Result of FASTA (ccds) for pF1KB3414
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3414, 876 aa
  1>>>pF1KB3414 876 - 876 aa - 876 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1905+/-0.00103; mu= 15.5293+/- 0.061
 mean_var=62.2750+/-12.363, 0's: 0 Z-trim(102.1): 43  B-trim: 365 in 1/49
 Lambda= 0.162524
 statistics sampled from 6778 (6807) to 6778 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.558), E-opt: 0.2 (0.209), width:  16
 Scan time:  4.190

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS11513.1 KPNB1 gene_id:3837|Hs108|chr17         ( 876) 5713 1348.7       0
CCDS62228.1 KPNB1 gene_id:3837|Hs108|chr17         ( 731) 4787 1131.6       0
CCDS4016.1 TNPO1 gene_id:3842|Hs108|chr5           ( 890)  310 81.9 5.8e-15
CCDS43329.1 TNPO1 gene_id:3842|Hs108|chr5          ( 898)  310 81.9 5.9e-15
CCDS45992.1 TNPO2 gene_id:30000|Hs108|chr19        ( 887)  292 77.6 1.1e-13
CCDS45991.1 TNPO2 gene_id:30000|Hs108|chr19        ( 897)  292 77.6 1.1e-13


>>CCDS11513.1 KPNB1 gene_id:3837|Hs108|chr17              (876 aa)
 initn: 5713 init1: 5713 opt: 5713  Z-score: 7228.9  bits: 1348.7 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5713; 100.0% identity (100.0% similar) in 876 aa overlap (1-876:1-876)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MELITILEKTVSPDRLELEAAQKFLERAAVENLPTFLVELSRVLANPGNSQVARVAAGLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MELITILEKTVSPDRLELEAAQKFLERAAVENLPTFLVELSRVLANPGNSQVARVAAGLQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 IKNSLTSKDPDIKAQYQQRWLAIDANARREVKNYVLQTLGTETYRPSSASQCVAGIACAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IKNSLTSKDPDIKAQYQQRWLAIDANARREVKNYVLQTLGTETYRPSSASQCVAGIACAE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 IPVNQWPELIPQLVANVTNPNSTEHMKESTLEAIGYICQDIDPEQLQDKSNEILTAIIQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IPVNQWPELIPQLVANVTNPNSTEHMKESTLEAIGYICQDIDPEQLQDKSNEILTAIIQG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 MRKEEPSNNVKLAATNALLNSLEFTKANFDKESERHFIMQVVCEATQCPDTRVRVAALQN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MRKEEPSNNVKLAATNALLNSLEFTKANFDKESERHFIMQVVCEATQCPDTRVRVAALQN
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 LVKIMSLYYQYMETYMGPALFAITIEAMKSDIDEVALQGIEFWSNVCDEEMDLAIEASEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LVKIMSLYYQYMETYMGPALFAITIEAMKSDIDEVALQGIEFWSNVCDEEMDLAIEASEA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 AEQGRPPEHTSKFYAKGALQYLVPILTQTLTKQDENDDDDDWNPCKAAGVCLMLLATCCE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AEQGRPPEHTSKFYAKGALQYLVPILTQTLTKQDENDDDDDWNPCKAAGVCLMLLATCCE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 DDIVPHVLPFIKEHIKNPDWRYRDAAVMAFGCILEGPEPSQLKPLVIQAMPTLIELMKDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DDIVPHVLPFIKEHIKNPDWRYRDAAVMAFGCILEGPEPSQLKPLVIQAMPTLIELMKDP
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 SVVVRDTAAWTVGRICELLPEAAINDVYLAPLLQCLIEGLSAEPRVASNVCWAFSSLAEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SVVVRDTAAWTVGRICELLPEAAINDVYLAPLLQCLIEGLSAEPRVASNVCWAFSSLAEA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 AYEAADVADDQEEPATYCLSSSFELIVQKLLETTDRPDGHQNNLRSSAYESLMEIVKNSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AYEAADVADDQEEPATYCLSSSFELIVQKLLETTDRPDGHQNNLRSSAYESLMEIVKNSA
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 KDCYPAVQKTTLVIMERLQQVLQMESHIQSTSDRIQFNDLQSLLCATLQNVLRKVQHQDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KDCYPAVQKTTLVIMERLQQVLQMESHIQSTSDRIQFNDLQSLLCATLQNVLRKVQHQDA
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB3 LQISDVVMASLLRMFQSTAGSGGVQEDALMAVSTLVEVLGGEFLKYMEAFKPFLGIGLKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LQISDVVMASLLRMFQSTAGSGGVQEDALMAVSTLVEVLGGEFLKYMEAFKPFLGIGLKN
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB3 YAEYQVCLAAVGLVGDLCRALQSNIIPFCDEVMQLLLENLGNENVHRSVKPQILSVFGDI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YAEYQVCLAAVGLVGDLCRALQSNIIPFCDEVMQLLLENLGNENVHRSVKPQILSVFGDI
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB3 ALAIGGEFKKYLEVVLNTLQQASQAQVDKSDYDMVDYLNELRESCLEAYTGIVQGLKGDQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ALAIGGEFKKYLEVVLNTLQQASQAQVDKSDYDMVDYLNELRESCLEAYTGIVQGLKGDQ
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB3 ENVHPDVMLVQPRVEFILSFIDHIAGDEDHTDGVVACAAGLIGDLCTAFGKDVLKLVEAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ENVHPDVMLVQPRVEFILSFIDHIAGDEDHTDGVVACAAGLIGDLCTAFGKDVLKLVEAR
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870      
pF1KB3 PMIHELLTEGRRSKTNKAKTLATWATKELRKLKNQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PMIHELLTEGRRSKTNKAKTLATWATKELRKLKNQA
              850       860       870      

>>CCDS62228.1 KPNB1 gene_id:3837|Hs108|chr17              (731 aa)
 initn: 4787 init1: 4787 opt: 4787  Z-score: 6056.8  bits: 1131.6 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4787; 100.0% identity (100.0% similar) in 731 aa overlap (146-876:1-731)

         120       130       140       150       160       170     
pF1KB3 IACAEIPVNQWPELIPQLVANVTNPNSTEHMKESTLEAIGYICQDIDPEQLQDKSNEILT
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62                               MKESTLEAIGYICQDIDPEQLQDKSNEILT
                                             10        20        30

         180       190       200       210       220       230     
pF1KB3 AIIQGMRKEEPSNNVKLAATNALLNSLEFTKANFDKESERHFIMQVVCEATQCPDTRVRV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 AIIQGMRKEEPSNNVKLAATNALLNSLEFTKANFDKESERHFIMQVVCEATQCPDTRVRV
               40        50        60        70        80        90

         240       250       260       270       280       290     
pF1KB3 AALQNLVKIMSLYYQYMETYMGPALFAITIEAMKSDIDEVALQGIEFWSNVCDEEMDLAI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 AALQNLVKIMSLYYQYMETYMGPALFAITIEAMKSDIDEVALQGIEFWSNVCDEEMDLAI
              100       110       120       130       140       150

         300       310       320       330       340       350     
pF1KB3 EASEAAEQGRPPEHTSKFYAKGALQYLVPILTQTLTKQDENDDDDDWNPCKAAGVCLMLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 EASEAAEQGRPPEHTSKFYAKGALQYLVPILTQTLTKQDENDDDDDWNPCKAAGVCLMLL
              160       170       180       190       200       210

         360       370       380       390       400       410     
pF1KB3 ATCCEDDIVPHVLPFIKEHIKNPDWRYRDAAVMAFGCILEGPEPSQLKPLVIQAMPTLIE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 ATCCEDDIVPHVLPFIKEHIKNPDWRYRDAAVMAFGCILEGPEPSQLKPLVIQAMPTLIE
              220       230       240       250       260       270

         420       430       440       450       460       470     
pF1KB3 LMKDPSVVVRDTAAWTVGRICELLPEAAINDVYLAPLLQCLIEGLSAEPRVASNVCWAFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 LMKDPSVVVRDTAAWTVGRICELLPEAAINDVYLAPLLQCLIEGLSAEPRVASNVCWAFS
              280       290       300       310       320       330

         480       490       500       510       520       530     
pF1KB3 SLAEAAYEAADVADDQEEPATYCLSSSFELIVQKLLETTDRPDGHQNNLRSSAYESLMEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 SLAEAAYEAADVADDQEEPATYCLSSSFELIVQKLLETTDRPDGHQNNLRSSAYESLMEI
              340       350       360       370       380       390

         540       550       560       570       580       590     
pF1KB3 VKNSAKDCYPAVQKTTLVIMERLQQVLQMESHIQSTSDRIQFNDLQSLLCATLQNVLRKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 VKNSAKDCYPAVQKTTLVIMERLQQVLQMESHIQSTSDRIQFNDLQSLLCATLQNVLRKV
              400       410       420       430       440       450

         600       610       620       630       640       650     
pF1KB3 QHQDALQISDVVMASLLRMFQSTAGSGGVQEDALMAVSTLVEVLGGEFLKYMEAFKPFLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 QHQDALQISDVVMASLLRMFQSTAGSGGVQEDALMAVSTLVEVLGGEFLKYMEAFKPFLG
              460       470       480       490       500       510

         660       670       680       690       700       710     
pF1KB3 IGLKNYAEYQVCLAAVGLVGDLCRALQSNIIPFCDEVMQLLLENLGNENVHRSVKPQILS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 IGLKNYAEYQVCLAAVGLVGDLCRALQSNIIPFCDEVMQLLLENLGNENVHRSVKPQILS
              520       530       540       550       560       570

         720       730       740       750       760       770     
pF1KB3 VFGDIALAIGGEFKKYLEVVLNTLQQASQAQVDKSDYDMVDYLNELRESCLEAYTGIVQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 VFGDIALAIGGEFKKYLEVVLNTLQQASQAQVDKSDYDMVDYLNELRESCLEAYTGIVQG
              580       590       600       610       620       630

         780       790       800       810       820       830     
pF1KB3 LKGDQENVHPDVMLVQPRVEFILSFIDHIAGDEDHTDGVVACAAGLIGDLCTAFGKDVLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 LKGDQENVHPDVMLVQPRVEFILSFIDHIAGDEDHTDGVVACAAGLIGDLCTAFGKDVLK
              640       650       660       670       680       690

         840       850       860       870      
pF1KB3 LVEARPMIHELLTEGRRSKTNKAKTLATWATKELRKLKNQA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 LVEARPMIHELLTEGRRSKTNKAKTLATWATKELRKLKNQA
              700       710       720       730 

>>CCDS4016.1 TNPO1 gene_id:3842|Hs108|chr5                (890 aa)
 initn: 245 init1: 168 opt: 310  Z-score: 382.1  bits: 81.9 E(32554): 5.8e-15
Smith-Waterman score: 456; 22.6% identity (52.1% similar) in 800 aa overlap (2-739:14-754)

                           10        20        30        40        
pF1KB3             MELITILEKTVSPDRLELEAAQKFLERAAVENLPTFLVELSRVLAN-P
                    ... .:... :::    ...:. ::.  ... : :   :  ::..  
CCDS40 MEYEWKPDEQGLQQILQLLKESQSPDTTIQRTVQQKLEQ--LNQYPDFNNYLIFVLTKLK
               10        20        30          40        50        

        50        60        70        80        90       100       
pF1KB3 GNSQVARVAAGLQIKNSLTSKDPDIKAQYQQRWLAIDANARREVKNYVLQTLGTETYRPS
       .... .:  .:: .::       ..::..:.    .  ..   .:.  :...:  .    
CCDS40 SEDEPTRSLSGLILKN-------NVKAHFQN----FPNGVTDFIKSECLNNIGDSSPLIR
       60        70               80            90       100       

       110       120       130       140       150       160       
pF1KB3 SASQCVAGIACAEIPVNQWPELIPQLVANVTNPNSTEHMKESTLEAIGYICQD----IDP
       ..   .     ..  ...::.:.:.: . . . .   .  :... :.  ::.:    .: 
CCDS40 ATVGILITTIASKGELQNWPDLLPKLCSLLDSEDY--NTCEGAFGALQKICEDSAEILDS
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pF1KB3 EQLQDKSNEILTAIIQGMRKEEPS---------NNVKLAATNALLNSLE-FTKANF----
       . :.   : ..  ..: ...  :.         :.  .. :.::.  .. : .  :    
CCDS40 DVLDRPLNIMIPKFLQFFKHSSPKIRSHAVACVNQFIISRTQALMLHIDSFIENLFALAG
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pF1KB3 DKESERHFIMQVVCEA-TQCPDTRVR--VAALQNLVKIMSLYYQYMETYMG---------
       :.: :   . . ::.: ..  ..:.   .  ..:.:. :    : ..  ..         
CCDS40 DEEPE---VRKNVCRALVMLLEVRMDRLLPHMHNIVEYMLQRTQDQDENVALEACEFWLT
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pF1KB3 ---------------PALFAITIEAMK-SDIDEVALQGIEFWSNVCDEEMDLAIEASEAA
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CCDS40 LAEQPICKDVLVRHLPKLIPVLVNGMKYSDIDIILLKG--------DVEEDETIPDSE--
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pF1KB3 EQGRPPEHTSKFYAKGALQYLVPILTQTLTKQDENDDDD---DWNPCKAAGVCLMLLATC
       .. ::  : :.  :.   :.    . .    .:: ::::   :::  : ... : .::. 
CCDS40 QDIRPRFHRSRTVAQ---QHDEDGIEEEDDDDDEIDDDDTISDWNLRKCSAAALDVLANV
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pF1KB3 CEDDIVPHVLPFIKEHIKNPDWRYRDAAVMAFGCILEGPEPSQLKPLVIQAMPTLIELMK
        .:...::.::..:: . . .:  ........: : ::   ... : . . .: ::. ..
CCDS40 YRDELLPHILPLLKELLFHHEWVVKESGILVLGAIAEGCMQGMI-PYLPELIPHLIQCLS
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pF1KB3 DPSVVVRDTAAWTVGRICELLPEAAINDVYLAPLLQCLIEG-LSAEPRVASNVCWAFSSL
       : ...::. . ::..:  . .  .   :.:: ::.  :..  :... ::   .: ::..:
CCDS40 DKKALVRSITCWTLSRYAHWVV-SQPPDTYLKPLMTELLKRILDSNKRVQEAACSAFATL
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pF1KB3 AEAA-YEAADVADDQEEPATYCLSSSFE---LIVQKLLETTDRPDGHQNNLRSSAYESLM
        : :  : .       .  .. .:.  .   ::.   . :     ::. : .    . ::
CCDS40 EEEACTELVPYLAYILDTLVFAFSKYQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLN-KPEYIQMLM
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pF1KB3 -------EIVKNSAKDCYPAVQKTTLVIMERLQQVLQMESHIQSTSDRIQFNDLQSLLCA
              ...:.  :: .: ..  . :     .  : .   . .       : .:. :  
CCDS40 PPLIQKWNMLKDEDKDLFPLLECLSSVATALQSGFLPYCEPVYQRC----VNLVQKTLAQ
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pF1KB3 TLQNVLRKVQHQDALQISDVVMASLLRMFQSTAGSGGVQEDALMAVSTLVEVLGGEFLKY
       .. :  .  :..   .  : ....:  .   . : ::  :. :.: :... ..     . 
CCDS40 AMLNNAQPDQYEAPDK--DFMIVALDLLSGLAEGLGGNIEQ-LVARSNILTLM----YQC
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pF1KB3 MEAFKPFLGIGLKNYAEYQVCLAAVGLVGDLCRALQSNIIPFCDEVMQLLLENLGNENVH
       :.   :            .:  .. .:.::: .:  ... :   . : .:  ::. : . 
CCDS40 MQDKMP------------EVRQSSFALLGDLTKACFQHVKPCIADFMPILGTNLNPEFI-
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pF1KB3 RSVKPQILSVFGDIALAIGGEFKKYLEVVLNTLQQASQAQVDKSDYDMVDYLNELRESCL
        ::  .   ..:.:.. .: :.. :. .::. :                           
CCDS40 -SVCNNATWAIGEISIQMGIEMQPYIPMVLHQLVEIINRPNTPKTLLENTAITIGRLGYV
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pF1KB3 EAYTGIVQGLKGDQENVHPDVMLVQPRVEFILSFIDHIAGDEDHTDGVVACAAGLIGDLC
                                                                   
CCDS40 CPQEVAPMLQQFIRPWCTSLRNIRDNEEKDSAFRGICTMISVNPSGVIQDFIFFCDAVAS
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>>CCDS43329.1 TNPO1 gene_id:3842|Hs108|chr5               (898 aa)
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CCDS43 MVWDRQTKMEYEWKPDEQGLQQILQLLKESQSPDTTIQRTVQQKLEQ--LNQYPDFNNYL
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pF1KB3 SRVLAN-PGNSQVARVAAGLQIKNSLTSKDPDIKAQYQQRWLAIDANARREVKNYVLQTL
         ::..  .... .:  .:: .::       ..::..:.    .  ..   .:.  :...
CCDS43 IFVLTKLKSEDEPTRSLSGLILKN-------NVKAHFQN----FPNGVTDFIKSECLNNI
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pF1KB3 GTETYRPSSASQCVAGIACAEIPVNQWPELIPQLVANVTNPNSTEHMKESTLEAIGYICQ
       :  .    ..   .     ..  ...::.:.:.: . . . .   .  :... :.  ::.
CCDS43 GDSSPLIRATVGILITTIASKGELQNWPDLLPKLCSLLDSEDY--NTCEGAFGALQKICE
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pF1KB3 D----IDPEQLQDKSNEILTAIIQGMRKEEPS---------NNVKLAATNALLNSLE-FT
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CCDS43 DSAEILDSDVLDRPLNIMIPKFLQFFKHSSPKIRSHAVACVNQFIISRTQALMLHIDSFI
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pF1KB3 KANF----DKESERHFIMQVVCEA-TQCPDTRVR--VAALQNLVKIMSLYYQYMETYMG-
       .  :    :.: :   . . ::.: ..  ..:.   .  ..:.:. :    : ..  .. 
CCDS43 ENLFALAGDEEPE---VRKNVCRALVMLLEVRMDRLLPHMHNIVEYMLQRTQDQDENVAL
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pF1KB3 -----------------------PALFAITIEAMK-SDIDEVALQGIEFWSNVCDEEMDL
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CCDS43 EACEFWLTLAEQPICKDVLVRHLPKLIPVLVNGMKYSDIDIILLKG--------DVEEDE
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pF1KB3 AIEASEAAEQGRPPEHTSKFYAKGALQYLVPILTQTLTKQDENDDDD---DWNPCKAAGV
       .:  ::  .. ::  : :.  :.   :.    . .    .:: ::::   :::  : ...
CCDS43 TIPDSE--QDIRPRFHRSRTVAQ---QHDEDGIEEEDDDDDEIDDDDTISDWNLRKCSAA
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pF1KB3 CLMLLATCCEDDIVPHVLPFIKEHIKNPDWRYRDAAVMAFGCILEGPEPSQLKPLVIQAM
        : .::.  .:...::.::..:: . . .:  ........: : ::   ... : . . .
CCDS43 ALDVLANVYRDELLPHILPLLKELLFHHEWVVKESGILVLGAIAEGCMQGMI-PYLPELI
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pF1KB3 PTLIELMKDPSVVVRDTAAWTVGRICELLPEAAINDVYLAPLLQCLIEG-LSAEPRVASN
       : ::. ..: ...::. . ::..:  . .  .   :.:: ::.  :..  :... ::   
CCDS43 PHLIQCLSDKKALVRSITCWTLSRYAHWVV-SQPPDTYLKPLMTELLKRILDSNKRVQEA
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pF1KB3 VCWAFSSLAEAA-YEAADVADDQEEPATYCLSSSFE---LIVQKLLETTDRPDGHQNNLR
       .: ::..: : :  : .       .  .. .:.  .   ::.   . :     ::. : .
CCDS43 ACSAFATLEEEACTELVPYLAYILDTLVFAFSKYQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLN-K
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pF1KB3 SSAYESLM-------EIVKNSAKDCYPAVQKTTLVIMERLQQVLQMESHIQSTSDRIQFN
           . ::       ...:.  :: .: ..  . :     .  : .   . .       :
CCDS43 PEYIQMLMPPLIQKWNMLKDEDKDLFPLLECLSSVATALQSGFLPYCEPVYQRC----VN
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pF1KB3 DLQSLLCATLQNVLRKVQHQDALQISDVVMASLLRMFQSTAGSGGVQEDALMAVSTLVEV
        .:. :  .. :  .  :..   .  : ....:  .   . : ::  :. :.: :... .
CCDS43 LVQKTLAQAMLNNAQPDQYEAPDK--DFMIVALDLLSGLAEGLGGNIEQ-LVARSNILTL
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pF1KB3 LGGEFLKYMEAFKPFLGIGLKNYAEYQVCLAAVGLVGDLCRALQSNIIPFCDEVMQLLLE
       .     . :.   :            .:  .. .:.::: .:  ... :   . : .:  
CCDS43 M----YQCMQDKMP------------EVRQSSFALLGDLTKACFQHVKPCIADFMPILGT
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pF1KB3 NLGNENVHRSVKPQILSVFGDIALAIGGEFKKYLEVVLNTLQQASQAQVDKSDYDMVDYL
       ::. : .  ::  .   ..:.:.. .: :.. :. .::. :                   
CCDS43 NLNPEFI--SVCNNATWAIGEISIQMGIEMQPYIPMVLHQLVEIINRPNTPKTLLENTAI
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pF1KB3 NELRESCLEAYTGIVQGLKGDQENVHPDVMLVQPRVEFILSFIDHIAGDEDHTDGVVACA
                                                                   
CCDS43 TIGRLGYVCPQEVAPMLQQFIRPWCTSLRNIRDNEEKDSAFRGICTMISVNPSGVIQDFI
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>>CCDS45992.1 TNPO2 gene_id:30000|Hs108|chr19             (887 aa)
 initn: 280 init1: 158 opt: 292  Z-score: 359.3  bits: 77.6 E(32554): 1.1e-13
Smith-Waterman score: 462; 23.0% identity (53.2% similar) in 793 aa overlap (2-739:12-751)

                         10        20        30        40          
pF1KB3           MELITILEKTVSPDRLELEAAQKFLERAAVENLPTFLVELSRVLAN-PGN
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CCDS45 MDWQPDEQGLQQVLQLLKDSQSPNTATQRIVQDKLKQ--LNQFPDFNNYLIFVLTRLKSE
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pF1KB3 SQVARVAAGLQIKNSLTSKDPDIKAQYQQRWLAIDANARREVKNYVLQTLGTETYRPSSA
       .. .:  .:: .::       ..::.::    ..   .   .:.  :...:      :: 
CCDS45 DEPTRSLSGLILKN-------NVKAHYQ----SFPPPVADFIKQECLNNIGDA----SSL
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pF1KB3 SQCVAGIACAEIP----VNQWPELIPQLVANVTNPNSTEHMKESTLEAIGYICQD----I
        . . ::  . :     ...::::.:::  :. : .   .  :... :.  ::.:    .
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