Result of FASTA (ccds) for
pF1KB1123
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB1123, 2549 aa
1>>>pF1KB1123 2549 - 2549 aa - 2549 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2018+/-0.00132; mu= 21.2295+/- 0.079
mean_var=78.8702+/-15.586, 0's: 0 Z-trim(100.5): 40 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.144417
statistics sampled from 6128 (6157) to 6128 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.517), E-opt: 0.2 (0.189), width: 16
Scan time: 8.170
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS127.1 MTOR gene_id:2475|Hs108|chr1 (2549) 16818 3515.3 0
CCDS3124.1 ATR gene_id:545|Hs108|chr3 (2644) 625 141.5 5.4e-32
CCDS31669.1 ATM gene_id:472|Hs108|chr11 (3056) 577 131.6 6.3e-29
CCDS45430.1 SMG1 gene_id:23049|Hs108|chr16 (3661) 328 79.7 3.1e-13
CCDS75735.1 PRKDC gene_id:5591|Hs108|chr8 (4128) 305 74.9 9.5e-12
>>CCDS127.1 MTOR gene_id:2475|Hs108|chr1 (2549 aa)
initn: 16818 init1: 16818 opt: 16818 Z-score: 18921.6 bits: 3515.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 16818; 100.0% identity (100.0% similar) in 2549 aa overlap (1-2549:1-2549)
10 20 30 40 50 60
pF1KB1 MLGTGPAAATTAATTSSNVSVLQQFASGLKSRNEETRAKAAKELQHYVTMELREMSQEES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MLGTGPAAATTAATTSSNVSVLQQFASGLKSRNEETRAKAAKELQHYVTMELREMSQEES
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB1 TRFYDQLNHHIFELVSSSDANERKGGILAIASLIGVEGGNATRIGRFANYLRNLLPSNDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TRFYDQLNHHIFELVSSSDANERKGGILAIASLIGVEGGNATRIGRFANYLRNLLPSNDP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB1 VVMEMASKAIGRLAMAGDTFTAEYVEFEVKRALEWLGADRNEGRRHAAVLVLRELAISVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VVMEMASKAIGRLAMAGDTFTAEYVEFEVKRALEWLGADRNEGRRHAAVLVLRELAISVP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB1 TFFFQQVQPFFDNIFVAVWDPKQAIREGAVAALRACLILTTQREPKEMQKPQWYRHTFEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TFFFQQVQPFFDNIFVAVWDPKQAIREGAVAALRACLILTTQREPKEMQKPQWYRHTFEE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB1 AEKGFDETLAKEKGMNRDDRIHGALLILNELVRISSMEGERLREEMEEITQQQLVHDKYC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AEKGFDETLAKEKGMNRDDRIHGALLILNELVRISSMEGERLREEMEEITQQQLVHDKYC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB1 KDLMGFGTKPRHITPFTSFQAVQPQQSNALVGLLGYSSHQGLMGFGTSPSPAKSTLVESR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KDLMGFGTKPRHITPFTSFQAVQPQQSNALVGLLGYSSHQGLMGFGTSPSPAKSTLVESR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB1 CCRDLMEEKFDQVCQWVLKCRNSKNSLIQMTILNLLPRLAAFRPSAFTDTQYLQDTMNHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 CCRDLMEEKFDQVCQWVLKCRNSKNSLIQMTILNLLPRLAAFRPSAFTDTQYLQDTMNHV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB1 LSCVKKEKERTAAFQALGLLSVAVRSEFKVYLPRVLDIIRAALPPKDFAHKRQKAMQVDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LSCVKKEKERTAAFQALGLLSVAVRSEFKVYLPRVLDIIRAALPPKDFAHKRQKAMQVDA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB1 TVFTCISMLARAMGPGIQQDIKELLEPMLAVGLSPALTAVLYDLSRQIPQLKKDIQDGLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TVFTCISMLARAMGPGIQQDIKELLEPMLAVGLSPALTAVLYDLSRQIPQLKKDIQDGLL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB1 KMLSLVLMHKPLRHPGMPKGLAHQLASPGLTTLPEASDVGSITLALRTLGSFEFEGHSLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KMLSLVLMHKPLRHPGMPKGLAHQLASPGLTTLPEASDVGSITLALRTLGSFEFEGHSLT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB1 QFVRHCADHFLNSEHKEIRMEAARTCSRLLTPSIHLISGHAHVVSQTAVQVVADVLSKLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QFVRHCADHFLNSEHKEIRMEAARTCSRLLTPSIHLISGHAHVVSQTAVQVVADVLSKLL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB1 VVGITDPDPDIRYCVLASLDERFDAHLAQAENLQALFVALNDQVFEIRELAICTVGRLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VVGITDPDPDIRYCVLASLDERFDAHLAQAENLQALFVALNDQVFEIRELAICTVGRLSS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB1 MNPAFVMPFLRKMLIQILTELEHSGIGRIKEQSARMLGHLVSNAPRLIRPYMEPILKALI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MNPAFVMPFLRKMLIQILTELEHSGIGRIKEQSARMLGHLVSNAPRLIRPYMEPILKALI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB1 LKLKDPDPDPNPGVINNVLATIGELAQVSGLEMRKWVDELFIIIMDMLQDSSLLAKRQVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LKLKDPDPDPNPGVINNVLATIGELAQVSGLEMRKWVDELFIIIMDMLQDSSLLAKRQVA
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB1 LWTLGQLVASTGYVVELYRKYPTLLEVLLNFLKTEQNQGTRREAIRVLGLLGALDPYKHK
:::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LWTLGQLVASTGYVVEPYRKYPTLLEVLLNFLKTEQNQGTRREAIRVLGLLGALDPYKHK
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB1 VNIGMIDQSRDASAVSLSESKSSQDSSDYSTSEMLVNMGNLPLDEFYPAVSMVALMRIFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VNIGMIDQSRDASAVSLSESKSSQDSSDYSTSEMLVNMGNLPLDEFYPAVSMVALMRIFR
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB1 DQSLSHHHTMVVQAITFIFKSLGLKCVQFLPQVMPTFLNVIRVCDGAIREFLFQQLGMLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DQSLSHHHTMVVQAITFIFKSLGLKCVQFLPQVMPTFLNVIRVCDGAIREFLFQQLGMLV
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB1 SFVKSHIRPYMDEIVTLMREFWVMNTSIQSTIILLIEQIVVALGGEFKLYLPQLIPHMLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SFVKSHIRPYMDEIVTLMREFWVMNTSIQSTIILLIEQIVVALGGEFKLYLPQLIPHMLR
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB1 VFMHDNSPGRIVSIKLLAAIQLFGANLDDYLHLLLPPIVKLFDAPEAPLPSRKAALETVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VFMHDNSPGRIVSIKLLAAIQLFGANLDDYLHLLLPPIVKLFDAPEAPLPSRKAALETVD
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB1 RLTESLDFTDYASRIIHPIVRTLDQSPELRSTAMDTLSSLVFQLGKKYQIFIPMVNKVLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RLTESLDFTDYASRIIHPIVRTLDQSPELRSTAMDTLSSLVFQLGKKYQIFIPMVNKVLV
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB1 RHRINHQRYDVLICRIVKGYTLADEEEDPLIYQHRMLRSGQGDALASGPVETGPMKKLHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RHRINHQRYDVLICRIVKGYTLADEEEDPLIYQHRMLRSGQGDALASGPVETGPMKKLHV
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KB1 STINLQKAWGAARRVSKDDWLEWLRRLSLELLKDSSSPSLRSCWALAQAYNPMARDLFNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 STINLQKAWGAARRVSKDDWLEWLRRLSLELLKDSSSPSLRSCWALAQAYNPMARDLFNA
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KB1 AFVSCWSELNEDQQDELIRSIELALTSQDIAEVTQTLLNLAEFMEHSDKGPLPLRDDNGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AFVSCWSELNEDQQDELIRSIELALTSQDIAEVTQTLLNLAEFMEHSDKGPLPLRDDNGI
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KB1 VLLGERAAKCRAYAKALHYKELEFQKGPTPAILESLISINNKLQQPEAAAGVLEYAMKHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VLLGERAAKCRAYAKALHYKELEFQKGPTPAILESLISINNKLQQPEAAAGVLEYAMKHF
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KB1 GELEIQATWYEKLHEWEDALVAYDKKMDTNKDDPELMLGRMRCLEALGEWGQLHQQCCEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GELEIQATWYEKLHEWEDALVAYDKKMDTNKDDPELMLGRMRCLEALGEWGQLHQQCCEK
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KB1 WTLVNDETQAKMARMAAAAAWGLGQWDSMEEYTCMIPRDTHDGAFYRAVLALHQDLFSLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 WTLVNDETQAKMARMAAAAAWGLGQWDSMEEYTCMIPRDTHDGAFYRAVLALHQDLFSLA
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KB1 QQCIDKARDLLDAELTAMAGESYSRAYGAMVSCHMLSELEEVIQYKLVPERREIIRQIWW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QQCIDKARDLLDAELTAMAGESYSRAYGAMVSCHMLSELEEVIQYKLVPERREIIRQIWW
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KB1 ERLQGCQRIVEDWQKILMVRSLVVSPHEDMRTWLKYASLCGKSGRLALAHKTLVLLLGVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ERLQGCQRIVEDWQKILMVRSLVVSPHEDMRTWLKYASLCGKSGRLALAHKTLVLLLGVD
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KB1 PSRQLDHPLPTVHPQVTYAYMKNMWKSARKIDAFQHMQHFVQTMQQQAQHAIATEDQQHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PSRQLDHPLPTVHPQVTYAYMKNMWKSARKIDAFQHMQHFVQTMQQQAQHAIATEDQQHK
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KB1 QELHKLMARCFLKLGEWQLNLQGINESTIPKVLQYYSAATEHDRSWYKAWHAWAVMNFEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QELHKLMARCFLKLGEWQLNLQGINESTIPKVLQYYSAATEHDRSWYKAWHAWAVMNFEA
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KB1 VLHYKHQNQARDEKKKLRHASGANITNATTAATTAATATTTASTEGSNSESEAESTENSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VLHYKHQNQARDEKKKLRHASGANITNATTAATTAATATTTASTEGSNSESEAESTENSP
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KB1 TPSPLQKKVTEDLSKTLLMYTVPAVQGFFRSISLSRGNNLQDTLRVLTLWFDYGHWPDVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TPSPLQKKVTEDLSKTLLMYTVPAVQGFFRSISLSRGNNLQDTLRVLTLWFDYGHWPDVN
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KB1 EALVEGVKAIQIDTWLQVIPQLIARIDTPRPLVGRLIHQLLTDIGRYHPQALIYPLTVAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EALVEGVKAIQIDTWLQVIPQLIARIDTPRPLVGRLIHQLLTDIGRYHPQALIYPLTVAS
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KB1 KSTTTARHNAANKILKNMCEHSNTLVQQAMMVSEELIRVAILWHEMWHEGLEEASRLYFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KSTTTARHNAANKILKNMCEHSNTLVQQAMMVSEELIRVAILWHEMWHEGLEEASRLYFG
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KB1 ERNVKGMFEVLEPLHAMMERGPQTLKETSFNQAYGRDLMEAQEWCRKYMKSGNVKDLTQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ERNVKGMFEVLEPLHAMMERGPQTLKETSFNQAYGRDLMEAQEWCRKYMKSGNVKDLTQA
2050 2060 2070 2080 2090 2100
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KB1 WDLYYHVFRRISKQLPQLTSLELQYVSPKLLMCRDLELAVPGTYDPNQPIIRIQSIAPSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 WDLYYHVFRRISKQLPQLTSLELQYVSPKLLMCRDLELAVPGTYDPNQPIIRIQSIAPSL
2110 2120 2130 2140 2150 2160
2170 2180 2190 2200 2210 2220
pF1KB1 QVITSKQRPRKLTLMGSNGHEFVFLLKGHEDLRQDERVMQLFGLVNTLLANDPTSLRKNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QVITSKQRPRKLTLMGSNGHEFVFLLKGHEDLRQDERVMQLFGLVNTLLANDPTSLRKNL
2170 2180 2190 2200 2210 2220
2230 2240 2250 2260 2270 2280
pF1KB1 SIQRYAVIPLSTNSGLIGWVPHCDTLHALIRDYREKKKILLNIEHRIMLRMAPDYDHLTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SIQRYAVIPLSTNSGLIGWVPHCDTLHALIRDYREKKKILLNIEHRIMLRMAPDYDHLTL
2230 2240 2250 2260 2270 2280
2290 2300 2310 2320 2330 2340
pF1KB1 MQKVEVFEHAVNNTAGDDLAKLLWLKSPSSEVWFDRRTNYTRSLAVMSMVGYILGLGDRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MQKVEVFEHAVNNTAGDDLAKLLWLKSPSSEVWFDRRTNYTRSLAVMSMVGYILGLGDRH
2290 2300 2310 2320 2330 2340
2350 2360 2370 2380 2390 2400
pF1KB1 PSNLMLDRLSGKILHIDFGDCFEVAMTREKFPEKIPFRLTRMLTNAMEVTGLDGNYRITC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PSNLMLDRLSGKILHIDFGDCFEVAMTREKFPEKIPFRLTRMLTNAMEVTGLDGNYRITC
2350 2360 2370 2380 2390 2400
2410 2420 2430 2440 2450 2460
pF1KB1 HTVMEVLREHKDSVMAVLEAFVYDPLLNWRLMDTNTKGNKRSRTRTDSYSAGQSVEILDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HTVMEVLREHKDSVMAVLEAFVYDPLLNWRLMDTNTKGNKRSRTRTDSYSAGQSVEILDG
2410 2420 2430 2440 2450 2460
2470 2480 2490 2500 2510 2520
pF1KB1 VELGEPAHKKTGTTVPESIHSFIGDGLVKPEALNKKAIQIINRVRDKLTGRDFSHDDTLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VELGEPAHKKTGTTVPESIHSFIGDGLVKPEALNKKAIQIINRVRDKLTGRDFSHDDTLD
2470 2480 2490 2500 2510 2520
2530 2540
pF1KB1 VPTQVELLIKQATSHENLCQCYIGWCPFW
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VPTQVELLIKQATSHENLCQCYIGWCPFW
2530 2540
>>CCDS3124.1 ATR gene_id:545|Hs108|chr3 (2644 aa)
initn: 928 init1: 235 opt: 625 Z-score: 687.8 bits: 141.5 E(32554): 5.4e-32
Smith-Waterman score: 749; 24.1% identity (51.2% similar) in 1192 aa overlap (1389-2548:1647-2643)
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KB1 NLAEFMEHSDKGPLPLRDDNGIVLLGERAAKCRAYAKA-LHYKE-LEFQKGPTPAILESL
. .::..: .:.. . .: : :
CCDS31 MVSTVDYEDYQSVTRFLDLIPQDTLAVASFRSKAYTRAVMHFESFITEKKQNIQEHLGFL
1620 1630 1640 1650 1660 1670
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KB1 ISINNKLQQPEAAAGVLEYAMKHFGELEIQATWYEKLHEWEDALVAYDKKMDTNKDDPEL
.. ...:...::: : :. : .:.: .:: . ::. .. . :.
CCDS31 QKLYAAMHEPDGVAGV-SAIRKAEPSLKEQILEHESLGLLRDATACYDRAIQLEPDQIIH
1680 1690 1700 1710 1720 1730
1480 1490 1500 1510 1520 1530
pF1KB1 MLGRMRCLEALGEWGQLHQQCCEKWTLVN-DETQAKMARMAAAAAWGLGQWDSMEEYTCM
. : .. . .::. . . : . . .: .: .. . . ::: :.::: .:.:
CCDS31 YHGVVKSMLGLGQLSTVITQV--NGVHANRSEWTDELNTYRVEAAWKLSQWDLVENYLAA
1740 1750 1760 1770 1780 1790
1540 1550 1560 1570 1580
pF1KB1 IPRDTHDGAFYRAVLALHQDLFSLAQQCIDKARD---LLDAE----LTAMAGE--SYSRA
:: . : : :.: .. : : :. :: :.: . : ::.:.
CCDS31 ------DGKSTTWSVRLGQLLLSAKKRDITAFYDSLKLVRAEQIVPLSAASFERGSYQRG
1800 1810 1820 1830 1840
1590 1600 1610 1620 1630 1640
pF1KB1 YGAMVSCHMLSELEEVIQ--YKLVP-ERREIIRQIWWERLQGCQRIVEDWQKILMVRSLV
: .: ::: :::. :. .. : . . : ::. : . . :: .: .
CCDS31 YEYIVRLHMLCELEHSIKPLFQHSPGDSSQEDSLNWVARLEMTQNSYRAKEPILALRRAL
1850 1860 1870 1880 1890 1900
1650 1660 1670 1680 1690
pF1KB1 VS----P-HEDM--RTWLKYASLCGKSGRLALAHKTLVLLLGVDPSRQLDHPLPTVHPQV
.: : ...: . ::. : . :.:. :...: :.. :: ..
CCDS31 LSLNKRPDYNEMVGECWLQSARVARKAGHHQTAYNAL---LNAGESRL---------AEL
1910 1920 1930 1940 1950
1700 1710 1720 1730 1740 1750
pF1KB1 TYAYMKNMWKSARKIDAFQHMQHFVQTMQQQAQHAIATEDQQHKQELHKLMARCFLKLGE
: .:. : :. : . ..:. .. . .. . . . .: .: .:.
CCDS31 YVERAKWLWS---KGDVHQALI----VLQKGVELCFPENETPPEGKNMLIHGRAMLLVGR
1960 1970 1980 1990 2000
1760 1770 1780 1790 1800 1810
pF1KB1 WQLNLQGINESTIPKVLQYYSAATEHDRSWYKAWHAWAVMNFEAVLHY-KHQNQARDEKK
.. . ... ..: : . .: . : .: . .: : . .. :.:
CCDS31 FMEETANFESNAIMKKYKDVTACLPE----------WEDGHFYLAKYYDKLMPMVTDNK-
2010 2020 2030 2040 2050
1820 1830 1840 1850 1860 1870
pF1KB1 KLRHASGANITNATTAATTAATATTTASTEGSNSESEAESTENSPTPSPLQKKVTEDLSK
..:. :: .
CCDS31 -------------------------------------------------MEKQ--GDLIR
2060
1880 1890 1900 1910 1920 1930
pF1KB1 TLLMYTVPAVQGFFRSISLSRGNNL--QDTLRVLTLWFDYGHWPDVNEALVEGVKAIQID
.... : :: :. ::.. :. :.::::.::: .:: .
CCDS31 YIVLH-------FGRS--LQYGNQFIYQSMPRMLTLWLDYG------------TKAYE--
2070 2080 2090 2100
1940 1950 1960 1970 1980 1990
pF1KB1 TWLQVIPQLIARIDTPRPLVGRLIHQLLTDIGRYHPQALIYPLTVASKSTTTARHNAANK
: .. .: : :. :. .:.:. . . .: . :: ..
CCDS31 -WEKA-----GRSD-------RV--QMRNDLGKINKVITEHTNYLAPYQFLTA----FSQ
2110 2120 2130 2140
2000 2010 2020 2030 2040 2050
pF1KB1 ILKNMCEHSNTLVQQAMMVSEELIRVAILWHEMWHEGLEEASRLYFGERNVKGMFEVLEP
... .: ::. : ..: . .: . :: . .:. . : :. :.:.
CCDS31 LISRIC-HSHDEVFVVLMEIIAKVFLAYPQQAMWM--MTAVSKSSYPMR-VNRCKEILN-
2150 2160 2170 2180 2190
2060 2070 2080 2090 2100 2110
pF1KB1 LHAMMERGPQTLKETSFNQAYGRDLMEAQEWCRKYMKSGNVKDLTQAWDLYYHVFRRISK
.:. . ..:.. . . : . : : : . .:. . :. . : :. ..:
CCDS31 -KAIHMK--KSLEKFVGDATRLTDKL--LELCNKPV-DGSSSTLS----MSTH-FKMLKK
2200 2210 2220 2230 2240
2120 2130 2140 2150 2160
pF1KB1 QLPQLTSLELQYVSPKLLMCRDLE--LAVPGTYDPNQPI----IRIQSIAPSLQVITSKQ
. . : :. . . .: : :.. ... ..:. : .. .....: :
CCDS31 LVEEATFSEI-LIPLQSVMIPTLPSILGTHANHASHEPFPGHWAYIAGFDDMVEILASLQ
2250 2260 2270 2280 2290 2300
2170 2180 2190 2200 2210 2220
pF1KB1 RPRKLTLMGSNGHEFVFLLKGHEDLRQDERVMQLFGLVNTLLANDPTSLRKNLSIQRYAV
.:.:..: ::.:. .... : ..:::.: :.:.. .:.: : .: : :..: :. :::
CCDS31 KPKKISLKGSDGKFYIMMCKPKDDLRKDCRLMEFNSLINKCLRKDAESRRRELHIRTYAV
2310 2320 2330 2340 2350 2360
2230 2240 2250 2260 2270 2280
pF1KB1 IPLSTNSGLIGWVPHCDTLHALI-RDYREKKKILLNIEHRIMLRMAPDYDHLTLMQKVEV
:::. . :.: :: . :. .. . :.:: . . : : : : :. .:..:
CCDS31 IPLNDECGIIEWVNNTAGLRPILTKLYKEKGVYMTGKELRQC--MLPKSAALS--EKLKV
2370 2380 2390 2400 2410 2420
2290 2300 2310 2320 2330 2340
pF1KB1 FEHAVNNTAGDDLAKLLWLKSPSSEVWFDRRTNYTRSLAVMSMVGYILGLGDRHPSNLML
:.. . . . . :. :.. :. : :: :::::::::::::::: :...
CCDS31 FREFLLPRHPPIFHEWFLRTFPDPTSWYSSRSAYCRSTAVMSMVGYILGLGDRHGENILF
2430 2440 2450 2460 2470 2480
2350 2360 2370 2380 2390 2400
pF1KB1 DRLSGKILHIDFGDCFEVAMTREKFPEKIPFRLTRMLTNAMEVTGLDGNYRITCHTVMEV
: :.:. .:.::. :. . : : :: .:::::. ..:.: : .: .: .:...:..
CCDS31 DSLTGECVHVDFNCLFNKGETFE-VPEIVPFRLTHNMVNGMGPMGTEGLFRRACEVTMRL
2490 2500 2510 2520 2530 2540
2410 2420 2430 2440 2450 2460
pF1KB1 LREHKDSVMAVLEAFVYDPLLNWRLMDTNTKGNKRSRTRTDSYSAGQSVEILDGVELGEP
.:.... .:.::..:..:::..: . .::.... :
CCDS31 MRDQREPLMSVLKTFLHDPLVEW---SKPVKGHSKA-----------------------P
2550 2560 2570
2470 2480 2490 2500 2510 2520
pF1KB1 AHKKTGTTVPESIHSFIGDGLVKPEALNKKAIQIINRVRDKLTGRDFSHDDTLDVPTQVE
.. :: .: :. .. . : .. .: . ..:...:: .: . .:.
CCDS31 LNE-TGEVVNEKAKTHVLD--------IEQRLQGVIKTRNRVTGLPLS------IEGHVH
2580 2590 2600 2610 2620
2530 2540
pF1KB1 LLIKQATSHENLCQCYIGWCPFW
::..::... ::: :.:: :.
CCDS31 YLIQEATDENLLCQMYLGWTPYM
2630 2640
>>CCDS31669.1 ATM gene_id:472|Hs108|chr11 (3056 aa)
initn: 782 init1: 211 opt: 577 Z-score: 632.7 bits: 131.6 E(32554): 6.3e-29
Smith-Waterman score: 663; 22.1% identity (50.7% similar) in 1262 aa overlap (1312-2545:1922-3052)
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KB1 EWLRRLSLELLKDSSSPSLRSCWALAQAYNPMARDLFNAAFVSCWSELNEDQQDELIRSI
: . .:: :: : .:: .
CCDS31 ESEHFFRCCLDKKSQRTMLAVVDYMRRQKRPSSGTIFNDAF---WLDLN---------YL
1900 1910 1920 1930
1350 1360 1370 1380 1390 1400
pF1KB1 ELALTSQDIAEVTQTLLNLAEFMEHSDKGPLPLRDDNGIVLLGERAAKCRAYAKALHYKE
:.: ..:. : .:: ::. ..:: . ::. :. . .. . ..: :
CCDS31 EVAKVAQSCAAHFTALL-YAEI--YADKKSM---DDQEKRSLAFEEGSQSTTISSLSEKS
1940 1950 1960 1970 1980 1990
1410 1420 1430 1440 1450 1460
pF1KB1 LEFQKGPTPAILESLISINNKLQQPEAAAGVLEYAMKHFGELEIQATWYEKLHEWEDALV
: . : . . . :. : .. .:.. : . : . . : ::. : :::
CCDS31 KE-ETGIS--LQDLLLEIYRSIGEPDSLYGC--GGGKMLQPITRLRT-YEHEAMWGKALV
2000 2010 2020 2030 2040
1470 1480 1490 1500 1510 1520
pF1KB1 AYDKKMDTNKDDPELMLGRMRCLEALGEWGQLHQQCCEKWTLVNDETQAKMARMAAAAAW
.:: ..: . . : .. :. :: .. . . : . .. .. :::
CCDS31 TYD--LETAIPSSTRQAGIIQALQNLG-LCHILSVYLKGLDYENKDWCPELEELHYQAAW
2050 2060 2070 2080 2090 2100
1530 1540 1550 1560 1570 1580
pF1KB1 GLGQWDSMEEYTCMIPRDTHDGAFYRAVLALHQDLFSLAQQCIDKARDLLDAELTAMAGE
::: . . .. ..: :. .:.. :: . . :: :. . :
CCDS31 RNMQWDHCTSVSKEVEGTSYHESLYNALQSLRDREFSTFYESLKYARVKEVEEMCKRSLE
2110 2120 2130 2140 2150 2160
1590 1600 1610 1620 1630
pF1KB1 SYSRAYGAMVSCHMLSELEEVIQY--KLVPERREIIRQIWWERLQGCQRIVE-DWQKILM
: : .. . ..::: . . . : .:. : :.. . . . ..:. .:
CCDS31 SVYSLYPTLSRLQAIGELESIGELFSRSVTHRQLSEVYIKWQKHSQLLKDSDFSFQEPIM
2170 2180 2190 2200 2210 2220
1640 1650 1660 1670 1680 1690
pF1KB1 VRSLVVSPHEDMRTWLKYASLCGKSGRLALAHKT-LVLLLGVDPSRQL-DHPLPTVHPQV
. :. . . : :. . : . : .: . . :: .. . ..
CCDS31 ALRTVILEILMEKEMDNSQRECIKD--ILTKHLVELSILARTFKNTQLPERAIFQIKQYN
2230 2240 2250 2260 2270 2280
1700 1710 1720 1730 1740 1750
pF1KB1 TYAYMKNMWKSARKIDAF--QHMQHFVQTMQQQAQHAIATEDQQHKQELHKLMARCFLKL
. . . :. .. ..: .. : .. .. .: . . . .. :. ...:.
CCDS31 SVSCGVSEWQ-LEEAQVFWAKKEQSLALSILKQMIKKLDASCAANNPSLKLTYTECLRVC
2290 2300 2310 2320 2330 2340
1760 1770 1780 1790 1800 1810
pF1KB1 GEWQLNLQGINESTIPKVL--QYYSAATEHDRSWYKAWHAWAVMNFEAVLHYKHQNQARD
:.: . : ..: .. . .: ..: . . : .. ... . :
CCDS31 GNWLAETCLENPAVIMQTYLEKAVEVAGNYDGESSDELRNGKMKAFLSLARFSDTQYQRI
2350 2360 2370 2380 2390 2400
1820 1830 1840 1850 1860 1870
pF1KB1 EKKKLRHASGANITNATTAATTAATATTTASTEGSNSESEAESTENSPTPSPLQKKVTED
:. . ..... : . : . . ... . ... . : .. ..
CCDS31 EN----YMKSSEFENKQALLKRAKEEVGLLREHKIQTNRYTVKVQRELELDELALRALKE
2410 2420 2430 2440 2450
1880 1890 1900 1910 1920 1930
pF1KB1 LSKTLLMYTVPAVQGFFRSISLSRGNNLQDTLRVLTLWFDYGHWPDVNEALV-EGVKAIQ
: .: ::.... . :: .. . ..:. .::.. . .:: . .:.: :
CCDS31 DRKRFL---CKAVENYINCL-LSGEEHDMWVFRLCSLWLENSGVSEVNGMMKRDGMK-IP
2460 2470 2480 2490 2500 2510
1940 1950 1960 1970 1980
pF1KB1 IDTWLQVIPQLIARIDTPRPLVGRLIHQLLTD-IGRY---HPQA---LIYPLTVASKSTT
.: .. :: ::. : . . : .:..:.. :.: ::. .: :. :...
CCDS31 TYKFLPLMYQLAARMGT-KMMGGLGFHEVLNNLISRISMDHPHHTLFIILALANANRDEF
2520 2530 2540 2550 2560 2570
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KB1 TARHNAA--NKILKNMCEHSNTLVQQAMMVSEELIRVAILWHEMWHEGLEEASRLYFGER
.. ..: ..: ::. ..:. : .: . : :.:. :
CCDS31 LTKPEVARRSRITKNVPKQSSQL--------DE-------------DRTEAANRIICTIR
2580 2590 2600 2610
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KB1 NVKGMFEVLEPLHAMMERGPQTLKETSFNQAYGRDLMEAQEWCRKYMKSGNVKDLTQAWD
. : :: .. .:: : :. .:. : :: :
CCDS31 S----------------RRPQMVRS-----------VEAL--CDAYIILANL-DATQ-WK
2620 2630
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KB1 LYYHVFRRISKQ-LPQLTSLELQYVSPKLLMCRDLELAVPGTYDPNQPIIRIQSIAPSLQ
. . . : . .: .:: . : : . .... : : .. :::. ..
CCDS31 TQRKGINIPADQPITKLKNLE-DVVVPTM----EIKVDHTGEYGN---LVTIQSFKAEFR
2640 2650 2660 2670 2680 2690
2170 2180 2190 2200 2210 2220
pF1KB1 VITSKQRPRKLTLMGSNGHEFVFLLKGHEDLRQDERVMQLFGLVNTLLANDPTSLRKNLS
. . . :. . .::.:.: :.::..::::: ..:.: . :::: . . ...:.
CCDS31 LAGGVNLPKIIDCVGSDGKERRQLVKGRDDLRQDAVMQQVFQMCNTLLQRNTETRKRKLT
2700 2710 2720 2730 2740 2750
2230 2240 2250 2260 2270
pF1KB1 IQRYAVIPLSTNSGLIGW----VPHCDTL----HALIRDYREKKKILLNIEHRIMLRMAP
: : :.::: ::.. : :: . : . . :: . .. ....:
CCDS31 ICTYKVVPLSQRSGVLEWCTGTVPIGEFLVNNEDGAHKRYRPNDFSAFQCQKKMM-----
2760 2770 2780 2790 2800
2280 2290 2300 2310 2320 2330
pF1KB1 DYDHLTLMQKVEVFEHAVNNTAGDDLAKLLWLKSPSSEVWFDRRTNYTRSLAVMSMVGYI
. .. .. .: ::: . .: . . : . .::..: ::::.:. :.::::
CCDS31 EVQKKSFEEKYEVFMDVCQNFQ-PVFRYFCMEKFLDPAIWFEKRLAYTRSVATSSIVGYI
2810 2820 2830 2840 2850 2860
2340 2350 2360 2370 2380 2390
pF1KB1 LGLGDRHPSNLMLDRLSGKILHIDFGDCFEVAMTREKFPEKIPFRLTRMLTNAMEVTGLD
::::::: .:..... :....:::.: :: . :: .:::::: ....: .::..
CCDS31 LGLGDRHVQNILINEQSAELVHIDLGVAFEQGKILPT-PETVPFRLTRDIVDGMGITGVE
2870 2880 2890 2900 2910 2920
2400 2410 2420 2430 2440 2450
pF1KB1 GNYRITCHTVMEVLREHKDSVMAVLEAFVYDPLLNWRLMDTNTKGNKRSRTRTDSYSAGQ
: .: :. .:::.:. ........:...::::..: . : . : .. .
CCDS31 GVFRRCCEKTMEVMRNSQETLLTIVEVLLYDPLFDWTM---NPLKALYLQQRPEDET---
2930 2940 2950 2960 2970
2460 2470 2480 2490 2500 2510
pF1KB1 SVEILDGVELGEPAHKKTGTTVPESIHSFIGDGLVKPEALNKKAIQIINRVRDKLTGRDF
:. .. . :.. . . .: .:: : ... :...:: : .
CCDS31 --ELHPTLNADDQECKRNLSDIDQS--------------FNKVAERVLMRLQEKLKGVE-
2980 2990 3000 3010 3020
2520 2530 2540
pF1KB1 SHDDTLDVPTQVELLIKQATSHENLCQCYIGWCPFW
. .:.: ::.:::.:: . .:: . . ::
CCDS31 -EGTVLSVGGQVNLLIQQAIDPKNLSRLFPGWKAWV
3030 3040 3050
>>CCDS45430.1 SMG1 gene_id:23049|Hs108|chr16 (3661 aa)
initn: 1049 init1: 251 opt: 328 Z-score: 351.1 bits: 79.7 E(32554): 3.1e-13
Smith-Waterman score: 772; 27.1% identity (54.4% similar) in 641 aa overlap (1903-2429:1789-2425)
1880 1890 1900 1910 1920 1930
pF1KB1 LSKTLLMYTVPAVQGFFRSISLSRGNNLQDTLRVLTLWFDYGHWPDVNEALVEGVKAIQI
:::.: : : .. . : .:...
CCDS45 AGQIPLDEDDPRLHLSHRVEQSTDDMIVMATLRLLRLLVK--HAGELRQYLEHGLETTPT
1760 1770 1780 1790 1800 1810
1940 1950 1960 1970 1980 1990
pF1KB1 DTWLQVIPQLIARIDTPRPLVGRLIHQLLTDIGRYHPQALIYPLTVASKSTTTARHNAAN
: .::::..:.. :. : . : .:: ... :. ..:: :.. : .. . ..:
CCDS45 APWRGIIPQLFSRLNHPEVYVRQSICNLLCRVAQDSPHLILYPAIVGTISLSSESQASGN
1820 1830 1840 1850 1860 1870
2000
pF1KB1 K-------ILKNM---------CE--------HSN-------------------------
: .: :. :: ::
CCDS45 KFSTAIPTLLGNIQGEELLVSECEGGSPPASQDSNKDEPKSGLNEDQAMMQDCYSKIVDK
1880 1890 1900 1910 1920 1930
2010 2020 2030 2040
pF1KB1 ------TLVQQAMMVSEELIRVAILWHEMW-----HEGLEEASRLYFGERNVK-----GM
:.: :..:. :: ::..:: :.: .. . :. : .:: .
CCDS45 LSSANPTMVLQVQMLVAELRRVTVLWDELWLGVLLQQHMYVLRRIQQLEDEVKRVQNNNT
1940 1950 1960 1970 1980 1990
2050 2060 2070 2080 2090
pF1KB1 FEVLEPLHAMMERGPQTLKETSFNQAYGRDLMEA------QEWCR-----------KYMK
.. : . : :. .: : . :.. : ..: . . .:
CCDS45 LRKEEKIAIMREKHTALMKPIVFALEHVRSITAAPAETPHEKWFQDNYGDAIENALEKLK
2000 2010 2020 2030 2040 2050
2100 2110 2120 2130 2140
pF1KB1 SG-NVKDLTQAWDLYYHVFRRISKQLPQLTS--LELQYVSPKLLMCRDLELAVPGTYDPN
. : ..: . ... .... . .: :.:. .:: : . :.:.:: .
CCDS45 TPLNPAKPGSSWIPFKEIMLSLQQRAQKRASYILRLEEISPWLAAMTNTEIALPGEVSA-
2060 2070 2080 2090 2100 2110
2150 2160 2170 2180 2190 2200
pF1KB1 QPIIRIQSIAPSLQVITSKQRPRKLTLMGSNGHEFVFLLKGHEDLRQDERVMQLFGLVNT
. . :.:.. .. .. .: .:.:: ..::.:. . .:.:: :::. :::.::....:::
CCDS45 RDTVTIHSVGGTITILPTKTKPKKLLFLGSDGKSYPYLFKGLEDLHLDERIMQFLSIVNT
2120 2130 2140 2150 2160 2170
2210 2220 2230 2240 2250 2260
pF1KB1 LLANDPTSLRKNLSIQRYAVIPLSTNSGLIGWVPHCDTLHALIRDYREKKKILL------
..:. . . ..:.: ::.: :::: :: : .: . ..... :
CCDS45 MFATINRQETPRFHARHYSVTPLGTRSGLIQWVDGATPLFGLYKRWQQREAALQAQKAQD
2180 2190 2200 2210 2220 2230
2270 2280 2290
pF1KB1 --------NIEHR----IMLRMAPDYDHLTLMQKVE-----------VFEHAVNNTAGDD
.: : . ...: . : : :.:. .. : .
CCDS45 SYQTPQNPGIVPRPSELYYSKIGPALKTVGLSLDVSRRDWPLHVMKAVLEELMEATPPNL
2240 2250 2260 2270 2280 2290
2300 2310 2320 2330 2340 2350
pF1KB1 LAKLLWLKSPSSEVWFDRRTNYTRSLAVMSMVGYILGLGDRHPSNLMLDRLSGKILHIDF
::: :: . . . :. .:.:: :::::::::.:::::: .:...: .:...:::.
CCDS45 LAKELWSSCTTPDEWWRVTQSYARSTAVMSMVGYIIGLGDRHLDNVLIDMTTGEVVHIDY
2300 2310 2320 2330 2340 2350
2360 2370 2380 2390 2400 2410
pF1KB1 GDCFEVAMTREKFPEKIPFRLTRMLTNAMEVTGLDGNYRITCHTVMEVLREHKDSVMAVL
. ::: . . . :::.:::.:. . .:. :::..: .:..:. :....:. .......:
CCDS45 NVCFEKGKSL-RVPEKVPFRMTQNIETALGVTGVEGVFRLSCEQVLHIMRRGRETLLTLL
2360 2370 2380 2390 2400 2410
2420 2430 2440 2450 2460 2470
pF1KB1 EAFVYDPLLNWRLMDTNTKGNKRSRTRTDSYSAGQSVEILDGVELGEPAHKKTGTTVPES
::::::::..:
CCDS45 EAFVYDPLVDWTAGGEAGFAGAVYGGGGQQAESKQSKREMEREITRSLFSSRVAEIKVNW
2420 2430 2440 2450 2460 2470
>>CCDS75735.1 PRKDC gene_id:5591|Hs108|chr8 (4128 aa)
initn: 523 init1: 254 opt: 305 Z-score: 324.4 bits: 74.9 E(32554): 9.5e-12
Smith-Waterman score: 592; 21.5% identity (51.2% similar) in 1338 aa overlap (1348-2549:2859-4127)
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KB1 FNAAFVSCWSELNEDQQDELIRSIELALTSQDIAEVTQTLLNLAEFMEHSDKGPLP-LRD
:::. .::.: . : : :..
CCDS75 KNNITQKLLQDFNRFLNTTFSFFPPFVSCIQDISCQHAALLSLDP--AAVSAGCLASLQQ
2830 2840 2850 2860 2870 2880
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KB1 DNGIVLLGERAAKCRAYAKALHYKELEFQKGPTPAILE--SLISINNKLQQPEAAAGVL-
:: :: : : : : :... . : .:. : .. .. . .. :..
CCDS75 PVGIRLLEE--ALLRLLPAELPAKRVRGKARLPPDVLRWVELAKLYRSIGEYDVLRGIFT
2890 2900 2910 2920 2930 2940
1440 1450 1460 1470 1480
pF1KB1 -EYAMKHFGE----LEIQATWYEKLHEWEDALVAYD----KKMDTNKDDPELMLGRMRCL
: . :.. . : .. . : .....:: : . ...:: :: . . :
CCDS75 SEIGTKQITQSALLAEARSDYSEAAKQYDEALNKQDWVDGEPTEAEKDFWEL--ASLDCY
2950 2960 2970 2980 2990 3000
1490 1500 1510 1520 1530
pF1KB1 EALGEWGQLHQQCCEKWTLVNDET-------------QAKMARMAAAAAWGLGQWDSMEE
. :.:: .:. : .. ... .. . : . : : .. .
CCDS75 NHLAEWKSLEY--CSTASIDSENPPDLNKIWSEPFYQETYLPYMIRSKLKLLLQGEADQS
3010 3020 3030 3040 3050 3060
1540 1550 1560 1570 1580
pF1KB1 YTCMIPRDTHDGAFYRAVLALHQD----LFSLAQQCIDKARDLLDAELTAMAGESYSRA-
.: . : : . .:.: :: . :. : :. .:.:. .. . .. ..::
CCDS75 LLTFIDKAMH-GELQKAILELHYSQELSLLYLLQDDVDRAKYYIQNGIQSFM-QNYSSID
3070 3080 3090 3100 3110
1590 1600 1610 1620 1630
pF1KB1 -------YGAMVSCHMLSELEEVIQY--------KLVPERREIIRQIWWERLQGCQR-IV
. : . :.:..: :.. . :: .: . . : .: . .
CCDS75 VLLHQSRLTKLQSVQALTEIQEFISFISKQGNLSSQVPLKRLL--NTWTNRYPDAKMDPM
3120 3130 3140 3150 3160 3170
1640 1650 1660 1670 1680
pF1KB1 EDWQKILMVRSLVVSPHEDMRTWLKYASLCGKSGRLALAHKTLVLLLGVDPSRQLD----
. :. :. : . .: :. : : ... . ::: ...
CCDS75 NIWDDIITNRCFFLSKIEEKLTPLP-------------EDNSMNVDQDGDPSDRMEVQEQ
3180 3190 3200 3210 3220
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KB1 -HPLPTVHPQVTYAYMKNMWKSARKIDAFQHMQHFVQTMQQQAQHAIATEDQQHKQELHK
. . .. . ... .: :::: . :. ..... ...... :.:. .
CCDS75 EEDISSLIRSCKFSMKMKMIDSARKQNNFSLAMKLLKELHKESK----TRDD---WLVSW
3230 3240 3250 3260 3270
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KB1 LMARCFLKLGEWQLNLQGINESTIPKVLQYYSAATEHDRSWYKAWHAWAVMNFEAVLHYK
... : .:.. . :: .:... ::. : :.. : : . . : . . .:
CCDS75 VQSYC--RLSHCRSRSQGCSEQVLT-VLKTVSLLDENNVSSYLSKNILAFRDQNILLGTT
3280 3290 3300 3310 3320 3330
1810 1820 1830 1840
pF1KB1 HQNQA--------------RDEKKKLRHASGANITNATTAAT---TAATATTTASTEGSN
.. : .:. ... . ::.. .. . . : . ......
CCDS75 YRIIANALSSEPACLAEIEEDKARRILELSGSSSEDSEKVIAGLYQRAFQHLSEAVQAAE
3340 3350 3360 3370 3380 3390
1850 1860 1870 1880 1890
pF1KB1 SESEAESTENSPTPSPLQKKVT-EDL----------------SKTLLMYTVPAVQGFFRS
:.. : .:. . .. .: :. : : : . .:. ....
CCDS75 EEAQPPSWSCGPAAGVIDAYMTLADFCDQQLRKEEENASVIDSAELQAYPALVVEKMLKA
3400 3410 3420 3430 3440 3450
1900 1910 1920 1930 1940
pF1KB1 ISLSRGNNLQDTLRVLTLWFDYGHWPDVNEALVEGVKAIQ-IDTW--LQVIPQLIARIDT
..:. .. :.: . : :. :.: .: :. . : .. : ...: .:
CCDS75 LKLNSNEARLKFPRLLQIIERY---PE--ETLSLMTKEISSVPCWQFISWISHMVALLDK
3460 3470 3480 3490 3500
1950 1960 1970 1980 1990 2000
pF1KB1 PRPLVGRLIHQLLTDIGRYHPQALIYPLTVASKS----TTTARHNAANKI--LKNMCEHS
. .. ... . .: .:::..::. ..:.: :.. :. . . .:. ...
CCDS75 DQAVA---VQHSVEEITDNYPQAIVYPFIISSESYSFKDTSTGHKNKEFVARIKSKLDQG
3510 3520 3530 3540 3550 3560
2010 2020 2030 2040 2050
pF1KB1 NTLVQQAMMVSEELIRVAILWHEMWHEGLE-EASRLYFGERNVKGMFEVL-----EP---
. ..:. . . ..: .:... : . .. : .. ...:.. :.: . .:
CCDS75 G-VIQDFINALDQLSNPELLFKD-WSNDVRAELAKTPVNKKNIEKMYERMYAALGDPKAP
3570 3580 3590 3600 3610 3620
2060 2070 2080 2090 2100 2110
pF1KB1 -LHAMMERGPQTLKETSFNQAYGRDLMEAQEWCRKYMKSGNVKDLTQAWDLYYHVFRRIS
: :. .. ::. . :.. .:. ... : :: .. .:.:. : .. . :
CCDS75 GLGAFRRKFIQTFGKE-FDKHFGKG---GSKLLR--MKLSDFNDITNMLLLKMN---KDS
3630 3640 3650 3660 3670
2120 2130 2140 2150 2160
pF1KB1 KQLPQLTSLELQYVSPKLLMCRDLELAVPGTYDP-NQPI----IRIQSIAPSLQVITSKQ
: .: . . :. . :. :: .:: :: ..:. .:: .. . :..: .
CCDS75 KPPGNLKECSPWMSDFKVEFLRN-ELEIPGQYDGRGKPLPEYHVRIAGFDERVTVMASLR
3680 3690 3700 3710 3720 3730
2170 2180 2190 2200 2210 2220
pF1KB1 RPRKLTLMGSNGHEFVFLLKGHEDLRQDERVMQLFGLVNTLLANDPTSLRKNLSIQRYAV
::... . : . .: ::.:: ::::::.:: ::: ..: .::.: . .. :... :.:
CCDS75 RPKRIIIRGHDEREHPFLVKGGEDLRQDQRVEQLFQVMNGILAQDSACSQRALQLRTYSV
3740 3750 3760 3770 3780 3790
2230 2240 2250 2260 2270
pF1KB1 IPLSTNSGLIGWVPHCDTLHALIRDY--REKKKILLN------IEHRIML-RMAPDYD--
.:... ::: :. . ::. :. . .:.: :. :.. : .:. .:
CCDS75 VPMTSRLGLIEWLENTVTLKDLLLNTMSQEEKAAYLSDPRAPPCEYKDWLTKMSGKHDVG
3800 3810 3820 3830 3840 3850
2280 2290 2300 2310 2320
pF1KB1 HLTLMQK-------VEVFEHAVNNTAGDDLAKLLWLKSPSSEVWFDRRTNYTRSLAVMSM
:: : : :.. ... .: : . . : : :... :.... : :.. .
CCDS75 AYMLMYKGANRTETVTSFRKRESKVPADLLKRAFVRMSTSPEAFLALRSHFASSHALICI
3860 3870 3880 3890 3900 3910
2330 2340 2350 2360 2370 2380
pF1KB1 VGYILGLGDRHPSNLMLDRLSGKILHIDFGDCFEVAMTREKFPEKIPFRLTRMLTN---A
.:::.:::: .:.:. .: .. :::: : : :: .::::::.. :
CCDS75 SHWILGIGDRHLNNFMVAMETGGVIGIDFGHAFGSATQFLPVPELMPFRLTRQFINLMLP
3920 3930 3940 3950 3960 3970
2390 2400 2410 2420 2430 2440
pF1KB1 MEVTGLDGNYRITCHTVMEVLREHKDSVMAVLEAFVYDPLLNWRLMDTNTKGNKRSRTRT
:. ::: : : :. ....: . ....:: .: ..:. : ...
CCDS75 MKETGL--MYSIMVHA-LRAFRSDPGLLTNTMDVFVKEPSFDWK--------NFEQKMLK
3980 3990 4000 4010 4020
2450 2460 2470 2480 2490 2500
pF1KB1 DSYSAGQSVEILDGVELGEP----AHKKTGTTVPESIH-SFIGDGLVKPEALNKKAIQII
. : : ... . . :..: . . : : . . : : :. . . .
CCDS75 KGGSWIQEINVAEKNWYPRQKICYAKRKLAGANPAVITCDELLLGHEKAPAF-RDYVAVA
4030 4040 4050 4060 4070 4080
2510 2520 2530 2540
pF1KB1 NRVRDKLTGRDFSHDDTLDVPTQVELLIKQATSHENLCQCYIGWCPFW
.:. . : .. :. :::. :. :::. . : . . :: : :
CCDS75 RGSKDH-NIRAQEPESGLSEETQVKCLMDQATDPNILGRTWEGWEP-WM
4090 4100 4110 4120
2549 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 11:47:41 2016 done: Thu Nov 3 11:47:43 2016
Total Scan time: 8.170 Total Display time: 0.860
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]