Result of FASTA (ccds) for pF1KB4082
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB4082, 894 aa
  1>>>pF1KB4082 894 - 894 aa - 894 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2919+/-0.000971; mu= 21.0238+/- 0.059
 mean_var=60.2055+/-12.226, 0's: 0 Z-trim(103.6): 46  B-trim: 308 in 1/51
 Lambda= 0.165294
 statistics sampled from 7465 (7511) to 7465 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.584), E-opt: 0.2 (0.231), width:  16
 Scan time:  3.270

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS14605.1 GRIA3 gene_id:2892|Hs108|chrX          ( 894) 5918 1420.2       0
CCDS14604.1 GRIA3 gene_id:2892|Hs108|chrX          ( 894) 5860 1406.4       0
CCDS41706.1 GRIA4 gene_id:2893|Hs108|chr11         ( 884) 4547 1093.3       0
CCDS8333.1 GRIA4 gene_id:2893|Hs108|chr11          ( 902) 4437 1067.1       0
CCDS3797.1 GRIA2 gene_id:2891|Hs108|chr4           ( 883) 4342 1044.4       0
CCDS43274.1 GRIA2 gene_id:2891|Hs108|chr4          ( 883) 4285 1030.8       0
CCDS43275.1 GRIA2 gene_id:2891|Hs108|chr4          ( 836) 4258 1024.4       0
CCDS47318.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5          ( 906) 3891 936.9       0
CCDS58988.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5          ( 916) 3891 936.9       0
CCDS4322.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5           ( 906) 3862 929.9       0
CCDS58987.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5          ( 916) 3862 929.9       0
CCDS58989.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5          ( 837) 3828 921.8       0
CCDS58986.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5          ( 826) 3419 824.3       0
CCDS5049.1 GRIK2 gene_id:2898|Hs108|chr6           ( 869) 2007 487.6 4.3e-137
CCDS55045.1 GRIK2 gene_id:2898|Hs108|chr6          ( 892) 2007 487.6 4.4e-137
CCDS5048.1 GRIK2 gene_id:2898|Hs108|chr6           ( 908) 2007 487.6 4.4e-137
CCDS33530.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21         ( 905) 1951 474.2 4.6e-133
CCDS82656.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21         ( 934) 1951 474.2 4.8e-133
CCDS416.1 GRIK3 gene_id:2899|Hs108|chr1            ( 919) 1931 469.5 1.3e-131
CCDS41707.1 GRIA4 gene_id:2893|Hs108|chr11         ( 433) 1834 446.2 6.1e-125
CCDS42913.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21         ( 918) 1805 439.4 1.4e-122
CCDS82658.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21         ( 920) 1805 439.4 1.4e-122
CCDS82659.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21         ( 949) 1805 439.4 1.5e-122
CCDS12595.1 GRIK5 gene_id:2901|Hs108|chr19         ( 980) 1636 399.1  2e-110
CCDS77305.1 GRIK5 gene_id:2901|Hs108|chr19         ( 981) 1632 398.2 3.9e-110
CCDS8433.1 GRIK4 gene_id:2900|Hs108|chr11          ( 956) 1619 395.1 3.3e-109
CCDS76017.1 GRIA3 gene_id:2892|Hs108|chrX          ( 144)  588 148.9 6.5e-36
CCDS68758.1 GRID2 gene_id:2895|Hs108|chr4          ( 912)  586 148.7 4.5e-35
CCDS3637.1 GRID2 gene_id:2895|Hs108|chr4           (1007)  586 148.7 4.9e-35
CCDS31236.1 GRID1 gene_id:2894|Hs108|chr10         (1009)  564 143.5 1.9e-33
CCDS8662.1 GRIN2B gene_id:2904|Hs108|chr12         (1484)  557 141.9 8.4e-33
CCDS45407.1 GRIN2A gene_id:2903|Hs108|chr16        (1281)  554 141.1 1.2e-32
CCDS10539.1 GRIN2A gene_id:2903|Hs108|chr16        (1464)  554 141.2 1.4e-32
CCDS62330.1 GRIN2C gene_id:2905|Hs108|chr17        ( 873)  542 138.2 6.3e-32
CCDS32724.1 GRIN2C gene_id:2905|Hs108|chr17        (1233)  542 138.3 8.5e-32
CCDS12719.1 GRIN2D gene_id:2906|Hs108|chr19        (1336)  531 135.7 5.6e-31
CCDS43910.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9          ( 885)  362 95.3 5.3e-19
CCDS7032.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9           ( 901)  362 95.3 5.4e-19
CCDS55355.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9          ( 906)  362 95.3 5.4e-19
CCDS7031.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9           ( 938)  362 95.3 5.6e-19
CCDS55354.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9          ( 943)  362 95.3 5.6e-19
CCDS6758.1 GRIN3A gene_id:116443|Hs108|chr9        (1115)  311 83.2   3e-15
CCDS32861.1 GRIN3B gene_id:116444|Hs108|chr19      (1043)  307 82.2 5.4e-15


>>CCDS14605.1 GRIA3 gene_id:2892|Hs108|chrX               (894 aa)
 initn: 5918 init1: 5918 opt: 5918  Z-score: 7615.0  bits: 1420.2 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5918; 99.9% identity (99.9% similar) in 894 aa overlap (1-894:1-894)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MARQKKMGQSVLRAVFFLVLGLLGHSHGGFPNTISIGGLFMRNTVQEHSAFRFAVQLYNT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MARQKKMGQSVLRAVFFLVLGLLGHSHGGFPNTISIGGLFMRNTVQEHSAFRFAVQLYNT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 NQNTTEKPFHLNYHVDHLDSSNSFSVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDQMSMNTLTSFCGAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NQNTTEKPFHLNYHVDHLDSSNSFSVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDQMSMNTLTSFCGAL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 HTSFVTPSFPTDADVQFVIQMRPALKGAILSLLGHYKWEKFVYLYDTERGFSILQAIMEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 HTSFVTPSFPTDADVQFVIQMRPALKGAILSLLGHYKWEKFVYLYDTERGFSILQAIMEA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 AVQNNWQVTARSVGNIKDVQEFRRIIEEMDRRQEKRYLIDCEVERINTILEQVVILGKHS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AVQNNWQVTARSVGNIKDVQEFRRIIEEMDRRQEKRYLIDCEVERINTILEQVVILGKHS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 RGYHYMLANLGFTDILLERVMHGGANITGFQIVNNENPMVQQFIQRWVRLDEREFPEAKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RGYHYMLANLGFTDILLERVMHGGANITGFQIVNNENPMVQQFIQRWVRLDEREFPEAKN
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 APLKYTSALTHDAILVIAEAFRYLRRQRVDVSRRGSAGDCLANPAVPWSQGIDIERALKM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 APLKYTSALTHDAILVIAEAFRYLRRQRVDVSRRGSAGDCLANPAVPWSQGIDIERALKM
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 VQVQGMTGNIQFDTYGRRTNYTIDVYEMKVSGSRKAGYWNEYERFVPFSDQQISNDSASS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VQVQGMTGNIQFDTYGRRTNYTIDVYEMKVSGSRKAGYWNEYERFVPFSDQQISNDSASS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB4 ENRTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGDGKY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ENRTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGDGKY
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB4 GARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB4 KPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHLEDNNEEPRDPQSPPDPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHLEDNNEEPRDPQSPPDPP
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB4 NEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVER
              610       620       630       640       650       660

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pF1KB4 MVSPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKTTAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MVSPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKTTAD
              670       680       690       700       710       720

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pF1KB4 GVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGTPVNL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::
CCDS14 GVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALRTPVNL
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB4 AVLKLSEQGILDKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGLAMM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AVLKLSEQGILDKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGLAMM
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890    
pF1KB4 VALIEFCYKSRAESKRMKLTKNTQNFKPAPATNTQNYATYREGYNVYGTESVKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VALIEFCYKSRAESKRMKLTKNTQNFKPAPATNTQNYATYREGYNVYGTESVKI
              850       860       870       880       890    

>>CCDS14604.1 GRIA3 gene_id:2892|Hs108|chrX               (894 aa)
 initn: 5860 init1: 5860 opt: 5860  Z-score: 7540.3  bits: 1406.4 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5860; 98.9% identity (99.4% similar) in 894 aa overlap (1-894:1-894)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MARQKKMGQSVLRAVFFLVLGLLGHSHGGFPNTISIGGLFMRNTVQEHSAFRFAVQLYNT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MARQKKMGQSVLRAVFFLVLGLLGHSHGGFPNTISIGGLFMRNTVQEHSAFRFAVQLYNT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 NQNTTEKPFHLNYHVDHLDSSNSFSVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDQMSMNTLTSFCGAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NQNTTEKPFHLNYHVDHLDSSNSFSVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDQMSMNTLTSFCGAL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 HTSFVTPSFPTDADVQFVIQMRPALKGAILSLLGHYKWEKFVYLYDTERGFSILQAIMEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 HTSFVTPSFPTDADVQFVIQMRPALKGAILSLLGHYKWEKFVYLYDTERGFSILQAIMEA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 AVQNNWQVTARSVGNIKDVQEFRRIIEEMDRRQEKRYLIDCEVERINTILEQVVILGKHS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AVQNNWQVTARSVGNIKDVQEFRRIIEEMDRRQEKRYLIDCEVERINTILEQVVILGKHS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 RGYHYMLANLGFTDILLERVMHGGANITGFQIVNNENPMVQQFIQRWVRLDEREFPEAKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RGYHYMLANLGFTDILLERVMHGGANITGFQIVNNENPMVQQFIQRWVRLDEREFPEAKN
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 APLKYTSALTHDAILVIAEAFRYLRRQRVDVSRRGSAGDCLANPAVPWSQGIDIERALKM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VQVQGMTGNIQFDTYGRRTNYTIDVYEMKVSGSRKAGYWNEYERFVPFSDQQISNDSASS
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MVSPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKTTAD
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       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: . :::
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       :::::.:::.::::::::::::::::.  . :::::::::::::::::::::::::::::
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VALIEFCYKSRAESKRMKLTKNTQNFKPAPATNTQNYATYREGYNVYGTESVKI
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>>CCDS41706.1 GRIA4 gene_id:2893|Hs108|chr11              (884 aa)
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Smith-Waterman score: 4547; 74.6% identity (92.7% similar) in 887 aa overlap (11-894:4-884)

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                 . : . .:  :. : . :.::....:::::.::: ::..:::.:. :.::
CCDS41        MRIISRQIVLLFSGFWGLAMGAFPSSVQIGGLFIRNTDQEYTAFRLAIFLHNT
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       . :..: ::.:  :::.....:::.::::::::.::::.::::.::. :..::::::.::
CCDS41 SPNASEAPFNLVPHVDNIETANSFAVTNAFCSQYSRGVFAIFGLYDKRSVHTLTSFCSAL
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CCDS41 HISLITPSFPTEGESQFVLQLRPSLRGALLSLLDHYEWNCFVFLYDTDRGYSILQAIMEK
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pF1KB4 RGYHYMLANLGFTDILLERVMHGGANITGFQIVNNENPMVQQFIQRWVRLDEREFPEAKN
       .::::..::::: :: ::: .:::::.::::.:. ..::: ....:: .::.::.: ...
CCDS41 KGYHYIIANLGFKDISLERFIHGGANVTGFQLVDFNTPMVIKLMDRWKKLDQREYPGSET
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        : :::::::.:..::.::.:: ::::..:.::::.:::::::::.::.::::.::.::.
CCDS41 PP-KYTSALTYDGVLVMAETFRSLRRQKIDISRRGNAGDCLANPAAPWGQGIDMERTLKQ
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pF1KB4 VQVQGMTGNIQFDTYGRRTNYTIDVYEMKVSGSRKAGYWNEYERFVPFSD-QQISNDSAS
       :..::.:::.::: ::::.:::.::.:.: .: ::.::::.....: ..:   ..::.:.
CCDS41 VRIQGLTGNVQFDHYGRRVNYTMDVFELKSTGPRKVGYWNDMDKLVLIQDVPTLGNDTAA
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pF1KB4 SENRTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGDGK
        ::::.:::::.::::::::::::..:::..::::::::: :::::. ::::..:: :::
CCDS41 IENRTVVVTTIMESPYVMYKKNHEMFEGNDKYEGYCVDLASEIAKHIGIKYKIAIVPDGK
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pF1KB4 YGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQK
       ::::: .::::::::::::::.:.::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 YGARDADTKIWNGMVGELVYGKAEIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQK
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pF1KB4 SKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHLEDNNEEPRD-PQSPPD
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::    .:::.:  ..: :
CCDS41 SKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWH----TEEPEDGKEGPSD
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pF1KB4 -PPNEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLT
        :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QPPNEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLT
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.::::::::.:
CCDS41 VERMVSPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWTYMRSAEPSVFTRT
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pF1KB4 TADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGTP
       ::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.: . 
CCDS41 TAEGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSSLRNA
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pF1KB4 VNLAVLKLSEQGILDKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGL
       ::::::::.:::.::::::::::::::::.  . ::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECGSGGGDSKDKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGL
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pF1KB4 AMMVALIEFCYKSRAESKRMKLTKNTQNFKPAPATNTQNYATYREGYNVYGTESVKI
       ::.:::::::::::::.::::..:..:.:.:. . :::: ::::::::::::::.::
CCDS41 AMLVALIEFCYKSRAEAKRMKVAKSAQTFNPTSSQNTQNLATYREGYNVYGTESIKI
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>>CCDS8333.1 GRIA4 gene_id:2893|Hs108|chr11               (902 aa)
 initn: 2991 init1: 1663 opt: 4437  Z-score: 5706.3  bits: 1067.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4437; 75.7% identity (93.0% similar) in 853 aa overlap (11-860:4-850)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MARQKKMGQSVLRAVFFLVLGLLGHSHGGFPNTISIGGLFMRNTVQEHSAFRFAVQLYNT
                 . : . .:  :. : . :.::....:::::.::: ::..:::.:. :.::
CCDS83        MRIISRQIVLLFSGFWGLAMGAFPSSVQIGGLFIRNTDQEYTAFRLAIFLHNT
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pF1KB4 NQNTTEKPFHLNYHVDHLDSSNSFSVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDQMSMNTLTSFCGAL
       . :..: ::.:  :::.....:::.::::::::.::::.::::.::. :..::::::.::
CCDS83 SPNASEAPFNLVPHVDNIETANSFAVTNAFCSQYSRGVFAIFGLYDKRSVHTLTSFCSAL
            60        70        80        90       100       110   

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pF1KB4 HTSFVTPSFPTDADVQFVIQMRPALKGAILSLLGHYKWEKFVYLYDTERGFSILQAIMEA
       : :..::::::... :::.:.::.:.::.:::: ::.:. ::.::::.::.:::::::: 
CCDS83 HISLITPSFPTEGESQFVLQLRPSLRGALLSLLDHYEWNCFVFLYDTDRGYSILQAIMEK
           120       130       140       150       160       170   

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pF1KB4 AVQNNWQVTARSVGNIKDVQEFRRIIEEMDRRQEKRYLIDCEVERINTILEQVVILGKHS
       : ::.:.:.:  : :..::. .:...::.::::::...::::.::...::::.: .::: 
CCDS83 AGQNGWHVSAICVENFNDVS-YRQLLEELDRRQEKKFVIDCEIERLQNILEQIVSVGKHV
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pF1KB4 RGYHYMLANLGFTDILLERVMHGGANITGFQIVNNENPMVQQFIQRWVRLDEREFPEAKN
       .::::..::::: :: ::: .:::::.::::.:. ..::: ....:: .::.::.: ...
CCDS83 KGYHYIIANLGFKDISLERFIHGGANVTGFQLVDFNTPMVIKLMDRWKKLDQREYPGSET
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pF1KB4 APLKYTSALTHDAILVIAEAFRYLRRQRVDVSRRGSAGDCLANPAVPWSQGIDIERALKM
        : :::::::.:..::.::.:: ::::..:.::::.:::::::::.::.::::.::.::.
CCDS83 PP-KYTSALTYDGVLVMAETFRSLRRQKIDISRRGNAGDCLANPAAPWGQGIDMERTLKQ
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pF1KB4 VQVQGMTGNIQFDTYGRRTNYTIDVYEMKVSGSRKAGYWNEYERFVPFSD-QQISNDSAS
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CCDS83 VRIQGLTGNVQFDHYGRRVNYTMDVFELKSTGPRKVGYWNDMDKLVLIQDVPTLGNDTAA
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pF1KB4 SENRTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGDGK
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CCDS83 IENRTVVVTTIMESPYVMYKKNHEMFEGNDKYEGYCVDLASEIAKHIGIKYKIAIVPDGK
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pF1KB4 YGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQK
       ::::: .::::::::::::::.:.::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 YGARDADTKIWNGMVGELVYGKAEIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQK
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pF1KB4 SKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHLEDNNEEPRD-PQSPPD
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::    .:::.:  ..: :
CCDS83 SKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWH----TEEPEDGKEGPSD
             540       550       560       570           580       

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pF1KB4 -PPNEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLT
        :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 QPPNEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLT
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pF1KB4 VERMVSPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.::::::::.:
CCDS83 VERMVSPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWTYMRSAEPSVFTRT
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pF1KB4 TADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGTP
       ::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.: ::
CCDS83 TAEGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSSLRTP
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pF1KB4 VNLAVLKLSEQGILDKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGL
       :::::::::: :.:::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 VNLAVLKLSEAGVLDKLKNKWWYDKGECGPKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGL
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pF1KB4 AMMVALIEFCYKSRAESKRMKLTKNTQNFKPAPATNTQNYATYREGYNVYGTESVKI   
       ::.:::::::::::::.::::::                                     
CCDS83 AMLVALIEFCYKSRAEAKRMKLTFSEAIRNKARLSITGSVGENGRVLTPDCPKAVHTGTA
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>>CCDS3797.1 GRIA2 gene_id:2891|Hs108|chr4                (883 aa)
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               :....   .:   : :   :   :.:.::::: :.. ::.:::: ..  ..:
CCDS37        MQKIMHISVLLSPVLWGLIFGVSSNSIQIGGLFPRGADQEYSAFRVGMVQFST
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       ..      :.:. :.:.:. .:::.:::::::::::::::::::::. :.::.:::::.:
CCDS37 SE------FRLTPHIDNLEVANSFAVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDKKSVNTITSFCGTL
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       :.::.:::::::.   ::::::: ::::.:::. .:.:.::.::::..::.: :::....
CCDS37 HVSFITPSFPTDGTHPFVIQMRPDLKGALLSLIEYYQWDKFAYLYDSDRGLSTLQAVLDS
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pF1KB4 AVQNNWQVTARSVGNIKDVQE---FRRIIEEMDRRQEKRYLIDCEVERINTILEQVVILG
       :....::::: .::::.. ..   .: ...... ..:.: ..::: ...: :..::. .:
CCDS37 AAEKKWQVTAINVGNINNDKKDEMYRSLFQDLELKKERRVILDCERDKVNDIVDQVITIG
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pF1KB4 KHSRGYHYMLANLGFTDILLERVMHGGANITGFQIVNNENPMVQQFIQRWVRLDEREFPE
       :: .::::..:::::::  : ... ::::..:::::. .. .:..::.::  :.:.:.: 
CCDS37 KHVKGYHYIIANLGFTDGDLLKIQFGGANVSGFQIVDYDDSLVSKFIERWSTLEEKEYPG
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pF1KB4 AKNAPLKYTSALTHDAILVIAEAFRYLRRQRVDVSRRGSAGDCLANPAVPWSQGIDIERA
       :... .:::::::.::. :..:::: ::.::...::::.::::::::::::.::..::::
CCDS37 AHTTTIKYTSALTYDAVQVMTEAFRNLRKQRIEISRRGNAGDCLANPAVPWGQGVEIERA
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pF1KB4 LKMVQVQGMTGNIQFDTYGRRTNYTIDVYEMKVSGSRKAGYWNEYERFV-PFSDQQISND
       ::.:::.:..:::.::  :.: ::::...:.:..: :: :::.: ...:  ...   .::
CCDS37 LKQVQVEGLSGNIKFDQNGKRINYTINIMELKTNGPRKIGYWSEVDKMVVTLTELPSGND
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pF1KB4 SASSENRTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVG
       ... ::.:.::::::::::::.:::::.::::::::::::::: :::::  .::::.:::
CCDS37 TSGLENKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVG
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pF1KB4 DGKYGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKK
       :::::::: .::::::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 DGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKK
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pF1KB4 PQKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHLEDNNEEPRDPQSP
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :.  :. :. :: 
CCDS37 PQKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHTEEF-EDGRETQSS
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        .  ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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       :::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::..:::.::.:::::::..
CCDS37 TVERMVSPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVR
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       :::.:::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.: :
CCDS37 TTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLRT
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pF1KB4 PVNLAVLKLSEQGILDKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILVGGLG
       :::::::::::::.:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS37 PVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKEKTSALSLSNVAGVFYILVGGLG
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pF1KB4 LAMMVALIEFCYKSRAESKRMKLTKNTQNFKPAPATNTQNYATYREGYNVYGTESVKI
       :::.:::::::::::::.::::..::.::..:. . :.::.:::.::::::: :::::
CCDS37 LAMLVALIEFCYKSRAEAKRMKVAKNAQNINPSSSQNSQNFATYKEGYNVYGIESVKI
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>>CCDS43274.1 GRIA2 gene_id:2891|Hs108|chr4               (883 aa)
 initn: 3411 init1: 1720 opt: 4285  Z-score: 5510.5  bits: 1030.8 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4285; 70.7% identity (89.9% similar) in 890 aa overlap (9-894:2-883)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MARQKKMGQSVLRAVFFLVLGLLGHSHGGFPNTISIGGLFMRNTVQEHSAFRFAVQLYNT
               :....   .:   : :   :   :.:.::::: :.. ::.:::: ..  ..:
CCDS43        MQKIMHISVLLSPVLWGLIFGVSSNSIQIGGLFPRGADQEYSAFRVGMVQFST
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pF1KB4 NQNTTEKPFHLNYHVDHLDSSNSFSVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDQMSMNTLTSFCGAL
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CCDS43 SE------FRLTPHIDNLEVANSFAVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDKKSVNTITSFCGTL
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pF1KB4 HTSFVTPSFPTDADVQFVIQMRPALKGAILSLLGHYKWEKFVYLYDTERGFSILQAIMEA
       :.::.:::::::.   ::::::: ::::.:::. .:.:.::.::::..::.: :::....
CCDS43 HVSFITPSFPTDGTHPFVIQMRPDLKGALLSLIEYYQWDKFAYLYDSDRGLSTLQAVLDS
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pF1KB4 AVQNNWQVTARSVGNIKDVQE---FRRIIEEMDRRQEKRYLIDCEVERINTILEQVVILG
       :....::::: .::::.. ..   .: ...... ..:.: ..::: ...: :..::. .:
CCDS43 AAEKKWQVTAINVGNINNDKKDEMYRSLFQDLELKKERRVILDCERDKVNDIVDQVITIG
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pF1KB4 KHSRGYHYMLANLGFTDILLERVMHGGANITGFQIVNNENPMVQQFIQRWVRLDEREFPE
       :: .::::..:::::::  : ... ::::..:::::. .. .:..::.::  :.:.:.: 
CCDS43 KHVKGYHYIIANLGFTDGDLLKIQFGGANVSGFQIVDYDDSLVSKFIERWSTLEEKEYPG
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pF1KB4 AKNAPLKYTSALTHDAILVIAEAFRYLRRQRVDVSRRGSAGDCLANPAVPWSQGIDIERA
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CCDS43 AHTTTIKYTSALTYDAVQVMTEAFRNLRKQRIEISRRGNAGDCLANPAVPWGQGVEIERA
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pF1KB4 LKMVQVQGMTGNIQFDTYGRRTNYTIDVYEMKVSGSRKAGYWNEYERFV-PFSDQQISND
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CCDS43 LKQVQVEGLSGNIKFDQNGKRINYTINIMELKTNGPRKIGYWSEVDKMVVTLTELPSGND
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pF1KB4 SASSENRTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVG
       ... ::.:.::::::::::::.:::::.::::::::::::::: :::::  .::::.:::
CCDS43 TSGLENKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVG
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pF1KB4 DGKYGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKK
       :::::::: .::::::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKK
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pF1KB4 PQKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHLEDNNEEPRDPQSP
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :.  :. :. :: 
CCDS43 PQKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHTEEF-EDGRETQSS
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pF1KB4 PDPPNEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFL
        .  ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 -ESTNEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFL
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pF1KB4 TVERMVSPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTK
       :::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::..:::.::.:::::::..
CCDS43 TVERMVSPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVR
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pF1KB4 TTADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGT
       :::.:::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.: .
CCDS43 TTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLRN
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pF1KB4 PVNLAVLKLSEQGILDKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILVGGLG
        ::::::::.:::.::::::::::::::::.  . ::.::::::::::::::::::::::
CCDS43 AVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECGSGGGDSKEKTSALSLSNVAGVFYILVGGLG
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pF1KB4 LAMMVALIEFCYKSRAESKRMKLTKNTQNFKPAPATNTQNYATYREGYNVYGTESVKI
       :::.:::::::::::::.::::..::.::..:. . :.::.:::.::::::: :::::
CCDS43 LAMLVALIEFCYKSRAEAKRMKVAKNAQNINPSSSQNSQNFATYKEGYNVYGIESVKI
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>>CCDS43275.1 GRIA2 gene_id:2891|Hs108|chr4               (836 aa)
 initn: 3394 init1: 1777 opt: 4258  Z-score: 5476.1  bits: 1024.4 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4258; 74.3% identity (92.5% similar) in 830 aa overlap (69-894:9-836)

       40        50        60        70        80        90        
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                                     :.:. :.:.:. .:::.:::::::::::::
CCDS43                       MVQFSTSEFRLTPHIDNLEVANSFAVTNAFCSQFSRGV
                                     10        20        30        

      100       110       120       130       140       150        
pF1KB4 YAIFGFYDQMSMNTLTSFCGALHTSFVTPSFPTDADVQFVIQMRPALKGAILSLLGHYKW
       ::::::::. :.::.:::::.::.::.:::::::.   ::::::: ::::.:::. .:.:
CCDS43 YAIFGFYDKKSVNTITSFCGTLHVSFITPSFPTDGTHPFVIQMRPDLKGALLSLIEYYQW
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      160       170       180       190       200          210     
pF1KB4 EKFVYLYDTERGFSILQAIMEAAVQNNWQVTARSVGNIKDVQE---FRRIIEEMDRRQEK
       .::.::::..::.: :::....:....::::: .::::.. ..   .: ...... ..:.
CCDS43 DKFAYLYDSDRGLSTLQAVLDSAAEKKWQVTAINVGNINNDKKDEMYRSLFQDLELKKER
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pF1KB4 RYLIDCEVERINTILEQVVILGKHSRGYHYMLANLGFTDILLERVMHGGANITGFQIVNN
       : ..::: ...: :..::. .::: .::::..:::::::  : ... ::::..:::::. 
CCDS43 RVILDCERDKVNDIVDQVITIGKHVKGYHYIIANLGFTDGDLLKIQFGGANVSGFQIVDY
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pF1KB4 ENPMVQQFIQRWVRLDEREFPEAKNAPLKYTSALTHDAILVIAEAFRYLRRQRVDVSRRG
       .. .:..::.::  :.:.:.: :... .:::::::.::. :..:::: ::.::...::::
CCDS43 DDSLVSKFIERWSTLEEKEYPGAHTTTIKYTSALTYDAVQVMTEAFRNLRKQRIEISRRG
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pF1KB4 SAGDCLANPAVPWSQGIDIERALKMVQVQGMTGNIQFDTYGRRTNYTIDVYEMKVSGSRK
       .::::::::::::.::..::::::.:::.:..:::.::  :.: ::::...:.:..: ::
CCDS43 NAGDCLANPAVPWGQGVEIERALKQVQVEGLSGNIKFDQNGKRINYTINIMELKTNGPRK
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pF1KB4 AGYWNEYERFV-PFSDQQISNDSASSENRTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGY
        :::.: ...:  ...   .::... ::.:.::::::::::::.:::::.::::::::::
CCDS43 IGYWSEVDKMVVTLTELPSGNDTSGLENKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGY
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pF1KB4 CVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGDGKYGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLV
       ::::: :::::  .::::.::::::::::: .::::::::::::::.::::.::::::::
CCDS43 CVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLV
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pF1KB4 REEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 REEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVS
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pF1KB4 RFSPYEWHLEDNNEEPRDPQSPPDPPNEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVG
       :::::::: :.  :. :. ::  .  ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RFSPYEWHTEEF-EDGRETQSS-ESTNEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVG
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pF1KB4 GVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS43 GVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRS
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pF1KB4 KIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKTTADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMK
       ::::..:::.::.:::::::..:::.:::::::::::.:.::::::::::::::::::::
CCDS43 KIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMK
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pF1KB4 VGGNLDSKGYGVATPKGSALGTPVNLAVLKLSEQGILDKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKD
       :::::::::::.::::::.: ::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::.
CCDS43 VGGNLDSKGYGIATPKGSSLRTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKE
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pF1KB4 KTSALSLSNVAGVFYILVGGLGLAMMVALIEFCYKSRAESKRMKLTKNTQNFKPAPATNT
       :::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.::::..::.::..:. . :.
CCDS43 KTSALSLSNVAGVFYILVGGLGLAMLVALIEFCYKSRAEAKRMKVAKNAQNINPSSSQNS
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          880       890    
pF1KB4 QNYATYREGYNVYGTESVKI
       ::.:::.::::::: :::::
CCDS43 QNFATYKEGYNVYGIESVKI
        820       830      

>>CCDS47318.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5               (906 aa)
 initn: 2949 init1: 1605 opt: 3891  Z-score: 5002.6  bits: 936.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4002; 70.1% identity (87.4% similar) in 850 aa overlap (12-858:1-840)

               10         20         30        40        50        
pF1KB4 MARQKKMGQSVLRAVF-FLVLGLLGHSHGG-FPNTISIGGLFMRNTVQEHSAFRFAVQLY
                  .. .: :.  :.::   :. :::.:.:::::  .  :::.:::::..  
CCDS47            MQHIFAFFCTGFLGAVVGANFPNNIQIGGLFPNQQSQEHAAFRFALS--
                          10        20        30        40         

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pF1KB4 NTNQNTTEKPFHLNYHVDHLDSSNSFSVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDQMSMNTLTSFCG
           . :: : .:  ..: .. :.:: .:  ::::::.:::::::::.. ..: ::::::
CCDS47 ----QLTEPP-KLLPQIDIVNISDSFEMTYRFCSQFSKGVYAIFGFYERRTVNMLTSFCG
            50         60        70        80        90       100  

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pF1KB4 ALHTSFVTPSFPTDADVQFVIQMRPALKGAILSLLGHYKWEKFVYLYDTERGFSILQAIM
       :::. :.:::::.:.. :::.:.:: :. :..:.. ::::.::::.::..::.:.:: ..
CCDS47 ALHVCFITPSFPVDTSNQFVLQLRPELQDALISIIDHYKWQKFVYIYDADRGLSVLQKVL
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pF1KB4 EAAVQNNWQVTARSVGNIKDVQEFRRIIEEMDRRQEKRYLIDCEVERINTILEQVVILGK
       ..:...:::::: .. .  . . .: .........:.  ..::: ::.:.:: :.. : :
CCDS47 DTAAEKNWQVTAVNILTTTE-EGYRMLFQDLEKKKERLVVVDCESERLNAILGQIIKLEK
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pF1KB4 HSRGYHYMLANLGFTDILLERVMHGGANITGFQIVNNENPMVQQFIQRWVRLDEREFPEA
       .. ::::.:::::: :: :..  ..:::.::::.::  . .  ...:.:   : :.  ..
CCDS47 NGIGYHYILANLGFMDIDLNKFKESGANVTGFQLVNYTDTIPAKIMQQWKNSDARDHTRV
             230       240       250       260       270       280 

      300       310       320       330       340       350        
pF1KB4 KNAPLKYTSALTHDAILVIAEAFRYLRRQRVDVSRRGSAGDCLANPAVPWSQGIDIERAL
            :::::::.:.. :.::::. :::::.:.::::.::::::::::::.:::::.:::
CCDS47 DWKRPKYTSALTYDGVKVMAEAFQSLRRQRIDISRRGNAGDCLANPAVPWGQGIDIQRAL
             290       300       310       320       330       340 

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pF1KB4 KMVQVQGMTGNIQFDTYGRRTNYTIDVYEMKVSGSRKAGYWNEYERFVPF-SDQQISNDS
       ..:. .:.:::.::.  :::::::. : ::: .: :: ::::: ..:::  .: : ..:.
CCDS47 QQVRFEGLTGNVQFNEKGRRTNYTLHVIEMKHDGIRKIGYWNEDDKFVPAATDAQAGGDN
             350       360       370       380       390       400 

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pF1KB4 ASSENRTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGD
       .: .::: .::::::.:::: ::: .:.:::.:::::::.:: ::::::  .:.: ::.:
CCDS47 SSVQNRTYIVTTILEDPYVMLKKNANQFEGNDRYEGYCVELAAEIAKHVGYSYRLEIVSD
             410       420       430       440       450       460 

       480       490       500       510       520       530       
pF1KB4 GKYGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKP
       ::::::::.:: ::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GKYGARDPDTKAWNGMVGELVYGRADVAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKP
             470       480       490       500       510       520 

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pF1KB4 QKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHLEDNNEEPRDPQSPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :.  :: :: :.  
CCDS47 QKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHSEEF-EEGRD-QTTS
             530       540       550       560       570           

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pF1KB4 DPPNEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLT
       :  :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DQSNEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLT
     580       590       600       610       620       630         

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pF1KB4 VERMVSPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKT
       :::::::::::::::::::::::::..::::::::::::::.::::.::::::::::..:
CCDS47 VERMVSPIESAEDLAKQTEIAYGTLEAGSTKEFFRRSKIAVFEKMWTYMKSAEPSVFVRT
     640       650       660       670       680       690         

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pF1KB4 TADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGTP
       : .:. ::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::  :
CCDS47 TEEGMIRVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSALRGP
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pF1KB4 VNLAVLKLSEQGILDKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGL
       ::::::::::::.:::::.::::::::::.::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS47 VNLAVLKLSEQGVLDKLKSKWWYDKGECGSKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILIGGLGL
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       ::.:::::::::::.::::::                                       
CCDS47 AMLVALIEFCYKSRSESKRMKGFCLIPQQSINEAIRTSTLPRNSGAGASSGGSGENGRVV
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>>CCDS58988.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5               (916 aa)
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       : : .:  ..: .. :.:: .:  ::::::.:::::::::.. ..: :::::::::. :.
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       :::::.:.. :::.:.:: :. :..:.. ::::.::::.::..::.:.:: ....:...:
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       ::::: .. .  . . .: .........:.  ..::: ::.:.:: :.. : :.. ::::
CCDS58 WQVTAVNILTTTE-EGYRMLFQDLEKKKERLVVVDCESERLNAILGQIIKLEKNGIGYHY
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       .:::::: :: :..  ..:::.::::.::  . .  ...:.:   : :.  ..     ::
CCDS58 ILANLGFMDIDLNKFKESGANVTGFQLVNYTDTIPAKIMQQWKNSDARDHTRVDWKRPKY
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       :::::.:.. :.::::. :::::.:.::::.::::::::::::.:::::.:::..:. .:
CCDS58 TSALTYDGVKVMAEAFQSLRRQRIDISRRGNAGDCLANPAVPWGQGIDIQRALQQVRFEG
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pF1KB4 MTGNIQFDTYGRRTNYTIDVYEMKVSGSRKAGYWNEYERFVPF-SDQQISNDSASSENRT
       .:::.::.  :::::::. : ::: .: :: ::::: ..:::  .: : ..:..: .:::
CCDS58 LTGNVQFNEKGRRTNYTLHVIEMKHDGIRKIGYWNEDDKFVPAATDAQAGGDNSSVQNRT
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pF1KB4 IVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGDGKYGARD
        .::::::.:::: ::: .:.:::.:::::::.:: ::::::  .:.: ::.::::::::
CCDS58 YIVTTILEDPYVMLKKNANQFEGNDRYEGYCVELAAEIAKHVGYSYRLEIVSDGKYGARD
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       :.:: ::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PDTKAWNGMVGELVYGRADVAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGV
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       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :.  :: :: :.  :  ::::
CCDS58 FSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHSEEF-EEGRD-QTTSDQSNEFG
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 IFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSP
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       ::::::::::::::::::..::::::::::::::.::::.::::::::::..:: .:. :
CCDS58 IESAEDLAKQTEIAYGTLEAGSTKEFFRRSKIAVFEKMWTYMKSAEPSVFVRTTEEGMIR
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       :::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::  ::::::::
CCDS58 VRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSALRGPVNLAVLK
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       :::::.:::::.::::::::::.::::::::::::::::::::::::.:::::::.::::
CCDS58 LSEQGVLDKLKSKWWYDKGECGSKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILIGGLGLAMLVALI
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pF1KB4 EFCYKSRAESKRMKLTKNTQNFKPAPATNTQNYATYREGYNVYGTESVKI          
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CCDS58 EFCYKSRSESKRMKGFCLIPQQSINEAIRTSTLPRNSGAGASSGGSGENGRVVSHDFPKS
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>>CCDS4322.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5                (906 aa)
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Smith-Waterman score: 3973; 69.6% identity (87.2% similar) in 850 aa overlap (12-858:1-840)

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                  .. .: :.  :.::   :. :::.:.:::::  .  :::.:::::..  
CCDS43            MQHIFAFFCTGFLGAVVGANFPNNIQIGGLFPNQQSQEHAAFRFALS--
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pF1KB4 NTNQNTTEKPFHLNYHVDHLDSSNSFSVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDQMSMNTLTSFCG
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CCDS43 ----QLTEPP-KLLPQIDIVNISDSFEMTYRFCSQFSKGVYAIFGFYERRTVNMLTSFCG
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pF1KB4 ALHTSFVTPSFPTDADVQFVIQMRPALKGAILSLLGHYKWEKFVYLYDTERGFSILQAIM
       :::. :.:::::.:.. :::.:.:: :. :..:.. ::::.::::.::..::.:.:: ..
CCDS43 ALHVCFITPSFPVDTSNQFVLQLRPELQDALISIIDHYKWQKFVYIYDADRGLSVLQKVL
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pF1KB4 EAAVQNNWQVTARSVGNIKDVQEFRRIIEEMDRRQEKRYLIDCEVERINTILEQVVILGK
       ..:...:::::: .. .  . . .: .........:.  ..::: ::.:.:: :.. : :
CCDS43 DTAAEKNWQVTAVNILTTTE-EGYRMLFQDLEKKKERLVVVDCESERLNAILGQIIKLEK
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pF1KB4 HSRGYHYMLANLGFTDILLERVMHGGANITGFQIVNNENPMVQQFIQRWVRLDEREFPEA
       .. ::::.:::::: :: :..  ..:::.::::.::  . .  ...:.:   : :.  ..
CCDS43 NGIGYHYILANLGFMDIDLNKFKESGANVTGFQLVNYTDTIPAKIMQQWKNSDARDHTRV
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pF1KB4 KNAPLKYTSALTHDAILVIAEAFRYLRRQRVDVSRRGSAGDCLANPAVPWSQGIDIERAL
            :::::::.:.. :.::::. :::::.:.::::.::::::::::::.:::::.:::
CCDS43 DWKRPKYTSALTYDGVKVMAEAFQSLRRQRIDISRRGNAGDCLANPAVPWGQGIDIQRAL
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pF1KB4 KMVQVQGMTGNIQFDTYGRRTNYTIDVYEMKVSGSRKAGYWNEYERFVPF-SDQQISNDS
       ..:. .:.:::.::.  :::::::. : ::: .: :: ::::: ..:::  .: : ..:.
CCDS43 QQVRFEGLTGNVQFNEKGRRTNYTLHVIEMKHDGIRKIGYWNEDDKFVPAATDAQAGGDN
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pF1KB4 ASSENRTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGD
       .: .::: .::::::.:::: ::: .:.:::.:::::::.:: ::::::  .:.: ::.:
CCDS43 SSVQNRTYIVTTILEDPYVMLKKNANQFEGNDRYEGYCVELAAEIAKHVGYSYRLEIVSD
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pF1KB4 GKYGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKP
       ::::::::.:: ::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GKYGARDPDTKAWNGMVGELVYGRADVAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKP
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pF1KB4 QKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHLEDNNEEPRDPQSPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :.  :: :: :.  
CCDS43 QKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHSEEF-EEGRD-QTTS
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pF1KB4 DPPNEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLT
       :  :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DQSNEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLT
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pF1KB4 VERMVSPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKT
       :::::::::::::::::::::::::..::::::::::::::.::::.::::::::::..:
CCDS43 VERMVSPIESAEDLAKQTEIAYGTLEAGSTKEFFRRSKIAVFEKMWTYMKSAEPSVFVRT
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pF1KB4 TADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGTP
       : .:. ::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::: .:
CCDS43 TEEGMIRVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSALRNP
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pF1KB4 VNLAVLKLSEQGILDKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGL
       ::::::::.:::.::::::::::::::::.  . ::::::::::::::::::::.:::::
CCDS43 VNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECGSGGGDSKDKTSALSLSNVAGVFYILIGGLGL
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