Result of FASTA (omim) for pF1KB3272
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3272, 1265 aa
  1>>>pF1KB3272 1265 - 1265 aa - 1265 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6913+/-0.000705; mu= 11.7508+/- 0.043
 mean_var=307.0681+/-70.480, 0's: 0 Z-trim(109.9): 333  B-trim: 34 in 1/50
 Lambda= 0.073191
 statistics sampled from 17775 (18163) to 17775 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.546), E-opt: 0.2 (0.213), width:  16
 Scan time: 13.890

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_002652 (OMIM: 600220,614468,614878) 1-phosphati (1265) 8502 914.4       0
XP_011527169 (OMIM: 172420) PREDICTED: 1-phosphati ( 906) 1745 200.7 3.8e-50
NP_877963 (OMIM: 172420) 1-phosphatidylinositol 4, (1290) 1745 200.9 4.6e-50
NP_002651 (OMIM: 172420) 1-phosphatidylinositol 4, (1291) 1745 200.9 4.6e-50
XP_005260495 (OMIM: 172420) PREDICTED: 1-phosphati (1330) 1745 200.9 4.7e-50
XP_011527167 (OMIM: 172420) PREDICTED: 1-phosphati (1151) 1217 145.1 2.6e-33
NP_055999 (OMIM: 614276) inactive phospholipase C- (1001)  710 91.5 3.2e-17
XP_016861514 (OMIM: 614276) PREDICTED: inactive ph (1001)  710 91.5 3.2e-17
XP_006713136 (OMIM: 614276) PREDICTED: inactive ph (1022)  710 91.5 3.2e-17
NP_001137854 (OMIM: 614276) inactive phospholipase (1127)  710 91.5 3.4e-17
XP_016861513 (OMIM: 614276) PREDICTED: inactive ph (1127)  710 91.5 3.4e-17
XP_016861511 (OMIM: 614276) PREDICTED: inactive ph (1127)  710 91.5 3.4e-17
XP_016861512 (OMIM: 614276) PREDICTED: inactive ph (1127)  710 91.5 3.4e-17
NP_588614 (OMIM: 608795) 1-phosphatidylinositol 4, ( 789)  674 87.5 3.9e-16
XP_016862111 (OMIM: 151600,602142) PREDICTED: 1-ph ( 698)  666 86.6 6.5e-16
NP_006216 (OMIM: 151600,602142) 1-phosphatidylinos ( 756)  666 86.6 6.8e-16
NP_001124436 (OMIM: 151600,602142) 1-phosphatidyli ( 777)  666 86.6 6.9e-16
XP_016859829 (OMIM: 600597) PREDICTED: inactive ph ( 997)  661 86.3 1.1e-15
XP_016859828 (OMIM: 600597) PREDICTED: inactive ph (1016)  661 86.3 1.2e-15
XP_005246701 (OMIM: 600597) PREDICTED: inactive ph (1016)  661 86.3 1.2e-15
XP_011509653 (OMIM: 600597) PREDICTED: inactive ph (1016)  661 86.3 1.2e-15
XP_005246700 (OMIM: 600597) PREDICTED: inactive ph (1021)  661 86.3 1.2e-15
NP_006217 (OMIM: 600597) inactive phospholipase C- (1095)  661 86.3 1.2e-15
NP_001124433 (OMIM: 612835) 1-phosphatidylinositol (1002)  654 85.5 1.9e-15
XP_016861418 (OMIM: 612835) PREDICTED: 1-phosphati (1002)  654 85.5 1.9e-15
XP_016861417 (OMIM: 612835) PREDICTED: 1-phosphati (1014)  654 85.5 1.9e-15
XP_011510869 (OMIM: 612835) PREDICTED: 1-phosphati (1014)  654 85.5 1.9e-15
XP_016861416 (OMIM: 612835) PREDICTED: 1-phosphati (1021)  654 85.6 1.9e-15
NP_055811 (OMIM: 612835) 1-phosphatidylinositol 4, (1655)  654 85.9 2.5e-15
XP_005247296 (OMIM: 612835) PREDICTED: 1-phosphati (1673)  654 85.9 2.6e-15
XP_011510867 (OMIM: 612835) PREDICTED: 1-phosphati (1675)  654 85.9 2.6e-15
XP_011510868 (OMIM: 612835) PREDICTED: 1-phosphati (1675)  654 85.9 2.6e-15
XP_016861415 (OMIM: 612835) PREDICTED: 1-phosphati (1675)  654 85.9 2.6e-15
XP_016861414 (OMIM: 612835) PREDICTED: 1-phosphati (1681)  654 85.9 2.6e-15
XP_016861413 (OMIM: 612835) PREDICTED: 1-phosphati (1684)  654 85.9 2.6e-15
XP_011510866 (OMIM: 612835) PREDICTED: 1-phosphati (1685)  654 85.9 2.6e-15
NP_001124432 (OMIM: 612835) 1-phosphatidylinositol (1693)  654 85.9 2.6e-15
XP_016861412 (OMIM: 612835) PREDICTED: 1-phosphati (1704)  654 85.9 2.6e-15
XP_011510864 (OMIM: 612835) PREDICTED: 1-phosphati (1705)  654 85.9 2.6e-15
XP_011510863 (OMIM: 612835) PREDICTED: 1-phosphati (1705)  654 85.9 2.6e-15
XP_005247295 (OMIM: 612835) PREDICTED: 1-phosphati (1705)  654 85.9 2.6e-15
XP_011510862 (OMIM: 612835) PREDICTED: 1-phosphati (1705)  654 85.9 2.6e-15
XP_016860608 (OMIM: 605939) PREDICTED: 1-phosphati ( 675)  641 83.9   4e-15
XP_016860607 (OMIM: 605939) PREDICTED: 1-phosphati ( 716)  641 84.0 4.1e-15
NP_116115 (OMIM: 605939) 1-phosphatidylinositol 4, ( 762)  641 84.0 4.3e-15
XP_005246970 (OMIM: 605939) PREDICTED: 1-phosphati ( 788)  641 84.0 4.3e-15
XP_016860605 (OMIM: 605939) PREDICTED: 1-phosphati ( 794)  641 84.0 4.4e-15
XP_016860604 (OMIM: 605939) PREDICTED: 1-phosphati ( 820)  641 84.0 4.4e-15
XP_016860603 (OMIM: 605939) PREDICTED: 1-phosphati ( 820)  641 84.0 4.4e-15
XP_011510314 (OMIM: 605939) PREDICTED: 1-phosphati ( 820)  641 84.0 4.4e-15


>>NP_002652 (OMIM: 600220,614468,614878) 1-phosphatidyli  (1265 aa)
 initn: 8502 init1: 8502 opt: 8502  Z-score: 4875.8  bits: 914.4 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 8502; 100.0% identity (100.0% similar) in 1265 aa overlap (1-1265:1-1265)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MSTTVNVDSLAEYEKSQIKRALELGTVMTVFSFRKSTPERRTVQVIMETRQVAWSKTADK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MSTTVNVDSLAEYEKSQIKRALELGTVMTVFSFRKSTPERRTVQVIMETRQVAWSKTADK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 IEGFLDIMEIKEIRPGKNSKDFERAKAVRQKEDCCFTILYGTQFVLSTLSLAADSKEDAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 IEGFLDIMEIKEIRPGKNSKDFERAKAVRQKEDCCFTILYGTQFVLSTLSLAADSKEDAV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 NWLSGLKILHQEAMNASTPTIIESWLRKQIYSVDQTRRNSISLRELKTILPLINFKVSSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 NWLSGLKILHQEAMNASTPTIIESWLRKQIYSVDQTRRNSISLRELKTILPLINFKVSSA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 KFLKDKFVEIGAHKDELSFEQFHLFYKKLMFEQQKSILDEFKKDSSVFILGNTDRPDASA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 KFLKDKFVEIGAHKDELSFEQFHLFYKKLMFEQQKSILDEFKKDSSVFILGNTDRPDASA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 VYLHDFQRFLIHEQQEHWAQDLNKVRERMTKFIDDTMRETAEPFLFVDEFLTYLFSRENS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 VYLHDFQRFLIHEQQEHWAQDLNKVRERMTKFIDDTMRETAEPFLFVDEFLTYLFSRENS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 IWDEKYDAVDMQDMNNPLSHYWISSSHNTYLTGDQLRSESSPEAYIRCLRMGCRCIELDC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 IWDEKYDAVDMQDMNNPLSHYWISSSHNTYLTGDQLRSESSPEAYIRCLRMGCRCIELDC
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 WDGPDGKPVIYHGWTRTTKIKFDDVVQAIKDHAFVTSSFPVILSIEEHCSVEQQRHMAKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 WDGPDGKPVIYHGWTRTTKIKFDDVVQAIKDHAFVTSSFPVILSIEEHCSVEQQRHMAKA
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 FKEVFGDLLLTKPTEASADQLPSPSQLREKIIIKHKKLGPRGDVDVNMEDKKDEHKQQGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 FKEVFGDLLLTKPTEASADQLPSPSQLREKIIIKHKKLGPRGDVDVNMEDKKDEHKQQGE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 LYMWDSIDQKWTRHYCAIADAKLSFSDDIEQTMEEEVPQDIPPTELHFGEKWFHKKVEKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LYMWDSIDQKWTRHYCAIADAKLSFSDDIEQTMEEEVPQDIPPTELHFGEKWFHKKVEKR
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 TSAEKLLQEYCMETGGKDGTFLVRESETFPNDYTLSFWRSGRVQHCRIRSTMEGGTLKYY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 TSAEKLLQEYCMETGGKDGTFLVRESETFPNDYTLSFWRSGRVQHCRIRSTMEGGTLKYY
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB3 LTDNLTFSSIYALIQHYRETHLRCAEFELRLTDPVPNPNPHESKPWYYDSLSRGEAEDML
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LTDNLTFSSIYALIQHYRETHLRCAEFELRLTDPVPNPNPHESKPWYYDSLSRGEAEDML
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB3 MRIPRDGAFLIRKREGSDSYAITFRARGKVKHCRINRDGRHFVLGTSAYFESLVELVSYY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MRIPRDGAFLIRKREGSDSYAITFRARGKVKHCRINRDGRHFVLGTSAYFESLVELVSYY
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB3 EKHSLYRKMRLRYPVTPELLERYNMERDINSLYDVSRMYVDPSEINPSMPQRTVKALYDY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 EKHSLYRKMRLRYPVTPELLERYNMERDINSLYDVSRMYVDPSEINPSMPQRTVKALYDY
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB3 KAKRSDELSFCRGALIHNVSKEPGGWWKGDYGTRIQQYFPSNYVEDISTADFEELEKQII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 KAKRSDELSFCRGALIHNVSKEPGGWWKGDYGTRIQQYFPSNYVEDISTADFEELEKQII
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB3 EDNPLGSLCRGILDLNTYNVVKAPQGKNQKSFVFILEPKQQGDPPVEFATDRVEELFEWF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 EDNPLGSLCRGILDLNTYNVVKAPQGKNQKSFVFILEPKQQGDPPVEFATDRVEELFEWF
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB3 QSIREITWKIDTKENNMKYWEKNQSIAIELSDLVVYCKPTSKTKDNLENPDFREIRSFVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 QSIREITWKIDTKENNMKYWEKNQSIAIELSDLVVYCKPTSKTKDNLENPDFREIRSFVE
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB3 TKADSIIRQKPVDLLKYNQKGLTRVYPKGQRVDSSNYDPFRLWLCGSQMVALNFQTADKY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 TKADSIIRQKPVDLLKYNQKGLTRVYPKGQRVDSSNYDPFRLWLCGSQMVALNFQTADKY
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KB3 MQMNHALFSLNGRTGYVLQPESMRTEKYDPMPPESQRKILMTLTVKVLGARHLPKLGRSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MQMNHALFSLNGRTGYVLQPESMRTEKYDPMPPESQRKILMTLTVKVLGARHLPKLGRSI
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KB3 ACPFVEVEICGAEYDNNKFKTTVVNDNGLSPIWAPTQEKVTFEIYDPNLAFLRFVVYEED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 ACPFVEVEICGAEYDNNKFKTTVVNDNGLSPIWAPTQEKVTFEIYDPNLAFLRFVVYEED
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KB3 MFSDPNFLAHATYPIKAVKSGFRSVPLKNGYSEDIELASLLVFCEMRPVLESEEELYSSC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MFSDPNFLAHATYPIKAVKSGFRSVPLKNGYSEDIELASLLVFCEMRPVLESEEELYSSC
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KB3 RQLRRRQEELNNQLFLYDTHQNLRNANRDALVKEFSVNENQLQLYQEKCNKRLREKRVSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 RQLRRRQEELNNQLFLYDTHQNLRNANRDALVKEFSVNENQLQLYQEKCNKRLREKRVSN
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NP_002 SKFYS
            

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NP_055 GQNFPKPKGSGAKGDVVDPYVYVEIHGIPADCAEQRTKTVHQNGDAPIF---DESFEFQI
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pF1KB3 KPVIYHGWTRTTKIKFDDVVQAIKDHAFVTSSFPVILSIEEHCSVEQQRHMAKAFKEVFG
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XP_006 GQNFPKPKGSGAKGDVVDPYVYVEIHGIPADCAEQRTKTVHQNGDAPIF---DESFEFQI
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pF1KB3 YDPNLAFLRFVVYEEDMFSDPNFLAHATYPIKAVKSGFRSVPLKNGYSEDIELASLLVFC
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pF1KB3 EMRPVLESEEELYSSCRQLRRRQEELNNQLFLYDTHQNLRNANRDALVKEFSVNENQLQL
                                                                   
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NP_001 FLEAEQGVAHINEEIS--LEIIHKY--EPSKEGQEKGWLSIDGFTNYLMSPDCYIFDPEH
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