Result of FASTA (omim) for pF1KB0356
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB0356, 1068 aa
  1>>>pF1KB0356 1068 - 1068 aa - 1068 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4080+/-0.000464; mu= 21.7621+/- 0.029
 mean_var=80.3502+/-16.710, 0's: 0 Z-trim(109.0): 111  B-trim: 14 in 1/49
 Lambda= 0.143081
 statistics sampled from 17054 (17165) to 17054 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.553), E-opt: 0.2 (0.201), width:  16
 Scan time: 11.870

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_006209 (OMIM: 114480,114500,114550,162900,16700 (1068) 7313 1520.6       0
XP_011511196 (OMIM: 114480,114500,114550,162900,16 (1068) 7313 1520.6       0
XP_006713721 (OMIM: 114480,114500,114550,162900,16 (1068) 7313 1520.6       0
XP_016862108 (OMIM: 602925) PREDICTED: phosphatidy (1070) 2127 450.0 3.2e-125
XP_011511197 (OMIM: 602925) PREDICTED: phosphatidy (1070) 2127 450.0 3.2e-125
XP_006713722 (OMIM: 602925) PREDICTED: phosphatidy (1070) 2127 450.0 3.2e-125
XP_005247587 (OMIM: 602925) PREDICTED: phosphatidy (1070) 2127 450.0 3.2e-125
NP_006210 (OMIM: 602925) phosphatidylinositol 4,5- (1070) 2127 450.0 3.2e-125
XP_011511198 (OMIM: 602925) PREDICTED: phosphatidy ( 902) 2026 429.1 5.4e-119
XP_016856974 (OMIM: 602839,615513) PREDICTED: phos (1015) 1861 395.1 1.1e-108
XP_006710752 (OMIM: 602839,615513) PREDICTED: phos (1044) 1854 393.7 2.9e-108
XP_006710750 (OMIM: 602839,615513) PREDICTED: phos (1044) 1854 393.7 2.9e-108
NP_005017 (OMIM: 602839,615513) phosphatidylinosit (1044) 1854 393.7 2.9e-108
NP_001269356 (OMIM: 601232) phosphatidylinositol 4 (1102) 1823 387.3 2.6e-106
NP_001269355 (OMIM: 601232) phosphatidylinositol 4 (1102) 1823 387.3 2.6e-106
XP_005250500 (OMIM: 601232) PREDICTED: phosphatidy (1102) 1823 387.3 2.6e-106
NP_002640 (OMIM: 601232) phosphatidylinositol 4,5- (1102) 1823 387.3 2.6e-106
NP_001242974 (OMIM: 602925) phosphatidylinositol 4 ( 582) 1806 383.6 1.8e-105
XP_016862110 (OMIM: 602925) PREDICTED: phosphatidy ( 657) 1806 383.6  2e-105
XP_016862109 (OMIM: 602925) PREDICTED: phosphatidy ( 674) 1806 383.6  2e-105
XP_016856972 (OMIM: 602839,615513) PREDICTED: phos (1074) 1748 371.8 1.2e-101
XP_016856970 (OMIM: 602839,615513) PREDICTED: phos (1103) 1748 371.8 1.2e-101
XP_016856968 (OMIM: 602839,615513) PREDICTED: phos (1103) 1748 371.8 1.2e-101
XP_016856965 (OMIM: 602839,615513) PREDICTED: phos (1103) 1748 371.8 1.2e-101
XP_016856966 (OMIM: 602839,615513) PREDICTED: phos (1103) 1748 371.8 1.2e-101
XP_016856969 (OMIM: 602839,615513) PREDICTED: phos (1103) 1748 371.8 1.2e-101
XP_016856971 (OMIM: 602839,615513) PREDICTED: phos (1103) 1748 371.8 1.2e-101
XP_016856967 (OMIM: 602839,615513) PREDICTED: phos (1103) 1748 371.8 1.2e-101
XP_016856973 (OMIM: 602839,615513) PREDICTED: phos (1043) 1741 370.4 3.1e-101
XP_016867817 (OMIM: 601232) PREDICTED: phosphatidy (1031) 1544 329.7 5.3e-89
XP_011514618 (OMIM: 601232) PREDICTED: phosphatidy (1011) 1538 328.4 1.2e-88
XP_016856964 (OMIM: 602838) PREDICTED: phosphatidy (1070) 1249 268.8 1.2e-70
XP_011507932 (OMIM: 602838) PREDICTED: phosphatidy (1634) 1249 268.9 1.6e-70
XP_011507933 (OMIM: 602838) PREDICTED: phosphatidy (1634) 1249 268.9 1.6e-70
NP_002637 (OMIM: 602838) phosphatidylinositol 4-ph (1634) 1249 268.9 1.6e-70
XP_016856962 (OMIM: 602838) PREDICTED: phosphatidy (1634) 1249 268.9 1.6e-70
XP_005245314 (OMIM: 602838) PREDICTED: phosphatidy (1634) 1249 268.9 1.6e-70
XP_016856963 (OMIM: 602838) PREDICTED: phosphatidy (1634) 1249 268.9 1.6e-70
XP_005245315 (OMIM: 602838) PREDICTED: phosphatidy (1607) 1150 248.5 2.3e-64
XP_016874968 (OMIM: 609001) PREDICTED: phosphatidy ( 817) 1115 241.1   2e-62
NP_001275703 (OMIM: 609001) phosphatidylinositol 4 (1264) 1115 241.2 2.8e-62
XP_016874966 (OMIM: 609001) PREDICTED: phosphatidy (1270) 1115 241.2 2.8e-62
XP_016874965 (OMIM: 609001) PREDICTED: phosphatidy (1407) 1115 241.2 3.1e-62
XP_016874964 (OMIM: 609001) PREDICTED: phosphatidy (1437) 1115 241.2 3.1e-62
XP_011518999 (OMIM: 609001) PREDICTED: phosphatidy (1442) 1115 241.2 3.1e-62
NP_004561 (OMIM: 609001) phosphatidylinositol 4-ph (1445) 1115 241.2 3.1e-62
XP_016874963 (OMIM: 609001) PREDICTED: phosphatidy (1451) 1115 241.3 3.1e-62
XP_011518998 (OMIM: 609001) PREDICTED: phosphatidy (1475) 1115 241.3 3.2e-62
NP_001275701 (OMIM: 609001) phosphatidylinositol 4 (1486) 1115 241.3 3.2e-62
XP_016874962 (OMIM: 609001) PREDICTED: phosphatidy (1492) 1115 241.3 3.2e-62


>>NP_006209 (OMIM: 114480,114500,114550,162900,167000,17  (1068 aa)
 initn: 7313 init1: 7313 opt: 7313  Z-score: 8154.5  bits: 1520.6 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 7313; 100.0% identity (100.0% similar) in 1068 aa overlap (1-1068:1-1068)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MPPRPSSGELWGIHLMPPRILVECLLPNGMIVTLECLREATLITIKHELFKEARKYPLHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MPPRPSSGELWGIHLMPPRILVECLLPNGMIVTLECLREATLITIKHELFKEARKYPLHQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB0 LLQDESSYIFVSVTQEAEREEFFDETRRLCDLRLFQPFLKVIEPVGNREEKILNREIGFA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LLQDESSYIFVSVTQEAEREEFFDETRRLCDLRLFQPFLKVIEPVGNREEKILNREIGFA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB0 IGMPVCEFDMVKDPEVQDFRRNILNVCKEAVDLRDLNSPHSRAMYVYPPNVESSPELPKH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 IGMPVCEFDMVKDPEVQDFRRNILNVCKEAVDLRDLNSPHSRAMYVYPPNVESSPELPKH
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB0 IYNKLDKGQIIVVIWVIVSPNNDKQKYTLKINHDCVPEQVIAEAIRKKTRSMLLSSEQLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 IYNKLDKGQIIVVIWVIVSPNNDKQKYTLKINHDCVPEQVIAEAIRKKTRSMLLSSEQLK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB0 LCVLEYQGKYILKVCGCDEYFLEKYPLSQYKYIRSCIMLGRMPNLMLMAKESLYSQLPMD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LCVLEYQGKYILKVCGCDEYFLEKYPLSQYKYIRSCIMLGRMPNLMLMAKESLYSQLPMD
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB0 CFTMPSYSRRISTATPYMNGETSTKSLWVINSALRIKILCATYVNVNIRDIDKIYVRTGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 CFTMPSYSRRISTATPYMNGETSTKSLWVINSALRIKILCATYVNVNIRDIDKIYVRTGI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB0 YHGGEPLCDNVNTQRVPCSNPRWNEWLNYDIYIPDLPRAARLCLSICSVKGRKGAKEEHC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 YHGGEPLCDNVNTQRVPCSNPRWNEWLNYDIYIPDLPRAARLCLSICSVKGRKGAKEEHC
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB0 PLAWGNINLFDYTDTLVSGKMALNLWPVPHGLEDLLNPIGVTGSNPNKETPCLELEFDWF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 PLAWGNINLFDYTDTLVSGKMALNLWPVPHGLEDLLNPIGVTGSNPNKETPCLELEFDWF
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB0 SSVVKFPDMSVIEEHANWSVSREAGFSYSHAGLSNRLARDNELRENDKEQLKAISTRDPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 SSVVKFPDMSVIEEHANWSVSREAGFSYSHAGLSNRLARDNELRENDKEQLKAISTRDPL
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB0 SEITEQEKDFLWSHRHYCVTIPEILPKLLLSVKWNSRDEVAQMYCLVKDWPPIKPEQAME
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 SEITEQEKDFLWSHRHYCVTIPEILPKLLLSVKWNSRDEVAQMYCLVKDWPPIKPEQAME
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB0 LLDCNYPDPMVRGFAVRCLEKYLTDDKLSQYLIQLVQVLKYEQYLDNLLVRFLLKKALTN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LLDCNYPDPMVRGFAVRCLEKYLTDDKLSQYLIQLVQVLKYEQYLDNLLVRFLLKKALTN
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB0 QRIGHFFFWHLKSEMHNKTVSQRFGLLLESYCRACGMYLKHLNRQVEAMEKLINLTDILK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 QRIGHFFFWHLKSEMHNKTVSQRFGLLLESYCRACGMYLKHLNRQVEAMEKLINLTDILK
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB0 QEKKDETQKVQMKFLVEQMRRPDFMDALQGFLSPLNPAHQLGNLRLEECRIMSSAKRPLW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 QEKKDETQKVQMKFLVEQMRRPDFMDALQGFLSPLNPAHQLGNLRLEECRIMSSAKRPLW
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB0 LNWENPDIMSELLFQNNEIIFKNGDDLRQDMLTLQIIRIMENIWQNQGLDLRMLPYGCLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LNWENPDIMSELLFQNNEIIFKNGDDLRQDMLTLQIIRIMENIWQNQGLDLRMLPYGCLS
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB0 IGDCVGLIEVVRNSHTIMQIQCKGGLKGALQFNSHTLHQWLKDKNKGEIYDAAIDLFTRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 IGDCVGLIEVVRNSHTIMQIQCKGGLKGALQFNSHTLHQWLKDKNKGEIYDAAIDLFTRS
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB0 CAGYCVATFILGIGDRHNSNIMVKDDGQLFHIDFGHFLDHKKKKFGYKRERVPFVLTQDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 CAGYCVATFILGIGDRHNSNIMVKDDGQLFHIDFGHFLDHKKKKFGYKRERVPFVLTQDF
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KB0 LIVISKGAQECTKTREFERFQEMCYKAYLAIRQHANLFINLFSMMLGSGMPELQSFDDIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LIVISKGAQECTKTREFERFQEMCYKAYLAIRQHANLFINLFSMMLGSGMPELQSFDDIA
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060        
pF1KB0 YIRKTLALDKTEQEALEYFMKQMNDAHHGGWTTKMDWIFHTIKQHALN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 YIRKTLALDKTEQEALEYFMKQMNDAHHGGWTTKMDWIFHTIKQHALN
             1030      1040      1050      1060        

>>XP_011511196 (OMIM: 114480,114500,114550,162900,167000  (1068 aa)
 initn: 7313 init1: 7313 opt: 7313  Z-score: 8154.5  bits: 1520.6 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 7313; 100.0% identity (100.0% similar) in 1068 aa overlap (1-1068:1-1068)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB0 MPPRPSSGELWGIHLMPPRILVECLLPNGMIVTLECLREATLITIKHELFKEARKYPLHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MPPRPSSGELWGIHLMPPRILVECLLPNGMIVTLECLREATLITIKHELFKEARKYPLHQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB0 LLQDESSYIFVSVTQEAEREEFFDETRRLCDLRLFQPFLKVIEPVGNREEKILNREIGFA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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