Result of FASTA (ccds) for pF1KB3471
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3471, 534 aa
  1>>>pF1KB3471 534 - 534 aa - 534 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4773+/-0.00098; mu= 18.5655+/- 0.059
 mean_var=86.2232+/-17.234, 0's: 0 Z-trim(106.2): 32  B-trim: 49 in 1/51
 Lambda= 0.138122
 statistics sampled from 8835 (8864) to 8835 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.635), E-opt: 0.2 (0.272), width:  16
 Scan time:  3.360

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS8084.1 EHD1 gene_id:10938|Hs108|chr11          ( 534) 3552 718.1 6.4e-207
CCDS73315.1 EHD1 gene_id:10938|Hs108|chr11         ( 548) 3552 718.1 6.5e-207
CCDS1774.1 EHD3 gene_id:30845|Hs108|chr2           ( 535) 3188 645.5 4.4e-185
CCDS10081.1 EHD4 gene_id:30844|Hs108|chr15         ( 541) 2759 560.1 2.4e-159
CCDS12704.1 EHD2 gene_id:30846|Hs108|chr19         ( 543) 2608 530.0 2.7e-150
CCDS81943.1 SRL gene_id:6345|Hs108|chr16           ( 431)  765 162.6 8.2e-40
CCDS42113.1 SRL gene_id:6345|Hs108|chr16           ( 473)  765 162.7 8.8e-40
CCDS557.1 EPS15 gene_id:2060|Hs108|chr1            ( 896)  344 79.0 2.6e-14
CCDS59363.1 EPS15L1 gene_id:58513|Hs108|chr19      ( 601)  326 75.3 2.3e-13
CCDS58653.1 EPS15L1 gene_id:58513|Hs108|chr19      ( 754)  326 75.4 2.7e-13
CCDS32944.1 EPS15L1 gene_id:58513|Hs108|chr19      ( 864)  326 75.4   3e-13
CCDS58654.1 EPS15L1 gene_id:58513|Hs108|chr19      ( 910)  326 75.4 3.1e-13


>>CCDS8084.1 EHD1 gene_id:10938|Hs108|chr11               (534 aa)
 initn: 3552 init1: 3552 opt: 3552  Z-score: 3828.4  bits: 718.1 E(32554): 6.4e-207
Smith-Waterman score: 3552; 100.0% identity (100.0% similar) in 534 aa overlap (1-534:1-534)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MFSWVSKDARRKKEPELFQTVAEGLRQLYAQKLLPLEEHYRFHEFHSPALEDADFDNKPM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 MFSWVSKDARRKKEPELFQTVAEGLRQLYAQKLLPLEEHYRFHEFHSPALEDADFDNKPM
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 VLLVGQYSTGKTTFIRHLIEQDFPGMRIGPEPTTDSFIAVMHGPTEGVVPGNALVVDPRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 VLLVGQYSTGKTTFIRHLIEQDFPGMRIGPEPTTDSFIAVMHGPTEGVVPGNALVVDPRR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 PFRKLNAFGNAFLNRFMCAQLPNPVLDSISIIDTPGILSGEKQRISRGYDFAAVLEWFAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 PFRKLNAFGNAFLNRFMCAQLPNPVLDSISIIDTPGILSGEKQRISRGYDFAAVLEWFAE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 RVDRIILLFDAHKLDISDEFSEVIKALKNHEDKIRVVLNKADQIETQQLMRVYGALMWSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 RVDRIILLFDAHKLDISDEFSEVIKALKNHEDKIRVVLNKADQIETQQLMRVYGALMWSL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 GKIINTPEVVRVYIGSFWSHPLLIPDNRKLFEAEEQDLFKDIQSLPRNAALRKLNDLIKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 GKIINTPEVVRVYIGSFWSHPLLIPDNRKLFEAEEQDLFKDIQSLPRNAALRKLNDLIKR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 ARLAKVHAYIISSLKKEMPNVFGKESKKKELVNNLGEIYQKIEREHQISPGDFPSLRKMQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 ARLAKVHAYIISSLKKEMPNVFGKESKKKELVNNLGEIYQKIEREHQISPGDFPSLRKMQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 ELLQTQDFSKFQALKPKLLDTVDDMLANDIARLMVMVRQEESLMPSQVVKGGAFDGTMNG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 ELLQTQDFSKFQALKPKLLDTVDDMLANDIARLMVMVRQEESLMPSQVVKGGAFDGTMNG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 PFGHGYGEGAGEGIDDVEWVVGKDKPTYDEIFYTLSPVNGKITGANAKKEMVKSKLPNTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 PFGHGYGEGAGEGIDDVEWVVGKDKPTYDEIFYTLSPVNGKITGANAKKEMVKSKLPNTV
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530    
pF1KB3 LGKIWKLADVDKDGLLDDEEFALANHLIKVKLEGHELPADLPPHLVPPSKRRHE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 LGKIWKLADVDKDGLLDDEEFALANHLIKVKLEGHELPADLPPHLVPPSKRRHE
              490       500       510       520       530    

>>CCDS73315.1 EHD1 gene_id:10938|Hs108|chr11              (548 aa)
 initn: 3552 init1: 3552 opt: 3552  Z-score: 3828.2  bits: 718.1 E(32554): 6.5e-207
Smith-Waterman score: 3552; 100.0% identity (100.0% similar) in 534 aa overlap (1-534:15-548)

                             10        20        30        40      
pF1KB3               MFSWVSKDARRKKEPELFQTVAEGLRQLYAQKLLPLEEHYRFHEFH
                     ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MEQPGTAASPVSGSMFSWVSKDARRKKEPELFQTVAEGLRQLYAQKLLPLEEHYRFHEFH
               10        20        30        40        50        60

         50        60        70        80        90       100      
pF1KB3 SPALEDADFDNKPMVLLVGQYSTGKTTFIRHLIEQDFPGMRIGPEPTTDSFIAVMHGPTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SPALEDADFDNKPMVLLVGQYSTGKTTFIRHLIEQDFPGMRIGPEPTTDSFIAVMHGPTE
               70        80        90       100       110       120

        110       120       130       140       150       160      
pF1KB3 GVVPGNALVVDPRRPFRKLNAFGNAFLNRFMCAQLPNPVLDSISIIDTPGILSGEKQRIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 GVVPGNALVVDPRRPFRKLNAFGNAFLNRFMCAQLPNPVLDSISIIDTPGILSGEKQRIS
              130       140       150       160       170       180

        170       180       190       200       210       220      
pF1KB3 RGYDFAAVLEWFAERVDRIILLFDAHKLDISDEFSEVIKALKNHEDKIRVVLNKADQIET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RGYDFAAVLEWFAERVDRIILLFDAHKLDISDEFSEVIKALKNHEDKIRVVLNKADQIET
              190       200       210       220       230       240

        230       240       250       260       270       280      
pF1KB3 QQLMRVYGALMWSLGKIINTPEVVRVYIGSFWSHPLLIPDNRKLFEAEEQDLFKDIQSLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 QQLMRVYGALMWSLGKIINTPEVVRVYIGSFWSHPLLIPDNRKLFEAEEQDLFKDIQSLP
              250       260       270       280       290       300

        290       300       310       320       330       340      
pF1KB3 RNAALRKLNDLIKRARLAKVHAYIISSLKKEMPNVFGKESKKKELVNNLGEIYQKIEREH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RNAALRKLNDLIKRARLAKVHAYIISSLKKEMPNVFGKESKKKELVNNLGEIYQKIEREH
              310       320       330       340       350       360

        350       360       370       380       390       400      
pF1KB3 QISPGDFPSLRKMQELLQTQDFSKFQALKPKLLDTVDDMLANDIARLMVMVRQEESLMPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 QISPGDFPSLRKMQELLQTQDFSKFQALKPKLLDTVDDMLANDIARLMVMVRQEESLMPS
              370       380       390       400       410       420

        410       420       430       440       450       460      
pF1KB3 QVVKGGAFDGTMNGPFGHGYGEGAGEGIDDVEWVVGKDKPTYDEIFYTLSPVNGKITGAN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 QVVKGGAFDGTMNGPFGHGYGEGAGEGIDDVEWVVGKDKPTYDEIFYTLSPVNGKITGAN
              430       440       450       460       470       480

        470       480       490       500       510       520      
pF1KB3 AKKEMVKSKLPNTVLGKIWKLADVDKDGLLDDEEFALANHLIKVKLEGHELPADLPPHLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 AKKEMVKSKLPNTVLGKIWKLADVDKDGLLDDEEFALANHLIKVKLEGHELPADLPPHLV
              490       500       510       520       530       540

        530    
pF1KB3 PPSKRRHE
       ::::::::
CCDS73 PPSKRRHE
               

>>CCDS1774.1 EHD3 gene_id:30845|Hs108|chr2                (535 aa)
 initn: 3220 init1: 3188 opt: 3188  Z-score: 3436.3  bits: 645.5 E(32554): 4.4e-185
Smith-Waterman score: 3188; 87.0% identity (97.2% similar) in 532 aa overlap (1-532:1-532)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MFSWVSKDARRKKEPELFQTVAEGLRQLYAQKLLPLEEHYRFHEFHSPALEDADFDNKPM
       ::::.. : ::.:.::.::::.:::..:: .:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 MFSWLGTDDRRRKDPEVFQTVSEGLKKLYKSKLLPLEEHYRFHEFHSPALEDADFDNKPM
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 VLLVGQYSTGKTTFIRHLIEQDFPGMRIGPEPTTDSFIAVMHGPTEGVVPGNALVVDPRR
       ::::::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::.:  ::..:::::::::..
CCDS17 VLLVGQYSTGKTTFIRYLLEQDFPGMRIGPEPTTDSFIAVMQGDMEGIIPGNALVVDPKK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 PFRKLNAFGNAFLNRFMCAQLPNPVLDSISIIDTPGILSGEKQRISRGYDFAAVLEWFAE
       ::::::::::::::::.:::::::::.:::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 PFRKLNAFGNAFLNRFVCAQLPNPVLESISVIDTPGILSGEKQRISRGYDFAAVLEWFAE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 RVDRIILLFDAHKLDISDEFSEVIKALKNHEDKIRVVLNKADQIETQQLMRVYGALMWSL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS17 RVDRIILLFDAHKLDISDEFSEVIKALKNHEDKMRVVLNKADQIETQQLMRVYGALMWSL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 GKIINTPEVVRVYIGSFWSHPLLIPDNRKLFEAEEQDLFKDIQSLPRNAALRKLNDLIKR
       :::.:::::.:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS17 GKIVNTPEVIRVYIGSFWSHPLLIPDNRKLFEAEEQDLFRDIQSLPRNAALRKLNDLIKR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 ARLAKVHAYIISSLKKEMPNVFGKESKKKELVNNLGEIYQKIEREHQISPGDFPSLRKMQ
       :::::::::::::::::::.::::..:::::::::.::: .:::::::::::::.:..::
CCDS17 ARLAKVHAYIISSLKKEMPSVFGKDNKKKELVNNLAEIYGRIEREHQISPGDFPNLKRMQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 ELLQTQDFSKFQALKPKLLDTVDDMLANDIARLMVMVRQEESLMPSQVVKGGAFDGTMNG
       . ::.::::::: :: :::..::::::.:::.:::.::::::  : :.::::::.::..:
CCDS17 DQLQAQDFSKFQPLKSKLLEVVDDMLAHDIAQLMVLVRQEESQRPIQMVKGGAFEGTLHG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 PFGHGYGEGAGEGIDDVEWVVGKDKPTYDEIFYTLSPVNGKITGANAKKEMVKSKLPNTV
       ::::::::::::::::.::::..::: :::::::::::.:::::::::::::.:::::.:
CCDS17 PFGHGYGEGAGEGIDDAEWVVARDKPMYDEIFYTLSPVDGKITGANAKKEMVRSKLPNSV
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530     
pF1KB3 LGKIWKLADVDKDGLLDDEEFALANHLIKVKLEGHELPADLPPHLVPPSKRRHE 
       :::::::::.::::.:::.::::::::::::::::::: .:: ::.:::::.   
CCDS17 LGKIWKLADIDKDGMLDDDEFALANHLIKVKLEGHELPNELPAHLLPPSKRKVAE
              490       500       510       520       530     

>>CCDS10081.1 EHD4 gene_id:30844|Hs108|chr15              (541 aa)
 initn: 2795 init1: 2732 opt: 2759  Z-score: 2974.3  bits: 560.1 E(32554): 2.4e-159
Smith-Waterman score: 2759; 75.0% identity (91.6% similar) in 535 aa overlap (1-532:1-535)

                  10        20        30        40        50       
pF1KB3 MFSWVSKDA---RRKKEPELFQTVAEGLRQLYAQKLLPLEEHYRFHEFHSPALEDADFDN
       ::::....:   .:    .  :::. :::.:: .:.::::: ::::::::::::::::.:
CCDS10 MFSWMGRQAGGRERAGGADAVQTVTGGLRSLYLRKVLPLEEAYRFHEFHSPALEDADFEN
               10        20        30        40        50        60

        60        70        80        90       100       110       
pF1KB3 KPMVLLVGQYSTGKTTFIRHLIEQDFPGMRIGPEPTTDSFIAVMHGPTEGVVPGNALVVD
       :::.:::::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::.: ::: .::::::::
CCDS10 KPMILLVGQYSTGKTTFIRYLLEQDFPGMRIGPEPTTDSFIAVMYGETEGSTPGNALVVD
               70        80        90       100       110       120

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB3 PRRPFRKLNAFGNAFLNRFMCAQLPNPVLDSISIIDTPGILSGEKQRISRGYDFAAVLEW
       :..:::::. :::::::::::.:::: :: :::.::.:::::::::::::::::  ::.:
CCDS10 PKKPFRKLSRFGNAFLNRFMCSQLPNQVLKSISVIDSPGILSGEKQRISRGYDFCQVLQW
              130       140       150       160       170       180

       180       190       200       210       220       230       
pF1KB3 FAERVDRIILLFDAHKLDISDEFSEVIKALKNHEDKIRVVLNKADQIETQQLMRVYGALM
       :::::::::::::::::::::::::.:::.....::::::::::::..::::::::::::
CCDS10 FAERVDRIILLFDAHKLDISDEFSEAIKAFRGQDDKIRVVLNKADQVDTQQLMRVYGALM
              190       200       210       220       230       240

       240       250       260       270       280       290       
pF1KB3 WSLGKIINTPEVVRVYIGSFWSHPLLIPDNRKLFEAEEQDLFKDIQSLPRNAALRKLNDL
       :::::.::::::.::::::::..::   :::.::::: ::::.::::::..::.::::::
CCDS10 WSLGKVINTPEVLRVYIGSFWAQPLQNTDNRRLFEAEAQDLFRDIQSLPQKAAVRKLNDL
              250       260       270       280       290       300

       300       310       320       330       340       350       
pF1KB3 IKRARLAKVHAYIISSLKKEMPNVFGKESKKKELVNNLGEIYQKIEREHQISPGDFPSLR
       ::::::::::::::: ::::::.:::::.::.::.. : ::: ...::.::: :::: ..
CCDS10 IKRARLAKVHAYIISYLKKEMPSVFGKENKKRELISRLPEIYIQLQREYQISAGDFPEVK
              310       320       330       340       350       360

       360       370       380       390       400       410       
pF1KB3 KMQELLQTQDFSKFQALKPKLLDTVDDMLANDIARLMVMVRQEESLMPSQVVKGGAFDGT
        ::: :.. ::.::..:::::...::.::.: :. :: .. :::.  :.:.:.:::::::
CCDS10 AMQEQLENYDFTKFHSLKPKLIEAVDNMLSNKISPLMNLISQEETSTPTQLVQGGAFDGT
              370       380       390       400       410       420

       420       430       440       450       460       470       
pF1KB3 MNGPFGHGYGEGAGEGIDDVEWVVGKDKPTYDEIFYTLSPVNGKITGANAKKEMVKSKLP
        .:::..:::::: :: :. ::::.::::.:::.::::::.::::.:.::::::: ::::
CCDS10 TEGPFNQGYGEGAKEGADEEEWVVAKDKPVYDELFYTLSPINGKISGVNAKKEMVTSKLP
              430       440       450       460       470       480

       480       490       500       510       520       530       
pF1KB3 NTVLGKIWKLADVDKDGLLDDEEFALANHLIKVKLEGHELPADLPPHLVPPSKRRHE   
       :.:::::::::: : ::.::.::::::.::::.::.:.:::..:::::::::.:.     
CCDS10 NSVLGKIWKLADCDCDGMLDEEEFALAKHLIKIKLDGYELPSSLPPHLVPPSHRKSLPKA
              490       500       510       520       530       540

CCDS10 D
        

>>CCDS12704.1 EHD2 gene_id:30846|Hs108|chr19              (543 aa)
 initn: 2598 init1: 2122 opt: 2608  Z-score: 2811.6  bits: 530.0 E(32554): 2.7e-150
Smith-Waterman score: 2608; 71.5% identity (90.0% similar) in 540 aa overlap (1-534:1-539)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MFSWVSKDARRKKEPELFQTVAEGLRQLYAQKLLPLEEHYRFHEFHSPALEDADFDNKPM
       ::::... . : ..:: ..::. .:..::  :::::::::::  ::::::::::::.:::
CCDS12 MFSWLKRGGARGQQPEAIRTVTSALKELYRTKLLPLEEHYRFGAFHSPALEDADFDGKPM
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 VLLVGQYSTGKTTFIRHLIEQDFPGMRIGPEPTTDSFIAVMHGPTEGVVPGNALVVDPRR
       ::..::::::::.::..:.::. :: :.::::::: :.::::: :::.:::::::::: .
CCDS12 VLVAGQYSTGKTSFIQYLLEQEVPGSRVGPEPTTDCFVAVMHGDTEGTVPGNALVVDPDK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 PFRKLNAFGNAFLNRFMCAQLPNPVLDSISIIDTPGILSGEKQRISRGYDFAAVLEWFAE
       :::::: :::.:::::::::::: ::.::::::::::::: :::.:::::: :::.::::
CCDS12 PFRKLNPFGNTFLNRFMCAQLPNQVLESISIIDTPGILSGAKQRVSRGYDFPAVLRWFAE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 RVDRIILLFDAHKLDISDEFSEVIKALKNHEDKIRVVLNKADQIETQQLMRVYGALMWSL
       ::: ::::::::::.:::::::.: ::..:::::::::::::..::::::::::::::.:
CCDS12 RVDLIILLFDAHKLEISDEFSEAIGALRGHEDKIRVVLNKADMVETQQLMRVYGALMWAL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 GKIINTPEVVRVYIGSFWSHPLLIPDNRKLFEAEEQDLFKDIQSLPRNAALRKLNDLIKR
       ::...::::.:::::::::.:::.::::.::: ::::::.:::.:::.:::::::::.::
CCDS12 GKVVGTPEVLRVYIGSFWSQPLLVPDNRRLFELEEQDLFRDIQGLPRHAALRKLNDLVKR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 ARLAKVHAYIISSLKKEMPNVFGKESKKKELVNNLGEIYQKIEREHQISPGDFPSLRKMQ
       :::..::::::: ::::::.:::::.:::.:. .:  :. ::. ::.:::::::. .:::
CCDS12 ARLVRVHAYIISYLKKEMPSVFGKENKKKQLILKLPVIFAKIQLEHHISPGDFPDCQKMQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400        410         
pF1KB3 ELLQTQDFSKFQALKPKLLDTVDDMLANDIARLMVMVRQEESLMPSQV-VKGGAFDGTMN
       :::...::.::..::::::...:.::..:::.:: ..:::: :  ..: :.::::.::  
CCDS12 ELLMAHDFTKFHSLKPKLLEALDEMLTHDIAKLMPLLRQEE-LESTEVGVQGGAFEGTHM
              370       380       390       400        410         

     420           430        440       450       460       470    
pF1KB3 GPF---GHGYG-EGAGEGIDD-VEWVVGKDKPTYDEIFYTLSPVNGKITGANAKKEMVKS
       :::   :   . : . :: :: .:::: :::  ::::::.:.:..::..:..::  :: .
CCDS12 GPFVERGPDEAMEDGEEGSDDEAEWVVTKDKSKYDEIFYNLAPADGKLSGSKAKTWMVGT
     420       430       440       450       460       470         

          480       490       500       510       520       530    
pF1KB3 KLPNTVLGKIWKLADVDKDGLLDDEEFALANHLIKVKLEGHELPADLPPHLVPPSKRRHE
       ::::.:::.::::.:::.::.:::::::::.:::..::::: :::.:: .:::::::::.
CCDS12 KLPNSVLGRIWKLSDVDRDGMLDDEEFALASHLIEAKLEGHGLPANLPRRLVPPSKRRHK
     480       490       500       510       520       530         

CCDS12 GSAE
     540   

>>CCDS81943.1 SRL gene_id:6345|Hs108|chr16                (431 aa)
 initn: 533 init1: 390 opt: 765  Z-score: 828.2  bits: 162.6 E(32554): 8.2e-40
Smith-Waterman score: 765; 33.2% identity (69.4% similar) in 373 aa overlap (13-377:6-377)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MFSWVSKDARRKKEPELFQTVAEGLRQLYAQKLLPLEEHYRFHEFHSPALEDADFDNKPM
                   :  . ...: . ::..: ... :::. :...:...  . :... .:::
CCDS81        MLNEDKPSDDYSAVLQRLRKIYHSSIKPLEQSYKYNELRQHEITDGEITSKPM
                      10        20        30        40        50   

               70          80        90       100       110        
pF1KB3 VLLVGQYSTGKTTFIRHLI--EQDFPGMRIGPEPTTDSFIAVMHGPTEGVVPGNALVVDP
       ::..: .:.::.:.: .:.  :.    .  : ::::. : ..::::   .. : ....: 
CCDS81 VLFLGPWSVGKSTMINYLLGLENTRYQLYTGAEPTTSEFTVLMHGPKLKTIEGIVMAADS
            60        70        80        90       100       110   

      120       130       140       150       160       170        
pF1KB3 RRPFRKLNAFGNAFLNRFMCAQLPNPVLDSISIIDTPGILSGEKQRISRGYDFAAVLEWF
        : :  :. ::. ::....  ..:. .:. ....:::::. ..::.  ::: :  : .::
CCDS81 ARSFSPLEKFGQNFLEKLIGIEVPHKLLERVTFVDTPGIIENRKQQ-ERGYPFNDVCQWF
           120       130       140       150        160       170  

      180       190       200       210       220       230        
pF1KB3 AERVDRIILLFDAHKLDISDEFSEVIKALKNHEDKIRVVLNKADQIETQQLMRVYGALMW
        .:.: :...::  :::.. :.  ... ::..:..::..:::::.. ::.::::::::.:
CCDS81 IDRADLIFVVFDPTKLDVGLELEMLFRQLKGRESQIRIILNKADNLATQMLMRVYGALFW
            180       190       200       210       220       230  

      240       250       260       270       280       290        
pF1KB3 SLGKIINTPEVVRVYIGSFWSHPLLIPDNRKLFEAEEQDLFKDIQSLPRNAALRKLNDLI
       ::. .::. :  :::..::: .      ...::  :: .:..:.... .:    :.  . 
CCDS81 SLAPLINVTEPPRVYVSSFWPQEYKPDTHQELFLQEEISLLEDLNQVIENRLENKIAFIR
            240       250       260       270       280       290  

      300       310           320       330         340       350  
pF1KB3 KRARLAKVHAYIIS----SLKKEMPNVFGKESKKKELVNNLGE--IYQKIEREHQISPGD
       ..:  ...:: ...    . : .:      :   :..:..  .  :.. :  . ..:  :
CCDS81 QHAIRVRIHALLVDRYLQTYKDKMTFFSDGELVFKDIVEDPDKFYIFKTILAKTNVSKFD
            300       310       320       330       340       350  

            360       370       380       390       400       410  
pF1KB3 FPSLRKMQELLQTQDFSKFQALKPKLLDTVDDMLANDIARLMVMVRQEESLMPSQVVKGG
       .:. . .....  . .:.:. :. .                                   
CCDS81 LPNREAYKDFFGINPISSFKLLSQQCSYMGGCFLEKIERAITQELPGLLGSLGLGKNPGA
            360       370       380       390       400       410  

>>CCDS42113.1 SRL gene_id:6345|Hs108|chr16                (473 aa)
 initn: 533 init1: 390 opt: 765  Z-score: 827.7  bits: 162.7 E(32554): 8.8e-40
Smith-Waterman score: 765; 33.2% identity (69.4% similar) in 373 aa overlap (13-377:48-419)

                                 10        20        30        40  
pF1KB3                   MFSWVSKDARRKKEPELFQTVAEGLRQLYAQKLLPLEEHYRF
                                     :  . ...: . ::..: ... :::. :..
CCDS42 GQAEETEDANEEAPLRDRSHIEKTLMLNEDKPSDDYSAVLQRLRKIYHSSIKPLEQSYKY
        20        30        40        50        60        70       

             50        60        70          80        90       100
pF1KB3 HEFHSPALEDADFDNKPMVLLVGQYSTGKTTFIRHLI--EQDFPGMRIGPEPTTDSFIAV
       .:...  . :... .:::::..: .:.::.:.: .:.  :.    .  : ::::. : ..
CCDS42 NELRQHEITDGEITSKPMVLFLGPWSVGKSTMINYLLGLENTRYQLYTGAEPTTSEFTVL
        80        90       100       110       120       130       

              110       120       130       140       150       160
pF1KB3 MHGPTEGVVPGNALVVDPRRPFRKLNAFGNAFLNRFMCAQLPNPVLDSISIIDTPGILSG
       ::::   .. : ....:  : :  :. ::. ::....  ..:. .:. ....:::::. .
CCDS42 MHGPKLKTIEGIVMAADSARSFSPLEKFGQNFLEKLIGIEVPHKLLERVTFVDTPGIIEN
       140       150       160       170       180       190       

              170       180       190       200       210       220
pF1KB3 EKQRISRGYDFAAVLEWFAERVDRIILLFDAHKLDISDEFSEVIKALKNHEDKIRVVLNK
       .::.  ::: :  : .:: .:.: :...::  :::.. :.  ... ::..:..::..:::
CCDS42 RKQQ-ERGYPFNDVCQWFIDRADLIFVVFDPTKLDVGLELEMLFRQLKGRESQIRIILNK
       200        210       220       230       240       250      

              230       240       250       260       270       280
pF1KB3 ADQIETQQLMRVYGALMWSLGKIINTPEVVRVYIGSFWSHPLLIPDNRKLFEAEEQDLFK
       ::.. ::.::::::::.:::. .::. :  :::..::: .      ...::  :: .:..
CCDS42 ADNLATQMLMRVYGALFWSLAPLINVTEPPRVYVSSFWPQEYKPDTHQELFLQEEISLLE
        260       270       280       290       300       310      

              290       300       310           320       330      
pF1KB3 DIQSLPRNAALRKLNDLIKRARLAKVHAYIIS----SLKKEMPNVFGKESKKKELVNNLG
       :.... .:    :.  . ..:  ...:: ...    . : .:      :   :..:..  
CCDS42 DLNQVIENRLENKIAFIRQHAIRVRIHALLVDRYLQTYKDKMTFFSDGELVFKDIVEDPD
        320       330       340       350       360       370      

          340       350       360       370       380       390    
pF1KB3 E--IYQKIEREHQISPGDFPSLRKMQELLQTQDFSKFQALKPKLLDTVDDMLANDIARLM
       .  :.. :  . ..:  :.:. . .....  . .:.:. :. .                 
CCDS42 KFYIFKTILAKTNVSKFDLPNREAYKDFFGINPISSFKLLSQQCSYMGGCFLEKIERAIT
        380       390       400       410       420       430      

          400       410       420       430       440       450    
pF1KB3 VMVRQEESLMPSQVVKGGAFDGTMNGPFGHGYGEGAGEGIDDVEWVVGKDKPTYDEIFYT
                                                                   
CCDS42 QELPGLLGSLGLGKNPGALNCDKTGCSETPKNRYRKH                       
        440       450       460       470                          

>>CCDS557.1 EPS15 gene_id:2060|Hs108|chr1                 (896 aa)
 initn: 463 init1: 330 opt: 344  Z-score: 370.5  bits: 79.0 E(32554): 2.6e-14
Smith-Waterman score: 344; 47.1% identity (75.0% similar) in 104 aa overlap (430-532:113-216)

     400       410       420       430       440        450        
pF1KB3 EESLMPSQVVKGGAFDGTMNGPFGHGYGEGAGEGIDDVEWVVG-KDKPTYDEIFYTLSPV
                                     .: .  .. :.:  .::  :: :: .::::
CCDS55 AQNGLEVSLSSLNLAVPPPRFHDTSSPLLISGTSAAELPWAVKPEDKAKYDAIFDSLSPV
             90       100       110       120       130       140  

      460       470       480       490       500       510        
pF1KB3 NGKITGANAKKEMVKSKLPNTVLGKIWKLADVDKDGLLDDEEFALANHLIKVKLEGHELP
       :: ..: ..:  ...::::  .::..:.:.:.:.::.:: .:::.:  :.   :: . .:
CCDS55 NGFLSGDKVKPVLLNSKLPVDILGRVWELSDIDHDGMLDRDEFAVAMFLVYCALEKEPVP
            150       160       170       180       190       200  

      520       530                                                
pF1KB3 ADLPPHLVPPSKRRHE                                            
        .::: :::::::.                                              
CCDS55 MSLPPALVPPSKRKTWVVSPAEKAKYDEIFLKTDKDMDGFVSGLEVREIFLKTGLPSTLL
            210       220       230       240       250       260  

>>CCDS59363.1 EPS15L1 gene_id:58513|Hs108|chr19           (601 aa)
 initn: 422 init1: 303 opt: 326  Z-score: 353.5  bits: 75.3 E(32554): 2.3e-13
Smith-Waterman score: 326; 46.9% identity (75.5% similar) in 98 aa overlap (436-532:118-215)

         410       420       430       440        450       460    
pF1KB3 SQVVKGGAFDGTMNGPFGHGYGEGAGEGIDDVEWVVG-KDKPTYDEIFYTLSPVNGKITG
                                     ...:.:  ..:  .: :: .: :.:: ..:
CCDS59 EVTLSNLNLSMPPPKFHDTSSPLMVTPPSAEAHWAVRVEEKAKFDGIFESLLPINGLLSG
        90       100       110       120       130       140       

          470       480       490       500       510       520    
pF1KB3 ANAKKEMVKSKLPNTVLGKIWKLADVDKDGLLDDEEFALANHLIKVKLEGHELPADLPPH
        ..:  ...::::  :::..: :.:.:::: :: .:::.: ::.   :: . .:. ::: 
CCDS59 DKVKPVLMNSKLPLDVLGRVWDLSDIDKDGHLDRDEFAVAMHLVYRALEKEPVPSALPPS
       150       160       170       180       190       200       

          530                                                      
pF1KB3 LVPPSKRRHE                                                  
       :.:::::.                                                    
CCDS59 LIPPSKRKKTVFPGAVPVLPASPPPKDSLRSTPSHGSVSSLNSTGSLSPKHSLKQTQPTV
       210       220       230       240       250       260       

>>CCDS58653.1 EPS15L1 gene_id:58513|Hs108|chr19           (754 aa)
 initn: 422 init1: 303 opt: 326  Z-score: 352.1  bits: 75.4 E(32554): 2.7e-13
Smith-Waterman score: 326; 46.9% identity (75.5% similar) in 98 aa overlap (436-532:118-215)

         410       420       430       440        450       460    
pF1KB3 SQVVKGGAFDGTMNGPFGHGYGEGAGEGIDDVEWVVG-KDKPTYDEIFYTLSPVNGKITG
                                     ...:.:  ..:  .: :: .: :.:: ..:
CCDS58 EVTLSNLNLSMPPPKFHDTSSPLMVTPPSAEAHWAVRVEEKAKFDGIFESLLPINGLLSG
        90       100       110       120       130       140       

          470       480       490       500       510       520    
pF1KB3 ANAKKEMVKSKLPNTVLGKIWKLADVDKDGLLDDEEFALANHLIKVKLEGHELPADLPPH
        ..:  ...::::  :::..: :.:.:::: :: .:::.: ::.   :: . .:. ::: 
CCDS58 DKVKPVLMNSKLPLDVLGRVWDLSDIDKDGHLDRDEFAVAMHLVYRALEKEPVPSALPPS
       150       160       170       180       190       200       

          530                                                      
pF1KB3 LVPPSKRRHE                                                  
       :.:::::.                                                    
CCDS58 LIPPSKRKKTVFPGAVPVLPASPPPKDSLRSTPSHGSVSSLNSTGSLSPKHSLKQTQPTV
       210       220       230       240       250       260       




534 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 13:20:41 2016 done: Thu Nov  3 13:20:42 2016
 Total Scan time:  3.360 Total Display time:  0.090

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com