Result of FASTA (omim) for pF1KB3004
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3004, 1050 aa
  1>>>pF1KB3004 1050 - 1050 aa - 1050 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8269+/-0.000478; mu= 5.1677+/- 0.030
 mean_var=195.1838+/-41.832, 0's: 0 Z-trim(115.6): 20  B-trim: 816 in 2/48
 Lambda= 0.091802
 statistics sampled from 26159 (26173) to 26159 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.657), E-opt: 0.2 (0.307), width:  16
 Scan time: 12.530

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001202 (OMIM: 114500,176430,257300,602860) mito (1050) 6979 938.1       0
NP_001265546 (OMIM: 602452) mitotic checkpoint ser (1028)  392 65.7 1.5e-09
NP_004327 (OMIM: 602452) mitotic checkpoint serine (1085)  392 65.7 1.6e-09
NP_001265545 (OMIM: 602452) mitotic checkpoint ser (1065)  323 56.6 8.9e-07


>>NP_001202 (OMIM: 114500,176430,257300,602860) mitotic   (1050 aa)
 initn: 6979 init1: 6979 opt: 6979  Z-score: 5007.0  bits: 938.1 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 6979; 99.9% identity (100.0% similar) in 1050 aa overlap (1-1050:1-1050)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MAAVKKEGGALSEAMSLEGDEWELSKENVQPLRQGRIMSTLQGALAQESACNNTLQQQKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAAVKKEGGALSEAMSLEGDEWELSKENVQPLRQGRIMSTLQGALAQESACNNTLQQQKR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 AFEYEIRFYTGNDPLDVWDRYISWTEQNYPQGGKESNMSTLLERAVEALQGEKRYYSDPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AFEYEIRFYTGNDPLDVWDRYISWTEQNYPQGGKESNMSTLLERAVEALQGEKRYYSDPR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 FLNLWLKLGRLCNEPLDMYSYLHNQGIGVSLAQFYISWAEEYEARENFRKADAIFQEGIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FLNLWLKLGRLCNEPLDMYSYLHNQGIGVSLAQFYISWAEEYEARENFRKADAIFQEGIQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 QKAEPLERLQSQHRQFQARVSRQTLLALEKEEEEEVFESSVPQRSTLAELKSKGKKTARA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QKAEPLERLQSQHRQFQARVSRQTLLALEKEEEEEVFESSVPQRSTLAELKSKGKKTARA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 PIIRVGGALKAPSQNRGLQNPFPQQMQNNSRITVFDENADEASTAELSKPTVQPWIAPPM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PIIRVGGALKAPSQNRGLQNPFPQQMQNNSRITVFDENADEASTAELSKPTVQPWIAPPM
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 PRAKENELQAGPWNTGRSLEHRPRGNTASLIAVPAVLPSFTPYVEETARQPVMTPCKIEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
NP_001 PRAKENELQAGPWNTGRSLEHRPRGNTASLIAVPAVLPSFTPYVEETAQQPVMTPCKIEP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 SINHILSTRKPGKEEGDPLQRVQSHQQASEEKKEKMMYCKEKIYAGVGEFSFEEIRAEVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SINHILSTRKPGKEEGDPLQRVQSHQQASEEKKEKMMYCKEKIYAGVGEFSFEEIRAEVF
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 RKKLKEQREAELLTSAEKRAEMQKQIEEMEKKLKEIQTTQQERTGDQQEETMPTKETTKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RKKLKEQREAELLTSAEKRAEMQKQIEEMEKKLKEIQTTQQERTGDQQEETMPTKETTKL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 QIASESQKIPGMTLSSSVCQVNCCARETSLAENIWQEQPHSKGPSVPFSIFDEFLLSEKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QIASESQKIPGMTLSSSVCQVNCCARETSLAENIWQEQPHSKGPSVPFSIFDEFLLSEKK
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 NKSPPADPPRVLAQRRPLAVLKTSESITSNEDVSPDVCDEFTGIEPLSEDAIITGFRNVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NKSPPADPPRVLAQRRPLAVLKTSESITSNEDVSPDVCDEFTGIEPLSEDAIITGFRNVT
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB3 ICPNPEDTCDFARAARFVSTPFHEIMSLKDLPSDPERLLPEEDLDVKTSEDQQTACGTIY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ICPNPEDTCDFARAARFVSTPFHEIMSLKDLPSDPERLLPEEDLDVKTSEDQQTACGTIY
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB3 SQTLSIKKLSPIIEDSREATHSSGFSGSSASVASTSSIKCLQIPEKLELTNETSENPTQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SQTLSIKKLSPIIEDSREATHSSGFSGSSASVASTSSIKCLQIPEKLELTNETSENPTQS
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB3 PWCSQYRRQLLKSLPELSASAELCIEDRPMPKLEIEKEIELGNEDYCIKREYLICEDYKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PWCSQYRRQLLKSLPELSASAELCIEDRPMPKLEIEKEIELGNEDYCIKREYLICEDYKL
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB3 FWVAPRNSAELTVIKVSSQPVPWDFYINLKLKERLNEDFDHFCSCYQYQDGCIVWHQYIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FWVAPRNSAELTVIKVSSQPVPWDFYINLKLKERLNEDFDHFCSCYQYQDGCIVWHQYIN
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB3 CFTLQDLLQHSEYITHEITVLIIYNLLTIVEMLHKAEIVHGDLSPRCLILRNRIHDPYDC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CFTLQDLLQHSEYITHEITVLIIYNLLTIVEMLHKAEIVHGDLSPRCLILRNRIHDPYDC
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB3 NKNNQALKIVDFSYSVDLRVQLDVFTLSGFRTVQILEGQKILANCSSPYQVDLFGIADLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NKNNQALKIVDFSYSVDLRVQLDVFTLSGFRTVQILEGQKILANCSSPYQVDLFGIADLA
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB3 HLLLFKEHLQVFWDGSFWKLSQNISELKDGELWNKFFVRILNANDEATVSVLGELAAEMN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HLLLFKEHLQVFWDGSFWKLSQNISELKDGELWNKFFVRILNANDEATVSVLGELAAEMN
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050
pF1KB3 GVFDTTFQSHLNKALWKVGKLTSPGALLFQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GVFDTTFQSHLNKALWKVGKLTSPGALLFQ
             1030      1040      1050

>>NP_001265546 (OMIM: 602452) mitotic checkpoint serine/  (1028 aa)
 initn: 778 init1: 276 opt: 392  Z-score: 292.3  bits: 65.7 E(85289): 1.5e-09
Smith-Waterman score: 537; 22.7% identity (51.7% similar) in 1088 aa overlap (53-1033:6-1008)

             30        40        50        60        70        80  
pF1KB3 ELSKENVQPLRQGRIMSTLQGALAQESACNNTLQQQKRAFEYEIRFYTGNDPLDVWDRYI
                                     :.::.    .: ... : :::::  :.:::
NP_001                          MDTPENVLQM----LEAHMQSYKGNDPLGEWERYI
                                        10            20        30 

             90       100       110       120       130       140  
pF1KB3 SWTEQNYPQGGKESNMSTLLERAVEALQGEKRYYSDPRFLNLWLKLGRLCNEPLDMYSYL
       .:.:.:.:.. ::  . ::::. .. .  .:.:..::::..  ::...  ..  ... .:
NP_001 QWVEENFPEN-KEY-LITLLEHLMKEFLDKKKYHNDPRFISYCLKFAEYNSDLHQFFEFL
              40          50        60        70        80         

            150       160       170       180       190       200  
pF1KB3 HNQGIGVSLAQFYISWAEEYEARENFRKADAIFQEGIQQKAEPLERLQSQHRQFQARVSR
       .:.:::.  . .::.:: . ::. ....:.:..:.:::..::: : ::.:.: ::.:...
NP_001 YNHGIGTLSSPLYIAWAGHLEAQGELQHASAVLQRGIQNQAEPREFLQQQYRLFQTRLTE
      90       100       110       120       130       140         

            210           220           230       240       250    
pF1KB3 QTLLALEKEEEE----EVFESSVPQRST----LAELKSKGKKTARAPIIRVGGALKAPSQ
         : :  .  :     .:... . ..:.    .: . ::.. .  . .:  .   ..  .
NP_001 THLPAQARTSEPLHNVQVLNQMITSKSNPGNNMACI-SKNQGSELSGVISSACDKESNME
     150       160       170       180        190       200        

             260       270                 280       290           
pF1KB3 NRGL---QNPFPQQMQNNSRITVFD----------ENADEASTAELSKPTV------QPW
        : .   .. .  . .  :.. : .          .. .: :  ::           . :
NP_001 RRVITISKSEYSVHSSLASKVDVEQVVMYCKEKLIRGESEFSFEELRAQKYNQRRKHEQW
      210       220       230       240       250       260        

            300       310       320         330              340   
pF1KB3 IAPP---MPRAKENELQAGPWNTGRSLEHRPRGNTA--SLIAVPA------VLPS-FTPY
       .      : : . : ..    .   .  :.   ...  :   .::      : :. . : 
NP_001 VNEDRHYMKRKEANAFEEQLLKQKMDELHKKLHQVVETSHEDLPASQERSEVNPARMGPS
      270       280       290       300       310       320        

           350       360       370          380       390          
pF1KB3 VEETARQPVMTPCKIEPSINHILSTRKPGKEEGD---PLQRVQSHQQASEEKKEKM---M
       :   ..: . .::      .  .. .:  .:      ::  . :   .:   ....   .
NP_001 V--GSQQELRAPCLPVTYQQTPVNMEKNPREAPPVVPPLANAISAALVSPATSQSIAPPV
        330       340       350       360       370       380      

       400       410       420          430         440       450  
pF1KB3 YCKEKIYAGVGEFSFEEIRAEVFRK---KLKEQREAELLTSAE--KRAEMQKQIEEMEKK
         : .  .  . :.     :    :   ..: :  ::.  . :  : :. ..     . .
NP_001 PLKAQTVTD-SMFAVASKDAGCVNKSTHEFKPQSGAEIKEGCETHKVANTSSFHTTPNTS
        390        400       410       420       430       440     

            460       470       480        490       500           
pF1KB3 LKEIQTTQQERTGDQQEETMPTKETTKLQIAS-ESQKIPGMTLSSSVCQV---NCCARET
       :  .:.: ..    :   :. :::.  . .   ..  .: .. ...  :    :  : :.
NP_001 LGMVQATPSKV---QPSPTVHTKEALGFIMNMFQAPTLPDISDDKDEWQSLDQNEDAFEA
         450          460       470       480       490       500  

      510            520       530       540       550       560   
pF1KB3 SLAENI-----WQEQPHSKGPSVPFSIFDEFLLSEKKNKSPPADPPRVLAQRRPLAVLKT
       .. .:.     :  .   .. :  : .:..   ..:.: . :   :.     .: ..   
NP_001 QFQKNVRSSGAWGVNKIISSLSSAFHVFED---GNKENYGLP--QPK----NKPTGARTF
            510       520       530          540             550   

           570       580       590        600       610       620  
pF1KB3 SESITSNEDVSPDVCDEFTGIEPLSEDAIITGFR-NVTICPNPEDTCDFARAARFVSTPF
       .:  .:    .:   .:    : . .:. . :.: : :. :.:..  ::. ::...::::
NP_001 GERSVSRLPSKPK--EEVPHAEEFLDDSTVWGIRCNKTLAPSPKSPGDFTSAAQLASTPF
           560         570       580       590       600       610 

                 630                     640          650       660
pF1KB3 HE-----IMSLKD-------------LPSDPERLL-PEED---LDVKTSEDQQTACGTIY
       :.     .  :.:             : :  : .. : .:     .. .  .:.  . .:
NP_001 HKLPVESVHILEDKENVVAKQCTQATLDSCEENMVVPSRDGKFSPIQEKSPKQALSSHMY
             620       630       640       650       660       670 

              670            680       690         700       710   
pF1KB3 SQTLSIKKLSP-----IIEDSREATHSSGFSGSSASVAST--SSIKCLQIPEKLELTNE-
       : .: ..  .:     .  ... ....  .. ..:..:    ..:  ::  : .....  
NP_001 SASL-LRLSQPAAGGVLTCEAELGVEACRLTDTDAAIAEDPPDAIAGLQA-EWMQMSSLG
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pF1KB3 TSENPT---QSPWCSQYRRQLLKSLPELSASAELCIEDR-PMPKLEIEKEIELGNEDYCI
       : . :.    .:: ..   .::..: .  .:    .: .  .: .. . :..::..   .
NP_001 TVDAPNFIVGNPWDDKLIFKLLSGLSKPVSSYPNTFEWQCKLPAIKPKTEFQLGSK--LV
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pF1KB3 KREYLICED-YKLFWVAPR---NSA---ELTVIKVSSQPVPWDFYINLKLKERLNEDFDH
         ..:. :  .   . : .   :.:   .  :.::..   ::.:::. .: :::. ...:
NP_001 YVHHLLGEGAFAQVYEATQGDLNDAKNKQKFVLKVQKPANPWEFYIGTQLMERLKPSMQH
       790       800       810       820       830       840       

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pF1KB3 FCSCYQYQDGCIVWHQYINCFTLQDLLQHSEYITHEITVLIIYNLLTIVEMLHKAEIVHG
       .               ... .. . :.:..  .. :.     :.  :...        . 
NP_001 M---------------FMKFYSAH-LFQNGSVLVGEL-----YSYGTLLDD-------ED
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pF1KB3 DLSPRCLILRNRIHDPYDCNKNNQALKIVDFSYSVDLRV--QLDVFT----LSGFRTVQI
       :::                     .: ..:.. :.:...  .  .::     :::. :. 
NP_001 DLSA--------------------GLALIDLGQSIDMKLFPKGTIFTAKCETSGFQCVE-
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pF1KB3 LEGQKILANCSSPYQVDLFGIADLAHLLLFKEHLQVFWDGSFWKLSQNISELKDGELWNK
            .:.:    ::.: ::.:  .. .::  ...:  .:.  :    . .:   ..::.
NP_001 -----MLSNKPWNYQIDYFGVAATVYCMLFGTYMKVKNEGGECKPEGLFRRLPHLDMWNE
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pF1KB3 FFVRILNANDEATVSVLGELAAEMNGVFDTTFQSHLNKALWKVGKLTSPGALLFQ   
       ::  .::  :   .  :  :  ... ::.   : . ::                    
NP_001 FFHVMLNIPDCHHLPSLDLLRQKLKKVFQ---QHYTNKIRALRNRLIVLLLECKRSRK
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>>NP_004327 (OMIM: 602452) mitotic checkpoint serine/thr  (1085 aa)
 initn: 848 init1: 276 opt: 392  Z-score: 291.9  bits: 65.7 E(85289): 1.6e-09
Smith-Waterman score: 666; 23.3% identity (54.0% similar) in 1058 aa overlap (53-994:6-1029)

             30        40        50        60        70        80  
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                                     :.::.    .: ... : :::::  :.:::
NP_004                          MDTPENVLQM----LEAHMQSYKGNDPLGEWERYI
                                        10            20        30 

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pF1KB3 SWTEQNYPQGGKESNMSTLLERAVEALQGEKRYYSDPRFLNLWLKLGRLCNEPLDMYSYL
       .:.:.:.:.. ::  . ::::. .. .  .:.:..::::..  ::...  ..  ... .:
NP_004 QWVEENFPEN-KEY-LITLLEHLMKEFLDKKKYHNDPRFISYCLKFAEYNSDLHQFFEFL
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pF1KB3 HNQGIGVSLAQFYISWAEEYEARENFRKADAIFQEGIQQKAEPLERLQSQHRQFQARVSR
       .:.:::.  . .::.:: . ::. ....:.:..:.:::..::: : ::.:.: ::.:...
NP_004 YNHGIGTLSSPLYIAWAGHLEAQGELQHASAVLQRGIQNQAEPREFLQQQYRLFQTRLTE
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pF1KB3 QTLLALEKEEEE----EVFESSVPQRST----LAELKSKGKKTARAPIIRVGGALKAPSQ
         : :  .  :     .:... . ..:.    .: . ::.. .  . .:  .   ..  .
NP_004 THLPAQARTSEPLHNVQVLNQMITSKSNPGNNMACI-SKNQGSELSGVISSACDKESNME
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pF1KB3 NRGL---QNPFPQQMQNNSRITVFD----------ENADEASTAELSKPTV------QPW
        : .   .. .  . .  :.. : .          .. .: :  ::           . :
NP_004 RRVITISKSEYSVHSSLASKVDVEQVVMYCKEKLIRGESEFSFEELRAQKYNQRRKHEQW
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            300       310       320         330              340   
pF1KB3 IAPP---MPRAKENELQAGPWNTGRSLEHRPRGNTA--SLIAVPA------VLPS-FTPY
       .      : : . : ..    .   .  :.   ...  :   .::      : :. . : 
NP_004 VNEDRHYMKRKEANAFEEQLLKQKMDELHKKLHQVVETSHEDLPASQERSEVNPARMGPS
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pF1KB3 VEETARQPVMTPCKIEPSINHILSTRKPGKEEGD---PLQRVQSHQQASEEKKEKM---M
       :   ..: . .::      .  .. .:  .:      ::  . :   .:   ....   .
NP_004 V--GSQQELRAPCLPVTYQQTPVNMEKNPREAPPVVPPLANAISAALVSPATSQSIAPPV
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pF1KB3 YCKEKIYAGVGEFSFEEIRAEVFRK---KLKEQREAELLTSAE--KRAEMQKQIEEMEKK
         : .  .  . :.     :    :   ..: :  ::.  . :  : :. ..     . .
NP_004 PLKAQTVTD-SMFAVASKDAGCVNKSTHEFKPQSGAEIKEGCETHKVANTSSFHTTPNTS
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pF1KB3 LKEIQTTQQERTGDQQEETMPTKETTKLQIAS-ESQKIPGMTLSSSVCQV---NCCARET
       :  .:.: ..    :   :. :::.  . .   ..  .: .. ...  :    :  : :.
NP_004 LGMVQATPSKV---QPSPTVHTKEALGFIMNMFQAPTLPDISDDKDEWQSLDQNEDAFEA
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pF1KB3 SLAENI-----WQEQPHSKGPSVPFSIFDEFLLSEKKNKSPPADPPRVLAQRRPLAVLKT
       .. .:.     :  .   .. :  : .:..   ..:.: . :   :.     .: ..   
NP_004 QFQKNVRSSGAWGVNKIISSLSSAFHVFED---GNKENYGLP--QPK----NKPTGARTF
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pF1KB3 SESITSNEDVSPDVCDEFTGIEPLSEDAIITGFR-NVTICPNPEDTCDFARAARFVSTPF
       .:  .:    .:   .:    : . .:. . :.: : :. :.:..  ::. ::...::::
NP_004 GERSVSRLPSKPK--EEVPHAEEFLDDSTVWGIRCNKTLAPSPKSPGDFTSAAQLASTPF
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pF1KB3 HE-----IMSLKD-------------LPSDPERLL-PEED---LDVKTSEDQQTACGTIY
       :.     .  :.:             : :  : .. : .:     .. .  .:.  . .:
NP_004 HKLPVESVHILEDKENVVAKQCTQATLDSCEENMVVPSRDGKFSPIQEKSPKQALSSHMY
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pF1KB3 SQTLSIKKLSP-----IIEDSREATHSSGFSGSSASVAST--SSIKCLQIPEKLELTNE-
       : .: ..  .:     .  ... ....  .. ..:..:    ..:  ::  : .....  
NP_004 SASL-LRLSQPAAGGVLTCEAELGVEACRLTDTDAAIAEDPPDAIAGLQA-EWMQMSSLG
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               720       730       740        750       760        
pF1KB3 TSENPT---QSPWCSQYRRQLLKSLPELSASAELCIEDR-PMPKLEIEKEIELGNEDYCI
       : . :.    .:: ..   .::..: .  .:    .: .  .: .. . :..::..   .
NP_004 TVDAPNFIVGNPWDDKLIFKLLSGLSKPVSSYPNTFEWQCKLPAIKPKTEFQLGSK--LV
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pF1KB3 KREYLICED-YKLFWVAPR---NSA---ELTVIKVSSQPVPWDFYINLKLKERLNEDFDH
         ..:. :  .   . : .   :.:   .  :.::..   ::.:::. .: :::. ...:
NP_004 YVHHLLGEGAFAQVYEATQGDLNDAKNKQKFVLKVQKPANPWEFYIGTQLMERLKPSMQH
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pF1KB3 ----FCSCYQYQDGCIV---WHQYINCFTLQDLLQHS--EYITHEITVLIIYNLLTIVEM
           : : . .:.: ..    ..: . ..  .: ...  . . . ... . . .: ..:.
NP_004 MFMKFYSAHLFQNGSVLVGELYSYGTLLNAINLYKNTPEKVMPQGLVISFAMRMLYMIEQ
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pF1KB3 LHKAEIVHGDLSPRCLILRNRIHDPYDCNKNNQALKIVDFSYSVDLRV--QLDVFT----
       .:  ::.:::..:  .:: : . .  : .  . .: ..:.. :.:...  .  .::    
NP_004 VHDCEIIHGDIKPDNFILGNGFLEQDDEDDLSAGLALIDLGQSIDMKLFPKGTIFTAKCE
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pF1KB3 LSGFRTVQILEGQKILANCSSPYQVDLFGIADLAHLLLFKEHLQVFWDGSFWKLSQNISE
        :::. :..:      .:    ::.: ::.:  .. .::  ...:  .:.  :    . .
NP_004 TSGFQCVEML------SNKPWNYQIDYFGVAATVYCMLFGTYMKVKNEGGECKPEGLFRR
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pF1KB3 LKDGELWNKFFVRILNANDEATVSVLGELAAEMNGVFDTTFQSHLNKALWKVGKLTSPGA
       :   ..::                                                    
NP_004 LPHLDMWNEFFHVMLNIPDCHHLPSLDLLRQKLKKVFQQHYTNKIRALRNRLIVLLLECK
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>>NP_001265545 (OMIM: 602452) mitotic checkpoint serine/  (1065 aa)
 initn: 745 init1: 276 opt: 323  Z-score: 242.7  bits: 56.6 E(85289): 8.9e-07
Smith-Waterman score: 597; 22.7% identity (53.6% similar) in 1039 aa overlap (72-994:2-1009)

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pF1KB3 QGALAQESACNNTLQQQKRAFEYEIRFYTGNDPLDVWDRYISWTEQNYPQGGKESNMSTL
                                     . : .:  .::.:.:.:.:.. ::  . ::
NP_001                              MDTPENVL-QYIQWVEENFPEN-KEY-LITL
                                             10        20          

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pF1KB3 LERAVEALQGEKRYYSDPRFLNLWLKLGRLCNEPLDMYSYLHNQGIGVSLAQFYISWAEE
       ::. .. .  .:.:..::::..  ::...  ..  ... .:.:.:::.  . .::.:: .
NP_001 LEHLMKEFLDKKKYHNDPRFISYCLKFAEYNSDLHQFFEFLYNHGIGTLSSPLYIAWAGH
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             170       180       190       200       210           
pF1KB3 YEARENFRKADAIFQEGIQQKAEPLERLQSQHRQFQARVSRQTLLALEKEEEE----EVF
        ::. ....:.:..:.:::..::: : ::.:.: ::.:...  : :  .  :     .:.
NP_001 LEAQGELQHASAVLQRGIQNQAEPREFLQQQYRLFQTRLTETHLPAQARTSEPLHNVQVL
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pF1KB3 ESSVPQRST----LAELKSKGKKTARAPIIRVGGALKAPSQNRGL---QNPFPQQMQNNS
       .. . ..:.    .: . ::.. .  . .:  .   ..  . : .   .. .  . .  :
NP_001 NQMITSKSNPGNNMACI-SKNQGSELSGVISSACDKESNMERRVITISKSEYSVHSSLAS
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pF1KB3 RITVFD----------ENADEASTAELSKPTV------QPWIAPP---MPRAKENELQAG
       .. : .          .. .: :  ::           . :.      : : . : ..  
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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