Result of FASTA (ccds) for pF1KB3088
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3088, 418 aa
  1>>>pF1KB3088 418 - 418 aa - 418 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1200+/-0.000942; mu= 13.3106+/- 0.057
 mean_var=86.4613+/-16.950, 0's: 0 Z-trim(106.8): 32  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.137931
 statistics sampled from 9202 (9223) to 9202 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.649), E-opt: 0.2 (0.283), width:  16
 Scan time:  2.970

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS5740.1 PRKAR2B gene_id:5577|Hs108|chr7         ( 418) 2758 558.9 3.3e-159
CCDS2778.1 PRKAR2A gene_id:5576|Hs108|chr3         ( 404) 1601 328.6 6.4e-90
CCDS82771.1 PRKAR2A gene_id:5576|Hs108|chr3        ( 382) 1100 228.9 6.3e-60
CCDS34579.1 PRKAR1B gene_id:5575|Hs108|chr7        ( 381)  788 166.9 3.1e-41
CCDS11678.1 PRKAR1A gene_id:5573|Hs108|chr17       ( 381)  775 164.3 1.8e-40
CCDS62307.1 PRKAR1A gene_id:5573|Hs108|chr17       ( 337)  598 129.0 6.7e-30
CCDS64005.1 PRKG2 gene_id:5593|Hs108|chr4          ( 733)  459 101.5 2.7e-21
CCDS3589.1 PRKG2 gene_id:5593|Hs108|chr4           ( 762)  459 101.5 2.8e-21
CCDS7244.1 PRKG1 gene_id:5592|Hs108|chr10          ( 686)  443 98.3 2.3e-20
CCDS44399.1 PRKG1 gene_id:5592|Hs108|chr10         ( 671)  426 94.9 2.4e-19


>>CCDS5740.1 PRKAR2B gene_id:5577|Hs108|chr7              (418 aa)
 initn: 2758 init1: 2758 opt: 2758  Z-score: 2971.9  bits: 558.9 E(32554): 3.3e-159
Smith-Waterman score: 2758; 100.0% identity (100.0% similar) in 418 aa overlap (1-418:1-418)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MSIEIPAGLTELLQGFTVEVLRHQPADLLEFALQHFTRLQQENERKGTARFGHEGRTWGD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 MSIEIPAGLTELLQGFTVEVLRHQPADLLEFALQHFTRLQQENERKGTARFGHEGRTWGD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 LGAAAGGGTPSKGVNFAEEPMQSDSEDGEEEEAAPADAGAFNAPVINRFTRRASVCAEAY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 LGAAAGGGTPSKGVNFAEEPMQSDSEDGEEEEAAPADAGAFNAPVINRFTRRASVCAEAY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 NPDEEEDDAESRIIHPKTDDQRNRLQEACKDILLFKNLDPEQMSQVLDAMFEKLVKDGEH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 NPDEEEDDAESRIIHPKTDDQRNRLQEACKDILLFKNLDPEQMSQVLDAMFEKLVKDGEH
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 VIDQGDDGDNFYVIDRGTFDIYVKCDGVGRCVGNYDNRGSFGELALMYNTPRAATITATS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 VIDQGDDGDNFYVIDRGTFDIYVKCDGVGRCVGNYDNRGSFGELALMYNTPRAATITATS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 PGALWGLDRVTFRRIIVKNNAKKRKMYESFIESLPFLKSLEFSERLKVVDVIGTKVYNDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 PGALWGLDRVTFRRIIVKNNAKKRKMYESFIESLPFLKSLEFSERLKVVDVIGTKVYNDG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 EQIIAQGDSADSFFIVESGEVKITMKRKGKSEVEENGAVEIARCSRGQYFGELALVTNKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 EQIIAQGDSADSFFIVESGEVKITMKRKGKSEVEENGAVEIARCSRGQYFGELALVTNKP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410        
pF1KB3 RAASAHAIGTVKCLAMDVQAFERLLGPCMEIMKRNIATYEEQLVALFGTNMDIVEPTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 RAASAHAIGTVKCLAMDVQAFERLLGPCMEIMKRNIATYEEQLVALFGTNMDIVEPTA
              370       380       390       400       410        

>>CCDS2778.1 PRKAR2A gene_id:5576|Hs108|chr3              (404 aa)
 initn: 1767 init1: 1187 opt: 1601  Z-score: 1727.8  bits: 328.6 E(32554): 6.4e-90
Smith-Waterman score: 1759; 66.7% identity (84.0% similar) in 412 aa overlap (3-413:4-399)

                10        20        30        40        50         
pF1KB3  MSIEIPAGLTELLQGFTVEVLRHQPADLLEFALQHFTRLQQENERKGTARFGHEGRTWG
          :.:: ::::::::.::::::.:: ::.:::...::::.   : .. :     .    
CCDS27 MSHIQIPPGLTELLQGYTVEVLRQQPPDLVEFAVEYFTRLR---EARAPASVLPAATPRQ
               10        20        30        40           50       

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB3 DLGAAAGGGTPSKGVNFAEEPMQSDSEDGEEEEAAPADAGAFNAPVINRFTRRASVCAEA
       .::       :  : . . .  ..:::. :.:.        ...:: .::.::.:::::.
CCDS27 SLGHPP----PEPGPDRVADA-KGDSESEEDED--------LEVPVPSRFNRRVSVCAET
        60            70         80                90       100    

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB3 YNPDEEEDDAESRIIHPKTDDQRNRLQEACKDILLFKNLDPEQMSQVLDAMFEKLVKDGE
       :::::::.:.. :.::::::.:: :::::::::::::::: ::.:::::::::..::  :
CCDS27 YNPDEEEEDTDPRVIHPKTDEQRCRLQEACKDILLFKNLDQEQLSQVLDAMFERIVKADE
          110       120       130       140       150       160    

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB3 HVIDQGDDGDNFYVIDRGTFDIYVKCDGVGRCVGNYDNRGSFGELALMYNTPRAATITAT
       :::::::::::::::.:::.:: :  :.  : ::.::::::::::::::::::::::.::
CCDS27 HVIDQGDDGDNFYVIERGTYDILVTKDNQTRSVGQYDNRGSFGELALMYNTPRAATIVAT
          170       180       190       200       210       220    

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB3 SPGALWGLDRVTFRRIIVKNNAKKRKMYESFIESLPFLKSLEFSERLKVVDVIGTKVYND
       : :.:::::::::::::::::::::::.::::::.:.::::: :::.:.::::: :.:.:
CCDS27 SEGSLWGLDRVTFRRIIVKNNAKKRKMFESFIESVPLLKSLEVSERMKIVDVIGEKIYKD
          230       240       250       260       270       280    

     300       310       320       330        340       350        
pF1KB3 GEQIIAQGDSADSFFIVESGEVKITMKRKGKSEVEE-NGAVEIARCSRGQYFGELALVTN
       ::.::.::..::::.:.:::::.: .. . ::. .  :  :::::: .::::::::::::
CCDS27 GERIITQGEKADSFYIIESGEVSILIRSRTKSNKDGGNQEVEIARCHKGQYFGELALVTN
          290       300       310       320       330       340    

      360       370       380       390       400       410        
pF1KB3 KPRAASAHAIGTVKCLAMDVQAFERLLGPCMEIMKRNIATYEEQLVALFGTNMDIVEPTA
       :::::::.:.: ::::.::::::::::::::.::::::. :::::: .::...:.     
CCDS27 KPRAASAYAVGDVKCLVMDVQAFERLLGPCMDIMKRNISHYEEQLVKMFGSSVDLGNLGQ
          350       360       370       380       390       400    

>>CCDS82771.1 PRKAR2A gene_id:5576|Hs108|chr3             (382 aa)
 initn: 1732 init1: 1089 opt: 1100  Z-score: 1189.4  bits: 228.9 E(32554): 6.3e-60
Smith-Waterman score: 1627; 64.2% identity (79.6% similar) in 411 aa overlap (3-413:4-377)

                10        20        30        40        50         
pF1KB3  MSIEIPAGLTELLQGFTVEVLRHQPADLLEFALQHFTRLQQENERKGTARFGHEGRTWG
          :.:: ::::::::.::::::.:: ::.:::...::::.   : .. :     .    
CCDS82 MSHIQIPPGLTELLQGYTVEVLRQQPPDLVEFAVEYFTRLR---EARAPASVLPAATPRQ
               10        20        30        40           50       

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB3 DLGAAAGGGTPSKGVNFAEEPMQSDSEDGEEEEAAPADAGAFNAPVINRFTRRASVCAEA
       .::       :  : . . .  ..:::. :.:.        ...:: .::.::.:::::.
CCDS82 SLGHPP----PEPGPDRVADA-KGDSESEEDED--------LEVPVPSRFNRRVSVCAET
        60            70         80                90       100    

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB3 YNPDEEEDDAESRIIHPKTDDQRNRLQEACKDILLFKNLDPEQMSQVLDAMFEKLVKDGE
       :::::::.:.. :.::::::.:: :::::::::::::::: ::.:::::::::..::  :
CCDS82 YNPDEEEEDTDPRVIHPKTDEQRCRLQEACKDILLFKNLDQEQLSQVLDAMFERIVKADE
          110       120       130       140       150       160    

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB3 HVIDQGDDGDNFYVIDRGTFDIYVKCDGVGRCVGNYDNRGSFGELALMYNTPRAATITAT
       :::::::::::::::.:::.:: :  :.  : ::.::::::::::::::::::::::.::
CCDS82 HVIDQGDDGDNFYVIERGTYDILVTKDNQTRSVGQYDNRGSFGELALMYNTPRAATIVAT
          170       180       190       200       210       220    

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB3 SPGALWGLDRVTFRRIIVKNNAKKRKMYESFIESLPFLKSLEFSERLKVVDVIGTKVYND
       : :.:::::::::::::::::::::::.::::::.:.::::: :::.:.::::: :.:.:
CCDS82 SEGSLWGLDRVTFRRIIVKNNAKKRKMFESFIESVPLLKSLEVSERMKIVDVIGEKIYKD
          230       240       250       260       270       280    

     300       310       320       330       340       350         
pF1KB3 GEQIIAQGDSADSFFIVESGEVKITMKRKGKSEVEENGAVEIARCSRGQYFGELALVTNK
       ::.::.:  :                :  :..:::      :::: .:::::::::::::
CCDS82 GERIITQTKSN---------------KDGGNQEVE------IARCHKGQYFGELALVTNK
          290                      300             310       320   

     360       370       380       390       400       410        
pF1KB3 PRAASAHAIGTVKCLAMDVQAFERLLGPCMEIMKRNIATYEEQLVALFGTNMDIVEPTA
       ::::::.:.: ::::.::::::::::::::.::::::. :::::: .::...:.     
CCDS82 PRAASAYAVGDVKCLVMDVQAFERLLGPCMDIMKRNISHYEEQLVKMFGSSVDLGNLGQ
           330       340       350       360       370       380  

>>CCDS34579.1 PRKAR1B gene_id:5575|Hs108|chr7             (381 aa)
 initn: 823 init1: 363 opt: 788  Z-score: 853.9  bits: 166.9 E(32554): 3.1e-41
Smith-Waterman score: 820; 38.3% identity (64.2% similar) in 394 aa overlap (8-399:26-373)

                                 10        20        30        40  
pF1KB3                   MSIEIPAGLTELLQGFTVEVLRHQPADLLEFALQHFTRLQQE
                                :. ..:.   :..   .:   ..:  .:: .:..:
CCDS34 MASPPACPSEEDESLKGCELYVQLHGIQQVLKDCIVHLCISKPERPMKFLREHFEKLEKE
               10        20        30        40        50        60

             50        60        70        80        90       100  
pF1KB3 NERKGTARFGHEGRTWGDLGAAAGGGTPSKGVNFAEEPMQSDSEDGEEEEAAPADAGAFN
       ..:.  ::                           .   ::::.:   ::..:.  .   
CCDS34 ENRQILAR--------------------------QKSNSQSDSHD---EEVSPTPPN---
                                         70           80           

            110       120       130         140       150       160
pF1KB3 APVINRFTRRASVCAEAYNPDEEEDDAES--RIIHPKTDDQRNRLQEACKDILLFKNLDP
        ::..   ::..: ::.:.    :.:: :  : . ::     . : .: .  .:: .:: 
CCDS34 -PVVKARRRRGGVSAEVYT----EEDAVSYVRKVIPKDYKTMTALAKAISKNVLFAHLDD
        90       100           110       120       130       140   

              170       180       190       200       210       220
pF1KB3 EQMSQVLDAMFEKLVKDGEHVIDQGDDGDNFYVIDRGTFDIYVKCDGVGRCVGNYDNRGS
       .. :...::::      :: ::.::..::::::.:.:  :.::.    :. : : .. ::
CCDS34 NERSDIFDAMFPVTHIAGETVIQQGNEGDNFYVVDQGEVDVYVN----GEWVTNISEGGS
           150       160       170       180           190         

              230       240       250       260       270       280
pF1KB3 FGELALMYNTPRAATITATSPGALWGLDRVTFRRIIVKNNAKKRKMYESFIESLPFLKSL
       ::::::.:.::::::. : .   :::.:: ..:::.. .. .:::::: :. .. .:.::
CCDS34 FGELALIYGTPRAATVKAKTDLKLWGIDRDSYRRILMGSTLRKRKMYEEFLSKVSILESL
     200       210       220       230       240       250         

              290       300       310       320       330       340
pF1KB3 EFSERLKVVDVIGTKVYNDGEQIIAQGDSADSFFIVESGEVKITMKRKGKSEVEENGAVE
       :  ::: :.:..    ..:::.:..::. .:.:.:.  : ... ..:. . :      ::
CCDS34 EKWERLTVADALEPVQFEDGEKIVVQGEPGDDFYIITEGTASVLQRRSPNEEY-----VE
     260       270       280       290       300       310         

              350       360       370       380       390       400
pF1KB3 IARCSRGQYFGELALVTNKPRAASAHAIGTVKCLAMDVQAFERLLGPCMEIMKRNIATYE
       ..: . ..::::.::. :.::::.. : : .::. .:   :::.:::: ::.::::  : 
CCDS34 VGRLGPSDYFGEIALLLNRPRAATVVARGPLKCVKLDRPRFERVLGPCSEILKRNIQRYN
          320       330       340       350       360       370    

              410        
pF1KB3 EQLVALFGTNMDIVEPTA
                         
CCDS34 SFISLTV           
          380            

>>CCDS11678.1 PRKAR1A gene_id:5573|Hs108|chr17            (381 aa)
 initn: 757 init1: 353 opt: 775  Z-score: 839.9  bits: 164.3 E(32554): 1.8e-40
Smith-Waterman score: 786; 43.2% identity (69.2% similar) in 315 aa overlap (87-399:76-373)

         60        70        80        90       100       110      
pF1KB3 TWGDLGAAAGGGTPSKGVNFAEEPMQSDSEDGEEEEAAPADAGAFNAPVINRFTRRASVC
                                     :..:.: .:   .    ::..   ::... 
CCDS11 PMAFLREYFERLEKEEAKQIQNLQKAGTRTDSREDEISPPPPN----PVVKGRRRRGAIS
          50        60        70        80            90       100 

        120       130         140       150       160       170    
pF1KB3 AEAYNPDEEEDDAES--RIIHPKTDDQRNRLQEACKDILLFKNLDPEQMSQVLDAMFEKL
       ::.:.    :.:: :  : . ::       : .: .  .::..:: .. :...::::   
CCDS11 AEVYT----EEDAASYVRKVIPKDYKTMAALAKAIEKNVLFSHLDDNERSDIFDAMFSVS
                 110       120       130       140       150       

          180       190       200       210       220       230    
pF1KB3 VKDGEHVIDQGDDGDNFYVIDRGTFDIYVKCDGVGRCVGNYDNRGSFGELALMYNTPRAA
          :: ::.:::.::::::::.:  :.::. . .   ::.    ::::::::.:.:::::
CCDS11 FIAGETVIQQGDEGDNFYVIDQGETDVYVNNEWA-TSVGE---GGSFGELALIYGTPRAA
       160       170       180       190           200       210   

          240       250       260       270       280       290    
pF1KB3 TITATSPGALWGLDRVTFRRIIVKNNAKKRKMYESFIESLPFLKSLEFSERLKVVDVIGT
       :. : .   :::.:: ..:::.. .. .:::::: :. .. .:.::.  ::: :.:..  
CCDS11 TVKAKTNVKLWGIDRDSYRRILMGSTLRKRKMYEEFLSKVSILESLDKWERLTVADALEP
           220       230       240       250       260       270   

          300       310       320       330       340       350    
pF1KB3 KVYNDGEQIIAQGDSADSFFIVESGEVKITMKRKGKSEVEENGAVEIARCSRGQYFGELA
         ..::..:..::. .: :::.  : . . ..:   :: ::   ::..: . ..::::.:
CCDS11 VQFEDGQKIVVQGEPGDEFFIILEGSAAVLQRR---SENEE--FVEVGRLGPSDYFGEIA
           280       290       300          310         320        

          360       370       380       390       400       410    
pF1KB3 LVTNKPRAASAHAIGTVKCLAMDVQAFERLLGPCMEIMKRNIATYEEQLVALFGTNMDIV
       :. :.::::.. : : .::. .:   :::.:::: .:.::::  :               
CCDS11 LLMNRPRAATVVARGPLKCVKLDRPRFERVLGPCSDILKRNIQQYNSFVSLSV       
      330       340       350       360       370       380        

           
pF1KB3 EPTA

>>CCDS62307.1 PRKAR1A gene_id:5573|Hs108|chr17            (337 aa)
 initn: 580 init1: 353 opt: 598  Z-score: 650.3  bits: 129.0 E(32554): 6.7e-30
Smith-Waterman score: 609; 41.0% identity (67.9% similar) in 271 aa overlap (87-355:76-329)

         60        70        80        90       100       110      
pF1KB3 TWGDLGAAAGGGTPSKGVNFAEEPMQSDSEDGEEEEAAPADAGAFNAPVINRFTRRASVC
                                     :..:.: .:   .    ::..   ::... 
CCDS62 PMAFLREYFERLEKEEAKQIQNLQKAGTRTDSREDEISPPPPN----PVVKGRRRRGAIS
          50        60        70        80            90       100 

        120       130         140       150       160       170    
pF1KB3 AEAYNPDEEEDDAES--RIIHPKTDDQRNRLQEACKDILLFKNLDPEQMSQVLDAMFEKL
       ::.:.    :.:: :  : . ::       : .: .  .::..:: .. :...::::   
CCDS62 AEVYT----EEDAASYVRKVIPKDYKTMAALAKAIEKNVLFSHLDDNERSDIFDAMFSVS
                 110       120       130       140       150       

          180       190       200       210       220       230    
pF1KB3 VKDGEHVIDQGDDGDNFYVIDRGTFDIYVKCDGVGRCVGNYDNRGSFGELALMYNTPRAA
          :: ::.:::.::::::::.:  :.::. . .   ::.    ::::::::.:.:::::
CCDS62 FIAGETVIQQGDEGDNFYVIDQGETDVYVNNEWA-TSVGEG---GSFGELALIYGTPRAA
       160       170       180       190           200       210   

          240       250       260       270       280       290    
pF1KB3 TITATSPGALWGLDRVTFRRIIVKNNAKKRKMYESFIESLPFLKSLEFSERLKVVDVIGT
       :. : .   :::.:: ..:::.. .. .:::::: :. .. .:.::.  ::: :.:..  
CCDS62 TVKAKTNVKLWGIDRDSYRRILMGSTLRKRKMYEEFLSKVSILESLDKWERLTVADALEP
           220       230       240       250       260       270   

          300       310       320       330       340       350    
pF1KB3 KVYNDGEQIIAQGDSADSFFIVESGEVKITMKRKGKSEVEENGAVEIARCSRGQYFGELA
         ..::..:..::. .: :::.  : . . ..:   :: ::   ::..: . ..:::.: 
CCDS62 VQFEDGQKIVVQGEPGDEFFIILEGSAAVLQRR---SENEE--FVEVGRLGPSDYFGHLI
           280       290       300          310         320        

          360       370       380       390       400       410    
pF1KB3 LVTNKPRAASAHAIGTVKCLAMDVQAFERLLGPCMEIMKRNIATYEEQLVALFGTNMDIV
       .                                                           
CCDS62 ISRRSIPLG                                                   
      330                                                          

>>CCDS64005.1 PRKG2 gene_id:5593|Hs108|chr4               (733 aa)
 initn: 378 init1: 265 opt: 459  Z-score: 495.7  bits: 101.5 E(32554): 2.7e-21
Smith-Waterman score: 459; 25.9% identity (64.5% similar) in 321 aa overlap (81-393:88-399)

               60        70        80        90       100       110
pF1KB3 FGHEGRTWGDLGAAAGGGTPSKGVNFAEEPMQSDSEDGEEEEAAPADAGAFNAPVINRFT
                                     ::. :      . .: ..   .. ...  .
CCDS64 LSKQTVAIAELTEELQNKCIQLNKLQDVVHMQGGSPLQASPDKVPLEVHRKTSGLVSLHS
        60        70        80        90       100       110       

                     120       130       140       150       160   
pF1KB3 RR---ASVCAE----AYNPDEEEDDAESRIIHPKTDDQRNRLQEACKDILLFKNLDPEQM
       ::   :.: ::    .:. ..  . .  .    : ..... . .: .   ..: :::.:.
CCDS64 RRGAKAGVSAEPTTRTYDLNKPPEFSFEKARVRKDSSEKKLITDALNKNQFLKRLDPQQI
       120       130       140       150       160       170       

           170       180       190       200       210       220   
pF1KB3 SQVLDAMFEKLVKDGEHVIDQGDDGDNFYVIDRGTFDIYVKCDGVGRCVGNYDNRGSFGE
       ..... :. .  ..: ..: ::. :....:. .: ....   .:  . ...     .:::
CCDS64 KDMVECMYGRNYQQGSYIIKQGEPGNHIFVLAEGRLEVF---QGE-KLLSSIPMWTTFGE
       180       190       200       210           220       230   

           230       240       250       260       270       280   
pF1KB3 LALMYNTPRAATITATSPGALWGLDRVTFRRIIVKNNAKKRKMYESFIESLPFLKSLEFS
       ::..::  :.:.. : .    :.::: .:. :. ..   . ..:..:..:. .::.:  .
CCDS64 LAILYNCTRTASVKAITNVKTWALDREVFQNIMRRTAQARDEQYRNFLRSVSLLKNLPED
           240       250       260       270       280       290   

           290       300       310       320       330       340   
pF1KB3 ERLKVVDVIGTKVYNDGEQIIAQGDSADSFFIVESGEVKITMKRKGKSEVEENGAVEIAR
       .  :..: . .. :. :. :: .:. ...:::. .:.::.:.. .:... .      :  
CCDS64 KLTKIIDCLEVEYYDKGDYIIREGEEGSTFFILAKGKVKVTQSTEGHDQPQL-----IKT
           300       310       320       330       340             

           350       360        370       380       390       400  
pF1KB3 CSRGQYFGELALVTNKPRAASAHAI-GTVKCLAMDVQAFERLLGPCMEIMKRNIATYEEQ
        ..:.:::: ::...  :.:.  :  . : ::..: ..:.. .:   :..:         
CCDS64 LQKGEYFGEKALISDDVRSANIIAEENDVACLVIDRETFNQTVGTFEELQKYLEGYVANL
      350       360       370       380       390       400        

            410                                                    
pF1KB3 LVALFGTNMDIVEPTA                                            
                                                                   
CCDS64 NRDDEKRHAKRSMSNWKLSKALSLEMIQLKEKVKVKNENVAFAMKCIRKKHIVDTKQQEH
      410       420       430       440       450       460        

>>CCDS3589.1 PRKG2 gene_id:5593|Hs108|chr4                (762 aa)
 initn: 378 init1: 265 opt: 459  Z-score: 495.5  bits: 101.5 E(32554): 2.8e-21
Smith-Waterman score: 459; 25.9% identity (64.5% similar) in 321 aa overlap (81-393:88-399)

               60        70        80        90       100       110
pF1KB3 FGHEGRTWGDLGAAAGGGTPSKGVNFAEEPMQSDSEDGEEEEAAPADAGAFNAPVINRFT
                                     ::. :      . .: ..   .. ...  .
CCDS35 LSKQTVAIAELTEELQNKCIQLNKLQDVVHMQGGSPLQASPDKVPLEVHRKTSGLVSLHS
        60        70        80        90       100       110       

                     120       130       140       150       160   
pF1KB3 RR---ASVCAE----AYNPDEEEDDAESRIIHPKTDDQRNRLQEACKDILLFKNLDPEQM
       ::   :.: ::    .:. ..  . .  .    : ..... . .: .   ..: :::.:.
CCDS35 RRGAKAGVSAEPTTRTYDLNKPPEFSFEKARVRKDSSEKKLITDALNKNQFLKRLDPQQI
       120       130       140       150       160       170       

           170       180       190       200       210       220   
pF1KB3 SQVLDAMFEKLVKDGEHVIDQGDDGDNFYVIDRGTFDIYVKCDGVGRCVGNYDNRGSFGE
       ..... :. .  ..: ..: ::. :....:. .: ....   .:  . ...     .:::
CCDS35 KDMVECMYGRNYQQGSYIIKQGEPGNHIFVLAEGRLEVF---QGE-KLLSSIPMWTTFGE
       180       190       200       210           220       230   

           230       240       250       260       270       280   
pF1KB3 LALMYNTPRAATITATSPGALWGLDRVTFRRIIVKNNAKKRKMYESFIESLPFLKSLEFS
       ::..::  :.:.. : .    :.::: .:. :. ..   . ..:..:..:. .::.:  .
CCDS35 LAILYNCTRTASVKAITNVKTWALDREVFQNIMRRTAQARDEQYRNFLRSVSLLKNLPED
           240       250       260       270       280       290   

           290       300       310       320       330       340   
pF1KB3 ERLKVVDVIGTKVYNDGEQIIAQGDSADSFFIVESGEVKITMKRKGKSEVEENGAVEIAR
       .  :..: . .. :. :. :: .:. ...:::. .:.::.:.. .:... .      :  
CCDS35 KLTKIIDCLEVEYYDKGDYIIREGEEGSTFFILAKGKVKVTQSTEGHDQPQL-----IKT
           300       310       320       330       340             

           350       360        370       380       390       400  
pF1KB3 CSRGQYFGELALVTNKPRAASAHAI-GTVKCLAMDVQAFERLLGPCMEIMKRNIATYEEQ
        ..:.:::: ::...  :.:.  :  . : ::..: ..:.. .:   :..:         
CCDS35 LQKGEYFGEKALISDDVRSANIIAEENDVACLVIDRETFNQTVGTFEELQKYLEGYVANL
      350       360       370       380       390       400        

            410                                                    
pF1KB3 LVALFGTNMDIVEPTA                                            
                                                                   
CCDS35 NRDDEKRHAKRSMSNWKLSKALSLEMIQLKEKVARFSSSSPFQNLEIIATLGVGGFGRVE
      410       420       430       440       450       460        

>>CCDS7244.1 PRKG1 gene_id:5592|Hs108|chr10               (686 aa)
 initn: 423 init1: 249 opt: 443  Z-score: 479.0  bits: 98.3 E(32554): 2.3e-20
Smith-Waterman score: 443; 31.0% identity (61.7% similar) in 277 aa overlap (110-386:74-341)

      80        90       100       110       120       130         
pF1KB3 PMQSDSEDGEEEEAAPADAGAFNAPVINRFTRRASVCAEAYNPDEEEDDAESRIIHPKTD
                                     :.: .. ::    : .. .  .  ..::. 
CCDS72 NELDKYRSVIRPATQQAQKQSASTLQGEPRTKRQAISAEPTAFDIQDLSHVTLPFYPKSP
            50        60        70        80        90       100   

     140       150       160       170       180       190         
pF1KB3 DQRNRLQEACKDILLFKNLDPEQMSQVLDAMFEKLVKDGEHVIDQGDDGDNFYVIDRGTF
       .... ..::  :  ..:::.  :.....: :.         .: .:: :.  ::.. :  
CCDS72 QSKDLIKEAILDNDFMKNLELSQIQEIVDCMYPVEYGKDSCIIKEGDVGSLVYVMEDG--
           110       120       130       140       150       160   

     200       210       220       230       240       250         
pF1KB3 DIYVKCDGVGRCVGNYDNRGSFGELALMYNTPRAATITATSPGALWGLDRVTFRRIIVKN
        . :  .::  :. .  .   :::::..::  :.::. .     ::..::  :. :....
CCDS72 KVEVTKEGVKLCTMGPGK--VFGELAILYNCTRTATVKTLVNVKLWAIDRQCFQTIMMRT
             170         180       190       200       210         

     260       270       280       290       300       310         
pF1KB3 NAKKRKMYESFIESLPFLKSLEFSERLKVVDVIGTKVYNDGEQIIAQGDSADSFFIVESG
       .  :.  :  :..:.: ..::      :..::.    :..:: :: ::  .:.:::. .:
CCDS72 GLIKHTEYMEFLKSVPTFQSLPEEILSKLADVLEETHYENGEYIIRQGARGDTFFIISKG
     220       230       240       250       260       270         

     320       330       340       350       360       370         
pF1KB3 EVKITMKRKGKSEVEENGAVEIARCSRGQYFGELALVTNKPRAASAHAIGTVKCLAMDVQ
        :..: .. . ::      : .   ..:..::: ::  .  :.:.. :  .: ::..: .
CCDS72 TVNVT-REDSPSE----DPVFLRTLGKGDWFGEKALQGEDVRTANVIAAEAVTCLVIDRD
     280        290           300       310       320       330    

     380       390       400       410                             
pF1KB3 AFERLLGPCMEIMKRNIATYEEQLVALFGTNMDIVEPTA                     
       .:..:.:                                                     
CCDS72 SFKHLIGGLDDVSNKAYEDAEAKAKYEAEAAFFANLKLSDFNIIDTLGVGGFGRVELVQL
          340       350       360       370       380       390    

>>CCDS44399.1 PRKG1 gene_id:5592|Hs108|chr10              (671 aa)
 initn: 417 init1: 249 opt: 426  Z-score: 460.8  bits: 94.9 E(32554): 2.4e-19
Smith-Waterman score: 426; 30.8% identity (60.2% similar) in 279 aa overlap (108-386:57-326)

        80        90       100       110       120       130       
pF1KB3 EEPMQSDSEDGEEEEAAPADAGAFNAPVINRFTRRASVCAEAYNPDEEEDDAESRIIHPK
                                     : ::  .. ::  .    .:  ..     :
CCDS44 SEKEEEIQELKRKLHKCQSVLPVPSTHIGPRTTRAQGISAEPQTYRSFHDLRQAFRKFTK
         30        40        50        60        70        80      

       140       150       160       170       180       190       
pF1KB3 TDDQRNRLQEACKDILLFKNLDPEQMSQVLDAMFEKLVKDGEHVIDQGDDGDNFYVIDRG
       .. ... ..::  :  ..:::.  :.....: :.         .: .:: :.  ::.. :
CCDS44 SERSKDLIKEAILDNDFMKNLELSQIQEIVDCMYPVEYGKDSCIIKEGDVGSLVYVMEDG
         90       100       110       120       130       140      

       200       210       220       230       240       250       
pF1KB3 TFDIYVKCDGVGRCVGNYDNRGSFGELALMYNTPRAATITATSPGALWGLDRVTFRRIIV
          . :  .::  :. .  .   :::::..::  :.::. .     ::..::  :. :..
CCDS44 --KVEVTKEGVKLCTMGPGK--VFGELAILYNCTRTATVKTLVNVKLWAIDRQCFQTIMM
          150       160         170       180       190       200  

       260       270       280       290       300       310       
pF1KB3 KNNAKKRKMYESFIESLPFLKSLEFSERLKVVDVIGTKVYNDGEQIIAQGDSADSFFIVE
       ...  :.  :  :..:.: ..::      :..::.    :..:: :: ::  .:.:::. 
CCDS44 RTGLIKHTEYMEFLKSVPTFQSLPEEILSKLADVLEETHYENGEYIIRQGARGDTFFIIS
            210       220       230       240       250       260  

       320       330       340       350       360       370       
pF1KB3 SGEVKITMKRKGKSEVEENGAVEIARCSRGQYFGELALVTNKPRAASAHAIGTVKCLAMD
       .: :..: .. . ::      : .   ..:..::: ::  .  :.:.. :  .: ::..:
CCDS44 KGTVNVT-REDSPSE----DPVFLRTLGKGDWFGEKALQGEDVRTANVIAAEAVTCLVID
             270           280       290       300       310       

       380       390       400       410                           
pF1KB3 VQAFERLLGPCMEIMKRNIATYEEQLVALFGTNMDIVEPTA                   
        ..:..:.:                                                   
CCDS44 RDSFKHLIGGLDDVSNKAYEDAEAKAKYEAEAAFFANLKLSDFNIIDTLGVGGFGRVELV
       320       330       340       350       360       370       




418 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 12:19:13 2016 done: Thu Nov  3 12:19:13 2016
 Total Scan time:  2.970 Total Display time:  0.060

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com