Result of FASTA (ccds) for pF1KB4700
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB4700, 906 aa
  1>>>pF1KB4700 906 - 906 aa - 906 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0834+/-0.000986; mu= 17.5752+/- 0.060
 mean_var=87.4716+/-17.251, 0's: 0 Z-trim(106.2): 196  B-trim: 89 in 1/50
 Lambda= 0.137133
 statistics sampled from 8625 (8823) to 8625 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.627), E-opt: 0.2 (0.271), width:  16
 Scan time:  4.210

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS11891.1 CDH2 gene_id:1000|Hs108|chr18          ( 906) 6041 1205.8       0
CCDS77172.1 CDH2 gene_id:1000|Hs108|chr18          ( 875) 5686 1135.6       0
CCDS58784.1 CDH4 gene_id:1002|Hs108|chr20          ( 842) 3883 778.9       0
CCDS13488.1 CDH4 gene_id:1002|Hs108|chr20          ( 916) 3883 778.9       0
CCDS10976.1 CDH15 gene_id:1013|Hs108|chr16         ( 814) 2061 418.4 2.7e-116
CCDS10869.1 CDH1 gene_id:999|Hs108|chr16           ( 882) 1804 367.6 5.8e-101
CCDS58486.1 CDH13 gene_id:1012|Hs108|chr16         ( 713) 1685 344.0 5.9e-94
CCDS58485.1 CDH13 gene_id:1012|Hs108|chr16         ( 760) 1685 344.0 6.2e-94
CCDS58487.1 CDH13 gene_id:1012|Hs108|chr16         ( 674) 1588 324.8 3.4e-88
CCDS82004.1 CDH3 gene_id:1001|Hs108|chr16          ( 784) 1495 306.4 1.3e-82
CCDS10868.1 CDH3 gene_id:1001|Hs108|chr16          ( 829) 1495 306.4 1.4e-82
CCDS10803.1 CDH11 gene_id:1009|Hs108|chr16         ( 796) 1401 287.8 5.3e-77
CCDS11977.1 CDH20 gene_id:28316|Hs108|chr18        ( 801) 1344 276.6 1.3e-73
CCDS11893.1 DSC2 gene_id:1824|Hs108|chr18          ( 847) 1344 276.6 1.4e-73
CCDS11892.1 DSC2 gene_id:1824|Hs108|chr18          ( 901) 1344 276.6 1.5e-73
CCDS32810.1 DSC3 gene_id:1825|Hs108|chr18          ( 896) 1340 275.8 2.5e-73
CCDS81992.1 CDH11 gene_id:1009|Hs108|chr16         ( 670) 1322 272.2 2.3e-72
CCDS11895.1 DSC1 gene_id:1823|Hs108|chr18          ( 840) 1300 267.9 5.7e-71
CCDS11894.1 DSC1 gene_id:1823|Hs108|chr18          ( 894) 1300 267.9   6e-71
CCDS13485.1 CDH26 gene_id:60437|Hs108|chr20        ( 832) 1250 258.0 5.4e-68
CCDS42423.1 DSG2 gene_id:1829|Hs108|chr18          (1118) 1177 243.6 1.5e-63
CCDS11993.1 CDH7 gene_id:1005|Hs108|chr18          ( 785) 1169 241.9 3.4e-63
CCDS10802.1 CDH8 gene_id:1006|Hs108|chr16          ( 799) 1153 238.8 3.1e-62
CCDS3894.1 CDH6 gene_id:1004|Hs108|chr5            ( 790) 1123 232.8 1.9e-60
CCDS3890.1 CDH12 gene_id:1010|Hs108|chr5           ( 794) 1123 232.8 1.9e-60
CCDS3893.1 CDH9 gene_id:1007|Hs108|chr5            ( 789) 1108 229.9 1.5e-59
CCDS82991.1 CDH12 gene_id:1010|Hs108|chr5          ( 754) 1106 229.5 1.9e-59
CCDS11897.1 DSG4 gene_id:147409|Hs108|chr18        (1040) 1067 221.8 5.2e-57
CCDS45845.1 DSG4 gene_id:147409|Hs108|chr18        (1059) 1067 221.8 5.2e-57
CCDS82005.1 CDH1 gene_id:999|Hs108|chr16           ( 821) 1046 217.6 7.5e-56
CCDS11898.1 DSG3 gene_id:1830|Hs108|chr18          ( 999) 1045 217.5   1e-55
CCDS3889.1 CDH18 gene_id:1016|Hs108|chr5           ( 790) 1035 215.4 3.3e-55
CCDS10804.1 CDH5 gene_id:1003|Hs108|chr16          ( 784) 1013 211.1 6.7e-54
CCDS82259.1 CDH7 gene_id:1005|Hs108|chr18          ( 630)  995 207.5 6.6e-53
CCDS81993.1 CDH11 gene_id:1009|Hs108|chr16         ( 693)  994 207.3 8.2e-53
CCDS9586.1 CDH24 gene_id:64403|Hs108|chr14         ( 781)  969 202.4 2.8e-51
CCDS11896.1 DSG1 gene_id:1828|Hs108|chr18          (1049)  848 178.5 5.7e-44
CCDS3892.1 CDH10 gene_id:1008|Hs108|chr5           ( 788)  778 164.6 6.7e-40
CCDS54835.1 CDH18 gene_id:1016|Hs108|chr5          ( 574)  755 160.0 1.2e-38
CCDS75229.1 CDH18 gene_id:1016|Hs108|chr5          ( 575)  755 160.0 1.2e-38
CCDS58472.1 CDH16 gene_id:1014|Hs108|chr16         ( 732)  682 145.6 3.3e-34
CCDS9585.1 CDH24 gene_id:64403|Hs108|chr14         ( 819)  581 125.6 3.7e-28
CCDS11994.1 CDH19 gene_id:28513|Hs108|chr18        ( 772)  555 120.5 1.3e-26
CCDS59325.1 CDH19 gene_id:28513|Hs108|chr18        ( 490)  506 110.7 7.1e-24
CCDS31986.1 PCDH17 gene_id:27253|Hs108|chr13       (1159)  503 110.3 2.2e-23
CCDS47177.1 FAT1 gene_id:2195|Hs108|chr4           (4588)  437 97.5 5.9e-19
CCDS6260.1 CDH17 gene_id:1015|Hs108|chr8           ( 832)  382 86.2 2.7e-16
CCDS58471.1 CDH16 gene_id:1014|Hs108|chr16         ( 790)  371 84.1 1.2e-15
CCDS56002.1 CDH16 gene_id:1014|Hs108|chr16         ( 807)  371 84.1 1.2e-15
CCDS10823.1 CDH16 gene_id:1014|Hs108|chr16         ( 829)  371 84.1 1.2e-15


>>CCDS11891.1 CDH2 gene_id:1000|Hs108|chr18               (906 aa)
 initn: 6041 init1: 6041 opt: 6041  Z-score: 6456.2  bits: 1205.8 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6041; 100.0% identity (100.0% similar) in 906 aa overlap (1-906:1-906)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MCRIAGALRTLLPLLAALLQASVEASGEIALCKTGFPEDVYSAVLSKDVHEGQPLLNVKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MCRIAGALRTLLPLLAALLQASVEASGEIALCKTGFPEDVYSAVLSKDVHEGQPLLNVKF
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 SNCNGKRKVQYESSEPADFKVDEDGMVYAVRSFPLSSEHAKFLIYAQDKETQEKWQVAVK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SNCNGKRKVQYESSEPADFKVDEDGMVYAVRSFPLSSEHAKFLIYAQDKETQEKWQVAVK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 LSLKPTLTEESVKESAEVEEIVFPRQFSKHSGHLQRQKRDWVIPPINLPENSRGPFPQEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LSLKPTLTEESVKESAEVEEIVFPRQFSKHSGHLQRQKRDWVIPPINLPENSRGPFPQEL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 VRIRSDRDKNLSLRYSVTGPGADQPPTGIFIINPISGQLSVTKPLDREQIARFHLRAHAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VRIRSDRDKNLSLRYSVTGPGADQPPTGIFIINPISGQLSVTKPLDREQIARFHLRAHAV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 DINGNQVENPIDIVINVIDMNDNRPEFLHQVWNGTVPEGSKPGTYVMTVTAIDADDPNAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DINGNQVENPIDIVINVIDMNDNRPEFLHQVWNGTVPEGSKPGTYVMTVTAIDADDPNAL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 NGMLRYRIVSQAPSTPSPNMFTINNETGDIITVAAGLDREKVQQYTLIIQATDMEGNPTY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NGMLRYRIVSQAPSTPSPNMFTINNETGDIITVAAGLDREKVQQYTLIIQATDMEGNPTY
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 GLSNTATAVITVTDVNDNPPEFTAMTFYGEVPENRVDIIVANLTVTDKDQPHTPAWNAVY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GLSNTATAVITVTDVNDNPPEFTAMTFYGEVPENRVDIIVANLTVTDKDQPHTPAWNAVY
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB4 RISGGDPTGRFAIQTDPNSNDGLVTVVKPIDFETNRMFVLTVAAENQVPLAKGIQHPPQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RISGGDPTGRFAIQTDPNSNDGLVTVVKPIDFETNRMFVLTVAAENQVPLAKGIQHPPQS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB4 TATVSVTVIDVNENPYFAPNPKIIRQEEGLHAGTMLTTFTAQDPDRYMQQNIRYTKLSDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TATVSVTVIDVNENPYFAPNPKIIRQEEGLHAGTMLTTFTAQDPDRYMQQNIRYTKLSDP
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB4 ANWLKIDPVNGQITTIAVLDRESPNVKNNIYNATFLASDNGIPPMSGTGTLQIYLLDIND
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ANWLKIDPVNGQITTIAVLDRESPNVKNNIYNATFLASDNGIPPMSGTGTLQIYLLDIND
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB4 NAPQVLPQEAETCETPDPNSINITALDYDIDPNAGPFAFDLPLSPVTIKRNWTITRLNGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NAPQVLPQEAETCETPDPNSINITALDYDIDPNAGPFAFDLPLSPVTIKRNWTITRLNGD
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB4 FAQLNLKIKFLEAGIYEVPIIITDSGNPPKSNISILRVKVCQCDSNGDCTDVDRIVGAGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FAQLNLKIKFLEAGIYEVPIIITDSGNPPKSNISILRVKVCQCDSNGDCTDVDRIVGAGL
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB4 GTGAIIAILLCIIILLILVLMFVVWMKRRDKERQAKQLLIDPEDDVRDNILKYDEEGGGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GTGAIIAILLCIIILLILVLMFVVWMKRRDKERQAKQLLIDPEDDVRDNILKYDEEGGGE
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB4 EDQDYDLSQLQQPDTVEPDAIKPVGIRRMDERPIHAEPQYPVRSAAPHPGDIGDFINEGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EDQDYDLSQLQQPDTVEPDAIKPVGIRRMDERPIHAEPQYPVRSAAPHPGDIGDFINEGL
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB4 KAADNDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSTAGSLSSLNSSSSGGEQDYDYLNDWGPRFKKLADM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KAADNDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSTAGSLSSLNSSSSGGEQDYDYLNDWGPRFKKLADM
              850       860       870       880       890       900

             
pF1KB4 YGGGDD
       ::::::
CCDS11 YGGGDD
             

>>CCDS77172.1 CDH2 gene_id:1000|Hs108|chr18               (875 aa)
 initn: 5685 init1: 5685 opt: 5686  Z-score: 6076.9  bits: 1135.6 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5686; 99.1% identity (99.4% similar) in 860 aa overlap (47-906:16-875)

         20        30        40        50        60        70      
pF1KB4 ALLQASVEASGEIALCKTGFPEDVYSAVLSKDVHEGQPLLNVKFSNCNGKRKVQYESSEP
                                     :.  :   .:.:::::::::::::::::::
CCDS77                MFLLRRYVCIFTEKLKNQAELYVFLSVKFSNCNGKRKVQYESSEP
                              10        20        30        40     

         80        90       100       110       120       130      
pF1KB4 ADFKVDEDGMVYAVRSFPLSSEHAKFLIYAQDKETQEKWQVAVKLSLKPTLTEESVKESA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 ADFKVDEDGMVYAVRSFPLSSEHAKFLIYAQDKETQEKWQVAVKLSLKPTLTEESVKESA
          50        60        70        80        90       100     

        140       150       160       170       180       190      
pF1KB4 EVEEIVFPRQFSKHSGHLQRQKRDWVIPPINLPENSRGPFPQELVRIRSDRDKNLSLRYS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 EVEEIVFPRQFSKHSGHLQRQKRDWVIPPINLPENSRGPFPQELVRIRSDRDKNLSLRYS
         110       120       130       140       150       160     

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CCDS77 EPDAIKPVGIRRMDERPIHAEPQYPVRSAAPHPGDIGDFINEGLKAADNDPTAPPYDSLL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 VFDYEGSGSTAGSLSSLNSSSSGGEQDYDYLNDWGPRFKKLADMYGGGDD
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>>CCDS58784.1 CDH4 gene_id:1002|Hs108|chr20               (842 aa)
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CCDS58                              MDFKVGADGTVFATRELQVPSEQVAFTVTAW
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       :..: :::...:.: .  : . .: ..  . ...:            .:    .... :.
CCDS58 DSQTAEKWDAVVRLLVAQTSSPHSGHKPQKGKKVVALDPSPPPKDTLLPWPQHQNANGLR
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pF1KB4 RQKRDWVIPPINLPENSRGPFPQELVRIRSDRDKNLSLRYSVTGPGADQPPTGIFIINPI
       :.::::::::::.::::::::::.:::::::.:... .:::.:: ::::::  .: :. .
CCDS58 RRKRDWVIPPINVPENSRGPFPQQLVRIRSDKDNDIPIRYSITGVGADQPPMEVFSIDSM
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       ::.. ::.:.:::. : .::::::::.:::.::::::. : :::::::::::..::.::.
CCDS58 SGRMYVTRPMDREEHASYHLRAHAVDMNGNKVENPIDLYIYVIDMNDNRPEFINQVYNGS
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       : :::::::::::::: :::: .. :::.:::::.:.:..:: ::::::.:::::.::::
CCDS58 VDEGSKPGTYVMTVTANDADDSTTANGMVRYRIVTQTPQSPSQNMFTINSETGDIVTVAA
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       :::::::::::.:.:::::::: .:::::::::.::::::::::::::: :: :::::::
CCDS58 GLDREKVQQYTVIVQATDMEGNLNYGLSNTATAIITVTDVNDNPPEFTASTFAGEVPENR
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pF1KB4 VDIIVANLTVTDKDQPHTPAWNAVYRISGGDPTGRFAIQTDPNSNDGLVTVVKPIDFETN
       :. .:::::: :.::::.: ::::::: .:::.:.:...::: .:.:.::::: .:.: :
CCDS58 VETVVANLTVMDRDQPHSPNWNAVYRIISGDPSGHFSVRTDPVTNEGMVTVVKAVDYELN
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pF1KB4 RMFVLTVAAENQVPLAKGIQHPPQSTATVSVTVIDVNENPYFAPNPKIIRQEEGLHAGTM
       : :.::: . ::.:::.:::   :::: :.....:.:: :::  : :.:: :::.  ::.
CCDS58 RAFMLTVMVSNQAPLASGIQMSFQSTAGVTISIMDINEAPYFPSNHKLIRLEEGVPPGTV
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pF1KB4 LTTFTAQDPDRYMQQNIRYTKLSDPANWLKIDPVNGQITTIAVLDRESPNVKNNIYNATF
       ::::.: ::::.::: .::.::::::.::.:. .:::::: :::::::  .:::.:.:::
CCDS58 LTTFSAVDPDRFMQQAVRYSKLSDPASWLHINATNGQITTAAVLDRESLYTKNNVYEATF
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pF1KB4 LASDNGIPPMSGTGTLQIYLLDINDNAPQVLPQEAETCETPDPNSINITALDYDIDPNAG
       ::.:::::: ::::::::::.:::::::..::.::. :: :. :.::::: : :.::: :
CCDS58 LAADNGIPPASGTGTLQIYLIDINDNAPELLPKEAQICEKPNLNAINITAADADVDPNIG
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pF1KB4 PFAFDLPLSPVTIKRNWTITRLNGDFAQLNLKIKFLEAGIYEVPIIITDSGNPPKSNISI
       :..:.::. :.....::::::::::.:::.:.: .::::.:.::::.::::::: :: ::
CCDS58 PYVFELPFVPAAVRKNWTITRLNGDYAQLSLRILYLEAGMYDVPIIVTDSGNPPLSNTSI
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pF1KB4 LRVKVCQCDSNGDCTDVDRIVGAGLGTGAIIAILLCIIILLILVLMFVVWMKRRDKERQA
       ..:::: ::.::::: .  ...::::::::.:::.::.::: .::.::.:::::.:::..
CCDS58 IKVKVCPCDDNGDCTTIGAVAAAGLGTGAIVAILICILILLTMVLLFVMWMKRREKERHT
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pF1KB4 KQLLIDPEDDVRDNILKYDEEGGGEEDQDYDLSQLQQPDTVEPDAIKPVGIRRMDERPIH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::...     :  :.::.::::. 
CCDS58 KQLLIDPEDDVRDNILKYDEEGGGEEDQDYDLSQLQQPEAMGHVPSKAPGVRRVDERPVG
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pF1KB4 AEPQYPVRSAAPHPGDIGDFINEGLKAADNDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSTAGSLSSLNS
       ::::::.:  .::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS58 AEPQYPIRPMVPHPGDIGDFINEGLRAADNDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSTAGSVSSLNS
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pF1KB4 SSSGGEQDYDYLNDWGPRFKKLADMYGGGDD 
       :::: .:::::::::::::::::::::::.. 
CCDS58 SSSG-DQDYDYLNDWGPRFKKLADMYGGGEED
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>>CCDS13488.1 CDH4 gene_id:1002|Hs108|chr20               (916 aa)
 initn: 4184 init1: 3709 opt: 3883  Z-score: 4148.8  bits: 778.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4158; 66.1% identity (85.3% similar) in 914 aa overlap (5-906:5-915)

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pF1KB4 MCRIAGALRTLLPLLAALLQASVEASGEIALCKTGFPEDVYSAVLSKDVHEGQPLLNVKF
           ::.:  :: : .:: .:  :       ::.:: :: :.:..:... ::. ::.:::
CCDS13 MTAGAGVLLLLLSLSGAL-RAHNEDLTTRETCKAGFSEDDYTALISQNILEGEKLLQVKF
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pF1KB4 SNCNGKRKVQYESSEPADFKVDEDGMVYAVRSFPLSSEHAKFLIYAQDKETQEKWQVAVK
       :.: : . .:::..   ::::  :: :.:.: . . ::.. : . : :..: :::...:.
CCDS13 SSCVGTKGTQYETNS-MDFKVGADGTVFATRELQVPSEQVAFTVTAWDSQTAEKWDAVVR
      60        70         80        90       100       110        

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pF1KB4 LSLKPTLTEESVKESAEVEEIV------------FPRQFSKHSGHLQRQKRDWVIPPINL
       : .  : . .: ..  . ...:            .:    .... :.:.::::::::::.
CCDS13 LLVAQTSSPHSGHKPQKGKKVVALDPSPPPKDTLLPWPQHQNANGLRRRKRDWVIPPINV
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pF1KB4 PENSRGPFPQELVRIRSDRDKNLSLRYSVTGPGADQPPTGIFIINPISGQLSVTKPLDRE
       ::::::::::.:::::::.:... .:::.:: ::::::  .: :. .::.. ::.:.:::
CCDS13 PENSRGPFPQQLVRIRSDKDNDIPIRYSITGVGADQPPMEVFSIDSMSGRMYVTRPMDRE
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pF1KB4 QIARFHLRAHAVDINGNQVENPIDIVINVIDMNDNRPEFLHQVWNGTVPEGSKPGTYVMT
       . : .::::::::.:::.::::::. : :::::::::::..::.::.: :::::::::::
CCDS13 EHASYHLRAHAVDMNGNKVENPIDLYIYVIDMNDNRPEFINQVYNGSVDEGSKPGTYVMT
      240       250       260       270       280       290        

      290       300       310       320       330       340        
pF1KB4 VTAIDADDPNALNGMLRYRIVSQAPSTPSPNMFTINNETGDIITVAAGLDREKVQQYTLI
       ::: :::: .. :::.:::::.:.:..:: ::::::.:::::.:::::::::::::::.:
CCDS13 VTANDADDSTTANGMVRYRIVTQTPQSPSQNMFTINSETGDIVTVAAGLDREKVQQYTVI
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pF1KB4 IQATDMEGNPTYGLSNTATAVITVTDVNDNPPEFTAMTFYGEVPENRVDIIVANLTVTDK
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CCDS13 VQATDMEGNLNYGLSNTATAIITVTDVNDNPPEFTASTFAGEVPENRVETVVANLTVMDR
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pF1KB4 DQPHTPAWNAVYRISGGDPTGRFAIQTDPNSNDGLVTVVKPIDFETNRMFVLTVAAENQV
       ::::.: ::::::: .:::.:.:...::: .:.:.::::: .:.: :: :.::: . ::.
CCDS13 DQPHSPNWNAVYRIISGDPSGHFSVRTDPVTNEGMVTVVKAVDYELNRAFMLTVMVSNQA
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pF1KB4 PLAKGIQHPPQSTATVSVTVIDVNENPYFAPNPKIIRQEEGLHAGTMLTTFTAQDPDRYM
       :::.:::   :::: :.....:.:: :::  : :.:: :::.  ::.::::.: ::::.:
CCDS13 PLASGIQMSFQSTAGVTISIMDINEAPYFPSNHKLIRLEEGVPPGTVLTTFSAVDPDRFM
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pF1KB4 QQNIRYTKLSDPANWLKIDPVNGQITTIAVLDRESPNVKNNIYNATFLASDNGIPPMSGT
       :: .::.::::::.::.:. .:::::: :::::::  .:::.:.:::::.:::::: :::
CCDS13 QQAVRYSKLSDPASWLHINATNGQITTAAVLDRESLYTKNNVYEATFLAADNGIPPASGT
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pF1KB4 GTLQIYLLDINDNAPQVLPQEAETCETPDPNSINITALDYDIDPNAGPFAFDLPLSPVTI
       :::::::.:::::::..::.::. :: :. :.::::: : :.::: ::..:.::. :...
CCDS13 GTLQIYLIDINDNAPELLPKEAQICEKPNLNAINITAADADVDPNIGPYVFELPFVPAAV
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pF1KB4 KRNWTITRLNGDFAQLNLKIKFLEAGIYEVPIIITDSGNPPKSNISILRVKVCQCDSNGD
       ..::::::::::.:::.:.: .::::.:.::::.::::::: :: ::..:::: ::.:::
CCDS13 RKNWTITRLNGDYAQLSLRILYLEAGMYDVPIIVTDSGNPPLSNTSIIKVKVCPCDDNGD
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pF1KB4 CTDVDRIVGAGLGTGAIIAILLCIIILLILVLMFVVWMKRRDKERQAKQLLIDPEDDVRD
       :: .  ...::::::::.:::.::.::: .::.::.:::::.:::..:::::::::::::
CCDS13 CTTIGAVAAAGLGTGAIVAILICILILLTMVLLFVMWMKRREKERHTKQLLIDPEDDVRD
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pF1KB4 NILKYDEEGGGEEDQDYDLSQLQQPDTVEPDAIKPVGIRRMDERPIHAEPQYPVRSAAPH
       :::::::::::::::::::::::::...     :  :.::.::::. ::::::.:  .::
CCDS13 NILKYDEEGGGEEDQDYDLSQLQQPEAMGHVPSKAPGVRRVDERPVGAEPQYPIRPMVPH
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pF1KB4 PGDIGDFINEGLKAADNDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSTAGSLSSLNSSSSGGEQDYDYLN
       ::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::.::::::::: .:::::::
CCDS13 PGDIGDFINEGLRAADNDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSTAGSVSSLNSSSSG-DQDYDYLN
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pF1KB4 DWGPRFKKLADMYGGGDD 
       ::::::::::::::::.. 
CCDS13 DWGPRFKKLADMYGGGEED
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>>CCDS10976.1 CDH15 gene_id:1013|Hs108|chr16              (814 aa)
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       :.::...  :. ::. :::.:. : :.: :. ..:.. ..  ::::.  ::.::: :.:.
CCDS10 IKSDKQQLGSVIYSIQGPGVDEEPRGVFSIDKFTGKVFLNAMLDREKTDRFRLRAFALDL
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pF1KB4 NGNQVENPIDIVINVIDMNDNRPEFLHQVWNGTVPEGSKPGTYVMTVTAIDADDPNALNG
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CCDS10 GGSTLEDPTDLEIVVVDQNDNRPAFLQEAFTGRVLEGAVPGTYVTRAEATDADDPETDNA
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CCDS10 ALRFSILQQG----SPELFSIDELTGEIRTVQVGLDREVVAVYNLTLQVADMSGD---GL
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pF1KB4 SNTATAVITVTDVNDNPPEFTAMTFYGEVPENRVDIIVANLTVTDKDQPHTPAWNAVYRI
       . ::.:.::. :.::: ::::   :. :. :    . :. : : :.: : .: : : . :
CCDS10 TATASAIITLDDINDNAPEFTRDEFFMEAIEAVSGVDVGRLEVEDRDLPGSPNWVARFTI
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pF1KB4 SGGDPTGRFAIQTDPNSNDGLVTVVKPIDFETNRMFVLTVAAENQVPLAKGIQHPPQSTA
         ::: :.:.:.:::..:.:....:: .:.:. . . : :...:..::  .  .  .. :
CCDS10 LEGDPDGQFTIRTDPKTNEGVLSIVKALDYESCEHYELKVSVQNEAPLQAAALRAERGQA
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pF1KB4 TVSVTVIDVNENPYFAPNPKIIRQEEGLHAGTMLTTFTAQDPDRYMQQNIRYTKLSDPAN
        : : : :.:: : :  ::      ::   ::...::.:.:::  . : . :.:  :: .
CCDS10 KVRVHVQDTNEPPVFQENPLRTSLAEGAPPGTLVATFSARDPDTEQLQRLSYSKDYDPED
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pF1KB4 WLKIDPVNGQITTIAVLDRESPNVKNNIYNATFLASDNGIPPMSGTGTLQIYLLDINDNA
       ::..: ..:.: :  ::.  :: .:.. : :  ::.:..  : ..::::.: .:..::.:
CCDS10 WLQVDAATGRIQTQHVLSPASPFLKGGWYRAIVLAQDDASQPRTATGTLSIEILEVNDHA
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pF1KB4 PQVLPQEAET-CETPDPN-SINITALDYDIDPNAGPFAFDL-PLSPVTIKRNWTITRLNG
       : . :    . :  :  . .. . : : :. :...:: :.: :  :  . :::.....: 
CCDS10 PVLAPPPPGSLCSEPHQGPGLLLGATDEDLPPHGAPFHFQLSPRLP-ELGRNWSLSQVNV
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pF1KB4 DFAQLNLKIKFLEAGIYEVPIIITDSGNPPKSNISILRVKVCQCDSNGDCTDVDRIV---
       . :.:  . .  : :.... ... :::.::..  . : : ::.: ..: :      .   
CCDS10 SHARLRPRHQVPE-GLHRLSLLLRDSGQPPQQREQPLNVTVCRCGKDGVCLPGAAALLAG
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pF1KB4 GAGLGTGAIIAILLCIIILLILVLMFVVWMKRRDKERQAKQLLIDPEDDVRDNILKYDEE
       :.::. ::.. .:   ..::.:::. :.   :  :. ..: ::  :.::.:::.:.:::.
CCDS10 GTGLSLGALVIVLASALLLLVLVLL-VALRARFWKQSRGKGLLHGPQDDLRDNVLNYDEQ
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pF1KB4 GGGEEDQD-YDLSQLQQPDTVEPDAIKPVGIRRMDERPIHAEPQYPVRSAAPHPGDIGDF
       :::::::: ::.:::..: :.    . :  .:: :    . .:: : :     : ::.::
CCDS10 GGGEEDQDAYDISQLRHP-TALSLPLGPPPLRR-DAPQGRLHPQ-PPRVLPTSPLDIADF
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pF1KB4 INEGLKAADNDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSTAGSLSSLNSSSSGGEQDYDYLNDWGPRFK
       ::.::.:::.::..::::. :..::::.::.::.:::. ::..  .:::::: :::::: 
CCDS10 INDGLEAADSDPSVPPYDTALIYDYEGDGSVAGTLSSILSSQGDEDQDYDYLRDWGPRFA
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pF1KB4 KLADMYGGGDD                             
       .::::::                                 
CCDS10 RLADMYGHPCGLEYGARWDHQAREGLSPGALLPRHRGRTA
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>>CCDS10869.1 CDH1 gene_id:999|Hs108|chr16                (882 aa)
 initn: 1857 init1: 609 opt: 1804  Z-score: 1926.1  bits: 367.6 E(32554): 5.8e-101
Smith-Waterman score: 2537; 47.3% identity (72.3% similar) in 910 aa overlap (9-906:6-881)

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pF1KB4 MCRIAGALRTLLPLLAALLQASVEASGEIALCKTGFPEDVYS-AVLSKDVHEGQPLLNVK
               :.:  ::  :::.:     :   :. ::  . :. .:  . ...:. :  :.
CCDS10    MGPWSRSLSALLL-LLQVSSWLCQEPEPCHPGFDAESYTFTVPRRHLERGRVLGRVN
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pF1KB4 FSNCNGKRKVQYESSEPADFKVDEDGMVYAVRSFPLSSEHAKFLIYAQDKETQEKWQVAV
       : .:.:.... : : . . :::  ::.. . : . . . . .::.:: :. : .:... :
CCDS10 FEDCTGRQRTAYFSLD-TRFKVGTDGVITVKRPLRFHNPQIHFLVYAWDS-TYRKFSTKV
         60        70         80        90       100        110    

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pF1KB4 KLSL-----KPTLTEESVKESAEVEEIVFPRQFSKHSGHLQRQKRDWVIPPINLPENSRG
        :.      .:   . ::. . ..: ..::    . :  :.:::::::::::. ::: .:
CCDS10 TLNTVGHHHRPPPHQASVS-GIQAELLTFP----NSSPGLRRQKRDWVIPPISCPENEKG
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pF1KB4 PFPQELVRIRSDRDKNLSLRYSVTGPGADQPPTGIFIINPISGQLSVTKPLDREQIARFH
       :::..::.:.:..::. .. ::.:: ::: ::.:.:::.  .: :.::.:::::.:: . 
CCDS10 PFPKNLVQIKSNKDKEGKVFYSITGQGADTPPVGVFIIERETGWLKVTEPLDRERIATYT
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pF1KB4 LRAHAVDINGNQVENPIDIVINVIDMNDNRPEFLHQVWNGTVPEGSKPGTYVMTVTAIDA
       : .:::. ::: ::.:..:.:.: :.:::.::: ..:..:.: ::. ::: :: ::: ::
CCDS10 LFSHAVSSNGNAVEDPMEILITVTDQNDNKPEFTQEVFKGSVMEGALPGTSVMEVTATDA
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pF1KB4 DDP-NALNGMLRYRIVSQAPSTPSPNMFTINNETGDIITVAAGLDREKVQQYTLIIQATD
       ::  :. :. . : :.:: :  :. :::::: .:: : .:..:::::.   :::..::.:
CCDS10 DDDVNTYNAAIAYTILSQDPELPDKNMFTINRNTGVISVVTTGLDRESFPTYTLVVQAAD
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pF1KB4 MEGNPTYGLSNTATAVITVTDVNDNPPEFTAMTFYGEVPENRVDIIVANLTVTDKDQPHT
       ..:.   :::.::::::::::.::::: :.  :. :.::::........: ::: : :.:
CCDS10 LQGE---GLSTTATAVITVTDTNDNPPIFNPTTYKGQVPENEANVVITTLKVTDADAPNT
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pF1KB4 PAWNAVYRISGGDPTGRFAIQTDPNSNDGLVTVVKPIDFETNRMFVLTVAAENQVPLAKG
       :::.::: : . :  :.:.. :.: .:::.. ..: .:::......: ::. : ::.  .
CCDS10 PAWEAVYTILNDDG-GQFVVTTNPVNNDGILKTAKGLDFEAKQQYILHVAVTNVVPFEVS
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CCDS10 YRIWRDTANWLEINPDTGAISTRAELDREDFEHVKNSTYTALIIATDNGSPVATGTGTLL
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CCDS10 RKA-QPVEAGLQIPAILGILGGILALLILILLLLLFLRRRAV---VKEPLLPPEDDTRDN
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CCDS10 VYYYDEEGGGEEDQDFDLSQLHRGLDARPE------VTRNDVAPTLMSVPRYLPRPA--N
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CCDS10 EWGNRFKKLADMYGGGEDD
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CCDS58 GPSSTATVHITVLDVNEGPVFYPDPMMVTRQEDLSVGSVLLTVNATDPDSLQHQTIRYSV
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CCDS58 KINNTHALVSL-LQNLNKANYNLPIMVTDSGKPPMTNITDLRVQVCSCRNSKVDCNAAGA
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>>CCDS58485.1 CDH13 gene_id:1012|Hs108|chr16              (760 aa)
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CCDS58 FVHARTPHAEDMAELVI-------VGGKDIQGS--LQDIF---KFARTSP-VPRQKRSIV
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pF1KB4 IPPINLPENSRGPFPQELVRIRSDRDKNLSLRYSVTGPGADQPPTGIFIINPISGQLSVT
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CCDS58 VSPILIPENQRQPFPRDVGKV-VDSDRPERSKFRLTGKGVDQEPKGIFRINENTGSVSVT
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CCDS58 RTLDREVIAVYQLFVETTDVNGKTLEGPVPLEVIVIDQNDNRPIFREGPYIGHVMEGSPT
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CCDS58 TLENPKYELIIEAQDMAGLDV-GLTGTATATIMIDDKNDHSPKFTKKEFQATVEEGAVGV
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pF1KB4 IVANLTVTDKDQPHTPAWNAVYRISGGDPTGRFAIQTDPNSNDGLVTVVKPIDFETNRMF
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CCDS58 IV-NLTVEDKDDPTTGAWRAAYTIINGNPGQSFEIHTNPQTNEGMLSVVKPLDYEISAFH
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       :.: :: .::::: : : :.::::: . :  ::.:.     :. :  : : :. ::. ::
CCDS58 DSGNPPATGTGTLLITLEDVNDNAPFIYPTVAEVCDDAKNLSVVILGASDKDLHPNTDPF
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pF1KB4 AFDLPLSPVTIKRNWTITRLNGDFAQLNLKIKFLEAGIYEVPIIITDSGNPPKSNISILR
        :..  . :   . : :...:.  : ..: .. :. . :..::..::::.:: .::. ::
CCDS58 KFEIHKQAVP-DKVWKISKINNTHALVSL-LQNLNKANYNLPIMVTDSGKPPMTNITDLR
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       :.::.: .:. ::                                               
CCDS58 VQVCSCRNSKVDCNAAGALRFSLPSVLLLSLFSLACL                       
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               :: : : . : :. . .:.:   :  :: . :.      .  : : .::. :
CCDS58      MQPRTPLVLCVLLSQVLLLTSAEDLDCTPGFQQKVFHINQPAEFIEDQSILNLTF
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       :.:.:. :..:: : :  :::. :: . :.:.  ...    ....:.  ....       
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          : .:.:     . .:: :.:: : ::: ::  .:..:::. :::: :: ..: ....
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       :.::. .:.:. . . :::.::::: : .  . : : :::  :: :: .::.::::: . 
CCDS58 DVNGKTLEGPVPLEVIVIDQNDNRPIFREGPYIGHVMEGSPTGTTVMRMTAFDADDPATD
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pF1KB4 NGMLRYRIVSQAPSTPSPNMFTINNETGDIITVA--AGLDREKVQ--QYTLIIQATDMEG
       :..::: : .:.:. :::::: :. : :::.::.  : :::: ..  .: :::.: :: :
CCDS58 NALLRYNIRQQTPDKPSPNMFYIDPEKGDIVTVVSPALLDRETLENPKYELIIEAQDMAG
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pF1KB4 NPTYGLSNTATAVITVTDVNDNPPEFTAMTFYGEVPENRVDIIVANLTVTDKDQPHTPAW
         . ::..::::.: . : ::. :.::   : . : :. : .:: :::: :::.: : ::
CCDS58 LDV-GLTGTATATIMIDDKNDHSPKFTKKEFQATVEEGAVGVIV-NLTVEDKDDPTTGAW
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pF1KB4 NAVYRISGGDPTGRFAIQTDPNSNDGLVTVVKPIDFETNRMFVLTVAAENQVPLAKGIQH
        :.: : .:.:   : :.:.:..:.:...::::.:.: . . .: . .::. ::.  ...
CCDS58 RAAYTIINGNPGQSFEIHTNPQTNEGMLSVVKPLDYEISAFHTLLIKVENEDPLVPDVSY
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pF1KB4 PPQSTATVSVTVIDVNENPYFAPNPKIIRQEEGLHAGTMLTTFTAQDPDRYMQQNIRYTK
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CCDS58 GPSSTATVHITVLDVNEGPVFYPDPMMVTRQEDLSVGSVLLTVNATDPDSLQHQTIRYSV
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pF1KB4 LSDPANWLKIDPVNGQITTIAVLDRESPNVKNNIYNATFLASDNGIPPMSGTGTLQIYLL
        .:::.::.:.:.:: . : :::::::: : :..:.: ::: :.: :: .::::: : : 
CCDS58 YKDPAGWLNINPINGTVDTTAVLDRESPFVDNSVYTALFLAIDSGNPPATGTGTLLITLE
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pF1KB4 DINDNAPQVLPQEAETCETPDPNSINIT-ALDYDIDPNAGPFAFDLPLSPVTIKRNWTIT
       :.::::: . :  ::.:.     :. :  : : :. ::. :: :..  . :   . : :.
CCDS58 DVNDNAPFIYPTVAEVCDDAKNLSVVILGASDKDLHPNTDPFKFEIHKQAVP-DKVWKIS
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       ..:.  : ..: .. :. . :..::..::::.:: .::. :::.::.: .:. ::     
CCDS58 KINNTHALVSL-LQNLNKANYNLPIMVTDSGKPPMTNITDLRVQVCSCRNSKVDCNAAGA
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CCDS58 LRFSLPSVLLLSLFSLACL                                         
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>>CCDS82004.1 CDH3 gene_id:1001|Hs108|chr16               (784 aa)
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CCDS82 QALGKVFMGCPGQEPALFSTDNDDFTVRNGETVQERRSLKERNPLKIFP---SKRI--LR
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pF1KB4 RQKRDWVIPPINLPENSRGPFPQELVRIRSDRDKNLSLRYSVTGPGADQPPTGIFIINPI
       :.:::::. ::..:::..:::::.: ...:..:.. .. ::.::::::.:: :.: ..  
CCDS82 RHKRDWVVAPISVPENGKGPFPQRLNQLKSNKDRDTKIFYSITGPGADSPPEGVFAVEKE
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pF1KB4 SGQLSVTKPLDREQIARFHLRAHAVDINGNQVENPIDIVINVIDMNDNRPEFLHQVWNGT
       .: : ..::::::.::...: .:::. :: .::.:..: : : :.::..:.: .... :.
CCDS82 TGWLLLNKPLDREEIAKYELFGHAVSENGASVEDPMNISIIVTDQNDHKPKFTQDTFRGS
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       : ::  ::: :: ::: : ::   . ::.. : : :: :. :   ::::.  :: : ...
CCDS82 VLEGVLPGTSVMQVTATDEDDAIYTYNGVVAYSIHSQEPKDPHDLMFTIHRSTGTISVIS
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pF1KB4 AGLDREKVQQYTLIIQATDMEGNPTYGLSNTATAVITVTDVNDNPPEFTAMTFYGEVPEN
       .::::::: .::: ::::::.:.   : ..::.::. . :.::: : :  . . ..::::
CCDS82 SGLDREKVPEYTLTIQATDMDGD---GSTTTAVAVVEILDANDNAPMFDPQKYEAHVPEN
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pF1KB4 RVDIIVANLTVTDKDQPHTPAWNAVYRISGGDPTGRFAIQTDPNSNDGLVTVVKPIDFET
        :   :  ::::: : :..::: :.: : :::   .:.: : :.::.:..:. : .:::.
CCDS82 AVGHEVQRLTVTDLDAPNSPAWRATYLIMGGDDGDHFTITTHPESNQGILTTRKGLDFEA
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pF1KB4 NRMFVLTVAAENQVPLAKGIQHPPQSTATVSVTVIDVNENPYFAPNPKIIRQEEGLHAGT
       . . .: : . :..:.   . . : ::::. : : :::: : :.:  :... .::. .: 
CCDS82 KNQHTLYVEVTNEAPF---VLKLPTSTATIVVHVEDVNEAPVFVPPSKVVEVQEGIPTGE
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pF1KB4 MLTTFTAQDPDRYMQQNIRYTKLSDPANWLKIDPVNGQITTIAVLDRESPN-VKNNIYNA
        . ..::.:::.  .:.: :  : :::.:: .:: .::.:....::::. . :.::::..
CCDS82 PVCVYTAEDPDKE-NQKISYRILRDPAGWLAMDPDSGQVTAVGTLDREDEQFVRNNIYEV
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pF1KB4 TFLASDNGIPPMSGTGTLQIYLLDINDNAPQVLPQEAETC-ETPDPNSINITALDYDIDP
         :: ::: :: .::::: . :.:.::..:   :..   : ..:  . .:::  : :..:
CCDS82 MVLAMDNGSPPTTGTGTLLLTLIDVNDHGPVPEPRQITICNQSPVRQVLNIT--DKDLSP
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CCDS82 HTSPFQAQLT-DDSDIY--WTAEVNEEGDTVVLSLK-KFLKQDTYDVHLSLSDHGN--KE
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pF1KB4 NISILRVKVCQCDSNGDCTDVDRIVGAGLGTGAIIAILLCIIILLILVLMFVVWMKRRDK
       .....:. ::.: ..     :.   :   : : :. .:  .. ::.:.:.... ..   :
CCDS82 QLTVIRATVCDCHGH-----VETCPGPWKG-GFILPVLGAVLALLFLLLVLLLLVR---K
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pF1KB4 ERQAKQLLIDPEDDVRDNILKYDEEGGGEEDQDYDLSQLQQPDTVEPDAIKPVGIRRMDE
       .:. :. :. ::::.:::.. : ::::::::::::..::..   ..:..     . : : 
CCDS82 KRKIKEPLLLPEDDTRDNVFYYGEEGGGEEDQDYDITQLHRGLEARPEV-----VLRNDV
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pF1KB4 RP-IHAEPQYPVRSAAPHPGDIGDFINEGLKAADNDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSTAGSL
        : :   :.:  : :  .: .::.:: ::                               
CCDS82 APTIIPTPMYRPRPA--NPDEIGNFIIEGRGERGSQRGNGGLQLARGRTRRS        
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906 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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 start: Thu Nov  3 15:24:52 2016 done: Thu Nov  3 15:24:52 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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