FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB3191, 589 aa 1>>>pF1KB3191 589 - 589 aa - 589 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7635+/-0.000499; mu= 16.1257+/- 0.031 mean_var=77.1391+/-15.166, 0's: 0 Z-trim(108.4): 79 B-trim: 819 in 1/52 Lambda= 0.146028 statistics sampled from 16417 (16486) to 16417 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.544), E-opt: 0.2 (0.193), width: 16 Scan time: 9.000 The best scores are: opt bits E(85289) NP_055040 (OMIM: 605983,616362) serine/threonine-p ( 589) 3789 808.7 0 NP_002707 (OMIM: 211980,603113) serine/threonine-p ( 601) 3315 708.9 1.2e-203 XP_016873448 (OMIM: 211980,603113) PREDICTED: seri ( 640) 3301 705.9 1e-202 XP_016873447 (OMIM: 211980,603113) PREDICTED: seri ( 661) 3301 705.9 1e-202 NP_859050 (OMIM: 211980,603113) serine/threonine-p ( 667) 3301 705.9 1e-202 XP_016873450 (OMIM: 211980,603113) PREDICTED: seri ( 621) 3295 704.6 2.4e-202 NP_859051 (OMIM: 211980,603113) serine/threonine-p ( 603) 2783 596.8 6.8e-170 XP_016882418 (OMIM: 605983,616362) PREDICTED: seri ( 410) 2635 565.5 1.2e-160 NP_001171034 (OMIM: 211980,603113) serine/threonin ( 474) 2074 447.4 5.1e-125 XP_016873449 (OMIM: 211980,603113) PREDICTED: seri ( 622) 1954 422.1 2.6e-117 NP_001171033 (OMIM: 211980,603113) serine/threonin ( 556) 1951 421.5 3.7e-117 NP_036565 (OMIM: 605590,614286) splicing factor 3B (1304) 194 51.5 2e-05 NP_006827 (OMIM: 605614) eIF-2-alpha kinase activa (2671) 193 51.5 4.3e-05 XP_016881596 (OMIM: 604908) PREDICTED: serine/thre ( 861) 179 48.3 0.00013 XP_016881595 (OMIM: 604908) PREDICTED: serine/thre ( 861) 179 48.3 0.00013 XP_011524081 (OMIM: 604908) PREDICTED: serine/thre ( 891) 179 48.3 0.00013 NP_005125 (OMIM: 604908) serine/threonine-protein ( 933) 179 48.3 0.00014 XP_016881594 (OMIM: 604908) PREDICTED: serine/thre ( 949) 179 48.3 0.00014 NP_001035847 (OMIM: 604908) serine/threonine-prote ( 950) 179 48.3 0.00014 XP_011524078 (OMIM: 604908) PREDICTED: serine/thre ( 985) 179 48.3 0.00014 XP_011524077 (OMIM: 604908) PREDICTED: serine/thre (1002) 179 48.3 0.00015 NP_055417 (OMIM: 602610) phosphoinositide 3-kinase (1358) 172 46.9 0.00052 >>NP_055040 (OMIM: 605983,616362) serine/threonine-prote (589 aa) initn: 3789 init1: 3789 opt: 3789 Z-score: 4316.7 bits: 808.7 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 3789; 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86.0% identity (96.8% similar) in 586 aa overlap (2-587:14-599) 10 20 30 40 pF1KB3 MAAADGDDSLYPIAVLIDELRNEDVQLRLNSIKKLSTIALALGVERTR :..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 MAGASELGTGPGAAGGDGDDSLYPIAVLIDELRNEDVQLRLNSIKKLSTIALALGVERTR 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KB3 SELLPFLTDTIYDEDEVLLALAEQLGTFTTLVGGPEYVHCLLPPLESLATVEETVVRDKA ::::::::::::::::::::::::::.:: :::::...::::::::.::::::::::::: XP_016 SELLPFLTDTIYDEDEVLLALAEQLGNFTGLVGGPDFAHCLLPPLENLATVEETVVRDKA 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KB3 VESLRAISHEHSPSDLEAHFVPLVKRLAGGDWFTSRTSACGLFSVCYPRVSSAVKAELRQ ::::: ::.::.: :::.:::::::::.::::::::::::::::::::.:.:::::.:: XP_016 VESLRQISQEHTPVALEAYFVPLVKRLASGDWFTSRTSACGLFSVCYPRASNAVKAEIRQ 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KB3 YFRNLCSDDTPMVRRAAASKLGEFAKVLELDNVKSEIIPMFSNLASDEQDSVRLLAVEAC ::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::.:.:..::::::::::::::::: XP_016 QFRSLCSDDTPMVRRAAASKLGEFAKVLELDSVKSEIVPLFTSLASDEQDSVRLLAVEAC 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KB3 VNIAQLLPQEDLEALVMPTLRQAAEDKSWRVRYMVADKFTELQKAVGPEITKTDLVPAFQ :.::::: :.:::.:::::::::::::::::::::::.:.:::::.::.:: .::.:::: XP_016 VSIAQLLSQDDLETLVMPTLRQAAEDKSWRVRYMVADRFSELQKAMGPKITLNDLIPAFQ 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KB3 NLMKDCEAEVRAAASHKVKEFCENLSADCRENVIMSQILPCIKELVSDANQHVKSALASV ::.:::::::::::.:::::. ::: . ::..::.:::: :::::::.::::::::::: XP_016 NLLKDCEAEVRAAAAHKVKELGENLPIEDRETIIMNQILPYIKELVSDTNQHVKSALASV 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 400 pF1KB3 IMGLSPILGKDNTIEHLLPLFLAQLKDECPEVRLNIISNLDCVNEVIGIRQLSQSLLPAI ::::: ::::.:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 IMGLSTILGKENTIEHLLPLFLAQLKDECPDVRLNIISNLDCVNEVIGIRQLSQSLLPAI 370 380 390 400 410 420 410 420 430 440 450 460 pF1KB3 VELAEDAKWRVRLAIIEYMPLLAGQLGVEFFDEKLNSLCMAWLVDHVYAIREAATSNLKK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: : XP_016 VELAEDAKWRVRLAIIEYMPLLAGQLGVEFFDEKLNSLCMAWLVDHVYAIREAATNNLMK 430 440 450 460 470 480 470 480 490 500 510 520 pF1KB3 LVEKFGKEWAHATIIPKVLAMSGDPNYLHRMTTLFCINVLSEVCGQDITTKHMLPTVLRM ::.::: :::. ::.::::.:..:::::::::::::::.:::.:::.::::.::: ::.: XP_016 LVQKFGTEWAQNTIVPKVLVMANDPNYLHRMTTLFCINALSEACGQEITTKQMLPIVLKM 490 500 510 520 530 540 530 540 550 560 570 580 pF1KB3 AGDPVANVRFNVAKSLQKIGPILDNSTLQSEVKPILEKLTQDQDVDVKYFAQEALTVLSL ::: ::::::::::::::::::::...::.::::.:.:: ::.:.:::::::::..:.. XP_016 AGDQVANVRFNVAKSLQKIGPILDTNALQGEVKPVLQKLGQDEDMDVKYFAQEAISVVAQ 550 560 570 580 590 600 pF1KB3 A XP_016 RLRKLEFPVKDSGEPSVPRADKNHFPRPTVPGEDMGKESG 610 620 630 640 >>XP_016873447 (OMIM: 211980,603113) PREDICTED: serine/t (661 aa) initn: 3583 init1: 3296 opt: 3301 Z-score: 3760.3 bits: 705.9 E(85289): 1e-202 Smith-Waterman score: 3301; 86.0% identity (96.8% similar) in 586 aa overlap (2-587:14-599) 10 20 30 40 pF1KB3 MAAADGDDSLYPIAVLIDELRNEDVQLRLNSIKKLSTIALALGVERTR :..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 MAGASELGTGPGAAGGDGDDSLYPIAVLIDELRNEDVQLRLNSIKKLSTIALALGVERTR 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KB3 SELLPFLTDTIYDEDEVLLALAEQLGTFTTLVGGPEYVHCLLPPLESLATVEETVVRDKA ::::::::::::::::::::::::::.:: :::::...::::::::.::::::::::::: XP_016 SELLPFLTDTIYDEDEVLLALAEQLGNFTGLVGGPDFAHCLLPPLENLATVEETVVRDKA 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KB3 VESLRAISHEHSPSDLEAHFVPLVKRLAGGDWFTSRTSACGLFSVCYPRVSSAVKAELRQ ::::: ::.::.: :::.:::::::::.::::::::::::::::::::.:.:::::.:: XP_016 VESLRQISQEHTPVALEAYFVPLVKRLASGDWFTSRTSACGLFSVCYPRASNAVKAEIRQ 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KB3 YFRNLCSDDTPMVRRAAASKLGEFAKVLELDNVKSEIIPMFSNLASDEQDSVRLLAVEAC ::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::.:.:..::::::::::::::::: XP_016 QFRSLCSDDTPMVRRAAASKLGEFAKVLELDSVKSEIVPLFTSLASDEQDSVRLLAVEAC 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KB3 VNIAQLLPQEDLEALVMPTLRQAAEDKSWRVRYMVADKFTELQKAVGPEITKTDLVPAFQ :.::::: :.:::.:::::::::::::::::::::::.:.:::::.::.:: .::.:::: XP_016 VSIAQLLSQDDLETLVMPTLRQAAEDKSWRVRYMVADRFSELQKAMGPKITLNDLIPAFQ 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KB3 NLMKDCEAEVRAAASHKVKEFCENLSADCRENVIMSQILPCIKELVSDANQHVKSALASV ::.:::::::::::.:::::. ::: . ::..::.:::: :::::::.::::::::::: XP_016 NLLKDCEAEVRAAAAHKVKELGENLPIEDRETIIMNQILPYIKELVSDTNQHVKSALASV 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 400 pF1KB3 IMGLSPILGKDNTIEHLLPLFLAQLKDECPEVRLNIISNLDCVNEVIGIRQLSQSLLPAI ::::: ::::.:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 IMGLSTILGKENTIEHLLPLFLAQLKDECPDVRLNIISNLDCVNEVIGIRQLSQSLLPAI 370 380 390 400 410 420 410 420 430 440 450 460 pF1KB3 VELAEDAKWRVRLAIIEYMPLLAGQLGVEFFDEKLNSLCMAWLVDHVYAIREAATSNLKK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: : XP_016 VELAEDAKWRVRLAIIEYMPLLAGQLGVEFFDEKLNSLCMAWLVDHVYAIREAATNNLMK 430 440 450 460 470 480 470 480 490 500 510 520 pF1KB3 LVEKFGKEWAHATIIPKVLAMSGDPNYLHRMTTLFCINVLSEVCGQDITTKHMLPTVLRM ::.::: :::. ::.::::.:..:::::::::::::::.:::.:::.::::.::: ::.: XP_016 LVQKFGTEWAQNTIVPKVLVMANDPNYLHRMTTLFCINALSEACGQEITTKQMLPIVLKM 490 500 510 520 530 540 530 540 550 560 570 580 pF1KB3 AGDPVANVRFNVAKSLQKIGPILDNSTLQSEVKPILEKLTQDQDVDVKYFAQEALTVLSL ::: ::::::::::::::::::::...::.::::.:.:: ::.:.:::::::::..:.. XP_016 AGDQVANVRFNVAKSLQKIGPILDTNALQGEVKPVLQKLGQDEDMDVKYFAQEAISVVAQ 550 560 570 580 590 600 pF1KB3 A XP_016 RLRKLEFPVKDSGEPSVPRADKNHFPRPTVPGEDMGKDKAAQEALGCVFRDPEIHTIIAA 610 620 630 640 650 660 >>NP_859050 (OMIM: 211980,603113) serine/threonine-prote (667 aa) initn: 3583 init1: 3296 opt: 3301 Z-score: 3760.2 bits: 705.9 E(85289): 1e-202 Smith-Waterman score: 3301; 86.0% identity (96.8% similar) in 586 aa overlap (2-587:14-599) 10 20 30 40 pF1KB3 MAAADGDDSLYPIAVLIDELRNEDVQLRLNSIKKLSTIALALGVERTR :..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_859 MAGASELGTGPGAAGGDGDDSLYPIAVLIDELRNEDVQLRLNSIKKLSTIALALGVERTR 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KB3 SELLPFLTDTIYDEDEVLLALAEQLGTFTTLVGGPEYVHCLLPPLESLATVEETVVRDKA ::::::::::::::::::::::::::.:: :::::...::::::::.::::::::::::: NP_859 SELLPFLTDTIYDEDEVLLALAEQLGNFTGLVGGPDFAHCLLPPLENLATVEETVVRDKA 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KB3 VESLRAISHEHSPSDLEAHFVPLVKRLAGGDWFTSRTSACGLFSVCYPRVSSAVKAELRQ ::::: ::.::.: :::.:::::::::.::::::::::::::::::::.:.:::::.:: NP_859 VESLRQISQEHTPVALEAYFVPLVKRLASGDWFTSRTSACGLFSVCYPRASNAVKAEIRQ 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KB3 YFRNLCSDDTPMVRRAAASKLGEFAKVLELDNVKSEIIPMFSNLASDEQDSVRLLAVEAC ::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::.:.:..::::::::::::::::: NP_859 QFRSLCSDDTPMVRRAAASKLGEFAKVLELDSVKSEIVPLFTSLASDEQDSVRLLAVEAC 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KB3 VNIAQLLPQEDLEALVMPTLRQAAEDKSWRVRYMVADKFTELQKAVGPEITKTDLVPAFQ :.::::: :.:::.:::::::::::::::::::::::.:.:::::.::.:: .::.:::: NP_859 VSIAQLLSQDDLETLVMPTLRQAAEDKSWRVRYMVADRFSELQKAMGPKITLNDLIPAFQ 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KB3 NLMKDCEAEVRAAASHKVKEFCENLSADCRENVIMSQILPCIKELVSDANQHVKSALASV ::.:::::::::::.:::::. ::: . ::..::.:::: :::::::.::::::::::: NP_859 NLLKDCEAEVRAAAAHKVKELGENLPIEDRETIIMNQILPYIKELVSDTNQHVKSALASV 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 400 pF1KB3 IMGLSPILGKDNTIEHLLPLFLAQLKDECPEVRLNIISNLDCVNEVIGIRQLSQSLLPAI ::::: ::::.:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::: NP_859 IMGLSTILGKENTIEHLLPLFLAQLKDECPDVRLNIISNLDCVNEVIGIRQLSQSLLPAI 370 380 390 400 410 420 410 420 430 440 450 460 pF1KB3 VELAEDAKWRVRLAIIEYMPLLAGQLGVEFFDEKLNSLCMAWLVDHVYAIREAATSNLKK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: : NP_859 VELAEDAKWRVRLAIIEYMPLLAGQLGVEFFDEKLNSLCMAWLVDHVYAIREAATNNLMK 430 440 450 460 470 480 470 480 490 500 510 520 pF1KB3 LVEKFGKEWAHATIIPKVLAMSGDPNYLHRMTTLFCINVLSEVCGQDITTKHMLPTVLRM ::.::: :::. ::.::::.:..:::::::::::::::.:::.:::.::::.::: ::.: NP_859 LVQKFGTEWAQNTIVPKVLVMANDPNYLHRMTTLFCINALSEACGQEITTKQMLPIVLKM 490 500 510 520 530 540 530 540 550 560 570 580 pF1KB3 AGDPVANVRFNVAKSLQKIGPILDNSTLQSEVKPILEKLTQDQDVDVKYFAQEALTVLSL ::: ::::::::::::::::::::...::.::::.:.:: ::.:.:::::::::..:.. NP_859 AGDQVANVRFNVAKSLQKIGPILDTNALQGEVKPVLQKLGQDEDMDVKYFAQEAISVVAQ 550 560 570 580 590 600 pF1KB3 A NP_859 RLRKLEFPVKDSGEPSVPRADKNHFPRPTVPGEDMGKGPVYQLRGDTRDTLAQLGIAELV 610 620 630 640 650 660 >>XP_016873450 (OMIM: 211980,603113) PREDICTED: serine/t (621 aa) initn: 3577 init1: 3290 opt: 3295 Z-score: 3753.9 bits: 704.6 E(85289): 2.4e-202 Smith-Waterman score: 3295; 86.2% identity (96.6% similar) in 585 aa overlap (2-586:14-598) 10 20 30 40 pF1KB3 MAAADGDDSLYPIAVLIDELRNEDVQLRLNSIKKLSTIALALGVERTR :..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 MAGASELGTGPGAAGGDGDDSLYPIAVLIDELRNEDVQLRLNSIKKLSTIALALGVERTR 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KB3 SELLPFLTDTIYDEDEVLLALAEQLGTFTTLVGGPEYVHCLLPPLESLATVEETVVRDKA ::::::::::::::::::::::::::.:: :::::...::::::::.::::::::::::: XP_016 SELLPFLTDTIYDEDEVLLALAEQLGNFTGLVGGPDFAHCLLPPLENLATVEETVVRDKA 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KB3 VESLRAISHEHSPSDLEAHFVPLVKRLAGGDWFTSRTSACGLFSVCYPRVSSAVKAELRQ ::::: ::.::.: :::.:::::::::.::::::::::::::::::::.:.:::::.:: XP_016 VESLRQISQEHTPVALEAYFVPLVKRLASGDWFTSRTSACGLFSVCYPRASNAVKAEIRQ 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KB3 YFRNLCSDDTPMVRRAAASKLGEFAKVLELDNVKSEIIPMFSNLASDEQDSVRLLAVEAC ::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::.:.:..::::::::::::::::: XP_016 QFRSLCSDDTPMVRRAAASKLGEFAKVLELDSVKSEIVPLFTSLASDEQDSVRLLAVEAC 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KB3 VNIAQLLPQEDLEALVMPTLRQAAEDKSWRVRYMVADKFTELQKAVGPEITKTDLVPAFQ :.::::: :.:::.:::::::::::::::::::::::.:.:::::.::.:: .::.:::: XP_016 VSIAQLLSQDDLETLVMPTLRQAAEDKSWRVRYMVADRFSELQKAMGPKITLNDLIPAFQ 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KB3 NLMKDCEAEVRAAASHKVKEFCENLSADCRENVIMSQILPCIKELVSDANQHVKSALASV ::.:::::::::::.:::::. ::: . ::..::.:::: :::::::.::::::::::: XP_016 NLLKDCEAEVRAAAAHKVKELGENLPIEDRETIIMNQILPYIKELVSDTNQHVKSALASV 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 400 pF1KB3 IMGLSPILGKDNTIEHLLPLFLAQLKDECPEVRLNIISNLDCVNEVIGIRQLSQSLLPAI ::::: ::::.:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 IMGLSTILGKENTIEHLLPLFLAQLKDECPDVRLNIISNLDCVNEVIGIRQLSQSLLPAI 370 380 390 400 410 420 410 420 430 440 450 460 pF1KB3 VELAEDAKWRVRLAIIEYMPLLAGQLGVEFFDEKLNSLCMAWLVDHVYAIREAATSNLKK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: : XP_016 VELAEDAKWRVRLAIIEYMPLLAGQLGVEFFDEKLNSLCMAWLVDHVYAIREAATNNLMK 430 440 450 460 470 480 470 480 490 500 510 520 pF1KB3 LVEKFGKEWAHATIIPKVLAMSGDPNYLHRMTTLFCINVLSEVCGQDITTKHMLPTVLRM ::.::: :::. ::.::::.:..:::::::::::::::.:::.:::.::::.::: ::.: XP_016 LVQKFGTEWAQNTIVPKVLVMANDPNYLHRMTTLFCINALSEACGQEITTKQMLPIVLKM 490 500 510 520 530 540 530 540 550 560 570 580 pF1KB3 AGDPVANVRFNVAKSLQKIGPILDNSTLQSEVKPILEKLTQDQDVDVKYFAQEALTVLSL ::: ::::::::::::::::::::...::.::::.:.:: ::.:.:::::::::.. : XP_016 AGDQVANVRFNVAKSLQKIGPILDTNALQGEVKPVLQKLGQDEDMDVKYFAQEAISGLRD 550 560 570 580 590 600 pF1KB3 A XP_016 QVLFLSLCYQEDVNLRMHLVS 610 620 >>NP_859051 (OMIM: 211980,603113) serine/threonine-prote (603 aa) initn: 3203 init1: 2783 opt: 2783 Z-score: 3171.1 bits: 596.8 E(85289): 6.8e-170 Smith-Waterman score: 2794; 75.9% identity (86.0% similar) in 586 aa overlap (2-587:14-535) 10 20 30 40 pF1KB3 MAAADGDDSLYPIAVLIDELRNEDVQLRLNSIKKLSTIALALGVERTR :..:::::::::::::::::::::: NP_859 MAGASELGTGPGAAGGDGDDSLYPIAVLIDELRNEDVQ---------------------- 10 20 30 50 60 70 80 90 100 pF1KB3 SELLPFLTDTIYDEDEVLLALAEQLGTFTTLVGGPEYVHCLLPPLESLATVEETVVRDKA ::::.::::::::::::: NP_859 ------------------------------------------PPLENLATVEETVVRDKA 40 50 110 120 130 140 150 160 pF1KB3 VESLRAISHEHSPSDLEAHFVPLVKRLAGGDWFTSRTSACGLFSVCYPRVSSAVKAELRQ ::::: ::.::.: :::.:::::::::.::::::::::::::::::::.:.:::::.:: NP_859 VESLRQISQEHTPVALEAYFVPLVKRLASGDWFTSRTSACGLFSVCYPRASNAVKAEIRQ 60 70 80 90 100 110 170 180 190 200 210 220 pF1KB3 YFRNLCSDDTPMVRRAAASKLGEFAKVLELDNVKSEIIPMFSNLASDEQDSVRLLAVEAC ::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::.:.:..::::::::::::::::: NP_859 QFRSLCSDDTPMVRRAAASKLGEFAKVLELDSVKSEIVPLFTSLASDEQDSVRLLAVEAC 120 130 140 150 160 170 230 240 250 260 270 280 pF1KB3 VNIAQLLPQEDLEALVMPTLRQAAEDKSWRVRYMVADKFTELQKAVGPEITKTDLVPAFQ :.::::: :.:::.:::::::::::::::::::::::.:.:::::.::.:: .::.:::: NP_859 VSIAQLLSQDDLETLVMPTLRQAAEDKSWRVRYMVADRFSELQKAMGPKITLNDLIPAFQ 180 190 200 210 220 230 290 300 310 320 330 340 pF1KB3 NLMKDCEAEVRAAASHKVKEFCENLSADCRENVIMSQILPCIKELVSDANQHVKSALASV ::.:::::::::::.:::::. ::: . ::..::.:::: :::::::.::::::::::: NP_859 NLLKDCEAEVRAAAAHKVKELGENLPIEDRETIIMNQILPYIKELVSDTNQHVKSALASV 240 250 260 270 280 290 350 360 370 380 390 400 pF1KB3 IMGLSPILGKDNTIEHLLPLFLAQLKDECPEVRLNIISNLDCVNEVIGIRQLSQSLLPAI ::::: ::::.:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::: NP_859 IMGLSTILGKENTIEHLLPLFLAQLKDECPDVRLNIISNLDCVNEVIGIRQLSQSLLPAI 300 310 320 330 340 350 410 420 430 440 450 460 pF1KB3 VELAEDAKWRVRLAIIEYMPLLAGQLGVEFFDEKLNSLCMAWLVDHVYAIREAATSNLKK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: : NP_859 VELAEDAKWRVRLAIIEYMPLLAGQLGVEFFDEKLNSLCMAWLVDHVYAIREAATNNLMK 360 370 380 390 400 410 470 480 490 500 510 520 pF1KB3 LVEKFGKEWAHATIIPKVLAMSGDPNYLHRMTTLFCINVLSEVCGQDITTKHMLPTVLRM ::.::: :::. ::.::::.:..:::::::::::::::.:::.:::.::::.::: ::.: NP_859 LVQKFGTEWAQNTIVPKVLVMANDPNYLHRMTTLFCINALSEACGQEITTKQMLPIVLKM 420 430 440 450 460 470 530 540 550 560 570 580 pF1KB3 AGDPVANVRFNVAKSLQKIGPILDNSTLQSEVKPILEKLTQDQDVDVKYFAQEALTVLSL ::: ::::::::::::::::::::...::.::::.:.:: ::.:.:::::::::..:.. NP_859 AGDQVANVRFNVAKSLQKIGPILDTNALQGEVKPVLQKLGQDEDMDVKYFAQEAISVVAQ 480 490 500 510 520 530 pF1KB3 A NP_859 RLRKLEFPVKDSGEPSVPRADKNHFPRPTVPGEDMGKGPVYQLRGDTRDTLAQLGIAELV 540 550 560 570 580 590 >>XP_016882418 (OMIM: 605983,616362) PREDICTED: serine/t (410 aa) initn: 2635 init1: 2635 opt: 2635 Z-score: 3005.1 bits: 565.5 E(85289): 1.2e-160 Smith-Waterman score: 2635; 100.0% identity (100.0% similar) in 410 aa overlap (180-589:1-410) 150 160 170 180 190 200 pF1KB3 LFSVCYPRVSSAVKAELRQYFRNLCSDDTPMVRRAAASKLGEFAKVLELDNVKSEIIPMF :::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 MVRRAAASKLGEFAKVLELDNVKSEIIPMF 10 20 30 210 220 230 240 250 260 pF1KB3 SNLASDEQDSVRLLAVEACVNIAQLLPQEDLEALVMPTLRQAAEDKSWRVRYMVADKFTE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 SNLASDEQDSVRLLAVEACVNIAQLLPQEDLEALVMPTLRQAAEDKSWRVRYMVADKFTE 40 50 60 70 80 90 270 280 290 300 310 320 pF1KB3 LQKAVGPEITKTDLVPAFQNLMKDCEAEVRAAASHKVKEFCENLSADCRENVIMSQILPC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 LQKAVGPEITKTDLVPAFQNLMKDCEAEVRAAASHKVKEFCENLSADCRENVIMSQILPC 100 110 120 130 140 150 330 340 350 360 370 380 pF1KB3 IKELVSDANQHVKSALASVIMGLSPILGKDNTIEHLLPLFLAQLKDECPEVRLNIISNLD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 IKELVSDANQHVKSALASVIMGLSPILGKDNTIEHLLPLFLAQLKDECPEVRLNIISNLD 160 170 180 190 200 210 390 400 410 420 430 440 pF1KB3 CVNEVIGIRQLSQSLLPAIVELAEDAKWRVRLAIIEYMPLLAGQLGVEFFDEKLNSLCMA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 CVNEVIGIRQLSQSLLPAIVELAEDAKWRVRLAIIEYMPLLAGQLGVEFFDEKLNSLCMA 220 230 240 250 260 270 450 460 470 480 490 500 pF1KB3 WLVDHVYAIREAATSNLKKLVEKFGKEWAHATIIPKVLAMSGDPNYLHRMTTLFCINVLS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 WLVDHVYAIREAATSNLKKLVEKFGKEWAHATIIPKVLAMSGDPNYLHRMTTLFCINVLS 280 290 300 310 320 330 510 520 530 540 550 560 pF1KB3 EVCGQDITTKHMLPTVLRMAGDPVANVRFNVAKSLQKIGPILDNSTLQSEVKPILEKLTQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 EVCGQDITTKHMLPTVLRMAGDPVANVRFNVAKSLQKIGPILDNSTLQSEVKPILEKLTQ 340 350 360 370 380 390 570 580 pF1KB3 DQDVDVKYFAQEALTVLSLA :::::::::::::::::::: XP_016 DQDVDVKYFAQEALTVLSLA 400 410 >>NP_001171034 (OMIM: 211980,603113) serine/threonine-pr (474 aa) initn: 2074 init1: 2074 opt: 2074 Z-score: 2365.4 bits: 447.4 E(85289): 5.1e-125 Smith-Waterman score: 2328; 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78.8% identity (89.2% similar) in 586 aa overlap (2-587:14-554) 10 20 30 40 pF1KB3 MAAADGDDSLYPIAVLIDELRNEDVQLRLNSIKKLSTIALALGVERTR :..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 MAGASELGTGPGAAGGDGDDSLYPIAVLIDELRNEDVQLRLNSIKKLSTIALALGVERTR 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KB3 SELLPFLTDTIYDEDEVLLALAEQLGTFTTLVGGPEYVHCLLPPLESLATVEETVVRDKA ::::::::::::::::::::::::::.:: :::::...::::::::.::::::::::::: XP_016 SELLPFLTDTIYDEDEVLLALAEQLGNFTGLVGGPDFAHCLLPPLENLATVEETVVRDKA 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KB3 VESLRAISHEHSPSDLEAHFVPLVKRLAGGDWFTSRTSACGLFSVCYPRVSSAVKAELRQ ::::: ::.::.: :::.:::::::::.::::::::::::::::::::.:.:::::.:: XP_016 VESLRQISQEHTPVALEAYFVPLVKRLASGDWFTSRTSACGLFSVCYPRASNAVKAEIRQ 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KB3 YFRNLCSDDTPMVRRAAASKLGEFAKVLELDNVKSEIIPMFSNLASDEQDSVRLLAVEAC ::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::.:.:..::::::::::::::::: XP_016 QFRSLCSDDTPMVRRAAASKLGEFAKVLELDSVKSEIVPLFTSLASDEQDSVRLLAVEAC 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KB3 VNIAQLLPQEDLEALVMPTLRQAAEDKSWRVRYMVADKFTELQKAVGPEITKTDLVPAFQ :.::::: :.:::.:::::::::::::::::::::::.:.:::::.::.:: .::.:::: XP_016 VSIAQLLSQDDLETLVMPTLRQAAEDKSWRVRYMVADRFSELQKAMGPKITLNDLIPAFQ 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KB3 NLMKDCEAEVRAAASHKVKEFCENLSADCRENVIMSQILPCIKELVSDANQHVKSALASV ::.:::::::::::.:::::. ::: . ::..::.:::: :: XP_016 NLLKDCEAEVRAAAAHKVKELGENLPIEDRETIIMNQILPYIK----------------- 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KB3 IMGLSPILGKDNTIEHLLPLFLAQLKDECPEVRLNIISNLDCVNEVIGIRQLSQSLLPAI ::.::::::::::::::::::::::::::::: XP_016 ----------------------------CPDVRLNIISNLDCVNEVIGIRQLSQSLLPAI 350 360 370 410 420 430 440 450 460 pF1KB3 VELAEDAKWRVRLAIIEYMPLLAGQLGVEFFDEKLNSLCMAWLVDHVYAIREAATSNLKK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: : XP_016 VELAEDAKWRVRLAIIEYMPLLAGQLGVEFFDEKLNSLCMAWLVDHVYAIREAATNNLMK 380 390 400 410 420 430 470 480 490 500 510 520 pF1KB3 LVEKFGKEWAHATIIPKVLAMSGDPNYLHRMTTLFCINVLSEVCGQDITTKHMLPTVLRM ::.::: :::. ::.::::.:..:::::::::::::::.:::.:::.::::.::: ::.: XP_016 LVQKFGTEWAQNTIVPKVLVMANDPNYLHRMTTLFCINALSEACGQEITTKQMLPIVLKM 440 450 460 470 480 490 530 540 550 560 570 580 pF1KB3 AGDPVANVRFNVAKSLQKIGPILDNSTLQSEVKPILEKLTQDQDVDVKYFAQEALTVLSL ::: ::::::::::::::::::::...::.::::.:.:: ::.:.:::::::::..:.. XP_016 AGDQVANVRFNVAKSLQKIGPILDTNALQGEVKPVLQKLGQDEDMDVKYFAQEAISVVAQ 500 510 520 530 540 550 pF1KB3 A XP_016 RLRKLEFPVKDSGEPSVPRADKNHFPRPTVPGEDMGKGPVYQLRGDTRDTLAQLGIAELV 560 570 580 590 600 610 589 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Thu Nov 3 12:30:18 2016 done: Thu Nov 3 12:30:19 2016 Total Scan time: 9.000 Total Display time: 0.120 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]