Result of FASTA (ccds) for pF1KB4848
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB4848, 419 aa
  1>>>pF1KB4848 419 - 419 aa - 419 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2714+/-0.00092; mu= 17.2214+/- 0.055
 mean_var=64.7020+/-13.015, 0's: 0 Z-trim(105.4): 31  B-trim: 266 in 1/46
 Lambda= 0.159447
 statistics sampled from 8358 (8381) to 8358 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.634), E-opt: 0.2 (0.257), width:  16
 Scan time:  2.630

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS8479.1 KCNJ5 gene_id:3762|Hs108|chr11          ( 419) 2819 657.4 7.3e-189
CCDS42927.1 KCNJ6 gene_id:3763|Hs108|chr21         ( 423) 1975 463.2  2e-130
CCDS1194.1 KCNJ9 gene_id:3765|Hs108|chr1           ( 393) 1727 406.2 2.9e-113
CCDS2200.1 KCNJ3 gene_id:3760|Hs108|chr2           ( 501) 1501 354.2 1.6e-97
CCDS11219.1 KCNJ12 gene_id:3768|Hs108|chr17        ( 433) 1317 311.9 7.6e-85
CCDS74015.1 KCNJ18 gene_id:100134444|Hs108|chr17   ( 433) 1300 308.0 1.1e-83
CCDS11688.1 KCNJ2 gene_id:3759|Hs108|chr17         ( 427) 1297 307.3 1.8e-83
CCDS12721.1 KCNJ14 gene_id:3770|Hs108|chr19        ( 436) 1193 283.4   3e-76
CCDS8692.1 KCNJ8 gene_id:3764|Hs108|chr12          ( 424) 1138 270.7 1.9e-72
CCDS31436.1 KCNJ11 gene_id:3767|Hs108|chr11        ( 390) 1127 268.2   1e-71
CCDS13971.1 KCNJ4 gene_id:3761|Hs108|chr22         ( 445) 1091 259.9 3.5e-69
CCDS8477.1 KCNJ1 gene_id:3758|Hs108|chr11          ( 372) 1071 255.3 7.3e-68
CCDS8476.1 KCNJ1 gene_id:3758|Hs108|chr11          ( 391) 1071 255.3 7.6e-68
CCDS11687.1 KCNJ16 gene_id:3773|Hs108|chr17        ( 418)  951 227.7 1.6e-59
CCDS74141.1 KCNJ16 gene_id:3773|Hs108|chr17        ( 453)  951 227.7 1.8e-59
CCDS58733.1 KCNJ3 gene_id:3760|Hs108|chr2          ( 235)  929 222.5 3.4e-58
CCDS1193.1 KCNJ10 gene_id:3766|Hs108|chr1          ( 379)  900 215.9 5.1e-56
CCDS53606.1 KCNJ11 gene_id:3767|Hs108|chr11        ( 303)  897 215.2 6.9e-56
CCDS13656.1 KCNJ15 gene_id:3772|Hs108|chr21        ( 375)  879 211.1 1.4e-54
CCDS2498.1 KCNJ13 gene_id:3769|Hs108|chr2          ( 360)  639 155.9 5.8e-38


>>CCDS8479.1 KCNJ5 gene_id:3762|Hs108|chr11               (419 aa)
 initn: 2819 init1: 2819 opt: 2819  Z-score: 3504.2  bits: 657.4 E(32554): 7.3e-189
Smith-Waterman score: 2819; 99.8% identity (100.0% similar) in 419 aa overlap (1-419:1-419)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MAGDSRNAMNQDMEIGVTPWDPKKIPKQARDYVPIATDRTRLLAEGKKPRQRYMEKSGKC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 MAGDSRNAMNQDMEIGVTPWDPKKIPKQARDYVPIATDRTRLLAEGKKPRQRYMEKSGKC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 NVHHGNVQETYRYLSDLFTTLVDLKWRFNLLVFTMVYTVTWLFFGFIWWLIAYIRGDLDH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 NVHHGNVQETYRYLSDLFTTLVDLKWRFNLLVFTMVYTVTWLFFGFIWWLIAYIRGDLDH
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 VGDQEWIPCVENLSGFVSAFLFSIETETTIGYGFRVITEKCPEGIILLLVQAILGSIVNA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 VGDQEWIPCVENLSGFVSAFLFSIETETTIGYGFRVITEKCPEGIILLLVQAILGSIVNA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 FMVGCMFVKISQPKKRAETLMFSNNAVISMRDEKLCLMFRVGDLRNSHIVEASIRAKLIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 FMVGCMFVKISQPKKRAETLMFSNNAVISMRDEKLCLMFRVGDLRNSHIVEASIRAKLIK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 SRQTKEGEFIPLNQTDINVGFDTGDDRLFLVSPLIISHEINEKSPFWEMSQAQLHQEEFE
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS84 SRQTKEGEFIPLNQTDINVGFDTGDDRLFLVSPLIISHEINQKSPFWEMSQAQLHQEEFE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 VVVILEGMVEATGMTCQARSSYMDTEVLWGHRFTPVLTLEKGFYEVDYNTFHDTYETNTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 VVVILEGMVEATGMTCQARSSYMDTEVLWGHRFTPVLTLEKGFYEVDYNTFHDTYETNTP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410         
pF1KB4 SCCAKELAEMKREGRLLQYLPSPPLLGGCAEAGLDAEAEQNEEDEPKGLGGSREARGSV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 SCCAKELAEMKREGRLLQYLPSPPLLGGCAEAGLDAEAEQNEEDEPKGLGGSREARGSV
              370       380       390       400       410         

>>CCDS42927.1 KCNJ6 gene_id:3763|Hs108|chr21              (423 aa)
 initn: 1943 init1: 1876 opt: 1975  Z-score: 2454.9  bits: 463.2 E(32554): 2e-130
Smith-Waterman score: 1975; 72.4% identity (86.7% similar) in 421 aa overlap (1-419:12-414)

                          10        20        30          40       
pF1KB4            MAGDSRNAMNQDMEIGVTPWDPKKIPKQARDYVP--IATDRTRLLAEGK
                  . :::   :.::.:  :.  .:: .:::::: .:  :. :::      :
CCDS42 MAKLTESMTNVLEGDS---MDQDVESPVAIHQPK-LPKQARDDLPRHISRDRT------K
               10           20        30         40              50

        50        60        70        80        90       100       
pF1KB4 KPRQRYMEKSGKCNVHHGNVQETYRYLSDLFTTLVDLKWRFNLLVFTMVYTVTWLFFGFI
       .  :::..:.::::::::::.::::::.:.::::::::::::::.:.:::::::::::.:
CCDS42 RKIQRYVRKDGKCNVHHGNVRETYRYLTDIFTTLVDLKWRFNLLIFVMVYTVTWLFFGMI
               60        70        80        90       100       110

       110       120       130       140       150       160       
pF1KB4 WWLIAYIRGDLDHVGDQEWIPCVENLSGFVSAFLFSIETETTIGYGFRVITEKCPEGIIL
       ::::::::::.::. :  : ::: ::.:::::::::::::::::::.::::.::::::::
CCDS42 WWLIAYIRGDMDHIEDPSWTPCVTNLNGFVSAFLFSIETETTIGYGYRVITDKCPEGIIL
              120       130       140       150       160       170

       170       180       190       200       210       220       
pF1KB4 LLVQAILGSIVNAFMVGCMFVKISQPKKRAETLMFSNNAVISMRDEKLCLMFRVGDLRNS
       ::.:..:::::::::::::::::::::::::::.::..::::::: ::::::::::::::
CCDS42 LLIQSVLGSIVNAFMVGCMFVKISQPKKRAETLVFSTHAVISMRDGKLCLMFRVGDLRNS
              180       190       200       210       220       230

       230       240       250       260       270       280       
pF1KB4 HIVEASIRAKLIKSRQTKEGEFIPLNQTDINVGFDTGDDRLFLVSPLIISHEINEKSPFW
       ::::::::::::::.::.:::::::::::::::. :::::::::::::::::::..::::
CCDS42 HIVEASIRAKLIKSKQTSEGEFIPLNQTDINVGYYTGDDRLFLVSPLIISHEINQQSPFW
              240       250       260       270       280       290

       290       300       310       320       330       340       
pF1KB4 EMSQAQLHQEEFEVVVILEGMVEATGMTCQARSSYMDTEVLWGHRFTPVLTLEKGFYEVD
       :.:.::: .::.:.:::::::::::::::::::::. .:.:::.::::::::: ::::::
CCDS42 EISKAQLPKEELEIVVILEGMVEATGMTCQARSSYITSEILWGYRFTPVLTLEDGFYEVD
              300       310       320       330       340       350

       350       360       370       380       390       400       
pF1KB4 YNTFHDTYETNTPSCCAKELAEMKREGRLLQYLPSPPLLGGCAEAGLDAEAEQNEEDEPK
       ::.::.::::.:::  ::::::.  ...    ::    :.  . . :. .:: . :.: :
CCDS42 YNSFHETYETSTPSLSAKELAELASRAE----LP----LSWSVSSKLNQHAELETEEEEK
              360       370           380           390       400  

       410                  
pF1KB4 GLGGSREARGSV         
       .:  . :  :.:         
CCDS42 NLEEQTERNGDVANLENESKV
            410       420   

>>CCDS1194.1 KCNJ9 gene_id:3765|Hs108|chr1                (393 aa)
 initn: 1719 init1: 1719 opt: 1727  Z-score: 2147.0  bits: 406.2 E(32554): 2.9e-113
Smith-Waterman score: 1727; 70.0% identity (86.6% similar) in 367 aa overlap (47-411:18-372)

         20        30        40        50        60        70      
pF1KB4 VTPWDPKKIPKQARDYVPIATDRTRLLAEGKKPRQRYMEKSGKCNVHHGNVQETYRYLSD
                                     .. ::::.::.:.:::..:::.::::::.:
CCDS11              MAQENAAFSPGQEEPPRRRGRQRYVEKDGRCNVQQGNVRETYRYLTD
                            10        20        30        40       

         80        90       100       110       120       130      
pF1KB4 LFTTLVDLKWRFNLLVFTMVYTVTWLFFGFIWWLIAYIRGDLDHVGDQEWIPCVENLSGF
       ::::::::.::..:: :...:..:::::: ::::::: ::::.:. :  : :::.::.::
CCDS11 LFTTLVDLQWRLSLLFFVLAYALTWLFFGAIWWLIAYGRGDLEHLEDTAWTPCVNNLNGF
        50        60        70        80        90       100       

        140       150       160       170       180       190      
pF1KB4 VSAFLFSIETETTIGYGFRVITEKCPEGIILLLVQAILGSIVNAFMVGCMFVKISQPKKR
       :.::::::::::::::: ::::..:::::.:::.::::::.::::::::::::::::.::
CCDS11 VAAFLFSIETETTIGYGHRVITDQCPEGIVLLLLQAILGSMVNAFMVGCMFVKISQPNKR
       110       120       130       140       150       160       

        200       210       220       230       240       250      
pF1KB4 AETLMFSNNAVISMRDEKLCLMFRVGDLRNSHIVEASIRAKLIKSRQTKEGEFIPLNQTD
       : ::.::..::.:.:: .:::::::::::.:::::::::::::.:::: :::::::.:::
CCDS11 AATLVFSSHAVVSLRDGRLCLMFRVGDLRSSHIVEASIRAKLIRSRQTLEGEFIPLHQTD
       170       180       190       200       210       220       

        260       270       280       290       300       310      
pF1KB4 INVGFDTGDDRLFLVSPLIISHEINEKSPFWEMSQAQLHQEEFEVVVILEGMVEATGMTC
       ..::::::::::::::::.:::::.  ::::: :.  :....::.:::::::::::::::
CCDS11 LSVGFDTGDDRLFLVSPLVISHEIDAASPFWEASRRALERDDFEIVVILEGMVEATGMTC
       230       240       250       260       270       280       

        320       330       340       350       360       370      
pF1KB4 QARSSYMDTEVLWGHRFTPVLTLEKGFYEVDYNTFHDTYETNTPSCCAKELAEM--KREG
       ::::::.  ::::::::: ::::: ::::::: .::.:.:. :::: :.::::   . ..
CCDS11 QARSSYLVDEVLWGHRFTSVLTLEDGFYEVDYASFHETFEVPTPSCSARELAEAAARLDA
       290       300       310       320       330       340       

          380       390       400       410                      
pF1KB4 RLLQYLPSPPLLGGCAEAGLDAEAEQNEEDEPKGLGGSREARGSV             
       .:   .::           :: ..:  ::   .: ::                     
CCDS11 HLYWSIPSR----------LDEKVE--EEGAGEGAGGEAGADKEQNGCLPPPESESKV
       350                 360         370       380       390   

>>CCDS2200.1 KCNJ3 gene_id:3760|Hs108|chr2                (501 aa)
 initn: 1399 init1: 1399 opt: 1501  Z-score: 1864.5  bits: 354.2 E(32554): 1.6e-97
Smith-Waterman score: 1508; 62.8% identity (83.0% similar) in 358 aa overlap (16-370:23-364)

                      10        20        30        40        50   
pF1KB4        MAGDSRNAMNQDMEIGVTPWDPKKIPKQARDYVPIATDRTRLLAEGKKPRQRY
                             :. :  : . :.:  . ::            :: :::.
CCDS22 MSALRRKFGDDYQVVTTSSSGSGLQPQGPGQDPQQ--QLVP------------KKKRQRF
               10        20        30                      40      

            60         70        80        90       100       110  
pF1KB4 MEKSGKCNVHHGNV-QETYRYLSDLFTTLVDLKWRFNLLVFTMVYTVTWLFFGFIWWLIA
       ..:.:.:::.:::. .:: ::::::::::::::::.::..: ..:::.:::.. .::.::
CCDS22 VDKNGRCNVQHGNLGSETSRYLSDLFTTLVDLKWRWNLFIFILTYTVAWLFMASMWWVIA
         50        60        70        80        90       100      

              120       130       140       150       160       170
pF1KB4 YIRGDLD--HVGDQEWIPCVENLSGFVSAFLFSIETETTIGYGFRVITEKCPEGIILLLV
       : ::::.  :::.  . ::: :. .: ::::: ::::.:::::.: ::.::::::::.: 
CCDS22 YTRGDLNKAHVGN--YTPCVANVYNFPSAFLFFIETEATIGYGYRYITDKCPEGIILFLF
        110         120       130       140       150       160    

              180       190       200       210       220       230
pF1KB4 QAILGSIVNAFMVGCMFVKISQPKKRAETLMFSNNAVISMRDEKLCLMFRVGDLRNSHIV
       :.::::::.::..::::.:.:::::::::::::..::::::: :: ::::::.:::::.:
CCDS22 QSILGSIVDAFLIGCMFIKMSQPKKRAETLMFSEHAVISMRDGKLTLMFRVGNLRNSHMV
          170       180       190       200       210       220    

              240       250       260       270       280       290
pF1KB4 EASIRAKLIKSRQTKEGEFIPLNQTDINVGFDTGDDRLFLVSPLIISHEINEKSPFWEMS
        :.:: ::.::::: ::::.::.: ...:::.:: :.::::::: : : :. ::::...:
CCDS22 SAQIRCKLLKSRQTPEGEFLPLDQLELDVGFSTGADQLFLVSPLTICHVIDAKSPFYDLS
          230       240       250       260       270       280    

              300       310       320       330       340       350
pF1KB4 QAQLHQEEFEVVVILEGMVEATGMTCQARSSYMDTEVLWGHRFTPVLTLEKGFYEVDYNT
       : ... :.::.::::::.::.::::::::.:: . :::::::: ::..::.::..:::. 
CCDS22 QRSMQTEQFEIVVILEGIVETTGMTCQARTSYTEDEVLWGHRFFPVISLEEGFFKVDYSQ
          290       300       310       320       330       340    

              360       370       380       390       400       410
pF1KB4 FHDTYETNTPSCCAKELAEMKREGRLLQYLPSPPLLGGCAEAGLDAEAEQNEEDEPKGLG
       :: :.:. ::   .::  ::                                        
CCDS22 FHATFEVPTPPYSVKEQEEMLLMSSPLIAPAITNSKERHNSVECLDGLDDITTKLPSKLQ
          350       360       370       380       390       400    

>>CCDS11219.1 KCNJ12 gene_id:3768|Hs108|chr17             (433 aa)
 initn: 1243 init1: 1203 opt: 1317  Z-score: 1636.7  bits: 311.9 E(32554): 7.6e-85
Smith-Waterman score: 1317; 52.5% identity (80.7% similar) in 373 aa overlap (47-417:40-403)

         20        30        40        50        60         70     
pF1KB4 VTPWDPKKIPKQARDYVPIATDRTRLLAEGKKPRQRYMEKSGKCNVHHGNVQE-TYRYLS
                                     .. :.:...:.:.::.. .:..: . :::.
CCDS11 YSIVSSEEDGLHLVTMSGANGFGNGKVHTRRRCRNRFVKKNGQCNIEFANMDEKSQRYLA
      10        20        30        40        50        60         

          80        90       100       110       120       130     
pF1KB4 DLFTTLVDLKWRFNLLVFTMVYTVTWLFFGFIWWLIAYIRGDLDHVGDQEWIPCVENLSG
       :.::: ::..::. ::.:.... ..::.::.:.:.::  .:::. .  .   ::: .. :
CCDS11 DMFTTCVDIRWRYMLLIFSLAFLASWLLFGIIFWVIAVAHGDLEPAEGRGRTPCVMQVHG
      70        80        90       100       110       120         

         140       150       160       170       180       190     
pF1KB4 FVSAFLFSIETETTIGYGFRVITEKCPEGIILLLVQAILGSIVNAFMVGCMFVKISQPKK
       :..::::::::.::::::.: .::.:: .......:.:.: :...::.: ...:...:::
CCDS11 FMAAFLFSIETQTTIGYGLRCVTEECPVAVFMVVAQSIVGCIIDSFMIGAIMAKMARPKK
     130       140       150       160       170       180         

         200       210       220       230       240       250     
pF1KB4 RAETLMFSNNAVISMRDEKLCLMFRVGDLRNSHIVEASIRAKLIKSRQTKEGEFIPLNQT
       ::.::.::.:::...:: :::::.:::.::.:::::: .::.::: : :.:::.:::.: 
CCDS11 RAQTLLFSHNAVVALRDGKLCLMWRVGNLRKSHIVEAHVRAQLIKPRVTEEGEYIPLDQI
     190       200       210       220       230       240         

         260       270       280       290       300       310     
pF1KB4 DINVGFDTGDDRLFLVSPLIISHEINEKSPFWEMSQAQLHQEEFEVVVILEGMVEATGMT
       ::.:::: : ::.:::::. : :::.: ::.. .:. .:. ..::.:::::::::::.::
CCDS11 DIDVGFDKGLDRIFLVSPITILHEIDEASPLFGISRQDLETDDFEIVVILEGMVEATAMT
     250       260       270       280       290       300         

         320       330       340       350        360       370    
pF1KB4 CQARSSYMDTEVLWGHRFTPVLTLEKGFYEVDYNTFHDTYET-NTPSCCAKELAEMKREG
        ::::::. .:.:::::: :::  ::. :..::. :: :::. .:: : ::.:.: :   
CCDS11 TQARSSYLANEILWGHRFEPVLFEEKNQYKIDYSHFHKTYEVPSTPRCSAKDLVENK---
     310       320       330       340       350       360         

          380       390       400       410                        
pF1KB4 RLLQYLPSPPLLGGCAEAGLDAEAEQNEEDEPKGLGGSREARGSV               
        .:  :::   .  : :  : :   ..::::  :   .:   :                 
CCDS11 -FL--LPSANSF--CYENEL-AFLSRDEEDEADGDQDGRSRDGLSPQARHDFDRLQAGGG
           370         380        390       400       410       420

CCDS11 VLEQRPYRRESEI
              430   

>>CCDS74015.1 KCNJ18 gene_id:100134444|Hs108|chr17        (433 aa)
 initn: 1228 init1: 1188 opt: 1300  Z-score: 1615.5  bits: 308.0 E(32554): 1.1e-83
Smith-Waterman score: 1300; 52.3% identity (79.9% similar) in 373 aa overlap (47-417:40-403)

         20        30        40        50        60         70     
pF1KB4 VTPWDPKKIPKQARDYVPIATDRTRLLAEGKKPRQRYMEKSGKCNVHHGNVQE-TYRYLS
                                     .. :.:...:.:.::.  .:..: . :::.
CCDS74 YSIVSLEEDGLHLVTMSGANGFGNGKVHTRRRCRNRFVKKNGQCNIAFANMDEKSQRYLA
      10        20        30        40        50        60         

          80        90       100       110       120       130     
pF1KB4 DLFTTLVDLKWRFNLLVFTMVYTVTWLFFGFIWWLIAYIRGDLDHVGDQEWIPCVENLSG
       :.::: ::..::. ::.:.... ..::.:: :.:.::  .:::. .  .   ::: .. :
CCDS74 DMFTTCVDIRWRYMLLIFSLAFLASWLLFGVIFWVIAVAHGDLEPAEGHGRTPCVMQVHG
      70        80        90       100       110       120         

         140       150       160       170       180       190     
pF1KB4 FVSAFLFSIETETTIGYGFRVITEKCPEGIILLLVQAILGSIVNAFMVGCMFVKISQPKK
       :..::::::::.::::::.: .::.:  .......:.:.: :...::.: ...:...:::
CCDS74 FMAAFLFSIETQTTIGYGLRCVTEECLVAVFMVVAQSIVGCIIDSFMIGAIMAKMARPKK
     130       140       150       160       170       180         

         200       210       220       230       240       250     
pF1KB4 RAETLMFSNNAVISMRDEKLCLMFRVGDLRNSHIVEASIRAKLIKSRQTKEGEFIPLNQT
       ::.::.::.:::...:: :::::.:::.::.:::::: .::.::: : :.:::.:::.: 
CCDS74 RAQTLLFSHNAVVALRDGKLCLMWRVGNLRKSHIVEAHVRAQLIKPRVTEEGEYIPLDQI
     190       200       210       220       230       240         

         260       270       280       290       300       310     
pF1KB4 DINVGFDTGDDRLFLVSPLIISHEINEKSPFWEMSQAQLHQEEFEVVVILEGMVEATGMT
       ::.:::: : ::.:::::. : :::.: ::.. .:. .:. ..::.:::::::::::.::
CCDS74 DIDVGFDKGLDRIFLVSPITILHEIDEASPLFGISRQDLETDDFEIVVILEGMVEATAMT
     250       260       270       280       290       300         

         320       330       340       350        360       370    
pF1KB4 CQARSSYMDTEVLWGHRFTPVLTLEKGFYEVDYNTFHDTYET-NTPSCCAKELAEMKREG
        ::::::. .:.:::::: :::  ::. :..::. :: :::. .:: : ::.:.: :   
CCDS74 TQARSSYLANEILWGHRFEPVLFEEKNQYKIDYSHFHKTYEVPSTPRCSAKDLVENK---
     310       320       330       340       350       360         

          380       390       400       410                        
pF1KB4 RLLQYLPSPPLLGGCAEAGLDAEAEQNEEDEPKGLGGSREARGSV               
        .:  :::   .  : :  : :   ..::::  :   .:   :                 
CCDS74 -FL--LPSANSF--CYENEL-AFLSRDEEDEADGDQDGRSRDGLSPQARHDFDRLQAGGG
           370         380        390       400       410       420

CCDS74 VLEQRPYRRGSEI
              430   

>>CCDS11688.1 KCNJ2 gene_id:3759|Hs108|chr17              (427 aa)
 initn: 1294 init1: 984 opt: 1297  Z-score: 1611.9  bits: 307.3 E(32554): 1.8e-83
Smith-Waterman score: 1297; 56.8% identity (85.5% similar) in 324 aa overlap (50-371:44-365)

      20        30        40        50        60        70         
pF1KB4 WDPKKIPKQARDYVPIATDRTRLLAEGKKPRQRYMEKSGKCNVHHGNVQET-YRYLSDLF
                                     :.:...:.:.:::.  :: :   :::.:.:
CCDS11 SEEDGMKLATMAVANGFGNGKSKVHTRQQCRSRFVKKDGHCNVQFINVGEKGQRYLADIF
            20        30        40        50        60        70   

       80        90       100       110       120       130        
pF1KB4 TTLVDLKWRFNLLVFTMVYTVTWLFFGFIWWLIAYIRGDLDHVGDQEWIPCVENLSGFVS
       :: ::..::. :..: ......::::: ..:::: ..::::  ...:   :: ....:..
CCDS11 TTCVDIRWRWMLVIFCLAFVLSWLFFGCVFWLIALLHGDLD--ASKEGKACVSEVNSFTA
            80        90       100       110         120       130 

      140       150       160       170       180       190        
pF1KB4 AFLFSIETETTIGYGFRVITEKCPEGIILLLVQAILGSIVNAFMVGCMFVKISQPKKRAE
       ::::::::.:::::::: .:..:: ...... :.:.: :..::..: ...:...:::: :
CCDS11 AFLFSIETQTTIGYGFRCVTDECPIAVFMVVFQSIVGCIIDAFIIGAVMAKMAKPKKRNE
             140       150       160       170       180       190 

      200       210       220       230       240       250        
pF1KB4 TLMFSNNAVISMRDEKLCLMFRVGDLRNSHIVEASIRAKLIKSRQTKEGEFIPLNQTDIN
       ::.::.::::.::: :::::.:::.::.::.::: .::.:.::: :.:::.:::.: :::
CCDS11 TLVFSHNAVIAMRDGKLCLMWRVGNLRKSHLVEAHVRAQLLKSRITSEGEYIPLDQIDIN
             200       210       220       230       240       250 

      260       270       280       290       300       310        
pF1KB4 VGFDTGDDRLFLVSPLIISHEINEKSPFWEMSQAQLHQEEFEVVVILEGMVEATGMTCQA
       ::::.: ::.:::::. : :::.: ::....:. .. . .::.:::::::::::.:: : 
CCDS11 VGFDSGIDRIFLVSPITIVHEIDEDSPLYDLSKQDIDNADFEIVVILEGMVEATAMTTQC
             260       270       280       290       300       310 

      320       330       340       350        360       370       
pF1KB4 RSSYMDTEVLWGHRFTPVLTLEKGFYEVDYNTFHDTYET-NTPSCCAKELAEMKREGRLL
       ::::. .:.:::::. :::  :: .:.:::. :: :::. ::: : :..::: :      
CCDS11 RSSYLANEILWGHRYEPVLFEEKHYYKVDYSRFHKTYEVPNTPLCSARDLAEKKYILSNA
             320       330       340       350       360       370 

       380       390       400       410                       
pF1KB4 QYLPSPPLLGGCAEAGLDAEAEQNEEDEPKGLGGSREARGSV              
                                                               
CCDS11 NSFCYENEVALTSKEEDDSENGVPESTSTDTPPDIDLHNQASVPLEPRPLRRESEI
             380       390       400       410       420       

>>CCDS12721.1 KCNJ14 gene_id:3770|Hs108|chr19             (436 aa)
 initn: 1156 init1: 914 opt: 1193  Z-score: 1482.5  bits: 283.4 E(32554): 3e-76
Smith-Waterman score: 1196; 45.4% identity (72.5% similar) in 425 aa overlap (2-418:16-420)

                             10          20        30        40    
pF1KB4               MAGDSRNAMNQDMEIGV--TPWDPKKIPKQARDYVPIATDRTRLLA
                      .:::: . ...   :.  . : :   : :.    :.         
CCDS12 MGLARALRRLSGALDSGDSRAGDEEEAGPGLCRNGWAPA--PVQS----PV---------
               10        20        30          40                  

           50        60         70        80        90       100   
pF1KB4 EGKKPRQRYMEKSGKCNVHHGNVQ-ETYRYLSDLFTTLVDLKWRFNLLVFTMVYTVTWLF
        :.. : :...:.:.:::.  :.  .  ::::::::: ::..::.  :.:.  . ..::.
CCDS12 -GRR-RGRFVKKDGHCNVRFVNLGGQGARYLSDLFTTCVDVRWRWMCLLFSCSFLASWLL
            50        60        70        80        90       100   

           110       120       130       140       150       160   
pF1KB4 FGFIWWLIAYIRGDLDHVGDQEWIPCVENLSGFVSAFLFSIETETTIGYGFRVITEKCPE
       ::. .:::: ..:::  ..     ::  ....:..::::..::.:.:::: : .::.:: 
CCDS12 FGLAFWLIASLHGDL--AAPPPPAPCFSHVASFLAAFLFALETQTSIGYGVRSVTEECPA
           110         120       130       140       150       160 

           170       180       190       200       210       220   
pF1KB4 GIILLLVQAILGSIVNAFMVGCMFVKISQPKKRAETLMFSNNAVISMRDEKLCLMFRVGD
       ..  ...: : : ...::.:: ...:...:::: :::.::.:::...::..::::.:::.
CCDS12 AVAAVVLQCIAGCVLDAFVVGAVMAKMAKPKKRNETLVFSENAVVALRDHRLCLMWRVGN
             170       180       190       200       210       220 

           230       240       250       260       270       280   
pF1KB4 LRNSHIVEASIRAKLIKSRQTKEGEFIPLNQTDINVGFDTGDDRLFLVSPLIISHEINEK
       :: ::.::: .::.:.. : : :::.:::.. :..:::: : ::.:::::. : :::.  
CCDS12 LRRSHLVEAHVRAQLLQPRVTPEGEYIPLDHQDVDVGFDGGTDRIFLVSPITIVHEIDSA
             230       240       250       260       270       280 

           290       300       310       320       330       340   
pF1KB4 SPFWEMSQAQLHQEEFEVVVILEGMVEATGMTCQARSSYMDTEVLWGHRFTPVLTLEKGF
       ::..:...:.: . .::.:::::::::::.:: : ::::.  :.:::::: :::  . . 
CCDS12 SPLYELGRAELARADFELVVILEGMVEATAMTTQCRSSYLPGELLWGHRFEPVLFQRGSQ
             290       300       310       320       330       340 

           350        360       370         380       390          
pF1KB4 YEVDYNTFHDTYET-NTPSCCAKELAEMKREGR--LLQYLPSPPLLGGCAEA--GLDAEA
       :::::  :: :::. .:: : :::: :  ...   : . .:.  : . : :   .:.   
CCDS12 YEVDYRHFHRTYEVPGTPVCSAKELDERAEQASHSLKSSFPGS-LTAFCYENELALSCCQ
             350       360       370       380        390       400

      400       410                        
pF1KB4 EQNEEDEPKGLGGSREARGSV               
       :..:.:: .  .: .   :.                
CCDS12 EEDEDDETEEGNGVETEDGAASPRVLTPTLALTLPP
              410       420       430      

>>CCDS8692.1 KCNJ8 gene_id:3764|Hs108|chr12               (424 aa)
 initn: 1152 init1: 861 opt: 1138  Z-score: 1414.3  bits: 270.7 E(32554): 1.9e-72
Smith-Waterman score: 1138; 47.8% identity (77.1% similar) in 345 aa overlap (49-385:32-374)

       20        30        40        50        60        70        
pF1KB4 PWDPKKIPKQARDYVPIATDRTRLLAEGKKPRQRYMEKSGKCNVHHGNVQETYRYLSDLF
                                     :. :.. ::: ::. : :..:  :.:.:.:
CCDS86 LARKSIIPEEYVLARIAAENLRKPRIRDRLPKARFIAKSGACNLAHKNIREQGRFLQDIF
              10        20        30        40        50        60 

       80        90       100       110           120           130
pF1KB4 TTLVDLKWRFNLLVFTMVYTVTWLFFGFIWWLIAYIRGD----LDHVGDQ----EWIPCV
       ::::::::: .:..::: .  .::.:...:::.:. .::    ... : .    :   ::
CCDS86 TTLVDLKWRHTLVIFTMSFLCSWLLFAIMWWLVAFAHGDIYAYMEKSGMEKSGLESTVCV
              70        80        90       100       110       120 

              140       150       160       170       180       190
pF1KB4 ENLSGFVSAFLFSIETETTIGYGFRVITEKCPEGIILLLVQAILGSIVNAFMVGCMFVKI
        :. .:.::::::::...:::.: :..::.:: .: .:..: :.: :.:: :.::.:.: 
CCDS86 TNVRSFTSAFLFSIEVQVTIGFGGRMMTEECPLAITVLILQNIVGLIINAVMLGCIFMKT
             130       140       150       160       170       180 

              200       210       220       230       240       250
pF1KB4 SQPKKRAETLMFSNNAVISMRDEKLCLMFRVGDLRNSHIVEASIRAKLIKSRQTKEGEFI
       .: ..:::::.:: .:::..:. :::.::::::::.: :. ::.: ...:.  : ::: .
CCDS86 AQAHRRAETLIFSRHAVIAVRNGKLCFMFRVGDLRKSMIISASVRIQVVKKTTTPEGEVV
             190       200       210       220       230       240 

              260       270       280       290       300       310
pF1KB4 PLNQTDINVGFDTGDDRLFLVSPLIISHEINEKSPFWEMSQAQLHQEEFEVVVILEGMVE
       :..: :: :     .. .:::.:::: : :...::....: ..: ....::.:::::.::
CCDS86 PIHQLDIPVDNPIESNNIFLVAPLIICHVIDKRSPLYDISATDLANQDLEVIVILEGVVE
             250       260       270       280       290       300 

              320       330       340       350       360       370
pF1KB4 ATGMTCQARSSYMDTEVLWGHRFTPVLTLEKGFYEVDYNTFHDTYETNTPSCCAKELAEM
       .::.: :::.::.  :. :::::. ..: :.: : :::. : .: .. .: : :.:: : 
CCDS86 TTGITTQARTSYIAEEIQWGHRFVSIVTEEEGVYSVDYSKFGNTVKVAAPRCSARELDE-
             310       320       330       340       350       360 

              380       390       400       410                    
pF1KB4 KREGRLLQYLPSPPLLGGCAEAGLDAEAEQNEEDEPKGLGGSREARGSV           
        . . :.: : .  :                                             
CCDS86 -KPSILIQTLQKSELSHQNSLRKRNSMRRNNSMRRNNSIRRNNSSLMVPKVQFMTPEGNQ
               370       380       390       400       410         

>>CCDS31436.1 KCNJ11 gene_id:3767|Hs108|chr11             (390 aa)
 initn: 1023 init1: 590 opt: 1127  Z-score: 1401.2  bits: 268.2 E(32554): 1e-71
Smith-Waterman score: 1127; 47.5% identity (79.2% similar) in 337 aa overlap (35-369:17-351)

           10        20        30        40        50        60    
pF1KB4 SRNAMNQDMEIGVTPWDPKKIPKQARDYVPIATDRTRLLAEGKKPRQRYMEKSGKCNVHH
                                     .: : ..   .... : :.. :.:.::: :
CCDS31               MLSRKGIIPEEYVLTRLAEDPAKPRYRARQRRARFVSKKGNCNVAH
                             10        20        30        40      

           70        80        90       100       110        120   
pF1KB4 GNVQETYRYLSDLFTTLVDLKWRFNLLVFTMVYTVTWLFFGFIWWLIAYIRGDL-DHVGD
        :..:  :.:.:.:::::::::  .::.::: .  .::.:.. :::::. .:::    : 
CCDS31 KNIREQGRFLQDVFTTLVDLKWPHTLLIFTMSFLCSWLLFAMAWWLIAFAHGDLAPSEGT
         50        60        70        80        90       100      

           130       140       150       160       170       180   
pF1KB4 QEWIPCVENLSGFVSAFLFSIETETTIGYGFRVITEKCPEGIILLLVQAILGSIVNAFMV
        :  ::: .. .: ::::::::...:::.: :..::.:: .:..:.:: :.: ..::.:.
CCDS31 AE--PCVTSIHSFSSAFLFSIEVQVTIGFGGRMVTEECPLAILILIVQNIVGLMINAIML
          110       120       130       140       150       160    

           190       200       210       220       230       240   
pF1KB4 GCMFVKISQPKKRAETLMFSNNAVISMRDEKLCLMFRVGDLRNSHIVEASIRAKLIKSRQ
       ::.:.: .: ..:::::.::..:::..:  .::.:.::::::.: :. :.:. .....  
CCDS31 GCIFMKTAQAHRRAETLIFSKHAVIALRHGRLCFMLRVGDLRKSMIISATIHMQVVRKTT
          170       180       190       200       210       220    

           250       260       270       280       290        300  
pF1KB4 TKEGEFIPLNQTDINVGFDTGDDRLFLVSPLIISHEINEKSPFWEMSQAQLHQ-EEFEVV
       . ::: .::.:.:: .   .: . .:::.:::: : :. .::..... ..::. ...:..
CCDS31 SPEGEVVPLHQVDIPMENGVGGNSIFLVAPLIIYHVIDANSPLYDLAPSDLHHHQDLEII
          230       240       250       260       270       280    

            310       320       330       340       350       360  
pF1KB4 VILEGMVEATGMTCQARSSYMDTEVLWGHRFTPVLTLEKGFYEVDYNTFHDTYETNTPSC
       :::::.::.::.: :::.::.  :.:::.::.:... : : : :::. : .: .. :: :
CCDS31 VILEGVVETTGITTQARTSYLADEILWGQRFVPIVAEEDGRYSVDYSKFGNTVKVPTPLC
          290       300       310       320       330       340    

            370       380       390       400       410         
pF1KB4 CAKELAEMKREGRLLQYLPSPPLLGGCAEAGLDAEAEQNEEDEPKGLGGSREARGSV
        :..: :                                                  
CCDS31 TARQLDEDHSLLEALTLASARGPLRKRSVPMAKAKPKFSISPDSLS           
          350       360       370       380       390           




419 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 15:31:56 2016 done: Thu Nov  3 15:31:56 2016
 Total Scan time:  2.630 Total Display time:  0.040

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com