: ...::::::. :..  : .:: . :::.:  
CCDS48 LRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTH
        50        60        70        80        90       100       

           130       140       150       160       170       180   
pF1KB5 LMETDLYKLLKSQQLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLINTTCDLKIC
       :: .:: ...: :.:..::. ...:::::::::::::...::::::::: .:  :.::: 
CCDS48 LMGADLNNIVKCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKIL
       110       120       130       140       150       160       

           190       200       210       220       230       240   
pF1KB5 DFGLARIADPEHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSNRP
       :::::: .: :      .: :::::::::::::::   :....::::::::.::.:..: 
CCDS48 DFGLARHTDDE------MTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRT
       170             180       190       200       210       220 

           250       260       270       280       290       300   
pF1KB5 IFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINMKARNYLQSLPSKTKVAWAKLFPKSDSKA
       .:::  ...::..:. . :.:    .: . . .::::.::: .  :. .:..:  ..  :
CCDS48 LFPGTDHINQLQQIMRLTGTPPAYLINRMPSHEARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLA
             230       240       250       260       270       280 

           310       320       330       340       350       360   
pF1KB5 LDLLDRMLTFNPNKRITVEEALAHPYLEQYYDPTDEPVAEEPFTFAMELDDLPKERLKEL
       .:::..::... .::::. .:::: :. ::.:: :::::. :.  ..:  ::  .. : :
CCDS48 VDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVAD-PYDQSFESRDLLIDEWKSL
             290       300       310       320        330       340

           370             
pF1KB5 IFQETARFQPGVLEAP    
        ..:.  : :  :.      
CCDS48 TYDEVISFVPPPLDQEEMES
              350       360

>>CCDS14090.1 MAPK11 gene_id:5600|Hs108|chr22             (364 aa)
 initn: 982 init1: 511 opt: 1065  Z-score: 694.7  bits: 137.2 E(32554): 2.2e-32
Smith-Waterman score: 1065; 47.6% identity (74.7% similar) in 340 aa overlap (36-373:18-350)

          10        20        30        40        50        60     
pF1KB5 AQGGGGGEPRRTEGVGPGVPGEVEMVKGQPFDVGPRYTQLQYIGEGAYGMVSSAYDHVRK
                                     ..:  :   :. .: :::: : ::::   .
CCDS14              MSGPRAGFYRQELNKTVWEVPQRLQGLRPVGSGAYGSVCSAYDARLR
                            10        20        30        40       

          70         80        90       100        110       120   
pF1KB5 TRVAIKKIS-PFEHQTYCQRTLREIQILLRFRHENVIGIRDILR-ASTLEAMRDVYIVQD
        .::.::.: ::.   . .:: ::...: ...::::::. :..  :...: . .::.:  
CCDS14 QKVAVKKLSRPFQSLIHARRTYRELRLLKHLKHENVIGLLDVFTPATSIEDFSEVYLVTT
        50        60        70        80        90       100       

           130       140       150       160       170       180   
pF1KB5 LMETDLYKLLKSQQLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLINTTCDLKIC
       :: .:: ...: : ::..:. ...::.::::::::::...::::::::. .:  :.:.: 
CCDS14 LMGADLNNIVKCQALSDEHVQFLVYQLLRGLKYIHSAGIIHRDLKPSNVAVNEDCELRIL
       110       120       130       140       150       160       

           190       200       210       220       230       240   
pF1KB5 DFGLARIADPEHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSNRP
       :::::: :: :      .: :::::::::::::::   :....::::::::.::.:... 
CCDS14 DFGLARQADEE------MTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLQGKA
       170             180       190       200       210       220 

           250       260       270       280       290       300   
pF1KB5 IFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINMKARNYLQSLPSKTKVAWAKLFPKSDSKA
       .:::. :.:::..:. ..:.:: : :  : . .::.:.::::   .   ...:  ..  :
CCDS14 LFPGSDYIDQLKRIMEVVGTPSPEVLAKISSEHARTYIQSLPPMPQKDLSSIFRGANPLA
             230       240       250       260       270       280 

           310       320       330       340       350       360   
pF1KB5 LDLLDRMLTFNPNKRITVEEALAHPYLEQYYDPTDEPVAEEPFTFAMELDDLPKERLKEL
       .::: :::... ..:... ::::: :. ::.:: ::: :: :.  ..:  .   :. :::
CCDS14 IDLLGRMLVLDSDQRVSAAEALAHAYFSQYHDPEDEPEAE-PYDESVEAKERTLEEWKEL
             290       300       310       320        330       340

           370                 
pF1KB5 IFQETARFQPGVLEAP        
        .::.  :.:              
CCDS14 TYQEVLSFKPPEPPKPPGSLEIEQ
              350       360    

>>CCDS4818.1 MAPK13 gene_id:5603|Hs108|chr6               (365 aa)
 initn: 881 init1: 498 opt: 1005  Z-score: 657.1  bits: 130.2 E(32554): 2.8e-30
Smith-Waterman score: 1005; 45.1% identity (76.3% similar) in 337 aa overlap (40-373:22-351)

      10        20        30        40         50        60        
pF1KB5 GGGEPRRTEGVGPGVPGEVEMVKGQPFDVGPR-YTQLQYIGEGAYGMVSSAYDHVRKTRV
                                     :. :..  ..: :::: : :: :.    .:
CCDS48          MSLIRKKGFYKQDVNKTAWELPKTYVSPTHVGSGAYGSVCSAIDKRSGEKV
                        10        20        30        40        50 

       70         80        90       100        110       120      
pF1KB5 AIKKIS-PFEHQTYCQRTLREIQILLRFRHENVIGIRDILR-ASTLEAMRDVYIVQDLME
       ::::.: ::. . . .:. ::. .: ...::::::. :..  ::.:. . : :.:. .:.
CCDS48 AIKKLSRPFQSEIFAKRAYRELLLLKHMQHENVIGLLDVFTPASSLRNFYDFYLVMPFMQ
              60        70        80        90       100       110 

        130       140       150       160       170       180      
pF1KB5 TDLYKLLKSQQLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLINTTCDLKICDFG
       ::: :.. ....:...: :..::.:.::::::::.:.::::::.:: .:  :.::: :::
CCDS48 TDLQKIM-GMEFSEEKIQYLVYQMLKGLKYIHSAGVVHRDLKPGNLAVNEDCELKILDFG
              120       130       140       150       160       170

        190       200       210       220       230       240      
pF1KB5 LARIADPEHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSNRPIFP
       ::: :: :      .: ::.::::::::..:.   :....::::::::.::::... .: 
CCDS48 LARHADAE------MTGYVVTRWYRAPEVILSWMHYNQTVDIWSVGCIMAEMLTGKTLFK
                    180       190       200       210       220    

        250       260       270       280       290       300      
pF1KB5 GKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINMKARNYLQSLPSKTKVAWAKLFPKSDSKALDL
       :: :::::..:: . : :. : .. . .  :..:.::::.  .  ...:::... .: ::
CCDS48 GKDYLDQLTQILKVTGVPGTEFVQKLNDKAAKSYIQSLPQTPRKDFTQLFPRASPQAADL
          230       240       250       260       270       280    

        310       320       330       340       350       360      
pF1KB5 LDRMLTFNPNKRITVEEALAHPYLEQYYDPTDEPVAEEPFTFAMELDDLPKERLKELIFQ
       :..:: .. .::.:. .::.::..: . :: .:  :..::  ..: . :  .. :. :..
CCDS48 LEKMLELDVDKRLTAAQALTHPFFEPFRDPEEETEAQQPFDDSLEHEKLTVDEWKQHIYK
          290       300       310       320       330       340    

        370                 
pF1KB5 ETARFQPGVLEAP        
       : . :.:              
CCDS48 EIVNFSPIARKDSRRRSGMKL
          350       360     

>>CCDS14089.1 MAPK12 gene_id:6300|Hs108|chr22             (367 aa)
 initn: 939 init1: 450 opt: 955  Z-score: 625.7  bits: 124.4 E(32554): 1.6e-28
Smith-Waterman score: 955; 42.7% identity (74.9% similar) in 342 aa overlap (36-373:21-353)

          10        20        30        40        50        60     
pF1KB5 AQGGGGGEPRRTEGVGPGVPGEVEMVKGQPFDVGPRYTQLQYIGEGAYGMVSSAYDHVRK
                                     ..:   : .:: .: :::: : :: :    
CCDS14           MSSPPPARSGFYRQEVTKTAWEVRAVYRDLQPVGSGAYGAVCSAVDGRTG
                         10        20        30        40        50

          70         80        90       100       110        120   
pF1KB5 TRVAIKKI-SPFEHQTYCQRTLREIQILLRFRHENVIGIRDILRAS-TLEAMRDVYIVQD
       ..:::::.  ::. . . .:. ::...: ..:::::::. :..  . ::. . : :.:. 
CCDS14 AKVAIKKLYRPFQSELFAKRAYRELRLLKHMRHENVIGLLDVFTPDETLDDFTDFYLVMP
               60        70        80        90       100       110

           130       140       150       160       170       180   
pF1KB5 LMETDLYKLLKSQQLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLINTTCDLKIC
       .: ::: ::.: ..:..:.: ...::.:.::.:::.:...::::::.:: .:  :.::: 
CCDS14 FMGTDLGKLMKHEKLGEDRIQFLVYQMLKGLRYIHAAGIIHRDLKPGNLAVNEDCELKIL
              120       130       140       150       160       170

           190       200       210       220       230       240   
pF1KB5 DFGLARIADPEHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSNRP
       :::::: :: :      .: ::.::::::::..::   ::...::::::::.:::.... 
CCDS14 DFGLARQADSE------MTGYVVTRWYRAPEVILNWMRYTQTVDIWSVGCIMAEMITGKT
              180             190       200       210       220    

           250       260       270       280       290       300   
pF1KB5 IFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINMKARNYLQSLPSKTKVAWAKLFPKSDSKA
       .: :. .::::..:. . :.:  : .. . . .:.::...::   :  .:... ...  :
CCDS14 LFKGSDHLDQLKEIMKVTGTPPAEFVQRLQSDEAKNYMKGLPELEKKDFASILTNASPLA
          230       240       250       260       270       280    

           310       320       330       340       350         360 
pF1KB5 LDLLDRMLTFNPNKRITVEEALAHPYLEQYYDPTDEPVAEEPFTFAMELDDLPK--ERLK
       ..::..::... ..:.:. :::::::.:. .:  ::: ...   .   .::. .  .. :
CCDS14 VNLLEKMLVLDAEQRVTAGEALAHPYFESLHDTEDEPQVQK---YDDSFDDVDRTLDEWK
          290       300       310       320          330       340 

             370                 
pF1KB5 ELIFQETARFQPGVLEAP        
       .. ..:.  :.:              
CCDS14 RVTYKEVLSFKPPRQLGARVSKETPL
             350       360       




379 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 16:28:00 2016 done: Thu Nov  3 16:28:00 2016
 Total Scan time:  2.860 Total Display time:  0.020

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com