Result of FASTA (ccds) for pF1KB3513
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3513, 1023 aa
  1>>>pF1KB3513 1023 - 1023 aa - 1023 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7889+/-0.00106; mu= 18.6105+/- 0.063
 mean_var=71.1349+/-14.185, 0's: 0 Z-trim(103.3): 63  B-trim: 0 in 0/49
 Lambda= 0.152066
 statistics sampled from 7269 (7331) to 7269 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.577), E-opt: 0.2 (0.225), width:  16
 Scan time:  4.480

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS887.1 ATP1A1 gene_id:476|Hs108|chr1            (1023) 6746 1490.1       0
CCDS53351.1 ATP1A1 gene_id:476|Hs108|chr1          (1023) 6718 1483.9       0
CCDS53352.1 ATP1A1 gene_id:476|Hs108|chr1          ( 992) 6535 1443.8       0
CCDS58664.1 ATP1A3 gene_id:478|Hs108|chr19         (1026) 5943 1313.9       0
CCDS1196.1 ATP1A2 gene_id:477|Hs108|chr1           (1020) 5942 1313.7       0
CCDS58663.1 ATP1A3 gene_id:478|Hs108|chr19         (1024) 5922 1309.3       0
CCDS12594.1 ATP1A3 gene_id:478|Hs108|chr19         (1013) 5919 1308.6       0
CCDS1197.1 ATP1A4 gene_id:480|Hs108|chr1           (1029) 5336 1180.7       0
CCDS12467.1 ATP4A gene_id:495|Hs108|chr19          (1035) 4428 981.5       0
CCDS31948.1 ATP12A gene_id:479|Hs108|chr13         (1039) 4411 977.8       0
CCDS53858.1 ATP12A gene_id:479|Hs108|chr13         (1045) 4389 973.0       0
CCDS44255.1 ATP1A4 gene_id:480|Hs108|chr1          ( 165)  946 217.3 2.1e-56
CCDS45580.1 ATP2A3 gene_id:489|Hs108|chr17         ( 998)  522 124.6   1e-27
CCDS45579.1 ATP2A3 gene_id:489|Hs108|chr17         ( 999)  522 124.6   1e-27
CCDS42234.1 ATP2A3 gene_id:489|Hs108|chr17         (1029)  522 124.6 1.1e-27
CCDS11041.1 ATP2A3 gene_id:489|Hs108|chr17         (1043)  522 124.6 1.1e-27
CCDS11042.1 ATP2A3 gene_id:489|Hs108|chr17         (1052)  522 124.6 1.1e-27
CCDS42207.1 ATP2C2 gene_id:9914|Hs108|chr16        ( 946)  516 123.3 2.4e-27
CCDS46913.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3        ( 888)  513 122.6 3.6e-27
CCDS56281.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3        ( 903)  513 122.6 3.7e-27
CCDS46914.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3        ( 919)  513 122.6 3.7e-27
CCDS56280.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3        ( 923)  513 122.6 3.8e-27
CCDS46912.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3        ( 939)  513 122.6 3.8e-27
CCDS56279.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3        ( 944)  513 122.6 3.8e-27
CCDS33856.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3        ( 949)  513 122.6 3.8e-27
CCDS75006.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3        ( 953)  513 122.6 3.9e-27
CCDS56278.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3        ( 973)  513 122.6 3.9e-27
CCDS9144.1 ATP2A2 gene_id:488|Hs108|chr12          (1042)  493 118.3 8.7e-26
CCDS9143.1 ATP2A2 gene_id:488|Hs108|chr12          ( 997)  490 117.6 1.3e-25
CCDS66997.1 ATP2A1 gene_id:487|Hs108|chr16         ( 869)  488 117.1 1.6e-25
CCDS42139.1 ATP2A1 gene_id:487|Hs108|chr16         ( 994)  488 117.2 1.8e-25
CCDS10643.1 ATP2A1 gene_id:487|Hs108|chr16         (1001)  488 117.2 1.8e-25
CCDS67088.1 ATP2C2 gene_id:9914|Hs108|chr16        ( 975)  464 111.9 6.8e-24
CCDS30977.1 ATP2B4 gene_id:493|Hs108|chr1          (1170)  408 99.6   4e-20
CCDS1440.1 ATP2B4 gene_id:493|Hs108|chr1           (1205)  408 99.6 4.1e-20
CCDS82733.1 ATP2B2 gene_id:491|Hs108|chr3          (1154)  405 99.0 6.2e-20
CCDS41817.1 ATP2B1 gene_id:490|Hs108|chr12         (1176)  405 99.0 6.3e-20
CCDS2601.1 ATP2B2 gene_id:491|Hs108|chr3           (1198)  405 99.0 6.4e-20
CCDS9035.1 ATP2B1 gene_id:490|Hs108|chr12          (1220)  405 99.0 6.5e-20
CCDS33701.1 ATP2B2 gene_id:491|Hs108|chr3          (1243)  405 99.0 6.6e-20
CCDS14722.1 ATP2B3 gene_id:492|Hs108|chrX          (1173)  401 98.1 1.2e-19
CCDS35440.1 ATP2B3 gene_id:492|Hs108|chrX          (1220)  401 98.1 1.2e-19


>>CCDS887.1 ATP1A1 gene_id:476|Hs108|chr1                 (1023 aa)
 initn: 6746 init1: 6746 opt: 6746  Z-score: 7990.4  bits: 1490.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6746; 100.0% identity (100.0% similar) in 1023 aa overlap (1-1023:1-1023)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MGKGVGRDKYEPAAVSEQGDKKGKKGKKDRDMDELKKEVSMDDHKLSLDELHRKYGTDLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 MGKGVGRDKYEPAAVSEQGDKKGKKGKKDRDMDELKKEVSMDDHKLSLDELHRKYGTDLS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 RGLTSARAAEILARDGPNALTPPPTTPEWIKFCRQLFGGFSMLLWIGAILCFLAYSIQAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 RGLTSARAAEILARDGPNALTPPPTTPEWIKFCRQLFGGFSMLLWIGAILCFLAYSIQAA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 TEEEPQNDNLYLGVVLSAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIRNGEKMSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 TEEEPQNDNLYLGVVLSAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIRNGEKMSI
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 NAEEVVVGDLVEVKGGDRIPADLRIISANGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDFTNENPLETR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 NAEEVVVGDLVEVKGGDRIPADLRIISANGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDFTNENPLETR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 NIAFFSTNCVEGTARGIVVYTGDRTVMGRIATLASGLEGGQTPIAAEIEHFIHIITGVAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 NIAFFSTNCVEGTARGIVVYTGDRTVMGRIATLASGLEGGQTPIAAEIEHFIHIITGVAV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 FLGVSFFILSLILEYTWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 FLGVSFFILSLILEYTWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 LEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTENQSGVSFDKTSATWLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 LEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTENQSGVSFDKTSATWLA
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 LSRIAGLCNRAVFQANQENLPILKRAVAGDASESALLKCIELCCGSVKEMRERYAKIVEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 LSRIAGLCNRAVFQANQENLPILKRAVAGDASESALLKCIELCCGSVKEMRERYAKIVEI
              430       440       450       460       470       480

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pF1KB3 PFNSTNKYQLSIHKNPNTSEPQHLLVMKGAPERILDRCSSILLHGKEQPLDEELKDAFQN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 PFNSTNKYQLSIHKNPNTSEPQHLLVMKGAPERILDRCSSILLHGKEQPLDEELKDAFQN
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 AYLELGGLGERVLGFCHLFLPDEQFPEGFQFDTDDVNFPIDNLCFVGLISMIDPPRAAVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 AYLELGGLGERVLGFCHLFLPDEQFPEGFQFDTDDVNFPIDNLCFVGLISMIDPPRAAVP
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB3 DAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVSQVNPRDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 DAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVSQVNPRDA
              610       620       630       640       650       660

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pF1KB3 KACVVHGSDLKDMTSEQLDDILKYHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 KACVVHGSDLKDMTSEQLDDILKYHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGVN
              670       680       690       700       710       720

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pF1KB3 DSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 DSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTL
              730       740       750       760       770       780

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pF1KB3 TSNIPEITPFLIFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEQAESDIMKRQPRNPK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 TSNIPEITPFLIFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEQAESDIMKRQPRNPK
              790       800       810       820       830       840

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pF1KB3 TDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPIHLLGLRVDWDDRWINDVED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 TDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPIHLLGLRVDWDDRWINDVED
              850       860       870       880       890       900

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pF1KB3 SYGQQWTYEQRKIVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLVICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLFE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 SYGQQWTYEQRKIVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLVICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLFE
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB3 ETALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKPTWWFCAFPYSLLIFVYDEVRKLIIRRRPGGWVEKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 ETALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKPTWWFCAFPYSLLIFVYDEVRKLIIRRRPGGWVEKE
              970       980       990      1000      1010      1020

          
pF1KB3 TYY
       :::
CCDS88 TYY
          

>>CCDS53351.1 ATP1A1 gene_id:476|Hs108|chr1               (1023 aa)
 initn: 6717 init1: 6717 opt: 6718  Z-score: 7957.2  bits: 1483.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6718; 99.7% identity (99.8% similar) in 1023 aa overlap (1-1023:1-1023)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MGKGVGRDKYEPAAVSEQGDKKGKKGKKDRDMDELKKEVSMDDHKLSLDELHRKYGTDLS
       :.  ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MAFKVGRDKYEPAAVSEQGDKKGKKGKKDRDMDELKKEVSMDDHKLSLDELHRKYGTDLS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 RGLTSARAAEILARDGPNALTPPPTTPEWIKFCRQLFGGFSMLLWIGAILCFLAYSIQAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RGLTSARAAEILARDGPNALTPPPTTPEWIKFCRQLFGGFSMLLWIGAILCFLAYSIQAA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 TEEEPQNDNLYLGVVLSAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIRNGEKMSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TEEEPQNDNLYLGVVLSAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIRNGEKMSI
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 NAEEVVVGDLVEVKGGDRIPADLRIISANGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDFTNENPLETR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NAEEVVVGDLVEVKGGDRIPADLRIISANGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDFTNENPLETR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 NIAFFSTNCVEGTARGIVVYTGDRTVMGRIATLASGLEGGQTPIAAEIEHFIHIITGVAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NIAFFSTNCVEGTARGIVVYTGDRTVMGRIATLASGLEGGQTPIAAEIEHFIHIITGVAV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 FLGVSFFILSLILEYTWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 FLGVSFFILSLILEYTWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKN
              310       320       330       340       350       360

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pF1KB3 LEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTENQSGVSFDKTSATWLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTENQSGVSFDKTSATWLA
              370       380       390       400       410       420

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pF1KB3 LSRIAGLCNRAVFQANQENLPILKRAVAGDASESALLKCIELCCGSVKEMRERYAKIVEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LSRIAGLCNRAVFQANQENLPILKRAVAGDASESALLKCIELCCGSVKEMRERYAKIVEI
              430       440       450       460       470       480

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pF1KB3 PFNSTNKYQLSIHKNPNTSEPQHLLVMKGAPERILDRCSSILLHGKEQPLDEELKDAFQN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PFNSTNKYQLSIHKNPNTSEPQHLLVMKGAPERILDRCSSILLHGKEQPLDEELKDAFQN
              490       500       510       520       530       540

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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 AYLELGGLGERVLGFCHLFLPDEQFPEGFQFDTDDVNFPIDNLCFVGLISMIDPPRAAVP
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVSQVNPRDA
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KACVVHGSDLKDMTSEQLDDILKYHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGVN
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTL
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pF1KB3 TSNIPEITPFLIFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEQAESDIMKRQPRNPK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TSNIPEITPFLIFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEQAESDIMKRQPRNPK
              790       800       810       820       830       840

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pF1KB3 TDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPIHLLGLRVDWDDRWINDVED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPIHLLGLRVDWDDRWINDVED
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pF1KB3 SYGQQWTYEQRKIVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLVICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLFE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SYGQQWTYEQRKIVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLVICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLFE
              910       920       930       940       950       960

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pF1KB3 ETALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKPTWWFCAFPYSLLIFVYDEVRKLIIRRRPGGWVEKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ETALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKPTWWFCAFPYSLLIFVYDEVRKLIIRRRPGGWVEKE
              970       980       990      1000      1010      1020

          
pF1KB3 TYY
       :::
CCDS53 TYY
          

>>CCDS53352.1 ATP1A1 gene_id:476|Hs108|chr1               (992 aa)
 initn: 6535 init1: 6535 opt: 6535  Z-score: 7740.5  bits: 1443.8 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6535; 100.0% identity (100.0% similar) in 992 aa overlap (32-1023:1-992)

              10        20        30        40        50        60 
pF1KB3 GKGVGRDKYEPAAVSEQGDKKGKKGKKDRDMDELKKEVSMDDHKLSLDELHRKYGTDLSR
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53                               MDELKKEVSMDDHKLSLDELHRKYGTDLSR
                                             10        20        30

              70        80        90       100       110       120 
pF1KB3 GLTSARAAEILARDGPNALTPPPTTPEWIKFCRQLFGGFSMLLWIGAILCFLAYSIQAAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GLTSARAAEILARDGPNALTPPPTTPEWIKFCRQLFGGFSMLLWIGAILCFLAYSIQAAT
               40        50        60        70        80        90

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pF1KB3 EEEPQNDNLYLGVVLSAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIRNGEKMSIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EEEPQNDNLYLGVVLSAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIRNGEKMSIN
              100       110       120       130       140       150

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pF1KB3 AEEVVVGDLVEVKGGDRIPADLRIISANGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDFTNENPLETRN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 AEEVVVGDLVEVKGGDRIPADLRIISANGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDFTNENPLETRN
              160       170       180       190       200       210

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pF1KB3 IAFFSTNCVEGTARGIVVYTGDRTVMGRIATLASGLEGGQTPIAAEIEHFIHIITGVAVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 IAFFSTNCVEGTARGIVVYTGDRTVMGRIATLASGLEGGQTPIAAEIEHFIHIITGVAVF
              220       230       240       250       260       270

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pF1KB3 LGVSFFILSLILEYTWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LGVSFFILSLILEYTWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKNL
              280       290       300       310       320       330

             370       380       390       400       410       420 
pF1KB3 EAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTENQSGVSFDKTSATWLAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTENQSGVSFDKTSATWLAL
              340       350       360       370       380       390

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pF1KB3 SRIAGLCNRAVFQANQENLPILKRAVAGDASESALLKCIELCCGSVKEMRERYAKIVEIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SRIAGLCNRAVFQANQENLPILKRAVAGDASESALLKCIELCCGSVKEMRERYAKIVEIP
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             490       500       510       520       530       540 
pF1KB3 FNSTNKYQLSIHKNPNTSEPQHLLVMKGAPERILDRCSSILLHGKEQPLDEELKDAFQNA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 FNSTNKYQLSIHKNPNTSEPQHLLVMKGAPERILDRCSSILLHGKEQPLDEELKDAFQNA
              460       470       480       490       500       510

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pF1KB3 YLELGGLGERVLGFCHLFLPDEQFPEGFQFDTDDVNFPIDNLCFVGLISMIDPPRAAVPD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YLELGGLGERVLGFCHLFLPDEQFPEGFQFDTDDVNFPIDNLCFVGLISMIDPPRAAVPD
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pF1KB3 AVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVSQVNPRDAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 AVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVSQVNPRDAK
              580       590       600       610       620       630

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pF1KB3 ACVVHGSDLKDMTSEQLDDILKYHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGVND
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ACVVHGSDLKDMTSEQLDDILKYHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGVND
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pF1KB3 SPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTLT
              700       710       720       730       740       750

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pF1KB3 SNIPEITPFLIFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEQAESDIMKRQPRNPKT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SNIPEITPFLIFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEQAESDIMKRQPRNPKT
              760       770       780       790       800       810

             850       860       870       880       890       900 
pF1KB3 DKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPIHLLGLRVDWDDRWINDVEDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPIHLLGLRVDWDDRWINDVEDS
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             910       920       930       940       950       960 
pF1KB3 YGQQWTYEQRKIVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLVICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLFEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YGQQWTYEQRKIVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLVICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLFEE
              880       890       900       910       920       930

             970       980       990      1000      1010      1020 
pF1KB3 TALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKPTWWFCAFPYSLLIFVYDEVRKLIIRRRPGGWVEKET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKPTWWFCAFPYSLLIFVYDEVRKLIIRRRPGGWVEKET
              940       950       960       970       980       990

         
pF1KB3 YY
       ::
CCDS53 YY
         

>>CCDS58664.1 ATP1A3 gene_id:478|Hs108|chr19              (1026 aa)
 initn: 5919 init1: 5919 opt: 5943  Z-score: 7038.3  bits: 1313.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5943; 86.4% identity (95.7% similar) in 1027 aa overlap (1-1023:1-1026)

               10        20            30        40        50      
pF1KB3 MGKGVGRDKYEPAAVSEQGDKKGK----KGKKDRDMDELKKEVSMDDHKLSLDELHRKYG
       ::.: : :.:. :. ... : : .    :::. ::.:.:::::.: .::.:..:. :::.
CCDS58 MGSG-GSDSYRIATSQDKKDDKDSPKKNKGKERRDLDDLKKEVAMTEHKMSVEEVCRKYN
                10        20        30        40        50         

         60        70        80        90       100       110      
pF1KB3 TDLSRGLTSARAAEILARDGPNALTPPPTTPEWIKFCRQLFGGFSMLLWIGAILCFLAYS
       ::  .::: ..: ::::::::::::::::::::.:::::::::::.:::::::::::::.
CCDS58 TDCVQGLTHSKAQEILARDGPNALTPPPTTPEWVKFCRQLFGGFSILLWIGAILCFLAYG
      60        70        80        90       100       110         

        120       130       140       150       160       170      
pF1KB3 IQAATEEEPQNDNLYLGVVLSAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIRNGE
       :::.::..:..::::::.::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS58 IQAGTEDDPSGDNLYLGIVLAAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIREGE
     120       130       140       150       160       170         

        180       190       200       210       220       230      
pF1KB3 KMSINAEEVVVGDLVEVKGGDRIPADLRIISANGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDFTNENP
       ::..::::::::::::.:::::.:::::::::.::::::::::::::::::::: :..::
CCDS58 KMQVNAEEVVVGDLVEIKGGDRVPADLRIISAHGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDCTHDNP
     180       190       200       210       220       230         

        240       250       260       270       280       290      
pF1KB3 LETRNIAFFSTNCVEGTARGIVVYTGDRTVMGRIATLASGLEGGQTPIAAEIEHFIHIIT
       ::::::.:::::::::::::.:: :::::::::::::::::: :.:::: ::::::..::
CCDS58 LETRNITFFSTNCVEGTARGVVVATGDRTVMGRIATLASGLEVGKTPIAIEIEHFIQLIT
     240       250       260       270       280       290         

        300       310       320       330       340       350      
pF1KB3 GVAVFLGVSFFILSLILEYTWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNC
       ::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GVAVFLGVSFFILSLILGYTWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNC
     300       310       320       330       340       350         

        360       370       380       390       400       410      
pF1KB3 LVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTENQSGVSFDKTSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::.: 
CCDS58 LVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTEDQSGTSFDKSSH
     360       370       380       390       400       410         

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pF1KB3 TWLALSRIAGLCNRAVFQANQENLPILKRAVAGDASESALLKCIELCCGSVKEMRERYAK
       ::.:::.::::::::::...:.:.:.::: ::::::::::::::::  :::: ::::  :
CCDS58 TWVALSHIAGLCNRAVFKGGQDNIPVLKRDVAGDASESALLKCIELSSGSVKLMRERNKK
     420       430       440       450       460       470         

        480       490       500       510       520       530      
pF1KB3 IVEIPFNSTNKYQLSIHKNPNTSEPQHLLVMKGAPERILDRCSSILLHGKEQPLDEELKD
       ..:::::::::::::::.. . .. ..::::::::::::::::.:::.:::::::::.:.
CCDS58 VAEIPFNSTNKYQLSIHETEDPNDNRYLLVMKGAPERILDRCSTILLQGKEQPLDEEMKE
     480       490       500       510       520       530         

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pF1KB3 AFQNAYLELGGLGERVLGFCHLFLPDEQFPEGFQFDTDDVNFPIDNLCFVGLISMIDPPR
       ::::::::::::::::::::: .::.::::.:: :: :::::  ::::::::.:::::::
CCDS58 AFQNAYLELGGLGERVLGFCHYYLPEEQFPKGFAFDCDDVNFTTDNLCFVGLMSMIDPPR
     540       550       560       570       580       590         

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pF1KB3 AAVPDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVSQVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AAVPDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVSQVN
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pF1KB3 PRDAKACVVHGSDLKDMTSEQLDDILKYHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTG
       ::::::::.::.::::.::::.:.::. ::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PRDAKACVIHGTDLKDFTSEQIDEILQNHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTG
     660       670       680       690       700       710         

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pF1KB3 DGVNDSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DGVNDSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSI
     720       730       740       750       760       770         

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pF1KB3 AYTLTSNIPEITPFLIFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEQAESDIMKRQP
       :::::::::::::::.::.:::::::::.:::::::::::::::::::: ::::::::::
CCDS58 AYTLTSNIPEITPFLLFIMANIPLPLGTITILCIDLGTDMVPAISLAYEAAESDIMKRQP
     780       790       800       810       820       830         

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pF1KB3 RNPKTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPIHLLGLRVDWDDRWIN
       :::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::: .:.:.:..:::: .:
CCDS58 RNPRTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFSYFVILAENGFLPGNLVGIRLNWDDRTVN
     840       850       860       870       880       890         

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pF1KB3 DVEDSYGQQWTYEQRKIVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLVICKTRRNSVFQQGMKNKILIF
       :.::::::::::::::.:::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS58 DLEDSYGQQWTYEQRKVVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLIICKTRRNSVFQQGMKNKILIF
     900       910       920       930       940       950         

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pF1KB3 GLFEETALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKPTWWFCAFPYSLLIFVYDEVRKLIIRRRPGGW
       :::::::::::::::::: ::::::::::.:::::::::.:::::::.::::.:: ::::
CCDS58 GLFEETALAAFLSYCPGMDVALRMYPLKPSWWFCAFPYSFLIFVYDEIRKLILRRNPGGW
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       1020   
pF1KB3 VEKETYY
       :::::::
CCDS58 VEKETYY
    1020      

>>CCDS1196.1 ATP1A2 gene_id:477|Hs108|chr1                (1020 aa)
 initn: 3207 init1: 3207 opt: 5942  Z-score: 7037.2  bits: 1313.7 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5942; 86.9% identity (95.9% similar) in 1024 aa overlap (1-1023:1-1020)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MGKGVGRDKYEPAAVSEQGDKKGKKGKKDRDMDELKKEVSMDDHKLSLDELHRKYGTDLS
       ::.:.::. : :::.. . .  ::: .:....:::::::.::::::::::: ::: .:::
CCDS11 MGRGAGRE-YSPAATTAE-NGGGKKKQKEKELDELKKEVAMDDHKLSLDELGRKYQVDLS
                10         20        30        40        50        

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 RGLTSARAAEILARDGPNALTPPPTTPEWIKFCRQLFGGFSMLLWIGAILCFLAYSIQAA
       .:::. :: ..::::::::::::::::::.:::::::::::.:::::::::::::.::::
CCDS11 KGLTNQRAQDVLARDGPNALTPPPTTPEWVKFCRQLFGGFSILLWIGAILCFLAYGIQAA
       60        70        80        90       100       110        

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pF1KB3 TEEEPQNDNLYLGVVLSAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIRNGEKMSI
        :.::.::::::::::.::::.::::::::::::::::.::::::::::::::.::::.:
CCDS11 MEDEPSNDNLYLGVVLAAVVIVTGCFSYYQEAKSSKIMDSFKNMVPQQALVIREGEKMQI
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pF1KB3 NAEEVVVGDLVEVKGGDRIPADLRIISANGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDFTNENPLETR
       ::::::::::::::::::.::::::::..::::::::::::::::::::.::.:::::::
CCDS11 NAEEVVVGDLVEVKGGDRVPADLRIISSHGCKVDNSSLTGESEPQTRSPEFTHENPLETR
      180       190       200       210       220       230        

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pF1KB3 NIAFFSTNCVEGTARGIVVYTGDRTVMGRIATLASGLEGGQTPIAAEIEHFIHIITGVAV
       :: :::::::::::::::. :::::::::::::::::: :.:::: ::::::..::::::
CCDS11 NICFFSTNCVEGTARGIVIATGDRTVMGRIATLASGLEVGRTPIAMEIEHFIQLITGVAV
      240       250       260       270       280       290        

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pF1KB3 FLGVSFFILSLILEYTWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKN
       :::::::.::::: :.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FLGVSFFVLSLILGYSWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKN
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pF1KB3 LEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTENQSGVSFDKTSATWLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::..::: : :: :
CCDS11 LEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTEDQSGATFDKRSPTWTA
      360       370       380       390       400       410        

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pF1KB3 LSRIAGLCNRAVFQANQENLPILKRAVAGDASESALLKCIELCCGSVKEMRERYAKIVEI
       :::::::::::::.:.:::. . :: .::::::::::::::: ::::..::.:  :..::
CCDS11 LSRIAGLCNRAVFKAGQENISVSKRDTAGDASESALLKCIELSCGSVRKMRDRNPKVAEI
      420       430       440       450       460       470        

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pF1KB3 PFNSTNKYQLSIHKNPNTSEPQ-HLLVMKGAPERILDRCSSILLHGKEQPLDEELKDAFQ
       :::::::::::::.  ..  :: :.:::::::::::::::.::..::: :::.:..::::
CCDS11 PFNSTNKYQLSIHEREDS--PQSHVLVMKGAPERILDRCSTILVQGKEIPLDKEMQDAFQ
      480       490         500       510       520       530      

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pF1KB3 NAYLELGGLGERVLGFCHLFLPDEQFPEGFQFDTDDVNFPIDNLCFVGLISMIDPPRAAV
       :::.:::::::::::::.: ::. .::.::.::::..::: ..::::::.::::::::::
CCDS11 NAYMELGGLGERVLGFCQLNLPSGKFPRGFKFDTDELNFPTEKLCFVGLMSMIDPPRAAV
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pF1KB3 PDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVSQVNPRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.
CCDS11 PDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPMSQVNPRE
        600       610       620       630       640       650      

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pF1KB3 AKACVVHGSDLKDMTSEQLDDILKYHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGV
       ::::::::::::::::::::.::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AKACVVHGSDLKDMTSEQLDEILKNHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGV
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pF1KB3 NDSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYT
       ::::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NDSPALKKADIGIAMGISGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYT
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pF1KB3 LTSNIPEITPFLIFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEQAESDIMKRQPRNP
       ::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::: 
CCDS11 LTSNIPEITPFLLFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEAAESDIMKRQPRNS
        780       790       800       810       820       830      

     840       850       860       870       880       890         
pF1KB3 KTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPIHLLGLRVDWDDRWINDVE
       .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .:::.:.::::: .::.:
CCDS11 QTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPSRLLGIRLDWDDRTMNDLE
        840       850       860       870       880       890      

     900       910       920       930       940       950         
pF1KB3 DSYGQQWTYEQRKIVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLVICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLF
       :::::.:::::::.::::::::::.::::::::::.:::::::::::::::::::::::.
CCDS11 DSYGQEWTYEQRKVVEFTCHTAFFASIVVVQWADLIICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLL
        900       910       920       930       940       950      

     960       970       980       990      1000      1010         
pF1KB3 EETALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKPTWWFCAFPYSLLIFVYDEVRKLIIRRRPGGWVEK
       ::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::.::::::::.:: :::::::
CCDS11 EETALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKVTWWFCAFPYSLLIFIYDEVRKLILRRYPGGWVEK
        960       970       980       990      1000      1010      

    1020   
pF1KB3 ETYY
       ::::
CCDS11 ETYY
       1020

>>CCDS58663.1 ATP1A3 gene_id:478|Hs108|chr19              (1024 aa)
 initn: 5919 init1: 5919 opt: 5922  Z-score: 7013.4  bits: 1309.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5922; 87.1% identity (96.2% similar) in 1013 aa overlap (14-1023:12-1024)

               10        20           30        40        50       
pF1KB3 MGKGVGRDKYEPAAVSEQGDK---KGKKGKKDRDMDELKKEVSMDDHKLSLDELHRKYGT
                    :.... ::   : .:::. ::.:.:::::.: .::.:..:. :::.:
CCDS58   MGGWEEERNRRATDKKDDKDSPKKNKGKERRDLDDLKKEVAMTEHKMSVEEVCRKYNT
                 10        20        30        40        50        

        60        70        80        90       100       110       
pF1KB3 DLSRGLTSARAAEILARDGPNALTPPPTTPEWIKFCRQLFGGFSMLLWIGAILCFLAYSI
       :  .::: ..: ::::::::::::::::::::.:::::::::::.:::::::::::::.:
CCDS58 DCVQGLTHSKAQEILARDGPNALTPPPTTPEWVKFCRQLFGGFSILLWIGAILCFLAYGI
       60        70        80        90       100       110        

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB3 QAATEEEPQNDNLYLGVVLSAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIRNGEK
       ::.::..:..::::::.::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS58 QAGTEDDPSGDNLYLGIVLAAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIREGEK
      120       130       140       150       160       170        

       180       190       200       210       220       230       
pF1KB3 MSINAEEVVVGDLVEVKGGDRIPADLRIISANGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDFTNENPL
       :..::::::::::::.:::::.:::::::::.::::::::::::::::::::: :..:::
CCDS58 MQVNAEEVVVGDLVEIKGGDRVPADLRIISAHGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDCTHDNPL
      180       190       200       210       220       230        

       240       250       260       270       280       290       
pF1KB3 ETRNIAFFSTNCVEGTARGIVVYTGDRTVMGRIATLASGLEGGQTPIAAEIEHFIHIITG
       :::::.:::::::::::::.:: :::::::::::::::::: :.:::: ::::::..:::
CCDS58 ETRNITFFSTNCVEGTARGVVVATGDRTVMGRIATLASGLEVGKTPIAIEIEHFIQLITG
      240       250       260       270       280       290        

       300       310       320       330       340       350       
pF1KB3 VAVFLGVSFFILSLILEYTWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCL
       :::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VAVFLGVSFFILSLILGYTWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCL
      300       310       320       330       340       350        

       360       370       380       390       400       410       
pF1KB3 VKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTENQSGVSFDKTSAT
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::.: :
CCDS58 VKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTEDQSGTSFDKSSHT
      360       370       380       390       400       410        

       420       430       440       450       460       470       
pF1KB3 WLALSRIAGLCNRAVFQANQENLPILKRAVAGDASESALLKCIELCCGSVKEMRERYAKI
       :.:::.::::::::::...:.:.:.::: ::::::::::::::::  :::: ::::  :.
CCDS58 WVALSHIAGLCNRAVFKGGQDNIPVLKRDVAGDASESALLKCIELSSGSVKLMRERNKKV
      420       430       440       450       460       470        

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pF1KB3 VEIPFNSTNKYQLSIHKNPNTSEPQHLLVMKGAPERILDRCSSILLHGKEQPLDEELKDA
       .:::::::::::::::.. . .. ..::::::::::::::::.:::.:::::::::.:.:
CCDS58 AEIPFNSTNKYQLSIHETEDPNDNRYLLVMKGAPERILDRCSTILLQGKEQPLDEEMKEA
      480       490       500       510       520       530        

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pF1KB3 FQNAYLELGGLGERVLGFCHLFLPDEQFPEGFQFDTDDVNFPIDNLCFVGLISMIDPPRA
       :::::::::::::::::::: .::.::::.:: :: :::::  ::::::::.::::::::
CCDS58 FQNAYLELGGLGERVLGFCHYYLPEEQFPKGFAFDCDDVNFTTDNLCFVGLMSMIDPPRA
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pF1KB3 AVPDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVSQVNP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AVPDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVSQVNP
      600       610       620       630       640       650        

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pF1KB3 RDAKACVVHGSDLKDMTSEQLDDILKYHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGD
       :::::::.::.::::.::::.:.::. :::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RDAKACVIHGTDLKDFTSEQIDEILQNHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGD
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pF1KB3 GVNDSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GVNDSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIA
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pF1KB3 YTLTSNIPEITPFLIFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEQAESDIMKRQPR
       ::::::::::::::.::.:::::::::.:::::::::::::::::::: :::::::::::
CCDS58 YTLTSNIPEITPFLLFIMANIPLPLGTITILCIDLGTDMVPAISLAYEAAESDIMKRQPR
      780       790       800       810       820       830        

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pF1KB3 NPKTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPIHLLGLRVDWDDRWIND
       ::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::: .:.:.:..:::: .::
CCDS58 NPRTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFSYFVILAENGFLPGNLVGIRLNWDDRTVND
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pF1KB3 VEDSYGQQWTYEQRKIVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLVICKTRRNSVFQQGMKNKILIFG
       .::::::::::::::.:::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS58 LEDSYGQQWTYEQRKVVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLIICKTRRNSVFQQGMKNKILIFG
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pF1KB3 LFEETALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKPTWWFCAFPYSLLIFVYDEVRKLIIRRRPGGWV
       ::::::::::::::::: ::::::::::.:::::::::.:::::::.::::.:: :::::
CCDS58 LFEETALAAFLSYCPGMDVALRMYPLKPSWWFCAFPYSFLIFVYDEIRKLILRRNPGGWV
      960       970       980       990      1000      1010        

      1020   
pF1KB3 EKETYY
       ::::::
CCDS58 EKETYY
     1020    

>>CCDS12594.1 ATP1A3 gene_id:478|Hs108|chr19              (1013 aa)
 initn: 5919 init1: 5919 opt: 5919  Z-score: 7010.0  bits: 1308.6 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5919; 87.3% identity (96.4% similar) in 1007 aa overlap (17-1023:7-1013)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MGKGVGRDKYEPAAVSEQGDKKGKKGKKDRDMDELKKEVSMDDHKLSLDELHRKYGTDLS
                       .. . : .:::. ::.:.:::::.: .::.:..:. :::.::  
CCDS12           MGDKKDDKDSPKKNKGKERRDLDDLKKEVAMTEHKMSVEEVCRKYNTDCV
                         10        20        30        40        50

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pF1KB3 RGLTSARAAEILARDGPNALTPPPTTPEWIKFCRQLFGGFSMLLWIGAILCFLAYSIQAA
       .::: ..: ::::::::::::::::::::.:::::::::::.:::::::::::::.:::.
CCDS12 QGLTHSKAQEILARDGPNALTPPPTTPEWVKFCRQLFGGFSILLWIGAILCFLAYGIQAG
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pF1KB3 TEEEPQNDNLYLGVVLSAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIRNGEKMSI
       ::..:..::::::.::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::..
CCDS12 TEDDPSGDNLYLGIVLAAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIREGEKMQV
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pF1KB3 NAEEVVVGDLVEVKGGDRIPADLRIISANGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDFTNENPLETR
       ::::::::::::.:::::.:::::::::.::::::::::::::::::::: :..::::::
CCDS12 NAEEVVVGDLVEIKGGDRVPADLRIISAHGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDCTHDNPLETR
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pF1KB3 NIAFFSTNCVEGTARGIVVYTGDRTVMGRIATLASGLEGGQTPIAAEIEHFIHIITGVAV
       ::.:::::::::::::.:: :::::::::::::::::: :.:::: ::::::..::::::
CCDS12 NITFFSTNCVEGTARGVVVATGDRTVMGRIATLASGLEVGKTPIAIEIEHFIQLITGVAV
              240       250       260       270       280       290

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pF1KB3 FLGVSFFILSLILEYTWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKN
       ::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FLGVSFFILSLILGYTWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKN
              300       310       320       330       340       350

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pF1KB3 LEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTENQSGVSFDKTSATWLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::.: ::.:
CCDS12 LEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTEDQSGTSFDKSSHTWVA
              360       370       380       390       400       410

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pF1KB3 LSRIAGLCNRAVFQANQENLPILKRAVAGDASESALLKCIELCCGSVKEMRERYAKIVEI
       ::.::::::::::...:.:.:.::: ::::::::::::::::  :::: ::::  :..::
CCDS12 LSHIAGLCNRAVFKGGQDNIPVLKRDVAGDASESALLKCIELSSGSVKLMRERNKKVAEI
              420       430       440       450       460       470

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pF1KB3 PFNSTNKYQLSIHKNPNTSEPQHLLVMKGAPERILDRCSSILLHGKEQPLDEELKDAFQN
       :::::::::::::.. . .. ..::::::::::::::::.:::.:::::::::.:.::::
CCDS12 PFNSTNKYQLSIHETEDPNDNRYLLVMKGAPERILDRCSTILLQGKEQPLDEEMKEAFQN
              480       490       500       510       520       530

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pF1KB3 AYLELGGLGERVLGFCHLFLPDEQFPEGFQFDTDDVNFPIDNLCFVGLISMIDPPRAAVP
       ::::::::::::::::: .::.::::.:: :: :::::  ::::::::.:::::::::::
CCDS12 AYLELGGLGERVLGFCHYYLPEEQFPKGFAFDCDDVNFTTDNLCFVGLMSMIDPPRAAVP
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pF1KB3 DAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVSQVNPRDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVSQVNPRDA
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pF1KB3 KACVVHGSDLKDMTSEQLDDILKYHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGVN
       ::::.::.::::.::::.:.::. ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KACVIHGTDLKDFTSEQIDEILQNHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGVN
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pF1KB3 DSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTL
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pF1KB3 TSNIPEITPFLIFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEQAESDIMKRQPRNPK
       :::::::::::.::.:::::::::.:::::::::::::::::::: :::::::::::::.
CCDS12 TSNIPEITPFLLFIMANIPLPLGTITILCIDLGTDMVPAISLAYEAAESDIMKRQPRNPR
              780       790       800       810       820       830

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pF1KB3 TDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPIHLLGLRVDWDDRWINDVED
       :::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::: .:.:.:..:::: .::.::
CCDS12 TDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFSYFVILAENGFLPGNLVGIRLNWDDRTVNDLED
              840       850       860       870       880       890

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pF1KB3 SYGQQWTYEQRKIVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLVICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLFE
       ::::::::::::.:::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SYGQQWTYEQRKVVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLIICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLFE
              900       910       920       930       940       950

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pF1KB3 ETALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKPTWWFCAFPYSLLIFVYDEVRKLIIRRRPGGWVEKE
       :::::::::::::: ::::::::::.:::::::::.:::::::.::::.:: ::::::::
CCDS12 ETALAAFLSYCPGMDVALRMYPLKPSWWFCAFPYSFLIFVYDEIRKLILRRNPGGWVEKE
              960       970       980       990      1000      1010

          
pF1KB3 TYY
       :::
CCDS12 TYY
          

>>CCDS1197.1 ATP1A4 gene_id:480|Hs108|chr1                (1029 aa)
 initn: 5056 init1: 2595 opt: 5336  Z-score: 6318.6  bits: 1180.7 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5336; 79.6% identity (92.7% similar) in 1000 aa overlap (24-1023:32-1029)

                      10        20        30        40        50   
pF1KB3        MGKGVGRDKYEPAAVSEQGDKKGKKGKKDRDMDELKKEVSMDDHKLSLDELHR
                                     :. :. :.:.:::::: ::::::.:.::  
CCDS11 GLWGKKGTVAPHDQSPRRRPKKGLIKKKMVKREKQKRNMEELKKEVVMDDHKLTLEELST
              10        20        30        40        50        60 

            60        70        80        90       100       110   
pF1KB3 KYGTDLSRGLTSARAAEILARDGPNALTPPPTTPEWIKFCRQLFGGFSMLLWIGAILCFL
       ::..::..: .  :: :::.: :::..:::::::::.:::.:::::::.::: ::::::.
CCDS11 KYSVDLTKGHSHQRAKEILTRGGPNTVTPPPTTPEWVKFCKQLFGGFSLLLWTGAILCFV
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pF1KB3 AYSIQAATEEEPQNDNLYLGVVLSAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIR
       :::::   .::: .:::::..:::.:::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AYSIQIYFNEEPTKDNLYLSIVLSVVVIVTGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIR
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pF1KB3 NGEKMSINAEEVVVGDLVEVKGGDRIPADLRIISANGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDFTN
       .::::.::..:::.:::::.:::::.:::::.:::.::::::::::::::::.::::::.
CCDS11 GGEKMQINVQEVVLGDLVEIKGGDRVPADLRLISAQGCKVDNSSLTGESEPQSRSPDFTH
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pF1KB3 ENPLETRNIAFFSTNCVEGTARGIVVYTGDRTVMGRIATLASGLEGGQTPIAAEIEHFIH
       ::::::::: :::::::::::::::. ::: :::::::.:.:::  ::::::::::::::
CCDS11 ENPLETRNICFFSTNCVEGTARGIVIATGDSTVMGRIASLTSGLAVGQTPIAAEIEHFIH
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       .:: :::::::.:: :::.: : ::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LITVVAVFLGVTFFALSLLLGYGWLEAIIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMAR
             310       320       330       340       350       360 

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pF1KB3 KNCLVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTENQSGVSFDK
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::  ..::::::.:.: .: :
CCDS11 KNCLVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDMTVYEADTTEEQTGKTFTK
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pF1KB3 TSATWLALSRIAGLCNRAVFQANQENLPILKRAVAGDASESALLKCIELCCGSVKEMRER
       .: ::. :.::::::::: :.:::: ::: :::..:::::::::: ::   .:: ::::.
CCDS11 SSDTWFMLARIAGLCNRADFKANQEILPIAKRATTGDASESALLKFIEQSYSSVAEMREK
             430       440       450       460       470       480 

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pF1KB3 YAKIVEIPFNSTNKYQLSIHKNPNTSEPQHLLVMKGAPERILDRCSSILLHGKEQPLDEE
         :..:::::::::::.:::   ..:.  :.:.:::::::::. ::..::.:.:  ...:
CCDS11 NPKVAEIPFNSTNKYQMSIHLREDSSQT-HVLMMKGAPERILEFCSTFLLNGQEYSMNDE
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pF1KB3 LKDAFQNAYLELGGLGERVLGFCHLFLPDEQFPEGFQFDTDDVNFPIDNLCFVGLISMID
       .:.:::::::::::::::::::: : ::. .: .:: :.::..:::.:::::::::::::
CCDS11 MKEAFQNAYLELGGLGERVLGFCFLNLPS-SFSKGFPFNTDEINFPMDNLCFVGLISMID
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pF1KB3 PPRAAVPDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVS
       ::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:..::::.::.:
CCDS11 PPRAAVPDAVSKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGTETAEEVAARLKIPIS
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pF1KB3 QVNPRDAKACVVHGSDLKDMTSEQLDDILKYHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVA
       .:.   ::: ::::..:::. :.:::.::. : ::::::::::::::::::::: ::.::
CCDS11 KVDASAAKAIVVHGAELKDIQSKQLDQILQNHPEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRLGAVVA
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pF1KB3 VTGDGVNDSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLK
       ::::::::::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VTGDGVNDSPALKKADIGIAMGISGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLK
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pF1KB3 KSIAYTLTSNIPEITPFLIFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEQAESDIMK
       ::: ::::::::::::::.::: .:::::::.::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS11 KSIMYTLTSNIPEITPFLMFIILGIPLPLGTITILCIDLGTDMVPAISLAYESAESDIMK
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pF1KB3 RQPRNPKTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPIHLLGLRVDWDDR
       : :::::::.:::.:::.::::::::::::.:::::::::::::: :. :::.:. :.:.
CCDS11 RLPRNPKTDNLVNHRLIGMAYGQIGMIQALAGFFTYFVILAENGFRPVDLLGIRLHWEDK
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pF1KB3 WINDVEDSYGQQWTYEQRKIVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLVICKTRRNSVFQQGMKNKI
       ..::.::::::::::::::.:::::.:::::.:::::::::.: ::::::.:::::.::.
CCDS11 YLNDLEDSYGQQWTYEQRKVVEFTCQTAFFVTIVVVQWADLIISKTRRNSLFQQGMRNKV
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pF1KB3 LIFGLFEETALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKPTWWFCAFPYSLLIFVYDEVRKLIIRRRP
       ::::..::: ::::::: ::: ::::::::: :::.::.:::.:::::::.:::.::..:
CCDS11 LIFGILEETLLAAFLSYTPGMDVALRMYPLKITWWLCAIPYSILIFVYDEIRKLLIRQHP
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pF1KB3 GGWVEKETYY
        ::::.::::
CCDS11 DGWVERETYY
    1020         

>>CCDS12467.1 ATP4A gene_id:495|Hs108|chr19               (1035 aa)
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                    .: : : :    : .:..    :  ::. . ....:::. ..::.::
CCDS12 MGKAENYELYSVELGPGPGGDM--AAKMSKKKKAGGGGGKRKEKLENMKKEMEINDHQLS
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pF1KB3 LDELHRKYGTDLSRGLTSARAAEILARDGPNALTPPPTTPEWIKFCRQLFGGFSMLLWIG
       . ::..:: :. ..::... :::.: ::::::: ::  :::..:: ::: ::.. :.:..
CCDS12 VAELEQKYQTSATKGLSASLAAELLLRDGPNALRPPRGTPEYVKFARQLAGGLQCLMWVA
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pF1KB3 AILCFLAYSIQAATEEEPQNDNLYLGVVLSAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQ
       : .:..:..:::.  .   .:::::...: :::..::::.:::: ::..:. ::::.:::
CCDS12 AAICLIAFAIQASEGDLTTDDNLYLAIALIAVVVVTGCFGYYQEFKSTNIIASFKNLVPQ
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pF1KB3 QALVIRNGEKMSINAEEVVVGDLVEVKGGDRIPADLRIISANGCKVDNSSLTGESEPQTR
       :: :::.:.:..:::...:::::::.:::::.:::.::..:.::::::::::::::::::
CCDS12 QATVIRDGDKFQINADQLVVGDLVEMKGGDRVPADIRILAAQGCKVDNSSLTGESEPQTR
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pF1KB3 SPDFTNENPLETRNIAFFSTNCVEGTARGIVVYTGDRTVMGRIATLASGLEGGQTPIAAE
       ::. :.:.:::::::::::: :.:::..:.:: :::::..::::.::::.:. .:::: :
CCDS12 SPECTHESPLETRNIAFFSTMCLEGTVQGLVVNTGDRTIIGRIASLASGVENEKTPIAIE
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pF1KB3 IEHFIHIITGVAVFLGVSFFILSLILEYTWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLT
       ::::. ::.:.:...:..:::... . ::.:.:..:...:.:: :::::::::::::.::
CCDS12 IEHFVDIIAGLAILFGATFFIVAMCIGYTFLRAMVFFMAIVVAYVPEGLLATVTVCLSLT
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pF1KB3 AKRMARKNCLVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTENQS
       :::.: :::.::::::::::::::.::::::::::::::::.:.::::.:: :::::.::
CCDS12 AKRLASKNCVVKNLEAVETLGSTSVICSDKTGTLTQNRMTVSHLWFDNHIHTADTTEDQS
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pF1KB3 GVSFDKTSATWLALSRIAGLCNRAVFQANQENLPILKRAVAGDASESALLKCIELCCGSV
       : .::..: :: :: :.  :::::.:...:. .:. :: : :::::.::::  ::  :..
CCDS12 GQTFDQSSETWRALCRVLTLCNRAAFKSGQDAVPVPKRIVIGDASETALLKFSELTLGNA
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pF1KB3 KEMRERYAKIVEIPFNSTNKYQLSIHKNPNTSEPQHLLVMKGAPERILDRCSSILLHGKE
         .:.:. :. :::::::::.:::::   .  .:.:::::::::::.:.::::::..:.:
CCDS12 MGYRDRFPKVCEIPFNSTNKFQLSIHTLEDPRDPRHLLVMKGAPERVLERCSSILIKGQE
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pF1KB3 QPLDEELKDAFQNAYLELGGLGERVLGFCHLFLPDEQFPEGFQFDTDDVNFPIDNLCFVG
        ::::. ..:::.::: ::::::::::::.:.: ....: :. ::.. .::: ..:::.:
CCDS12 LPLDEQWREAFQTAYLSLGGLGERVLGFCQLYLNEKDYPPGYAFDVEAMNFPSSGLCFAG
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pF1KB3 LISMIDPPRAAVPDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAAR
       :.::::::::.::::: :::.:::.:::::::::::::::: .:::::::.:::::::::
CCDS12 LVSMIDPPRATVPDAVLKCRTAGIRVIMVTGDHPITAKAIAASVGIISEGSETVEDIAAR
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pF1KB3 LNIPVSQVNPRDAKACVVHGSDLKDMTSEQLDDILKYHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQR
       : .::.::: .::.:::..: .::::   .: . :. : :.:::::::::::.:::.:::
CCDS12 LRVPVDQVNRKDARACVINGMQLKDMDPSELVEALRTHPEMVFARTSPQQKLVIVESCQR
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pF1KB3 QGAIVAVTGDGVNDSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRL
        ::::::::::::::::::::::::::::::::..:.:::::::::::::::::::.:::
CCDS12 LGAIVAVTGDGVNDSPALKKADIGVAMGIAGSDAAKNAADMILLDDNFASIVTGVEQGRL
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pF1KB3 IFDNLKKSIAYTLTSNIPEITPFLIFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEQA
       ::::::::::::::.::::.::.::.: ...::::: .::: :.: ::. :..:::::.:
CCDS12 IFDNLKKSIAYTLTKNIPELTPYLIYITVSVPLPLGCITILFIELCTDIFPSVSLAYEKA
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pF1KB3 ESDIMKRQPRNPKTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPIHLLGLR
       :::::. .::::: :.:::: : ...: ::: ::...::  ::. .:..:..:.  .:::
CCDS12 ESDIMHLRPRNPKRDRLVNEPLAAYSYFQIGAIQSFAGFTDYFTAMAQEGWFPLLCVGLR
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pF1KB3 VDWDDRWINDVEDSYGQQWTYEQRKIVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLVICKTRRNSVFQQ
       ..:.:. ..:..:::::.::. ::   ..::.:.::.:: : : ::..: :::: :.:::
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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