Result of FASTA (ccds) for pF1KB3499
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3499, 1072 aa
  1>>>pF1KB3499 1072 - 1072 aa - 1072 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.3823+/-0.00154; mu= -3.6124+/- 0.087
 mean_var=478.4783+/-113.165, 0's: 0 Z-trim(107.6): 311  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.058633
 statistics sampled from 9366 (9656) to 9366 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.649), E-opt: 0.2 (0.297), width:  16
 Scan time:  3.780

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS53525.1 RET gene_id:5979|Hs108|chr10           (1072) 7286 633.2  9e-181
CCDS7200.1 RET gene_id:5979|Hs108|chr10            (1114) 7226 628.2 3.1e-179
CCDS55221.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8          ( 812) 1129 112.2 4.6e-24
CCDS55222.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8          ( 820) 1129 112.2 4.6e-24
CCDS43731.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8          ( 731) 1120 111.4 7.3e-24
CCDS43730.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8          ( 733) 1120 111.4 7.4e-24
CCDS43732.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8          ( 820) 1120 111.5 7.9e-24
CCDS6107.2 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8           ( 822) 1120 111.5 7.9e-24
CCDS55223.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8          ( 853) 1120 111.5 8.1e-24
CCDS81514.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 593) 1115 110.9 8.7e-24
CCDS7620.2 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10          ( 822) 1118 111.3 8.9e-24
CCDS44486.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 709) 1115 111.0 9.7e-24
CCDS73210.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 732) 1115 111.0 9.9e-24
CCDS44485.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 704) 1114 110.9   1e-23
CCDS31298.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 821) 1115 111.1 1.1e-23
CCDS4410.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5           ( 802) 1114 111.0 1.1e-23
CCDS81515.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 819) 1114 111.0 1.1e-23
CCDS44487.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 705) 1108 110.4 1.5e-23
CCDS3354.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4           ( 694) 1102 109.9   2e-23
CCDS3353.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4           ( 806) 1102 110.0 2.2e-23
CCDS54706.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4          ( 808) 1102 110.0 2.2e-23
CCDS44488.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 680) 1099 109.6 2.4e-23
CCDS44489.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 769) 1099 109.7 2.6e-23
CCDS53584.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 707) 1096 109.4 2.9e-23
CCDS4411.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5           ( 762) 1090 108.9 4.4e-23
CCDS78096.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5          ( 734) 1032 104.0 1.3e-21
CCDS75874.1 MUSK gene_id:4593|Hs108|chr9           ( 783)  773 82.1 5.2e-15
CCDS48005.1 MUSK gene_id:4593|Hs108|chr9           ( 869)  773 82.2 5.6e-15
CCDS626.1 ROR1 gene_id:4919|Hs108|chr1             ( 937)  673 73.7 2.1e-12
CCDS4690.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6             ( 876)  660 72.6 4.2e-12
CCDS56411.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6            ( 894)  660 72.6 4.3e-12
CCDS34385.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6            ( 913)  660 72.6 4.3e-12
CCDS3495.1 PDGFRA gene_id:5156|Hs108|chr4          (1089)  660 72.7 4.8e-12
CCDS482.1 TIE1 gene_id:7075|Hs108|chr1             (1138)  649 71.8 9.5e-12
CCDS3497.1 KDR gene_id:3791|Hs108|chr4             (1356)  648 71.8 1.1e-11
CCDS47058.1 KIT gene_id:3815|Hs108|chr4            ( 972)  631 70.2 2.5e-11
CCDS3496.1 KIT gene_id:3815|Hs108|chr4             ( 976)  631 70.2 2.5e-11
CCDS9330.1 FLT1 gene_id:2321|Hs108|chr13           (1338)  634 70.7 2.5e-11
CCDS4302.1 CSF1R gene_id:1436|Hs108|chr5           ( 972)  627 69.9 3.1e-11
CCDS78389.1 TEK gene_id:7010|Hs108|chr9            ( 976)  627 69.9 3.1e-11
CCDS75825.1 TEK gene_id:7010|Hs108|chr9            (1081)  627 69.9 3.3e-11
CCDS6519.1 TEK gene_id:7010|Hs108|chr9             (1124)  627 70.0 3.4e-11
CCDS43412.1 FLT4 gene_id:2324|Hs108|chr5           (1298)  622 69.6   5e-11
CCDS4457.1 FLT4 gene_id:2324|Hs108|chr5            (1363)  622 69.6 5.1e-11
CCDS4303.1 PDGFRB gene_id:5159|Hs108|chr5          (1106)  610 68.5 9.2e-11
CCDS75419.1 DDR1 gene_id:780|Hs108|chr6            ( 767)  606 68.0 9.3e-11


>>CCDS53525.1 RET gene_id:5979|Hs108|chr10                (1072 aa)
 initn: 7286 init1: 7286 opt: 7286  Z-score: 3358.9  bits: 633.2 E(32554): 9e-181
Smith-Waterman score: 7286; 100.0% identity (100.0% similar) in 1072 aa overlap (1-1072:1-1072)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MAKATSGAAGLRLLLLLLLPLLGKVALGLYFSRDAYWEKLYVDQAAGTPLLYVHALRDAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MAKATSGAAGLRLLLLLLLPLLGKVALGLYFSRDAYWEKLYVDQAAGTPLLYVHALRDAP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 EEVPSFRLGQHLYGTYRTRLHENNWICIQEDTGLLYLNRSLDHSSWEKLSVRNRGFPLLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EEVPSFRLGQHLYGTYRTRLHENNWICIQEDTGLLYLNRSLDHSSWEKLSVRNRGFPLLT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 VYLKVFLSPTSLREGECQWPGCARVYFSFFNTSFPACSSLKPRELCFPETRPSFRIRENR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VYLKVFLSPTSLREGECQWPGCARVYFSFFNTSFPACSSLKPRELCFPETRPSFRIRENR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 PPGTFHQFRLLPVQFLCPNISVAYRLLEGEGLPFRCAPDSLEVSTRWALDREQREKYELV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PPGTFHQFRLLPVQFLCPNISVAYRLLEGEGLPFRCAPDSLEVSTRWALDREQREKYELV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 AVCTVHAGAREEVVMVPFPVTVYDEDDSAPTFPAGVDTASAVVEFKRKEDTVVATLRVFD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 AVCTVHAGAREEVVMVPFPVTVYDEDDSAPTFPAGVDTASAVVEFKRKEDTVVATLRVFD
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 ADVVPASGELVRRYTSTLLPGDTWAQQTFRVEHWPNETSVQANGSFVRATVHDYRLVLNR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ADVVPASGELVRRYTSTLLPGDTWAQQTFRVEHWPNETSVQANGSFVRATVHDYRLVLNR
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 NLSISENRTMQLAVLVNDSDFQGPGAGVLLLHFNVSVLPVSLHLPSTYSLSVSRRARRFA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NLSISENRTMQLAVLVNDSDFQGPGAGVLLLHFNVSVLPVSLHLPSTYSLSVSRRARRFA
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 QIGKVCVENCQAFSGINVQYKLHSSGANCSTLGVVTSAEDTSGILFVNDTKALRRPKCAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 QIGKVCVENCQAFSGINVQYKLHSSGANCSTLGVVTSAEDTSGILFVNDTKALRRPKCAE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 LHYMVVATDQQTSRQAQAQLLVTVEGSYVAEEAGCPLSCAVSKRRLECEECGGLGSPTGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LHYMVVATDQQTSRQAQAQLLVTVEGSYVAEEAGCPLSCAVSKRRLECEECGGLGSPTGR
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 CEWRQGDGKGITRNFSTCSPSTKTCPDGHCDVVETQDINICPQDCLRGSIVGGHEPGEPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 CEWRQGDGKGITRNFSTCSPSTKTCPDGHCDVVETQDINICPQDCLRGSIVGGHEPGEPR
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB3 GIKAGYGTCNCFPEEEKCFCEPEDIQDPLCDELCRTVIAAAVLFSFIVSVLLSAFCIHCY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GIKAGYGTCNCFPEEEKCFCEPEDIQDPLCDELCRTVIAAAVLFSFIVSVLLSAFCIHCY
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB3 HKFAHKPPISSAEMTFRRPAQAFPVSYSSSGARRPSLDSMENQVSVDAFKILEDPKWEFP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 HKFAHKPPISSAEMTFRRPAQAFPVSYSSSGARRPSLDSMENQVSVDAFKILEDPKWEFP
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB3 RKNLVLGKTLGEGEFGKVVKATAFHLKGRAGYTTVAVKMLKENASPSELRDLLSEFNVLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RKNLVLGKTLGEGEFGKVVKATAFHLKGRAGYTTVAVKMLKENASPSELRDLLSEFNVLK
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB3 QVNHPHVIKLYGACSQDGPLLLIVEYAKYGSLRGFLRESRKVGPGYLGSGGSRNSSSLDH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 QVNHPHVIKLYGACSQDGPLLLIVEYAKYGSLRGFLRESRKVGPGYLGSGGSRNSSSLDH
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB3 PDERALTMGDLISFAWQISQGMQYLAEMKLVHRDLAARNILVAEGRKMKISDFGLSRDVY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PDERALTMGDLISFAWQISQGMQYLAEMKLVHRDLAARNILVAEGRKMKISDFGLSRDVY
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB3 EEDSYVKRSQGRIPVKWMAIESLFDHIYTTQSDVWSFGVLLWEIVTLGGNPYPGIPPERL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EEDSYVKRSQGRIPVKWMAIESLFDHIYTTQSDVWSFGVLLWEIVTLGGNPYPGIPPERL
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB3 FNLLKTGHRMERPDNCSEEMYRLMLQCWKQEPDKRPVFADISKDLEKMMVKRRDYLDLAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 FNLLKTGHRMERPDNCSEEMYRLMLQCWKQEPDKRPVFADISKDLEKMMVKRRDYLDLAA
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070  
pF1KB3 STPSDSLIYDDGLSEEETPLVDCNNAPLPRALPSTWIENKLYGRISHAFTRF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 STPSDSLIYDDGLSEEETPLVDCNNAPLPRALPSTWIENKLYGRISHAFTRF
             1030      1040      1050      1060      1070  

>>CCDS7200.1 RET gene_id:5979|Hs108|chr10                 (1114 aa)
 initn: 7226 init1: 7226 opt: 7226  Z-score: 3331.3  bits: 628.2 E(32554): 3.1e-179
Smith-Waterman score: 7226; 100.0% identity (100.0% similar) in 1063 aa overlap (1-1063:1-1063)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MAKATSGAAGLRLLLLLLLPLLGKVALGLYFSRDAYWEKLYVDQAAGTPLLYVHALRDAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MAKATSGAAGLRLLLLLLLPLLGKVALGLYFSRDAYWEKLYVDQAAGTPLLYVHALRDAP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 EEVPSFRLGQHLYGTYRTRLHENNWICIQEDTGLLYLNRSLDHSSWEKLSVRNRGFPLLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 EEVPSFRLGQHLYGTYRTRLHENNWICIQEDTGLLYLNRSLDHSSWEKLSVRNRGFPLLT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 VYLKVFLSPTSLREGECQWPGCARVYFSFFNTSFPACSSLKPRELCFPETRPSFRIRENR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 VYLKVFLSPTSLREGECQWPGCARVYFSFFNTSFPACSSLKPRELCFPETRPSFRIRENR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 PPGTFHQFRLLPVQFLCPNISVAYRLLEGEGLPFRCAPDSLEVSTRWALDREQREKYELV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 PPGTFHQFRLLPVQFLCPNISVAYRLLEGEGLPFRCAPDSLEVSTRWALDREQREKYELV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 AVCTVHAGAREEVVMVPFPVTVYDEDDSAPTFPAGVDTASAVVEFKRKEDTVVATLRVFD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 AVCTVHAGAREEVVMVPFPVTVYDEDDSAPTFPAGVDTASAVVEFKRKEDTVVATLRVFD
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 ADVVPASGELVRRYTSTLLPGDTWAQQTFRVEHWPNETSVQANGSFVRATVHDYRLVLNR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 ADVVPASGELVRRYTSTLLPGDTWAQQTFRVEHWPNETSVQANGSFVRATVHDYRLVLNR
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 NLSISENRTMQLAVLVNDSDFQGPGAGVLLLHFNVSVLPVSLHLPSTYSLSVSRRARRFA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 NLSISENRTMQLAVLVNDSDFQGPGAGVLLLHFNVSVLPVSLHLPSTYSLSVSRRARRFA
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 QIGKVCVENCQAFSGINVQYKLHSSGANCSTLGVVTSAEDTSGILFVNDTKALRRPKCAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 QIGKVCVENCQAFSGINVQYKLHSSGANCSTLGVVTSAEDTSGILFVNDTKALRRPKCAE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 LHYMVVATDQQTSRQAQAQLLVTVEGSYVAEEAGCPLSCAVSKRRLECEECGGLGSPTGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LHYMVVATDQQTSRQAQAQLLVTVEGSYVAEEAGCPLSCAVSKRRLECEECGGLGSPTGR
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 CEWRQGDGKGITRNFSTCSPSTKTCPDGHCDVVETQDINICPQDCLRGSIVGGHEPGEPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 CEWRQGDGKGITRNFSTCSPSTKTCPDGHCDVVETQDINICPQDCLRGSIVGGHEPGEPR
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB3 GIKAGYGTCNCFPEEEKCFCEPEDIQDPLCDELCRTVIAAAVLFSFIVSVLLSAFCIHCY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 GIKAGYGTCNCFPEEEKCFCEPEDIQDPLCDELCRTVIAAAVLFSFIVSVLLSAFCIHCY
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB3 HKFAHKPPISSAEMTFRRPAQAFPVSYSSSGARRPSLDSMENQVSVDAFKILEDPKWEFP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 HKFAHKPPISSAEMTFRRPAQAFPVSYSSSGARRPSLDSMENQVSVDAFKILEDPKWEFP
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB3 RKNLVLGKTLGEGEFGKVVKATAFHLKGRAGYTTVAVKMLKENASPSELRDLLSEFNVLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 RKNLVLGKTLGEGEFGKVVKATAFHLKGRAGYTTVAVKMLKENASPSELRDLLSEFNVLK
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB3 QVNHPHVIKLYGACSQDGPLLLIVEYAKYGSLRGFLRESRKVGPGYLGSGGSRNSSSLDH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 QVNHPHVIKLYGACSQDGPLLLIVEYAKYGSLRGFLRESRKVGPGYLGSGGSRNSSSLDH
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB3 PDERALTMGDLISFAWQISQGMQYLAEMKLVHRDLAARNILVAEGRKMKISDFGLSRDVY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 PDERALTMGDLISFAWQISQGMQYLAEMKLVHRDLAARNILVAEGRKMKISDFGLSRDVY
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB3 EEDSYVKRSQGRIPVKWMAIESLFDHIYTTQSDVWSFGVLLWEIVTLGGNPYPGIPPERL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 EEDSYVKRSQGRIPVKWMAIESLFDHIYTTQSDVWSFGVLLWEIVTLGGNPYPGIPPERL
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB3 FNLLKTGHRMERPDNCSEEMYRLMLQCWKQEPDKRPVFADISKDLEKMMVKRRDYLDLAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 FNLLKTGHRMERPDNCSEEMYRLMLQCWKQEPDKRPVFADISKDLEKMMVKRRDYLDLAA
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070          
pF1KB3 STPSDSLIYDDGLSEEETPLVDCNNAPLPRALPSTWIENKLYGRISHAFTRF        
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::                 
CCDS72 STPSDSLIYDDGLSEEETPLVDCNNAPLPRALPSTWIENKLYGMSDPNWPGESPVPLTRA
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

CCDS72 DGTNTGFPRYPNDSVYANWMLSPSAAKLMDTFDS
             1090      1100      1110    

>>CCDS55221.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8               (812 aa)
 initn: 1079 init1: 746 opt: 1129  Z-score: 545.5  bits: 112.2 E(32554): 4.6e-24
Smith-Waterman score: 1134; 44.8% identity (71.8% similar) in 426 aa overlap (645-1049:376-792)

          620       630       640       650       660       670    
pF1KB3 EEKCFCEPEDIQDPLCDELCRTVIAAAVLFSFIVSVLLSAFCIHCYHKFAHKPPISSAEM
                                     .:..: ....  .. ... ..:  . : .:
CCDS55 AWLTVLEALEERPAVMTSPLYLEIIIYCTGAFLISCMVGSVIVYKMKSGTKKSDFHS-QM
         350       360       370       380       390       400     

          680           690               700         710       720
pF1KB3 TFRRPAQAFP----VSYSSSGAR-------RPS-LDSMENQV--SVDAFKILEDPKWEFP
       . .. :...:    :: .::..        ::: :.:  . .  .:. ... :::.::.:
CCDS55 AVHKLAKSIPLRRQVSADSSASMNSGVLLVRPSRLSSSGTPMLAGVSEYELPEDPRWELP
          410       420       430       440       450       460    

              730       740        750        760       770        
pF1KB3 RKNLVLGKTLGEGEFGKVVKATAFHL-KGRAGYTT-VAVKMLKENASPSELRDLLSEFNV
       :  ::::: :::: ::.:: : :. : : . . .: ::::::: .:. ..: ::.::...
CCDS55 RDRLVLGKPLGEGCFGQVVLAEAIGLDKDKPNRVTKVAVKMLKSDATEKDLSDLISEMEM
          470       480       490       500       510       520    

      780        790       800       810       820       830       
pF1KB3 LKQVN-HPHVIKLYGACSQDGPLLLIVEYAKYGSLRGFLRESRKVGPGYLGSGGSRNSSS
       .:... : ..:.: :::.::::: .:::::. :.:: .:.  :  :  :       : : 
CCDS55 MKMIGKHKNIINLLGACTQDGPLYVIVEYASKGNLREYLQARRPPGLEY-----CYNPS-
          530       540       550       560       570              

       840       850       860       870       880       890       
pF1KB3 LDHPDERALTMGDLISFAWQISQGMQYLAEMKLVHRDLAARNILVAEGRKMKISDFGLSR
         :  :. :.  ::.: :.:...::.:::  : .::::::::.::.:   :::.::::.:
CCDS55 --HNPEEQLSSKDLVSCAYQVARGMEYLASKKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLAR
        580       590       600       610       620       630      

       900       910       920       930       940       950       
pF1KB3 DVYEEDSYVKRSQGRIPVKWMAIESLFDHIYTTQSDVWSFGVLLWEIVTLGGNPYPGIPP
       :... : : : ..::.:::::: :.:::.::: :::::::::::::: ::::.::::.: 
CCDS55 DIHHIDYYKKTTNGRLPVKWMAPEALFDRIYTHQSDVWSFGVLLWEIFTLGGSPYPGVPV
        640       650       660       670       680       690      

       960       970       980       990      1000        1010     
pF1KB3 ERLFNLLKTGHRMERPDNCSEEMYRLMLQCWKQEPDKRPVFADISKDLEKM--MVKRRDY
       :.::.::: ::::..:.::..:.: .: .::.  :..::.: .. .::...  ... ..:
CCDS55 EELFKLLKEGHRMDKPSNCTNELYMMMRDCWHAVPSQRPTFKQLVEDLDRIVALTSNQEY
        700       710       720       730       740       750      

        1020      1030      1040        1050      1060      1070  
pF1KB3 LDLAASTPSDSLIYDDGLSEEETPLVDC--NNAPLPRALPSTWIENKLYGRISHAFTRF
       :::.    . :  . :  :   .   :   .. :::                       
CCDS55 LDLSMPLDQYSPSFPDTRSSTCSSGEDSVFSHEPLPEEPCLPRHPAQLANGGLKRR   
        760       770       780       790       800       810     

>>CCDS55222.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8               (820 aa)
 initn: 1079 init1: 746 opt: 1129  Z-score: 545.4  bits: 112.2 E(32554): 4.6e-24
Smith-Waterman score: 1134; 44.8% identity (71.8% similar) in 426 aa overlap (645-1049:384-800)

          620       630       640       650       660       670    
pF1KB3 EEKCFCEPEDIQDPLCDELCRTVIAAAVLFSFIVSVLLSAFCIHCYHKFAHKPPISSAEM
                                     .:..: ....  .. ... ..:  . : .:
CCDS55 AWLTVLEALEERPAVMTSPLYLEIIIYCTGAFLISCMVGSVIVYKMKSGTKKSDFHS-QM
           360       370       380       390       400       410   

          680           690               700         710       720
pF1KB3 TFRRPAQAFP----VSYSSSGAR-------RPS-LDSMENQV--SVDAFKILEDPKWEFP
       . .. :...:    :: .::..        ::: :.:  . .  .:. ... :::.::.:
CCDS55 AVHKLAKSIPLRRQVSADSSASMNSGVLLVRPSRLSSSGTPMLAGVSEYELPEDPRWELP
            420       430       440       450       460       470  

              730       740        750        760       770        
pF1KB3 RKNLVLGKTLGEGEFGKVVKATAFHL-KGRAGYTT-VAVKMLKENASPSELRDLLSEFNV
       :  ::::: :::: ::.:: : :. : : . . .: ::::::: .:. ..: ::.::...
CCDS55 RDRLVLGKPLGEGCFGQVVLAEAIGLDKDKPNRVTKVAVKMLKSDATEKDLSDLISEMEM
            480       490       500       510       520       530  

      780        790       800       810       820       830       
pF1KB3 LKQVN-HPHVIKLYGACSQDGPLLLIVEYAKYGSLRGFLRESRKVGPGYLGSGGSRNSSS
       .:... : ..:.: :::.::::: .:::::. :.:: .:.  :  :  :       : : 
CCDS55 MKMIGKHKNIINLLGACTQDGPLYVIVEYASKGNLREYLQARRPPGLEY-----CYNPS-
            540       550       560       570       580            

       840       850       860       870       880       890       
pF1KB3 LDHPDERALTMGDLISFAWQISQGMQYLAEMKLVHRDLAARNILVAEGRKMKISDFGLSR
         :  :. :.  ::.: :.:...::.:::  : .::::::::.::.:   :::.::::.:
CCDS55 --HNPEEQLSSKDLVSCAYQVARGMEYLASKKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLAR
          590       600       610       620       630       640    

       900       910       920       930       940       950       
pF1KB3 DVYEEDSYVKRSQGRIPVKWMAIESLFDHIYTTQSDVWSFGVLLWEIVTLGGNPYPGIPP
       :... : : : ..::.:::::: :.:::.::: :::::::::::::: ::::.::::.: 
CCDS55 DIHHIDYYKKTTNGRLPVKWMAPEALFDRIYTHQSDVWSFGVLLWEIFTLGGSPYPGVPV
          650       660       670       680       690       700    

       960       970       980       990      1000        1010     
pF1KB3 ERLFNLLKTGHRMERPDNCSEEMYRLMLQCWKQEPDKRPVFADISKDLEKM--MVKRRDY
       :.::.::: ::::..:.::..:.: .: .::.  :..::.: .. .::...  ... ..:
CCDS55 EELFKLLKEGHRMDKPSNCTNELYMMMRDCWHAVPSQRPTFKQLVEDLDRIVALTSNQEY
          710       720       730       740       750       760    

        1020      1030      1040        1050      1060      1070  
pF1KB3 LDLAASTPSDSLIYDDGLSEEETPLVDC--NNAPLPRALPSTWIENKLYGRISHAFTRF
       :::.    . :  . :  :   .   :   .. :::                       
CCDS55 LDLSMPLDQYSPSFPDTRSSTCSSGEDSVFSHEPLPEEPCLPRHPAQLANGGLKRR   
          770       780       790       800       810       820   

>>CCDS43731.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8               (731 aa)
 initn: 1079 init1: 746 opt: 1120  Z-score: 541.8  bits: 111.4 E(32554): 7.3e-24
Smith-Waterman score: 1130; 44.6% identity (71.5% similar) in 428 aa overlap (645-1049:293-711)

          620       630       640       650       660       670    
pF1KB3 EEKCFCEPEDIQDPLCDELCRTVIAAAVLFSFIVSVLLSAFCIHCYHKFAHKPPISSAEM
                                     .:..: ....  .. ... ..:  . : .:
CCDS43 AWLTVLEALEERPAVMTSPLYLEIIIYCTGAFLISCMVGSVIVYKMKSGTKKSDFHS-QM
            270       280       290       300       310        320 

          680             690               700         710        
pF1KB3 TFRRPAQAFP------VSYSSSGAR-------RPS-LDSMENQV--SVDAFKILEDPKWE
       . .. :...:      :: .::..        ::: :.:  . .  .:. ... :::.::
CCDS43 AVHKLAKSIPLRRQVTVSADSSASMNSGVLLVRPSRLSSSGTPMLAGVSEYELPEDPRWE
             330       340       350       360       370       380 

      720       730       740        750        760       770      
pF1KB3 FPRKNLVLGKTLGEGEFGKVVKATAFHL-KGRAGYTT-VAVKMLKENASPSELRDLLSEF
       .::  ::::: :::: ::.:: : :. : : . . .: ::::::: .:. ..: ::.::.
CCDS43 LPRDRLVLGKPLGEGCFGQVVLAEAIGLDKDKPNRVTKVAVKMLKSDATEKDLSDLISEM
             390       400       410       420       430       440 

        780        790       800       810       820       830     
pF1KB3 NVLKQVN-HPHVIKLYGACSQDGPLLLIVEYAKYGSLRGFLRESRKVGPGYLGSGGSRNS
       ...:... : ..:.: :::.::::: .:::::. :.:: .:.  :  :  :       : 
CCDS43 EMMKMIGKHKNIINLLGACTQDGPLYVIVEYASKGNLREYLQARRPPGLEY-----CYNP
             450       460       470       480       490           

         840       850       860       870       880       890     
pF1KB3 SSLDHPDERALTMGDLISFAWQISQGMQYLAEMKLVHRDLAARNILVAEGRKMKISDFGL
       :   :  :. :.  ::.: :.:...::.:::  : .::::::::.::.:   :::.::::
CCDS43 S---HNPEEQLSSKDLVSCAYQVARGMEYLASKKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGL
           500       510       520       530       540       550   

         900       910       920       930       940       950     
pF1KB3 SRDVYEEDSYVKRSQGRIPVKWMAIESLFDHIYTTQSDVWSFGVLLWEIVTLGGNPYPGI
       .::... : : : ..::.:::::: :.:::.::: :::::::::::::: ::::.::::.
CCDS43 ARDIHHIDYYKKTTNGRLPVKWMAPEALFDRIYTHQSDVWSFGVLLWEIFTLGGSPYPGV
           560       570       580       590       600       610   

         960       970       980       990      1000        1010   
pF1KB3 PPERLFNLLKTGHRMERPDNCSEEMYRLMLQCWKQEPDKRPVFADISKDLEKM--MVKRR
       : :.::.::: ::::..:.::..:.: .: .::.  :..::.: .. .::...  ... .
CCDS43 PVEELFKLLKEGHRMDKPSNCTNELYMMMRDCWHAVPSQRPTFKQLVEDLDRIVALTSNQ
           620       630       640       650       660       670   

          1020      1030      1040        1050      1060      1070 
pF1KB3 DYLDLAASTPSDSLIYDDGLSEEETPLVDC--NNAPLPRALPSTWIENKLYGRISHAFTR
       .::::.    . :  . :  :   .   :   .. :::                      
CCDS43 EYLDLSMPLDQYSPSFPDTRSSTCSSGEDSVFSHEPLPEEPCLPRHPAQLANGGLKRR  
           680       690       700       710       720       730   

        
pF1KB3 F

>>CCDS43730.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8               (733 aa)
 initn: 1079 init1: 746 opt: 1120  Z-score: 541.8  bits: 111.4 E(32554): 7.4e-24
Smith-Waterman score: 1130; 44.6% identity (71.5% similar) in 428 aa overlap (645-1049:295-713)

          620       630       640       650       660       670    
pF1KB3 EEKCFCEPEDIQDPLCDELCRTVIAAAVLFSFIVSVLLSAFCIHCYHKFAHKPPISSAEM
                                     .:..: ....  .. ... ..:  . : .:
CCDS43 AWLTVLEALEERPAVMTSPLYLEIIIYCTGAFLISCMVGSVIVYKMKSGTKKSDFHS-QM
          270       280       290       300       310       320    

          680             690               700         710        
pF1KB3 TFRRPAQAFP------VSYSSSGAR-------RPS-LDSMENQV--SVDAFKILEDPKWE
       . .. :...:      :: .::..        ::: :.:  . .  .:. ... :::.::
CCDS43 AVHKLAKSIPLRRQVTVSADSSASMNSGVLLVRPSRLSSSGTPMLAGVSEYELPEDPRWE
           330       340       350       360       370       380   

      720       730       740        750        760       770      
pF1KB3 FPRKNLVLGKTLGEGEFGKVVKATAFHL-KGRAGYTT-VAVKMLKENASPSELRDLLSEF
       .::  ::::: :::: ::.:: : :. : : . . .: ::::::: .:. ..: ::.::.
CCDS43 LPRDRLVLGKPLGEGCFGQVVLAEAIGLDKDKPNRVTKVAVKMLKSDATEKDLSDLISEM
           390       400       410       420       430       440   

        780        790       800       810       820       830     
pF1KB3 NVLKQVN-HPHVIKLYGACSQDGPLLLIVEYAKYGSLRGFLRESRKVGPGYLGSGGSRNS
       ...:... : ..:.: :::.::::: .:::::. :.:: .:.  :  :  :       : 
CCDS43 EMMKMIGKHKNIINLLGACTQDGPLYVIVEYASKGNLREYLQARRPPGLEY-----CYNP
           450       460       470       480       490             

         840       850       860       870       880       890     
pF1KB3 SSLDHPDERALTMGDLISFAWQISQGMQYLAEMKLVHRDLAARNILVAEGRKMKISDFGL
       :   :  :. :.  ::.: :.:...::.:::  : .::::::::.::.:   :::.::::
CCDS43 S---HNPEEQLSSKDLVSCAYQVARGMEYLASKKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGL
         500       510       520       530       540       550     

         900       910       920       930       940       950     
pF1KB3 SRDVYEEDSYVKRSQGRIPVKWMAIESLFDHIYTTQSDVWSFGVLLWEIVTLGGNPYPGI
       .::... : : : ..::.:::::: :.:::.::: :::::::::::::: ::::.::::.
CCDS43 ARDIHHIDYYKKTTNGRLPVKWMAPEALFDRIYTHQSDVWSFGVLLWEIFTLGGSPYPGV
         560       570       580       590       600       610     

         960       970       980       990      1000        1010   
pF1KB3 PPERLFNLLKTGHRMERPDNCSEEMYRLMLQCWKQEPDKRPVFADISKDLEKM--MVKRR
       : :.::.::: ::::..:.::..:.: .: .::.  :..::.: .. .::...  ... .
CCDS43 PVEELFKLLKEGHRMDKPSNCTNELYMMMRDCWHAVPSQRPTFKQLVEDLDRIVALTSNQ
         620       630       640       650       660       670     

          1020      1030      1040        1050      1060      1070 
pF1KB3 DYLDLAASTPSDSLIYDDGLSEEETPLVDC--NNAPLPRALPSTWIENKLYGRISHAFTR
       .::::.    . :  . :  :   .   :   .. :::                      
CCDS43 EYLDLSMPLDQYSPSFPDTRSSTCSSGEDSVFSHEPLPEEPCLPRHPAQLANGGLKRR  
         680       690       700       710       720       730     

        
pF1KB3 F

>>CCDS43732.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8               (820 aa)
 initn: 1079 init1: 746 opt: 1120  Z-score: 541.3  bits: 111.5 E(32554): 7.9e-24
Smith-Waterman score: 1130; 44.6% identity (71.5% similar) in 428 aa overlap (645-1049:382-800)

          620       630       640       650       660       670    
pF1KB3 EEKCFCEPEDIQDPLCDELCRTVIAAAVLFSFIVSVLLSAFCIHCYHKFAHKPPISSAEM
                                     .:..: ....  .. ... ..:  . : .:
CCDS43 AWLTVLEALEERPAVMTSPLYLEIIIYCTGAFLISCMVGSVIVYKMKSGTKKSDFHS-QM
             360       370       380       390       400        410

          680             690               700         710        
pF1KB3 TFRRPAQAFP------VSYSSSGAR-------RPS-LDSMENQV--SVDAFKILEDPKWE
       . .. :...:      :: .::..        ::: :.:  . .  .:. ... :::.::
CCDS43 AVHKLAKSIPLRRQVTVSADSSASMNSGVLLVRPSRLSSSGTPMLAGVSEYELPEDPRWE
              420       430       440       450       460       470

      720       730       740        750        760       770      
pF1KB3 FPRKNLVLGKTLGEGEFGKVVKATAFHL-KGRAGYTT-VAVKMLKENASPSELRDLLSEF
       .::  ::::: :::: ::.:: : :. : : . . .: ::::::: .:. ..: ::.::.
CCDS43 LPRDRLVLGKPLGEGCFGQVVLAEAIGLDKDKPNRVTKVAVKMLKSDATEKDLSDLISEM
              480       490       500       510       520       530

        780        790       800       810       820       830     
pF1KB3 NVLKQVN-HPHVIKLYGACSQDGPLLLIVEYAKYGSLRGFLRESRKVGPGYLGSGGSRNS
       ...:... : ..:.: :::.::::: .:::::. :.:: .:.  :  :  :       : 
CCDS43 EMMKMIGKHKNIINLLGACTQDGPLYVIVEYASKGNLREYLQARRPPGLEY-----CYNP
              540       550       560       570       580          

         840       850       860       870       880       890     
pF1KB3 SSLDHPDERALTMGDLISFAWQISQGMQYLAEMKLVHRDLAARNILVAEGRKMKISDFGL
       :   :  :. :.  ::.: :.:...::.:::  : .::::::::.::.:   :::.::::
CCDS43 S---HNPEEQLSSKDLVSCAYQVARGMEYLASKKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGL
            590       600       610       620       630       640  

         900       910       920       930       940       950     
pF1KB3 SRDVYEEDSYVKRSQGRIPVKWMAIESLFDHIYTTQSDVWSFGVLLWEIVTLGGNPYPGI
       .::... : : : ..::.:::::: :.:::.::: :::::::::::::: ::::.::::.
CCDS43 ARDIHHIDYYKKTTNGRLPVKWMAPEALFDRIYTHQSDVWSFGVLLWEIFTLGGSPYPGV
            650       660       670       680       690       700  

         960       970       980       990      1000        1010   
pF1KB3 PPERLFNLLKTGHRMERPDNCSEEMYRLMLQCWKQEPDKRPVFADISKDLEKM--MVKRR
       : :.::.::: ::::..:.::..:.: .: .::.  :..::.: .. .::...  ... .
CCDS43 PVEELFKLLKEGHRMDKPSNCTNELYMMMRDCWHAVPSQRPTFKQLVEDLDRIVALTSNQ
            710       720       730       740       750       760  

          1020      1030      1040        1050      1060      1070 
pF1KB3 DYLDLAASTPSDSLIYDDGLSEEETPLVDC--NNAPLPRALPSTWIENKLYGRISHAFTR
       .::::.    . :  . :  :   .   :   .. :::                      
CCDS43 EYLDLSMPLDQYSPSFPDTRSSTCSSGEDSVFSHEPLPEEPCLPRHPAQLANGGLKRR  
            770       780       790       800       810       820  

        
pF1KB3 F

>>CCDS6107.2 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8                (822 aa)
 initn: 1079 init1: 746 opt: 1120  Z-score: 541.3  bits: 111.5 E(32554): 7.9e-24
Smith-Waterman score: 1130; 44.6% identity (71.5% similar) in 428 aa overlap (645-1049:384-802)

          620       630       640       650       660       670    
pF1KB3 EEKCFCEPEDIQDPLCDELCRTVIAAAVLFSFIVSVLLSAFCIHCYHKFAHKPPISSAEM
                                     .:..: ....  .. ... ..:  . : .:
CCDS61 AWLTVLEALEERPAVMTSPLYLEIIIYCTGAFLISCMVGSVIVYKMKSGTKKSDFHS-QM
           360       370       380       390       400       410   

          680             690               700         710        
pF1KB3 TFRRPAQAFP------VSYSSSGAR-------RPS-LDSMENQV--SVDAFKILEDPKWE
       . .. :...:      :: .::..        ::: :.:  . .  .:. ... :::.::
CCDS61 AVHKLAKSIPLRRQVTVSADSSASMNSGVLLVRPSRLSSSGTPMLAGVSEYELPEDPRWE
            420       430       440       450       460       470  

      720       730       740        750        760       770      
pF1KB3 FPRKNLVLGKTLGEGEFGKVVKATAFHL-KGRAGYTT-VAVKMLKENASPSELRDLLSEF
       .::  ::::: :::: ::.:: : :. : : . . .: ::::::: .:. ..: ::.::.
CCDS61 LPRDRLVLGKPLGEGCFGQVVLAEAIGLDKDKPNRVTKVAVKMLKSDATEKDLSDLISEM
            480       490       500       510       520       530  

        780        790       800       810       820       830     
pF1KB3 NVLKQVN-HPHVIKLYGACSQDGPLLLIVEYAKYGSLRGFLRESRKVGPGYLGSGGSRNS
       ...:... : ..:.: :::.::::: .:::::. :.:: .:.  :  :  :       : 
CCDS61 EMMKMIGKHKNIINLLGACTQDGPLYVIVEYASKGNLREYLQARRPPGLEY-----CYNP
            540       550       560       570       580            

         840       850       860       870       880       890     
pF1KB3 SSLDHPDERALTMGDLISFAWQISQGMQYLAEMKLVHRDLAARNILVAEGRKMKISDFGL
       :   :  :. :.  ::.: :.:...::.:::  : .::::::::.::.:   :::.::::
CCDS61 S---HNPEEQLSSKDLVSCAYQVARGMEYLASKKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGL
          590       600       610       620       630       640    

         900       910       920       930       940       950     
pF1KB3 SRDVYEEDSYVKRSQGRIPVKWMAIESLFDHIYTTQSDVWSFGVLLWEIVTLGGNPYPGI
       .::... : : : ..::.:::::: :.:::.::: :::::::::::::: ::::.::::.
CCDS61 ARDIHHIDYYKKTTNGRLPVKWMAPEALFDRIYTHQSDVWSFGVLLWEIFTLGGSPYPGV
          650       660       670       680       690       700    

         960       970       980       990      1000        1010   
pF1KB3 PPERLFNLLKTGHRMERPDNCSEEMYRLMLQCWKQEPDKRPVFADISKDLEKM--MVKRR
       : :.::.::: ::::..:.::..:.: .: .::.  :..::.: .. .::...  ... .
CCDS61 PVEELFKLLKEGHRMDKPSNCTNELYMMMRDCWHAVPSQRPTFKQLVEDLDRIVALTSNQ
          710       720       730       740       750       760    

          1020      1030      1040        1050      1060      1070 
pF1KB3 DYLDLAASTPSDSLIYDDGLSEEETPLVDC--NNAPLPRALPSTWIENKLYGRISHAFTR
       .::::.    . :  . :  :   .   :   .. :::                      
CCDS61 EYLDLSMPLDQYSPSFPDTRSSTCSSGEDSVFSHEPLPEEPCLPRHPAQLANGGLKRR  
          770       780       790       800       810       820    

        
pF1KB3 F

>>CCDS55223.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8               (853 aa)
 initn: 1079 init1: 746 opt: 1120  Z-score: 541.1  bits: 111.5 E(32554): 8.1e-24
Smith-Waterman score: 1130; 44.6% identity (71.5% similar) in 428 aa overlap (645-1049:415-833)

          620       630       640       650       660       670    
pF1KB3 EEKCFCEPEDIQDPLCDELCRTVIAAAVLFSFIVSVLLSAFCIHCYHKFAHKPPISSAEM
                                     .:..: ....  .. ... ..:  . : .:
CCDS55 AWLTVLEALEERPAVMTSPLYLEIIIYCTGAFLISCMVGSVIVYKMKSGTKKSDFHS-QM
          390       400       410       420       430       440    

          680             690               700         710        
pF1KB3 TFRRPAQAFP------VSYSSSGAR-------RPS-LDSMENQV--SVDAFKILEDPKWE
       . .. :...:      :: .::..        ::: :.:  . .  .:. ... :::.::
CCDS55 AVHKLAKSIPLRRQVTVSADSSASMNSGVLLVRPSRLSSSGTPMLAGVSEYELPEDPRWE
           450       460       470       480       490       500   

      720       730       740        750        760       770      
pF1KB3 FPRKNLVLGKTLGEGEFGKVVKATAFHL-KGRAGYTT-VAVKMLKENASPSELRDLLSEF
       .::  ::::: :::: ::.:: : :. : : . . .: ::::::: .:. ..: ::.::.
CCDS55 LPRDRLVLGKPLGEGCFGQVVLAEAIGLDKDKPNRVTKVAVKMLKSDATEKDLSDLISEM
           510       520       530       540       550       560   

        780        790       800       810       820       830     
pF1KB3 NVLKQVN-HPHVIKLYGACSQDGPLLLIVEYAKYGSLRGFLRESRKVGPGYLGSGGSRNS
       ...:... : ..:.: :::.::::: .:::::. :.:: .:.  :  :  :       : 
CCDS55 EMMKMIGKHKNIINLLGACTQDGPLYVIVEYASKGNLREYLQARRPPGLEY-----CYNP
           570       580       590       600       610             

         840       850       860       870       880       890     
pF1KB3 SSLDHPDERALTMGDLISFAWQISQGMQYLAEMKLVHRDLAARNILVAEGRKMKISDFGL
       :   :  :. :.  ::.: :.:...::.:::  : .::::::::.::.:   :::.::::
CCDS55 S---HNPEEQLSSKDLVSCAYQVARGMEYLASKKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGL
         620       630       640       650       660       670     

         900       910       920       930       940       950     
pF1KB3 SRDVYEEDSYVKRSQGRIPVKWMAIESLFDHIYTTQSDVWSFGVLLWEIVTLGGNPYPGI
       .::... : : : ..::.:::::: :.:::.::: :::::::::::::: ::::.::::.
CCDS55 ARDIHHIDYYKKTTNGRLPVKWMAPEALFDRIYTHQSDVWSFGVLLWEIFTLGGSPYPGV
         680       690       700       710       720       730     

         960       970       980       990      1000        1010   
pF1KB3 PPERLFNLLKTGHRMERPDNCSEEMYRLMLQCWKQEPDKRPVFADISKDLEKM--MVKRR
       : :.::.::: ::::..:.::..:.: .: .::.  :..::.: .. .::...  ... .
CCDS55 PVEELFKLLKEGHRMDKPSNCTNELYMMMRDCWHAVPSQRPTFKQLVEDLDRIVALTSNQ
         740       750       760       770       780       790     

          1020      1030      1040        1050      1060      1070 
pF1KB3 DYLDLAASTPSDSLIYDDGLSEEETPLVDC--NNAPLPRALPSTWIENKLYGRISHAFTR
       .::::.    . :  . :  :   .   :   .. :::                      
CCDS55 EYLDLSMPLDQYSPSFPDTRSSTCSSGEDSVFSHEPLPEEPCLPRHPAQLANGGLKRR  
         800       810       820       830       840       850     

        
pF1KB3 F

>>CCDS81514.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10              (593 aa)
 initn: 1086 init1: 711 opt: 1115  Z-score: 540.6  bits: 110.9 E(32554): 8.7e-24
Smith-Waterman score: 1115; 43.5% identity (70.1% similar) in 428 aa overlap (621-1031:138-557)

              600       610       620       630       640       650
pF1KB3 VGGHEPGEPRGIKAGYGTCNCFPEEEKCFCEPEDIQDPLCDELCRTVIAAAVLFSFIVSV
                                     : :   .:   :.    :.. ..  ..:.:
CCDS81 DAGEYTCLAGNSIGISFHSAWLTVLPAPGREKEITASPDYLEIAIYCIGVFLIACMVVTV
       110       120       130       140       150       160       

              660        670         680       690             700 
pF1KB3 LLSAFCIHCYHK-FAHKPPIS--SAEMTFRRPAQAFPVSYSSSGARRP------SLDSME
       .:  .     .  :. .: .   . .. .:: . .   : :: ..  :       :.:  
CCDS81 ILCRMKNTTKKPDFSSQPAVHKLTKRIPLRRQVTVSAESSSSMNSNTPLVRITTRLSSTA
       170       180       190       200       210       220       

                710       720       730       740        750       
pF1KB3 NQ---VSVDAFKILEDPKWEFPRKNLVLGKTLGEGEFGKVVKATAFHL-KGRAGYT-TVA
       .    ..:. ... ::::::::: .:.::: :::: ::.:: : :  . : .   . :::
CCDS81 DTPMLAGVSEYELPEDPKWEFPRDKLTLGKPLGEGCFGQVVMAEAVGIDKDKPKEAVTVA
       230       240       250       260       270       280       

        760       770       780        790       800       810     
pF1KB3 VKMLKENASPSELRDLLSEFNVLKQVN-HPHVIKLYGACSQDGPLLLIVEYAKYGSLRGF
       :::::..:. ..: ::.::....:... : ..:.: :::.::::: .:::::. :.:: .
CCDS81 VKMLKDDATEKDLSDLVSEMEMMKMIGKHKNIINLLGACTQDGPLYVIVEYASKGNLREY
       290       300       310       320       330       340       

         820       830       840       850       860       870     
pF1KB3 LRESRKVGPGYLGSGGSRNSSSLDHPDERALTMGDLISFAWQISQGMQYLAEMKLVHRDL
       ::  :  :  :        : ....  :. .:. ::.: ..:...::.::: .: .::::
CCDS81 LRARRPPGMEY--------SYDINRVPEEQMTFKDLVSCTYQLARGMEYLASQKCIHRDL
       350               360       370       380       390         

         880       890       900       910       920       930     
pF1KB3 AARNILVAEGRKMKISDFGLSRDVYEEDSYVKRSQGRIPVKWMAIESLFDHIYTTQSDVW
       ::::.::.:.  :::.::::.::. . : : : ..::.:::::: :.:::..:: :::::
CCDS81 AARNVLVTENNVMKIADFGLARDINNIDYYKKTTNGRLPVKWMAPEALFDRVYTHQSDVW
     400       410       420       430       440       450         

         940       950       960       970       980       990     
pF1KB3 SFGVLLWEIVTLGGNPYPGIPPERLFNLLKTGHRMERPDNCSEEMYRLMLQCWKQEPDKR
       :::::.::: ::::.:::::: :.::.::: ::::..: ::..:.: .: .::.  :..:
CCDS81 SFGVLMWEIFTLGGSPYPGIPVEELFKLLKEGHRMDKPANCTNELYMMMRDCWHAVPSQR
     460       470       480       490       500       510         

        1000      1010        1020      1030      1040      1050   
pF1KB3 PVFADISKDLEKMMV--KRRDYLDLAASTPSDSLIYDDGLSEEETPLVDCNNAPLPRALP
       :.: .. .::.....    ..::::.    . :  : :                      
CCDS81 PTFKQLVEDLDRILTLTTNEEYLDLSQPLEQYSPSYPDTRSSCSSGDDSVFSPDPMPYEP
     520       530       540       550       560       570         

          1060      1070  
pF1KB3 STWIENKLYGRISHAFTRF
                          
CCDS81 CLPQYPHINGSVKT     
     580       590        




1072 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 13:26:59 2016 done: Thu Nov  3 13:27:00 2016
 Total Scan time:  3.780 Total Display time:  0.280

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com